|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000001_pilon:2017092..2027952+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.109 ID=MSTRG.109|Name=MSTRG.109|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=10861bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:2017092..2027952+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAATTATTCGCAGATCTTGAATACCTAACAGGGTTACAAGAGTCTTGGA
ATAATTTCTGTTATTTTGCGCAAATTCTAAGCAGAAGAATATAAACGGGT
AGTGAAAATGAAACTGTTCCTTGTTTTGTTGTTAGTGGCAGCAGGTAGGT
TAAACTATAATAGGCTATTTTACAGTCGCTAAGTGTAATGTGCAATCAGG
ACCACTTCAAGCTAATAACAATTTACTtttggtcttatttttaaaagaat
tttgaagatttttgcgtctaaccaacgggAAACTGTTATCGGGCGcgatc
agtcctgattacccatgatccatttcgactgtgaagtGGGCTATTCTTTT
TAGCTTTTGAGGAGTGTTTTAGGGATCCAGAATGTAAGTAcaccatataa
cgttagatgaacgcattgaaacaacgttgtgtgccagctgggtctgGTTG
CCGTTGGAGTGGCCGCTGGGAGTGAAAGAttttatccccttttctatttg
cgttAGACTGAATGCTGATGTGGAGCGCTACACCTACTCTCAGTTCTCAA
TAacttagatcagattacccaatctaagctgcTCATTCGCTGATTTGGTG
GTGACCGGGAATCAAACCATCAACCTCAACCCTTGGACtataaggcgaat
gctctaccggcTGAGGGCTGAGCTACCCGGTCATTATTGTCTGTAAGAAT
CCTGATGATACCACTTAAAGAGTTTATTATGCTTCTTTTGGTGTTTCATA
GTCATGTGATGTTAGACTTTACAAAGGGTGGCTGTCCGAAGCTATGAACA
GGTCGTTAGATTACTCACAGCTACCTTAGAAAGTAGGATAACTGTACAAC
CGTAAGCGCGGCCCTACATTTTCAGCCCTCCCAAAACGCACGACATGGGT
TGATTTCAGAGACGGTGTACTGTTAGGGTGTATGAAGTGTGTAAAGTGTA
TGAACATAAAAAGTCTTTCAGCAAATCCAAGCATTCATGCCCTAAAATAG
ATTAAACGTGAGGTTAGATTTGAACAAGTTTGCTTACAGCTCTGGTAATG
GCTGGTACCATGATTGATGTCTAAATGATTTATGTGCTTTAGGTAAAATT
CTCTAAACGCTATTTTGATAACCAATAATATTAGGAAGAGGAAAGAAGAG
TCAAGGGAACTTTTATCAAGCGTTTTTGAATTCGATTCGTTTTGTTTTTT
CAGTTGCAGCTGTACCACACTGTCCACATGGAGATTGTGATTGCAAATGT
CCATGCCATCGTGAACTGAAATTGAAAGAACATTCTGACAACCAAGTCCG
TGCTGTGTTGAAATCTCTACGAACCATTGATGATGAAGGTAGGTGGAGAA
ATTCCAACCATGTACGAACCCTAGGGTTGCAAGGATTGACCAAAACTCCA
ACCATGTACGAACCTTAAGgcctacttagactacacaacaATATATTGGG
GAGCAATATTCGACAATGTATTTTACGGGCCGTAATATTCAGAGCGAACA
ATTggtattttattataaaaaggaattttctttcggtaaacaattcccct
atattgttggaatattgcaaatgaagctgacaatatattgcgtaCTCCTT
TTATCAATCAAattattgcctgacaatatattgtgtagtgtatatAGCCC
TTTAGGGTTGCAAGGATTGACCAAACTTGGCAGGCGTGTCCgagtaaaat
attcaaaattgacGTTTAGGGAGAAAAAGCCAGATGACGTACTAAATTCC
TGCATGATAAATGTGGCTTAAAGCTCATAGATAGCCGAACCGTTTTTATG
TTGATGCGgtaaaaacaaaccaaaagacTTCTAAAGAACACAGATCCACT
GGGGCcctaccactgacctttatataccctggacaaagcttctcaatccc
