|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000086_pilon:483855..489617+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11744 ID=MSTRG.11744|Name=MSTRG.11744|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=5763bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:483855..489617+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAAACCTTTTCATCTATCTCCATTtcagtcaaaataaaaaaaaaacaat
ttacaaTAAAACCTTTACACGAATACAAAAGCATGAtatatttatgacgt
cattattgcaGCTTTAAATGGTTTCATGGTTTTTATTTTGGCGTGTTATT
CCATCACTTTACAATTTACTGCCCATCCAGGAAAGCATATAAAATCATTT
TGTGGAACTGATGAATTTCATGAAAGGCAAGATCTCAACAGGTGGTACAT
CCACACAATATGAAACAGTGGAAGACTCCAAAGATTTGAGGATACCTGTC
CAAAGTGAAGAAGCTTTCGAACATGGAATCAATTTCAAATGCAAGGTAGt
tgttagactggagtcgtttaatTCCCTTTAATACACTAATATGGGTGCTA
TAAGATGATACAATGAtagttacgggataatatcagttttaCACTAATAT
GGGTGCTATAAGATGATGCAATGAtagttacgggataatatcagttttaC
ACTAATATGGGTGCTATAAGATGATACAATGAtagttacgggataatatc
agttttaCACTAATATGGGTGCTATAAGATGATGCAATGAtagttacggg
ataatatcagttttaCACTAATATGGGTGCTATAAGATGATGCAATAAta
gttacgggataatatcagttttaCACTAATATGGGTGCTATAAGATGATA
CAATGAtagttacgggataatatcagttttaCACTAATATGGGTGCTATA
AGATGATACAAAAAtagttacgggataatatcagtttagTATACTTCAAT
TTGCCCTTTTAATTTTCTACTTTGTCTGATTTATTCGTCTACATGCTGGA
CTAGTATATAATTGGTTGATGTTCTATGGGGCTTACTAACACAAGTCAAA
AAGCAGTAGCCAAAAACTATAGTAGTTATCAAGGGGTGTCAACCGTTATT
Tggtaataccgagtttatgtatcggaggatatcgacggcgacggtaagtg
aaatcgatacaaaacaaagtcggtagttgatgtacggctctatatcgcct
ttgctcaccgaAACAGacgtttttaccgtcgtcgagcaaagtggacggcg
atttcggccctatgtcagctttgctttataccgtccccctcgatttatct
cgaatacataaactcgctaattgACTTCAAGCTCTCAGTTTTCTAGGAGC
CACTCCTGAAACTCAATTGGCCAATTGTAACTTATTACACCAAGACATCa
gcaaaattaataaatttttatttttgtttttcagtatATTGGTACGGAGG
AAATACCACGTCCAAACAGTCGTGTGGAAATTGTGGCTGCTATGAGAAGG
ATAAGAGTAAGAAAGATTTTCTTACATATATCACTAAGTCATTATTTGAG
AATTAAACCAAAAATCTTCACCGAGTCTAACTTgcatgaatgaataaaaa
atctttcatggCCTAAGCAAGTCATTTTAGCGTGACTTGAAACTAAGAGC
TCGAAAAGTTCATTTTAGATAATGTCTGAATTTTGACCATATTTTTTCGA
CAAGAATCACAGAGTTTGGTCCTGTTTTGAAGTTTTGTCAACCTCTAAGA
TATTAGAAAGAAACTAACTTGAAACCACCCTGAGCTTTGGACAGTTTTTT
AGAAGCACtttcaaatctttattttcCAGTACGAACACAAATATCGAAAT
ATAAAGAAAAGGAAAGTGTTCGTCGATATTTCTGCGGATGGCATCAAAGT
