MSTRG.11662 (gene) -

Overview
NameMSTRG.11662
Unique NameMSTRG.11662
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000085_pilon:662548..672784+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11662 ID=MSTRG.11662|Name=MSTRG.11662|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=10237bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:662548..672784+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TACTACGATCTAATACGAGTCTTGATATAATCAGAGGTACGCCGTCAGTC CGTGGCCACTACAGTTAAATCCGACTGCATGACGATCCATGACCATTGTT CTTCATCACCAGATGCCAGACAAAGACTGAGTACTGAGAGGtcattaaaa aaagttggtaagaATTGTACTTTTTTAGATTAAAAACTGGGAGTCTGAAC AAGGTTAGAGTCTGGGTCAAACCATGATATTTTTAAGGAGATTGAATTTA CAGAAACCAGTTTTATAGCCGTTTTTTATAGGGGATTAGGGGAAATGAAC TGACCAGTTGCTATCCTGCTGAGATATTGTTCTCTGATTGTTCTCCACca agctaaagctctaaaataaTAAGTGAAAACAAACGATCTGAAGAATGTGC AATCTCATTTTCTTGAGAACGACACAACAAAGTAGTGAGACAGACAGAGT TGAAATAGGCGCACACTTCACACTTCAGGAAAATTTAGGTTTCGACTTTC CAGCACACAACaaaattcttgttgtagaaCTTCTTgtgggaggactattt tcctcagacaGTCTAGTCTTAAACTCCTATCAAGTCAAGATTAGGAACTA GGCTACtattacctcttttatcttttccttacaacaatacaatgctgaca agttgacacaacacattgataAGTTATCCCtgtcagtctaaacttaaact cctaccgtgaaaaagggtaacttgcatcattggaggctaacatgcatagc cctcaaatgaaagacccagctggtcattaaaatacaaaaataaatcaaaa caaaaatggtagagtagagctgcgagcggagctgcgtagttgtattttaa tgaccagccaggtcattcatttgagggctatgcgtgttagcctccactga tgcaagttaccctttttcacggtatatcaggattagaaactaggctagtc ttacctcttttatcttttcctttacaacaatacaatgctgacaagtcagt ctgggaaatcctctcaattgcacgcttatgttccgaggccgtaagcgcgc aattgcacggttatcaaaatggcagaatttttaagcgtgtaagcgttaag caagattgacgggtggcggcttttgcggtaagcgtgtaattgcacgcttt aaaatttcctatatttttgacacgtaattccttccgaaagctctgttgaa tttcaaaagcctagggcagttttactcaaaatttatcgtagaagaagatt ccgtaaaaatggattgcccgttaaaccatgccttcgcccgaattagagaa ttctgaaccccttgaaatccctaagcaatttcaaccggggcgggagcggg cgtaaattataaccatgcaattacgcgcttacgccctcagaacataagcg tgcaattgagaggatttcccaaactgcaagttgacacaacacatgtgtac atcgTACATTGAcaaagtaatccctgagagaagtctatatcgaaatctgc aacaaaaacgaaagtggtctcttctactgattgcttcccagcgctccttc acagctgtttatcaaatgcACGACGGgcagctgtaaaatcccacccttca tatatttgtttcaatccgtgatccgtggcttaggttttttctcatcttca atttactgaagaaagcaggaAGTTGacgcgagagttagattgtcaacaaa gtgccgtaaaaaatatcattgaatgaaagaagaacttaaaatcttaaata ttttcattttgaagaatgggtgcaaaaaagtgaaacataaaaaagtttca