TCONS_00039855 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00039855
Unique Name	TCONS_00039855
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4106

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0002223:10081..19373+

transcript sequence

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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0002223:10081..19373+

Legend: exon

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>TCONS_00039855 ID=TCONS_00039855|Name=TCONS_00039855|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9293bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002223:10081..19373+ (Clytia hemisphaerica)
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tttcaaatcaaaacattgatttcAACCCCCTGGCCTGATTAATAGCGGCA
AAATCTTGTTTTTACTAACGTCTTGCCCTGGACGTTGTAGATCAAAACAg
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GCTTTtcctcaaaaaaaaatcataaaattcgatttttgagattttcgtCA
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AAGCGTAAATTTCTAGTTTTTCATGGTCCCTTTccttttttactaaaaaa
tttacattagAATATCTCAACTAACTTTGAAaggtcaattttc

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_024125	XLOC_024125	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0002223	supercontig	sc0002223:10081..19373 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0	1.29147e-08	0.352648	0.996452	0	0.694147	0.494493	0.00369057	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00039855 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00039855 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00039855 (transcript) - C. hemisphaerica