CacaataagaaagaaaaagaaaaaggtacaaAGAATCGATTGGTTTATTT
CCGATATTTCATATAAATATTACTAACATCAACGTTCTAGATCGTCACTA
TCACCTTGTCGTACAATCATTGGTCTTTAACCTCTGATTGCCGGAGCctt
ttttgatatgttttagaAAGGTTACAAGGTCATTTAAATGTTAAAGCGCC
CCTACAATATTCTCCCTATATTCCAATGAAAATTAGGCCTACTATAGACA
AAAGTATGTCTCCATCGTGAATTGCAAAGTTCCTCGTTTCATTTCAGAAT
GTTAAACCAGACGAGAGTACACTTTTTATCATGCAATACGCCATTAACAG
GTATTTTACAGGGATGGTTCAAAACTTGTCAGTGTTGCTTTAAATCTTCA
TTATTTTCAATCCATTCTGTATGTAAATAGTTTGAACACTGATACTGAGA
ACAGGATTGCGCTATCGTGATTCTCGGAATcagctgaaaaatataaatGG
GCTATATTACAGTCTATCATTGGTTGTAATgtgaacaaataaaaaaagag
ctCGATACCagtgataaaaaaatcaaagatagagctaattttgagaaaaa
agagaatatAGAATGGCATAGGGAAGCCAAATCGATTCCGCCAATAACAA
TTGATTGATGATTGGGACTGAGTAAGTAAGATATCAACTGGTAACAACGA
CAATTTAAATTTCACGCCATGGTTACCCAttggaaatctttgaaaaagtt
cattcaattgtttttctcttttttatctcAGGGTGTTTTACGTTTCACAC
GATTCACaagatttaaagattttcagtTACATTGCACGCGGTGAAGATGG
GGTCTTCAGGTGTTGTGTATTTAAAGCCCTCGGTAAAGTAAGTgctttta
tttatctttttatggCTGAATCGCCAACACCGTACACCGTAAAGTTGCAT
TTTACTGCTAAGCTTTTAAGCTAAAAAACGCGATTTGATGTCCTGCAGTA
tttttttGTGGTTGTTATGATAAAGGGTTTTCATGGTCGGAGGGGAGAAG
AATTGACCATTTCTTAGTCTGGTATGTAATTGGTATGGTAAGGTAATTCA
GCAAAATTGGAATTTTGGAACCCAAAACAGGGGAGACAgaaaattggtca
tttttaTCCGGAAAAACGGAATCGGGAATTTCAGAGTTTCGTTTcataaa
acaaatttcaaataaattctCGTTGGccaatttttggttttcttttggAC
GATATGATTTACATCTGCTTTGTTTTCGACACAGTCGCAAGCGATGCACG
TCGTTCGAACTATCGGGCAAGCATTCGAAGTGTGTCACAAGATCAACAAA
GTTCGAGATAAGACGACGTCGCCAACAGATGAAAAAGAATCACCGATACA
TTCAGACAAAATAGACGCACAAATTACTGATACCGACGAGAAaagtaaga
aactttttctaCATCCTGTCCAAAATGGAAGATTTCGATTATTTAGACAT
ATAATTATATTGTCTTTGCACAGTTTGGCGAAGTTCTTGTGGGATTAGCA
TTTTGTTCGGAGCTTCTAGATTCGatttatgataaattttcaagCTAACG
TTTCCCGGTTAGGCTATCAAACCAACTTCATCGGTAAATTTATTCTAGTT
CTAGAGactataaaaatgaaactttactTAAGGCAGAAGTAGCACTGACT
ATTTAATTACTCGATAAATTCTTTCTCCGACAAAATATACGAAAGTTCCC
GATTAACCAAGGTATTCTTCGTAAACTTCTTCCCTAGGCCCAGAAGAGAC
GGATATAGATGACGTATGCGAGTCAGACATTGATTCTCCCAACATCAAAG
GAGGAACACATGAACTACAACCATCCACCTTAGTGACAGATATCGATAAC
GTTCGTAATTTGAATGAACTCCCTCCACCTTTGGTGCCAACAAAACAAGT
TCATGGAGTGGTAcggttttcttcattttcttgagctatttcttcatttt
cttgagctatttcttcttcttttcttgaTGTGTACTTCAATAACATTATG
