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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00038972 ID=TCONS_00038972|Name=TCONS_00038972|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2199bp
attctgggtaatattcgattggttcgattgaatTATGccgttcgattgca
ttcgattacTCGTGGTCGATCATGTTCGATTTCCGTCGATTATATTCGAT
TTTCATTGATTATATTCCATGTTCGCTGATTATATTCGATGCTTGTCGAT
TATGTTCGAAGTCTCAATCAAACCGCAATCAAATCCAAAAATTGCGGTAA
attttgattgagattcgattgcgcaTTCGACTatcgaatttcaatcgatc
AAATgagttcgatttggtttgattgattcaatCGTCAATCCCGTTCAATT
GAGACGTGAGATTGTCAAATGATCAGACTTTACGACCAAAACGCATTTTT
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GGCCAattctgagaagtttgaattacggaaaaggtgtattgacaatctca
atcaaacaggatcaacaatcaaaccaatcaaaccagATTGAACGCAGTCA
AtcaattgaaatttgattgtcggAGGGCAAAATTCTGGGTattatttgat
tggttcgattgaaatttgccgttcgattgctcgTCGATCATGTTCAATTT
CTGTCGATTATATTCGATGTTCGTCGATTACGCTCGATAtatcaatcaaa
ccaaaatcaaatgtgaaaaatgcggtaatatttgattgagattcaattgc
gttcgatttggtttgattgatttgatCCTTGGTcccgttcgattgacatc
gtctggaccTATCGAACTTTGCTGTAAAATCTTCAGTTcaatttcaatta
taaatttggTTCAGGAATCAAACACCTATCGTTTAATATTGTTCGATTGA
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TTAACAGTCCAAATTTTGACTTCAGATCTcaacacaaaaaaaaagaaact
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TGGTCCACCTGCAAAAAGATCCTTCACTCCCAAAAAGACATGGACAGCAA
CGTTTTtttgtttatcagaaaaaggtgCTACACACACTCCATCATCCTCC
CAATACTTTTTATATGGTAACGCAGGGCTTGGGAAAAAACGAATACAGAT
GCCCAACACAGCAAGTCACCTTGACTTACAATTAAACTTGGAAGAGGAGT
TTCCAAAGCTCTGCATTTGTTCAGGGCGGTTTATGCTGTACAAAGCAACT
GGTGGTGGGAGTGGTAAGCGACAACTCCAACGGATTGAACTTGGTCCTTG
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CAATTTACATTGTACCAATCCAGCATACTCTCGACATGACAGCAGTAGTA
AAGccTTCTTACAATTCACCAACGGTTGATTGTCAGTTTTGTGGAGATAT
AATCGAACTAGCCCTTTTAGAGGAACACACCAAGAGTTGCAACAAGGTA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0001980:5083..7441+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00038972 ID=TCONS_00038972|Name=TCONS_00038972|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2359bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001980:5083..7441+ (Clytia hemisphaerica)
attctgggtaatattcgattggttcgattgaatTATGccgttcgattgca
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AACAAGGTA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00038972-exon-sc0001980-1491911889:5083..7185 | TCONS_00038972-exon-sc0001980-1491911889:5083..7185 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00038972-exon-sc0001980-1510915933:5083..7185 | TCONS_00038972-exon-sc0001980-1510915933:5083..7185 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00038972-exon-sc0001980-1575043694:5083..7185 | TCONS_00038972-exon-sc0001980-1575043694:5083..7185 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00038972-exon-sc0001980-1491911889:7346..7441 | TCONS_00038972-exon-sc0001980-1491911889:7346..7441 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00038972-exon-sc0001980-1510915933:7346..7441 | TCONS_00038972-exon-sc0001980-1510915933:7346..7441 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00038972-exon-sc0001980-1575043694:7346..7441 | TCONS_00038972-exon-sc0001980-1575043694:7346..7441 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0001980 | supercontig | sc0001980:5083..7441 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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