|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000087_pilon:961264..967412+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11865 ID=MSTRG.11865|Name=MSTRG.11865|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=6149bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:961264..967412+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCGGGTCTAACCAACGCTTCATCGGATGAATAAACTGAGCTATACAACT
GCACCCGACTGAGTACAGTCATTCTGTCAGAAACATTATCAAAAGATCAA
TCGAACAggtatttgtttattttatcgatttttcCTGTTTGTTTTGGGTA
CATCAAGGGTATAACTATATATTCATGCACATATAAAGTATAATCCTTGA
ATTTTTGTATGGCTTGGGCGTTTATGTCCATACCACCATTTATTAATGTA
TTATTATCATCATTCTCATTGAGAAATgaataccgtgaagtcggggaacc
cagtctggaaaggagggAAATGTTACGCTGGAGCTGGGCCAACTTAacta
cgaccctcgacatggcctgagaatagaccttttttcaaagaggccaccct
gttgaataattatgtagtccagcagaaaaacaatgataaaaccatgcata
attattacaatacaAATGCATACATACTATctttgtttttatggctggac
tacataattattcaacaggacgtcctctttgaaaaaaggtctattctcgg
gccatgttcgggccgagagaccctatcaattctttcggcccgaacatgac
ccgagtcattcgggccatgttcgggccatgttcagaagattccatattta
aattgattcagcatgtccagtcaaacaaaatactacaaaataagatttgt
ctgttttgtttatatcgctcaaaaaaactttacaagcttcccgtggacac
gcttcagtttaaaaccaggaccagtttactagcaaatatttccaccctaa
gtatatttataaatgttttcataccaaataagacatttaatatttatatg
aatttacaacattcatatatttaatataattaagagaagtttttctcaaa
gaaaatgttaaaaaaattcagtcctgaaattacacgcctgtttaaatcat
gttttcaaaaattggcccgagtgtgacCCGTGCGTGTTGAGGGTTGTACT
TAACTGGGAAAAGTTGAAGGCAGCAGATCTCAAACCTTAAATCTACGCCT
GAGATATCCGGCGCACAAGCCACAattcttcttcataaagacgaaagaca
tatctggacttatttcgtactttccagtctcttgttggtagtttttctga
cttcctGGATCTATGTgatctatgttttctaactgacTGATTGACTTTTA
CCGAAAGATTGCCACCagggtgggattcgaacccaccaaatacTTAAAGt
tccatcgtttggaaatttATGAGGAAGAAGGAAATTTTTagaagatgctt
tattcgatatgaggatccccatttccgtaaaatcgcgattccccatggtt
gcgaaatggtggctatgggtggtaattcctttgttcttttgctattttct
attgttctatgtGACGTAAAGACACTTCACAAATCGATGTACTTGCAGTA
ACTGtcaatgccttatccactgtgCCATGGATTCATGCTTGGAGAgtgtt
tctgacggctatttatattgtatatacaaactacagaccagactatacgg
aagagaaaatcacaaaagagtactttttttctagctccaaccctaaccat
AACTGATAATACCCAATTCCTATTTggtgtaacttttttattcaattgag
cataacttttatctaatctaatgaaccaaattttataaatcacccatcaa
aatttaaatttatctctcttcaatgaaaaagaattgattatttttgaatt
tttagaccttgagaaaattcactttaaagagagaaaaGGATTTTGTGACG
CACCCAGTAGTAGTTaattttgatataatacatctttaaaatgtatagca
