|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000085_pilon:662548..672784+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11662 ID=MSTRG.11662|Name=MSTRG.11662|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=10237bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:662548..672784+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TACTACGATCTAATACGAGTCTTGATATAATCAGAGGTACGCCGTCAGTC
CGTGGCCACTACAGTTAAATCCGACTGCATGACGATCCATGACCATTGTT
CTTCATCACCAGATGCCAGACAAAGACTGAGTACTGAGAGGtcattaaaa
aaagttggtaagaATTGTACTTTTTTAGATTAAAAACTGGGAGTCTGAAC
AAGGTTAGAGTCTGGGTCAAACCATGATATTTTTAAGGAGATTGAATTTA
CAGAAACCAGTTTTATAGCCGTTTTTTATAGGGGATTAGGGGAAATGAAC
TGACCAGTTGCTATCCTGCTGAGATATTGTTCTCTGATTGTTCTCCACca
agctaaagctctaaaataaTAAGTGAAAACAAACGATCTGAAGAATGTGC
AATCTCATTTTCTTGAGAACGACACAACAAAGTAGTGAGACAGACAGAGT
TGAAATAGGCGCACACTTCACACTTCAGGAAAATTTAGGTTTCGACTTTC
CAGCACACAACaaaattcttgttgtagaaCTTCTTgtgggaggactattt
tcctcagacaGTCTAGTCTTAAACTCCTATCAAGTCAAGATTAGGAACTA
GGCTACtattacctcttttatcttttccttacaacaatacaatgctgaca
agttgacacaacacattgataAGTTATCCCtgtcagtctaaacttaaact
cctaccgtgaaaaagggtaacttgcatcattggaggctaacatgcatagc
cctcaaatgaaagacccagctggtcattaaaatacaaaaataaatcaaaa
caaaaatggtagagtagagctgcgagcggagctgcgtagttgtattttaa
tgaccagccaggtcattcatttgagggctatgcgtgttagcctccactga
tgcaagttaccctttttcacggtatatcaggattagaaactaggctagtc
ttacctcttttatcttttcctttacaacaatacaatgctgacaagtcagt
ctgggaaatcctctcaattgcacgcttatgttccgaggccgtaagcgcgc
aattgcacggttatcaaaatggcagaatttttaagcgtgtaagcgttaag
caagattgacgggtggcggcttttgcggtaagcgtgtaattgcacgcttt
aaaatttcctatatttttgacacgtaattccttccgaaagctctgttgaa
tttcaaaagcctagggcagttttactcaaaatttatcgtagaagaagatt
ccgtaaaaatggattgcccgttaaaccatgccttcgcccgaattagagaa
ttctgaaccccttgaaatccctaagcaatttcaaccggggcgggagcggg
cgtaaattataaccatgcaattacgcgcttacgccctcagaacataagcg
tgcaattgagaggatttcccaaactgcaagttgacacaacacatgtgtac
atcgTACATTGAcaaagtaatccctgagagaagtctatatcgaaatctgc
aacaaaaacgaaagtggtctcttctactgattgcttcccagcgctccttc
acagctgtttatcaaatgcACGACGGgcagctgtaaaatcccacccttca
tatatttgtttcaatccgtgatccgtggcttaggttttttctcatcttca
atttactgaagaaagcaggaAGTTGacgcgagagttagattgtcaacaaa
gtgccgtaaaaaatatcattgaatgaaagaagaacttaaaatcttaaata
ttttcattttgaagaatgggtgcaaaaaagtgaaacataaaaaagtttca
