|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000005_pilon:2636603..2645607+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1122 ID=MSTRG.1122|Name=MSTRG.1122|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=9005bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2636603..2645607+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttaaaatatttttcttattccCATGTTGTAATTACAAAGATACGCATACC
TACTTATAAAATCTGATCGTGATTTCTAATTTGAATAATTGGCATACTAA
ATTACAAAGTTAGATATACCTTAAGTACATCATAGCCTGTTTTCATTTAG
CATTTGATACCGACTGTGGATTTACTCGCAACAAGATGGTAAGATTATTT
ATCTACTCTTTGTTTTAACTTTTCGTACGACTTTTTTCTCATGAAGAATA
TATCCAAAATAAATCCTAGATAGAATAGATCTTTTAAAAGAAGGAAGGAG
TTTTTTCTGGGGTCTAGCGACACACTTTAGTTTTATACGGAAgtaatttt
cttctttgattACGAAAAAGCCAACAGATTAACCAACCAAATTGTAGGTG
CAAATAGTTTTGGGCTTCACGCATACTCAATTATATTTACCCAAAGAAGC
GTATTTTGATGTAGAACGCAGCAAAAATAGACATTTTGCTAGtcaggatg
tcatgttgaataattaaaaactacAGAATTGGAGTTGAAGTTGGGAATAA
CAGCACAGTTGGAATTAATGACAGGCTGATGGAAACTagatttctttgct
tagcgatcagaGATTCATACGAGCGAATTAAACTAATTAAGTGTAATTTA
TTTTCCTGTACAATTGAAGGATGTTAAACAAGAAGTAATGGAAAAAGTAG
AAGTTAAAGACGAAGAATTTCCCCAGGTAAGCATGGAAGGCATGAAAAAT
AAGAGTATTTTAAGAGTATTTCGTGTATTCTGATAGTTACCACTTCtggg
atacacgtttttttataagaacattcaaattttttgaagccttcagataa
CTTTTTGtgtaagtctaaaaatgttcttaacctgttcttaacattttggc
cagcgaagccttatgttcttgtatagtttgttcttataaaaaaaacgtgt
accataCAATATTTTCCCTTTAAGTCTCGtgctatttttttccaaatgac
TTAGTTTTGGAGCCAAACCCGATCTTGATCTGCTTGAAATAAGTCCTTTA
ACTTCGTCCATTAGCATTTTCTTCTGTGTGTCAATTTTGTCTCTGGTTAC
TTTTCGCCCTTGAAAGAATTCTTTTACGTAGAAAGGTATTGGTTCATCGA
GGGCTTTGAAAGGCTGGTCGGTGATCGCATTTTTAGAAATAAATCCTTAa
tgatggtgatgatgatgatggggAATCATCTAACATGTTgaacaaaaatc
aggaaatttcaaagtagtctctctaagggtgggaaaaatcacgactttta
gaaaaaaattttgattttgagagaaaaaattacgaaaaagtctcactaag
ggtaggaaatttttgaaaatcacggaaaatttttcgaaaaagtctctcta
agggtcactatttcactaaaatttggtctctctaagggtcggttttcgga
ggtcccgtccgcacatacccctcattcaccaaccctagtacccccccccc
ccccccgggtcaaaTCACCAATCTCAgaatgaaaaatagaatttgttact
ttttcaagttgatttttgatttttctcctaGGACCATTTGGACCAGCCTT
CCAAAAGAAAGAACATTGATGACACTGTACGTGACATTCTCTTTCTAACA
GCATTCGTTGCCCCATCGATGACAAAAATGCTTCAAGTTATCTAACTAAA
TTTATCGAAATCGTTGTAAAGATTGATGGAAAGTTTTTTCAATAATTCGA
TTTCATGACTATCCAAAATACGTTATTTCAGCAAAATGTCAACCTCATTT
TATgatctttcttattttttctctttcGATATTCCTTAGGAGCCGATCAA
GCAGGAGGATGGTGGAGatgataattttgatttgatgGTAAGAATACTTT
TTAGTTGAGCCGAACATTTTGTTCATTTAATTCTCATCATATATCCCATG
GCCAATGTCCCTTTTAATTGCTACTATTATATACGACATACGACCCTTCA