agccaagcaaaatctttgatcggagttttttgaaaattggtaccctaatg
tcggcactactcgatagcggtgtaaatgcatcgagagcgctaggtctact
tttcctcaaattcttttgatgatgcagcggcgttagacgttaatttttaa
cattgcaatggcttctccttgggtaccaattctaaaaaaactccaatcaa
agatggcagatattgtttggtccagggttatataaaggtcagtgggccct
acccccactagaaaatttagaaaaaaaattcgttcccacggggaaaaata
ccctaaagTTTCAGCCTCACTGAAACTTTGACTTTTATATCATCCGCATT
CGAtttcattgtttagaaatagcactccaaaaccattcccgctagatttt
ttaaccttgggacgatagaatttttatccccattgagatttcaatcgagg
tttttatccccgctgtcggaaaaagtttcaccggggccgTGAGATAGGTG
TGTTAAAGAGTATCACATTATATTACCTTATGTCATTGGTTCTGTATAAT
CTTTTTTACATCAGATGTCTTAGTCAGTGGAGTCTCCactcaaatttgtt
cgagttaaggaaatttcgagttatagaggttcgagttaaataAGACACTG
CTGTACTCAAATTGACACGATTGACTTTTTCGTGAATTTTTGCCACCTGC
AAACCATAGCTACGCAAGaggaacaaaaatttgttcgagttaaggaaatt
tcgagttatggagtaagatttATAAGGCATTGATAACTGAAGGGTTGAGA
AagcttgtttgagttaaggagacgttcgagttaaagaggttcgTGTTAAA
GAAGGCACTACTGTACTCAAATTGACACATCGTGATTTTTCGTGAATTTT
TGCCACCTGCAAACCATGAAAATTCTCTGGTTAAGTTTCTACAGTGGAGT
TTCTATAACTACGCAAGAGGAAACACAAATTCGTTGGAGTTAAAGGGACA
TAatagtactgacgaaatttgtaaacaaactgtatgcagcgggatgcaaa
atctaaacaaatgtcacatgtcaaaataaaaagtaaaaacaaatatCATT
TTGactgtttcaattgttttaaaagtttgttttggacacttGATTTAAAT
TATTCtgtttaatgacacgtggtttgcgcaatgtttacattttaatactt
ttatgtccctttaagggaAATTTTACCTACAGAGACTCCACAGCTAAACC
AAAattgatgataattttttttttatattcctATGTTTTTAGCCATTGTG
AATTTTTGCGCCAATCTGGAGAATGGCAACTACGCCCATCCAACAGGATG
CGAAAAATATGTCGCATGTGCCAATCACATCGCTTACACGATGCCGTGCC
CAGCAGGACTCCATTTCAATCACGTGTTAAACAAATGTCTTGAGCCAGAA
GAAGCACATTGTCTGATGTTTGCTGGAGAAACTACTTTTGCTGCTAAGGG
AAGAAAACCAGGTTAGTATTCATTTGGCAAATGTAAGCCAACAATTTAAG
AGCGAACCatggtgcagtggtagagcatccggctacggttcgcaagatTG
CGAGTCCAATCCCCacccgggtcataccaaagattcgcAAAATAGTACtt
aatgcctctctgcttgatacaCAGCAGTTAAGAGAAGTACCAAGGGTAat
tggagaaatccagggagaaagagtggcgtccTCCTCTTCCTTTGGGTAGA
TAGTtatcaaaagaggagcctttgggtcgcctccgGCTGTGGTTGCAGAG
TTACTTATTTGCTTGGCTGTCATCCATGTAATGTTATGTTCTCGCCCTAC
TGAACTGACTTTTTTctcatttaaattcaaaattcaaaggtaaaaattgc
actccCAAACTATCCTACCTGGACTgaataactatcaaagaacgccTCAG
CCTCGTCCCCGTGATTTCAtacccactcgaaattcaatttttaaaaattg
cactctagaaccatccccaatgaatttttttgcatgacCTTGGAAGAATA
TGATTTTATCTCCATTAGAATTTCGATTTTCGTCTAAGTAATTCCAAAAC
TCTTGAAAATATTggatattcttaatattttgagttttaagccttaaaat
gttcttaatttgttcttaatattttgaccatcgaaagccttgtgttctta
gaTAGAAAAACTTGTATAACACTTaatctagcaagctagacgaatAATTC
CGACATAgcagaaataaagcaaaaagtaatggagggaataattttagttt
