|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000086_pilon:332330..343022+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11734 ID=MSTRG.11734|Name=MSTRG.11734|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=10693bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:332330..343022+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTATTatgttgaatttttcttttatttacagatatacacaaaaaaaa
taaaaaaaactcaaacctactaaaaaaCTACACAAAGAATACTAACACAT
AATACTTTGGAATAATAACCCATTTTAAAATTGCTTGATGACAAATAATG
CTCTCTGGTGCTTTTTATGGTTCAGACGCACACTATCGTACAACAAAATT
CACAAGCAGTACTATCAATCATGTTGATAAACTAAATAACGTAGAAAATG
AAGaggttattttttgttcattacTTGATACAAATGGAAAAGAAGTGAAA
GCATATTTGACTTCCAAACGTTTCATATGGGACGTCACATTTATTCACCC
AACGACTAGGAAACCGAGTAAGTGTAATGAATATGGATATTCTTGTCTTT
AGGCTCTCAAGACTCTATTATGTCAGGTCTATACTAACATTTGCTACCAG
GATTGATCTTTGAGACAAAGTAGTTTTCGAATAAAGTCATTGAAACAAAC
TAAAATTTGCATTTAATGTGTCTTATTTTAAACGTTAAATGATTATTTGT
CTctttaacaaatttttacaaaatcattattattattttatttcagaAAC
GATACATCATGATGTTGAGCTGAATAACATAATTATTGCACAATATGAAA
GAGGTTTTCACAAAAAAGCACCACAAAATGAAATCGAACTTTTCCCTACA
CAATATTTTAGTGTACATTATTGTCGTAAAATCAAAGGAAATAAGTTAAA
ACATCATCATGTTGTTTTCCAAGCCAAGGAATCAGAAATTTGTAAAAGTT
GGGTGGATAGTATCAAATCTACAATAAAAAGTGAGTACAATTCAGGCCTC
ATAAGGATACATCACAAAAAGGTTTACACTTTCATTTCGATAAAGACTAT
AGAATAGAATCGTTATCCTTACATTTTTATAGAGGGGAGAGATGACTgaa
gtttattaaatttgatagaTCAAAGTTACGATAAATAAATTAAACAAAAG
TCTGCAAAGCTTCAAAGGTTGGATTTTGATTAAACGTTTACTCTGAAAGA
TTGCCAaataaaattccagccaaaatgTTCTCTTCCAGAGAAAACCTCAA
TGTTCATTCTGTTAAATATTTTCGTCACCAGGATATACATCACGTCCAGA
GAAGCTACTGGTTTTCATCAATCCTGTTGGTGGAAAGAAAGAAGCAGAAA
AAATATTCCAAAGCAAAGTTGAACCGTTGTTCTACTTGGCAAAAGTAAAT
TACGATATTGTCAGTAAGTTGGACTAAATGTCTTTTATaaatatttgttg
ttttttaattgttttcatcTAAATACAACAGGTGGACATTAAGTAAGACC
ACTGAGCCCTATATAAACCCTTGAGGCAGTTCTCAAAAAACCCAACCCAG
CAAAATCCTTTGGTCAAAATGGTACTCTAATGGTAACACTACTCAATAGT
GGCCTCAAAATCTTCAACCTTGTCAGATGCCTTAATATATCTTTTGCTCA
CAAATTCTTGAACAACAGATTACCTTTCGATCTCctgcaattttttaact
tcattCAGCTTGATGCTGATGGTGATGATAATCAAGGTACCAGAGGAGCA
AAATTGAAACTTCTTTTTGTTCCTTCCTTTAACACTATAACTTTTGGTAA
CAAAGACCTGCATAACACAATGGAATTGTTTACAGCGATCATACCCTGAT
ATAACCTTGAGCTCATCTGATTATGATTTCATTAAATCTCTTGCCTTCAC
TCACTGTATTGGGGAATACTGAGCACACCCCCTCCCCAACcaagaaagca
aaaaataaaataaaaatttattctattttttattgcttcaaTTTTTTCGG
CACTTAGGTGGCTGCATCtttttttGATTAGCTTAgctataaggcggtct