GTATGATCAATATGCTATCGATGTCGACAAATGTATAAAGATATCTGTTT
ACTCGGGTGTTCCCAAAAGGAAGGGTAACGAAGTAGGTACtttttttATT
GCCCATTATACTTATCAATGCTACCTTAACCTTTTACCTTTTACCTTTTG
GCAGTGGATTTGGTATTTGCTTGATAATTCAGTCATCGTCGGGCTGGAAT
AATTATATAAAATGGGGGACCGCCTGAGAACTCCCGGTTCGTGGAACGTA
GTGAAATCTTTCTCCCAGTCAAGTTCAGGAATTTAGCCAAGTCTCTAGAA
TATTCTAAATGGTCCGTTTTGGGCTCGTTGGCAATGTTGGCAAGCCATGA
AACGCTGAGAAAATTTCCCGGCGCTTCGAGTCAGACAATTATCTTTATGT
GAGTTCGAATCTGGTCTTTCGCcaagttttgatatttcattcCACAAAAT
GTGGTCCAAAgttctgaaaaatttggcaaaaaggTGCGGGAGTAAACCCA
AGGAACGATTTTGACCTGTCTGTAGcccccccccTCTCTAGCGCACAGAA
TCGAGCGAATACATTTTGATTGGCGCATGCAACGCAACGTcgaaatcttc
tttttttacgATACTTTTCTAGTTTTATAGTTTTGTCGATAATCTGGCTA
ATGTAGGGGGAGTAGATATTGCAAATAAGTAAGAAACAAATCTATTTTTT
GATGTCACAAAaccgaaaaaatttaaaacacagTGGTAATTTGTTACAGT
CTGTAAAGCTTTAGGCTACCCCAATAACTAGCTCAATCAAGGTCCAAATT
GGGGTACCCTACCTTTTGGGAACActcatttttctgattttaccTTTCAA
ACTTTGGTATTTTTTGTATCTTGACGACTTTGCAATATAGATAATTTGAG
TAACCGAATTTCTAGTAAGAGTGTGGACATTCCTTCGATTACCAAGGTTT
TGTaacaattaaaaaattcttCTATCTCACTAGTTTTTTAACCTCGTTGT
AGGATGATCTTGCAAAGTAAAATCACCGTACGTAGAGTAAGTTAAGGACC
TCTTAGTGTGAAGAAAGGTGCTGCTGGTGAATGATAGCCTAAACAAAGCA
ATGAGATTTTCAGATTCAATTAGCAACTATAGTTTAATTACACAATTACC
AAGTGCCCTTCTAGATTGATTGGATTGAGTTTGAATTCAAGTCAACTTGG
TTTGACTTCTCTCTCATGGAATGCAAATATTGAACTTGAAGcccctttca
tttttattttattttagactGGAACAATGAATAAAAGGATGCGGAATGGA
TTCAAAAGTAAGCATTGCTAGTAACTCTACCTCTCATGTGTATAAAGATt
taaattgggcttttccagaaaaaaatcgtgcaccccctgttgaggaggtc
catttccgttccaagggggtaaggtttgaaatgcagtggaattccataag
ggcagacgaaaatccgtcaaaaataagcggaattccaagggggtaatgat
tgaaaatttgtaaaaattcggagttccagaggggtatgatcctaaaattg
gttggaattccaagggggtaggtcacaaaaggttggacctcctcaacagg
gggtgcacggtttctttttctggaaaagcccatttataTGTTTTCTCTGC
TTTCTTCATACTTCAAGAACTTTTTTATGCTTACATTAAAGGAATCTTAG
GTGGGTGAAATTTACACACAGAGTTCGATAAATTATTTTATGCAGTAATT
AAAACAATACCTGACTAGGTTATTGTGATTTACATATTAAAAAGTCTATT
AGAATACGCACCAATGTATTAAAACTTacatatttctatattttagaACT
CTGCTCAGCGATTGACGGTAAAGACGTTTTCCGATCGTTTAAAAAGTCTG
CTGATACGATTTATCAATCCCACAAGCAAACAGAGCTCAATACTTTACTT
TAATGATACACCCCTTCTCATAAACTCGGTAAACTTTTTCAGTCATTGGG
GTAAAAATGACgaactgaaactcaatggggattggattccattattttca
agtcagaaaattcagttgggATGCAAAAATAACACTATtactttgcagtg
aggatttgtttatttgattatttttagcatGGACAAAATTTGGAGTATAG
TTTTCCACTTGAGacaatattttgaccaatttttgtcAGGGGAGGGTGAT
TACCGGGTCTGTAAAAAGAGAAAGTAATAACACAATTGTTTTATATTTCA
TTCTCGTCTAGTCTCGATCTTTGTGGATTCATGGTAAAAGCATTTCTGTT
GAATGACAATTACCGTAGTTTAGGGCTACTAAAAGCCTAATACTACAAAA
TTCTGACTGGAAGGCAAGAAAATATATGCCTATAAAAAACTGGTTAACAC
