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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00045652 ID=TCONS_00045652|Name=TCONS_00045652|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5286bp
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ATTGTatcttttcaattcttttttttgatATCCAAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_100:173145..190768+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00045652 ID=TCONS_00045652|Name=TCONS_00045652|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17624bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_100:173145..190768+ (Clytia hemisphaerica)
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TCGAACTGCACAagacaaaaaccaaaataaatcaaatataaGATACATTT
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GTCTTTGTCACAGAAAAAACGCACATACGCAAACTCGCTAGTAGTAGCCC
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TAATTGCTTTTCATAACCATTATATAAATAAGAAATTATCTGCCTACTGC
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CTATTTTTATCAAGCAGTCtgtcaatgtttcttaagaaatcggcctttcg
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CTTAAATCGATAGATAGTTGATCTGATTGAGATAGTATAAATAAATAGAT
AAAACAAACTTGAAAATTCTGACTTAGACTTTTGTCTTGCCTTTGAGATG
ATATATCCGAATCAATAAGGAAAAAGTTAACTTTAAGCATAGCTTTACAT
GTTTGTCTCTAGGAATAGATATACTTTTTAGAAGTCTGGTGTCACGTTCT
GTAATGCGAAGCGTTTCACTTATTCTACACTTTCGAGTGCTCGACCTTTC
ACAGTGGCTACTCTGTCAAATCTCACTGAGAATGACGTAATTGGATACTT
CAATGACGTCATTGCATTGTTGTAATGTTTCTTTCTATATTTCGTGTACT
CGCTGTCTATAAATATGGTGTGCCCTAGCCGGATGATCCATGCTGTGATG
ttatatcagattataaaaatacagttgatttttttaatttcaattttcaa
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TGGTTTCTTTGAGTGAGAATTTTTAATTGTGATTCTTTGGGAGCTTGGTA
CTGAATATGACGGTGTGAAATACGATTTGACGGTGTGAAATACGATTTGA
CGGATTTTCACAAAGATTTGATGGATACAACCGTCATTTGAGCGAATGTA
TCTATTTATTTACCACGCTACTGCTGGGTAGGGGATGAGTACAAATGTTT
TGTTTATAGTAGATCTTGTGACGTTCTTAAGGTGAAGCAGATTCTTGAAA
TTTGAGTGTTTTATATCCGTCACTTGATCTGTCAAGTTTGTGCATTGATA
TCAAGTAGTAGGTGATTGAAATATCCAATTAAGACATtctgttttttata
tttcgtCCTAGATGGAGAGCAAATCAAATTGACCAAAGTATTCCTTTTAT
GGGAATGTTTCGCCCTCCTCAGGAGAGACATGCATCTTGTTTTTGTGAAG
CTTAAAGTTTCGTGGTGTTTGAATAGTAAATCGTCTggtgtcatattttt
caaaaattttatttttaaaaaaatcttatgaAATATACTTAATGCAGGTT
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ATTGCAGGTTTTTGTTTTGGGTTGCTATTCAAAGCAAAGTAACCGCTGTT
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TTCCAGATTTTTGCCGCCGCTctcccttgtacgcagagaataaaataaat
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CTCCCCTCctcttcactgcgtacgtactatatggatggcccctatAAATG
ATTAAGTCAGAAATCGAATGAATTCTAGACTGTTcctataatttttttaa
tcttgtgttttttcaaattacaagatctaaaaaCAGTGTTTTAAATCTGA
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TAGTTCACTTAAAGCAGTCTTGTTAAAATCTCGATCAATGGAAGACTTAT
AATAGTGTATGATAACTTTGCAAATAtaataactttacaaatatgTATTT
GCATATGAAAGGTGTATTTTCTTCAAGGGTCTTCTTACACCTTTTTGATA
AGTGCAGGGCTAATGTTTTGTCTTAACCTAATTacactttgagcctgaaa
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CGACTAATTTAGACATAgaagaaaataagcaaaaaatgttggAAGAGATA
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CAAGTTTCGCTAGTTTGATAATATTATTGTATGATGTTTTTATTCTGAGG
CATTGAGGTTAACTTaagttattcttaaatttttatcgCCTCCAATCTTT
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GACGTCATGAGTCCATGTGTCATTCAAGAATTTGTCAACCATGGTTCAAA
ATTATACAAAATCGCCAATGCCGATCGGTCGCACTACATCTGCGAGCGGC
CGTCCGTCAAAAATCTTGAAGCCGGATGTGAACAGACTGTTTATTTTGAT
TCGATGACCGTCTCAAAGGTTAATATCCATAACAAAGATTTGCATGACAT
