|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000086_pilon:394244..400183+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11739 ID=MSTRG.11739|Name=MSTRG.11739|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=5940bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:394244..400183+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ttcagattcaaacaagaagtaaataaaaataatacaaccataaataaaat
catataaaaaataatacaagATGCCAATCGAAGATTATGCAGAGGAAGGC
CTGAAAAAGATCCCTAACTTAGAATTGGCTCAAGCACTGTTTACACTACA
GACCAAACATACttcagaagaagaaaaaagtgagGCTAAAACATTATTGG
AAAAAGAAATCACAGATAATAGTAAGTAAATTATTAAATTACCTTTCTAA
TTGTAATGGAGTGTACAGAATTATCAATCAGATCTCTACTACTGtttaca
acaaaaacaaaacagtacTGATAACAAGtcttatttcatttgaaatactc
AAAAACATAACCATGATTATAAGTAAGGGATGTAAAATTTAAAGGGTGCA
GTATCGGCATTTTTAAGGAGTGtataaaaatatgaaacaaGAAAGTATaa
ggcttgaaaattaaatgaGTGCAAAAATGCTAAAACTATTTTACATAGAG
TGGCCATTGACTTTAATTGCTGTGAGGGATAGAATCTACCATTATAACTT
GATGCCTTTCATTTTTCAGACATGACCTCTTTCTACGAGGAAGTTTGTAA
ACAATTAAACTGGAAAATTGACCAATCACGTCTCACCAcgatgaaaagtg
aaaatgagaAGAAGTTAAAAGAACTTGAAGACAAGATTAAAGATGCAGAG
GAGAATTTAGGGGAAATCGAGATCAGAGATGCACATTTAGATAAAGCTGA
ATTTTATGTTACTATTGGAGATAAGGTTTGGAACAGTTTGGAAGGGttaa
ttttaaaaaagattttcagctGTTGAGTAAATGAATGAGTTCACGTCaaa
tcttccttcgtttcgagtgtaaaaatcctACCCTTCAAGATAAGCGCACT
AATCtagttttgaatattgaatttttgaaacagTGAAACAATAGAACATA
TTCAAAGtggattttcttcaaattttcataggATAACTCATTGACATCAT
TACGAAAAGCATACGAAAAGACGACTACACTTGGACACAAATTGGACAAC
ATATTCTTACAGATTCGTGTTGGTTTCTTTTTCCTGGATAATGATCTGAT
CActcgaaatattgaaaaagcAGCCAGGTATTTTTGTCCCCATGTTCTCC
TCCATTTTTCTAGACATTTCATTTATGTGAGTGTTAGGGcttttatttta
agccaattttaattcttgtgattttttcaaattctttattactttaGGCG
TTCAAACATTTGCCAGCAGAAACCTTCGTGAttttcacgagttttggcct
tttttgcgaaagttttaatgtcttttttttgaaaattctttctaTGGCCA
TTCCCTAAAGTTttcacaaaatagaaaaatctgtGAAACTGTAAGATGTA
TGGCACTTTTTAGTTTTAGGCACTTTCACAAGTTAACCGATTCACGAAGA
ATAAAAGGTCCTTCATAAACCTTAGAGTTAAGTAATTGACTTGtgaggct
aaaaagtgccataaatctttcagttttacagatttttctattttgtcaag
aatttctCGCGAAATTAAAAGATTAATCTCATTTTCACTCTTCTTCTCAT
TTAGCCTTATCGAAGAGGGCGGTGACTGGGACAGACGAAACCGCCTAAAA
GTTTACAAAGGATATTACGCCCTCACATCACGTGACTTTAAGGGCGCCGC
CACCAACTTCTTAGAGAGTATCTCTACTTTCACGTCATACGAGTTGATGA
ATTACTCCAAGTTGGTCGAGTACACCATACTGGTGTCTATCATCTCACTA
