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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00045824 ID=TCONS_00045824|Name=TCONS_00045824|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=444bp
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ATTCTTGAGCTCAGCTTTCAGGCTACTTGGTGGAAAAACTGCAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_102:58624..84011+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00045824 ID=TCONS_00045824|Name=TCONS_00045824|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=25388bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_102:58624..84011+ (Clytia hemisphaerica)
AACAAAGCTACAgttgtaaaaaaatgagaatcgaaaatcaacaaaaaaaa
acaaaaaaattcgtcGACGTAGAAACAAAGTGTTGTGAGATGAAAAGATA
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GGACATGCTATATAAGATATGCTTtgtaaaaatattcatgatgaaattgg
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agaTTTTAACGATGTAACTGGCAGTGTCCTAAAATTTACCaaatattcat
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ggTAACCTCTTAGGAATACTTTGCTAAAAGCGTCAAAAGTTCGACTAAAG
Tcgctgttgttctactcttctcaagtcttttatctatatcataacaaaga
tagcAGAgccaaaatcatcgtcagcttgtcaaaactccgactattatttc
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ATTATGATGatacaggctctcaactttggcatactaaaggttattggagt
gacaaaagtgattaaaaaatattcatgCAGTTGACATTCTGCGTTTCAGC
GTTGAAAAATCTTGATacaatatattgcaaacttatgaaaaatatcgaga
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tttttcaaattccagTGGTACGTTCCCGTCGACCGTCAACGTTAGTgtag
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GTCtcttcaatttttacaatcggcATATTCAAATGAAATGAATCGATTTA
TTCATAaataggaaaatatttttaaaggttttccaGTTCTTTTGTAAGAT
GgaattatatatttttgatagAAGGTCTTCTCGATTTACTtaatttgtct
ggaatagttgtTGTGAcctaattttaagttttttgagtGTAGATTAGCTT
AATTTTCCAACTAGCCTTATGACCTACCGTCAAAGTCGTGGGTTCAAACG
ATGTGGGCGATTCATACCAGACTTTGTAGTTTTCTGCCTGATGCTCAATT
GAGAGAAAGGAACAAGGAAAAGTATcgagggagaaagagtggcgcatCCT
CTACATCCGTGTAGATTATCGAAAGTGGAGCCTTCGTGTCGCCTCCGGCT
GCGGTCACACACTGACTAACCTTTGAAATAAGTCATTTTTAAATTACATC
AAACCAAGAATGTAATTTCATAAATCAATTAACTGGTTTCATCTTGGCAA
AGAACTGTTTCAGCAAAACAAAGTCCACGTTGTACGGGGTCGTATAAATA
AATATTAGAAACCACGtaactttcgttttcgttttaaAGCAAAAAGCAAC
GTGGTTGTTTTATTGATTTGTTCGAAACCTTGAAATTACTTAAAAGTCTA
CTACATATGATGAGTCAGGGGCTAAATTGATTAAGGTGTTTAAGTTTGTT
ATCGGCTGGCTTGTTTCTCaccatttttgttcaaaatctaaaacatcGTC
AAATGACATTGTTAAGGCTATTTAAGGATATATTAAGGATATTCAATGCA
AAATAGTTTATCTTCGCTGTATGCTTGAAGTCAGTTTACTATCATTAAAG
GCTTTGGATTAATCCACTATCAAATTTTGCGTAAACAGTGTTTTGTATTA
GGGTACGTGACCAAAAAGTCAATAATTGCTTTAAAGAGcgttacacgttg
ttttttaagaacatccaaaatttttgaagcctttggatattcttaacttt
tttagttttaagactaaaaatgttcttaacatgttcttattttcaccatt
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AATGATAGAATCAACGCCCACACTTTGAAACTTTGAAACCTTGAAACTtc
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TTGAAATGTGGAGTTTCAAATGGCGACCAggaccagcgaccagataaatt
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ATGGTATATctggcgaaaataaaaaaatgtagtgtttccggaatgtgGGT
AAGGGATAAAAGCTCACATGCGGCCGggcgaaaaagattttttaactgAA
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TCTAAAAAAGACCTTTCAATATATGACTGCCCTTTCTTTATACTTACTGC
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CTTGGTGGTCGCATGAAGAGTGGTTGGTGTTCTTGGCTTTTGGGAGGATT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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|---|
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| TCONS_00045824-exon-scaffold_102-1491911889:83515..83602 | TCONS_00045824-exon-scaffold_102-1491911889:83515..83602 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045824-exon-scaffold_102-1510915933:83515..83602 | TCONS_00045824-exon-scaffold_102-1510915933:83515..83602 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045824-exon-scaffold_102-1575043694:83515..83602 | TCONS_00045824-exon-scaffold_102-1575043694:83515..83602 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045824-exon-scaffold_102-1491911889:83871..84011 | TCONS_00045824-exon-scaffold_102-1491911889:83871..84011 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045824-exon-scaffold_102-1510915933:83871..84011 | TCONS_00045824-exon-scaffold_102-1510915933:83871..84011 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045824-exon-scaffold_102-1575043694:83871..84011 | TCONS_00045824-exon-scaffold_102-1575043694:83871..84011 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_102 | supercontig | scaffold_102:58624..84011 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
