TCONS_00039620 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00039620
Unique Name	TCONS_00039620
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	204

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0002150:13104..29052+

transcript sequence

>TCONS_00039620 ID=TCONS_00039620|Name=TCONS_00039620|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=204bp
TTTAACCAAGGAGTGTTCCAACAACACAGTGGAGACTATATTCCATGCAT
GTATGCAATCTTTTGGTTTTCACAGAGACAACTGTGCAATTAAGGAATGA
TGCAAATTGCTTCTTTTTCGTTGCACTCGATAAAGAGTATGCCATATCAA
TGTTGGATTTACACAAACAAGCATCAAGGACTGAAGATATTGTCGGATGG
TAAG

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0002150:13104..29052+

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00039620 ID=TCONS_00039620|Name=TCONS_00039620|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15949bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002150:13104..29052+ (Clytia hemisphaerica)
TTTAACCAAGGAGTGTTCCAACAACACAGTGGAGACTATATTCCATGCAT
GTATGCAATCTTTTGGTTTTCACAGAGACAACTGTGCAATTAAGGAATGA
TGCAAATTGCTTCTTTTTCGTAAGTTGTGGTTTTTTATTACGCTGTTGAT
TACTTTCATAAGTATAGTGCAGAGGTTGAATTTAGAGCTGAGGTCATCAC
AAGTTAAGGTGAACGTGCTTTGAACTTTGCGGAAAATATGTTATATGCTT
AACAGTGCATCGGAGGGTAGGAATGTTGCAATCTTTCTTAAAGTAGAGGA
GGCCTCTAATAAGCAACCGAGCTGATTAAATACGTTTATTGCCAAATATT
GGTTTGCTCAGGTTATTCGTTGTTGGGGTTTAAAGGTTAAGGCTGTTTCC
ACACAAATGCTGAATGCGTCAGGACAAAGGTTTCTTGGAATTTAAAGATG
CATTTTAATCTTCGCCTGACTTATAATGACTTTGATTATACCGTGTTTTT
CCCAACTGACTTGATCGTCATAACTACTGTTATGGGAAAATTCCTGAGAT
TTGTTGTGATAAAGAGATGGTAACATGTAATTGACGGTCAGCTCATGAAA
AAGTCTTTTGTATAGTATACCATGATGACCAAAAATCTAGAGACTTTCAG
AAATCCTCACAGTTTAGACAGATCAATTGATGAATTTAGTATTCATGCTC
GTTTTCTGAAAAGATGGGAAAAAATCGGCTTTTTTGAGCCCCTGAGCCTC
AACCTTGCTGCTTATAAAAAGCTTTTGAGTACCTACTTTAAATGAAAATG
TTGTCTTTGCTGTTATGTTCCATTGCAATTTTAGTCCCCCAAAAGTTGTG
GTGAGGAGTGGTGATTGAGatatgttttgttttgacaGCTCATATCAAAG
TGATGACAGATATAATGTTGCTGTTATTAAGTGGTACTATAAGTTTAACA
AATGTCTGATTGTGGAATAGAGTTTTTGTCAAGTTTGATGATTTGGTACC
TGAGTGTcaaactattttgaaattttaatggaTTATCTCAATTTCCAGAC
ACATTTTTGGTCCATAAGTATCTGTAGTTGTTACTTAATCACAAATCCCA
GGTTTATCACTTCATGTGCGAATCATGCAATCATACATTGGCGAGATTAT
GcgtctggaattctctacgcgGCTACGGTTAAAgcggcgagggaaatggc
gaataaggcaagtaatggcgggtgaaagcaagttcgatatttgacgtacg
gcattatgtcgactttgcttatacggtggtttgatgtttttcccgtacag
agcaaagtagacaacgacatgtcgccttttgTGACGACCTGCACGAGCGG
CatcgcaaccgtagccgtagaatatctccgatacataatctcgctattcT
CAGCATCTTCAACTGCCACATTTTCACATGTAACTCtagcaaaaaataaa
tgaaaaatgaagaaaattcttaCTGGGCCTTATTTTGAAACTCAGCACAT
CGCCCTTCACAGATCCATAAGGGTACACAATAGCCTTCTTTATTTCCATA
TACATTGTGTCCAGTCAGAGATGGTTGAGAatgttttgaccattttgtgc
aaaaaatgagtATGGACCAGAACCTTTAGTCCAGTTGAACACACCTATTT
ATCTTTACGTCAAGGGCTACATATTAGCGGGTTGGGTTCGAGTTTATCAG
TGAAAATGACGTCTGAATGTCTAAAATTTTTGAGTCATTACATTGATGCA
GATACAATCATAACATTCGTCATCAACCCTTGCAAATTCGAGTCCAATCC
