|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000001_pilon:1852474..1862924+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.100 ID=MSTRG.100|Name=MSTRG.100|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=10451bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:1852474..1862924+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CAAGATTCTGATAGATCATGATTTTAGTTGCACCAGTTCAATAAATTACA
TTATTATTTTTCAGGTGCCCTGCCctcttttttcttaaaaaaaaacaaaa
caaacagcaatctaacaacaaaaacataaacacacaaaaTGGAGGTTATC
AAGAAGAAGATGAATACTTTGAGAGCTAAGCTCGAAGAGGCTGAAGCACA
AGCTGATCAAGCTGAAGCTGAATTGAATGCAATTAATGAAAGAGCTGATG
AGGCAAGTACCAATTTTAATTTGTTTCTACTTTGATActcgtttttctta
taagaacatccaaaattttattaaaacttcGATGTTCCACTTTTTGAGTT
AAGAAATTTCGTGATTTAGAGTCGGCAAAACCTAATGATGTTAtcaactt
gttcttgatattttgaccaTCAAAGCCTTGTGTttgtatataatttgttc
ttttgaaaaaatgtgtagGACATAAATGTTGATAAGATTTAAACTCTGTG
CTTACCAAATCTCATAAATTAAGCAATTAAAATCATGTGTcataatgttt
aaattttttgtttgacatttgacatttgctaattgattattagttttact
cctgttttcaaattttgtaacTAATTTTTTGTCCCTTAATAAGAAAgact
tttttcacaaacaatTTAGTtcgttgttctacgggcccgaccaatccttt
tttttgctaaaatgaaaaatatatatatttaaaaatttccactacaatat
tttacacactagttatttgtaagaattaaatttgagtaaaactgaaaatt
gaagaaattgaaaaatttagaaaaacaagtattccatacactaaaattaT
GATtatcatcgaagataaaaatgaaTTTCTGATCCAGATATATTTTGGAA
GACATTTACGGTACCTTATCAACCCTGataaatttattcttattttactg
aTCGACCGATCCATGTTTTTCTAAcaatctgcccgtagaacaacaaatta
aattggtctcgcctatcCACTCAAGGTTGATAAATCCAGAGAGTTTCTTT
GATGGAATGTTGTTTACACGAAATTCAAACAAAGAGCTGATTCAAAACCT
ATGTAATAGTAATCCGCGTATCCCGTATCACGGTAAGAAGAATGTTGAAT
TGTTTTGCgacgttttttttattgttcccattttctttttttatacaaCA
GGCTGAAGAGAATGCACTAGCCCTAGAAAAAGAATTACAAGAATTAGAAG
AAGAACACGACTCTAGTGAATCTAGGCTTGCAGATCTTAACGATCAACTC
AGAGAAGGTAATGCACCTTTTAGTAGGATCAAATTCTGCGGGTTTTTGTT
TGAACTTTAGGTGTGGTTTTAATACCTACCACCTTACGGCATGaagtagg
ctgcacgcatccacTGACATGTTTTGATGTACATCTTGTACAAAATTCCC
GTCCAATTTTAAAGTTCTGTCaaataaaacttactaatcaaTCAATCATA
GTTTGGACCCCCATTTTTGATAGGGGGatgccaaattttattttttgaag
gtctTTGTCgggggggATAGGAATGTAGGGTGGGATCATTCAAATAAGAA
AGGGGAGTTTGGAGATTGTGGTCAATTAAGTTACATGCAAATGGCTACGA
TctgttttaaagtaaaaatgtgtaccaacaaacacaaaaatatgCCTCAT
GTTGATAAAATGCTGGTTATATTGTTCATAATGCGGAAAGGGTCTGAACC
CCCGTTCTTAAATGATCCTCCCTTCTTGGCATATTCCCCCTaatctttaa
aaatgcctatcccataaggattttggacaaaaatagctaacaaatatttG
