TCONS_00041542 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00041542
Unique NameTCONS_00041542
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1387

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00041542 ID=TCONS_00041542|Name=TCONS_00041542|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1387bp
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GAGTGTGTTGGTGGGATGTTTTCGAATCCAGCAAAATCTTTGACAAGTGA
TGATATTGAAGATGCATTACACAGGTACATCATTCTACAAATACCAAGAG
ATAGTCACATGGTGTCATGTCGGGCAATGGGTCCAGAAGTTgtcgaaaaa
aaacaagaaatggAAACCAAGATAGCCAAGATCCCTGGTATTGAGTTGGT
CTTAGCGTGCGTGACTGGTACCAAAAGCAACTCTAAAAAGAAAGGCGTCT
CTGGAAAGAATGCAATCAAAACGGGTGTGGCGTTTTTTGTGGTGATGATG
GCAGAAGCTATCGAAGACGAAATCCTGAAAGCAATATATGAAAGTGGTGT
GCCAGCTGACGTAAAATACATAAGGCCGAGATGCAAAAGTCGGGATTCCA
AAGCCAATGCATTGCGAGCAGTATGCCAAGTTGTTAAGGACCACAACAAT
CAATTTAGCACCGACCTTCTTGCAGAAACTGATATTGATGCATGCTCGCT
GCTATCTTTCTGCCCTGAATTCCATAAAATGGTCAGTGATGCCAAACCAG
CCTTACAATCATCTGGTCTGAATTGTAGTGTTAATTGTGGAGTTATTTCG
AAAGTGGATGCCATAATTCGGGAGCCAGACTGTGATTTCGGAAGAGCACT
TGAAGAAGTTCGAAAAGCAGTGCGCAATGCGAAACATGCCTTTTACAAAG
GATCATTTTATGTCATGAGTGCTGGTGCTACATATGCTTATGAACATATG
TGCACTGCAGACGCCTACATTGAAACCGTCCTTGATATCACAAGTCATAT
GGGGAAATTTGCAAGACACACATTCCAGTTATCTCGGATGTTTTCAAAAT
CAGACTGCATGTTGATTCCCCAATTGTATTTCGACTCTGACATCATCGAG
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CCCATATAAGCCAGACGAATTGGGAAAGTTCTCACCAAGAATCTACAAAG
AATACAACCGAAACATGGAAGATAATTATTTTGGTGAATGCGTCTCAAAC
AGTATTAATACTCGACTAAAACGTACAACATTCTTAATCAAGTTCTACCA
GTGCTTATTGCCCGGCCAGCTACCAATGAAAACGGAAAAGCCCCTTTTGG
TTGGAGAGAAAAATTCCGGGAAGACCTCTATGGTTAAAATCGTCACTGCC
CTTACCCATCCACAATTTTGGTGCACTCTTTCGAAGGAAAAGGTTTTTGG
TCTTAGTCAAATCAACGACGATACTCAATTTGTATTCATTGACGAAATGA
CGGAAGAACTGATATCTGCTGACAtggcaaaaatttt
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00041542-protein

>TCONS_00041542-protein ID=TCONS_00041542-protein|Name=TCONS_00041542-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=461bp
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ANALRAVCQVVKDHNNQFSTDLLAETDIDACSLLSFCPEFHKMVSDAKPA
LQSSGLNCSVNCGVISKVDAIIREPDCDFGRALEEVRKAVRNAKHAFYKG
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GEKNSGKTSMVKIVTALTHPQFWCTLSKEKVFGLSQINDDTQFVFIDEMT
EELISADMAKI
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0002904:5863..15519-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00041542 ID=TCONS_00041542|Name=TCONS_00041542|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9657bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002904:5863..15519- (Clytia hemisphaerica)
