TCONS_00041485 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00041485
Unique NameTCONS_00041485
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length6656

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00041485 ID=TCONS_00041485|Name=TCONS_00041485|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6656bp
CTTCATCTTCCATGAATGGGATGGTAGCGTCGGAATCGTAGCCATCATTG
TCGATGTTAGGTGGTTGTTCGACAGGGTCTGGGTCGACGAGCCTACTGTC
GTCATCACTGTCATGTTGGGATGGAATGACAGATTTAGTCTTTAGGATGT
GTTGACGGTTGTGACGGAGTGTACGACCATTTGACATTTTGATGTGGTAA
GATCGAGGTTGGTTGGCTTTGCTGACGATGGTTCCTGTGCGTGACCAGCT
TTTGCCATCATGGATGCGGACGGTGTCTCCTGGGCAAAGCTCTGGTTTGA
CATGTTGAGTTGTGTTCGGTTTGATGGTCTGAGGCTTGTGTTGACGTTTT
GGAGCTTTGCTGGTGATGGTGGGTAGGAGCGTTCTTGGTGATCTGTTGAA
CATACGATCGGCTGGAGATGGTTCACCGATGTTGGATGGAGTGGTTCGTA
GGGCGAGAAGAGAAAGGTTGAGATCTTCTCCCGCTTTGTGTGCTTTTTTG
AGAGTCCGTTTGACGGTTTGTACAGTACGTTCTGCAAGACCATTGGATTT
TGGGTATTCCGGACTGCTTGTGTTGTGATTGATGTCCCATTTGTCACAGA
AGTCGTTGTAGGCTTTGGCTGAATATTCAGGTCCGTTGTCGGAGACAATT
TCTTTGGGAATGCCATAACGTGAGAAAATGGCTTTGCTATGGGCAACGAC
GGTTGGACTTTCTGCATCAGGTAGTTCACTGATATCGAAGAACTTGGAGG
TGTAGTCAACAATTAGCAGAAATGTTTTCTGAAAAAGATGGAAGAGGTCG
GTTCCAACTTTGGTCCATGGCGTTTCTGGAATGTCGTGTTGAAGTGGTGC
TTCCGGACGTTGACGGTTTTGGTACTCTTGGCACTGTTGACATGTTTGGG
AGAGGTTTTCGAGTTGACTGTTGATACCTGGCCAGTAGACGGTGGTGCGG
GCACGAGCTTTGACTTTAACGATACCGGGATGTCCAATGTGGAGGAGTTG
AAGAATTTCTCTCTGCATGGATCGAGGAACAATGATGCGTTGTCCTTTCA
GGATGAGATCGGAGTTGATGCTAAGTTCGTCTCGGATGTTGAAGTACGGT
TTAGCAGCTGGATGGATATCTTTGATTTTGGGCCATCCTGATTTGATGTA
GTGTTTGATATGTTGAAGTGTTTCATCATTGGCGGTTTCGGTTCGGAATT
GGTCAAGTCTCTTGTCGCTCATCGGGAGGTTTGGAATAACTGAGTCGACG
AAAGCATTGAGTTCTTCGATAGGGATTTCTGAAGTCGTGTCGGATAGGGC
TGCGCGACTTAAGGCGTCGGATACAAACATTTTCGAGCCTTGTTCGTAAT
GAAGAGTGAATTTGAACTGTTGCAGGCGGAGTAGAAAACGTTGGATTCTT
GCTGGAGCTCGATATAACGGTTTGGTAAAGATAGATTTCAGTGGCTTGTG
GTCATtgaatacatcaaaatttagtcCGTAAATGTATTCTCTAAATCTCT
CACAAGCAAATACGATTGAGAGTGTCTCTCTTTCTAGTGGACAGTAGTTT