TGAAATATCTTCAAAGagagagagaaagcgaaatactgaacttctttctt
ctttttgactcagactactctaacagaaaacttcctttcaagaagaccaa
atttcataacagtgcttgaaaataatctacaatatatatgtaagccctCC
TTTCCatgctaccccccccccttttcataaaaatttctgACCCCTCCCTC
CTTAAAAAAGAGGGGCGAATATGATTGTTATTATGAAATTGTTGGCTCGT
GTCTGTATACATTTTGTAaactttgataattttggtGATTAGATTTCCTG
TAAAAATGGGGGAAAAGATTTCATTACAGAAGTGGAGTGGATATATATAA
AGGCATAAAATAAAACTACAAACTGCGAATCAGGTTTCTGAAACtcaaaa
acagaaagaaaatattCCCGTCCATGAATTTCTCCCGTCATGGATgggaa
ttttcttattttgaaacGTACGAGTAAAGGcaggggggtgaagcagttag
taccagacatcatgcctactaactgctttctcggaagaagttagtaacac
caccaccttggtacacttagtacagttagtactaactgaaattagccttg
aaaaaggcttttgaccttcataaattcaataaaatcaaataaaataaaat
ttaatatcttaaaaatgattcaattttccatagctttcaataggaaaaaa
caacattttagaaaatcaaatttctatttattgcaaacagcaaattgttt
ttaagatttaaaaaaaaatttcgaaaatttgaaaaaaaaatctacttccc
caaaatcttttttggtaaaatatgggctttttttttaattttctcacaaa
atcctattttttacacagttagtaccaaaatttggcaaatttttagcagg
ggaccacccttttttgcagttagtacatctgagtactaagtgattttatc
caattcatatggcacaccaccacggtactaaccggcatgatgtcttgtag
taactgcttcacccccccccccctggtgaaGGTGTAACTTCATAATAGTT
TGGAATATAGAGTCTTATATAAATGGTTAGCACAAATGAccttaaaattt
tattaatgaATGGACTGTGACTTGGCAAATCTTCAACACGCATTGAAGGT
ACACAAATACAAAATGCTTTTATTCCTACCATTCATGCCAGGTTGGGGGA
GGGGTCacctttccaaaaataaagCCAAAAAAGGACTTGaaatttcgaac
ttttttttctatctttCTTTGGATGATCTTTTCATCTAAAGTTTTCGGTA
TGACACGGCAAAGGGTTATACACTGCAGCCTAATGATTTCTGCTTGAGAG
TagaaatatatgaaaaatgtaactTTTCTTCCTGACATTGCTCTTCATAG
GTcgatacccagctggcacacaacgttttttcgacgtttatctaacgttc
ataacgtccatataacgttagatgaacgttgaaacaacaacgtcgtgtgc
cagctggggagcaccgtaaaaaaattgaagaaatacttaaaatataattt
ttctaaaattacttATTTCAGGTGAGACGAACAGAGACGAATCATCTCGT
GCACACAAGGAATTAAGTAACCGTGGTCAGATTGACGAAGGTAAATTAGC
GAGATTGGAAGAAGAATTGAAAGTTGCTTTAGAGGAAATTGAACAAAATG
AAGCAGAATACGCAGAAGTAAGTTTTGATCTCCATGTtagaaaaataatc
aatttttctGTATGCAATTTTAGATACGttataaatttgtttaaaataac
AGAGCTTCGTTGTTTTAAATTTATTAGCCCCCtccaaacataattttttg
atCGGGCGGGGCTTGCATCGAAagtgctagatctactttccttTCCACAA
ttatgatgtagcgccgtttgacaTTAACTTATAACACCGAGATGGCTTCT
TAGCGGGTACCACATTCAAATaaaatccaatcaaagatggttGATATAGC
TTTGTCTAGGGTTTCTAAAGGTCAGTGTTTTATGTACAAGTAACTCTCGG
AAAATAAtgcaaattttctttgaaatttcttgacAGACTACTGAAAGCGT
GGAAGAAATGGAAATGGAGCTTGACGATTACGATGAACGCAGACACACCG
