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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00041542 ID=TCONS_00041542|Name=TCONS_00041542|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1387bp ATAAATTtgcaagaaaaaattcaaactgtGTGACTTCCTTCTTGCGTAAG GAGTGTGTTGGTGGGATGTTTTCGAATCCAGCAAAATCTTTGACAAGTGA TGATATTGAAGATGCATTACACAGGTACATCATTCTACAAATACCAAGAG ATAGTCACATGGTGTCATGTCGGGCAATGGGTCCAGAAGTTgtcgaaaaa aaacaagaaatggAAACCAAGATAGCCAAGATCCCTGGTATTGAGTTGGT CTTAGCGTGCGTGACTGGTACCAAAAGCAACTCTAAAAAGAAAGGCGTCT CTGGAAAGAATGCAATCAAAACGGGTGTGGCGTTTTTTGTGGTGATGATG GCAGAAGCTATCGAAGACGAAATCCTGAAAGCAATATATGAAAGTGGTGT GCCAGCTGACGTAAAATACATAAGGCCGAGATGCAAAAGTCGGGATTCCA AAGCCAATGCATTGCGAGCAGTATGCCAAGTTGTTAAGGACCACAACAAT CAATTTAGCACCGACCTTCTTGCAGAAACTGATATTGATGCATGCTCGCT GCTATCTTTCTGCCCTGAATTCCATAAAATGGTCAGTGATGCCAAACCAG CCTTACAATCATCTGGTCTGAATTGTAGTGTTAATTGTGGAGTTATTTCG AAAGTGGATGCCATAATTCGGGAGCCAGACTGTGATTTCGGAAGAGCACT TGAAGAAGTTCGAAAAGCAGTGCGCAATGCGAAACATGCCTTTTACAAAG GATCATTTTATGTCATGAGTGCTGGTGCTACATATGCTTATGAACATATG TGCACTGCAGACGCCTACATTGAAACCGTCCTTGATATCACAAGTCATAT GGGGAAATTTGCAAGACACACATTCCAGTTATCTCGGATGTTTTCAAAAT CAGACTGCATGTTGATTCCCCAATTGTATTTCGACTCTGACATCATCGAG ACAACGGGtggtaaatttttcaaattatctaGCATGCAGTTCATTCCTTG CCCATATAAGCCAGACGAATTGGGAAAGTTCTCACCAAGAATCTACAAAG AATACAACCGAAACATGGAAGATAATTATTTTGGTGAATGCGTCTCAAAC AGTATTAATACTCGACTAAAACGTACAACATTCTTAATCAAGTTCTACCA GTGCTTATTGCCCGGCCAGCTACCAATGAAAACGGAAAAGCCCCTTTTGG TTGGAGAGAAAAATTCCGGGAAGACCTCTATGGTTAAAATCGTCACTGCC CTTACCCATCCACAATTTTGGTGCACTCTTTCGAAGGAAAAGGTTTTTGG TCTTAGTCAAATCAACGACGATACTCAATTTGTATTCATTGACGAAATGA CGGAAGAACTGATATCTGCTGACAtggcaaaaatttt Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00041542-protein >TCONS_00041542-protein ID=TCONS_00041542-protein|Name=TCONS_00041542-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=461bp
KFARKNSNCVTSFLRKECVGGMFSNPAKSLTSDDIEDALHRYIILQIPRD SHMVSCRAMGPEVVEKKQEMETKIAKIPGIELVLACVTGTKSNSKKKGVS GKNAIKTGVAFFVVMMAEAIEDEILKAIYESGVPADVKYIRPRCKSRDSK ANALRAVCQVVKDHNNQFSTDLLAETDIDACSLLSFCPEFHKMVSDAKPA LQSSGLNCSVNCGVISKVDAIIREPDCDFGRALEEVRKAVRNAKHAFYKG SFYVMSAGATYAYEHMCTADAYIETVLDITSHMGKFARHTFQLSRMFSKS DCMLIPQLYFDSDIIETTGGKFFKLSSMQFIPCPYKPDELGKFSPRIYKE YNRNMEDNYFGECVSNSINTRLKRTTFLIKFYQCLLPGQLPMKTEKPLLV GEKNSGKTSMVKIVTALTHPQFWCTLSKEKVFGLSQINDDTQFVFIDEMT EELISADMAKI Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0002904:5863..15519- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00041542 ID=TCONS_00041542|Name=TCONS_00041542|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9657bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002904:5863..15519- (Clytia hemisphaerica) ATAAATTTGCAAGAAAAAATTCAAACTGTGTGACTTCCTTCTTGCGTAAG
GAGTGTGTTGGTGGGATGTTTTCGAATCCAGCAAAATCTTTGACAAGTGA
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ATAGTCACATGGTGTCATGTCGGGCAATGGGTCCAGAAGTTGTCGAAAAA
AAACAAGAAATGGAAACCAAGATAGCCAAGATCCCTGGTATTGAGTTGGT