TGTTCGGCAGGCGATAACGAGCGAGATGCGAATGCGACTGGATGCCATTC
GTTTTCGTGTTGTTGTTCTAGGACGGCTCCTAGACCGAGTTTTGATGCAT
CTGATGAGACTCGGGTCGGGATGTTCGGATTGTAGTACTGGAGAACAGGA
CTGGATGTGACAAGTTCTTTCAGTCTTTGTACGGCATTACGTTGGGGTTC
ATCAAAAGTCCAAATTACGTCTTTTTCGAGGAGAGTGCGAAGAGGTGAAG
TTTCATCAGATAAACGAGGAATGAATTTGCCGAGATAAGTGATCATTCCG
AGAAAGCGTTGGAGTTCTTTGACGTTTGTTGGATCTGGCATGTTGAGAAT
CGCTTCGGTTTTTCGTGGATCAGGCGATGTTCCGTCAGCTGAAATGAGAT
GTCCGAGGAAAGTTAGCTGAGTTTTGTTGAATTGACATTTGTCCTTTCGT
AACTTAAGTCCTGATTTACGGATTTCTTCGAGAGTGGCTTTGGTACGTTC
TCGGAGTTGTTCAAGGGTGTTTCCCCAGATGATGATGTCGTCTTGGGCGT
TGACAGCTCCTTCAACGTTAGAGAGAATGCTTGCGATGCGAGCTTGACAA
ATTTCACTTGCTGAGTGGATACCGTAGGGCATGCGGAGATAACGATAACG
ACCGAAAGGTGTATTAAAAGTCAAGAGTTTAGAGCTTTCTTCGTCGAGTT
CGATTTGCCAATATGCATTTGATGCGTCGAGTTTTGTGAAATAACGGGCT
CCGGACATTTGAGATAGGATTTCTTCAGCAGTGGGTAGTTTGTGATGGTG
ACGTTTGATGGCTTTATTGAGATTTAGAGGATCAAGACAGACTCTGAGCG
CTCCACTAGGCTTGTAGGCGACTACTAGCGAAGATACCCAGTCTGTTGGT
TCAGTCACTTTAGTTATAACATTTAGATCAGTCATGCGTTGAAGTTCTTT
CTTCAGTTTTTCGCGCAGAGGTATTGGTACATTTCGACANGACTTAAGGC
GTCGGATACAAACATTTTCGAGCCTTGTTCGTAATGAAGAGTGAATTTGA
ACTGTTGCAGGCGGAGTAGAAAACGTTGGATTCTTGCTGGAGCTCGATAT
AACGGTTTGGTAAAGATAGATTTCAGTGGCTTGTGGTCATtgaatacatc
aaaatttagtcCGTAAATGTATTCTCTAAATCTCTCACAAGCAAATACGA
TTGAAAGTGTCTCTCTTTCTAGTGGACAGTAGTTTTGTTCGGCAGGCGAT
AACGAGCGAGATGCGAACGCGACTGGATGCTATTCGTTTTCGTGTTGTTG
TTCTAGGACGGCTCCTAGACCGAGTTTTGATGCATCTGATGAGACTCGGG
TCGGGATGTTCGGATTGTAGTACTGGAGAACAGGACTGGATGTGACAAGT
TCTTTCAGTCTTTGTACGGCATTACGTTGGGGTTCATCAAAAGTCCAAAT
TACGTCTTTTTCGAGGAGAGTGCGAAGAGGTGAAGTTTCATCAGATAAAC
GAGGAATGAATTTGTCGAGATAAGTGATCATTCCGAGAAAGCGTTGGAGT
TCTTTGACGTTAGTTGGATCTGGCATGTTGAGAATCGCTTCCGTTTTTCG
TGGATCAGGCGATGTTCCGTCAGCTGAGATGAGATGTCCGAGGAAAGTTA
GCTGAGTTTTGTTGAATTGACATTTGTCCTTTCGTAACTTAAGTCCTGAT
TTACGGATTTCTTCGAGAGTGGCTTTGGTACGTTCTCGGAGTTGTTCAAG
GGTGTTTCCCCAGATGATGATGTCGTCTTGGGCGTTGACAGCTCCTTCAA
CGTTAGAGAGAATGCTTGCGATGCGAGCTTGACAAATTTCACCTGCTGAG
TGTATACCGTAGGGCATGCGGAGATAACGATAACGACCGAAAGGTGTATT
