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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000089_pilon:1012079..1025434+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12081 ID=MSTRG.12081|Name=MSTRG.12081|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=13356bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:1012079..1025434+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aaacatcATATAATTTCAGGTCATAGCAGCATGAAGGAACAATGAGCATT
CAAGATGTACCTGGGCACTCAGCTACCACCACCGACCAAGGTGACGCTTC
AATTTGCACTCGTCATGCTATCGCCAAAGCTGTCACACAGCATGCCTTTG
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TTCATCTGCTTGAAGAACGTCACGAGAGAGGGGATAAAAGGAAACAAAGA
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TCGATTTTCAACCAATTGTCAATTAATTTCTcaatatacagggtgtcccg
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atgtttctctcaatagatatgctttcattttctttatttttttgtatttt
gaccagttatgtctgatgtgtttcattgtttcaatgttggctgattagtt
tgatatctaggtaggtccataaaagtatcgcttgtttacCTCGGATCCAT
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TtgctcaatttttgattttgaaaaaattaatcttCAATTGAGCATGAATC
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AATCAGAATAACTTAACACCACGTTTCAATGGTTGCGGCAAGGGCAACTT
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ctaaaggagataaacatttagaagtcaatatttccaagttcttataaagg
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ggaacggtcgccccagccaatgaaattacgacaaagtccaaaaaatatca
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caggaattgtgttttagtatcctttactgaattatcatagtgatatgttt
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gtgaaaatttctccaatcttgttcaaatttacacaggaattgtgttttag
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gctcctaggccggagcaattaatcgaacagttcgattaccaAACTATTAT
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AAACATATAAAGTTCGACGACAAGAAATCTTCGACAAATTCGTCAAAAAA
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TAACTCCGTTCAACAAATAGACGATatcgtgaaaactcagatttgacccc
cgagaattgcccacaatgctttgcgcggaaaaaagttcatgGGGAAATTC
TTTCCGCACAAtgcattgtgggcaattctcgtgggtcaaatctgagtttt
catgtgacGCCGATATGGGCTATTCAACGAAAATTCTGTTTGAAGGGCTT
TTCTCAAATTACTGTTCGATTAAATTCTGCAAATGTCGATTAAGTTCAAT
TAATGTAAcgatcaaactaatcgaactattAAGGTCTTTTTAGTTCGATT
AAGATCGATTTctttaatcgaacttaatcgaactttatattttgaagaat
ttgcaGTATTCAattaaagttcgacaaccgaacttagtcgaacattaatc
ggACAACAAAGTTCGATCTGGCAGGGTCCCAATACTAATTAaattcaaga
tgtgtatctgacatggtcaacttttttacaattttcagggtggtattaaa
aaaattcaattttcgtctacttttagtcattttgggCACATTTCAGGGTG
TGAATGGAAAAATCTTTGATAaatttataataatataattatTTTAGTGT
CCCTTCAAAATAATTGGCTACTTGATATTTTGAGAAGAAGACAGCAAAGA
ATGACTATAAAATATCGTTTGCAAATACTTGCTTACTAACGTTATACGAA
AATGTttctttctgacagggtcccaaattcaCCAAACATTTATATttgac