ATAAATTTGCAAGAAAAAATTCAAACTGTGTGACTTCCTTCTTGCGTAAG GAGTGTGTTGGTGGGATGTTTTCGAATCCAGCAAAATCTTTGACAAGTGA TGATATTGAAGATGCATTACACAGGTACATCATTCTACAAGTAAGTTGTT TTAAGCTTTTTTTTGTCTCAACATTTCAATTTATTTTTATTTGACTCGGT TTTTTAGTGTTAAATTTTATTAAAGTTTTGTACTTGAACACTGATAATTC CGTCAAAAGGTTATTAAAGAATTATATTTTCCTAATTTAGATACCAAGAG ATAGTCACATGGTGTCATGTCGGGCAATGGGTCCAGAAGTTGTCGAAAAA AAACAAGAAATGGAAACCAAGATAGCCAAGATCCCTGGTATTGAGTTGGT CTTAGCGTGCGTGACTGGTACCAAAAGCAACTCTAAAAAGAAAGGCGTCT CTGGAAAGAATGCAATCAAAACGGGTGTGGCGTTTTTTGTGGTGATGATG GCAGAAGCTATCGAAGACGAAATCCTGAAAGCAATATATGAAAGTGGTGT GCCAGCTGACGTAAAATACATAAGGCCGAGATGCAAAAGTCGGGATTCCA AAGCCAATGCATTGCGAGCAGTATGCCAAGTTGTTAAGGTACTTGACTTG ATATTTAATGTTTTTATAACTAAATTTATGAATTGGACTTGCTTCAATGC ATCTTTCAATTAACTTTCTTTAGTGATGAGCCGCTGTGGCAAACTTCACT GATGTCCTTTGTAGCCCGTAGCCCATTCAAATATCGCAAAAATATATTTT TTGAGTGACGTAATACTAGAAATAGGGGAATGGAATCGAGTATATAAGAA GGAGACATATCTCATTCTCCAATATTCGTTCCCATTTTTCTATTTTTTAT GTCATTCAGAATTTTTTAGTTTGCCATATTTGAACGGGCTACTGGCTACT AAGCAATTTCAAGCTAAAAATGATGGGCTACAAGTTGGCTGCAAGTAGGC TACTATCAAAGTAGCCCATTAACAAAAAACAATGAAAAATTACATTTTTT GATGTGACGACATACTAAAAATAGAAGAATTTAACGAGAATTTAAGAACG GGACATGGGCACTTTATTGAAACTTGGACTTTTTTGGTGAAGAATTTCAA ATTTGGCTACTTTGATTTAAATAAGAAAGATTTTGAGTTTCTAATTTGTT GCATTTAAGAATAAAAAACAAGGGTTTCTGAGCTTTCAGTATGATATTTC ATTTATCTTTCAGTACTCTTTGTACGACAATTCGATAACGATATAAAGAA AATTATTCTGAATAAAAATTAAAATCATTCTAAAATTGCCAAGATTCAAA TGTTTATTTCTGTTTTGCTTGTTCGTTTTTCTTTAGTTCCTTCATTTCGG CTTTTGCTTCTTCCTTTTTCTTTACCTCCTTCAATTCCTCTTTTGCTTCA TTTTCTGTTGTGACGAGCCACTGTGGCAAAGTTCGCTGGTACCGCACTTT GTAAAGTCTTTTCCTCTTTAGGCAAGGCATGCCATCAATTGTGTACACGG TTGTCTCGTATTCTGTTTCAACTCCGCTGGAATCAGCGGAGTCAAGATAT ATAACATCGTCAATCTTGCGTTTTGGCATGTTCTGTTCTTTCTGAACACC AAATTAAAAGAAAGGTGACAGAATAACTGTAAGACACTATTTAAGTAGTA ACAAAATCAAAATGAGGTAAATTCACCACAACGAGGCAGACTTTTTTAAT TAACGCATGCGCACACATTTACACTTTGTAATTTTTCATTGTTTTTTACA AATATGGCTACTTTGAGAGTAGCCCTTGGGGAGCCCTTTGGTAGCCATCC CATTTTAGCTTGAAGTTACTTGGTAGCCCGTAGCCCATTCAAATATGGCA AAATATCTTTCTTAGAGTGACGTCACATTGAAAATAGTAGAATGGAAACT AGTATCTAAGATCGAGACATGCGCACTTCATGAAAATGTGGACTTTGTTG ATTTTTATTGAATTCTTTCTAAGATGGGCTACTTTGAATGTAGCCCGCTT GTAGCCCACTCGAAGCCCATCAGTTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCA GTAGCCCGGTGAAATATGGTAAAATATTTTTTTTAGAGTGACGTCATGTT AAAAATAGGAGAATGGAATAGAATACTAAGACGAGACATGCGCACTTCAT TAAAATGTCGACTTTGTTGATTTTCATCGATTTTTTCTTAGATGGGCTAC ATTGATTGTAGCCCGCTGGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTT GAAAGTGTTTGGTAGCCAGTAGCCCAGTGAAATATGGTAAAATATCTTTT TTAAAGTGACGTCATGTTAAGAATAGGAGAATGGAATAGAATATCTAAGA CGAGACATGCGCACTTCATGAAAATGTGGACTTTGTTTATTTTCATGGAA TTCTTTCTAATATGGGCTACTTTGATGGTAGCCCGCTAGTAGCCCACTGG TAGCCCGTCAATTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCAGTAGCCCAGTGA AATATGGTAAAATATCTTTTTTAAAGTGACGTCATGTTAAGAATAGGAGA ATGGAATAGAATATCTAAGACGAGACATGCGCACTTCATGAAAATGTGGA CTTTGTTTATTTTCATGGAATTCTTTCTAATATGGGCTACTTTGATGGTA GCCCGCTAGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTTGAAAGTGTTT GGTAGCCAGTAGCCCAGTGAAATATGGTAAAATATCTTTTTTAAAGTGAC GTCATGTTAAGAATAGGAGAATGGAATAGAATATCTAAGACGAGACATGC GCACTTCATGAAAATGTGGACTTTGTTTATTTTCATGGAATTCTTTCTAA TATGGGCTACTTTGATGGTAGCCCGCTAGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCA ATTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCAGTAGCCCAGTGAAATATGGTAA