CCGACGCGTAAGTCTCTCTAAAGTTCGCTTTCCTGCAAAATATGGATGGC
GAGTTGACGGCCACTCCTTTAAAAGAGCCGGACAATTTCCTATCGATAGG
GTTGATAGTCATCCTTCGATGAATAGCATTCCTTGTCGGGTTAAAATGCC
CTCACTTAGATTAGTCAACTTTTCCCACTATCTCGTATTAAGAGCATGAG
TCTGCTAATGTCAcccattttcggttttgtcaacttttcaactttaaggC
CCCAGTGAAAAATCTAGGTGCATGTAATAATGATACAagctgatgttttt
tatcagtcttgatactggcaagcttaaatagtcatttttttcactttaca
aaGTACGCAATTTTTTCAGGACAGCTTTTTGCATCAAAATGTGAAcggaa
aataaggtttttagCAAATTGTCTAAATTCATTAGTTAATAATCTAGGCC
AATCATCTCTGATCATAcctgatttttgtttttattacagccaatggata
taaaaaacaaaatctacaaaaagatttttcaaaatgaagtttttcccaga
ataaatgcaaaaagttgcggacataactttttccgttcgcaaagttatgt
ccgcacacaaTTGATTTTCTAGAGAAGTGAAAGTGTTAATATCTatagtt
atttgatttttaacccttcccatccattagagaaccaaaccaagtaacac
taaaataccagttgtccttcattgaaaaataatccATTTTGAAGTGAACA
GGGTATGATTTCCGTtcacaattttgagttatgtccgcacattattttat
cctttaaattttcaaaggagtTATCCTTACTCAgctgaatcatttttcta
tatCAAGGGTCATATTTGGGatcattttatacaaatttgaagtctcaaag
gctatttgttgggagacggtgaaacaaaacagtttctccaaaaattagtt
atgtccgcaacaaaaagttatgtccgcaacaattCATGAAGTTTTTCAGC
CCCCAAACATCattttaggtttctttgacaaattattgcaTTTGAGGTCA
TTTTAAGTtggaaaaaaacagaaaaaagtctGATATTTATCCATTggcaa
aattcagtttttccacctcatatcatatgtatttcatgttgcggacataa
ctatttcatCTAAAAATGTTGCTGATAAAGTGTTTTTGCAAGCTGGCATG
ATGTTTTGTCATATGGAAGTAGTGCTTAggctattagaaatagaaaacaa
atactctgatgccaagttgaggtccaaaatgaaaattttaacagaaaaat
aacctttttatttctttgaaaatgatggttctgAGCCTGCGAGCTTGAAT
AAAGGATAAATCATGCATTAATTTGCATGTTAAATTCATTTTGTAGTGTT
CACATAACATAACCTACTACACATTCACTTACAGACTGGTTAGAATTGCT
CCAATAGTTCAAAACAGAGTCATATTCTGTAGCAAAttgtatgttgcgga
cataactatttaaagtatttatcagatttttaacCCTCTTTAGGAGTTAT
GCTAACACCTTGACAATACTAAAGAGTTACATTTGTAAAAACCATGCATT
TCCttgctttttttcaattttttgtgtcctctaGGGTCGTTCTTCTATTA
GAAATATGAGAAAGCTCTAATATCATTAATaagtcttcttttgttctttt
cgaagaaaaacatgtaataactgacatcaaaccaaaccaaatcttttggt
tttatattgatttagtctctataatattccttaaattttggcaatagaaa
aagacactccaaaattttaaataaattatgtatAATGTCCTATGTTTCTA
Ccctggaagaaaaaaagttatgtccgcaacacagcattattatacattta
atcctttctattgaaaaagttgagtgactctcaaggaaaaatcatattta
atgaTTATGAAGATGTACAACAGTTGATGTCAAGCTcaaatcttaacttt
taagaaaagattttaacaaaaaattttatatgattggattctcttttaca
aataaatcttcaattttcaggaaatcatagttacaaagatctttcaagac
aacaaatttcaatgattaagttttggttcaaatacagcaaagtattaaaa
gccaaataaaaactcaatttaatgtttattgcttattttaaaccaaattt