AAAATTCAAGAGTTTAGAGCTTTCTTCGTCGAGTTCGATTTGCCAATATG
CATTTGATGCGTCGAGTTTTGTGAAATAACGGGCTCCGGACATTTGAGAT
AGGATTTCTTCAGCAGTGGGTAGTTTGTGATGGTGACGTTTGATGGCTTT
ATTGAGATTTAGAGGGTCAAGACAGACTCTTAGCGCTCCACTAGGCTTGT
ATGCGACTACTAGCGAAGATACCCAGTCTGTTGGTTCAGTCACTTTAGTT
ATAACATTTAGATCAGTCATGCGTTGAAGTTCTTTCTTCAGTTTTTCGCG
CAGAGGTATTGGTACATTTCGACAAGCATCGACTACTGGTGGTACATTTG
GGTCGGTCACAATGTGGTACTTGTCTTGGAGGGTACCAAGTTCTCCAAAA
CAGTCATTGTACTCGTTCATAAGATCAGAGGATTCTGTGTTGAGAGTTTC
TATGCGTTGAATTAAATCTAAATCACACGACGTTTTTAAGCTGAGGATTG
GTGATGCATCTTCCTTGGTAACGAAAAACATTGTTGGTGTTGATCCATTA
CGGTGTTTGATGCGAAGAATACATTGACCTGCTATAGAAATGTCAGTTTT
ATTATACGCTGTCAGTTTATACTTCGATGGTAAAAGTCTGGCAGGTTTAC
GAAGGCGTTTGAAGGTTGATATCGGAATGACATTAGCTCTGGCACCGGTA
TCGATTTTAAATGTTATTGGTGTGCCATTTGTGTTGAGGTCAATGAGCCA
ATCTGGGTGTTTTGTGGCTGTAGGGTCGGAAATTTGATCGATTTCGGCTG
TTGATTCTACTTTGATAGCATCAACTTCTGGTGGAGTATCGTTGTTGGAG
AGTTCAATCGATCCTAGGTAAAATTCATCCTCAGATTCAGATTCAGAGTC
GGTAGCGAGTTCTGGGAGTTGAGGTTCTACGTGGTGGATTTGTTTACGTG
GAGGTTTTCTATTTCGTGGACCTTTGGATTTGTTGGAGTCGTGGTTTCCC
TTGGATGATTTAGTGCAGCATTTGGAAAAATGTCCTTTGGATTTACAGTT
ATTGCACAACTTGCCGTAGGCAGGACATGCTCCTCGATGGTGACTACCAG
CACAAAATTTACAGTGTTTAATAATTTCCTTACTTTTAGAATGACGTTGG
TCGATATGGTTTACGTCTCGTTCAAGTGGATGGGACGATGATGATGGTAA
GGGTAGGTCATTTTGGTGGATGGATGGATTTTGTTTGAAGTTTAGATGCT
TCTGAagctcgacagtttgaaagtaCTTTTTCAAGAGTTATATCGTTTTC
TCGTAGGAGTCGTTCTTGCAGTTTTTTGTCTCTGAGTCCAATGATTATCA
TGTCTTTTATCAAAGAGTCACGTAATTGATTAAATTCGCAATCTTCAATC
ATCTTTTTGATACGTGTGTAAAATTCATCAAACTTTTCGTTTTCTGTTTG
ACGAGTGGTGAAGAATGAAAATCTCATGAAGGTCAAATTTNAGGTACATT
TTGACAAGCATCGACTACTGGTGGTACATTTGGGTCGGTCACAATGTGGT
ACTTGTCTTGGAGGGTACCAAGTTCTCCAAAACAGTCATTGTACTCGTTC
ATAAGATCAGAGGATTCTGTGTTGAGAGTTTCTATACGTCGAATTAAATC
TAAATCACACGACGTTTTTAAGCTGAGGATTGGTGATGCATCTTCCTTGG
TAACGAAAAACATTGTTGGTGTTGATCCATTACGGTGTGTGATGCGAAGA
ATACATTGACCTGCTATAGAAATGTCAGTTTTATTATACGCTGTCAGTTT
ATATTTCGATGGTAAAAGTCTGGCAGGTTTACGAAGGCGTTTGAAGGTTG