AATATCTTTTTTAAAGTGACGTCATGTTAAGAATAGGAGAATGGAATAGA ATATCTAAGACGAGACATGCGCACTTCATGAAAATGTGGACTTTGTTTAT TTTCATGGAATTCTTTCTAATATGGGCTACTTTGATGGTAGCCCGCTAGT AGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCAGT AGCCCAGTGAAATATGGTAAAATATCTTTTTTAAAGTGACGTCATGTTAA GAATAGGAGAATGGAATAGAATATCTAAGACGAGACATGCGCACTTCATG AAAATGTGGACTTTGTTTATTTTCATGGAATTCTTTCTAATATGGGCTAC TTTGATGGTAGCCCGCTAGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTT GAAAGTGTTTGGTAGCCAGTAGCCCAGTGAAATATGGTAAAATATCTTTT TTAAAGTGACGTCATGTTAAGAATAGGAGAATGGAATAGAATATCTAAGA CGAGACATGCGCACTTCATGAAAATGTGGACTTTGTTTATTTTCATGGAA TTCTTTCTAATATGGGCTACTTTGATGGTAGCCCGCTAGTAGCCCACTGG TAGCCCGTCAATTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCAGTAGCCCAGTGA AATATGGTAAAATATCTTTTTTAAAGTGACGTCATGTTAAGAATAGGAGA ATGGAATAGAATATCTAAGACGAGACATGCGCACTTCATTAAAATGTCGT CTTTGTTGATTTTCATCGATTTTTTCTAATCGGGGCTACATTGATTGTAG CCCGCTGGGAGCCTACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTTGAAAGTGTTTG GTAGCCAGTAGCCCGGTGAAATATGGTAAAATATCTTTTTTAAAGTGACG TCATGTTAAAAATAGGAGAATGGAATAGAGTATCTAGGAACGAGACATGC GCACTTCATGAAAATGTGGACTTTGTTTATTTTCATCGATTTTTTCTAAT ATGGGCTACTTTGATTGTAGCCCGCTAGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAA TTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCAATAGCCCGGTGAAATATGGCAAA ATATCTTTCTTAGAGTGACGTCATGTTAAAAATAGGAGAATGGAAACGAA TATCTAGGAACGAGACATGCGCACTTCATGAAAATGTGGACTTTGTTTAT TTTCGTCGATTTTTTCTAATATGGGCTACTTTGATTGTAGCCCGCTAGTA GCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCAGTA GCCCGGTGAAATATGGCAAAATATCTTTCNGCTTGAAAGTGTTTGGTAGC CAATAGCCCGGTGAAATATGGCAAAATATCTTTCTTAGAGTGACGTCATG TTAAAAATAGGAGAATGGAAACAAATATCTAGGAACGAGACATGCGCACT TCATGAAAATGTGGACTTTGTTTATTTTCATGGAATTCTTTCTAATATGG GCTACTTTGATTGTAGCCCGCTAGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTT AGCTTGAAGTTGTTTGGTAGCCCGTAGCCCGATGAAATATGGTAAAATAT CTTTTTTAGAGTGACGTCATGTTAAAAATAGGAGAATGGAATAGAGTATC TAAGAATGAGGCATGACTCCTTATTAAATTATCCATCCCATTCTCCTCTT ATTGATATGACGTCACCAGTAAATTAATATTTTGGCATATTTGAACGGGC TACTGGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAAATGGTGGGCTACCAGCTGGC TACGAGTGGGCTACTGTCAAAGTAGCCCATTTAAAAACCTTTTGCTAAAA AATTACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGCACATGTCTCGTTCTCTAATT GTCGAACCCATTCCCTTATTATGGATATGACGTCATGTTAAAATTAGGAG AATGGAAGCGAGTATCTATGAACAAGACATGCGCACTTCATGAAAATGTG GACTTTGTTGATTTTCATCGACTTTTTTCTAAGATGGGCTACTTTGATTG TAGCCCGCTGGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTTGAAAGTCT TTGGTAGCCTGTAGCCCATTCCAATATGGCAAAACATCTGTTTTGGTTGA CGTCATACTTGAAATAGGAGAATGGAATCGAATATTCAAGAAGAAGACAT GTCTCCCTTTTAAATTTTCGATCTCATTCTCCTATCATTGATATGACGTC ATCCCAAAATTAATATTTTGGCATATTTGAACGGGCTACTGGCTACCAAG CAATCTTAAGCTAAAAAGTTGGGGCTACCGGCTGGCTACGAGTGGGCTAC TGTCAAAGTAGCCCATTTAAAAACCTTTTGCTAAAAAACGACAAAGTCCA AATTTCAATTAAGTGCGCATGTGTCATTCTCCAATATTCGTTCCCATTCT CCTCTTATTGATATGACGTCATCCCAAAATTAATATTTTGGCATATTTGA ACGGGCTACTGGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAAAGTTGGGGCTACCG GCTGGCTACGAGTGGGCTACTCTCAATGTAGCCCATTTAAAAACCTTTTG CTAAAAAATGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTACGCATGTCTCCCTTT TAAATTTTCGATCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACTCGGATAT TAATATTTTGGCATATTTTAACGGGCTACTGGCTACCAAGCAATGTTAAG CTAAAGATTGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTCTCAAAGTA GCCCATTTAAAAACCTTTTGCTAAAAAGTTACAAAGTCGAAATTTCAATT AAGTGCGCATGTGTCATTCTCCAATATTCGTTCCCATTCTCCTCTTATTG ATATANGAGTGGGCTACCTTTAAAGTAGCCCATTTAAAAACGTTTTACTC AAAAACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTGTCATTCTCCA ATATTCGTTCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACCCGTGAATTAA TATTTTGGCATATTTGAACGGGCTACGAGCTACCAAGCAATCTTAAGCTA AAAATGGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTGTCAAAGTAGCC CATTTAAAAACGTTTTATTCAAAAACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAG TGCGCATGTTCCGTTCTTAAATTCTTGATCCCATTCTCCTATTATTGATA TGACGTCACTCGGAAATTTATATTTTTGCATATTTGAATGGGCTACTGGC TACCAAGCAATGTTAAGCTAAAAATTGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGT GGGCTACTCTCAAAGTAGCCCATTTAAAAACCTTTTGCTAAAAAGTTNAA AACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTTCCGTTCTTAAATT CTTGATCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACTCGGAAATTTATAT TTTTGCATATTTGAATGGGCTACTGGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAA ATTGTGGGCTACCAGATGGCTACGAGTGGGCTACCTTTAAAGTAGCCCAT TTAAAAACGTTTTACTCAAAAACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGC GCATGTGTCATTCTCCAATATTCGTTCCCATTCTCCTATTATTGATATGA CGTCACCCGTGAATTAATATTTTGGCATATTTGAACGGGCTACGAGCTAC CAAGCAATCTTAAGCTAAAAATGGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGG CTACTGTCAAAGTAGCCCATTTAAAAACGTTTTATTCAAAAACGACAAAG TCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTTCCGTTCTTAAATTCTTGATCCCA TTCTCCTATTATTGATATGACGTCACTCGGAAATTTATATTTTTGCATAT TTGAATGGGCTACTGGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAAATTGTGGGCT ACCAGATGGCTACGAGTGGGCTACCTTTAAAGTAGCCCATTTAAAAACGT TTTACTCAAAAACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTGTCA TTCTCCAATATTCGTTCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACCCGT GAATTAATATTTTGGCATATTTGAACGGGCTACGAGCTACCAAGCAATCT TAAGCTAAAAATGGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTGTCAA AGTAGCCCATTTAAAAACGTTTTATTCAAAAACGACAAAGTCCAAATTTC AATTAAGTGCGCATGTTCCGTTCTTAAATTCTTGATCCCATTCTCCTATT ATTGATATGACGTCACTCGGAAATTTATATTTTTGCATATTTGAATGGGC TACTGGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAAATTGTGGGCTACCAGATGGC TACGAGTGGGCTACCTTTAAAGTAGCCCATTTAAAAACGTTTTACTCAAA AACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTGTCATTCTCCAATA TTCGTTCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACCCGTGAATTAATAT TTTGGCATATTTGAACGGGCTACGAGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAA ATGGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTGTCAAAGTAGCCCAT TTAAAAACGTTTTATTCAAAAACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGC GCATGTTCCGTTCTTAAATTCTTGATCCCATTCTCCTATTATTGATATGA CGTCACTCGGAAATTTATATTTTTGCATATTTGAATGGGCTACTGGCTAC CAAGCAATCTTAAGCTAAAAATTGTGGGCTACCAGATGGCTACGAGTGGG CTACCTTTAAAGTAGCCCATTTAAAAACGTTTTACTCAAAAACGACAAAG TCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTGTCATTCTCCAATATTCGTTCCCA TTCTCCTATTATTGATATGACGTCACCCGTGAATTAATATTTTGGCATAT TTGAACGGGCTACGAGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAAATGGTGGGCT ACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTGTCAAAGTAGCCCATTTAAAAACGT TTTATTCAAAAACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTTCCG TTCTTAAATTCTTGATCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACTCGG AAATTTATATTTTTGCATATTTGAATGGGCTACTGGCTACCAAGCAATCT TCAGCTAAAAACTGTGGGCTACCAGATGGCTACGAGTGGGCTACCTTCAA AGTAGCCGTTTTAAATATTTTTCAGTAATAACCCACATTTCTATCAAGTG AAAAATATGAGTCACTGTAGCAGTTGTTGAGCAATGCTTTGCAATTTGGT CTTATTTGGCATAACATTATTCGATTCTCATTTAGGACCACAACAATCAA TTTAGCACCGACCTTCTTGCAGAAACTGATATTGATGCATGCTCGCTGCT ATCTTTCTGCCCTGAATTCCATAAAATGGTCAGTGATGCCAAACCAGCCT TACAATCATCTGGTCTGAATTGTAGTGTTAATTGTGGAGTTATTTCGAAA GTGGATGCCATAATTCGGGAGCCAGACTGTGATTTCGGAAGAGCACTTGA AGAAGTTCGAAAAGCAGTGCGCAATGCGAAACATGCCTTTTACAAAGGAT CATTTTATGTCATGAGTGCTGGTGGTAAGTGTAATTTTGAATTATTCGCT TATAAAAATCCAATTTTCCGGCCGCTTTCAATGCTGAATTCATTGGTAGC AGCCTAGGTTCATAGTTTTATTTTGTATTTTTACAGCTACATATGCTTAT GAACATATGTGCACTGCAGACGCCTACATTGAAACCGTCCTTGATATCAC AAGTCATATGGGGAAATTTGCAAGACACACATTCCAGTTATCTCGGATGT TTTCAAAATCAGACTGCATGGTAAGTATGTCAAATTTAAACAGACATGTA TAGTGATGTATAAATAAAAATCTCTTTTCGATATCCTCTTTATAACGGCA CAATCTTTAATTTATTTTCATTTAAATAATACCGTGCTAAATATTTTGTT ATTTGGAGCTTTATTATCTTCTTTATTTTAGTTGATTCCCCAATTGTATT TCGACTCTGACATCATCGAGACAACGGGTGGTAAATTTTTCAAATTATCT AGCATGCAGTTCATTCCTTGCCCATATAAGCCAGACGAATTGGGAAAGTT CTCACCAAGAATCTACAAAGAATACAACCGAAACATGGAAGATAATTATT TTGGTGAATGCGTCTCAAACAGTATTAATACTCGACTAAAACGTACAACA TTCTTAATCAAGTTCTACCAGTGCTTATTGCCCGGCCAGCTACCAATGAA AACGGAAAAGCCCCTTTTGGTTGGAGAGAAAAATTCCGGGAAGACCTCTA TGGTTAAAATCGTCACTGCCCTTACCCATCCACAATTTTGGTGCACTCTT TCGAAGGAAAAGGTTTTTGGTCTTAGTCAAATCAACGACGATACTCAATT TGTATTCATTGACGAAATGACGGAAGAACTGATATCTGCTGACATGGCAA AAATTTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0002904:5863..15519-

>TCONS_00041542 ID=TCONS_00041542|Name=TCONS_00041542|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=6915bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002904:5863..15519- (Clytia hemisphaerica)
TTGATTCCCCAATTGTATTTCGACTCTGACATCATCGAGACAACGGGTGG
TAAATTTTTCAAATTATCTAGCATGCAGTTCATTCCTTGCCCATATAAGC
CAGACGAATTGGGAAAGTTCTCACCAAGAATCTACAAAGAATACAACCGA
AACATGGAAGATAATTATTTTGGTGAATGCGTCTCAAACAGTATTAATAC
TCGACTAAAACGTACAACATTCTTAATCAAGTTCTACCAGTGCTTATTGC
CCGGCCAGCTACCAATGAAAACGGAAAAGCCCCTTTTGGTTGGAGAGAAA
AATTCCGGGAAGACCTCTATGGTTAAAATCGTCACTGCCCTTACCCATCC
ACAATTTTGGTGCACTCTTTCGAAGGAAAAGGTTTTTGGTCTTAGTCAAA
TCAACGACGATACTCAATTTGTATTCATTGACGAAATGACGGAAGAACTG