tttttcattgctttaatcgaaatgggggatttgaaaaatgttctctGTCT TGAGTTTTTTGCTctaacccctgtaactatgagcgagcaccctgttgcta agatgttggcttgaaatcgaaaataaaaccactcaaaacgaaagtaaaat cggcccgcaCTCGACATCccataatcttgatatacaagtttaagttTATA CTGCCTGTGAGAAATTTATACCGAAAACTgcgacaaaaacaaaagtggtc tcttctactgattgctttgcAGCGCTCTTTTGCAgacgttttttataatt tccacCAATGGTCCTTCGCAGACTGTTTataatttccaccaatgagattg ctgTATTTTATACAGTGTTTCGTTTTGGCACCcttggcctctcagtgcct tgcaggACAAGCAGGCAGTTGTAAAATTGCACCCTTCATAAcaccttttt tatttgtttcaatctgttatACTAAGGTGTAGACTATTTCTCATCTACAA ATTCTTTGAAGCaagcaggaatttgatgcgagagttagatcgtcaacaaa gtgccgtaaaaaatcattaaaatacctaaaagaaaacttacaatcttaaa tattttcattttgaagaattggtgcaaaaaagtgaaacattgaaaagttt cattttttattgctgTAATTGAAATGgggaatttagaaaattttctatgt tgttttctaagatgttggcttgaaatcgaaaatgaaactaCTGAACAAGa cagggggggcacgcagttactacaagacatgatgtgtagtaagtgctttt tcaacactttttttcaggaccaccaccctttgcagttactacaccttggt agtaactgttttcagaaaagatttccaggtaccacccctgtttttgagtg atatcatcaaaaacatgctcgaaattaccctaaattgcgattatttttca acctaaagccatttttgtgctagattttcttttaatttgcttggttaaca gctgttgagaacattttaatgataattagggaaagcataatttcaatgag aaaaatttcaaattttttttcatccatttataacaaaaatatttttttta acaaagaattttttcacaaaaaaattcattttttgtgaaaaattttgaaa gttctttaaaaagaattaaaatataagcacttactacaccaaaagtgcta gcatagtgtttggcaccacccccaaacagcagttactacactgtgtagta actgttttcataacttctgaatacagtaccaccacggtagtaagtgtcat actgtcttgtagtaactgcgtgcccccccctgaacaagaaagtaaaatcg gcccgcaCTCCAATTCCTTTAATCTTGATATAAGAGTTTTAGTCTAAACT CTccaattcttaatttttcgctTAGAGAGTGCGagccctaatattttttc tcccGGACTTCAGGGGAAAATGAAAGGAAGAACTTGCCaaaaaaaCCCAA TGACAAAAAGATGTCTTGCAAGGTTTTGGAAtagatcctgtgaagatgaa aagatCCCATAAACTCTAATTTTGTTCTTCCCTCAAGTTAAAAAGGTTAA AGGGTTTGGGCAATtgaggcaaaaatcagcaaaaaggcTGGTAAATCCCT AAATCTAAGAATCACTAAAAGATCCTCACTGATAAGGCCattcaagaaaa tttattttcacaaGAGTTCTCGACAAAATAGCATACGCTTAGCCTGATAG TTCTATTAATTAATAATCACATAATACGCTAATGTACATTTCATGAtatc atgatattgaaaataaaagtaattaagaatacctaataaaatgaaaacaa ctaaAGCTAAACAAGGCTATAATAAGAAGTAGTTAATGCAGAGCTAAGAG TAGCGAGATGTGACTGGAGCTGAAAGACTATCACAAGGATATAGAGTGTA TAGTACAGTGAGAGGCTAAGGACAAGGTGATGATGTAGACCTGAAAGACT TGTGattttataaaacattgaaatatatacattaaattttttagataata ataatatatgatatgattacttacaattaaatattataattcagtaatat aaataagaataaaataaaaagaaaatagtgaataaataGATTTTGCCTTG ATTACACGACCTGAGCtgaatagaaaatagaattAGTGAGATGATGAATT