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GTGTCTTGGATCAGCAAATTATAAGTGAACTTTTGAGACGTATTGTCAaa
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caattcttttttttgatATCCAAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00045652-exon-scaffold_100-1491911889:173145..173463 | TCONS_00045652-exon-scaffold_100-1491911889:173145..173463 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045652-exon-scaffold_100-1510915933:173145..173463 | TCONS_00045652-exon-scaffold_100-1510915933:173145..173463 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045652-exon-scaffold_100-1575043694:173145..173463 | TCONS_00045652-exon-scaffold_100-1575043694:173145..173463 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045652-exon-scaffold_100-1491911889:185802..190768 | TCONS_00045652-exon-scaffold_100-1491911889:185802..190768 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045652-exon-scaffold_100-1510915933:185802..190768 | TCONS_00045652-exon-scaffold_100-1510915933:185802..190768 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045652-exon-scaffold_100-1575043694:185802..190768 | TCONS_00045652-exon-scaffold_100-1575043694:185802..190768 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_100 | supercontig | scaffold_100:173145..190768 + |
Blast
BLAST of TCONS_00045652 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ITPK1 (Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase OS=Homo sapiens GN=ITPK1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 125.946 bits (315), Expect = 5.946e-30 Identity = 81/284 (28.52%), Postives = 147/284 (51.76%), Query Frame = 1
Query: 403 RVGVCFIELTRRKLRLPESLQELCLDHSIEFVVIDMNKSLDEQGPFDVIIHK---VLEWYNQGEDVGEAKLKKLLMHAQANPKLVLLDSVQKTYELADRLHSMEILKQCEFSLNGVEVFVPRFAFVEKTDSENVMAIVNKHSLSFPLITKPPLTRFDAEAHDMSIIFSEHSIGDVMSPCVIQEFVNHGSKLYKIANADRSHYICERPSVKNLEAGC--EQTVYFDSMTVSKVNIHNKDLHDIDPNRQKFRTYIEDQSQCVLDQQIISELLRRIVKYSGLYFFGV 1239
RVG E +KL ++ ELC +E V +++++ ++EQGP DVIIHK V+ +Q + + + + A+P+ ++LD + L DR S E++++ E + + P F + ++ M ++ K+ L+FP I K + +H+M+I+F++ + + PCV+Q F+NH + LYK+ S+ + +RPS+KN AG ++++F+S VSK + L ++D K E S ++I EL R + + G+ FG+
Sbjct: 9 RVGYWLSEKKIKKLNF-QAFAELCRKRGMEVVQLNLSRPIEEQGPLDVIIHKLTDVILEADQNDSQSLELVHRFQEYIDAHPETIVLDPLPAIRTLLDRSKSYELIRKIEAYMEDDRICSPPFMELTSLCGDDTMRLLEKNGLTFPFICKTRVAH-GTNSHEMAIVFNQEGLNAIQPPCVVQNFINHNAVLYKVFVVGESYTVVQRPSLKNFSAGTSDRESIFFNSHNVSKPE-SSSVLTELD----KIEGVFERPS-----DEVIRELSRALRQALGVSLFGI 280 HSP 2 Score: 125.946 bits (315), Expect = 6.106e-30 Identity = 71/229 (31.00%), Postives = 124/229 (54.15%), Query Frame = 1
Query: 1276 ANPKLVLLDSVQKTYELADRLHSMEILKQCEFSLNGVEVFVPRFAFVEKTDSENVMAIVNKHSLSFPLITKPPLTRFDAEAHDMSIIFSEHSIGDVMSPCVIQEFINHGSKLYKIANADRSHYICERPSVKNLEAGC--EQTVYFDSMTVSKVNIHNKDLHDIDPNRQKFRTYIEDQSQCVLDQQIISELLRRIVKYSGLYFFGVDIIIDQETGNYGIIDLNYMPSYNG 1956
A+P+ ++LD + L DR S E++++ E + + P F + ++ M ++ K+ L+FP I K + +H+M+I+F++ + + PCV+Q FINH + LYK+ S+ + +RPS+KN AG ++++F+S VSK + L ++D K E S ++I EL R + + G+ FG+DIII+ +TG + +ID+N P Y G
Sbjct: 87 AHPETIVLDPLPAIRTLLDRSKSYELIRKIEAYMEDDRICSPPFMELTSLCGDDTMRLLEKNGLTFPFICKTRVAH-GTNSHEMAIVFNQEGLNAIQPPCVVQNFINHNAVLYKVFVVGESYTVVQRPSLKNFSAGTSDRESIFFNSHNVSKPE-SSSVLTELD----KIEGVFERPS-----DEVIRELSRALRQALGVSLFGIDIIINNQTGQHAVIDINAFPGYEG 304
The following BLAST results are available for this feature:
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