MSTRG.100 (gene) -

Overview
NameMSTRG.100
Unique NameMSTRG.100
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000001_pilon:1852474..1862924+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.100 ID=MSTRG.100|Name=MSTRG.100|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=10451bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:1852474..1862924+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAGATTCTGATAGATCATGATTTTAGTTGCACCAGTTCAATAAATTACA TTATTATTTTTCAGGTGCCCTGCCctcttttttcttaaaaaaaaacaaaa caaacagcaatctaacaacaaaaacataaacacacaaaaTGGAGGTTATC AAGAAGAAGATGAATACTTTGAGAGCTAAGCTCGAAGAGGCTGAAGCACA AGCTGATCAAGCTGAAGCTGAATTGAATGCAATTAATGAAAGAGCTGATG AGGCAAGTACCAATTTTAATTTGTTTCTACTTTGATActcgtttttctta taagaacatccaaaattttattaaaacttcGATGTTCCACTTTTTGAGTT AAGAAATTTCGTGATTTAGAGTCGGCAAAACCTAATGATGTTAtcaactt gttcttgatattttgaccaTCAAAGCCTTGTGTttgtatataatttgttc ttttgaaaaaatgtgtagGACATAAATGTTGATAAGATTTAAACTCTGTG CTTACCAAATCTCATAAATTAAGCAATTAAAATCATGTGTcataatgttt aaattttttgtttgacatttgacatttgctaattgattattagttttact cctgttttcaaattttgtaacTAATTTTTTGTCCCTTAATAAGAAAgact tttttcacaaacaatTTAGTtcgttgttctacgggcccgaccaatccttt tttttgctaaaatgaaaaatatatatatttaaaaatttccactacaatat tttacacactagttatttgtaagaattaaatttgagtaaaactgaaaatt gaagaaattgaaaaatttagaaaaacaagtattccatacactaaaattaT GATtatcatcgaagataaaaatgaaTTTCTGATCCAGATATATTTTGGAA GACATTTACGGTACCTTATCAACCCTGataaatttattcttattttactg aTCGACCGATCCATGTTTTTCTAAcaatctgcccgtagaacaacaaatta aattggtctcgcctatcCACTCAAGGTTGATAAATCCAGAGAGTTTCTTT GATGGAATGTTGTTTACACGAAATTCAAACAAAGAGCTGATTCAAAACCT ATGTAATAGTAATCCGCGTATCCCGTATCACGGTAAGAAGAATGTTGAAT TGTTTTGCgacgttttttttattgttcccattttctttttttatacaaCA GGCTGAAGAGAATGCACTAGCCCTAGAAAAAGAATTACAAGAATTAGAAG AAGAACACGACTCTAGTGAATCTAGGCTTGCAGATCTTAACGATCAACTC AGAGAAGGTAATGCACCTTTTAGTAGGATCAAATTCTGCGGGTTTTTGTT TGAACTTTAGGTGTGGTTTTAATACCTACCACCTTACGGCATGaagtagg ctgcacgcatccacTGACATGTTTTGATGTACATCTTGTACAAAATTCCC GTCCAATTTTAAAGTTCTGTCaaataaaacttactaatcaaTCAATCATA GTTTGGACCCCCATTTTTGATAGGGGGatgccaaattttattttttgaag gtctTTGTCgggggggATAGGAATGTAGGGTGGGATCATTCAAATAAGAA AGGGGAGTTTGGAGATTGTGGTCAATTAAGTTACATGCAAATGGCTACGA TctgttttaaagtaaaaatgtgtaccaacaaacacaaaaatatgCCTCAT GTTGATAAAATGCTGGTTATATTGTTCATAATGCGGAAAGGGTCTGAACC CCCGTTCTTAAATGATCCTCCCTTCTTGGCATATTCCCCCTaatctttaa