ccttcctttttattttgtatattcCACCTCTTGTATCATTTTCAGATGTG
TTAAAAAGGTAAATAAatatttacttacttacttactagtggtgtaaatg
catcggtAACCCTATATCTTTTTAAACACAGAGTAAATAACCTCAAAGAA
AGCTGCGTTAAAGTTTTACTTTCTGTAACAAATAGGgggaaagttacaaa
gaaatgCCTAAGACTTGCCTTAAAAAGAGTGCTCATACGAACCAATTTTA
AATTgcacattttcataaatttcttaaaaagtttatttcaagtgttatta
gaaaatgaaaaattattttaaataattttttgataaactatttatagatt
taacataaatttcattttcacaatTCTTTTTAACAGTTACAGAACGAATG
AACCATGCAAAAGATTACCTTTGTGAAGAAGATATATCAAGTTATGATGG
GTAAGATTATCCTATGTTGTGATCAATCTCTTTTTTCTTGTCGTATGTTA
ATGTGAAGCTTCATAATTTATTTCTTATATGATTTAACATTTAGTGAGGC
ACCCATTGCATATAGCTTTCTACCCGAAGGCAGGGGAGGATTTCCCtgaa
tttctccacttaccctctCCTTTTTAAATACTGAgcattaagcagagagg
catcaagtaccattttgaaagattttggtAACGGTCGACTGGGGTTTGAA
CCCAACACTTTGCGCACCGTAGTCAGATGCTTTACCCTTGTGCTATGGTT
GACAcacagctgacacacaacgttgttttaacgttcatctaacgttatat
ggacgctgTGAACGTTACATAAACGTCGAAAGAACGTTGTGGGCCCGTTA
TATGCAACTGTATCtttcttttcttgttttcaGAGTGATATCAGTTGGTG
GTGACGGTATGTTTAGTGAAGTCATGAACGGTGTTTTGAAGTACGAAGAA
GAACAACATCAAATCATTACGTCATCAAGAACTAATAAACCAATCATAAT
GGGCATCATCCCAGCAGGTTTCAAATCTAACATgatattcgaatgttttg
agacTCACGAGTGCCTTCGGTTTCTGAGGATCAGATTTTGCTGAATTGAC
AGACTTTGtccttgtttttgatttttgtttaaatttcttcttAGAAAGTG
TTTTCACTAGTACCTTTTTGTTCCCTCACTTACTTTACGGAAAGAAATTT
CGCAGGTTTGGTGTATTTGAccaaaatctgccaaattaagcTCACTCCAA
ATTTAGATTATTGTTTTCGTTCCCCCGAACATGTGCTATTTAAGGCCTTT
TGTTACTTAATAGCgttttttttggacaaaaatattctcCATCCGTCAAA
TTacattcccgccaaaatttttcTTCCCTTAATGTATACAAACATTTCAA
ACACACATTTCTAAAGATTTGCCAacatttgttttttcatttttaggatc
AACAGATACTGTCATATATTGCACAACTGGCTGTAATGATCCTGTTACTG
CAGCACTGCAAATTGTTTTAGGTATTTAGACAGTTATTGAGTGTTGGATT
TTCCAATAGAAATATAATCACATATTTTAAGAGTCTGGAGGAAATTCCAT
TTGCTGACCTACCTAACACTGACTCTAATCCTCTGAAACTTTAGACTGAT
TGCACATAGCTTATTGAACGGCTTTCTCGTTGAGGAAGTTTTTCCTTGTT
GCAAAATTCTAGCAaaattttatgataaaaaaaactacttgaaatttgaa
aattgtaaatagGAAACCTGAGGAAACAAGATATTTACACTAGGTAGcct
attttaaaagaattttgacTTCTAATGTCCTTTTTGGCCGTTTTAGCCAT
TTTAAACCTAATTTGCACGGcttaataattttttatctaacAAAGATAGG
AGAAATCTGAAGACAGATTTATTTGAATCAGTgagattcaaatattttta
aaaagtttcttgTCGTGATTTTGAACCAGTGGAAAAATTCGGGCTAATGa
tgttaaagtctgtctcaaaataatttgcagctgagacaataatggtctgt
aacttttgatagaatttgaatcaagttgcgattttgtgctcgttaaaaag
atatttgtgagtggaatattatcaagtaaaaaatttgggaaaaaaagaca
aatgaaattgaaaaataaagaagaaaaaaatcaatttcttgtagaaatgt
