|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000087_pilon:773392..778825+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11851 ID=MSTRG.11851|Name=MSTRG.11851|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=5434bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:773392..778825+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttttttggctgGGGGCAAAACCGAGGGACGATTTTGAATCaagaaaatta
ttctttcaGTCAATGGAAGGCAACGTGCTGTGAGGAATGATATACACATG
GTACAACTGAAAAGGTTACTAAAGTTAACATTACTTCGAGAAAACTATAT
GTGAACTATTTTATCGTTGCAATGTTTTCCAAATCAGAAGATTTGAATTT
AGCATTTTCTGGAGCTGGGTTTATGGGTATCTATCACATTGGAGTTGTAT
CGTGTTTAAAGTTTTATGGAAAGAAACTGTTGGAAAATATTGAGTGTGTT
GGAGGTTCTTCTGCTGGAGCACTAACAGCATGTATGCTTTTATGTGACAC
AGATCTTGAAGCCAGTGTACAGTTTACAATGCATCTTGCTTCAAAAGTTC
ATGGGAAAGTTTTAGGGCCACTTAGCCCAGAATTTGAACCATGTGAAAAG
ATACGAAAGACATTTATGACACATTTACCATCTGATGCatataaaaaagt
ttctggAAAGCTCTATGTTTCCCTTACAAGAGTTTCTGATTGGGAAAATG
TCATTGTTTCAGACTTTGCAAGCAACAAAGAATTAGTAGATGTTAGTATG
ATTTCTGTTGATGTGCAATTTTTCCATAATTTCTGCTGTTCAGACAATTC
AACTTGAAAAGCGCTTAACGTTAACCAAgttcagtctgggaaatcctctc
aattgcacgcttatgttccgagggcgtaagcgcgtaattgcatggttata
atttacgcccgctcatcccgccccggttgaaattgcttagggatttcaag
gggttcagaattctctaattcgggcgaaggcatggtttaacgggcaatcc
atttttacggaatcttcttctacgataaattttgagtaaaactgcactag
gcttttgaaattcaacagagctttcggaaggaattacgtgtcaaaattat
agaaaattttaaagcGTGGCAATTACACGCTTACCGCAAAAGCCATCACC
CGTCAATCTTcttgcttaacgcttaccgcccgtttcagaacaatttcgat
aagcatgtaattacacgcttaaaaattctgccattttgataaccgtgcaa
ttgcgcgcttacggccttggaacataagcgtgcaattgagaggatttccc
agactgaagTTTATAAAGAATCAAGGAAACtttataaatttattcaaaGC
TTTGAAATGTGATGTGATAGTACTTATGAAGGgccaatataaaaaaaaaa
aggccTCCTGAAAAGACAGAATGACCAAAATATaagaatttcaaattcat
ttaaCTGCTTATAATTTTTAGGCTTTGGTTTGCACATCATTCATACCATT
TTTCTCTGGTGTTCTTCCTCCAAAGTTTCGTGGCGTGGTGAGATATATTT
CTTCAGTTTTTGCCTTCTTCTAACTTTCATGGTGTTTTTCACAATGCTTg
gatgatttatttttcaaaattctataaGATATTACTCTTTGATAAGATTT
CCACATTAAGCAGAGCTATAGTTTCCATACACTTAATATGAAATTATTGT
TATTGgaattatttcttttctttcagtcTTACATTGATGGTGGCTTTACA
GACAATATGCCACAACATTTTAATGGAATAACAATAACCATTTCACCTTT
TGGAGGGGAAAGTGATATTTGCCCAAACGATACACATAAATCACAAACAA
ACTTTGATATGAGGAACACCAGTATTCAATTCACAAGCCATAATATCTAC
AGAATGACTAGGGCACTATTTCCTCCAGATAATGATGTGTTATCAGAAAT
GTGTCGACAAGGCTACAGGGATACTTTGCGCTATCTACACAATAATTGTA
AGTCCCTTCAGTTGTTTATCATCCTAGAACGgctaaatttcttatttttt
gtatcATACACTTTTCAAGAATTTAGGATAGGCTCAACAAAAAGACTGTA
TATAAAAGGTTATACTGcctcagagaaaaaaaaattatcttgtgGTCATC
TTGGACTGAAATATGTAAAATGTAAAGATCTTCATATCAATTGTGATGAT
ATGGAAATGATCTAAAAATTGTACTTTTAGTTCAAACCACTTTAAGATAT
GTCAAATAATATATAatgtgttattttttgttttatatccTATTAGATCC
TGAAATGTTGAGTTTTGATGTAGCAATTGTGAGCATTCCACAATGTTGTG
GGTTTGCGACAGAAACTTCTGATGATGAGGGAAGTATTTGCTCCTGTGGA
AATGCAACATCTTCATGCTTCAGTGACATGGAACATACAATCGCTAAGGG
AAACATGATTGATAATTTGGTGACAGTCCCTGATCAGCTCAATAAAAGTA
AGTGTTTGGAAGTGTTTCTCTCCACTTTTCaatcaattcaattttaaaaa
ggttgaccttaaaaaaaaatacatttgatAACTATAGAATTTAAGAGTTA
TATAACCTTGTATTATACACCACAATACATAACATTTATAACAGTTTCGA
TTTATTTGAGACCTCCTATTTCATATTAAAGTAAGACAAAGAATCTAAAT
AAATGTCTAGACATATCAATTTTAATATCAAAACTACCCTATGATGCATC