gacaaaaagttatgtccgcaaccaacaaggtttcattttataatttttta
ttgactaACTGAATTATagcaaacttttggttttttggaaggCTTATGAT
GagtccttcaaatctagaatAAAATTACCTGACCAtagccagttttcttt
tcatgaagtcaaactttatgggaatattttttagtattttcgattttctt
ttgaaaaaagtgtcataatttgaaaaatatgctatACTGGACGGTAAAAA
TTGCTTTCCAATGCAGCTTAATATATTAACCATGAACTGAAATCTAAGAC
AAGCATTAGATTATGCATATTTTATCTCAAATGAAGTGTAAActacaaag
agttttttgccaaatttgtctgATTATAACTACTCTAGGTCAAATTTCTG
GACCAAACCAGTTTGATTAAGCCCTGATACttagtttttctgaaaattga
ggtcattaataaaaaaattatccaggaataaaactgaaattcaaaactta
ttttttccaaaatttttcacctttttgggTGACATTACCAGACTTGTGCT
CTTAAGTAGAAtttttttAGATAATATCATCATTGCAgacgatagccctt
gacccaataacCATATATGGTCTAATATAATGTGTAATATAATACGAGGT
GATCAGAGCagatttttccgaaaataactTACAATGCCAATCAATTCata
gccctgacccgaaaattaaAGTTGcctatatctgaaaaagctaattaaaa
ttcagaaaacactaaagcttttttcacatgtgcgtaaaattttgcttaag
accttgaagggtggagaatttccctaagcttacgtagtgttttaaggcct
tatgtagagtttgctCACGTTCAAAAAGTGTGACCACGAGTAAGCATCCC
CTGCTACTCGAGTCACCCGCCATCTAaccaaaagagaagaaagtgtTGAT
CGAGCACAATATAGAAGAGAAGAGATTAGGAAAGAAAGATGCACTGtcga
aaagtttcaaaagtagGCCTAGAGCCCGGTTCAATGTGCCGTATCCGGGT
GGCCGTACGactgaaagaaaagaaacgaAATGAGGAATTTGAACATAAAA
CACATATATCAATACGAATTGACTTCTTTAACCAAAATTTACTAGTTTGA
GTCGCTAATTCACACATCCTGCAATCAAGTGGAGCGCTACCAACCACTTA
ACTTTTTTGTAAGTGCAAACGAGACATTCACAACcttcaaactaaaattt
ttttcaaaaatgaaatagaaCGACAAATCCGGAAAATGTTTTAGATAATT
ATGATGATattaaaataaaactaaaaaagactATTCAAGAACAGTGTTAC
ATTGCTAGCAAGGGAATGGAAAACTTGCTGGCGTCTATTaacttttttca
atgttttctgtAAAAAGATATGTATcataaataagaaaatctttagCCAT
Tcgatagtctagcaagctagacgactaattcagacatattagaaataaag
caaaaaagtaaattttagtctttatacaaactaaatcccgtatcattatt
tgtgtttattattagtattacatgcattataaacgactccagtctagcca
TTCGACAATCAGGACCCCGTTCCCGCTTATTGACATGTGATAATTTTCCC
ATCCCATCTGACTTAGAGCTTTGACGTGTCGAAACCTATTGgtatttata
ttattttctaAATAATCAGCACATTTGTCAAATAATATTGACTATAAAGG
GATCATAAAatgatttgacatttttggCCCACAGTCATAGTTAAACCTCA
ATGTTCGTCTATGCttttttttCAgtaattcatttttattattttaagac
GAGTCAAAGAACTCGAGGCAGATACCGTCCAACTACAAAACAACGTTCGT
AGTATGAAAATCAACGAAGAAAAAACTTCACGATCCAACGAAACCAAATC
GGAAAAAGTCGCACAAATGGAAGCAAAATTGGCAGAAATGGTTGACGCAG
CCAACGATATGGAAGAAAGATCGAAAGAACTTGAAACAGAACTCGATGAT
CAAGAAGGTAAGCTCTATTTTAGACAGTCCACTTTTCACCATGTCTATAG
AGATTCTTCATGTTTTGTTATGTTACGTAATTTTCGCCATTATGGAAGGA
AACGTTCgtttcgaatctgtagaggcgaTCTCATacgcaaatcgaatgtt