TATTTtttggcccagctagctttagcgtactgggcctttcattagcattc
tgccggtgtcagtgtgtaacaatttactaggcgatacgcgttttcaagca
cagcacaggctagtacatattgtgaaggatttgattggctgttagaacat
gattgacagaataaaaaacaattgaaatcgtttttattggttgaaaacat
aaaaggagaaaatacaattaactattaaaactataagaatataacagatg
tagtacgttttaagaaaaacaatgtgattTACACCGAAATAACCGTAAAA
taccttcttctctttaggaagatgttcttttaaaaaaaagttgtttttac
atttctctatcatgtgaacagttcagttgttcacatgttaggaaaaaaac
acttctgtatataagattaaatattatgaattatttctcaTTGTTGTAAG
AGATAGAGAGCTATCAGAGATAGCCGAATGGTTTAAGGCGTCTATGACTT
GTCTTAGCGACTCCAGGTTCAAATCCCCTCTGCTactcaagtcttgttca
gttcatatttttattcgctgggccttcatgccctctgggcttcttgtttt
aCTTTGAAAACGTTTTATTCTCAGCATACTaacaacgttttttttctttt
tcttttcatattttggttccttttATTCGATTTACATACGAACTCAAACC
CAACCTCCTTCGCCAAATTTTTCTCTACAAAACCACCGTGCTTCATCATA
CTGATTTGGTCAAATCAACAACAAACGAATTGATACAATGAAACAATTCA
AAACAATAATTCCCAACCCATTGCAGAGAGAGACGCTATACTTGCTGGTA
ATTGAAATTTTACCTTTTAAAGTTGTCCATTATAAATCATACGGGATGCA
AAAACGACATTATCAGGAGCATAAATTATAATGAATTTTGATAATCTTAC
AAATAGtttagaatttagatttcaaattttttgcccaataaaaatgtttt
aatgtttttctgtaattttttcaTTATAGCGCTTGATCTAAAACGCAAAG
GTGAGACTTTTTGAGAAGGTACAATAtttttttGCCTCCTTACCTCGAAA
AGGAAACGATCCTGCGTAATGAGCCATAAATCCGTGTTTCTAGGCATATA
ATTCTTTGCTTTTCAAAGCTGTTCATGAAATCTTATGCATGGTAAAACTC
GGCTCATATCATCTTTATTATAGAAAAAGACGCTCTAATGGCTGGTACGT
GAATAATACCACTGATACATGGCGTAACTTTAGAACACCATGCACTGTTA
TGATTGCTTTACGTTTGATTATCAATTTGATGAGGACCTACACTTAAAAG
ATCTAACATTGCTTTGCCTGATAAGAATTTTATTAGGATTCGTAAggttg
attttgaattttttaatccCACAATAGtagaaagaaaatgagaaatGTCA
CAACTGGTCAATCTATAAATGCGattgattaatttataaaaGTTTAATTC
AggctgagaaaaaaaataaacccctgttttctaattaaaaaattggaaCT
AAAAATATCTCCCATATCAGTGGCCCGGTCAGATCTGCCCCGATGGAAAC
GCGGTAAGATAACTACGAAGAAATGTTTGTTTTATTCAAGTCCTGGTGGG
ATGGCGATTTAATAATTGAGACGGGGCTGTCTAAAACTTTAGCATCCTCA
ACTGAAatccttttttctattttcagagCTAGAAGCCGGACATCTTAGTA
AGTGGACTTGTTTTCAAGACGTTTCGCGTGATTGTATTACCCCTATCTTC
GCGCAGTAACTTCAATAACTGGTGGTCACATCGCGGAGTAAGGCAAACTT
GAACCATTGTCTTGGAAACTTTACAACTTTCCtatgaaaaatataacaaa
atgttttaatttacTGGAATCTCTGGAGAATCTAACGATCTGACACTGTT
TGGTTTTATTTGACTTGtcattcaaatttcatttttctttttttccaatt
cAGCGGTAGATTACATATCCCAAATGATGTTACACGGTAATTCTTTAATA
TTAATTTCACCTGTTTAGTTAGGGGCGGCTGTTATTATGGAATTATAGAa
ggtttttcattaaaaaggggaaatcttaaaaaagacaataaaatcgCTTT
CAGAGGCATCATATAAAGAGGAGgaatatttcatattttggtCGTTTTAT
CTTATCTCGCACCTTCGGAAAACTAGCTCAATGGATTGCTTTCACTAATC
CCTTTTGTTCTACTTTTCATCtcgatttgattggctgttcaGAAAAAGAG
AAACAAATTGCTGAGAAGCAAAAAAGTaagtaaaagctttttgttATTGA