ATATGGTTATGTAACTTTGATTTTAGACACATATTTTACTCTCAGTACTT
TGTAAGAAATTTTTTCTGATAACAACACATGAGACATAAAGCGTTTAagg
ttttgatttatttaataCCACATGAAAATTTAATTGAGTTTGACCAGGTT
TGACCACcctcaaaatatatattttctatttttccatttAGTTCTACTCC
AAACAAAAATCCTTTTTCAACAAAGTGATCTGTGCTGGTATTTCATCcga
acattttcaaatattgcCCAATGGATTGCCAAACCTTGTATTTATGCAAC
CGAACACGTCTCTGAATTTCTTAAAGAATTGTAAGTGCCTTAGCGTTTAT
CCTAAGATAGTAACACTTAAAAAAGACAACTCGGAGATCATATACAAAAT
CTTCCCACTATTAAGTCTTTCAAGCAAGCAATTCTCTGATTCctcagacc
cagtgctaactcagttttcagagctagtgacaacgatggtgttgttctcc
ttaaccgattaagggttggtttcagtcatcttcgtgagcataagttcaga
cataattttgcagacacagttgaccccttctgcaactgtcgacaaaattc
agtagaaacaacacagcatttttttgatgcattgctctgattactctaac
gACAGACTTGTGATGTGATGttcgacagccttcttcaacttgacataacc
ttgtttccattcAATCCCAAAACagtgtgtagaatacttctttatggcga
ccccgattttagcattgtccaaaatcatgatatattgagcataacgataa
aaaaaaaatttttttctgacgcGGCCGCAAACTTCCGTTCGTTAGTAGTC
CGTACTTGTTGTAATTTAGGGCATAATTTATGCTGTGtttatacataaaa
gttattcttaaactTTACTTCAATGAtccataaattatcaaaaatagcaa
attattttccggccggccgcatgataacttttttccttcacccgcattcc
ggaaacaaaacattttttatcattcgccTTATtagtttatttattaattt
attgttagcttagtttgggtcccttcctcctggcggtatgatctggtggt
ccttttgcgggaggttaggaacctttagttttgtactatttgtttgTGTT
ACCTATACTATAGACAACATGATATTCAAGCATGCTAGaattacaaatat
tttcttttagatATCCTACATGCATTAGTTGAAACTTAGGgtaaaaaaat
acatcaaaCGCTTTAGGAATTTgtgataaaatcataaaatactCACATCT
GAAAAGAATGGCTAAAAGACAAGTTACTCGATAGGACGTTTCATAACCCG
TTTCCCTTTTGGGTTTATGGATTAATTCAGAATAAGTAACCGAGTTTTCA
CTTGTAGTTTCTTTCAATAAACTCTTAATAAATTAATCCATCTTTCTTAG
ATTTCATTACATGATTCCAAGGATTAGAGAGCTTTGTGCATACAATTTCT
ACACCAAAAAGGCATTTGATATTGCGTTTGAAGTCATCCAGGCATATCAG
GATAAAGTCAACTTTGAATGGTAAGACTTAGGTTTATTTTTATTGGTGAC
AAAATTAATCAAATCTAAGAAATGTTCTATCCAACGACAGAAACACCATT
CAAATTGAGTTAAATAACCTTGATTTGTTCAGACATGTTTTCCATCATAT
TTTAGGCATCCTTCAATGAAAGAAGAGCATCACaatgaagttgaaaaaag
taagaatatatTCTCACAATttgaatactttaggcgtacaaactttcgcg
agaagACTTTTTCGCATgatagaaaaattgcaaaatttacgacatttact
ttcgtgaATAAAggcataaaaataaaagtttttacgCGGAAAATGACTCA
GAGGtgtgaattttcaaagacatttactttcgcgaaaaggatTAAGATTC
CCAAagatcgcgaaagtttctgcccaaaccaattttctttcaaaatggac
ATTCATCTCACGTTTCTTCTCTTTCCTTTCCCAGAAAAACGAAGAATCTT
GACAGCACAAAAGTCATTAGTGACAATACctattgtaaaaaatgattCAT
TATTGAAAATCGACGAAGAAAAGTCAGGTTTAGATGCTCCACCACCTTCA
CGTGTTTCATCCTTCGTTAAACTGACCGATCTCGATATTGTATCGAAACT
GAATTCGTACGTTTTCGACGAACAAGTTCTTTTTTCGGACCATTCATCTT
CTCCTGACTTGACTGAAGAAGATGATTATTTAGCTGAGGTAGACGAAGAT
GGAAAGACAATGTTTTGTGTCAAAGATGACGATGGTTTGGTTCTCAAATT
TGATCGAAGTCAATCCACATATGACCCTGACGATTATGGAAGTGAACTCC
AGTTGTACCCTGATCCAGTTTATGATGCACTGGTTGTGGGTCAGAAACGA
AGGAAATTTTCGTTTGATTCTGATGTCGATTCTTGGGATGATTTTGTGGA
GATAAATGGTTGTGATGCGTGATGACAGGTAGTGGTGGGTTTCATGTTCA
TTAATGTACTTATATCAggcataaaaatgaaaaaaactttgtttgatagc
CTATTAATTGGTCATACTTTCCGTTTTCTATctacagaagcagccaacga
gcccatttcccgaaaatatctgtttcccttttccaggagagagctttttt
tgaaaaatggggaaacagatccgattttctaggagagaccttttccttaa
aactatctgtttccccgctccagctgatgacgtcatcagagagaaacaga
tcaatatttctaggagatgacataataaattggg
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000087_pilon | genome | sc0000087_pilon:773392..778825 + |
|
