MSTRG.11811 (gene) -

Overview
NameMSTRG.11811
Unique NameMSTRG.11811
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000087_pilon:165430..173026+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11811 ID=MSTRG.11811|Name=MSTRG.11811|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=7597bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:165430..173026+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tgaaagtcgataaaccaaaaaagCAGCCGTGCCGTTTTTCACTTTGGTGT TGTCGTGTGCAGTGTGTTCTGCTCTTTTGCTCTTGATTTTTAAACAAGAA GTCTCCTGCAGTCTGCAGTGTCATGCCAGAACAAGATTCAACTACTTCAA GACCAGAGCCACTCTCTGGAAAACATATTGGGTATGAAGGCTATTAGATA TTTCTATTCAGATCAGGATATTtcttagcctgggaatccaagctcataat cttagaaaaaacaaaaaatacctcacctcacaaagttctaaaattataga gcttggtgcaggtagattagtctggcacagaatgttataaacagtctgtg tgtgaacccttgttgacagacttgctgaactttggaaacccaggcaaaca cacataatcatcAACTtcccataaaaactctttcacaagctctaaagact ttcaaaactactaaaaaccaaataaaaacatcagccacatgtatttagac ttccagccaacagccattttgttttgaaatgaatctatgttttcattttc atttgttttccttttttctgcagagtcagctttttccataaattatgcgc gcgcaataataaaaatgcgcgcgaaagtactgctaagtaatacgccgaaa gctggccaatcaggccgaacctgcattgcagggaaaaatctccctgcagg cgagttacctgcaccaagcgttaaaccagcagcaaaaatatcataaacta gactgtgaaaaaagtttaacgcttggattcccaggctagataTTTCTGTT TAATCATTTTTAGGAGAGATTGCACTACTAGTATTTTTGTTTGACGTCTA CTTTTACTCCAGCTCTTTTTTCTATTGATATCCATGGCTATGACCGAATT TCTATGTAGTATACTTACTCCAGATATTCATCTGTCCAGGTCCAGTCGAC GACAGTCGTTAATCAGTCCACCAGTCCAGCAGGttgtcacaggtcagtgt tgacaggtctGCTTCAattaccagacggtgtcaatccaacaagtttgaac aaaaatcacgctcaatcaaaccaattaaatgaaatgaaatgggacggcaa tttggccaccatttcactgtgaattttaacattttgacgacgaaaaccaa aatatatatttgaaaaaaagcaaaTTGTTCCCGTTGAATCTTTATTATAT GTTGAACCCCCAGGAGGAAAAGAACTTTCCAATTAAGTAACTATAAATTT CCCGGCTTGCTAACAGGCTAATTCCCacacagtctgggaaatcctctcaa ttgcacgcttatcaAAGTGCgtcgtaagcgcgcaattgcacggttatcaa aatggcagaatttttatacacgcttatcgaaattgttctgaaacgggcgg taagcgttaagcaagattgacgggtgacggcttttgcggtaagcgtgcaa ttgcacgctttaaaatttcctatatttttgacacgcaattccttTCGAAA GCtcagggcagttttactcaaaatttatcgtagaagaagattccgtaaaa atggattgcccgttaaaccatgccttcgcccgaattagagaattctgaac cccttgaaatccctaagcaatttcaactgGGGCTGGAGtgggcgtaaatt ataaccatgcaattgcgggcttacgccctcggaacataagcgtgcaattg agaggatttcccagagtGCCAGAGGAATTCTGATTGTAAACCCAATCAAT TACCGTCATCtgttctaacttgggacaattggtcgaaacatgggattgtt gatatctggcctgtattttcactcattgttaaatctctttgacaacaagc TTGTTtcgataactccaccaagtttatcaatcgtACTTTCTGTCATGACA TGTTACGATAACTTTCACTAGGTGGTTGTCTTctccccgtagatcttttt cttgggaatttGCTCTTCAAATTAGATTGCAGGGTTGGCTtggttcaatt tttttcatctatggctcaaaattTAGGTGATTTCTCAAGGTTTTTgaaga tttcattaaaaagtgccagtttattttttcataatgcTTCCCTTTAGACG TTTTACTACGCATaaagcgctttcgcagcattaatctttgatatatgaat ttcggcgggacgctagtgtgactaactgctagAATTTTATAGCTTTATAC GCCATTGGAAAATCAGAGTGAGCTTGTAAGTACCGCAAGAGGCAAGAGTA AAAATCTATCCATGTGCCTTCGTGTTCCCAGCCGTGCATAACACAGACCT