GATTGAGACTAGAGACTAAGGAGGCAGGAAATTAGAATGGTTCCAGTTTT CAATGTTTGAATCGAATCACAAGCACAAGAACAAAATTCAATTCCtaaca aacaaaaatttcaaatatttcatttgcCATGAAATGAATATAAACAAAAG TACATCATCATAAATTACTTACAGCTACTCCAagtttgatttaatagtaa gataccTTTTGAAATTAGATTAGATCATCTAGGCCTCCCAAAAGTTCTAT GTCctccaaaaaaatttcatttaggTTTCTGTTGTTTTTAGACAACAGCT ATCGGTAGTATTtaatttagaaagatttttagaAGCGATTTGATATAATT AATCTTAGTAACATGATTTTATCCATTTTTTCATTTGGACATATCATGAC CGATACAAAAGGTTTTCAGTCAGTCAAATGGCTTTTCCAGTTGGACATTG ACCAATGACCAAAGCTTATTTGCAGTCTCTGGAACTTGGCTCTGGCAGAT TCAATGGAAGTTGTTGCTGGTTGTTGGAATATGTTTACAaggttcttgac agaaaatcctttgtttgattgtcaaatgatgacagtgttgttattaattt tgttaaatctgacaaattgatgatgagagcactttatagttttgactccc attgaaaaatcatattttggttttcatgttactagatgctgttttaggag ctttagagctagcctgactATAAGTCTTATCAGTGATTCATGCCCAACTT GCTAACCACAAGGCAGGTCACCAAACTGCTGAAATTTATCAAATCTTTAA AGTGATATTTTAAAGAAGTATTAGGGAAAACCAGAACTCACAAGTAAGGC TAACTGTTATGTAATCATGTTAAGTATATCATTTTAACTCCATGAATTAA CGACGAGAACAAAATACGTAATGACTGGTGTTTGGATGTACTCAATGTAC TCCCGTCGTTGATGAAGACTAATCCAACTTCCCTCAAAGATAAAGCTAGA GATCATCAATAAaataccatctttatcatcctaGGGGTTTTGATGTGGAA GCAAAACCGGCTTTTTCGGCAAAGGGAACCCTCTAGTCTACAGTATTCTA AATCTTATTCTCCcttttattttagaaatatcGGAAGTAATATGGAGAAG ATTTTAATTGGTGTGCTTAGTTCTGAACAACCATTTCAACTAAAGAAAAC ATTAGCAATTCAAATAGCCAATGCTGgcaagaaaaatattgattatgcta attttgaaaacttggtGAAAGGATGTTTGAAACAATTATTTGAAACCGAT TTGAAGCAGCTTTCAATGGACAAAAACTCGTCAGAATTAATCCTCTTAGT TTTGAAAAGTTGgctaggaaattttgaattgaccAAAAGATATTTTGATG AAGAGTTTATGaacaaatctttcaaaactATTGATGCAACCCGTCAAATA ACATTTTTGAGGAAATTACTATTAGTCCTGGACTCTTTATTCAGCTCAAA ACAGAAATTTAATGCCAACAGTTTGGAACAAATGCAGTTTTACTTTTATG ATACATTCACATTGGCTACAGGCATTGAAGAATTTTCATTGATTTGTAAT GCCTACCTGGAATACCCTCACTTACTACCCAAAGATTTATCACTGAGCTC TGTGCAAAACATTGTCtccatttttgttaaaatcttaTCACTAACCCCAA TTTCGCAATTCATTGCATTGGAAAATAAGGATGGCAATAATGTCCAAAGT atatttaaacttttaaacttaCTTCTTGAGAAGGatcgaaagatttcaaa tttgattggaAATGCGTTATTCAAAGCCCTCACAACAGACGGGAAACATC CTTCAATTTGTATTGCTAAATTGTTGAAGTGCTTGAATTTGGACGAGTTA TCTTTATGCATCAATGAAGTGGTGAAATCACAATTGACTGATGACACTTT GACTTTGATGACATGTCGGCTGGTAGATTGGATCTGTTTACCAGACCCTG CAATTGCCACTGATCAATGGGTGATGCAAGTACTGAAATATTTGATACAA CACAAGAAATATCAAGTACTATCTTCTGTTATTGATGGAAAAATTAATCA GGTATTGCATGTGAACCtcctttaatttgacttttttagGTCTCTCTTGT TCTCTTGGTCATTTTGAGTAATCATTCTCATAAGTTCACTGTACTCTTAA TAGTATAAACCAATTTATCTATCTCTATTTCCCAACCAGCTTACCTAGTA