atacgaactaaatcccgtaacaataatcgtattatcatataacgccttac
tactgtattacacgcattataaacgaatCCAGTCTAGTATAACACCTTTA
TCTCATCATAGGACGTGTCAGTTTAGCCCATCTTCCATCCGGTTTGATCA
GTCAAGTTCGTTTGGAGCACGTATCAGGATCGGTCACGTGTACACAAAAT
GTCGCACCAAGCTACTGGGGTTGTAATAATAACCAGGCCACTTATACTTC
AGAGGTAAGTAAGTatcaaaggttttatttttacataagtgttcccgttt
catatcagacacatatttcatatcagcacagtgtctacctattgttatat
tatgctgatatgatcaaaaaaatgtttttcttttcctcttacTGACCAAT
CTttctccacatctgtgtcaattcaatgtgaaaaagcttgtgaattgaaa
attatgatcagtaagcaaacaatatcactcttttTTAAACACAAATCCTT
TAAGAGGGAAACCCTccaaaaaagtgttttgataCTCTGAAATTCAACGA
AAGTTTAACGTGCACCAGTAGAAATGAACGCTTAGAAAAAATCCCCTCGT
TGAgaggttcaaactttaaagggaAAATCTATTTGTTTTGCGCTGTCAGC
TGGTGTTTTTATATCATTCTTAAATCGCgtgattttccaatatttttcat
aacaTAGTTTTGTccccccccccTCCAGTTAATACCGAGTTTACGTATGt
ctgtttttcagcgacggagacggtaaggttctaatttgactagatcatga
ccaactgaggacgacgatcatcacttttaccgtcctcgattttgcggggc
agaattgcgggttattccaaatcgattcagtcactttaccgtcctcaaaa
gcgcaaatacataaactcgctaatgattCCATAGCCAGTCTCCATATTAA
CTCGATCGAGCTTGCGACTCGATCTCCATTTTGTGTTTGAGATTCTGTAA
ATatgatatattttatatttcgCACCCTAGCACTTAGTTTGTTTTCCTGT
GATTCTGATGTGGTCACAAAAAGTCCATCAGAAGGAAAAGAATATGGATG
ACTCTATAGGTTGGTACAAAATTGATGTAATTGAATCGGTTAATTTGACA
ATAAGATATTTATTCATCTTTACAGATCATTGGAACACTCATTACTGACG
CTGTTGAAACGAAAATCTTCGAGAAAGAAAGACTTCCCGGATTTACCGGC
AACAGCCCATTCATCACTTTCAACTCTGCTGTCATGGATATCCCAGCTGT
TCATACTTCGGTATGGTGTAATTCATGTGCTTGTTTTATTCTCCCAttgg
aaaattggccaaaatattatcCCCAAGACAATCATACTCATATTTTTGTc
aacactgaaaataatcagagaAGCAAATCCGCACTGCAAAACACTGTGCT
AATTTTTCTATCCCCACTCAATTTCctggcttgaaaacaatagaattcaa
atccccattCGTAATAGACTTGGGAATATCAAAAAGCCCATCGAGTTTTT
GTCCGTTTCTCCTACCCAGTCTGTGAAAAGGAGGTGTAGCTAGTACACGT
CAAAGTGCATTTTTTGACCAGGCCTAGTTAAATTACACGAATCCTTACGC
CGGTCTTTTGACATAAGTGCGTCAAGTGAATTTTTAGACCTGGAGAACCC
TTACGCCGACCCCTATTCGCCAGCGACGAACACAATACACATAAGGGTCg
ccgtaaaaagggccgataaggtattataACTTTCCTTTGTTGTTTACAGG
AATTGACTGACTTAGAATTATTGGTTTGGTATAACGAAGACTTCAACCAA
GAGACCACCAGTGATGATAGCGGTGAACACGTGATCAGAGTCCTTGTTAC
CATGGATACCGATGTTGACTTGGAGTTGGCCACGAGACAAAGTGAACAGA
AAACAAGTAAGATATATCGCCCTTCATCTTTTACATTACCCTCAATGAAT
TGTCGATGTGAGAAGAATCTgcaaaatatttgacaaaaaatttctatctt
tAGCGTCATTTATATTAAGAAAAACGATCACTTGTTCCATAGTATCCACA
TACATGTTGGCAAAATGGGCCTTAATTCATCATAAAAACCATGAAATCCC
CATTGCAAAACTTCACTGAGTTCTCTTACAAAACGAACTCACTTGTAGCT
AAGAATTTCTCATTGGGAAATCCTTGTGCGTAATTCCTAGGTTGAAACGA
