|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000080_pilon:609258..616609+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11170 ID=MSTRG.11170|Name=MSTRG.11170|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=7352bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:609258..616609+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CTGTagtttacacttttttttatttttaaacactTTGAAATGGGAATTTG
GGATTTGGTTTTAAAAGAATGGTGTACATTAGGTTTTGTTCACAAAAAAC
GAGAGCTTTTCGAATAAAGATTTTGCTGTAGAGAAAGTAACATGGGGAGG
ATTGACTTCGCGAGTATTTATGAGATAAATCTTTGATCAAAATGGAGACG
TTTTACTGTGTTTTCTTGTTCATGCTTTACTTGCTGTCATATTTGCATCG
GACGATTTCAGTTCCAGGAAGAACAGGCTTaggtatgaattttttttatc
aaccgAATAAAAGTCCTTATACTTATGACccatattttgattatttctag
cAGAAGGCTTTGAAATATTTCcggacagttagtcacactagcgtcccgcc
aaaatgcgtatcaaagattaatgctgcgaaagcgctatatcgtttacctg
actctcaagcaaaaaaatgcgccgcaaaacttctaaagggatttatcaaa
aaataacccggcgctttttaatgaaattagcattttcaaaaactttgaga
aattgcctaaaatttgagccatagataaaaaaatttgagccaagccaacc
ttgaaaactaatttgaagatcaatttcccaagaaaaagatctacagggga
ggcggaacccacctagatccgcgcactgccggataggctatctcccggaa
attttgccggacctcaaacaatgacccatttacatgtgcgtaattgtttt
tactttagcgtataaacaaggccttaaaaatcgaagcgctgtctcgggaa
ttgaatggcaaattttggttggctgattttggctgctgcacgttttattt
tgtttcaaacgttcaagttttaattaattgtcttgcgaacttgattcagg
taactctcatccttgttgtgcaaatgcatcctgtagatgactgatgttgt
tttttctgaaagctagattttctAGTGTGACTAATTGCCGGGGGTACTAA
AAAGTTTGTGACAAAAGTATGTGGACAAATTAGCTTTTTTGACATCATTT
TCTCAGCACCTATTCATCCTATGTTAGAAaattatacaccgttggaaaga
tatttccaagaaaaatgatattaaggaaaaaatatttttgaataatactt
tttttttaaatcatggcatgaaatttctttaaatatttgagcctttttga
tttcaaatctgtattcagatttttcatatctttcttggaaggaagaaaga
aagaaaaaatctgaACCATTTGAAGGCAGAAATGCTCAAAGTCTTAGCCC
AGCTGACACAATACGTTATTTCATCTAAAGTTATATGAACGCTGTGGACA
TTAGATCAACGTTATAACAACGTTATGTATCAACTGGGAAGGGTGCCTTG
CACTTCTTTCCTCTCcacttttattttctttctcaaatcTTTAGAGAAGA
AAATCACAAACTCAAAATTAACCTTCCAACAAGGTATAGCTAATAATCAA
AAGCAATGTTTACAAATTTAGGGAttaccaatttttttggaaCGAATTTA
TTTGGGGTTTATTTAAAATGCCCGTTATTTTTTAGATGAGGAATTCCATT
GTCATCCGAACGGTATGACATTTGTAATATACAATTTTACCCTGTATGAA
AGAAATAATATTACaataaagttcaaaaatgttACCGGAAAAGCAGCTGG
AGACTGCACTCGAAAATATACGCAAGAAGTGAAAGTGCCGCCTGCACTAA
GAGCTCCATACAATGAATGTGGCATAGAATCCCATCAGAGAAATGGTGAA
TTGGTTTACACTCAGACAATAATTGTTTCTTATAACGAAACAATCTCGGT
TGAAAGACTGGTTTATCGAGAACACATATTTGATATACATCTCGAATGTA
CTATAAGTAAGCTTCATGAAGTCGAGTTGGATGGCTACCTCAACGTGACG
AAATCGAAAGAACGAGTATTTACAAAAGGTACGTCTATTAATAtaatttt
gtttagaaaatgaatttaaaatttactcttgtctcccgaatagatgGGGG
TCCGAAGAAGCAggggggggTCCGACTAATCTTGCTTCACACCCTtttca
atccaatgtgaaaaaagcttctgaattaaaattgatgagtaagcaaacga
tatcactattatttaaaaacaaaacttttaaagaaattgCAATAACTAAC
CCCTTTTATCATAAGTAACACGcgtttttcaatgttttattgaatatttc