AAACGTGCTGAATTGGGTGAAAAGGTAAtaacttttcaattttgtattCT
GTGTGAGGCTAGTGAAgttagagagtctatcaccatatttcacACCCTGC
CTGGAAatgcttgggattcgaacacagttcATTGCGGAGCAAGTCTATGA
TCGAAACCATCACACAaccaatcggcagaatgttagttAGACGCTAGCCT
ATTAGTTTAAGTTTGAAAGGATTTCCAGGCTATTTCCTGACTGTTTTAAG
AGGCTTATTGTTGATATTGTTGATTTTCTCTACTAATGTCTTCTGTGTGA
GACTgtgtgcgccacaaaaaagtttctctataTCAAGTTATTTTCGTAAA
GAtctaagaattttaaaagaaacctatcaatttttgttttgattttgcaa
ttGCAATTTTCGGTTCTAGTAggttctacaatcatggacaaagatttgag
acaaaagggagttcccggtgaaattttaaacaccacaaatgacttttaag
cgccttaaactacagttggaaagtagagttttaactctgagttttaacat
gagacttaagacttaggaccttaggatcttaggatttaaaagctcaaatt
tgctcgaataaggcttggaatacaGCCTGGAAGCCACCAAACctctctaa
aatcgaaatattcaatgaaagaaagtggaagtgctaaaatagcaattctc
gcccgaactttaaattctgaaaaacgttaaaatacactaaaatctcgaTA
TATTTCGACCACGATTGTATACTGGTTAGTCAATATGTAAAGCTGGATTC
ATCTCGGAACCCatatttaatgtatttttatGGACTTTTTGGAATTTCTG
AATCAtttcttctttcattgaaattaaattttccttCACATAGCGAAAAT
CACTTAATGGCTGGTTCtcttttaatttgataggtcgatttttaacgttt
tcgagcactttctgaaagtaagttttgatctaatgaaccaaattaataaa
ttaacccatcaaaattaagtttatctttcttctttctaatggATTGGTTg
aactttttaaacatttagACCTTGAGAAAATTTACTTGAAAAGGAGAAAT
TTTTTCTGTGGCACTTCCTGGAAAGGGTCAACTTTGTAATAACTGAAAAG
ATAATTACATATCAACATGAAATTCATAGGTTGTTAAAGGATCAGAAATT
TTGGAATGTCTGCACACCTTACCTAAACTTCGACAATACTTGCAATCCTT
ATACGATTGTCAATACAAAGACTTCTTCCTGGCATTAGGTAAGTTCTTta
gggaaaaaataattaattcgtgAAGCATTCAGTTTGAAGGAAAATCTTCC
ATattagaccttttcataaattacgtgacgaacatcacttgcctcgtttt
gaaattattgccatggtgataaACTCCtagtggattttattaaaactact
tcctaaaTAATCATtcaatgtctcaagagacataatcaccatggtaattg
tttgaatacgaggcaagtgatgttcgtgatgtGATTTATGAAAACCCAAT
TCAAGGGTTGTGGATGTCAGCTACTTTCAAATTTGCAAGCTCAGCTTTCA
AGGTCCTCTGCTCAATcacgtttcaaaaaatttagataTGGTTGtaaatt
ttgatatctttttctCCAGCGGATATCGAACGTTCGTTACACTGCGACCG
CCTGTTCGCCCGTCACACCACGTATTACGTACGTGAGATGCGCATCATGG
CTTACGCACAACTGTTGGAATCTTATCGTAGTTTGACTTTGGAATATATG
GCAAATGCTTTTGGTGTATCCGTTGAATTTATTGATCGGTGAGTGCATTT
TCATGAAAAGGTTTTTCGAATTCAATTGTATTGTCACTTCTGTTCCTTGT
GGCTCTTCTCATCAAGGAATGGATACGAAAGATACTTCACTGACAAGTCA
TTTGAAGTAAAGAGATGGCGTGTTCTtgagaaaaagtaacaaaactgTTT
TATTACATGTTAACGactaaccaaatcaaaaaagagcTTGCAGGAACTCC
AACTTGCCCCAAATAAAAGGCGACAACGCTACTGTAGCCAAAGCTTTTTC
CCTTAATATAATAGAGGGACGCCAAAATATTAACTTGGGGAAGTCGCTTA
