|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000094_pilon:616320..624803+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12468 ID=MSTRG.12468|Name=MSTRG.12468|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=8484bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:616320..624803+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGCCAGTATAGCTGGAGCTTAAGAGATAAGAATGGAAATCTCCGGAAAAT
ATTTGAGGGCGGAGGATCACGGAATCTTCGAAATTCACATCTCGACAAAA
TTTTACAGCAGGCAGGCTGAAGACAAAATGTTAACCTAGGAAATTCCCAA
ATCCTTATGTCTTTGTTCCTAAGGAAAATATCAATGATATTCTGAGctac
aaagttttttttagttttaattagttggttttgttttcattaatATTCAA
TATGGCACGAGATTATGATCATCTGTTCAAGCTGCTGATTATTGGTGATA
GTGGTAAGCTAATACTTTCTTTGGTTTGTATTGTTTCTGTTTAGGAAATA
GTTTAGAGAAAGTATAATGGATATCAATCATTTCTTGACCAGATTTCCTG
TTTTCAGGCTCGTTTGGGGAGAGGAGACAAGTGGGGGGATGAAATCGTCT
AGGTGATCGATCACATGCAAACAAGTTAgacaagttgataaaagttaggA
AAATCTTTCAATGGTCCAAAAGACTTATACAGATAAGTCAggtcttcttc
tttttccttttccGATATCAGCTTCTGTTCAGTCTGtgtatccagacgat
ctcaatcgaacggaattgacgattgaaccagtcgaaccaaatcgaacaac
gaaatcgaccgattgaaattcgattgtcgaacgcaatcgaatctcaatcg
attattaccgcaattttcagattcgattgatattcgattgcgttcgattg
atgttcgattgcgttccaTTGCGTTTGATCGTCGATTCGTTGACCCCCAG
ATTGTTCATTGCACAATTtttacgggaaatcgaaagtaatttactctact
ctcaaaatatccaaagttgtgcctgtcttcaaacacaaaggttctcccct
tgaagtctctaattataggccaatttcacttttatctaacattgaaaaaa
tttttgagaaagtgatgtACTCACGTctttctgattttcttgaaaaccct
aatcaaatctactctcgacaatttggttttcgtaaggctcactctactga
gcatacactcattaatattgtcgaacgtatccgaaactatcttgacaatg
gtgggtttgcctgtggtgtatttgtcgatctacaaaaggctttcgacaca
gttgatcacgaaatcttacttgaaaaactcgatcactacggagtcagagg
cattgttaatgactggttccgatcttacctcactaagcgctcccagtatg
tttctctttcaggctcaaattcccttttaaaatctattaatcatggagtt
cctcagggttcagtcttgggtcctctgctgttcttgttgtatataaacga
tcttcaccgctgtataagaacctctgaaacatattatcattttgctgatg
atactcatttactaaatttttcaaaaaatgtatggagtctttgtgggagg
gttaatgctgatctcagagttttagtcagctggcttaatgccaacaaaat
ttctttgaatgctagcaaaactgagtttgttatttttcgttccccttgga
gacagatggactgtattccaagaattaagctttgtgggaaaattctatca
ccaagtaagagtgtgaagtatttgggtgttcaccttgacaatcatctaaa
ctggaaggttcatacttctttcgttgctgctacattgagaagggcaaatg
gggcaatatccaaacttcgtcactatgttccaattcacatccttctaaac
atttatcatgcaatttttgcttctcatgttcgctatgctagccaactctg
gggactgtgtgacaatactgtcacacatagaattcttactcttcaaaaca
ctgcactaagactcatgacctttagtgaaccaagaacttctgccactccc