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GCCAGCTGACGTAAAATACATAAGGCCGAGATGCAAAAGTCGGGATTCCA
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GGAGACATATCTCATTCTCCAATATTCGTTCCCATTTTTCTATTTTTTAT
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AAGCAATTTCAAGCTAAAAATGATGGGCTACAAGTTGGCTGCAAGTAGGC
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GGACATGGGCACTTTATTGAAACTTGGACTTTTTTGGTGAAGAATTTCAA
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ATTTATCTTTCAGTACTCTTTGTACGACAATTCGATAACGATATAAAGAA
AATTATTCTGAATAAAAATTAAAATCATTCTAAAATTGCCAAGATTCAAA
TGTTTATTTCTGTTTTGCTTGTTCGTTTTTCTTTAGTTCCTTCATTTCGG
CTTTTGCTTCTTCCTTTTTCTTTACCTCCTTCAATTCCTCTTTTGCTTCA
TTTTCTGTTGTGACGAGCCACTGTGGCAAAGTTCGCTGGTACCGCACTTT
GTAAAGTCTTTTCCTCTTTAGGCAAGGCATGCCATCAATTGTGTACACGG
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ATAACATCGTCAATCTTGCGTTTTGGCATGTTCTGTTCTTTCTGAACACC
AAATTAAAAGAAAGGTGACAGAATAACTGTAAGACACTATTTAAGTAGTA
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TAACGCATGCGCACACATTTACACTTTGTAATTTTTCATTGTTTTTTACA
AATATGGCTACTTTGAGAGTAGCCCTTGGGGAGCCCTTTGGTAGCCATCC
CATTTTAGCTTGAAGTTACTTGGTAGCCCGTAGCCCATTCAAATATGGCA
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ATTTTTATTGAATTCTTTCTAAGATGGGCTACTTTGAATGTAGCCCGCTT
GTAGCCCACTCGAAGCCCATCAGTTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCA
GTAGCCCGGTGAAATATGGTAAAATATTTTTTTTAGAGTGACGTCATGTT
AAAAATAGGAGAATGGAATAGAATACTAAGACGAGACATGCGCACTTCAT
TAAAATGTCGACTTTGTTGATTTTCATCGATTTTTTCTTAGATGGGCTAC
ATTGATTGTAGCCCGCTGGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTT
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CTTTGTTTATTTTCATGGAATTCTTTCTAATATGGGCTACTTTGATGGTA
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GGTAGCCAGTAGCCCAGTGAAATATGGTAAAATATCTTTTTTAAAGTGAC
GTCATGTTAAGAATAGGAGAATGGAATAGAATATCTAAGACGAGACATGC
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ATTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCAGTAGCCCAGTGAAATATGGTAA
AATATCTTTTTTAAAGTGACGTCATGTTAAGAATAGGAGAATGGAATAGA
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AGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCAGT
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GAAAGTGTTTGGTAGCCAGTAGCCCAGTGAAATATGGTAAAATATCTTTT
TTAAAGTGACGTCATGTTAAGAATAGGAGAATGGAATAGAATATCTAAGA
CGAGACATGCGCACTTCATGAAAATGTGGACTTTGTTTATTTTCATGGAA
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GTAGCCAGTAGCCCGGTGAAATATGGTAAAATATCTTTTTTAAAGTGACG
TCATGTTAAAAATAGGAGAATGGAATAGAGTATCTAGGAACGAGACATGC
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ATGGGCTACTTTGATTGTAGCCCGCTAGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAA
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TCATGAAAATGTGGACTTTGTTTATTTTCATGGAATTCTTTCTAATATGG
GCTACTTTGATTGTAGCCCGCTAGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTT
AGCTTGAAGTTGTTTGGTAGCCCGTAGCCCGATGAAATATGGTAAAATAT
CTTTTTTAGAGTGACGTCATGTTAAAAATAGGAGAATGGAATAGAGTATC