tgctcCCATAATGGCTGAATTTACGTAGCTGaacaacagctgattggttg
tctAAAGACagtgcattgccctcttttgacgtcaatgcaatgacttatTT
AAATCATAGTCCttttaaaaaacactggtctggaagcttattgttttaac
tttttgttagctttttcctttgttattatcaaaagatgaacatcgatttg
ctcagtttttgatcatgcccggggggggcagctgggcaaaaggaccgacg
ggtatgtgcgggtcctaagggtaccttttccaatatgtttaaaataggtc
gaaaaaactagagatgcactgtaagggtagaaatttcagaaaatttttga
aaaatctagatattttgaccaaaaatgctagaattttgaccattttttgc
acgaaagggatcgaaaatttgggggaaaatgcactctaagggtatgattt
tcactgatttttgctgcactgtaagggtgcaattttaaaagccaattttt
ggcccgcacataccgtcagtccgcaaacccagtgcccccccgggtGATCA
TGTTACCAAGTACTCCCATTGGGAtcggtttaagatttaatcacatgatc
aaaaagtgaacaaaacaaactaatttttcaacgcaagttcaagtaagaaa
caatggaaaaaatcaaaaggcCTCctgaccagggttttttatatggacta
tgtttaaatatttttcaagcaaagattttgattGCCAAGTGTTTGCTTTT
TCGGACAATTCAAACTCAAAGAACGGGAAGGCCAGTTTAAATTAGAGCTA
AATTACGAGCCGCCTTTCCCACCCATGTGACTTTTTATCACTTTGTTGGT
CTATAACATTTCACGTGTTTaactttaaattgaaaatagtATGTCAGTTC
CTTAAAACAGTACTGCAACGATTTCAAGTGACATCAATCACCCCCTCCCA
GGAACCTGGGAGGGGGTCGTAAAAAGTCACAACGGTTTCGAGATAAAAGC
AAAGGCCATGTTTGTCTGTTACGGCAAGTAGACTGTCAGTGATGTTCAAA
GCTCTTTGGCCTCTACTCGATGTCTAGACAAGACGCACTCCTTCCAAAGT
GGTAATAAGCCCTAATCAAAGTCAGAGATCACTGCACAGGTTtcagctct
agtttagacggtccaCTTTTCACCCTGCcttttctaattgtgaattaaag
tagGCATAAAGTTATCTGTTTGAAGTGGATATATTGCTTTCTTTTGATGT
AACTGCAATGTCgtctttcaacctttttcaagaaaaaattttaactgcca
acttggtgcccactttttgcctactctaacaattagaatggACGGGACAG
AAAGTCGGCCCTTTAAATAGAACTAACCAATGATAAAAGTGCTAATGATT
CCTCTTGATCGTCTCGTTTTAATTTATATATATTAATTGCTTTCCAATTT
GCAGAAGAACTAGAGGCAGCAAAGACACATTACGAAACAACGAAACTTGA
GTACGATCAACTCCTCGCCGAATTGGCTGAAGTATAAAGTATCTCTTTGT
TGGGGAAGATGTTTAGGGGTCAAATCAACACACACTTATGCAAACGCTAT
AAATATATAaatgtaattaattttttttactcttgattttttcaaaatag
ggaGGGAGGGGGTGTGTTTTCACTGTaaaaaaaaGGGGATAgggttaaaa
tttcaaatctatGGGTACCACTTTCTCTTTTTTGGTTTACTCCTCACTTG
GTTGCTGTTTGCTGTTTGtagagattttttcatttaagttttctgacacc
ttttattccatttgtggctgaattttttaatctcttttcctttctgcttt
ttttttgatatttttaccattatttattttctccttttttttggtttgtt
ttgttttgacgaaaaaaaaatcttcgaaatattaatgtgaaaagttttta
gcgaaaaaagaagaaaaaggaaactatttcaaaataatttttttctaaaa
ctttttttttgtaagacaTCACTATGTATTATTTagttttataaaagaaa
a
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000001_pilon | genome | sc0000001_pilon:1852474..1862924 + |
|