ctgtttgctgaacttaaattactcaaaatctttgatcaggtgaaagtaat
gaatatcttatttattcaaaaatacctccagggtaatcttccatctgatg
tcctatcaacacttaattttgatgaaattgatcacaaaactggcaccagg
ggcaaagctattaaactactaaaactttcaacggtcaaaaccacaaattt
tggacttaactctttctctcgtctttcgtcaaaacaatggaatgagttac
taataaatcatcctgacactgattttcacaacctttatactgatgaacta
aaatctttagctacaaaattctatttagacaaatacaaagctgaaaacga
ataatctttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtaattgtgtgtgcataagct
tagtgtgttttcccagggtgggagggggtgggtaacaggaagaactttat
agataaaactactcaaagaaattttcataaaataaaagtaaaaatatttc
ttatattcattattttgtgtcactattaatattatgataatcgtttattc
atttgttctttagttctgtaataatttttcagtttcttctaggttcccca
ttgtattagagaaatctatttttttttttgtaaggggttatcctgctgtg
ttgcagcgaaaatatattcaattcaattcaattcaattcaattcggcttg
tgatgtttgagagcttggatgttggaaagctgcaagaataaagccagaca
atctcaatcgaacggaatcaacgatcaaaccagtcgaacaacaatcgaac
caatcgaatattacccagaattttgacgttcgattgagattcgattgcgt
tcgacaatcgaatttcaatcggtcgattgcgttcaatttggtcagttaca
tcaaaatgcctcgaaaatgtcaatatgaaaattgcgtaatcagagaacgt
ttgtctcgctcattataaaaatgccgagacaaactttcaataattggatt
gtaacatcgagttaagtctcttttgttaagtcaccagggggtaaataaaa
cagaccttgatacatttatcgttcgtttcaacttgacgattcgtttaaaa
ctcagcctcctaaatatttggggtaggtaaaatatgtataaagaaattca
tacttttccaacctggcaaatctttaaaaaagaagcgaacaataaaataa
aattaccctttccaaataaacctcttcagTGGCGAGCGtggtctactctg
acgtaattgtaaaatttatgtgatgggagtagtttgacatagtaatgtaa
tgttgtttggggaattatgaagttctctggaattgcgattgcatttattc
aggttgattttttatgacttctaatggtactttttctaacgagtttgatt
actctgttctcacacttatgtctttttttttcgcgtccttttccgtgatt
aattttatttatatttttaaagacaagtaagaaggcatattgatgtaact
gttggTTAGCGTATATCAATAATATTTCTTTCATCCATTACAGGTGTTGG
GAAGAGCAGCATTTTGTTAAGGTTTGCAGATAACATGTTTTCAGGTAAGT
GTTATTTTCTTTCCTTCAGCGAATAAACAAACTTTGATCAGCTCATACTT
TTGAGGAGAAATTTGGTCTTAGTCACAAGGCATATCAGATGTTGTATTTG
GGGTGATGTATGATGCATGTTGCTCACATGAGTAAGCACTCCCTTCAATA
ATTTTGCAACAGGTCGTGGTTCTGTTGTTTCAAATGCATAAAGTCAACAC
TGTTTGGCCAGTGCTTTGAATTTCCCATCCAGGGATAGGTGACTGACTAC
TCACATTGGGTTGATCAACCTTCCAACCACAAGTCTATTCTATTTACTGA
TCTATTAACTGGGAGATTGATTTGGGCTGCTTTATAATAATGGCATGCCA
AAGTTTTGATATGAGTTAAATGATAAATGGAgaatttcaaaccaaagaat
CTCTAAGGTAATGATGGTTAACCATATTTTCTCAGGTTCTTATATCACAA
CTATTGGAGTGGATTTCAAAATTCGAACAATAGATGTTGGTGGCGAAAGA
ATCAAACTTCAAATTTGGGATACCGCAGGGCAAGAAAGATTCAGAACCAT
CACTTCAACGTGAGTATAAAGCTTttataaactttactttttTACTATTC