tttttcattgctttaatcgaaatgggggatttgaaaaatgttctctGTCT
TGAGTTTTTTGCTctaacccctgtaactatgagcgagcaccctgttgcta
agatgttggcttgaaatcgaaaataaaaccactcaaaacgaaagtaaaat
cggcccgcaCTCGACATCccataatcttgatatacaagtttaagttTATA
CTGCCTGTGAGAAATTTATACCGAAAACTgcgacaaaaacaaaagtggtc
tcttctactgattgctttgcAGCGCTCTTTTGCAgacgttttttataatt
tccacCAATGGTCCTTCGCAGACTGTTTataatttccaccaatgagattg
ctgTATTTTATACAGTGTTTCGTTTTGGCACCcttggcctctcagtgcct
tgcaggACAAGCAGGCAGTTGTAAAATTGCACCCTTCATAAcaccttttt
tatttgtttcaatctgttatACTAAGGTGTAGACTATTTCTCATCTACAA
ATTCTTTGAAGCaagcaggaatttgatgcgagagttagatcgtcaacaaa
gtgccgtaaaaaatcattaaaatacctaaaagaaaacttacaatcttaaa
tattttcattttgaagaattggtgcaaaaaagtgaaacattgaaaagttt
cattttttattgctgTAATTGAAATGgggaatttagaaaattttctatgt
tgttttctaagatgttggcttgaaatcgaaaatgaaactaCTGAACAAGa
cagggggggcacgcagttactacaagacatgatgtgtagtaagtgctttt
tcaacactttttttcaggaccaccaccctttgcagttactacaccttggt
agtaactgttttcagaaaagatttccaggtaccacccctgtttttgagtg
atatcatcaaaaacatgctcgaaattaccctaaattgcgattatttttca
acctaaagccatttttgtgctagattttcttttaatttgcttggttaaca
gctgttgagaacattttaatgataattagggaaagcataatttcaatgag
aaaaatttcaaattttttttcatccatttataacaaaaatatttttttta
acaaagaattttttcacaaaaaaattcattttttgtgaaaaattttgaaa
gttctttaaaaagaattaaaatataagcacttactacaccaaaagtgcta
gcatagtgtttggcaccacccccaaacagcagttactacactgtgtagta
actgttttcataacttctgaatacagtaccaccacggtagtaagtgtcat
actgtcttgtagtaactgcgtgcccccccctgaacaagaaagtaaaatcg
gcccgcaCTCCAATTCCTTTAATCTTGATATAAGAGTTTTAGTCTAAACT
CTccaattcttaatttttcgctTAGAGAGTGCGagccctaatattttttc
tcccGGACTTCAGGGGAAAATGAAAGGAAGAACTTGCCaaaaaaaCCCAA
TGACAAAAAGATGTCTTGCAAGGTTTTGGAAtagatcctgtgaagatgaa
aagatCCCATAAACTCTAATTTTGTTCTTCCCTCAAGTTAAAAAGGTTAA
AGGGTTTGGGCAATtgaggcaaaaatcagcaaaaaggcTGGTAAATCCCT
AAATCTAAGAATCACTAAAAGATCCTCACTGATAAGGCCattcaagaaaa
tttattttcacaaGAGTTCTCGACAAAATAGCATACGCTTAGCCTGATAG
TTCTATTAATTAATAATCACATAATACGCTAATGTACATTTCATGAtatc
atgatattgaaaataaaagtaattaagaatacctaataaaatgaaaacaa
ctaaAGCTAAACAAGGCTATAATAAGAAGTAGTTAATGCAGAGCTAAGAG
TAGCGAGATGTGACTGGAGCTGAAAGACTATCACAAGGATATAGAGTGTA
TAGTACAGTGAGAGGCTAAGGACAAGGTGATGATGTAGACCTGAAAGACT
TGTGattttataaaacattgaaatatatacattaaattttttagataata
ataatatatgatatgattacttacaattaaatattataattcagtaatat
aaataagaataaaataaaaagaaaatagtgaataaataGATTTTGCCTTG