CCTTGTTAGGGTTGGTATAACGATAGTGTgtatttaaacaaaaaaagttt
ttcatgaGTGCGATAAAAGATTGTACCCTCATAGTACAAGATGCAGCCTG
TTCAGAATTAATGATGattgaaaaattcttgacataTCTCGTAATAGATT
GATGACATTTTGAATGTTGATGACATAATTCTGTTGTTTGGATTATTATC
ATTTTAGTAAGCTTAATTCACGAGAGTCTGACACacacacaatttttttc
tttctttcttcgtAAGTAAGTACGCTCACTTGTTTATTAGCTGATCTGTT
ATTTTTCACTAAATGGTGGGTTGGATTGGCTTTATAAGCAGTTGTGATTT
AGATAAAAGCTCCAGATTGGAATTAGCCTTCAAAGGAAGAAGACTTCATC
TATCAAGGAAGGATTTTTTGATCGGATATTAACTTACAGAGGAAAGAATT
CGTGAGTGATTTTGGAAGGAAACTAACTGTACTTTCGAAAGTTCAATTCC
ACTTTGCTTGGTATTGGATATATCTAATTAGTTTTATCGTAAACTCGTAC
CAGCAGTGTGCAACTATAGACTTGTTGTTACTTNccctagaatcagcatt
gacaaaaccgaaaattctaaatatgagaaaaagcaaaaaatcttggaatt
atattcctatcaccttgagttaatattttataacaaaaaatttacattat
ttataaaatttttcgctgaatcagcaaaaacggcaaattctgtcattttt
ttacaaaatatagtagaaaaatatctttaaagcttaatattttcagtttc
agttaagctttttttctaaaattttcacagcttattccatacatgaatgg
aactattttcaaaagagatttgttttcaaaaacttgattaagacgttgtt
aaatcaaaattgtcattttgaaagtttctaaattttcagtttggactttg
caatatcgaaaatcttgaaatatttcataaaaatcataaatttcacATCT
ATcaggtcgtaaatttaagggaaaacacaaatatgttcatagtttttccc
cctattaccactgggcttgataatttgattttaactacacctacgttttg
ggggcccaaaacctgcattttgacaaccaggggtatactgtaaaaaattt
atcaaataaatttatgcccaaaaccctctaaatcatatttcaagactatg
gtcaaaattttgtatccatatattaaagatatctcgagaaatcgctataa
tctcaaacctccgttttgggggccattagaaaaaagctacctatctttaa
gcgattgaaaaatattgttgaaattggaaattttgaaaaagaacttccag
gaaataaagtagagatgttaaaggttttcatgcagcaaaaatttttgtaa
aatctcttttcctctagatttgagagaaatttcaaatttgatcaccgttt
tgggggccacatactgtacccTCATAGTACAAGATGCAGCCTGTTCAGAA
TTAAtgatgattgaaaaatttttgacataTCTCGTAATAGATTGATGACA
TTTTGAATGTTGATGACATAATTCTGTTGTTTGGATTATTATCATTTTAG
TAAGCTTAATTCACGAGAGTCTGACACACAcacaactttttttctttctt
tcttcgtAAGTAAGTACGCTCACTTGTTTATAGCTGATCTGTTATTTTTC
ACTAAATGGTGGGTTGGATTGGCTTTATAAGCAGTTGTGATTTAGATAAC
AGCTCCAGATTGGAATTAGCCTTCAAAGGAAGAAGACTTCATCTATCAAG
GAAGGGTTTTTGACCAGATATTAACTCACAGAGGAAAGAATTCGTGAGTG
ATTTTGGAAGGAAACTAACTGTACTTTCGAAAGTTCAATTCTACTTTGCT
TGGTATTGGATATATCTAATTAGTTTTATCGTGAACTCGTACCAGCAGTG
TGCTACTATAGACTTGTTGTTACTTTTTGAGTCAAGAGGACAAAGAACTT
TATTCAGGACCGGTAATCAGGCTTCTTGTTTTCGGAAACTACTTCATTTT
TATCACATACAAAGTTATATATCTATCGAGAGGAGCTTACTAACAGAATC
TATCAAGATGTCTTTGCAATCACTGAGCTCTAAACGAGGTGGTAAAAGCA
GTGTTTTGTCATCCTCTTCCACGATATCATCAACAAACAGACCTCAACCA
CAGAGAGGAATTGACCGTGTTGATGAACGCGTACTCAATCGGTTGATATC
TGAACTCGGATTGAATCGAAATCACACAGTTCCTGACCCCCACTGCTTTA
TCTGTCGGCAAGAGAAACATTGCGGGTTGAATCGATCATCTTTACGCGGG
GTGAGATGTACAAACAACTCTTGAATGTTTGTTATTTACAGAATGGTTTG
TGTCAAGTGGTGATCAAAGTAAGAGGTTCCAGAATGGCTCTTCAAAATAT
CGAGATAGTGAGTTGAATCACTTTGCTTTTGGTAGGAATTTAATAAATGC
TAAAAAGAAGGGGAAGGCAGATCAGTAGTACTTTGGAATACCGTTATTAT
GAGTTCCAATATCAAAACAACGTCAACGCAAACAATTACTTGTACGTTGA
ATTTCCCCGAACTCTTGAAATACTTAAAAGAAGGACCAAAAAAGGTTTCA
AGAATAATGATGCGAACTTTAATCGAAATTACACCACAATTTTGATTGAC