ggtataattaccattttcacaggagtaattcttcaatcttagaccATGat
cactgagaaaaaaaaattcaaaaatattcattcaatcaaaagatatcgac
aaaaggctgtttgtttgtcgttttttactactttatagagtcaaccaccA
AAtacaaactttgtttgatatcttttgattgaatgaatatttttgaattt
ttttttcacagtgatcatggtctaagattgaagaattactcctgtgaaaa
tggtcattataccacttttctacaagaagttgattttttttcttcttcat
ttttcattttcatttgtccttttttttcccaaattttttacttgatgata
ttccactcacaaatatctttttaacgagcacaaaatcgcaacttgattcg
aattctatcaaaagttacagactatttttgtctcagctgcaaattatttt
gagacagactttagtaaagTGTCATCATACTATACTTTTGAGTCCAACTT
TAACAGAGAATACAAATTCATTTATAAGGTGATGAACTACCGATGGACGT
TTGTTCAGTATGGCATGATGATGACCTTTTTAAATATTCCATTTCACTAA
TGGCTTATGGGTATTTTGGTGATATTATCagagaaagtgaaaaattaagA
TGGATCGGTCCTAAGAGATATGATTTCGCTGGTTTTAAAAGATTCATGGT
GAATAAGTAAGTTATGACTCATTTTTGAATTTACGTTTTGTAATTCTAGT
TTTGGTTAATCCTTCAAACCCGGCCGACGTTTGCCAAGACTTAAAGCCAT
AACCCCCTGACAACTTGATTTAAAAGGAAATAGACCGAATGCTTTAAAAA
ATAGTATAAAAATAACTTTCTATTGTCTAAATCTCAAGCTGTCAGTTTTT
ATGctggtttgaaaattttgatttcagacaaaaagttcacacttttcgaa
aaaatgTTGCTCGCTATTCACCCCGAGATCTTCAGGAGTTCTCCCAAGTC
GGATTTTGAAATCTGATTTCATTTCACTTCAATGCAAACtgttgctttga
aattttagcatccacttttgaaaatataaattctcATCAGATGTACTTTT
CATTCGGTCGTGTTGTCCTAGATGAATCTTAACTCTTTCTTTagactttt
ttcatccgttacgtcaatttcgaccaatggaattgctttatttttcaacc
gaccaatgaccttacaaaaacgttataGAGTTTTCACCAATGTCGCGCGA
AAgcggagaccggccttaactcGTTCACAAAATAGCAAAAACTTTGCATT
CCAGCACTTTTATTTCCCGACTTCGGTGTACCTATGATTCCCAACGACAC
AAgctttttcctttcttcattGACAGGTCTTATGAAGGCGAAGTGACATT
TCGGAGCGCAAATCCTCCACAAATCATTAGTGCTCAACAAGAACAATGCA
AACAAGGGTATGATATAGTAAATGGTTAATTGACCAGCTGACAATTTAGC
TTCAATTTTATTGTGATCTAGACGTCCACgaaataaagatatttttaaca
TCAAACTTTTCTCGACATTTTTCTGGTAAAGATTATCAtgataaaagatt
tcaaatttttcaatttttgttcttTCGAAAAAGGATGTTCCTTACGAGAT
TTAATTAGATTCATTCATTCCTAGGCGAAGAGCCTTACTTTTTAATATAT
GGTAGTCTAATCTACTTACATTCCCGAATTGTAGCCACTTTAAAGTGGCT
AACATTGCTTGACggtattttattgttttgtttactATAGGTGTAAACGT
TGCTCTACTTTCGTTGATGATGAAGATACACAAGGTCAGTCTCCTGATTC
TTTCCGCTCTTCTAACAATCCTCTGTCATAAGACTCTTCAATTGAAAAAG
TGGCCAAAAAActatttcatttgtttcataAGAAACTTCTTTTTCGAGTT
ACTTTCGAATAATCTTTGAGAGTTTCAAACCCCCAACTATTAAAATGGCG
TCTCCTTTTGCACCTAGcatctttgttttgttcctgCTGACTATTAGTTC
TCACCGAGTCTACGATACAGAGTTGTTCCCATCAACAAGATTCAAACGAg
tcttcaaaatttattgaaaccAGTTGGGTCAAACTGGAgttttttacaag
ttctttgatgactctgttggtcgttaaatgttgagacaaacgattttatt
actttttctaaagaacgcgtcatccctattgtttaaaaataaccaatcag