TACAAGCTGAAGTGTTGCTTACTTACATTGCACCCCTTTGTCACATACCC
ACTCGGACCCCAGTCCCGcttgaaaatttggccaaaatctcGTCCCCAGT
TGGAAAATACCCTGGTATTTTAGCCCCACTGTAAAGTTatgcaaaaattt
cgtccccggtgggaaaataccctgaaatttcagccccaccgggaaattga
ctttaatgtcatccccactcgaaatttaATGTTTGAAAGTTGCACTCCAT
TTCATCACTTCCACTgcattttttaaccttgaaacaataaCTTTTATCTC
cgctgaggaaaaaagttccaccgggggtGTGAGTTGTTAAAATGCAAATA
AACGCTATTTATTTCAGAGACAGCCCAAGAAGAGATCCCAATGGACGAAG
AATGCGTTGGACGCGCTGATGGAAACTATATCCATCCTTATGAATGCGGA
CTCTACTTGACTTGCTCTAATGAAAATACCTATGTCATGAAATGCCCTGC
AGGTAGGGtttttttAGAGATTCGTCTTTCTTTTTAGCAGATAACATCTC
AACAGGCActtaacgttgtttcaacgtgcgagcgttcacaacgtctatat
aacgttagatgaacgctgaaaacaacgttgtgtggcaGCCTGGATAGGCG
GTTTTACCATGTTGAACTTATTAGAGATTCATCTTTTTGTAACAGATTTA
AACGAGTTTATCCctaaaaattttatgaattttagtaaaatgttttttac
gAATAATAACACCTCTAGGCAGAAAGCTCTTGCATTTACCATCAGGTACC
TAATATAGGGTATAGTTTAGGAATGTCGTTACTCTtttgaaggaaatatt
ttttatttcggCATCTTTTGCCTTGACCTTATATTGAATTTTTGAGGTCC
TCCCGCCTTGAGtaagactacacgttttttctttgataagaacatccaga
atttttgaagccttcagacgTGGCCTTATATTTTCAGGTTTCAAACCaaa
gaatgttcttaatatgttcttattttcagcattttgagtatttttgtcca
ttttcacacgaagccttaaaatgtttttaacttgttcttaagattttagc
cactgaagccttatgttcttatatagtttgttcttataaaaaaacgtgaa
attCTATTTTCGTGTATCAATTTCTATTGTTGTAgttcattttctttctc
tttttgtaGGACTTCACTTCCACTTCGAACTGAACATGTGTCACTATCCA
GAAATCGTTCAATGCCAAATTTTAGTTGGACAAGTCACATTCGCTGCTAA
AGGAAACAAACCAGGTATagcaaagatttccaaaatggtacttgatccCT
CTTTGCTTGAtgttcagcaattaagagaaggatcaagggtaagcgggaat
ccagggagaaagagtaaCGCCTTATCCtatcttcgggtagatagctatcg
aaagaagagccttcgggtcgactccgactgtggtcgcagacttacttact
tagtaAACTTTGTACGCTTAAAGTATTCTCAACGTGATCGTTATGTGAAT
ACTCTTTACcggagtgtatctcacgtttatcgcttcatACTCTGTGCGCA
CTCTCtgtttattgataaaaaagtccCGTACGGTCAACCTCTGAGGTGAA
TTATGATTATTGTAAATAGCAATACTCCTCTCATTGTCTCCcttctctca
ccaacactccatcgcagcggtcggtttgaaaaatctcaaattagaAAAGA
CATTGataacagaccctctacggcaatatattttgaatttagaTGCAAGG
TCTATGTACACACAATATATAGAATTGAAACTTAACATAAGCCCCATTTG
GCCGAACACCTCTTTATCATAGAAGCTACCAAAACCCTATTAGAAGTTGT
ACTCCTTCATTCTTAACCCGTACTGCGCAaaatgtatatattttcttgat
ttaattttttaaatgaggCTGAAACTAGCTAAAGAGGGCTCTGAAAAGGG
ATTATTTGTACcaaaaaagtttgatatttCGAACATTACCAAACTGACTT
AAGTTATCTCACCTAGTTGCTGAGCCAGGGGTATGGCGGGGTTCTGACAT
GcttcaaaattaaaagttcttaaaatattAGCTTTTGCTTCTTTTCATCT
TTAGGTATCTTTGAAGTAATGATATCTGCTGGTTTAAATTTTAGGTGTCC
TTAAATTGGACAACACTTTGAGCGGCGAAATTACACAAATTCGATTGGAC