TAAGAATGAGGCATGACTCCTTATTAAATTATCCATCCCATTCTCCTCTT
ATTGATATGACGTCACCAGTAAATTAATATTTTGGCATATTTGAACGGGC
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AATGGAAGCGAGTATCTATGAACAAGACATGCGCACTTCATGAAAATGTG
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CGTCATACTTGAAATAGGAGAATGGAATCGAATATTCAAGAAGAAGACAT
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ATCCCAAAATTAATATTTTGGCATATTTGAACGGGCTACTGGCTACCAAG
CAATCTTAAGCTAAAAAGTTGGGGCTACCGGCTGGCTACGAGTGGGCTAC
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CCTCTTATTGATATGACGTCATCCCAAAATTAATATTTTGGCATATTTGA
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GCTGGCTACGAGTGGGCTACTCTCAATGTAGCCCATTTAAAAACCTTTTG
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TAAATTTTCGATCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACTCGGATAT
TAATATTTTGGCATATTTTAACGGGCTACTGGCTACCAAGCAATGTTAAG
CTAAAGATTGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTCTCAAAGTA
GCCCATTTAAAAACCTTTTGCTAAAAAGTTACAAAGTCGAAATTTCAATT
AAGTGCGCATGTGTCATTCTCCAATATTCGTTCCCATTCTCCTCTTATTG
ATATANGAGTGGGCTACCTTTAAAGTAGCCCATTTAAAAACGTTTTACTC
AAAAACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTGTCATTCTCCA
ATATTCGTTCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACCCGTGAATTAA
TATTTTGGCATATTTGAACGGGCTACGAGCTACCAAGCAATCTTAAGCTA
AAAATGGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTGTCAAAGTAGCC
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GGGCTACTCTCAAAGTAGCCCATTTAAAAACCTTTTGCTAAAAAGTTNAA
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CTTGATCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACTCGGAAATTTATAT
TTTTGCATATTTGAATGGGCTACTGGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAA
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TTAAAAACGTTTTACTCAAAAACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGC
GCATGTGTCATTCTCCAATATTCGTTCCCATTCTCCTATTATTGATATGA
CGTCACCCGTGAATTAATATTTTGGCATATTTGAACGGGCTACGAGCTAC
CAAGCAATCTTAAGCTAAAAATGGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGG
CTACTGTCAAAGTAGCCCATTTAAAAACGTTTTATTCAAAAACGACAAAG
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TTCTCCTATTATTGATATGACGTCACTCGGAAATTTATATTTTTGCATAT
TTGAATGGGCTACTGGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAAATTGTGGGCT
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TAAGCTAAAAATGGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTGTCAA
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ATTGATATGACGTCACTCGGAAATTTATATTTTTGCATATTTGAATGGGC
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TTCGTTCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACCCGTGAATTAATAT
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TTAAAAACGTTTTATTCAAAAACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGC
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CTACCTTTAAAGTAGCCCATTTAAAAACGTTTTACTCAAAAACGACAAAG
TCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTGTCATTCTCCAATATTCGTTCCCA