agggtccatttttcaaactccagcagCACGTCCCCGTCGACCGTTATTAT
TTACCCCGGGGTAAATAATTTCTAAAATGTGCCTTaacagttttttataa
gaaacacatAACTCGAAATACGCCGCATGATTCTTAAAAGTttgcaattt
tgatttttcagataTTCTTATGTGATTCTTGAGTTTTAAAAGACTAACAA
TTGATAAACTAACTAAAttaattttgactattttttcaCACATGCTTAAA
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GAAGTCTGCAATCTATGGTGGACTGAGAAACACTTCGAAGAATACTTCAC
TAATACACGTAATCAAGTAATGTTACATTTGTCACGAATGATGACATGTG
GCTTTCCCTATCTACTTTGTGCTATACAAAGCGTAACAAGCGACGACATT
TCATACTACACTTACATGACTATTTGAAACATAACCTCACTTTATTATGA
ATGCGTGTCATACTATCATACCAAACTTACACATCACCCTCTACCATGAT
GACATAATACAAAGTGAGTattacaatatacccctcaggtaatggtaatt
gcagtaatttcggtaatcacggtaatcacgcccttacgccacaatatatc
gccctttataacgccacaccataaaaatcttgtcattttattcaaaactg
aggttgggcatgttcttacgatgttcttctaatttttcgacgaatttcag
cctcaatgttcttataaactgggttttAATAAAAGAAGACGTTTATTGAT
TTGAAACCTTTCGTTGAGAAGTTACGAATTTTCTCAAATAGAAGTCTTTT
GGTTATTATTGTAGCTGAGTCGATGAAAATCGAtagtttgattttaaaat
tttagaaaaaatcttaCAAACCGGAACAAATTACCACGGCGTTTTCTACT
TTTTCGGTGTTCTGACAACAAAAAACAGATCAGCAAAATGGACATGATTT
GCAAtgtctccccccccccccgagtaaaaaaaTTTACGCAAACTCTCCCA
CCTGATCTTGGAATCAACTAACGATTTCGTActccttatactacctgcgg
ttttgaaGAGGTCTGCgcttttgtagaggtctgcgattcagactaccacT
TGGGTGCTCTCCCGAGCCTTTTACTAAATTTTCAGGACTTCGGACCATTT
CTTTGGATTCTACACCcaaaaaaatagaatatcaaaaCTTCGTTAAAATA
TTGACCCGGACCAGATTCGAACTCACATTCCCAGTGCTAGGGACCAGTGC
TCCGATGTGGGTGAAAACTTACCCCCTCTTGACCTACTTTTCAGACCTTG
GATCCACTTGTTTGaattatttattcaattttactgTTCCTTTTACaccc
aaaaaaaaacacagaaaatatCGAAATTTGGTGAAACTCTTTGAACCAGA
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CGAGTTCTGTCGAACATCGGGGCGTTATCTAAGGAATGCAATGGCTTGCC
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aacttttattttgagaattttgaaaatgggtCAGCAACATTTTGCTTTGT
CTTTGATCTTCCCGCAAAAGTTGGATCAAATGTTCcctattttgaaaact
ttacaTTGGTAAAATTCAGCATTCGAAAGTTCAACATTTCATTCAGCATT
CGAAAACTGGTATGTGATGGATGAAATATTGGATCCGTTTGCCCTGGCCT
TTAGACATTGTGAattttcattatctttttttAGCGGATCCGAACCCAAT
GTACGTACTTGTATACAAACCTTATCCAAAGAAAAATCCGCATTGCATCT
TCGTAAAATCTGTCATCGATCGTCATTTCCATTGCTTAAACAGTTGGGGC
GGACATGAACCAGAACCTAGAGTGCCGATCAACCAGGCGGAGAACCAATT
GTGGAAAATTATGCTGAAATATGACAGAACCCCTGAAGGTAATTAGACTA
GTCTAGAAGAGAATCGAATTAGAAGTACAATAAAAATGACACGATTTCTT
TTGGTcacgtttcttttttattaagttataattaaatttttttacgGGAT
CCAAATGGATAATACTAAAACACGCAACCAGCCAGAAAAGGCACAACCAT
CAAGAAAAAAggcacaaccacccacaacccgCCAGAATAACGCATAACCA
GCCAGAAAATgacacaaccacccacaacgaGGTTTTGCCTTTTCCTGGCT
GATTGTTGCCCGTTGTTTCTTTTTCTGTCTGATCGTGAATGGGTCTTTCT
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ctggttttgggtggtggtgggtggttctggctcgttgtggatggttgtgt
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ttgtagatttttcaaaaataactggCGAGTATTTAATAATAGTAACTTAG