TTTGTTTCTGGATTTGTCAAATGTTCTACCAACAGTGAGCCAAGCAAGTG
GGGCTGTAACAATTCACCTTCATCCAACTTCCCAACTGAGGTACGTCTGA
AAATATTCCAGCTAGCACAatacgttttttcaacgttcattcaATGTTTa
caatgttcacaacgtccatataacgttagatgaacgtcccaaaaaatcgt
ccccagtggaataTTATACTCCGATTTTTGTCtccactaaaaataatcaa
ataaaccaacccTCGCTGCAAAATTTTATGCTATTTTcctcatccccact
gaattttctgacttaaaaacaatccccagtcataaagaTATGAAAAAGTC
AATCCCTATCGAGTTTAAATCTaatattttacccccactggctgaaaaaa
atctacTGGGTCtttgagaaaggggtgtatttCCATTCAGGCACTGGAAC
AGGATGTAGGAAAAATGGTATCAATCCGTAAAATTATCATAACTTTAgta
gattaaatttcgcgtggattagtTTCCACAAAATTTGATTCTTgcaaaaa
ttttacaattttgatttttgccaATATATTGTGACGAAGGGAAGTTAGGC
GATTGGGGTCACCCTTTAGTTATTGAGGGGACCTCTCAGATCACTTATCT
GTTCCTTCGATCAGGGTATCCCTTATTGGGAATAAGTCTATGGACACGTA
GTAAAGGTACGCTAATAGATTTCAATCAACATCAATTCTGTTTCTCcaat
taagcaataaatatcaaataagcataacataaataacatcaaataaatta
ataacTCTAGCATGTGATTTACGATAGttctctttcaagtccttctcctt
caagttctccttttcaagtccttttcctttgagctttctttcgaagtcct
cttccttcaagctcttccttccaagtcctcgatttctttccttttctcgC
TCATGTTTGCTCGCCCTGGGGTCTGGGCTCGAGGGCCTGAGCCCCACTCT
ATTGATTTCTATTCATCTTTCAGTTCATTAATATCGTGCTGGCTCAGTCC
TAGTCTCTATTTGCATTATTCATCAATGATTAGTTTACTAGCTTCACAAt
atcttgaaaaattaaaaacatcagATAAAAAAGAGACCCATTTTAGGTCT
TCCATTcgcgaaataaattttgcgcCAAATTATTCCACTTATTAAAGTAA
TTCTGCTACCAAGCAAAGAATTAACTTAAAATAACTTTAACCCTTTCTAC
aattaaggtcataatatttgagaaaaaagtgaaattcaccgggaagtttt
gaaaccacaatcgaTttgtaagtgctctaaagggtagagttttaactatg
agttttaacgctagacttaagactgaggatccaaaagttcaaaaatagtc
taataaggctcagaatgtagcctggaagtctgccaactcCTCCCCGacta
aattaaagagatagcccaaaaatcgactttctcgccggaaaaatgttaaa
ataaccagaattctcaatatatttcaaccatgattgtagcgtATTGGAGT
TCAAATCACAAACAAACTTGAACAAACGCTTTTCAAAGAAGATAAGATGA
CCGGAAAAACTGGGAACAGTCAATCGATCACTTTCAACTCCAACAAGAAT
GAAATCTCAACTGAACCTATCCGTATTGCAGATCTTCCGGAACGTGAAAT
CCAAGTGTGGTATATTGAAGATATGGGCAATGGAGATTCGGAATATGACA
ATTCTGGCGAAGTTACCTGCAAAGTCTACGTTTCTGTCTTGTAAACTCAA
AGAGAAATATAAGCTGttattattttagtattttttcggtagaaatttta
cctacaagaatttttatataattttaccTTCGATATCATCTTCGTATCTT
TTCTATCAGTATTTCTAACCAATTTTCCAATTGTTATCTGATTCCCCCAA
AATACATGATCAAACGTTTTGCTATTTGACTCTTTccttgaataaatagt
ttaaaaaatactatttcttTGGTGATTGGTGATTTTCAGCATTTCCATTT
TCAATTGAGAGGCGTAAGAACTTTTAAGTATTTAAACCAAGTAGTATTTC
CTTTCAAATGTgataatgtttcttttttaattgtcttttttcaaacccct
tttctatactt
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000001_pilon | genome | sc0000001_pilon:2017092..2027952 + |
|