ttaagcatcttgtaaaaactccaaggcatctcaacCAGTTGAAGCGACTG
ctgattgaaaaattgaaatattttaaatcgaataaaagataaaaatttaa
aactgtGCATTAGTGATTTGGAAAAATAAACACGAATTCTTCAGTCTCGT
TTGAGATTTCTTTCACCTAGGGTACCAAGAATTAGTCTCGATTTCCAGAC
CATTATTCTTATTACGCAAAATAGGGGCAATTTTCCTAcaaagtaaaaaa
taggaagtatgtctgccaaaaaaaaaattgcgcgagagagtgttttgaat
aataataaaaataattttttcctcttttgacGAGCGTACTTCTCTTTTGC
AGTACTGTTCACCTTTTAGTGTTTGATAATTAGGTGAAGCTGATTATTGA
CCTGGAATTTTAAATTATTAGTCTAGATCTAGACTAacgaagaatgtttt
tttttcttattacaGAAAATCATGTCTATTCCCTtcattatttcaaatta
tttacaggTGAATGGCAAACCATCTCTGGACGTTTCATCAGTGTTCTGGC
AGCCAACATTTCATGTCGGTGTGCTAAATCCTCAACAGGGATTTCACCAC
ACGCCCATATTGGTGACGGGGAGATTGACCTCATTCTAGTGCGGAAGACA
ACACGTGCTAATTATTTACatcatttgatcaaaatttccgAGAAAACCAC
AGACAATGTAAGATTAATTTCCATGCATTAACATCGTCGTATGAATTTTC
ATTCGATTTTCATTCAATAGTCAGAACACCAAAATTAATTGAGCCTTTTA
AatctgaattgcagacctcttCAAAACAGCAAGTACttcataacttttca
aaaaattgttttctgaaaatgaaattttgagtgaTGTTCAGAGTTATGTA
AAAGATTGTCTctaccaaatttcaagtcaatagggTCAATAGTCAGAACA
CCAGAATTAATTGAGCCTTTTAaatctgaatcgcagacctcttcAAAACT
GCAGGTACttcataacttttcaaaaaattgttttctgaaaatgaaatttt
gagtgaTGTTCAGAGTTATGTAAAAGATTGTCTctaccaaatttcaagtc
aatagggCCAATAGAACTGGctctgtcaaaatttgaattttatggaCACT
TTTTCGGACTTTTCCTATGAGGAGCGTGAATCTGTTAATGGATGTCAGCA
GTCTATTTGGTAATTGGATGTTTCCCTTAAGGAAACAGCACCTTGCGGCG
TTGATCTGTTCTTCGTGTTAAAAAAGCCCTGTGATCAACGATATGCTGTC
ACAAAAGTACTAGCCTGCTAGACGAAAACTGAGCTTTTTGATCGCGTTta
atgaaacaaagaaaaaatttggtttgtcgGAATGTACTGGCTACAGGAGG
ACTAGGTTCGAGATTCTCGCAGTTTCCCACAATGTCTCGAGGGGTAAATT
ACCTCAACAAAAAAGCGTAcgaaataattttgtttttgatattgtggtga
tattgtgtttttttggttttaggttttttgattttttgattttgttgatt
ttttccttttgcactttccttatgttggttttacctagggatttattttt
cattccttGTAAGTTATTACTGTTCTTTTCACCTTAGTTCGACTTCAGTT
TCATTGAAGTTCATCGAGTTAAAGAATTTCGTTTCCGACCATTAAACTCG
ACTTCAATCACGATGTCAGAGTTGGAAAATCGAGCTGACATTTCACCGAT
AAATACTCGTAAAAACGGAGAAAAAAGTGACAACGGTACGGAAAACGAGA
AAATATTCACGATATTTGACGACCGTAAAACGACTTTAGAAGTTCCGGAT
CCCGATTATATTCGTCTGAGAACGTTGAATGGTTCGCGTAACAGTTTGAG
TAGTAACTCATCAACGTCGTCTGACACAAGTGTTTGGAACGTTGATGGAG
AACTGGTCGAATATCCTGAACTTCATTTTAAGTGAGTGTTTTTTGTATgc
taaaagattttttcctatATTCtactttttccataaaaaatccTGTATTT
Tctatcaaagtcataatatgttctttcttacaatgttcttgactttttcc
TCGAAGGATTTTCtcctcattattttttgttcttatGTAAAAAGTGTGTA
TTGGAGTCATTCGATATAAGAGGGCATATGTTGCTCAAGGGCAAACCATG
GCTTTTCTGatgggaaattttgaaatacaatttactagattggctaaaaa