AATGACACTTcactttgaaacaaaagaaaaagacaatcTTTACACGACGC
TCATTTTCATGATGCTTCTATGGATTAAAGTTAAAGATGAGCAAAAACCT
TCACCGTTAAATTATGCTGATTCAAATAAAGAATGGAGATATTGAGGTTT
tatgaaggaaaaaaaacctttttagaACTATGGAACGTAATTGCAACTGA
ATTAGATATATTATTTACAGCTTATtagtattttcaaaattgtcaccctc
taagaattttcaaaatgaagaatttcttccaaaatgttcttttttaaata
tttctgaCTATATAACGATTACATACAAGAGCCAACACACTATTTGATTT
GGTTCTGAAatcgaattttccttttttaaatgCTTCTTGGACCAAAAATT
GGGAGAAAAATATTCCAAGTGTTCATTCTACCTCCTAAcaagaaatatat
tttattttagaaaaaaaaaaaaagtaagtaagggttggaaaattcacgat
ttgttaggcaaaattttcgatttcgtCGAGAGAAATATTTGTAATTAAAT
ATTTTCCGTTTTCCgaaagggaaatatttattaaaaggGCTTTCTCCTGT
Gtgaaaacgccttccgtacgccctgactgacgcccgttttagcgcctaaa
gaaagtctactttataagaatcaaatcaatatctcttgattgaaggcaat
atatctttcggaaATTAGTTATTAggaagtaaacaaaggatgacaaaaaa
agatgagcatatttatctttattataagcattttctttataagaatcaaa
tcaataactcttgattgaaggcaatatatcttttggtaattagttctNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNATTTTcactgtgataacatgtgagcgacaacttctcttt
ttgagatgtgagcaaccgtctatcccatgtcatctcaaaagtaaagttga
aaccaagctttcttcgttcctccaacttaaattttatcgataaaacgaat
ttaaaatctacacatgcgtaattttgcttacttagggatatttcgacagg
aagctctgcggggcattcttagcgacagctacttgctagtatatgtcaat
aatgaccttcatttctaaggaaatatttagtcgcatttttgcgAATCTTG
TTCTAATTGtagaatttttacaaattttactaaaaaagtctctctaacgT
AACtacgatggcccagaaggctcattATTGCTGCGCGCGAGAACATGACT
GTGCGCGAGAAATATGCTGTGCGAGCGAGAATTATGTTGTGCGAGCGAGA
AATATGTTGTGCGCGCGAGAAATATGTTGTGCGTGCGAGAAATATGCTGT
GCGAGCGAGAATTATGTTGTGCGAGCGAAAAATATCTTGTGCGTGCGAAA
TGTATGTTGTGCGCGCAGGAAGATGTTATCGTGCGCGAGAGAATATAGTC
TACTGCGAAAGCAAAGGAGACATATATTAGCAAAGAAGATATAGTTTAAC
TTCCAAAAATAATGATTCCGGTCCTGAAATCGTGTAGCTGGTAATTCCAT
TGGGGTCCTTAAAATGTATACAAAGATAAACAATCTTTCAAAACTTGAAC
CATTCAgcaccacagatatctaagcccgaagggctagataggcaacttta
agctttctccagcaaaaaaaagtgaagcaaaaatttgactttttaaattt
cgtgccgatggataggatctagcattttaattgttttcggagcgcgagat
caaaaaacgtagtcggcaaacgctatttcacatctctcaaaccggtgaaa
ttgcatattttagtcacgtgactttggtaggaaatccttccaaacctagg
cttcacttttcgataaaagccgcaaatctagcccttcgggctttacagat
atctgtgttcAGCACCACAACCATCACAAAAAATAGTAGAGTGGTACATA
CAGGTCCATTATGTAATGTAAAACGACCACATTGACAAGAAGAGAAAAGC
TTTCCATTTCATATGACAATAACACTGATTAATAATACCTACCACTTTCC
ACTTTTTCCTCAGGTCAAGCCACCATCAGCAAACGATCACTCAAAGGAAG
GAATCTTGTTAAGCTGAAATCGGTCAAAAAACATGTNTTTTTCCTCAGGT
CAAGCCACCATCAGCAAACGATCAAAGGAAGGAATCTTGGTAAGCTGAAA
TCGGTCAAAAAACATatgtattgaaaaaaatatgttttgaggGCATGTAT
TCTACAGACTTGAATCAGAAATTCCAGACTCGAATTACAGGAGGGAGGGC
GGAAAGGGCGGAATTAATATAATCAAACATCTACTTTGATTTTTGTTCTC
GCGTGCACAGTATTTTTGCGGAAAGGGCGGAATTAATATAATCAAACATC
TACTTTAATTTTTGTTCTCGCGTGCACAGTATTTTTTTTTCGCACACAAT
TTCCAACTTGTGCGCGCACAACATACTTCTCGCGCGCATATAATATACTT
CTCATGCGCACAACATACTTCTCGCGCGCACAATATACTTTTCTTGCTCG
CACAGCATATTTCTtacgatggcccctaaggctcacaagacacttccagt
tcttataaaatttgtgaactacaatcagggtcataatatattggcacttt