aaatgcctatcccataaggattttggacaaaaatagctaacaaatatttG TGAAATATCTTCAAAGagagagagaaagcgaaatactgaacttctttctt ctttttgactcagactactctaacagaaaacttcctttcaagaagaccaa atttcataacagtgcttgaaaataatctacaatatatatgtaagccctCC TTTCCatgctaccccccccccttttcataaaaatttctgACCCCTCCCTC CTTAAAAAAGAGGGGCGAATATGATTGTTATTATGAAATTGTTGGCTCGT GTCTGTATACATTTTGTAaactttgataattttggtGATTAGATTTCCTG TAAAAATGGGGGAAAAGATTTCATTACAGAAGTGGAGTGGATATATATAA AGGCATAAAATAAAACTACAAACTGCGAATCAGGTTTCTGAAACtcaaaa acagaaagaaaatattCCCGTCCATGAATTTCTCCCGTCATGGATgggaa ttttcttattttgaaacGTACGAGTAAAGGcaggggggtgaagcagttag taccagacatcatgcctactaactgctttctcggaagaagttagtaacac caccaccttggtacacttagtacagttagtactaactgaaattagccttg aaaaaggcttttgaccttcataaattcaataaaatcaaataaaataaaat ttaatatcttaaaaatgattcaattttccatagctttcaataggaaaaaa caacattttagaaaatcaaatttctatttattgcaaacagcaaattgttt ttaagatttaaaaaaaaatttcgaaaatttgaaaaaaaaatctacttccc caaaatcttttttggtaaaatatgggctttttttttaattttctcacaaa atcctattttttacacagttagtaccaaaatttggcaaatttttagcagg ggaccacccttttttgcagttagtacatctgagtactaagtgattttatc caattcatatggcacaccaccacggtactaaccggcatgatgtcttgtag taactgcttcacccccccccccctggtgaaGGTGTAACTTCATAATAGTT TGGAATATAGAGTCTTATATAAATGGTTAGCACAAATGAccttaaaattt tattaatgaATGGACTGTGACTTGGCAAATCTTCAACACGCATTGAAGGT ACACAAATACAAAATGCTTTTATTCCTACCATTCATGCCAGGTTGGGGGA GGGGTCacctttccaaaaataaagCCAAAAAAGGACTTGaaatttcgaac ttttttttctatctttCTTTGGATGATCTTTTCATCTAAAGTTTTCGGTA TGACACGGCAAAGGGTTATACACTGCAGCCTAATGATTTCTGCTTGAGAG TagaaatatatgaaaaatgtaactTTTCTTCCTGACATTGCTCTTCATAG GTcgatacccagctggcacacaacgttttttcgacgtttatctaacgttc ataacgtccatataacgttagatgaacgttgaaacaacaacgtcgtgtgc cagctggggagcaccgtaaaaaaattgaagaaatacttaaaatataattt ttctaaaattacttATTTCAGGTGAGACGAACAGAGACGAATCATCTCGT GCACACAAGGAATTAAGTAACCGTGGTCAGATTGACGAAGGTAAATTAGC GAGATTGGAAGAAGAATTGAAAGTTGCTTTAGAGGAAATTGAACAAAATG AAGCAGAATACGCAGAAGTAAGTTTTGATCTCCATGTtagaaaaataatc aatttttctGTATGCAATTTTAGATACGttataaatttgtttaaaataac AGAGCTTCGTTGTTTTAAATTTATTAGCCCCCtccaaacataattttttg atCGGGCGGGGCTTGCATCGAAagtgctagatctactttccttTCCACAA ttatgatgtagcgccgtttgacaTTAACTTATAACACCGAGATGGCTTCT TAGCGGGTACCACATTCAAATaaaatccaatcaaagatggttGATATAGC TTTGTCTAGGGTTTCTAAAGGTCAGTGTTTTATGTACAAGTAACTCTCGG AAAATAAtgcaaattttctttgaaatttcttgacAGACTACTGAAAGCGT GGAAGAAATGGAAATGGAGCTTGACGATTACGATGAACGCAGACACACCG