ATTACACGACCTGAGCtgaatagaaaatagaattAGTGAGATGATGAATT
GATTGAGACTAGAGACTAAGGAGGCAGGAAATTAGAATGGTTCCAGTTTT
CAATGTTTGAATCGAATCACAAGCACAAGAACAAAATTCAATTCCtaaca
aacaaaaatttcaaatatttcatttgcCATGAAATGAATATAAACAAAAG
TACATCATCATAAATTACTTACAGCTACTCCAagtttgatttaatagtaa
gataccTTTTGAAATTAGATTAGATCATCTAGGCCTCCCAAAAGTTCTAT
GTCctccaaaaaaatttcatttaggTTTCTGTTGTTTTTAGACAACAGCT
ATCGGTAGTATTtaatttagaaagatttttagaAGCGATTTGATATAATT
AATCTTAGTAACATGATTTTATCCATTTTTTCATTTGGACATATCATGAC
CGATACAAAAGGTTTTCAGTCAGTCAAATGGCTTTTCCAGTTGGACATTG
ACCAATGACCAAAGCTTATTTGCAGTCTCTGGAACTTGGCTCTGGCAGAT
TCAATGGAAGTTGTTGCTGGTTGTTGGAATATGTTTACAaggttcttgac
agaaaatcctttgtttgattgtcaaatgatgacagtgttgttattaattt
tgttaaatctgacaaattgatgatgagagcactttatagttttgactccc
attgaaaaatcatattttggttttcatgttactagatgctgttttaggag
ctttagagctagcctgactATAAGTCTTATCAGTGATTCATGCCCAACTT
GCTAACCACAAGGCAGGTCACCAAACTGCTGAAATTTATCAAATCTTTAA
AGTGATATTTTAAAGAAGTATTAGGGAAAACCAGAACTCACAAGTAAGGC
TAACTGTTATGTAATCATGTTAAGTATATCATTTTAACTCCATGAATTAA
CGACGAGAACAAAATACGTAATGACTGGTGTTTGGATGTACTCAATGTAC
TCCCGTCGTTGATGAAGACTAATCCAACTTCCCTCAAAGATAAAGCTAGA
GATCATCAATAAaataccatctttatcatcctaGGGGTTTTGATGTGGAA
GCAAAACCGGCTTTTTCGGCAAAGGGAACCCTCTAGTCTACAGTATTCTA
AATCTTATTCTCCcttttattttagaaatatcGGAAGTAATATGGAGAAG
ATTTTAATTGGTGTGCTTAGTTCTGAACAACCATTTCAACTAAAGAAAAC
ATTAGCAATTCAAATAGCCAATGCTGgcaagaaaaatattgattatgcta
attttgaaaacttggtGAAAGGATGTTTGAAACAATTATTTGAAACCGAT
TTGAAGCAGCTTTCAATGGACAAAAACTCGTCAGAATTAATCCTCTTAGT
TTTGAAAAGTTGgctaggaaattttgaattgaccAAAAGATATTTTGATG
AAGAGTTTATGaacaaatctttcaaaactATTGATGCAACCCGTCAAATA
ACATTTTTGAGGAAATTACTATTAGTCCTGGACTCTTTATTCAGCTCAAA
ACAGAAATTTAATGCCAACAGTTTGGAACAAATGCAGTTTTACTTTTATG
ATACATTCACATTGGCTACAGGCATTGAAGAATTTTCATTGATTTGTAAT
GCCTACCTGGAATACCCTCACTTACTACCCAAAGATTTATCACTGAGCTC
TGTGCAAAACATTGTCtccatttttgttaaaatcttaTCACTAACCCCAA
TTTCGCAATTCATTGCATTGGAAAATAAGGATGGCAATAATGTCCAAAGT
atatttaaacttttaaacttaCTTCTTGAGAAGGatcgaaagatttcaaa
tttgattggaAATGCGTTATTCAAAGCCCTCACAACAGACGGGAAACATC
CTTCAATTTGTATTGCTAAATTGTTGAAGTGCTTGAATTTGGACGAGTTA
TCTTTATGCATCAATGAAGTGGTGAAATCACAATTGACTGATGACACTTT
GACTTTGATGACATGTCGGCTGGTAGATTGGATCTGTTTACCAGACCCTG
CAATTGCCACTGATCAATGGGTGATGCAAGTACTGAAATATTTGATACAA