GGAAAACATTCATTTATCATAATCACGATATCGTTCCTTTTTCAGATCTT TCACCTCGTATATTTACCAGTCTTTCGGAGGAGATCTTTGTCTTTGATGA CATTTATGTTGATTAGTTATTTACATTCTCCAAAGCCTTTTCACgaggta aatttttatttacttagcttttttctattttttaaagggaaaatttagtg tttttaatgaactacggcaagtttttttaaaattgaaataaacatttttg cTGAATGTCCAGCCTTGTGTTGTTGGAATTGAAGATAAGTCAAATAAACT TTTGACTGCTTGTAATGAAGTTAGTTTAACTGAATGAATAAATATCTCAC TTGTATGCTTGTAATGAAGTTAGTTTAACTGAATGAATAAATATCTCACT TGTAGATAGCAGTGCTTATTCCTGACTTGGTCGCACaattgaagaaagaa gaaaccCCTCAAGCTACCAATGATGTGGTTCTGCTTGGTGAATTAAGTTT CACGCTAATGTATCAATATCCCGGCTTCCCTGATATTTATGAAAAGTTGT TGGCTTCTTTACAGGTAACTTATAAATTCTTGAATTACATTGAATTGGTC CTGTTTGTAGTAAGAATTTTCCTTCAGTCTTTACTGAATTGGGCCataaa aacttaaattaaatATTCGGTTGTTTTTTAGGGAGTTCCTAAGCCTTCAG AAGAAAAGATGAACACTTGGTTAAAATCGAGCTTTTCAATATCTCAAGAA GAACTACCTCAAGTCATTGTCCCAGAGAGGTTACCCAACACCAAAGTTGG ATTGGATAACCTTGGGAATACATGTTATGCCAACAGTGTCATTCAAGCTC TTTTCAATCTCGCACAGTAGGTGTAATTCTCTTCTTGCCCTTCTTGTCCA TTCTATGCCTATGTATGGAGAATACACAAATAGAATGGGTTTAAAAGGGA TGGTATTATATCACGTAGGTTAAAACTATAGATAAACCTGTGTTCATTTG TTAGCTAGTTTGTTAGTTACCAGTTTCACTCGGGATTCTGTAACCATAAA CCCCCAAATGCTACGGAGCCAAATTCccaaagaaaaatttgaggTAAAAC GGCTAAAGAACAGTGGTAGCTATGGTACCACTGTATGGAAGATCTACacc aaataattcaatttttgactAGATGGGCCTGTTTTCATGCATATGAAaat gtaatttcattttctttataagcacaacCCGATTAACTCGTGATTGATTC AAGTCATTCAATTATTTATtatgattttgaatttaatcttttcctttgat taaccaggtaggtccataaatgCACCACTTGTTTTCTTGCTTTCAGTGTG CGGAAAGTATTGTTGGAGCGAGAAACCGATATGACTTTATCAACCACAAA ATCTATTCAAGAATTATTTGGTCTGTTGTTACTTACAAAGGTCAGCTATT AATCTCAataagtactagtaatcgtatggtttggagtgcaattaacgatt aatcacgagtaacaaaggagaaaatagtaatttaagtccgaaggacgagt gcaaattacggtattttctcctttgttactttttttatattgaagaaaaa aaatgtctttgttttttattatatagtaaaataaagtctctgacacagga cttgggagagaaaagaacaAGGgcacaaaagtgtccccccgccgaagagt gcaaaaagtggtaatagtgcaattaacgattaatcgcactcctctaaacc aatcagattcgagtaattttgcaagGCTGACGATTACTCCGAAAATATCC CATTCAGCTACAATTCATGCCTATGGTAACATGTTTTGCCGAAACATCta ttattaaaaattttcattagaacccccccccctttattaatttttaagaa tattttcagttggcaaaaagaagtACCCAtgttttgctccaaaaagcctg attttagcctattttaccttatttttgggttttcagaagtacaatttcca accccccggtaattaggttccccctgtttattattaaaaaagtttattag gtccccccccctgtttatttggcacctaaaaGTACATgctcgattttttt ttgaaaatttggtgcTGAATATGttaatattattttcttttcttagcgCT CTTCCATCGCACCGAGAGTCTTTTTAAACCTTTCAAGACCACCCTGGTTT