CCGACGCGTAAGTCTCTCTAAAGTTCGCTTTCCTGCAAAATATGGATGGC GAGTTGACGGCCACTCCTTTAAAAGAGCCGGACAATTTCCTATCGATAGG GTTGATAGTCATCCTTCGATGAATAGCATTCCTTGTCGGGTTAAAATGCC CTCACTTAGATTAGTCAACTTTTCCCACTATCTCGTATTAAGAGCATGAG TCTGCTAATGTCAcccattttcggttttgtcaacttttcaactttaaggC CCCAGTGAAAAATCTAGGTGCATGTAATAATGATACAagctgatgttttt tatcagtcttgatactggcaagcttaaatagtcatttttttcactttaca aaGTACGCAATTTTTTCAGGACAGCTTTTTGCATCAAAATGTGAAcggaa aataaggtttttagCAAATTGTCTAAATTCATTAGTTAATAATCTAGGCC AATCATCTCTGATCATAcctgatttttgtttttattacagccaatggata taaaaaacaaaatctacaaaaagatttttcaaaatgaagtttttcccaga ataaatgcaaaaagttgcggacataactttttccgttcgcaaagttatgt ccgcacacaaTTGATTTTCTAGAGAAGTGAAAGTGTTAATATCTatagtt atttgatttttaacccttcccatccattagagaaccaaaccaagtaacac taaaataccagttgtccttcattgaaaaataatccATTTTGAAGTGAACA GGGTATGATTTCCGTtcacaattttgagttatgtccgcacattattttat cctttaaattttcaaaggagtTATCCTTACTCAgctgaatcatttttcta tatCAAGGGTCATATTTGGGatcattttatacaaatttgaagtctcaaag gctatttgttgggagacggtgaaacaaaacagtttctccaaaaattagtt atgtccgcaacaaaaagttatgtccgcaacaattCATGAAGTTTTTCAGC CCCCAAACATCattttaggtttctttgacaaattattgcaTTTGAGGTCA TTTTAAGTtggaaaaaaacagaaaaaagtctGATATTTATCCATTggcaa aattcagtttttccacctcatatcatatgtatttcatgttgcggacataa ctatttcatCTAAAAATGTTGCTGATAAAGTGTTTTTGCAAGCTGGCATG ATGTTTTGTCATATGGAAGTAGTGCTTAggctattagaaatagaaaacaa atactctgatgccaagttgaggtccaaaatgaaaattttaacagaaaaat aacctttttatttctttgaaaatgatggttctgAGCCTGCGAGCTTGAAT AAAGGATAAATCATGCATTAATTTGCATGTTAAATTCATTTTGTAGTGTT CACATAACATAACCTACTACACATTCACTTACAGACTGGTTAGAATTGCT CCAATAGTTCAAAACAGAGTCATATTCTGTAGCAAAttgtatgttgcgga cataactatttaaagtatttatcagatttttaacCCTCTTTAGGAGTTAT GCTAACACCTTGACAATACTAAAGAGTTACATTTGTAAAAACCATGCATT TCCttgctttttttcaattttttgtgtcctctaGGGTCGTTCTTCTATTA GAAATATGAGAAAGCTCTAATATCATTAATaagtcttcttttgttctttt cgaagaaaaacatgtaataactgacatcaaaccaaaccaaatcttttggt tttatattgatttagtctctataatattccttaaattttggcaatagaaa aagacactccaaaattttaaataaattatgtatAATGTCCTATGTTTCTA Ccctggaagaaaaaaagttatgtccgcaacacagcattattatacattta atcctttctattgaaaaagttgagtgactctcaaggaaaaatcatattta atgaTTATGAAGATGTACAACAGTTGATGTCAAGCTcaaatcttaacttt taagaaaagattttaacaaaaaattttatatgattggattctcttttaca aataaatcttcaattttcaggaaatcatagttacaaagatctttcaagac aacaaatttcaatgattaagttttggttcaaatacagcaaagtattaaaa gccaaataaaaactcaatttaatgtttattgcttattttaaaccaaattt