AATCGTATTTCTTTTTCCTTTGATGAGGCTAGTAAAAGGGAGGGATAAAT
TCTTGCAAGACTGGCTTGCTTTCGTTTTCACTTTTACTGGTCAAAGCAAG
ATTTTTCGTCTGAGAAGGAAAACGGATTTTACACATCAAATTAACACATA
GTCTTCAGATTTTGGTAAATTATGCAGGATTTTGAAACGggaaaagcctc
tttatatacttcactTAGAACTTTTAACATTGCAGTTCAACAGTCAATTT
ATATATACAATAATGAACCAGTTAACCATTCCAGACAATAGACAATATTT
TAGGAATTACCAATATCCTACTTTCGATAAATTGGTAAAATGATCGATAA
TATTGAAACTCCAACTTATTGAGGGTAAATTGTATAGGTTACTATTAGCT
CACGAAGGAACCTCCTATTGGAAATGAAAGTATTTTCTTGATTTACTGAA
AAACCAGTTGTTCTCAAACAGTATTCCATTTAAATGTTATTTAATAAATA
ATTcttgataaaaattttgatgaaaagagCTCATGGTATTTTTAATGTAC
GTAAATAATAATatataactttttcaaaaattatcaacaaaACCGTGCCA
ATTCCCTTAAAACAGTACGGTTTCTCTTACATCATTACTTCACCTCTGAT
TTGGGTTTTCAATACAAAAGTAAGTAGATTAATTTGGTCGCTGTGGGCCG
AGCCAGGAGTGAGGGAGtctgtccccttttctatttgcgttAGATCTGGG
AGGtggaatgctgaggtggagagcCACATCTATTTTCAGCTACCAGTAAC
TTACCACGTAGATTGTacacacacacacGTCATAATTATGTTAACTAGAA
ATTTGTACGAATTCCAATCCCACTgttcatttcgaaatgattggAAACCC
GTGAAATTTATcgcctttcttttgatattgtaaGTAATTTACGTGCAAAG
GCAATTAACGCAAAGGAGGATGGGATTGCAAGTACAAATTTGTTACCATT
TTTAGACTCGCTGTGGTGTGCTAATCATTCAATCTTTAGCTTCATGGTTT
Ctttttcatagaattatatttcacaggtatatcgacctctacgaaatgat
tttgaaattcattttgtctAATCCTCGCTCGTCTTTCAGTTGCCAGAAAG
GGTTTTGGTTTTTGTTCTAtatttcgaactaggcgaaggctTCATACATA
TCTACACcttgttttttattagaaaatccaaaatttttgaagcctttgga
tgttcttaatatgttcttaaattttcttatttcttacattttttaaatat
tcttgtccattttcctttgaaatcggatgttttaaggtccgcaaagcctt
aaaatgttcttaacttgattttaacatttcggccatcgaagccttatttt
cttataaagtttgttcttataagaaaacgtgtattcattgtttatttttc
tgtaCAGGTATTACAGAGGTACGCATGGGGTGATTGTGGTTTATGACGTC
ACCAATGCCGAATCGTTTGTCAATGTGAAAAGGTGGCTGCATGAAATCGA
TCAAAATTGTGACGTTGTAAATAAAGTTTTAGGTGAGTTTCTGATTTATG
AATTCCTCCCAAACGAAATTGTACTGTAAGGAgaataatttttagaaatt
tgtagAAGTTTTCACCcatttttcagtgtttttggtTGATTTATGCCTAA
TTTTGATATGTAAATATAATGTAAAAGCGAcagtagcatgaaggtagagc
atccagctacgctGCGCAAGGtggtgggttcgatccccagtcgtgttata
ccaaagatttcccaaattggtacttgatacctctctgcttgatgctctaG
CAATTAAAGATAcgggtcaagggtaagtggagaaagccagggaaaggagt
ggcgccctcctcacctttgggtagacagctagagaaaagggaaCCTTCGG
gccgccctcgactgcggtcgcaaacttacttgaTATGTAGTGAGCATACT
CGTCATACTTTGTCTAAATGAATTATTTTTGCTTTCATATCTtgtctttt
cattttctaaacgTAAGCGACTCCGAATGAAATTGATTGGTTACTTTTGC
CCAATTTTAGAATTATGCCTACGAATGATTTTAAAACACTTCAGTTGAGC
CCAGTTCGACGgtcttttcattttctaaacgGAAGTGAATCTGAATTTAC
ATTgggttcttccagaaaatgtccttTCATgggggggggatggaggatat