CACAAGAAATATCAAGTACTATCTTCTGTTATTGATGGAAAAATTAATCA
GGTATTGCATGTGAACCtcctttaatttgacttttttagGTCTCTCTTGT
TCTCTTGGTCATTTTGAGTAATCATTCTCATAAGTTCACTGTACTCTTAA
TAGTATAAACCAATTTATCTATCTCTATTTCCCAACCAGCTTACCTAGTA
GGAAAACATTCATTTATCATAATCACGATATCGTTCCTTTTTCAGATCTT
TCACCTCGTATATTTACCAGTCTTTCGGAGGAGATCTTTGTCTTTGATGA
CATTTATGTTGATTAGTTATTTACATTCTCCAAAGCCTTTTCACgaggta
aatttttatttacttagcttttttctattttttaaagggaaaatttagtg
tttttaatgaactacggcaagtttttttaaaattgaaataaacatttttg
cTGAATGTCCAGCCTTGTGTTGTTGGAATTGAAGATAAGTCAAATAAACT
TTTGACTGCTTGTAATGAAGTTAGTTTAACTGAATGAATAAATATCTCAC
TTGTATGCTTGTAATGAAGTTAGTTTAACTGAATGAATAAATATCTCACT
TGTAGATAGCAGTGCTTATTCCTGACTTGGTCGCACaattgaagaaagaa
gaaaccCCTCAAGCTACCAATGATGTGGTTCTGCTTGGTGAATTAAGTTT
CACGCTAATGTATCAATATCCCGGCTTCCCTGATATTTATGAAAAGTTGT
TGGCTTCTTTACAGGTAACTTATAAATTCTTGAATTACATTGAATTGGTC
CTGTTTGTAGTAAGAATTTTCCTTCAGTCTTTACTGAATTGGGCCataaa
aacttaaattaaatATTCGGTTGTTTTTTAGGGAGTTCCTAAGCCTTCAG
AAGAAAAGATGAACACTTGGTTAAAATCGAGCTTTTCAATATCTCAAGAA
GAACTACCTCAAGTCATTGTCCCAGAGAGGTTACCCAACACCAAAGTTGG
ATTGGATAACCTTGGGAATACATGTTATGCCAACAGTGTCATTCAAGCTC
TTTTCAATCTCGCACAGTAGGTGTAATTCTCTTCTTGCCCTTCTTGTCCA
TTCTATGCCTATGTATGGAGAATACACAAATAGAATGGGTTTAAAAGGGA
TGGTATTATATCACGTAGGTTAAAACTATAGATAAACCTGTGTTCATTTG
TTAGCTAGTTTGTTAGTTACCAGTTTCACTCGGGATTCTGTAACCATAAA
CCCCCAAATGCTACGGAGCCAAATTCccaaagaaaaatttgaggTAAAAC
GGCTAAAGAACAGTGGTAGCTATGGTACCACTGTATGGAAGATCTACacc
aaataattcaatttttgactAGATGGGCCTGTTTTCATGCATATGAAaat
gtaatttcattttctttataagcacaacCCGATTAACTCGTGATTGATTC
AAGTCATTCAATTATTTATtatgattttgaatttaatcttttcctttgat
taaccaggtaggtccataaatgCACCACTTGTTTTCTTGCTTTCAGTGTG
CGGAAAGTATTGTTGGAGCGAGAAACCGATATGACTTTATCAACCACAAA
ATCTATTCAAGAATTATTTGGTCTGTTGTTACTTACAAAGGTCAGCTATT
AATCTCAataagtactagtaatcgtatggtttggagtgcaattaacgatt
aatcacgagtaacaaaggagaaaatagtaatttaagtccgaaggacgagt
gcaaattacggtattttctcctttgttactttttttatattgaagaaaaa
aaatgtctttgttttttattatatagtaaaataaagtctctgacacagga
cttgggagagaaaagaacaAGGgcacaaaagtgtccccccgccgaagagt
gcaaaaagtggtaatagtgcaattaacgattaatcgcactcctctaaacc
aatcagattcgagtaattttgcaagGCTGACGATTACTCCGAAAATATCC
CATTCAGCTACAATTCATGCCTATGGTAACATGTTTTGCCGAAACATCta
ttattaaaaattttcattagaacccccccccctttattaatttttaagaa
tattttcagttggcaaaaagaagtACCCAtgttttgctccaaaaagcctg