ATATCGGAATGACATTAGCTCTGGCACCGGTATCGATTTTAAATGTTATT
GGTGTGCCATTTGTGTTGAGGTCAATGAGCCAATCTGGGTGTTTTGTGGC
TGTAGGGTCGGAAATTTGATCGATTTCGGCTGTTGATTCTACTTTGATAG
CATCAACTTCTGGTGGAGTATCGTTGTTGGAGAGTTCAATCGATCCTAGG
TAAAATTCATCCTCAGATTCAGATTCAGAGTCGGTAGCGAGTTCTGGGAG
TTGAGGTTCTACGTGGTGGATTTGTTTACGTGGAGGTTTTCTATTTCGTG
GACCTTTGGATTTGTTGGAGTCGTGGTTTCCCTTGGATGATTTAGTGCAG
CATTTGGAAAAATGTCCTTTGGATTTACAGTTATTGCACAACTTGCCGTA
GGCAGGACATGCTCCTCGATGGTGACTACCAGCACAAAATTTACAGTGTT
TAATAATTTCCTTACTTTTAGAATGACGTTGGTCGATATGGTTTACGTCT
CGTTCAAGTGGATGGGACGATGATGATGGTAAGGGTAGGTCATTTTTGTG
GTGGATGGATTTTGTTTGAAGTTTAGATGCTTCTGAagctcgacagtttg
aaagtaCTTTTTCAAGAGTTATATCGTTTTCTCGTAGGAGTCGTTCCTGC
AGTTTTTTGTCTCTGAGTCCAATGATTATCATGTCTTTTATCAAAGAGTC
ACGTAATTGATTAAATTCGCAATCTTCACTCATCTTTTTGATACGTGTGT
AAAATTCATCAAACTTTTCGTTTTCTGTTTGACGAGTGGTGAAGAATGAA
AATCTCATGAAGGTCAAATTTTTCCTTGGTTTAAAGTGATTGTCGAATTT
TTGTAAGATGATGTTGAGTTTCATCCCATCAccttcttcaaattcaaaag
tGTCGTAAATTTCTTTACATTGCTTGCCAATGCGTTGGAGGAGTATTGAG
GATTTCACCAGATCAGGCTTGGTTGATGATTCTGTTGCTTGCAAGAAGAT
TTGGAACGATTTCTTCCATGATTTCCACAGTTCAGTATGGTTGCAAGTTG
AATCCAGATTAAGTGCTTTTGGTGCTTTCAGGCTGTCcatattgacaaaa
atattaccACCAAATGCAGGAGTAGGTTCTTCTGACTTGAAGTCAATGTT
CTGACACCATGTTATGATCTTATACAAGAGGATAGAGACGGATAGAATAG
AGACTGTAATGAGCTGTTCAGCTTTAGGACGCCATCTTGAATGAGAAAGA
CTAGATAATAATATAGCTATGTACAGGGAAGTAGATATACACTAAGATGG
TTATGTGGAGGTAGAAACGGGACCAGCTAGGAAGCTGGCTCTTAGAGCTT
AGGAGA
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0002891:1..6656+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00041485 ID=TCONS_00041485|Name=TCONS_00041485|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6656bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002891:1..6656+ (Clytia hemisphaerica)
CTTCATCTTCCATGAATGGGATGGTAGCGTCGGAATCGTAGCCATCATTG
TCGATGTTAGGTGGTTGTTCGACAGGGTCTGGGTCGACGAGCCTACTGTC
GTCATCACTGTCATGTTGGGATGGAATGACAGATTTAGTCTTTAGGATGT
GTTGACGGTTGTGACGGAGTGTACGACCATTTGACATTTTGATGTGGTAA