ATATCTGCTGACATGGCAAAAATTCTACATATGCTTATGAACATATGTGC
ACTGCAGACGCCTACATTGAAACCGTCCTTGATATCACAAGTCATATGGG
GAAATTTGCAAGACACACATTCCAGTTATCTCGGATGTTTTCAAAATCAG
ACTGCATGGACCACAACAATCAATTTAGCACCGACCTTCTTGCAGAAACT
GATATTGATGCATGCTCGCTGCTATCTTTCTGCCCTGAATTCCATAAAAT
GGTCAGTGATGCCAAACCAGCCTTACAATCATCTGGTCTGAATTGTAGTG
TTAATTGTGGAGTTATTTCGAAAGTGGATGCCATAATTCGGGAGCCAGAC
TGTGATTTCGGAAGAGCACTTGAAGAAGTTCGAAAAGCAGTGCGCAATGC
GAAACATGCCTTTTACAAAGGATCATTTTATGTCATGAGTGCTGGTGATA
CCAAGAGATAGTCACATGGTGTCATGTCGGGCAATGGGTCCAGAAGTTGT
CGAAAAAAAACAAGAAATGGAAACCAAGATAGCCAAGATCCCTGGTATTG
AGTTGGTCTTAGCGTGCGTGACTGGTACCAAAAGCAACTCTAAAAAGAAA
GGCGTCTCTGGAAAGAATGCAATCAAAACGGGTGTGGCGTTTTTTGTGGT
GATGATGGCAGAAGCTATCGAAGACGAAATCCTGAAAGCAATATATGAAA
GTGGTGTGCCAGCTGACGTAAAATACATAAGGCCGAGATGCAAAAGTCGG
GATTCCAAAGCCAATGCATTGCGAGCAGTATGCCAAGTTGTTAAGAAATT
TGCAAGAAAAAATTCAAACTGTGTGACTTCCTTCTTGCGTAAGGAGTGTG
TTGGTGGGATGTTTTCGAATCCAGCAAAATCTTTGACAAGTGATGATATT
GAAGATGCATTACACAGGTACATCATTCTACAATTGATTCCCCAATTGTA
TTTCGACTCTGACATCATCGAGACAACGGGTGGTAAATTTTTCAAATTAT
CTAGCATGCAGTTCATTCCTTGCCCATATAAGCCAGACGAATTGGGAAAG
TTCTCACCAAGAATCTACAAAGAATACAACCGAAACATGGAAGATAATTA
TTTTGGTGAATGCGTCTCAAACAGTATTAATACTCGACTAAAACGTACAA
CATTCTTAATCAAGTTCTACCAGTGCTTATTGCCCGGCCAGCTACCAATG
AAAACGGAAAAGCCCCTTTTGGTTGGAGAGAAAAATTCCGGGAAGACCTC
TATGGTTAAAATCGTCACTGCCCTTACCCATCCACAATTTTGGTGCACTC
TTTCGAAGGAAAAGGTTTTTGGTCTTAGTCAAATCAACGACGATACTCAA
TTTGTATTCATTGACGAAATGACGGAAGAACTGATATCTGCTGACATGGC
AAAAATTCTACATATGCTTATGAACATATGTGCACTGCAGACGCCTACAT
TGAAACCGTCCTTGATATCACAAGTCATATGGGGAAATTTGCAAGACACA
CATTCCAGTTATCTCGGATGTTTTCAAAATCAGACTGCATGGACCACAAC
AATCAATTTAGCACCGACCTTCTTGCAGAAACTGATATTGATGCATGCTC
GCTGCTATCTTTCTGCCCTGAATTCCATAAAATGGTCAGTGATGCCAAAC
CAGCCTTACAATCATCTGGTCTGAATTGTAGTGTTAATTGTGGAGTTATT
TCGAAAGTGGATGCCATAATTCGGGAGCCAGACTGTGATTTCGGAAGAGC
ACTTGAAGAAGTTCGAAAAGCAGTGCGCAATGCGAAACATGCCTTTTACA
AAGGATCATTTTATGTCATGAGTGCTGGTGATACCAAGAGATAGTCACAT
GGTGTCATGTCGGGCAATGGGTCCAGAAGTTGTCGAAAAAAAACAAGAAA
TGGAAACCAAGATAGCCAAGATCCCTGGTATTGAGTTGGTCTTAGCGTGC
GTGACTGGTACCAAAAGCAACTCTAAAAAGAAAGGCGTCTCTGGAAAGAA
TGCAATCAAAACGGGTGTGGCGTTTTTTGTGGTGATGATGGCAGAAGCTA
TCGAAGACGAAATCCTGAAAGCAATATATGAAAGTGGTGTGCCAGCTGAC
GTAAAATACATAAGGCCGAGATGCAAAAGTCGGGATTCCAAAGCCAATGC
ATTGCGAGCAGTATGCCAAGTTGTTAAGAAATTTGCAAGAAAAAATTCAA
ACTGTGTGACTTCCTTCTTGCGTAAGGAGTGTGTTGGTGGGATGTTTTCG
AATCCAGCAAAATCTTTGACAAGTGATGATATTGAAGATGCATTACACAG
GTACATCATTCTACAATTGATTCCCCAATTGTATTTCGACTCTGACATCA
TCGAGACAACGGGTGGTAAATTTTTCAAATTATCTAGCATGCAGTTCATT
CCTTGCCCATATAAGCCAGACGAATTGGGAAAGTTCTCACCAAGAATCTA
CAAAGAATACAACCGAAACATGGAAGATAATTATTTTGGTGAATGCGTCT
CAAACAGTATTAATACTCGACTAAAACGTACAACATTCTTAATCAAGTTC
TACCAGTGCTTATTGCCCGGCCAGCTACCAATGAAAACGGAAAAGCCCCT
TTTGGTTGGAGAGAAAAATTCCGGGAAGACCTCTATGGTTAAAATCGTCA
CTGCCCTTACCCATCCACAATTTTGGTGCACTCTTTCGAAGGAAAAGGTT
TTTGGTCTTAGTCAAATCAACGACGATACTCAATTTGTATTCATTGACGA
AATGACGGAAGAACTGATATCTGCTGACATGGCAAAAATTCTACATATGC