attttagcctattttaccttatttttgggttttcagaagtacaatttcca
accccccggtaattaggttccccctgtttattattaaaaaagtttattag
gtccccccccctgtttatttggcacctaaaaGTACATgctcgattttttt
ttgaaaatttggtgcTGAATATGttaatattattttcttttcttagcgCT
CTTCCATCGCACCGAGAGTCTTTTTAAACCTTTCAAGACCACCCTGGTTT
CAATCTGGTTTCCAACAAGACTGTTCAGAGTATCTCAAATATCTATTGGA
TAAACTTCAAACGGAGAGTAGTAAAGACACAAGCAAAGATATCAATCAAT
TCTTATCAGGACAGATTCGAACGTCAGTGGAATGTCTCAATTGTGGATTT
GTATCCTCACGCGAAGAGGTCTTTAATGATATCCCGCTATCGTTTAATCA
GGAACCCTTGGTAGCAGGCGGAGAGAAGGTTGTTCATACTTTGAAAGGGG
GCGACTCTTCTGACATGAAACGTAAAATAGGATGTAAATTATCGGAGGCT
TCTGATGCAAAACAGACGATGACTGATGATACAATTTCAAGTTTAGATAC
ACCTTTTGTTGACTTGACTGCAGCTGAAACACCACCTGATCCATTACAAA
AGTTCAACATTCAAGAAATGATGTGTAGTTATCTCTCACCAGAGCTGTTG
AATAATTCCAATAAGTATTACTGTGAGACATGTGCTTCTcttcaaaatgc
tcaaaagaCCATGAACATCTTGAAATATCCGAAATATTTGATTCTAACTA
TGAAAAGGTTTACGTATGACgtcaaaacacaaaaacgtTCGAAATTATTA
CACGTGGTTGATCACCCACAGACGTTCGATTTCTGTAATGAATGTGCTCG
ATGTCACAGTCAAAATCGTGTTGATTCAGACGAATCAGTAGCTGGTTCAT
CGAGTCAAAACACGACCAAAAACCGAGAATGTAATTCAGGGAACGAGAGT
CATTTCCGCTTACTATCGGTAATCGTACACTCCGGACAATCATCAGACAG
CGGACATTATTACGCTTACACATGCGAATATTTGGAAGATGGGAACATTA
AATGGCTTTTATTAAACGATTCAAGAGTTTCTTCTGCTCCTAACGACTGT
GTCAGCAAACTCAGTTCCAGGTTTCCACAAGATACTCCTTATGTTTGTAT
ATACGAATGttatgagaaaaataaggaaaagcAAAAGGAGGATGAGAAAG
AACTTGTTATtaatactcaacaaaaaatcttggattttGTTAATGCCGAC
AACATGGCTTACGAGAGGGTAAGGACTTATATCAAATTAATGGCTTCCTA
GTGGTAGACTACTATCATCCTCGCCTACACATGAAACTCTGATAATAtct
tcatatttcttttttctcgatCTGCTCCAAgggaattttttcattttttt
gaattttcaatacTTTAACTCTATTTAACGATCCTTTCTCTTGTATCATA
GGAATTGCAACGTGAGGTGATCCGTAAGCGAAAGACTTTCACATCCAATT
TCAATAATGATAAGGATGAAGATGGTTTCGGACCTTGTGGACCCACTGGC
GGCGGTAGAGGAGGTGGGATTGATGGGTCCAAATTTGTTTTCTGAAAGAC
CAGAATCACGTAAATCATGATTTCAGCCCTATAAAATGATCATAGTGGCT
GTTGTTGTTATTCTCTCTTCTTTACAGCATAATACTTTCTTATcgttgtt
ttgatgctggattCAGTTTTTAATTAATTCAACATTACGCCGCGTCCTAC
AAAACTTCTattattcattttcatttcaattcatTATAAATTCCTTGTTT
TTATGAATTAAATTAATTCCAATTCGAAGTCACCCATCATCGACTCTATT
AAGATAAcgtttttctgattattttttaaataatgtctctacttttgtgt
ttcttaaattaatatttttgtacagaaatgataatatttttgCTAAGAAT
TTAGTTTACGATTATGTTAATAATTAGAAGAATTTCa
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000085_pilon | genome | sc0000085_pilon:662548..672784 + |
|