CCCATTTAGTTTGCCCAAAATTTGGTCGGCCCGCCACGCTACTGAATGTT
GACAGTGTGATGCTGGAGACTCTACTTGGTTTGTTAATTCTTCAATTGAA
TAATTTATTCCGTAGGGAGCTATCACGTTTCATTGCTGCAGGTCGATTGA
ATTGTAAGATTGATAAAGTTGGAGGAATTGTTGAAACGAATAGGTAAGAG
GATTTTTAAAGTACTAGAGAGGGAAGAGTTgaacattttgacattttgag
cttttgtttttaaataagaatgatataacataatataacaaaaggcagac
actgtcctgatatgaaatatgtgtttgatatgaaacgggaacacttatgt
aaaaataaaacctttaaagcatttttgcaagaagaaaaatttcttgttaa
AGTAAGTACAGCGCGtactaaaaaatttgaataaacttTAATTATTTTGC
ACATTACAGTGTGCATATCCAGGCttatatcttaaaaaaaacttaagcAT
TGCATTGGCTAAGCATTTGCCAATTCAGTTTACGAAATCGCAAAGATTAA
AGTTACTgttaaagctaaaaaaaagaattttgcttAGCATAATGAGGTTA
ACCATAATTTACCCTGtgctaataaaaaacgtgtaaccttTTCCTTTGAA
TCATGTGTCCATTGAAGAGATTTCACAGGGCGCCAACtctataatttatt
ttttaactttctttttagACCGGATTCCAAGAATTATCAATACCAGGTAa
gctgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgat
tgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattg
attgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgat
tgattgattgattgattgatagattgattgattgattgattgattgattt
ttttataaggcttgaggtctcaaatttgccaatttttttcgacatCTCGt
gaagtaaaagctttttagataatctaaccatggCAGCAATCTTTGACCTA
ATAAGCATTAATATGGTGTAATATTGAATTTTGCAGAAAATAATCTAGAA
ATCTGGTCAGACCCAAAAGTTGGAGTCTGCAAAGCCTCGTCCGATATCTT
TTTTCGCACGCCcaatttttgcatattggattcgactttgtccaatttAT
GTTTAATATTCAACTTGTTTTGTGAAAGAGTGTTAGGACCTCACTTTACA
TGTTCAGATtgatttttattatttccttCTTTACGACAGGCTGTCATCAA
ACAAGGAGATACTTTGTTGAATCGCATCCAAAAATTGAGTCGAGTTATCA
ACTTGTAAACACAAAACATTTTGGAATATCTCAACTTACAGACAATTTCT
TTAGCATTTAGCATTTAGCATTTAGCTTTATCACTTTAGCTAGTATACTT
TTTCTAGAAGCTAATATGGTAATTGAGCGATTTGTATTATTTCTGTTGAG
GTCGCGTGGACCATTTGAATATGTTTGTTCATAAATTATTGGTAGCTGTG
AATCATCATCGATCCAGTTTTGTCATCAAATTGGATCTGCAGTGATGCAA
CTATTTCTTTTACTTGAAGTTGAAGATATGTCCTAGCGATATAAATAGTA
AATATAAGACCATTTTTCAACAGCTTTGTGTAGTTGaggaaatgttgaaa
tattttgacgtttaggttatttaattttttaaagaaatatttctgaaata
tttgaaaatattcttgtaCTCACTTGTTGACCTATTTCTCCGTTTAAAAT
ACAGCCTATGCTGCATGCTTCcgctctgatatgttttgacaAAGGGAATG
CgaatcgtgtataaaattctcgTCGCGAGAGTTACCCaagtctttgtatt
tttgagttttagaaacttgattagtaagttttatatgaTGAGAGATCTTA
AAACTTCATTGAagctaaattgaaaatttgaattgctaAA
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000086_pilon | genome | sc0000086_pilon:394244..400183 + |
|