TTATGAACATATGTGCACTGCAGACGCCTACATTGAAACCGTCCTTGATA
TCACAAGTCATATGGGGAAATTTGCAAGACACACATTCCAGTTATCTCGG
ATGTTTTCAAAATCAGACTGCATGGACCACAACAATCAATTTAGCACCGA
CCTTCTTGCAGAAACTGATATTGATGCATGCTCGCTGCTATCTTTCTGCC
CTGAATTCCATAAAATGGTCAGTGATGCCAAACCAGCCTTACAATCATCT
GGTCTGAATTGTAGTGTTAATTGTGGAGTTATTTCGAAAGTGGATGCCAT
AATTCGGGAGCCAGACTGTGATTTCGGAAGAGCACTTGAAGAAGTTCGAA
AAGCAGTGCGCAATGCGAAACATGCCTTTTACAAAGGATCATTTTATGTC
ATGAGTGCTGGTGATACCAAGAGATAGTCACATGGTGTCATGTCGGGCAA
TGGGTCCAGAAGTTGTCGAAAAAAAACAAGAAATGGAAACCAAGATAGCC
AAGATCCCTGGTATTGAGTTGGTCTTAGCGTGCGTGACTGGTACCAAAAG
CAACTCTAAAAAGAAAGGCGTCTCTGGAAAGAATGCAATCAAAACGGGTG
TGGCGTTTTTTGTGGTGATGATGGCAGAAGCTATCGAAGACGAAATCCTG
AAAGCAATATATGAAAGTGGTGTGCCAGCTGACGTAAAATACATAAGGCC
GAGATGCAAAAGTCGGGATTCCAAAGCCAATGCATTGCGAGCAGTATGCC
AAGTTGTTAAGAAATTTGCAAGAAAAAATTCAAACTGTGTGACTTCCTTC
TTGCGTAAGGAGTGTGTTGGTGGGATGTTTTCGAATCCAGCAAAATCTTT
GACAAGTGATGATATTGAAGATGCATTACACAGGTACATCATTCTACAAT
TGATTCCCCAATTGTATTTCGACTCTGACATCATCGAGACAACGGGTGGT
AAATTTTTCAAATTATCTAGCATGCAGTTCATTCCTTGCCCATATAAGCC
AGACGAATTGGGAAAGTTCTCACCAAGAATCTACAAAGAATACAACCGAA
ACATGGAAGATAATTATTTTGGTGAATGCGTCTCAAACAGTATTAATACT
CGACTAAAACGTACAACATTCTTAATCAAGTTCTACCAGTGCTTATTGCC
CGGCCAGCTACCAATGAAAACGGAAAAGCCCCTTTTGGTTGGAGAGAAAA
ATTCCGGGAAGACCTCTATGGTTAAAATCGTCACTGCCCTTACCCATCCA
CAATTTTGGTGCACTCTTTCGAAGGAAAAGGTTTTTGGTCTTAGTCAAAT
CAACGACGATACTCAATTTGTATTCATTGACGAAATGACGGAAGAACTGA
TATCTGCTGACATGGCAAAAATTCTACATATGCTTATGAACATATGTGCA
CTGCAGACGCCTACATTGAAACCGTCCTTGATATCACAAGTCATATGGGG
AAATTTGCAAGACACACATTCCAGTTATCTCGGATGTTTTCAAAATCAGA
CTGCATGGACCACAACAATCAATTTAGCACCGACCTTCTTGCAGAAACTG
ATATTGATGCATGCTCGCTGCTATCTTTCTGCCCTGAATTCCATAAAATG
GTCAGTGATGCCAAACCAGCCTTACAATCATCTGGTCTGAATTGTAGTGT
TAATTGTGGAGTTATTTCGAAAGTGGATGCCATAATTCGGGAGCCAGACT
GTGATTTCGGAAGAGCACTTGAAGAAGTTCGAAAAGCAGTGCGCAATGCG
AAACATGCCTTTTACAAAGGATCATTTTATGTCATGAGTGCTGGTGATAC
CAAGAGATAGTCACATGGTGTCATGTCGGGCAATGGGTCCAGAAGTTGTC
GAAAAAAAACAAGAAATGGAAACCAAGATAGCCAAGATCCCTGGTATTGA
GTTGGTCTTAGCGTGCGTGACTGGTACCAAAAGCAACTCTAAAAAGAAAG
GCGTCTCTGGAAAGAATGCAATCAAAACGGGTGTGGCGTTTTTTGTGGTG
ATGATGGCAGAAGCTATCGAAGACGAAATCCTGAAAGCAATATATGAAAG
TGGTGTGCCAGCTGACGTAAAATACATAAGGCCGAGATGCAAAAGTCGGG
ATTCCAAAGCCAATGCATTGCGAGCAGTATGCCAAGTTGTTAAGAAATTT
GCAAGAAAAAATTCAAACTGTGTGACTTCCTTCTTGCGTAAGGAGTGTGT
TGGTGGGATGTTTTCGAATCCAGCAAAATCTTTGACAAGTGATGATATTG
AAGATGCATTACACAGGTACATCATTCTACAATTGATTCCCCAATTGTAT
TTCGACTCTGACATCATCGAGACAACGGGTGGTAAATTTTTCAAATTATC
TAGCATGCAGTTCATTCCTTGCCCATATAAGCCAGACGAATTGGGAAAGT
TCTCACCAAGAATCTACAAAGAATACAACCGAAACATGGAAGATAATTAT
TTTGGTGAATGCGTCTCAAACAGTATTAATACTCGACTAAAACGTACAAC
ATTCTTAATCAAGTTCTACCAGTGCTTATTGCCCGGCCAGCTACCAATGA
AAACGGAAAAGCCCCTTTTGGTTGGAGAGAAAAATTCCGGGAAGACCTCT
ATGGTTAAAATCGTCACTGCCCTTACCCATCCACAATTTTGGTGCACTCT
TTCGAAGGAAAAGGTTTTTGGTCTTAGTCAAATCAACGACGATACTCAAT
TTGTATTCATTGACGAAATGACGGAAGAACTGATATCTGCTGACATGGCA
AAAATTCTACATATGCTTATGAACATATGTGCACTGCAGACGCCTACATT