GGAAAGTCGTTGATTATACCGTTAGAAACTTCTCCGTTTTTTCGAATACC
CTGTCCTCGTAATGTAAGAAACATCGGGATAAACTGAAAAATTACTTCTT
CAACATTGAATTCGGATAGTCGTGATAGGTGTTAATATAAGGTGTCCCCA
AATGTAAGTTACAGACATTGATTTAGTTCGGATTGTTTAAATAATGGAAT
GTTTAAATAACATAAAAAGGGTTAATTAAGCTTCAttttttttACTCCAC
AGCCGATGCCTTCTTTGGTGAACGGGCAAGTTGGAGGAGAGAAGCATGGT
GCTTTCACTTTACAACAGATACAACAATTGTATCACCAACAACTCCTACA
ACAAATCAATGAGGCCGATACCGCGCGCAATGAACTCTCACGCGTTCGCG
CGCAACTCAAAGTCGAAATGGATGCAAGGAGTCAAGCTCAGGTATGACGA
ATCTTACTTCAgcttttttttggtgatttcaatAATTGGTTTTGGCTTTT
TTACGATTCTGACGATCACAGGGCGTTCTAGTTATAGTGACATTACTGTA
TCCTTTCATGGCAATATTCAACAATAATTGTTACCTTGGTATACTTTTTA
CAGGGTTATTTCTTATAATTATAATATCCTTTTACcatgaattttttatt
tgtatatGGCCAATCAGCAaatatcttcttctttttcatttcagcaaCAA
GTTCATCGTTTACTGGCACAAAACCGTGAGATGTTGGTCATGATTCAACG
TTTGATGTCTCAAGTATCCGACAAATACGCCAAAGACAACAATGAACCTT
TAAACGAAACATGGATCCTCTCTGAACTCTCCTCCAATTTTTCTATGAAC
AGTTCATCGAACCTGTACAAAACCGATTCATTGACCAATAGTAATTTACT
GGGATCTCGAAATATAGACTTTAGTTCACAAGTTTTCGATAATTCCAATA
TAGGACCTAGTCCATCACATAAGAACGTTAATGTTGATCCAATAACGTCA
CCTTTCAAAGGAGCATTTAATCCGGAATCGTCTGGTATATCGAGTCAAAA
TGGTAGTATCTCGACAAATGGAGGTTTCACGTCAACACAGGATATCGAGT
CAAATGTAAAAGCGAGTAACCCGTTCGCCAGTGATGCTTATAAATTGACT
TTTGGAACTTCATTTAACAGTTCACACAATCCGCAACAGACTTCTTTAAA
TTCGACCATGAATTCCACTGATATAGTCAACAATAATGCTAAATCGACGT
TGATTCAATAACGGTTAAATGTGATTGATATGTTaataagtcattttgtc
agGAATGTATTTCCAAACAGTCTACCGTTCCTTAAGAATCCCACAGAAAA
TCTTCATGTTCTTGTTTTTAAGCAGTTTGACTCGGAGTTTGACATCCCTC
gcatagaaaataaattttgacccttaTCAGATACGCCAAAATGTCTTCAT
CCCTGCTTGATGAAATGACTTACTAGATTTTTAGCGcgatatttaaaaat
ttaattctgataattctattcaatttatttttctacttCAATTTGTTCAA
TTTTGTTAGGACTAGTATTATATGCACCCCAAAATACTTCAACTTTACGC
CTGATATAACTTCTCATTGAATTAGTCTGTAGGCTAATTTTATGTCTATA
GGTTTACTTTCTTGACTTGAATCCCATTGTTTTGAAGTaatcttttcaga
ttttcatataaaaaagtcGAATGTCCATCCTGACTGAAGAGAAAGGAAGC
atttttttggttctttttagctatttgtttcattttaatcaattaagttc
ttattttatatatatttccaatacaaattagcatatatgtatatttttct
tgttccgatTATTTattctgaatatttttttccattttttaatttaGTTC
ATTGCTTCTACTGACTCTTTGAAAATCTGCTTTGATTAAAGCTGCAGATA
TATTCGAATCTTT
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000086_pilon | genome | sc0000086_pilon:483855..489617 + |
|