atgtatacaatctttaaaagaaagatattattagtaattatgaaaacttt
taattGGAGCTGTTAGTCGAATTTTGAATAAATCCTGATGTTAATTGtga
tcagaggaatgtaaagagatggaaaaacagcttttctgattactcaaagt
tcaacgatcacttctattgaaaattgtattgtaaaaacgttgattaggtc
agtaaatgaaagtccagaaaagactgctcgccatacaaattggacggttt
ctacatgatttgacgataaaaatgaaaatttgtttttccttttttgccga
ttactagttcaatttttaagaataaggagcaatatttttaccaatgtata
gcaaaggAAATTCTTAActcaatgatattaaattggtttttgtaaaactg
tcagaagttgagtaaaatcaagatgaagttataattttctcgatctctag
ctttccatattatggtgctgtcatgatgcggttatatcagtagaatcgct
aggaaattctgagcaagaagatattggtaccttttcgtataggagaggtg
tacccaaaatataactATAAGCcttaaaagtttgcgcataatcaggcttg
aaacaaaagaattttgtcgcaacacgctaattatgcagattttttatagc
gacaacaaaagaaacctatttactcgacataaactcccttactggcaaga
gacctggtatatgacgagctgtttttccatctctttacattcctctgttg
TGATGTACTATCATTCAACGTGGAAATCTTTGGTTAAGGGTTTGATCTGT
TTAAACtggaaaatcggattttacctgaatacaatattttgaaaataatt
actcCTGTCGTGTGTCAATTTCTAAATAGTTATCTGATttgtcaaaagtt
ttgaaaataaggAATAAAGAAAACCAGGCTTATTTGAGGGTGTAATTATC
TTGTGGCGTAATTGTTAGAGCTTCCAGTAATAggaaagataatatttttt
ctgGCCTTTTAAGGATGTTAATGAcaaattttttccttatataaTAGCTC
AAGCATCTTATCGACTGGCAACTTGAAATTCTTGTGCAAAAATCTAGATC
CCACCCCGAAtctttgaattaaaaatattttttacttttcaagcaaagat
cTTCCCAATGAGAATAATCTAGTGTTCTAGTCTTAAATTGATatgtttca
aaaatgaaaagtaatatAAACTTTAAATTATGGTAAGCAACCCGCCATTT
CCTTTATTGTGGTTTTGGCTTTCAACTAATAAAGGCTTCAATTTctgaaa
ttaaatttgaaatttattactGGCATTCTTGTAATTTGGTCTTATGCTGG
CTGTGTCTTATAATTCTGTCACCGAAGAGATTATAGTAGACATTTGATGT
GAATTGCTACACCACAATCTTGAATATCATGCAAGAATATGAAAGGCGAA
TCTGCTTGACCTCTTAATTCCTCAGAAAGTATgcaaatcctttttttttt
tcacacacaaaccaaaatctaaaattacttttcttttctaAGACGTAAGT
CTAGAAATTCCTTCATTCTTTTTTACgacttttcaacttttgatttaacT
TATTTCTACTAATTTCTCCACTACAGAAATATCGGAAAAATAATTAACAC
CTCCGTTTGTTTTCGTTGAAGTTTGTGGATTGGAAGCTTTCATTTATTCT
TTTAAATTGAATAagcaatttaaaataaattaaagtaTTAGATAGAAATG
ATGAAAACCAATATTATACTTCTCTTACCGATTCCTTTTCTAGTTTTATC
AattaaaacaaataactttAATTAGAAGAAGCAAATGGTGCGGGAGAAAG
GAGACCGAGAGAAAGAACCTCTTCTGCAGAGAGAGATTCGAGATGATTTT
CATGGTAGCACAACAGCATCATTATCGTCTGCGGACTATGATACTTACAT
CAAGCCATACATTCAAACGGAAACTGCAGTGTATTGGTATGTaatatttt
ccaaagttttcatgaaaaaatgtgtatttcttTTTAGTAGAATCTGTTAG
ACATTAACAACTCCAGTTGGTTATACTTAATTATATTACTCGGCTTATTG
AATGCAAGGGAGCATattttagagcatttctttttcaacgattttgttta
gaatttttcaatttttgacctttatttgaaaaaggttgtgcgagtttttA