agtgtccggggggtagtgaaaaatctacaaaatttgccttgtccgggggg
taaacttgctctttTTGGGGGGTAATTTTAATTGTCCatggggtcaacta
atgcttgtccgggggtgtCAAAAGTCGGAATGTCCGAggagtaaatttcc
aaaaaaaattttttctggaaaagcccattgtgcAGTTTTTAGCACTTTTa
taacaattttatttcatatttttcacaGTGGGTAACAAGAACGACCAGCC
AGAGAATAAAGTTGTTGAGACGGGAGATGCGAAACGGTTTGCTTTGCAGA
TGGGTGTCGAAACGTTCGAAACATCCGCCAAAGATAACATTAATATAGAA
GAGGTATGAtttgtatttttattaatttttaactGCCTTTGGTCTTCAGA
ATCTCATGAAACTCTGCTAAGCTAGGATTTAGTTTGTGTTTTCGCTTTTG
GTGGTGTTGTGAATTTTGAATATAAATCAATTTTCCAGTTTCTATGAAAT
CATTTATAAGAACGTTTACCTGATTCCATCTGTCTAACAGCAGTAGGATT
TTGTCTGGGCGGGATTtcctcaatatttttttttcataactacGATTATA
CATAATGTTTCCttaaaaatacataaaacaCAGTCATTGCAAGactttac
aaaaaaacattaggctataggcttggggacacgagaagcttttttcgcgt
tggtgcaatgcaacatgctctatcccaccaacacaagaaaaaaagtgcgt
gtcctaTGGTTTCTTTTTTGGTTTCATGGGataaaaagtgagggaaatac
caaaaagacacgctgattttgggacaaaagtgagaaaagcacaaaatgtt
attaaaagaaaactgGGGTAATAGTGACACGTGacagcgtttcaggttgg
tgggatggagcatgttgcattgcaccaacacggaaaaacttctcgtgtcc
ccgaGCCTTAAGTCATGCCTCTTTTTGTTCACTGCTTCTCCTTTTAAGGG
AAGAAATAGGAGAGATTTGTTTAtaaattctaatttttattttctcgaCA
GGTTTTCCAACATATAACGAAGTTAGTATTAGATACGAAACAAGACCAGC
AAGCCAAAGCTGATGACAACAAACAATCCGGCATGAAACTAGatcataaa
caaaagaaaaagaaaggcgGTTGTTGTAAATAACGTCGCGGGTTGTTTTG
AATCATGTCTTTTTATACTGCCGCTCCACCTGTAGATGGTATTTTTAAAT
GGCGATGCTCGTTTTATCGATATTGGAATTTTGATGTCAAATAGATTATT
TGCTGTTGCTTGGCAATATGAAACACATTTGAGGATAAAACGAATTTCCG
GTAAAGTGGAAAAATGGATTACTACTCGGAGTAACTAGCAATCATTTATA
TCGATGATGTTTTTTGGAGAGAGGCTTTTTCTGGTTGGTCTTGATCACTC
GATCCTCATACATTTACACTGGTTTATCAAGATCACGAAAATTCCTAGAT
TTATCATATGCAGTTCTAGACCAAATCGGCGTCTTAGATAGCtttttttt
ACTTCGCTATATTAATGGgtctttttattgaaaagtattGGTTTATAAAG
TGGTAATTGAATGCATTATAATGTATGAGTCAGTCTCAGTATTTCTGGTG
ACTTTGCCTGGTAAGATTAAATTACATTGCCGAAATTAAGGTAGGTTTGA
TTTGTATGaaaaaaaaagcaatcaatttttttaaccgCCATGATACTGCA
TATTaaaaaaaCATCGCCTATGTTAAATGTTTAGGCTTCAatgtgttttt
taaaaataaaaagttacattttgaaTATAATATCGATTTATTTTAGTATA
CTATAATTCCTCAAAAGTTTaggaaaattatataaatttagctatttttt
aatttttgttatttttctcctTCTTAGTTCATAGGGAAACCTGTTAATTG
CTTAATTTTTTCTAGCTCTCTATCTAGACAAcgattcattttttaattta
tcaacCGATTTTAATCAACCACAGCCTTATGGTGCGAATCTGTCTCCGCC
AGGAAATGGATTactgattattttttttcaaattggatctttcaaaacaa
acattaaTGGATTCCCTTTTTgattaggctgcac
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000094_pilon | genome | sc0000094_pilon:616320..624803 + |
|