ATTATTCATTGCCACTTATTTCTTGAATATCGAAATTGCAAAGATAAAAG
CTATATTGTATGTTAAATTGACATTTCGGCTCaattctttgccacggaaa
gtcatgtgagATCTTTGTTAACAAATaagttttgataatttcgagggtaa
aacaaacactGTGGTTTAACTCACGaaaagattatgtttactgaaaacac
ataattaatcttttgtaagtgttctgttgtacccCAGTTCTGACGTCGTG
CCGTGGCGAAGAATAAATCTTTTCGACCATAGTCGGGTGGTCAAGCGCGT
GCCAAACTATtttttaattatccccctaaacacGATCCAAtccctttttt
acacctttttctattgtctattggtGCGAAAAAAGAAAGGGGCGGTTTTA
GGGGTGTAAAACGGATAGAAAAATGCCCGTGCGACAATTGACAGCCACGG
TTGAAAAGGTCATTAGTCATTTAATTTGATAAACCAACCAAATGAAAaaa
tctgtgtttttttttttttagaaaaggaACGCCTCCAAGCTGGTAATTAA
ATTCTTACAACAATTCATACGATTGATACGTTTATGTTCAAGCTGGGTGT
AGTTTACAGTGCATAGTTCCATAACATTGGTATGACAAAATACTATATtc
gttttttatgttttaaaatgaaaatgtttttatagacacttttaagtctc
TCGGATTCTCGTAAACCATAAACTCTAAAGTCGAATCTCCCGGGAAATGA
AGTCACtttttttCATCCCAACGCGTGGTATTCACACGAACGCCATATTG
AAAGTGAAACTCatcgccagatttcgaaaaatatgtccttacaaacaaaa
aaggctagattcaatccgcaATTATAAACGTGGCGCACATCTTAAAACCT
CATTTTTGTCTTGcatgagaaaggttgaagattcatcaTTCTCTAGCaac
ttcggggctttaaactcaatggtgtaaatgaaaaatttgaaaaaattacc
actcaaattaccaaattatttgcagacttttccaaaaaaattgaaattta
ggGTCCCTGTCCGATGAGGGGAAGAGCTTTTCACAGTAAAATTACAAATG
AAATATTTGCTCAATCAACATCCAAGTTGATGTTGACTATAGGATTGATA
TAAAAATCATATGCTTTGTTtcgttttattttcttttagagTTGGAGAGA
TTGAAATGAGAAAGTAAGAGTTTAAAAGTTTTAACTCGAGCTTGTGTGCT
GGTTCTATATTCCATATCCCTTACAcgaatttcctattagcagattcatg
taaaaaagtcacgaaacaACGTTTCGAAAAAAGcttaaattggctaaaaa
tgcttACGTAAAGATGTTTTTATTACAATGTCCAATGTATGAGGTGATCT
TTGCATGTCTCAGCCAATCAGTTGACTTCGACGTTTATTTGCGACTTTGT
TGCATGAATTTGCTAACAGGAAAATTACGCATTACGCATCTTCCTATTGA
AACTGTAACAACATGTAAGAATGATTGCTCaatgtttctgaaaaaaatgt
ttgtttgatATTTATATTGATTGGTACtggcaacctcgttccctgcgcat
catcagtttttttatgctttaactctctggcgtccatcattagtgtaaat
aaagcctgggatacacgggcacgAGGTTGTGGTACTGGCAGAGAAAGTGT
CATTTGTAAAGTTTTATAAATAATCGTTGACTCGTATTGTTTATAGATGT
GGTCCCAAGAATATGTGACGATGTGACGATGGAATGTTACGATGGAATTA
CCCATCGAATACATATTGAATGTAAGTTGGGGAGGGTTTTTACTTTtccg
gtgtgacgggattgtctcttttttagtacggtattacgggatttgacgag
aAAAGATACGGAGAAatgatattttaaaatcagataGTGACCGTGATCAG
CCtttttttCAGTATTCCGGTACTTTAACCTCTAAAAACCAGTACGACGT
TGTtattatgtttttaaatttccGGGATTCAGTGATATAACCAAAACTTT
GACGTGAAAACTGTATTTCGAACCCTCACAGGTTGCATGCATTTTCTGTA
TTTTCCTACTCGTGCATTGTCTTATTCTTTTCATGATCTGCTTGTTGTGC
AACTAAATATAggattttgattggtttaatAGTAGAAATCGCGAAGTGTT
TTCATATTTACAGATGAGCGAGACATCAACGGTGGTGAAAAGTTCAACGT
cgaac
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000005_pilon | genome | sc0000005_pilon:2636603..2645607 + |
|