GATCGAGGTTGGTTGGCTTTGCTGACGATGGTTCCTGTGCGTGACCAGCT
TTTGCCATCATGGATGCGGACGGTGTCTCCTGGGCAAAGCTCTGGTTTGA
CATGTTGAGTTGTGTTCGGTTTGATGGTCTGAGGCTTGTGTTGACGTTTT
GGAGCTTTGCTGGTGATGGTGGGTAGGAGCGTTCTTGGTGATCTGTTGAA
CATACGATCGGCTGGAGATGGTTCACCGATGTTGGATGGAGTGGTTCGTA
GGGCGAGAAGAGAAAGGTTGAGATCTTCTCCCGCTTTGTGTGCTTTTTTG
AGAGTCCGTTTGACGGTTTGTACAGTACGTTCTGCAAGACCATTGGATTT
TGGGTATTCCGGACTGCTTGTGTTGTGATTGATGTCCCATTTGTCACAGA
AGTCGTTGTAGGCTTTGGCTGAATATTCAGGTCCGTTGTCGGAGACAATT
TCTTTGGGAATGCCATAACGTGAGAAAATGGCTTTGCTATGGGCAACGAC
GGTTGGACTTTCTGCATCAGGTAGTTCACTGATATCGAAGAACTTGGAGG
TGTAGTCAACAATTAGCAGAAATGTTTTCTGAAAAAGATGGAAGAGGTCG
GTTCCAACTTTGGTCCATGGCGTTTCTGGAATGTCGTGTTGAAGTGGTGC
TTCCGGACGTTGACGGTTTTGGTACTCTTGGCACTGTTGACATGTTTGGG
AGAGGTTTTCGAGTTGACTGTTGATACCTGGCCAGTAGACGGTGGTGCGG
GCACGAGCTTTGACTTTAACGATACCGGGATGTCCAATGTGGAGGAGTTG
AAGAATTTCTCTCTGCATGGATCGAGGAACAATGATGCGTTGTCCTTTCA
GGATGAGATCGGAGTTGATGCTAAGTTCGTCTCGGATGTTGAAGTACGGT
TTAGCAGCTGGATGGATATCTTTGATTTTGGGCCATCCTGATTTGATGTA
GTGTTTGATATGTTGAAGTGTTTCATCATTGGCGGTTTCGGTTCGGAATT
GGTCAAGTCTCTTGTCGCTCATCGGGAGGTTTGGAATAACTGAGTCGACG
AAAGCATTGAGTTCTTCGATAGGGATTTCTGAAGTCGTGTCGGATAGGGC
TGCGCGACTTAAGGCGTCGGATACAAACATTTTCGAGCCTTGTTCGTAAT
GAAGAGTGAATTTGAACTGTTGCAGGCGGAGTAGAAAACGTTGGATTCTT
GCTGGAGCTCGATATAACGGTTTGGTAAAGATAGATTTCAGTGGCTTGTG
GTCATtgaatacatcaaaatttagtcCGTAAATGTATTCTCTAAATCTCT
CACAAGCAAATACGATTGAGAGTGTCTCTCTTTCTAGTGGACAGTAGTTT
TGTTCGGCAGGCGATAACGAGCGAGATGCGAATGCGACTGGATGCCATTC
GTTTTCGTGTTGTTGTTCTAGGACGGCTCCTAGACCGAGTTTTGATGCAT
CTGATGAGACTCGGGTCGGGATGTTCGGATTGTAGTACTGGAGAACAGGA
CTGGATGTGACAAGTTCTTTCAGTCTTTGTACGGCATTACGTTGGGGTTC
ATCAAAAGTCCAAATTACGTCTTTTTCGAGGAGAGTGCGAAGAGGTGAAG
TTTCATCAGATAAACGAGGAATGAATTTGCCGAGATAAGTGATCATTCCG
AGAAAGCGTTGGAGTTCTTTGACGTTTGTTGGATCTGGCATGTTGAGAAT
CGCTTCGGTTTTTCGTGGATCAGGCGATGTTCCGTCAGCTGAAATGAGAT
GTCCGAGGAAAGTTAGCTGAGTTTTGTTGAATTGACATTTGTCCTTTCGT
AACTTAAGTCCTGATTTACGGATTTCTTCGAGAGTGGCTTTGGTACGTTC
TCGGAGTTGTTCAAGGGTGTTTCCCCAGATGATGATGTCGTCTTGGGCGT