GTAATACTTATTTTATATATTACAcctatatcacacatgtaatgaaaatt atctttttaatgttacatgcatgttatatgttatatacaaaaacatttat taaaaattattaatCTCACCTTTTGCtttaacaggaaaatagctatctca caatcactatgtcataCTCATTTTATCTCCTACAACATAATTACAAGAAT ATatgaaaatagcgtcaatgagattatattttatacttcataaatatttt aatatttcatcccctgctttgtatttttgataaaaattatgtcactactt tcatatctctaaaacagctctcttggagcattattgctttcaaaacctgt caatctatatccacttgcagtgtcagcatcctattataaagcatgaaaaa tattttattgttaattggtgaacaaaatattttgagataacGCAGGATAA CGTcattatttcataattttagtgtcattttgtcaatatttggggttcAT GATTTGTCATTTAAATCttctaaataacatattttgatattacatgtcca ttacatataattttttcagaaacttaTGATATGAATTGTATGTTTAGAGT GGGTTagagttttccggtctgtaatttgtatgtgTAGTGTTTTACACTAC CTGCCAGACAttacaaaaaatttgagccactcggttagtgtaaaatgcag gtcacaggtcacaatTTTTACTGTAAGTGCcataaacgtcaattttatat ttttcacatactgcaattgcagtagaTACAAGAAAAATATTCTAACTAAC AGAAACTCTTAAGAAAACTAGTCATATCGTTTTGATATACAGATGaaaaa aaGCtttctaattttcaaaactgttttCGACTGTCTAAGAAAGAATCACT TATTTTATTCAAGACTACATTCTAGAACCCTCTATTATCGACACATTGAT TCTTTTAAGTTTGCTAAgtatttcttcagttttttacaGTGCTcgatata ccgggtgcaccaaaaaaaagtatacaggtttgtggagatattgtgagctt caggatttaaattttttgttcattcttttttaatgattttcttaaatttc gaataactttcaaactactttttcagattttatgtaCGATAACTCGAAAT TCAAGTTAGGACATCCTCTatacgattaaaaaagaatgaacaaacaACTT atatcctgaagctcacaatatctcgacaaacctgtatactttttttggtg cacccggtatatgtAGAGCGATGTCAGTCAGGAAtaacatagtgtcctcc tgggttggttccccccactaaaaatcaaaatttttctccattcccccctc ttttatttcccccaccatatttcaaaatttttcggttcccccctcttttt tgaattcccccagctatttgaagattttgcggttccccatatggttaaca taaaaatgccttaaatcaagtttgaaattttggaaagcttgaaaaaatag ccttgaaagtgctggaaaaatgaaattgtattgaaaagttggtttatccc aaaagatttgctgattttattgcttaaacaggttttgcaacaagatcacc ttgagatcagtgaagttcccccagtcaaaatctcctaaatttatggttta ttttcccccagcaaatttcaaatttttcattttcccccatactttaaaaa agggccaaaatcagaatccccccctttataaaggggggggggaggacact atggaataaaacacacttttttattctgctactggcagtttcatgcaact ttggtgacaatcttcaggcaacaataaatattaaataatGTTGCCTGAAG ATTGAATTTAATGTATTGTAATTCAATCTTCAGGCAACattatttaatat ttattgttgcctgaagattgtcaccaaagttgcatgaaactgccagtagc agaataaaaaagtgtgtttttTCCTGACTGACATCGCTCTacatataccg ggtgcaccaaaaaaagtatacaggtttgtctctacaatattgtttttttc tcaGGTGTGGCTTTATtgagttgtttttattttattgcttGGAAAActga tgttattttcaaaaatgtgttTGACCCTAAAGGCAGAGATCTGCTCTATA CGGGGCATCTTCTTTTATAGATTCACCAAAGGttaaaggccggcgcaaat gaatccaacatttgatccaacattattgttggatcaaatgttggattcat ttgcgcaagttataaaattgcaactttttaagaaaattgctggaaatcat gttggatgaagtttgatcgccgtcaaacttttcatccaacattttttatg agattgacgtcacttttatgttggtttcaatgttggatacatttgcgtaa tcatgttggatgaaaatgtttgacgtttttgcgcaaatgacttttcatgc aacTTTTCGAATCTTTCCACGTGACTTTTCGTCCAACATGTCGTCCAACA ATGAattggaaatgttggattgaatgttggattcatttgcgccggcctta agTCTTGGTATTGACCTCTGTTATATGTAGCTTTTTAGCATAAATTGTTC TGTAGATgcagtatttttgtttttaggtcCTTTGCTTACGTCACGATTAA GGATCGGTTACCaggaattttgaccaaagttttGGATCAGTTCAGTCGGC TAGCAAGTGATTACCACAACAATGGAAAACCTGTAAGAAAATCCACTGTG