TTCTCCTATTATTGATATGACGTCACCCGTGAATTAATATTTTGGCATAT
TTGAACGGGCTACGAGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAAATGGTGGGCT
ACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTGTCAAAGTAGCCCATTTAAAAACGT
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CTTATTTGGCATAACATTATTCGATTCTCATTTAGGACCACAACAATCAA
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GTGGATGCCATAATTCGGGAGCCAGACTGTGATTTCGGAAGAGCACTTGA
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CATTTTATGTCATGAGTGCTGGTGGTAAGTGTAATTTTGAATTATTCGCT
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AGCCTAGGTTCATAGTTTTATTTTGTATTTTTACAGCTACATATGCTTAT
GAACATATGTGCACTGCAGACGCCTACATTGAAACCGTCCTTGATATCAC
AAGTCATATGGGGAAATTTGCAAGACACACATTCCAGTTATCTCGGATGT
TTTCAAAATCAGACTGCATGGTAAGTATGTCAAATTTAAACAGACATGTA
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AGCATGCAGTTCATTCCTTGCCCATATAAGCCAGACGAATTGGGAAAGTT
CTCACCAAGAATCTACAAAGAATACAACCGAAACATGGAAGATAATTATT
TTGGTGAATGCGTCTCAAACAGTATTAATACTCGACTAAAACGTACAACA
TTCTTAATCAAGTTCTACCAGTGCTTATTGCCCGGCCAGCTACCAATGAA
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TGGTTAAAATCGTCACTGCCCTTACCCATCCACAATTTTGGTGCACTCTT
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TGTATTCATTGACGAAATGACGGAAGAACTGATATCTGCTGACATGGCAA
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AGGATCATTTTATGTCATGAGTGCTGGTGATACCAAGAGATAGTCACATG GTGTCATGTCGGGCAATGGGTCCAGAAGTTGTCGAAAAAAAACAAGAAAT GGAAACCAAGATAGCCAAGATCCCTGGTATTGAGTTGGTCTTAGCGTGCG TGACTGGTACCAAAAGCAACTCTAAAAAGAAAGGCGTCTCTGGAAAGAAT GCAATCAAAACGGGTGTGGCGTTTTTTGTGGTGATGATGGCAGAAGCTAT CGAAGACGAAATCCTGAAAGCAATATATGAAAGTGGTGTGCCAGCTGACG TAAAATACATAAGGCCGAGATGCAAAAGTCGGGATTCCAAAGCCAATGCA TTGCGAGCAGTATGCCAAGTTGTTAAGAAATTTGCAAGAAAAAATTCAAA CTGTGTGACTTCCTTCTTGCGTAAGGAGTGTGTTGGTGGGATGTTTTCGA ATCCAGCAAAATCTTTGACAAGTGATGATATTGAAGATGCATTACACAGG TACATCATTCTACAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
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| TCONS_00041542-exon-sc0002904-1575043694:6500..6633 | TCONS_00041542-exon-sc0002904-1575043694:6500..6633 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00041542-exon-sc0002904-1510915933:15380..15519 | TCONS_00041542-exon-sc0002904-1510915933:15380..15519 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00041542-exon-sc0002904-1510915933:5863..6338 | TCONS_00041542-exon-sc0002904-1510915933:5863..6338 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00041542-exon-sc0002904-1491911889:15380..15519 | TCONS_00041542-exon-sc0002904-1491911889:15380..15519 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00041542-exon-sc0002904-1491911889:14882..15229 | TCONS_00041542-exon-sc0002904-1491911889:14882..15229 | Clytia hemisphaerica | exon |
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0002904 | supercontig | sc0002904:5863..15519 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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