TATTGAAGGTAATTAAGAATTACTTTACAAAAGTTTTATAATAATGGTAC
ATATATCAATAAATGGTAATCTTTTTAATCAATAATACTAAATTTACTTG
GTACTAAAGCAGTTTTCATAATTGTTATCATCAACTTTTAGGTATCGTTG
GTATATCTTAGCATTGTTTACATGTATTGCAATGATGTCAAACATTGGTT
GGAACACTTGGGGTCCTATTGAAACATCTGCAAGAGCAACGTATGGGTGG
AGTAAGAGTACAATATCATTGCTAGCCAACTGGGGAGCTTTCACTTTCGT
TATCGCTGTTTTTCCATCTTCGTACATTCTTGATCGATATGGTGAGTTTT
TACACCCGTCTCCtttcaatgtatttttcatTTACATTAAGCAATAAACT
TCTTAAAAGTTCTTTTCGAAATGGTCTCAAGAAAGATTACTTTTGATGAA
AGCTTCTGAAAAGATTTGTAGTTTTGATCAcgttttgtcaaatttttatt
tcttgtcACTTTAGAGATCACTTTCTCAAGCGCTTGGTGAAGCCAATGAA
GAAGtacgaaataaatttttgttttaggtCTAAGGGTGTCAACTTTGATA
GCTATTACCTGTTTATGTTTTGGTACCGGAGTTCGTTGTATCACACCTGA
TCCGAAATATGCAACACCTTTGATCCATTGCGGTCAAATCATGATCGGAT
TTGCAGGACCTGTCGCGCAAGCAGCTGCCACCGCTCTCTCTAGTGTCTGG
TTTCCTTCAAACCAACGCACCACAGCAACTGCAGTGGCTTCACTTGCAAG
TTATTGTGGTACTGCATTGAGCTTCTTGACTGGACCATCCGTTGTGGAAG
ATTTTGGTGATTATCCCATCAGCGAGGCTCATTCTAAATACAAAGCACTT
GTTGATAAGATATCAAAAGACATAATGCATTATTTGTACGTACAAGCCGG
TGTTTGTGGTGTTCTGTTCATACTCGTCGTATTCACATTCCCAAAGAAAC
CACCAAAACCTCCAAGCGCAACTGCTACTTTGGAAAGAATGAATTTCAAA
GAAGGGCTAAAGAAACTGTTTTTTAACCCTCAGTTTCAATTGATTGCATT
TGCGTACGGATTGACGACTGGCGTTTACAGCGCATGGTGCTCCGATCTTG
CAATCAATCTTAAAAGTTTCAACATCAACGACAAAACAGCTGGCTTCTTG
GGATTCTGGGCTGTGATTGCTGGTTCAATCTCGGGAATTTCCCTGTCCTT
GTGAGTGAAGATTAATAAGTACTGTTTTCTATAAGACAATACATCCTCCT
TAAAGCAAACAatgaaattttctgtcaagaaattttggctcatcttattt
ccagtaatttcatttcataaacTCGGTTAAGTAAGATTGGTAGATaataa
actttctttcaaatttaattattttaggATGGCGGACAAACTTGGTGCAT
TGAAGTTGTTGATCATTCTTCTGTTTGTTGTGGCGACTGGTGGTTTCGCT
GTCTTCAGTCTCATTTGCGTCAATATCGTTCCTACTTCCATGGCTTTGTT
CTATCTGACATCCGTTGTCGGTGGTCTTTGTTTAAATGGTTCTATCCCCT
TATTTTTCGAACTAGCTGTCGAATCGAGTTACCCTGTCGCAGAAGGTATA
AACACTGGAGCTATGACCTTTTCGAACAATATTTATTGCTTGATTTTCTT
ATCTTTGCCATTAATACCTAACCTGGGGACAGCATGGATGAATTGGTTTC
TTGTAGGTAGCTGTGTGGTTTGTGTACCCACTATGTTGATGTTTAAAGAA
CGGTACCGAAGGCTTGAATTGGATATGGTTGAGGGAAATACAACTAATAA
AAATGAGAGTACGAATAGTTTACCATCTCCTACAAATTACAATACttaaa
tttattcattttgcCAATTAACGAATATACTTAATGTGGATGGATTTTTG
AATAACTTTCTAAAttattttgcatttgaagttttatacttactttaaaa
ttaatgttttaatgttttaactgtttttagttttagcttctactctttcg
ttatttttttctttcgtgaAGTTCGATGGAATTTTGATGAATATGGGAG
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000087_pilon | genome | sc0000087_pilon:961264..967412 + |
|
