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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00043942 ID=TCONS_00043942|Name=TCONS_00043942|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1835bp
TAAGCTGCGGATTTTGCGGTTTTGGGTGTCAACAAATTTTTGCTGTTTGC
TACctcaattttgcaaaatttggaaTCACTTCAGAAAAATTAGATTCAAT
CTGATCTGCAAAACTACGCAAAAATCAGGGAACTCCTcgaatccgcaaaa
ttaagtcccgcaaaatttttgaatttcacagataggcccatccgcgaaat
ttaattcccacAAAAGTTTATCCTATTAAAATACTTatgtggattaattt
ttgcgtggattaattttgtgaaaattaatccacgcaaaatttttgggaat
ttttcaatacaccgtttaacagtctcgccatctccgGAGATGGAgctcca
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tatttgaacatgatattaatgacaattttatgtatctctcctgaaaattt
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ccatatTTTACGGCtaggagagtgaagtttcccgtggttgccaaaatcaa
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GTATTGCGAAAATGTAAGTTGGTGATAACAAAGGAAaagtttgaaatcaa
aacataacaaGTTCAacttttcatttaaatttttaactttcaaTCTCTAG
TAATCTCCTAAGAATACCTTCTTTgtagttttttgaaaacttttgagaGA
CTTTGCCTGCCTTTGTtcaattaactttttttaaagtcaaaattacaCTA
TTAGCTTAGAGCCTTATGGTTGGAGTGTCAGATGTGATGTCTAATCTCTG
CTCAAAAAGTTTTCACTACACTTATACAAACGACTGATTGTATGTAAGCA
ATTTTTGTTGCTGCTAGTTTTATTGTGTCCTCCCTTTTTGCTGGGGGGAG
GGAGGACtagagatttttaaaattttccaaaagatGGGGGAGCAACAAAA
CTTTGATTTTCTTGGGGGTCTGAGACTAAAGGGATCACCTGCTTTTTAGG
AGGGGGGGGCTGAGATACAAGACCAGACCCAATTAATCAAACTTGCCAAA
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TAAAGTTTTGAGTAGATTATTAATCAAACCTAATCGagcaaaatttttta
agcaATAGGAGTTTGATTAGcttggtcagtaaaaagttttaattaGTTAA
GATTATTATTAGATCATATATTTTATCACTTGCAAAAACCCCTATTATGG
CAGATGATTGCCATTCTGACAGTTCCTGGACTTAAGTTtaattgtacccg
gatatttgtctatttGGAATAAAGCTTGAAGCtccccctctgttgcgatt
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TCTGGCATTGAAATTATGCAGGAAAAGTGGGTACATTATCGGAAGTAATT
CCCTGATTATCATTCTGAATTTGGCTTTAAACAGAAGCTGTTATATGGCG
GTGCAGCCTTGCAAACTTGTCAAACGAAATTGATCAGACCGCATCCCATT
GATTGAAATTATTAAaggaacactcacaatttttacaaatcttGCAGTAT
gagtttgatgaatttttttttcttgaactttaatcgttcgacaGAGTTTA
ATTAATACTCACTGTGATGGCATTAAAGTGTATTA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0004752:1..1835 Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00043942 ID=TCONS_00043942|Name=TCONS_00043942|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1835bp|location=Sequence derived from alignment at sc0004752:1..1835 (Clytia hemisphaerica)
TAATACACTTTAATGCCATCACAGTGAGTATTAATTAAACTCtgtcgaac
gattaaagttcaagaaaaaaaaattcatcaaactcATACTGCaagatttg
taaaaattgtgagtgttcctTTAATAATTTCAATCAATGGGATGCGGTCT
GATCAATTTCGTTTGACAAGTTTGCAAGGCTGCACCGCCATATAACAGCT
TCTGTTTAAAGCCAAATTCAGAATGATAATCAGGGAATTACTTCCGATAA
TGTACCCACTTTTCCTGCATAATTTCAATGCCAGAGGCAAACAAAACCGC
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ggaGCTTCAAGCTTTATTCCaaatagacaaatatccgggtacaattaAAC
TTAAGTCCAGGAACTGTCAGAATGGCAATCATCTGCCATAATAGGGGTTT
TTGCAAGTGATAAAATATATGATCTAATAATAATCTTAACtaattaaaac
tttttactgaccaagCTAATCAAACTCCTATtgcttaaaaaattttgctC
GATTAGGTTTGATTAATAATCTACTCAAAACTTTACTCATGATCGATGAT
AATGTTGAGTTCAATTAGTTCTATTGTTTAATTAGTTTGGCAAGTTTGAT
TAATTGGGTCTGGTCTTGTATCTCAGCCCCCCCCTCCTAAAAAGCAGGTG
ATCCCTTTAGTCTCAGACCCCCAAGAAAATCAAAGTTTTGTTGCTCCCCC
atcttttggaaaattttaaaaatctctaGTCCTCCCTCCCCCCAGCAAAA
AGGGAGGACACAATAAAACTAGCAGCAACAAAAATTGCTTACATACAATC
AGTCGTTTGTATAAGTGTAGTGAAAACTTTTTGAGCAGAGATTAGACATC
ACATCTGACACTCCAACCATAAGGCTCTAAGCTAATAGtgtaattttgac
tttaaaaaaagttaattgaACAAAGGCAGGCAAAGTCtctcaaaagtttt
caaaaaactacAAAGAAGGTATTCTTAGGAGATTACTAGAGAttgaaagt
taaaaatttaaatgaaaagtTGAACttgttatgttttgatttcaaacttT
TCCTTTGTTATCACCAACTTACATTTTCGCAATACACCATTtaacagtgt
cgactgcgcacacgtattaacaatttttcattgttttgattttggcaacc
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ttctcataagaaaacccaatagagaaatggtaggtaaagaactcttTTTA
ATcgtaacttcttttcctctagatgaatttttgtgaaattttcaggagag
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ctatctgtgaaattcaaaaattttgcgggacttaattttgcggattcgAG
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TCTGAAGTGAttccaaattttgcaaaattgagGTAGCAAACAGCAAAAAT
TTGTTGACACCCAAAACCGCAAAATCCGCAGCTTA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00043942-exon-sc0004752-1491911889:1..1835 | TCONS_00043942-exon-sc0004752-1491911889:1..1835 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00043942-exon-sc0004752-1510915933:1..1835 | TCONS_00043942-exon-sc0004752-1510915933:1..1835 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00043942-exon-sc0004752-1575043694:1..1835 | TCONS_00043942-exon-sc0004752-1575043694:1..1835 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0004752 | supercontig | sc0004752:1..1835 . |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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