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GAAAGTCTATAAGATAAAAGAGCTTTTACTACTTCTTGCTGATGCACATG
AAGCGTTCAAGAACCGAAagtaaaaatttcctttgtttctttGGTGTAGG
TTTGAAGCAACTTGAAACATTGAAATAATGAACTTAAATTATAACTAACT
TTTCAAAATACAACGAATTCACGATCATACCTTCCCTTTAAGACAATCGA
GAGCTAACGACTCTTCGTCAATTAAAAGTAACAATGCAATGCGTTCGAAT
CTTTGTTACGTatatgaccggttagtgagggctgtactgagaaatgtgcc
cgaggtcaagtaacgtcCGAGCTTGcaaggttgttgcgttgaccgagggc
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GAAAGTGATTTGTATATAGCTTTAATTTTGATAAAGTGTAAAATCATCTC
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CTTTTTAGGGAATGAAAATGTCTCAAGAGATGATTCTTCCTacataaatg
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GGCAAATCAGACAAATCGACTCCAGGTTGGTTGGAGCTTTGCTTATACTT
GTAACTTGTAACTTGTACTCAAACAAAGGgataaaatcttgaaattcaat
GCGTGTATGGTCATTTCCAAACCCCACGTATGATTTTTTCGAAGGCCTTG
GTGTTTTTATTCTAAAACATGATAAGTAGTGTAATTTTTAGATTCTGAGA
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AACCCGAATATAGCCAATTTACATGCATGACAttttttttCCgataaaaa
atgtttagaacaagttaaaaCTTAAAGGCTTTATGGGCTCTAAAAACATC
CAATTTATTAGGAATTTGCACAGAAAGTACtcttaaaattgtaaaattaa
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TAGCTTTTCTTTAGGTTCGTGTTGCTTGGAGGAGGTTCTTGATTATATCT
CGAAAAAATTGACACACGAAGAATCAAAGAAACTTCTCAAAAGCCTTGGG
ATAGATGATAATGGCTCTCAAGAAGAAATGTCAAAAAGATTGGAAAACAT
CGCATGGTTTGACCTTAAGAAAGAACTTGAAATGATCGGAAAAGATGATA
TTATTGATcatatcaaaaagaaaactttgatCACCAAAGGTGTTCCTAAA
TCAACCTTTAATTTTGTTTCGCTTGATGAGAATTTGCACATGCAATCAAA
ACTCCTGAAAATATTGCTTATTTCAGCCCATCGTGGACTGTTTTGAGCTA
ACTTCGAACGCATTTAATCATTCATAGAAAAAGAGGTTGACTTTTGGTTT
GGTCATAAATAGTTGAAATGAGAAATACTTTTTGAGACAGAATTTCcaga
tattgaaaaaaaaaagtgaaattcaagCTATAGAATGATATATTTTCTCG
TTCTAGGTCTGAAAACTGCATCCGATAGATTACGCAAACATTACGTTAAC
GAATTGAAGGATTATCTCGTAGAACAACCCTTATCCCCGTACACTGAAGA
TACAACTGGTGCTAAAAGAGAAGACGTCTATATTGATCTTGTTGTATTAC
CATCAGCAGATGTTGACAAAGAATGGTCGAATTCTGATCGCGCTGCTCTG
ATTGAACAGCAAAAGTACAAAAAACGTGAAAAGTCTACAAAAGATATTAA
TCAAATACTTCCTTCTGATAACGAGGCTGTCTTCGTGAGAGGAGTTGCAG
GAATCGGAAAGACGACCCTCCTTGACATGTTCACTTATAAATGGGCGAAA
AGAGAGCTTAGAAATACAGCTAGTATTGAATTTATGTTTCATTTCCGTTG
TCGAGAGTTAAACATTATTTCGAACAGTTTTAACAGTCTTGAGGGACTTT
TTCAACTGAAATATCCTAATTTGGAGATTTCATTTAAAGATCTAAAGGAA
ATTTCAGAGAGAGTCCTCATTGTTGTAGATGGACTTGATGAGTTAAATAT
CTCTGAAAACTTGTCGACTTCAAAaacgaccaatcaaattgtcTTCAAAT
TACTCAACCCTAAAGGAGCTTGGCTTCCCAACCATAAAGTGATCACATGT
GGACGACCAAAAGCTTCCGAATTCGTGAAAAAGCAGCTCCCTGTAAACTC
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AATATATCGAAAACTTTTTTGGCGAACAGAAAGACAGGGCAGATACTGTT
CAAGAAAGAATCGAGCAATCATATGACTTACGGATCATGGCTCGTGTGCC
AGTATTTTTATACAGCATCTGTAGTGTCTACAAAGAACAATTGATAAGAG
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atcaaaaatcatttcaataaaaaatcaaaaggttACGAAACTGTGAGGGA