tgcACTACGAGGTCGAACGAGCTAACAGCAATATTTAAAtgcaagatttt
tcaattttatagaATAATCACTTTTAATATGATcaaaaggcaaaacttta
ggggaaaaagtccctcgtgggaaaaccaaaccaaaaaatatttctaaagt
aGCTCAAATTCAATTTCCATCTCTTTGTCCTTCTCTCTACAGGGTTCACC
GACAGCTCATTCGAGTTTACGCAAGAGGGATCGAAGATGACTAGTTTCAT
GGCTATGTTGGTCGTATCGTTTGCAATATGGACTTGGTGTAATGGGAGAG
GTCAGTTTGCATTTTTGTTTTAGCTGGCTCTAGAACGATAATGCTGTGTT
TATCGACGTATGGTAATGGTAGTGGTTGGGTATTTGGTATACAATGACTG
GATTATAAAAGTAATATTTAAGAAGAACGTAGATTCactttttctgtcaa
tttttaattcacaacttttattttgaataaatttagcCTGGCGACGTGTA
AATATGGATTTGTCCATGGGGCTCGTTTCAGAAAGTAGGAGCAGAACTTT
TTCTACCATATTACATACGTAGCAACTTCATAACCTTTGATGGGTGTTGA
GCTTCGAACGCCAGAATCAAAGTATTTTGGTGGACGTGGAATTCATTTAC
TTTTTCCACGAAACAAATGTTAATTTAAAAGAGGCTCATTCTGACAGGAG
ACAAGCTGAATTTGACAATAGTTTCTTTTCTCAATATTATGAAACATGAA
GGGCTGTATTAACTTAAGggcaaattttcgcgggaacaaatttttgcgga
attcaATTTCacggttttttgacaaatccgcgaaactagattccgcgaaa
cacgaatattctcaggatttaaaaaatcacctctaaaattggtcttttta
ggggaAAATAGgtcattttgtaaacaaaacattCTCTCATACCATATGAt
tctctcaaccgcgaaattgaATTCCACGAAAATTGGTTGTAAAAATGAAA
Ggttttttaattcttcgtatttctttgttgttttttgtttattctgtata
taggttacttttgttatatgttttatgttattgtttCTTCGTCATTAGTT
TTCGTGTTGTCTCAGTTTTAGAAATGAGGAACTCCATTCTTGAAAGTAAT
CCCAAAGACATTTAAACAATCTCAATTCATTCATTGATCAGGATTTTGTC
AACGACATTGCCCATTTCGGGCATTTCGAcccaaatcttttatttttgta
ggttATCTTTGCGTTTTCAAAAAGGCGAGTAGCCTAGTACTCTCGGGTAT
TTTTTAACGAAATAATTATTCGAGTTTTGTTCAATATTGTAAGGTTGTCT
TCTagattttgttaaatatttcacattttcacagttttttgttcaaagtt
ttgttcatttttttatcgttaaattaaatttttcactttcacaatttaAA
AGATGTAGTAATAATTCtagtcaaaatttatttttgcttttaaatattaa
aacataCTTCAATTTGGCTCTGTAGACGCATCGAGCACTCTCCACGCTTA
TTTAATTGATTCAGTAATAATTCTAGTCACAGACCTTTAAAGATATACTT
ACCATGTAAAGTCTTCCTAcatcagaattttttttgttcagaggatgagc
agaagtctaatgtaatagaccttatcggagtttttgatttttctaaaaaa
gcgatgcattttgggattgtttcgagtgtattacaatagaaatctcttag
gaattcctcgagggaattctattgtaatacactcgaaacaatcccacaat
gcatcgcttttttagaaaaatgaaaaactccgataaggtctattgcaaGC
CTTCTCTGTTCCACGTTTATTGTTTTGTAGTACCCTCCAtagcaatgaat
tttaaataagCCGTAGATATCCGTACTATTCGTACTATTTTCTGTATTAt
tccaaaattccaaaatttgtcCTAAACACCCATTTGCATATATATTTCTA
AGTTATTTGTTTTGTAGAAGTAAAATTTCATGCAATTtattattgtttaa
aataagatttatatttttcgtttgattgattaaaaaaaatttt
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000086_pilon | genome | sc0000086_pilon:332330..343022 + |
|