TTTAAAAATCATGAATAGACGGACTTGGTCATTTGAGACTCTTTCTTAAT ATTAGAacaattttgtaagaaaaatgagccccaaaagcaaaaaatggagC AGTTTTGGGGATATTTAAAAGAGTTCaatgttcaaaaaaataaaaaagag ggcacaaagtcctgatgaaaaaaagaataagGTTGAAGCAATTTGATGGT TTGAGTAAGCTGAAAAGTTTTACCTGACCTTTTGGTTGATATTGTAGGAG CATGCAGAGGATGCTAAAGCTATCGTTGGAAAACTCTCCAAAATGAAGAA CGAAATCCAAACGAACAAACCGATCTCGAAACTTGAGGATAATTATACCG ATGTTTCAGTATGGAATGACTTCATCCAAAACATGTCATGTCTTGTAGAA GGGAAAGATGACCTACAGAAAGGCTGGTTTGATGTGGCTTGGTTGTCTTG CGAGTGTTATTTATACAGACGAATCCTTTCTGCTTTAAATCAAAGGTTGG TAAAGTTCTTTAGCACACGCCCTTCTCACTCATCCACCGGGACCTTGTTC CACTTGGTAAATGGGCCAAAATACtgcaaaaatatcgtcccaaGTAGTTA CACTCTATTTTTAgcccccgctgaaaataatttgaGAAGCAactcctcac tgcaaaatagtgtgcgattttttccatccccatcgAATTTTTTggctcga aaaaaaaaatggagTTCAAATCCCCAACCATaaaaaaaaCATCGGAATAT CAAACCCTCTCGAGTTTTTTCACCCCCACTAGCTGTAAAAATCCTACTGA CTGGGTCTCTGAGAAGTGGCTGTATTAAATTGCTGGGCTCCTCTAACGCA TTCGTGTTTATTATATAGCATACTAAGGTTTCGTATTGGTCTTTAATCCA ATTCTCTGTCTTCTTTGTTAATATTTTAGGTTACTTTAACCTTGCTTTAA TCAACTTGTCATACTATTGAATTTTCAGGAAATTCTGTTATTGAACGCAT AATGCTTCATATCAAAATATAGAAGGGGAAGCTTGATTTGATAACAGAAT GGTGTTTTCTTGATAGCCTTCTTTTCAGCAAGATCTTTTCTGGTTTTATT TTAGCTCCTTGCACCAAGATTTCGATCCTTTCTTGAATCAAAAGGAGACA GCCTTCAACACCTCTATCACCGCCATGAAAACATTGGCACAATATGTTTT GGCTTTCCTTCAAAACATGGAAGATACGGATGAGAAATTGCGAATGGATT TTGATACCCTACTTGAAgtaagatttattttgaaaatctaatactcattg tttttttgcttCACGAAAACCTTGTTTTTGTTCTTTATACACCCAGATCT GTGGAAGCCCAGACTCCTTAGTCGATGAGCTATGTACCTGTTTCTTTGGT TTGCAAAGCGGTTCACAATCAGATCATTATCATGTCGATGAAAAGTCAAT AAGAAAGAGAGGGATCTTTATAtcgtcttttttcttcttttagtaTTGTC TTTGGGGCAATAAATGTGATCTATCTATTTCTGCTGGAGTTCAAGTTTAC AAGCAGTTGAAAGAAAGTGATCAATTGAAAACtctctcagaacacatcat aTCGAATCATACGGAAAAACTTTATCATTACATTTGTAAGGAAAAACCTC TGGCTCGTGTCGACTTTATTCTTGATAATGCTGGTTTCGAACTATACACT GATCTTTGTTTAGCAGAATTTttactggagaaaaaaatgtgtaaacaAAT TCGATTCCATGTTAAAGACATACCCTGGTTTGTATCGGATACATCCAGAA AGGATTTCCTCTGGACTATCCAACAATGTACCCAGAGTGAGGAAGAACCT ATTCGCTTGTTGGGACAAAAATGGCAGAAACGGCTTGACGATGGTACATT TCTAATTGTGAATAAACCTTATTGGACTTATGGACAAGACTTTGCAGAAA TGCGAAAAATTGACCCTGATCTATATCAATATTTATCAGAATCTGGCCTT CTCATTTTCAAAGGTGATTTAAATTACCGTAAATTGCTTGGTGATCGAAA CTGGCCGACCACCACAAGTTTTGATAACAGTTTGTATGGTTTTTGTCCAG CACCTTTAGTGACTTTGAGGACATTAAAGTGTGATATGGTAGTCGGTCTC TGTGAAGGGAAAGCAGAAGAATTGCAAGCTATCACCGATCAATGGATGAT CAATGCCGAATATGCTGTTGTCCAGTTTTGTCAAAAACTATAAGCTTTAT TTATTTAGATTTTCTTATATTTTGTTATATTAGCACCCTCGTGTCACAGA TCCGACGCAAGGGATATCTCCAGAGATAGCTATCTCGATTCATTGTACCC CTTTGACTAATAGCGTAGCTGGACTgagcacaaatttattttctttgaac catGTGTGTCGTCGTGATAATAGATATTGTCTTTCTTTGACCAATAAGAG GTCATTCCTCatgttttttcaaccaatcagaaatactttttaataaaagt acTTAACAATGAAAAACCATCGTCAGACAGATGGAATTTGCACGGAA
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11811.1.p1MSTRG.11811.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000087_pilongenomesc0000087_pilon:165430..173026 +