TGACAGCTCCTTCAACGTTAGAGAGAATGCTTGCGATGCGAGCTTGACAA
ATTTCACTTGCTGAGTGGATACCGTAGGGCATGCGGAGATAACGATAACG
ACCGAAAGGTGTATTAAAAGTCAAGAGTTTAGAGCTTTCTTCGTCGAGTT
CGATTTGCCAATATGCATTTGATGCGTCGAGTTTTGTGAAATAACGGGCT
CCGGACATTTGAGATAGGATTTCTTCAGCAGTGGGTAGTTTGTGATGGTG
ACGTTTGATGGCTTTATTGAGATTTAGAGGATCAAGACAGACTCTGAGCG
CTCCACTAGGCTTGTAGGCGACTACTAGCGAAGATACCCAGTCTGTTGGT
TCAGTCACTTTAGTTATAACATTTAGATCAGTCATGCGTTGAAGTTCTTT
CTTCAGTTTTTCGCGCAGAGGTATTGGTACATTTCGACANGACTTAAGGC
GTCGGATACAAACATTTTCGAGCCTTGTTCGTAATGAAGAGTGAATTTGA
ACTGTTGCAGGCGGAGTAGAAAACGTTGGATTCTTGCTGGAGCTCGATAT
AACGGTTTGGTAAAGATAGATTTCAGTGGCTTGTGGTCATtgaatacatc
aaaatttagtcCGTAAATGTATTCTCTAAATCTCTCACAAGCAAATACGA
TTGAAAGTGTCTCTCTTTCTAGTGGACAGTAGTTTTGTTCGGCAGGCGAT
AACGAGCGAGATGCGAACGCGACTGGATGCTATTCGTTTTCGTGTTGTTG
TTCTAGGACGGCTCCTAGACCGAGTTTTGATGCATCTGATGAGACTCGGG
TCGGGATGTTCGGATTGTAGTACTGGAGAACAGGACTGGATGTGACAAGT
TCTTTCAGTCTTTGTACGGCATTACGTTGGGGTTCATCAAAAGTCCAAAT
TACGTCTTTTTCGAGGAGAGTGCGAAGAGGTGAAGTTTCATCAGATAAAC
GAGGAATGAATTTGTCGAGATAAGTGATCATTCCGAGAAAGCGTTGGAGT
TCTTTGACGTTAGTTGGATCTGGCATGTTGAGAATCGCTTCCGTTTTTCG
TGGATCAGGCGATGTTCCGTCAGCTGAGATGAGATGTCCGAGGAAAGTTA
GCTGAGTTTTGTTGAATTGACATTTGTCCTTTCGTAACTTAAGTCCTGAT
TTACGGATTTCTTCGAGAGTGGCTTTGGTACGTTCTCGGAGTTGTTCAAG
GGTGTTTCCCCAGATGATGATGTCGTCTTGGGCGTTGACAGCTCCTTCAA
CGTTAGAGAGAATGCTTGCGATGCGAGCTTGACAAATTTCACCTGCTGAG
TGTATACCGTAGGGCATGCGGAGATAACGATAACGACCGAAAGGTGTATT
AAAATTCAAGAGTTTAGAGCTTTCTTCGTCGAGTTCGATTTGCCAATATG
CATTTGATGCGTCGAGTTTTGTGAAATAACGGGCTCCGGACATTTGAGAT
AGGATTTCTTCAGCAGTGGGTAGTTTGTGATGGTGACGTTTGATGGCTTT
ATTGAGATTTAGAGGGTCAAGACAGACTCTTAGCGCTCCACTAGGCTTGT
ATGCGACTACTAGCGAAGATACCCAGTCTGTTGGTTCAGTCACTTTAGTT
ATAACATTTAGATCAGTCATGCGTTGAAGTTCTTTCTTCAGTTTTTCGCG
CAGAGGTATTGGTACATTTCGACAAGCATCGACTACTGGTGGTACATTTG
GGTCGGTCACAATGTGGTACTTGTCTTGGAGGGTACCAAGTTCTCCAAAA
CAGTCATTGTACTCGTTCATAAGATCAGAGGATTCTGTGTTGAGAGTTTC
TATGCGTTGAATTAAATCTAAATCACACGACGTTTTTAAGCTGAGGATTG