gacaaaaagttatgtccgcaaccaacaaggtttcattttataatttttta ttgactaACTGAATTATagcaaacttttggttttttggaaggCTTATGAT GagtccttcaaatctagaatAAAATTACCTGACCAtagccagttttcttt tcatgaagtcaaactttatgggaatattttttagtattttcgattttctt ttgaaaaaagtgtcataatttgaaaaatatgctatACTGGACGGTAAAAA TTGCTTTCCAATGCAGCTTAATATATTAACCATGAACTGAAATCTAAGAC AAGCATTAGATTATGCATATTTTATCTCAAATGAAGTGTAAActacaaag agttttttgccaaatttgtctgATTATAACTACTCTAGGTCAAATTTCTG GACCAAACCAGTTTGATTAAGCCCTGATACttagtttttctgaaaattga ggtcattaataaaaaaattatccaggaataaaactgaaattcaaaactta ttttttccaaaatttttcacctttttgggTGACATTACCAGACTTGTGCT CTTAAGTAGAAtttttttAGATAATATCATCATTGCAgacgatagccctt gacccaataacCATATATGGTCTAATATAATGTGTAATATAATACGAGGT GATCAGAGCagatttttccgaaaataactTACAATGCCAATCAATTCata gccctgacccgaaaattaaAGTTGcctatatctgaaaaagctaattaaaa ttcagaaaacactaaagcttttttcacatgtgcgtaaaattttgcttaag accttgaagggtggagaatttccctaagcttacgtagtgttttaaggcct tatgtagagtttgctCACGTTCAAAAAGTGTGACCACGAGTAAGCATCCC CTGCTACTCGAGTCACCCGCCATCTAaccaaaagagaagaaagtgtTGAT CGAGCACAATATAGAAGAGAAGAGATTAGGAAAGAAAGATGCACTGtcga aaagtttcaaaagtagGCCTAGAGCCCGGTTCAATGTGCCGTATCCGGGT GGCCGTACGactgaaagaaaagaaacgaAATGAGGAATTTGAACATAAAA CACATATATCAATACGAATTGACTTCTTTAACCAAAATTTACTAGTTTGA GTCGCTAATTCACACATCCTGCAATCAAGTGGAGCGCTACCAACCACTTA ACTTTTTTGTAAGTGCAAACGAGACATTCACAACcttcaaactaaaattt ttttcaaaaatgaaatagaaCGACAAATCCGGAAAATGTTTTAGATAATT ATGATGATattaaaataaaactaaaaaagactATTCAAGAACAGTGTTAC ATTGCTAGCAAGGGAATGGAAAACTTGCTGGCGTCTATTaacttttttca atgttttctgtAAAAAGATATGTATcataaataagaaaatctttagCCAT Tcgatagtctagcaagctagacgactaattcagacatattagaaataaag caaaaaagtaaattttagtctttatacaaactaaatcccgtatcattatt tgtgtttattattagtattacatgcattataaacgactccagtctagcca TTCGACAATCAGGACCCCGTTCCCGCTTATTGACATGTGATAATTTTCCC ATCCCATCTGACTTAGAGCTTTGACGTGTCGAAACCTATTGgtatttata ttattttctaAATAATCAGCACATTTGTCAAATAATATTGACTATAAAGG GATCATAAAatgatttgacatttttggCCCACAGTCATAGTTAAACCTCA ATGTTCGTCTATGCttttttttCAgtaattcatttttattattttaagac GAGTCAAAGAACTCGAGGCAGATACCGTCCAACTACAAAACAACGTTCGT AGTATGAAAATCAACGAAGAAAAAACTTCACGATCCAACGAAACCAAATC GGAAAAAGTCGCACAAATGGAAGCAAAATTGGCAGAAATGGTTGACGCAG CCAACGATATGGAAGAAAGATCGAAAGAACTTGAAACAGAACTCGATGAT CAAGAAGGTAAGCTCTATTTTAGACAGTCCACTTTTCACCATGTCTATAG AGATTCTTCATGTTTTGTTATGTTACGTAATTTTCGCCATTATGGAAGGA AACGTTCgtttcgaatctgtagaggcgaTCTCATacgcaaatcgaatgtt