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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00039235 ID=TCONS_00039235|Name=TCONS_00039235|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1360bp
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gatttgaagc Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0002050:9393..16794+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00039235 ID=TCONS_00039235|Name=TCONS_00039235|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7402bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002050:9393..16794+ (Clytia hemisphaerica)
GTTTGAATGCAGCAGTAGTTTTAAAGTGAAAAAAGCGATCTTTGTTACCA
AGTATAAGGCGTAAAAAGtagttttgtcatttttcaatcaaTCGGGACAC
GACTTGGTTGATGCATAATATTACCTTTAACTCCAATTCTTCGAGGTAAG
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ATCAAGAAGTTTGCAGAACAGAGCACTATCAATATGATTTTTGTGCACCA
TTGACACTCTCTATTTACTGATTGAATAATTATCATACTTACACTAAACT
TTTCAACACACAAAAGCTAAAAACATTTGGATATTCTAAGTTTTTGTAAC
TTAAGTGCGTTGGAAAATTGGGCATAAGTATGAAAAGTTTTTCCTTGACA
AAAATTAGTTTCTCCTGTCATTTTGTATACAAATATCAAATAATCACTCA
ATACAATACGTTAACGCACATTATCAAATTGAAATTTGTTGGTTTTGGGG
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gaaagttttgagtattttaaaattcttgGGATTTTATTTACATTCCAATT
TTAttatctcaatttttttattttagatgtCTATTGTGTTATTGAATTTT
AATATCTATtgtgttattgttttaaaaaatgctaattttaTCTCGTTGGC
TAGAGTTTCTTCTTGTGTGTCACGTGTTAATATAACAAGTTTTTATTGGT
TGATACGTTTGTTGAGGTTGTATGGTGGTGGGTGTTTGTTTTTTGGAGTT
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CATGTGATTATTTTCTTAGTTTTGATTGGCTAATAAGTTTCGGCTTATTT
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gttcaaaaattttgcatctTGATGttagaattttattttcatatgtCTCA
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AATATATTCTAATAAAATTTGTCATTTGAAAGTCAACGGAAcatttattg
ttttgtttagTTTCTTGGttaattttatatatttattcattaattttaca
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TGATGTTTTGTAGATTAGCTAATAAGATTTGGTATACatgtttcttatag
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GTTTGATTTCGTGGTTCGAGATTATTAAATTCACTGTGTGGTTGTGGATA
TTTCGCTTTAAGAGAGAGGTATAGTTTCAATTGaatacacgcttcttttt
tttataagaatacactttataaaaatgtccatgatgaaaatggccaaaaa
gttaagaatatgctaagaataccaccacaaaatctagtctgaattaggat
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TGCTATTAATAATatttttgaatgaaaatacaaccaattataaggaaaaa
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ttttcggccggaaaaagtTCTTTTGGTATAaagtgttaaaagtttttctg
gTATAAAATATTTAAAGTTTTCTTGGTATAACgtttaaggttttattttt
ctatttctttttcttattaGTGCTCAGGAACCATGTTTCTTATATTATCT
TATAATATCTTATATTATCTTATGTTATGAACCTTAGCCATGAGGTAGCG
GAAACACTAACAGCTGAATGGTGGCATAACTCAAAAGAAATCTTAGGTAT
TTGAATATATACTGTGAGAGTATTCATGTCTTACCgtcttcattttcgaa
atttgTTGGTGTTGGGGGTAGCGTTAGCTATTTTGTGTTTAAAATCTTGA
GTTGAAAATTAttgatttgaaagttttgagtattttaaaattcttgGGGT
TTTATTTACATTCCAATTTTAttgtctcaatttttttattttagatgtct
attgtattttttcttttcgaactttggacccttaccgggactaaaaaaga
aaaaaacaaaatgttgggaattttacgacccttagcgggacaaatttgac
cgattttgaccaaattttgatcttttcgTGGATGGTTTGACGTTGCCCCC
AAATTTGGGCTGCATAATAGGCGTGACATTGGAAGAGAGAAAAGTACAAT
GATATTAATGTTTTcttgtcgacataatgccgaAGTTTACTTAGAGCTCC
ATTAGCTCGTTTTAATTTATTACAgacctcattgttcttataaaaaaatt
gtattacatGTACATCTTGTTTTGTCATTTTCATACtttctaaattattt
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GTTGGAGATTGGACACTGGCTGTGTCTCAGTTCGTAGCAATTCCATTGAT
TCGTAGGATTCAGGTACCAGATGGTGAACATTGAGCACGTCGCTCGTGTC
GTCTACTACGAACTAGTGTAATAGCAACGAACCGATAGCACAGTTGGGAG
AGCGATCGCCcggcaagcgagaggtcgtgggtttaattcccactcgattc
gttacctttgagaaaactgggaagtacattagtgcaggatccgttgatcc
ATATTCTTAATCGTTTTAATATACCTTTATTTTCATCATATCAGTAAGAT
CTTTGACTTATCTTAAcattattacaattttttttgtcttttttaatcGT
TTAAAAACAATATTATAAGGTaataatttatatattttcGTAACATAATG
CTTACAGCAATCGTGTCAACTCaacaactacacgtttttttttataagaa
cgtcaaaaattttcgaagccttcggatgttcttagttttttggatttgaa
gc
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00039235-exon-sc0002050-1491911889:9393..9537 | TCONS_00039235-exon-sc0002050-1491911889:9393..9537 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039235-exon-sc0002050-1510915933:9393..9537 | TCONS_00039235-exon-sc0002050-1510915933:9393..9537 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039235-exon-sc0002050-1575043694:9393..9537 | TCONS_00039235-exon-sc0002050-1575043694:9393..9537 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039235-exon-sc0002050-1491911889:15580..16794 | TCONS_00039235-exon-sc0002050-1491911889:15580..16794 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039235-exon-sc0002050-1510915933:15580..16794 | TCONS_00039235-exon-sc0002050-1510915933:15580..16794 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039235-exon-sc0002050-1575043694:15580..16794 | TCONS_00039235-exon-sc0002050-1575043694:15580..16794 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0002050 | supercontig | sc0002050:9393..16794 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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