GTGATGCATCTTCCTTGGTAACGAAAAACATTGTTGGTGTTGATCCATTA
CGGTGTTTGATGCGAAGAATACATTGACCTGCTATAGAAATGTCAGTTTT
ATTATACGCTGTCAGTTTATACTTCGATGGTAAAAGTCTGGCAGGTTTAC
GAAGGCGTTTGAAGGTTGATATCGGAATGACATTAGCTCTGGCACCGGTA
TCGATTTTAAATGTTATTGGTGTGCCATTTGTGTTGAGGTCAATGAGCCA
ATCTGGGTGTTTTGTGGCTGTAGGGTCGGAAATTTGATCGATTTCGGCTG
TTGATTCTACTTTGATAGCATCAACTTCTGGTGGAGTATCGTTGTTGGAG
AGTTCAATCGATCCTAGGTAAAATTCATCCTCAGATTCAGATTCAGAGTC
GGTAGCGAGTTCTGGGAGTTGAGGTTCTACGTGGTGGATTTGTTTACGTG
GAGGTTTTCTATTTCGTGGACCTTTGGATTTGTTGGAGTCGTGGTTTCCC
TTGGATGATTTAGTGCAGCATTTGGAAAAATGTCCTTTGGATTTACAGTT
ATTGCACAACTTGCCGTAGGCAGGACATGCTCCTCGATGGTGACTACCAG
CACAAAATTTACAGTGTTTAATAATTTCCTTACTTTTAGAATGACGTTGG
TCGATATGGTTTACGTCTCGTTCAAGTGGATGGGACGATGATGATGGTAA
GGGTAGGTCATTTTGGTGGATGGATGGATTTTGTTTGAAGTTTAGATGCT
TCTGAagctcgacagtttgaaagtaCTTTTTCAAGAGTTATATCGTTTTC
TCGTAGGAGTCGTTCTTGCAGTTTTTTGTCTCTGAGTCCAATGATTATCA
TGTCTTTTATCAAAGAGTCACGTAATTGATTAAATTCGCAATCTTCAATC
ATCTTTTTGATACGTGTGTAAAATTCATCAAACTTTTCGTTTTCTGTTTG
ACGAGTGGTGAAGAATGAAAATCTCATGAAGGTCAAATTTNAGGTACATT
TTGACAAGCATCGACTACTGGTGGTACATTTGGGTCGGTCACAATGTGGT
ACTTGTCTTGGAGGGTACCAAGTTCTCCAAAACAGTCATTGTACTCGTTC
ATAAGATCAGAGGATTCTGTGTTGAGAGTTTCTATACGTCGAATTAAATC
TAAATCACACGACGTTTTTAAGCTGAGGATTGGTGATGCATCTTCCTTGG
TAACGAAAAACATTGTTGGTGTTGATCCATTACGGTGTGTGATGCGAAGA
ATACATTGACCTGCTATAGAAATGTCAGTTTTATTATACGCTGTCAGTTT
ATATTTCGATGGTAAAAGTCTGGCAGGTTTACGAAGGCGTTTGAAGGTTG
ATATCGGAATGACATTAGCTCTGGCACCGGTATCGATTTTAAATGTTATT
GGTGTGCCATTTGTGTTGAGGTCAATGAGCCAATCTGGGTGTTTTGTGGC
TGTAGGGTCGGAAATTTGATCGATTTCGGCTGTTGATTCTACTTTGATAG
CATCAACTTCTGGTGGAGTATCGTTGTTGGAGAGTTCAATCGATCCTAGG
TAAAATTCATCCTCAGATTCAGATTCAGAGTCGGTAGCGAGTTCTGGGAG
TTGAGGTTCTACGTGGTGGATTTGTTTACGTGGAGGTTTTCTATTTCGTG
GACCTTTGGATTTGTTGGAGTCGTGGTTTCCCTTGGATGATTTAGTGCAG
CATTTGGAAAAATGTCCTTTGGATTTACAGTTATTGCACAACTTGCCGTA
GGCAGGACATGCTCCTCGATGGTGACTACCAGCACAAAATTTACAGTGTT
TAATAATTTCCTTACTTTTAGAATGACGTTGGTCGATATGGTTTACGTCT
CGTTCAAGTGGATGGGACGATGATGATGGTAAGGGTAGGTCATTTTTGTG