ctatctatataggaaatatttgttaaaacggtaatttttcttcttctcca
agtctaacgctcggttttggtcaatttcgtgagtttgtacatgagtctct
ttttaaatcaagctccggcggtaaaaacagtaggaagtttttttttcgag
gcggaagacgtcatatCTTCGAGGaacgtctgtggtaaatatccgtacgg
tgctctattctccttgtcgatcgggcagcgtcggccgtttcagaagcgta
ttgttgatcggaccatacctactgctttgtttctaactgtcaaaacaaag
atggttgaaaatagacaacaacttttgctttttcgctacttttctttggt
ttggtttatatgctttgatgagttgaattggatcatgatttttgtacgat
tgtcacaaggaatggtcgatagtaaacttttcttaatattcctttctgga
tttgatcTTTCGTTTACATCCTGTTGGTTTGGCTGGAATGAGCTGGAGAG
AGATgatacaatgctggacaaaaggtttgtagacttctgcaatatttgca
aaatacttcaatatcgatcaaaaacaagttcccaagaggctctgggtgct
ttccaaacccatccaaagtctttcaaagtcacccactgcagtctaaccgc
aagggcaaaccacaagggcttgattaactggcttacaccagtatcaaaac
gctgattttttgcttgtggttccctcaaaagcaattcaaaagcaatgcaa
agacttcgaaagtgtttttcttaacttccgtcccctttcagacacattga
agagtcattttgctctatttctcatcatttttcactgaaatttcatttgt
ctacaaccttttgtccggcattgtacAATCTCTTGCGTCTTGGAatgaaa
aacaggacattttatcaagtttcacaacaaactaacttcaattttgtttg
tatatttacataaatcgtacaaaggcaagtgactgtgaataaatctgacc
atgttatacctgaaaaattacatacttgcaatcaatatgaaaaaagtttg
cacccaacgaatgcaatgccgacaatgcaacaatgggaatggttgatgaa
ctgattttagctaaaaatttaaacatggagcaaaattgactggttaatga
ttgaatttcccttggtttttttatctacaacaatgaattaactgctgggg
ttagtgacagttagtgaaactcgttgcggttataaatttcaaattttaaa
gctgataaccggatccggaacaccacggccccaatatgaagaatgttatg
ttatacttcttaaaaggtttatcgcattgaatatggatgtaaataatttg
aaatcacctcacatgtacaattaaaatttttcttgaacttggagattttc
ttccccgcgtgcattttataacgtggaaaactttagttgtgaattttaga
gatcttttgtaacttgtgttttaaacgtagaaacttttgtcgtgaatttg
gagattttcttacagtcaactgctccaacttgggcctatctgacaaaaca
tgggacggcaatttggccaccatttcgccgaacctccaaagtcatttgat
ttgagttaatgaacaacgtattaaaaaatggcaaaacgatggagcgtttg
acgtcactcgcgcggcaagttacacacgcgttatttgttaatcccgatag
gcggttaggcagcgggtgttctctaattctccaatcggcgctatcagtga
aagttatcgtgacatgttatgaaaggaagtatgattgataaacttggtgg
agttatcaaaacaagtttgttgtcaaagagatttaacacaagttagtgaa
aatacagaccagatatcaaccagtcccatgtttcgaccaatcgtcccaag
ttaaagcagttgacggtatgtacatttaaaatgtggaaacttttgtgata
aatttggagattttcttacacgtgcattcaaaacgtggaaaacttttgtc
gtgaacttgacattttcttccacatgcatttaaaaaatgaagaaaactcg
aGTGATTTCCTGgtatgacaatttattttattttctgagatttttttgga
cattttgattgtttccaagtacagtatgtgacattttttgctcttgcagc
atgcttttggaaatcataaaatggcttctgttaggggaattttttcctat
cgacattctttcagattatgaaatgtttcccagtatataaaaatgagatt
tttttttttttttcattctgttggaaaatatgaaattgtttccctgtttt
gaaagatttttactttttagcacgtacattatttcaaaaaactccaaaaa
ttactttaaatttttacattttttacaatattttatatatgaaagtataa
tgcaaaatatttcatctcattttgaaaatatataaaattttctttggttt
tcttactgtgaaatattctcctttttgtctatctttcattttaaatattt
gccctttttggctatataatatttctggaaatcagcgcttaaaatttaat
aattatataatcagcTCTTTTGATGTGTTTAACAACActacttggcggtg