TATTGTACAAGACAAAAATGTAGCTAAAGTCTTGTTATGTTTAATGGAGC
TGTCTACTACAACATATATGCAGAATAAAATTCTTTTCCGACAATCGGAA
ATTTCATTATTAGATTCTCCGATACCATTAGAGGAAACTGGATTTTTATC
TAAACATTCTTCAAACCTTTTGGAACCGAGTTTTCAATTCCGTCACCTTA
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AAACCATTCTCCGGGAATGTAGAATTGTCGAGTTGCAAGCCAACCATTTT
GGGCATACAGCGCATGttgaaaatggaagaaaatgaactttttctGCTAC
TATATAAAAATCTGGAAGCAATTCACCAATCACGAAAGCCCGATTCCAAA
GCAGAAACAGCCTTTACATTTGATAAATTTGTCggtgaatttctcaaaat
accaCCATCTATGATTAAAAACAATGGCATCCTTATCATCGATACCTTTG
AGAACGATTGTGTCGAATTTCTGACGTTATACAAAGAATCGCGTGAAAAT
TTCATCCCAGCACCGTTTACATCAGCAGAGATCAACGTTAAGGGAAATTA
CAAAGACGTTCTAAACATCGttaatttaataaatgattTAAACATTAAAG
ATATCGATATGCTTCACGTGGATGAACCAAAATACAGTGAATATGAAAAG
CATCTCATTTCGTTATCAGCACTAGGCGATGACTACAAGACAGTCATCGA
GATTGggtatcaaaaatcttttagcTGCAAGTGTAAACAAGGCAAATTAT
TTATGTATTCTAATCCTTCTTCACTGAAGGGAATACCAGATGACCTGTTA
AAAAAGTCAACtttgtttgatttcaaaattgtttttgaagatAAATACAA
CGATGATGAGGCTGTTGATATATTGAATTTTTCGCGTCGATTGCTAGTCT
ACAATAAACGAATCAAAGTATCATACATTCAAGTCAATGGAATCAATGCT
TACAGTATCGTCACTTGGATGaatgaattgaaaataaaaaagattggtGA
ACTAGTGGTATGTGAGCCAAAATACAGTGAGCATGAAAAGCATCTCATTT
CGTTATCGGCATTGGGTGAAGAATTTAAGACATTCATAACAATCGATGAA
AACGAACATGATTTCGGCTTCCAGTGTCAGAGAGGGGAATTAAATATAAA
TGTATGGTCCTTCTCATTGGCAGAGATACCAGACGATCTGTTGACAAAAT
CGATATCGTTTGATGTTAACATTGGTTTCGAGATATTGAAGGATGGTGAT
ATGACAGATGCAATTAACTTTTTGAGGCGATTGTCATCATATATAAAACC
AATTACAATATCAGGTATGTGTATCAAAGGTTTTAACGTTCATGAAATGG
CCGAATTGATGTTTGACAGTAATATTAGAATCACTGACTATCTTCGCGTT
AAATATCCGTCATACGATGAAGATGAAATGCATTTTATTACTCTGTCACC
GCTTGGTGAGGAGTTTGAGACGAATATCGAGATTGTGATGGAGAATGGAA
ATTACTTCAATGTTACGTCGTACTTCGAATGCTACCCAGGTCATTTGAGT
ATTGTTTGTCATTCCGTTTCTTGTTCATTGGTCGATATACCAAATGAGTT
ATTACAAAAGTCAACTTCCTTTCGTGTTTCAATTAAAGTTCAAAAAACTG
ATAACGATAAAGAAGCGGAGAATTTACGTGATATAATTAAATTCTTACAA
AGATTGACCTCAAACCGTAAACCAATTGTCTTGAATTGTTGGATTCATGT
GAATAGGTGGAATTGGATTTCACACGACGAAAAAACGATTCGTTCGATCC
TTGGGAAATATAACATTGATATGACAAATATTAACttcaaatcaagaaaa
taaggaatcaaaaagtttattcACAAAGGAATCTCGATTTTTCACTTTAT
TCAAGACTAGACCAAGATATTGATTTTTAATGGACGTTTTATCTTCTTTG
AATAATCCATAcacattgtaatttttaattaatttttggtttaaccaatg
aagtataagcctgaagggctaaaatcgaatctccttggtaggatttaaag
ccgacaaatcctaccaaagttgcgcggccttgagcggctcgcccacacaa
atgacagattgaaactaaaatttaccgctaaaatTCGAAAGAAATATCAA
TTGTAAagaaaggaattgctagattcaatctgtcgtcaaaaatacggcgc
attttttaaggcttcactttttcttgcctgagaaaggtcagagattcttc
tctagcccttcgggctttaaactcaatgggtttAACTTTTGAGCGCAGGG
TTACAA
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000089_pilon | genome | sc0000089_pilon:1012079..1025434 + |
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