GTGGATGGATTTTGTTTGAAGTTTAGATGCTTCTGAagctcgacagtttg
aaagtaCTTTTTCAAGAGTTATATCGTTTTCTCGTAGGAGTCGTTCCTGC
AGTTTTTTGTCTCTGAGTCCAATGATTATCATGTCTTTTATCAAAGAGTC
ACGTAATTGATTAAATTCGCAATCTTCACTCATCTTTTTGATACGTGTGT
AAAATTCATCAAACTTTTCGTTTTCTGTTTGACGAGTGGTGAAGAATGAA
AATCTCATGAAGGTCAAATTTTTCCTTGGTTTAAAGTGATTGTCGAATTT
TTGTAAGATGATGTTGAGTTTCATCCCATCAccttcttcaaattcaaaag
tGTCGTAAATTTCTTTACATTGCTTGCCAATGCGTTGGAGGAGTATTGAG
GATTTCACCAGATCAGGCTTGGTTGATGATTCTGTTGCTTGCAAGAAGAT
TTGGAACGATTTCTTCCATGATTTCCACAGTTCAGTATGGTTGCAAGTTG
AATCCAGATTAAGTGCTTTTGGTGCTTTCAGGCTGTCcatattgacaaaa
atattaccACCAAATGCAGGAGTAGGTTCTTCTGACTTGAAGTCAATGTT
CTGACACCATGTTATGATCTTATACAAGAGGATAGAGACGGATAGAATAG
AGACTGTAATGAGCTGTTCAGCTTTAGGACGCCATCTTGAATGAGAAAGA
CTAGATAATAATATAGCTATGTACAGGGAAGTAGATATACACTAAGATGG
TTATGTGGAGGTAGAAACGGGACCAGCTAGGAAGCTGGCTCTTAGAGCTT
AGGAGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_025447XLOC_025447Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00041485-exon-sc0002891-1491911889:1..6656TCONS_00041485-exon-sc0002891-1491911889:1..6656Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00041485-exon-sc0002891-1510915933:1..6656TCONS_00041485-exon-sc0002891-1510915933:1..6656Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00041485-exon-sc0002891-1575043694:1..6656TCONS_00041485-exon-sc0002891-1575043694:1..6656Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0002891supercontigsc0002891:1..6656 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.161463	0.100196	0.049859	0.0162597	1.08871	1.29829	0.698243	0.777357	0.494769	0.704779	0.520492	0.430133	0.546681	0.4258	0.0666791	0.0357785	0.143247	0.0790591	0.0936209	0.163279	0.0993435	0.166136	0	0.0306018	0.457028	0.309431	0.0402541	0.0429602	0.0814595	0.0497966
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00041485 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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