cgacgccgggtgaccgctagtataatactaaaatcatttaaagtccacct
aacgaaaattaaagttccagccaatttgattactgcattgttgttctcag
tcgggttcagcttggatatatttcgtgatccgtagctttgaaaCTACAGT
CATCTCATGAATAatcataaatggaattttgaaattcttagggacttgtg
ttgcttgatgttatctgagatttaaagcactttgaaatcttttgaggaca
tcaattattattttaacatttgtaaaggaaatatttatccgcatctttgc
ggctcttgtttatttttaaagttGGTGATGTTACAATTGACCTGCAAATG
ATCCGGTTTACAGATGCCACTTTTACCAAGGAAGATATTTCCCCCATACT
AAAATTAGACAAGTTTATGTACTTTCTAATCACGATGTCTCCTGACAATG
GGTTCTTTTTGTCTCTGCAACAATGCTATGCTACTAATGAATGGAATTCT
ACCGAGAGGCACTACATAATAGAAGACAAGTGAGATTTATTGTAAAGATT
TATACTTGGGTCACTACAATATAACCCTTTTGATACCCTTGTATCACATG
GGAAAATACCTTATAATTTCAGCCCAACTtggaaattaaattttatttca
tccccatttgaaattcaatgtttgagAATTGCACTTCAAGATCATTGATT
GCCACTGAATTTTTAAACCTtagaacaaaggaatttctatcaccattggg
atttcaatagaaatttttatccacactgagaaaaaaagttccaccggggc
tgtgagacaggggtgcccTTTGTCTTGGGAATACaccttttttgttaaaa
tacacAGGGGGCTGTGTTTTAACAAAACACCCAGTTCTTTGATGAAGTTG
GAGACATATCTCTATGTCTCATGACTGGTCTTTCTAAGACTTGGGGGTAA
TTAACAATttataatagacgatatcggcttaaccgaattctccccgaatg
attacccatgatgcatcgcgcaaaaaaattcacggacgataacccaaacc
ctaacaatgcatcatgggtaatcattcggggagaattcggaaagccgata
tcgtctattggaaatgacattcttagcttgagtagcaaaattccatgatg
gtgttattcttagcattattcttaattttttgcccattttcatcatggac
attcttataaagtgtattcttataaaagtgtGTATTCCTTGGCTTATTCT
AGATGTCCAAACATAGACGATAACACTGTACAGATTATGGAAAGTGAACA
CCCAACTGCTGTCATCAAATGGCAAAGTAAAGCATTCAGATTTTTTGAAT
CAAATTCACTCTTCATCAAATGCGAAGTTTTTATTTGTGATCCAGGAAGC
CCTTTTCCACATCCAGAATGCATGCCTTGTGATCTAAGTCTAGTTGATAA
AAAACGTCGTGGTTTGAGATCACCCAGTACTGATGAATTGAAGAAATCAA
CTGTAACATCAAAAATGTACTATTTAATtggtgagtgttttttttttgta
ttacaCTTTCCAGGcgggaaaaagaaaaatatcaaaacagaaacaaaagt
agaaaTTGTTTTCCCTCCTTCTCTTTTATAATGACTTCAAAGGacacaaa
atatttttcgaatttttcacaAGGCCTAGAGTTATGGTGATTCAATCACG
TAGATGGTAATTGAATGTTCGATTAGTGAGTCGAGAACAAGTTGCCTCTG
AATGCGTGGTCACAGACTATTTGTTATGTACTACtcgttttttctataag
aacaaactatataagaatataaggttTCGCTGGCCAAAacgttaagaaca
aattaaaaacattttaaggctttaaaactcaaaaacaccctattttttaa
ggaaaatggtcaaaaacattcacaaaatggtcaaacaaGCACATGTtaag
attcaaaaaattttgatgttcttataaaaaacgtgtttgtATGTAAATAG
AAAGTTTCTTTACATTCAGGTGAAGAAGAAGACCATTATGCTCcagaaaa
ccaaaaacaaccagcCATCTTTTCTGGTACTAAAGGCACAATCATCTTGG
TATTgttgattctttttattttggctgttttgatttgttttatcaAGAAA
TTCATTGAGTTCGTTGCAAAGTACAATGAACGGCATGCTAAAGACGTGAA
TCTAGAAGAAAATACTCAGAATGTGAACGAAGAAAAATTATGAATCTtga
cttttgattattttgttttgtttggaaATCTCTATGAAGAAATAGAAGCA
ATTCTTATATCAATTTCATTTATTATATGAATATACTTACTAGtgctaaa
aatatatttaatttatcatcaatgtaaaaagaaattctaattatatcaaa
atctcaaaacttagaTCATTTTGCAATCGATCTAGGTTCGAACCAATGaa
atataagcccgaagggctagaagcgcaATATCCTTTGTGGGATTTTAAGC
AA
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:609258..616609 + |
|