tggctaatttacaatttttcgaaaattgaagttcgagcgagaatgtcaat
ttttaggccttcaacttgatttcNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNgttg
gaataaaaatgtcctgggtggaaaattttcgaaaaattaattaacggggg
ggacggctattaggtacccgagagtagtcgAATTTGGACCATAAAGCTGG
GGAAAATaagattttcgcaaaattgtttgtcgcaaaaaataaattcagaC
AGATATCTGGAATTGAAaacctattgttttatttgcgATAGGGCGAAAGA
AATAAgcgatgaaaatgaaaacgttaCAACTTTAGATTAGCCGCAtgatt
aaaaatgttttaacttATTATTTTTAGGGAAACGAAACAATTAAATCCCA
AAAACATGCGattttatgtatattttggtaTTTCAGGGTTTAAAAACAGC
ACCGAAAGACATTACTGGTGAAACCTAAATTATATTATTTCTAATTATCA
TCTACTCAAGGGCTCAAAATAACCGTTTAACGTCAGACATTTTCTGAACC
AAATTGCTTCTGGTCTGGCCAAAAATCATAGTTTTTAATCTAAAGTAAGA
CTGGTCTGGTCCACTCGAAATTTTTACTACTATTTTATTATCAGAATATG
ATCATATAAGATACTTTAGATGGGATAGCTTTTATGTGTGGTAAAGAAAG
AAGAGTGAGATAGGGACActaaaataaacattttcagCCATGCTGAATTC
TATCTGTCAAACTGCTACTTTTGGGATTCTGCCCAAGTTTCTCACCTCTT
AGATACTACTGCTACCTTGACCAGACTGGCTACCTTGTTTCAATGAGCTA
TTCATCTGAGCTAAGTTGGCGTCGACTGAGGATCAAACCCTAAACCCAAA
ACCCTTGGATTGTAGTGCAAATGATCTACCTTCTTGTCAAAAAGTCTAGA
TTGGTATAATCAACATGCATGATGAAAGTTTTCCTTTTAACTCTAATTTT
GTAGGTTGCACTCGATAAAGAGTATGCNATGATGAAAGTTTTCCTTTTAA
CTCTAATTTTGTAGGTTGCACTCGATAAAGAGTATGCCATATCAATGTTG
GATTTACACAAACAAGCATCAAGGACTGAAGATATTGTCGGATGGTAAG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_023935	XLOC_023935	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00039620-exon-sc0002150-1491911889:13104..13222	TCONS_00039620-exon-sc0002150-1491911889:13104..13222	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00039620-exon-sc0002150-1510915933:13104..13222	TCONS_00039620-exon-sc0002150-1510915933:13104..13222	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00039620-exon-sc0002150-1575043694:13104..13222	TCONS_00039620-exon-sc0002150-1575043694:13104..13222	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00039620-exon-sc0002150-1491911889:28968..29052	TCONS_00039620-exon-sc0002150-1491911889:28968..29052	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00039620-exon-sc0002150-1510915933:28968..29052	TCONS_00039620-exon-sc0002150-1510915933:28968..29052	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00039620-exon-sc0002150-1575043694:28968..29052	TCONS_00039620-exon-sc0002150-1575043694:28968..29052	Clytia hemisphaerica	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0002150	supercontig	sc0002150:13104..29052 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	2.12207	0	0	1.894	2.67372	1.65897	0	2.10332	0	3.2809	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1.68949	1.50783	0	0	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00039620 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00039620 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00039620 (transcript) - C. hemisphaerica