CAATCTGGTTTCCAACAAGACTGTTCAGAGTATCTCAAATATCTATTGGA TAAACTTCAAACGGAGAGTAGTAAAGACACAAGCAAAGATATCAATCAAT TCTTATCAGGACAGATTCGAACGTCAGTGGAATGTCTCAATTGTGGATTT GTATCCTCACGCGAAGAGGTCTTTAATGATATCCCGCTATCGTTTAATCA GGAACCCTTGGTAGCAGGCGGAGAGAAGGTTGTTCATACTTTGAAAGGGG GCGACTCTTCTGACATGAAACGTAAAATAGGATGTAAATTATCGGAGGCT TCTGATGCAAAACAGACGATGACTGATGATACAATTTCAAGTTTAGATAC ACCTTTTGTTGACTTGACTGCAGCTGAAACACCACCTGATCCATTACAAA AGTTCAACATTCAAGAAATGATGTGTAGTTATCTCTCACCAGAGCTGTTG AATAATTCCAATAAGTATTACTGTGAGACATGTGCTTCTcttcaaaatgc tcaaaagaCCATGAACATCTTGAAATATCCGAAATATTTGATTCTAACTA TGAAAAGGTTTACGTATGACgtcaaaacacaaaaacgtTCGAAATTATTA CACGTGGTTGATCACCCACAGACGTTCGATTTCTGTAATGAATGTGCTCG ATGTCACAGTCAAAATCGTGTTGATTCAGACGAATCAGTAGCTGGTTCAT CGAGTCAAAACACGACCAAAAACCGAGAATGTAATTCAGGGAACGAGAGT CATTTCCGCTTACTATCGGTAATCGTACACTCCGGACAATCATCAGACAG CGGACATTATTACGCTTACACATGCGAATATTTGGAAGATGGGAACATTA AATGGCTTTTATTAAACGATTCAAGAGTTTCTTCTGCTCCTAACGACTGT GTCAGCAAACTCAGTTCCAGGTTTCCACAAGATACTCCTTATGTTTGTAT ATACGAATGttatgagaaaaataaggaaaagcAAAAGGAGGATGAGAAAG AACTTGTTATtaatactcaacaaaaaatcttggattttGTTAATGCCGAC AACATGGCTTACGAGAGGGTAAGGACTTATATCAAATTAATGGCTTCCTA GTGGTAGACTACTATCATCCTCGCCTACACATGAAACTCTGATAATAtct tcatatttcttttttctcgatCTGCTCCAAgggaattttttcattttttt gaattttcaatacTTTAACTCTATTTAACGATCCTTTCTCTTGTATCATA GGAATTGCAACGTGAGGTGATCCGTAAGCGAAAGACTTTCACATCCAATT TCAATAATGATAAGGATGAAGATGGTTTCGGACCTTGTGGACCCACTGGC GGCGGTAGAGGAGGTGGGATTGATGGGTCCAAATTTGTTTTCTGAAAGAC CAGAATCACGTAAATCATGATTTCAGCCCTATAAAATGATCATAGTGGCT GTTGTTGTTATTCTCTCTTCTTTACAGCATAATACTTTCTTATcgttgtt ttgatgctggattCAGTTTTTAATTAATTCAACATTACGCCGCGTCCTAC AAAACTTCTattattcattttcatttcaattcatTATAAATTCCTTGTTT TTATGAATTAAATTAATTCCAATTCGAAGTCACCCATCATCGACTCTATT AAGATAAcgtttttctgattattttttaaataatgtctctacttttgtgt ttcttaaattaatatttttgtacagaaatgataatatttttgCTAAGAAT TTAGTTTACGATTATGTTAATAATTAGAAGAATTTCa
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11662.1.p1MSTRG.11662.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
MSTRG.11662.2.p1MSTRG.11662.2.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
MSTRG.11662.3.p1MSTRG.11662.3.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
MSTRG.11662.4.p1MSTRG.11662.4.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000085_pilongenomesc0000085_pilon:662548..672784 +