GAAACCGTCCTTGATATCACAAGTCATATGGGGAAATTTGCAAGACACAC
ATTCCAGTTATCTCGGATGTTTTCAAAATCAGACTGCATGGACCACAACA
ATCAATTTAGCACCGACCTTCTTGCAGAAACTGATATTGATGCATGCTCG
CTGCTATCTTTCTGCCCTGAATTCCATAAAATGGTCAGTGATGCCAAACC
AGCCTTACAATCATCTGGTCTGAATTGTAGTGTTAATTGTGGAGTTATTT
CGAAAGTGGATGCCATAATTCGGGAGCCAGACTGTGATTTCGGAAGAGCA
CTTGAAGAAGTTCGAAAAGCAGTGCGCAATGCGAAACATGCCTTTTACAA
AGGATCATTTTATGTCATGAGTGCTGGTGATACCAAGAGATAGTCACATG
GTGTCATGTCGGGCAATGGGTCCAGAAGTTGTCGAAAAAAAACAAGAAAT
GGAAACCAAGATAGCCAAGATCCCTGGTATTGAGTTGGTCTTAGCGTGCG
TGACTGGTACCAAAAGCAACTCTAAAAAGAAAGGCGTCTCTGGAAAGAAT
GCAATCAAAACGGGTGTGGCGTTTTTTGTGGTGATGATGGCAGAAGCTAT
CGAAGACGAAATCCTGAAAGCAATATATGAAAGTGGTGTGCCAGCTGACG
TAAAATACATAAGGCCGAGATGCAAAAGTCGGGATTCCAAAGCCAATGCA
TTGCGAGCAGTATGCCAAGTTGTTAAGAAATTTGCAAGAAAAAATTCAAA
CTGTGTGACTTCCTTCTTGCGTAAGGAGTGTGTTGGTGGGATGTTTTCGA
ATCCAGCAAAATCTTTGACAAGTGATGATATTGAAGATGCATTACACAGG
TACATCATTCTACAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_025489XLOC_025489Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00041542-exon-sc0002904-1575043694:6746..7034TCONS_00041542-exon-sc0002904-1575043694:6746..7034Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00041542-exon-sc0002904-1575043694:6500..6633TCONS_00041542-exon-sc0002904-1575043694:6500..6633Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00041542-exon-sc0002904-1575043694:5863..6338TCONS_00041542-exon-sc0002904-1575043694:5863..6338Clytia hemisphaericaexon
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TCONS_00041542-exon-sc0002904-1510915933:6500..6633TCONS_00041542-exon-sc0002904-1510915933:6500..6633Clytia hemisphaericaexon
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TCONS_00041542-exon-sc0002904-1491911889:14882..15229TCONS_00041542-exon-sc0002904-1491911889:14882..15229Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00041542-exon-sc0002904-1491911889:6746..7034TCONS_00041542-exon-sc0002904-1491911889:6746..7034Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00041542-exon-sc0002904-1491911889:6500..6633TCONS_00041542-exon-sc0002904-1491911889:6500..6633Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00041542-exon-sc0002904-1491911889:5863..6338TCONS_00041542-exon-sc0002904-1491911889:5863..6338Clytia hemisphaericaexon
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00041542-proteinTCONS_00041542-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0002904supercontigsc0002904:5863..15519 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.12901 0.381794 0.375099 0.166807 0.162457 0.128376 0.0387201 0.326243 0.49407 0.502975 0.671275 0.832648 0.727361 0.561632 0.684055 1.22861 0.370908 0.417117 0.577115 1.40134 0.203831 0.187931 0.172657 0.156971 0.161676 0.288584 0.108329 0.17629 0.0668549 0.0681146
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00041542 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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