tgctcCCATAATGGCTGAATTTACGTAGCTGaacaacagctgattggttg tctAAAGACagtgcattgccctcttttgacgtcaatgcaatgacttatTT AAATCATAGTCCttttaaaaaacactggtctggaagcttattgttttaac tttttgttagctttttcctttgttattatcaaaagatgaacatcgatttg ctcagtttttgatcatgcccggggggggcagctgggcaaaaggaccgacg ggtatgtgcgggtcctaagggtaccttttccaatatgtttaaaataggtc gaaaaaactagagatgcactgtaagggtagaaatttcagaaaatttttga aaaatctagatattttgaccaaaaatgctagaattttgaccattttttgc acgaaagggatcgaaaatttgggggaaaatgcactctaagggtatgattt tcactgatttttgctgcactgtaagggtgcaattttaaaagccaattttt ggcccgcacataccgtcagtccgcaaacccagtgcccccccgggtGATCA TGTTACCAAGTACTCCCATTGGGAtcggtttaagatttaatcacatgatc aaaaagtgaacaaaacaaactaatttttcaacgcaagttcaagtaagaaa caatggaaaaaatcaaaaggcCTCctgaccagggttttttatatggacta tgtttaaatatttttcaagcaaagattttgattGCCAAGTGTTTGCTTTT TCGGACAATTCAAACTCAAAGAACGGGAAGGCCAGTTTAAATTAGAGCTA AATTACGAGCCGCCTTTCCCACCCATGTGACTTTTTATCACTTTGTTGGT CTATAACATTTCACGTGTTTaactttaaattgaaaatagtATGTCAGTTC CTTAAAACAGTACTGCAACGATTTCAAGTGACATCAATCACCCCCTCCCA GGAACCTGGGAGGGGGTCGTAAAAAGTCACAACGGTTTCGAGATAAAAGC AAAGGCCATGTTTGTCTGTTACGGCAAGTAGACTGTCAGTGATGTTCAAA GCTCTTTGGCCTCTACTCGATGTCTAGACAAGACGCACTCCTTCCAAAGT GGTAATAAGCCCTAATCAAAGTCAGAGATCACTGCACAGGTTtcagctct agtttagacggtccaCTTTTCACCCTGCcttttctaattgtgaattaaag tagGCATAAAGTTATCTGTTTGAAGTGGATATATTGCTTTCTTTTGATGT AACTGCAATGTCgtctttcaacctttttcaagaaaaaattttaactgcca acttggtgcccactttttgcctactctaacaattagaatggACGGGACAG AAAGTCGGCCCTTTAAATAGAACTAACCAATGATAAAAGTGCTAATGATT CCTCTTGATCGTCTCGTTTTAATTTATATATATTAATTGCTTTCCAATTT GCAGAAGAACTAGAGGCAGCAAAGACACATTACGAAACAACGAAACTTGA GTACGATCAACTCCTCGCCGAATTGGCTGAAGTATAAAGTATCTCTTTGT TGGGGAAGATGTTTAGGGGTCAAATCAACACACACTTATGCAAACGCTAT AAATATATAaatgtaattaattttttttactcttgattttttcaaaatag ggaGGGAGGGGGTGTGTTTTCACTGTaaaaaaaaGGGGATAgggttaaaa tttcaaatctatGGGTACCACTTTCTCTTTTTTGGTTTACTCCTCACTTG GTTGCTGTTTGCTGTTTGtagagattttttcatttaagttttctgacacc ttttattccatttgtggctgaattttttaatctcttttcctttctgcttt ttttttgatatttttaccattatttattttctccttttttttggtttgtt ttgttttgacgaaaaaaaaatcttcgaaatattaatgtgaaaagttttta gcgaaaaaagaagaaaaaggaaactatttcaaaataatttttttctaaaa ctttttttttgtaagacaTCACTATGTATTATTTagttttataaaagaaa a
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.100.1.p1MSTRG.100.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000001_pilongenomesc0000001_pilon:1852474..1862924 +