TCONS_00038839 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00038839
Unique Name	TCONS_00038839
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3753

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0001945:18268..34191-

transcript sequence

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GGN

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transcript from alignment at sc0001945:18268..34191-

Legend: exon

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>TCONS_00038839 ID=TCONS_00038839|Name=TCONS_00038839|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15924bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001945:18268..34191- (Clytia hemisphaerica)
GTTCGTCTTTGTTCGTCTCATGATGACGTCTTAAATGGATGGTATTCCGA
CTTACTTTGCACGGGAATCGTTTGGTGTAGCTTGTGTTGGCTTATACCCA
AAAATAACCTCAATCTCGGTCAAAATATATTGGGAATTTTGGTTAATTCC
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ATTTATCGTGGGACTTTACCTTTTTTCTCAAATATTATGACTTTGATTGA
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ATTTATATGGAAAAGAATCTCTATGATTTAAATGAACTGGCTTGCATATA
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ATCTTTGCTTACCTACACACAGGTGATATTGAAACAGGAGTCCATCACAG
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TACTATGAAGGCCAACTGAGTGTTGAAAACTTACAATATTCTAACCCACC
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AATTATACCTTTAAAGAAGCGCATTACGATGTAGAACATGAAAATCGGTG
TTACTTAAATTTAGGTTTTGCCAATTTTGCGAAAAACCGCAAAAATCAAA
AAATGCTGACGTCAGCAAAACTTGTTTTTTAAATAACTCCAGTTTGGCTA
ATGATATGAACATGAAATTTGCACCAAAGTTGCACATCATTAAAAGGATC
ATTTTGAATAAATTCTTTTTTGAAATTTTGCTGATGTCTGCACTTTATTG
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ATATAGGTTTTTCACATTTCGCTAAGTTACCTTATTGGAACTAATTTTCG
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GACACTTTTGTCCCCTTATTATTTTCTCTTTTTTTACTATATAATAAAAA
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GAAAATAGTGGCTTTTGACCAATTTTTTATTCAAATTTTTCGCACAATTG
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TGTTTTTTATTATATAGTAAAAAAAGAGAAAATAATAAGGGGACAAAAGT
GTCCCCCCGCCGAAGAGTGCAAAAAGTGGTAATAGTGCAATTAACGATTA
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TTGTCAATTCTAAACTCCATTATTCTTAATTTTGCAAACACTGAAATCTG
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CTTTGCCTTAAATTTATTTTCATGTATTGATCAGAACTGCTTAAAAAGAT
TTGCAAAAACAATGTTCCTTCTGAAAGTCCATTTTTCAGATGGGACCAAT
AGACCTATAGAGCCCCCTATAGAGTTTTCATGAGTTTAACAATTAAGAAT
TTTCTTTTACTAGGCTCCACTTTGATTGATAAACAAAGAAAACCTTCTTT
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TAGATCTGGTCGAAGTGCCATAAGTTGGAAAGCTTCTCATTTTAGGTAAA
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TGTCCTTTAGGAATGTTAAACGAAAGACAATTTGAAAGCTATTCTATAAA
TGTGGGGTATAAAATTATTACTTAAGCTGCCATCTGGTAAGTGGTAGGGT
ACATCCAATTTTTGGTAGGGTATGAAAATAAGAAGTCAACCAAAAAAATC
CCTTCCACCCTGGTATATGCTATACTTAATGACCGCTCCCTAAGTGGAAC
AATTTAGGGAAAAAGAGTGGCGCCCTCCCCAAATTACGCAAAATCAAAGT
AGGAAAATAATAATCTGAAACTTATTTATTTTGTCTATTTTAATCAGAAA
TTGCACAGGGGGTCAAGTGAAGCTCTATTCCACCAACCTGTAAAGTTTTT
CTCGCCAGCCCGTTTTTCCTCCTTTTAAAAATTAACTTGAAAACACTTGA
TAATGTTCTGGGACAATAGAACAAAATTGATTTGAATCATTTTCGCTGCA
TTTTTCCCAGGGACAAAATCGCGGGTTTTTTGGGTTTTTCTCTCAATTTT
TGTCCAATGAAACGAAAAAAGAATCCATGAGACATGCACTTTTTTCTTGT
GTTGGTGGTATATGAGCCCCCCCTCCCAGCATCAACTCACGCATTCACGC
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ATTTTCAGGAAAAATCGGGGAAACATTTGAAAATCGGGAAAATTATGCAC
ATAATCGGTGGGAAAAAGTGGAAATTTACGTATTCACACGCACAGAGTGG
CATAAATTCACGCATTCACGCAATCAGTGGACTTTCTAGCCAGTACCTTC
CCACAAACAAAATATTTTCTTTGTTAAATCGCGATAAAAAAAAAGTTTTC
GTCTAACAGGCTATGGACTTTCACGTTCACGCAAGTTTTTTCAATTCACA
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TGTAACACGCATGCGTAATTTGTCGTTCTTTAAACCATATGTAATTAATT
CCCGTGATAATCAAAGGGGAATGAAAACGTAGAGGTGGCATTTTCGGTCG
GGGTTATGGATAGCGACATTTGTCTTTTTTTATGAAATTTGTCGTTCTTT
TTTCCTATTTTTAGTAAATGCAGGATTCTTTAGATAAACAGCCTCAAAGA
TGCGAAAAGCTGTAATAACCATGGTTCAAATTAGAGAATACATGTTCTTT
GTTTGAGGAAAATTTTCTTAAGAGAAATATCGTGATGCCTTGACAACTCA
AGAAAACCATAATATTTCGGTTTCCAAGGTCTTATAAACTCTGCTTTCCT
TAGCCATAGGTCTCCAGGGTCGATGTGAGGTAACTGTGTAAGATTTCGGA
CCTCAAAAACAATTTACATGTCAATTTACAAGTTTATTTTAGCTAGCCTC
TTCACTTTTATATATAGGTGCAAAATGGGCAGAAAACCTTTATGATGTCA
TCAGTACACGCGAATCTATCNTCACTATTATACATAGGTGCAAAATGGGC
AGAAAACCTTTATGATGTCATCAGTACACGCGAATCTATCCAAGACATGG
CGATTGCTGAGATCATCACCAAAGGAAGCAGTCCGTACCACAAGTATGTC
ATGCTGCTCTTTTGTTTGGCGCCCGATACAGATTATGTGAAGGATCTCCA
CACTGACATCGTGACGTATCAATTACAAGAATTGAATGAATACTTTGAAG
GGACAGAACCAGAAATTGTGGACGAACAGATTAGAGACATTACTAACGCA
TTCTTGTCAAAGCTAGAAAGTGGTAAGTGTCCTTTAAATATCTAGCCCAA
CTGACGTTTTTACTAACGCAATCTTGTCAAAGCTAAACAGTGGTTAGTGC
ACTTCTAATATCTAGCCTAGCCTGGTGTAAATAACGTTGTTTCAACATCC
ACCTGACGTTAGATGGACATCATGAATGTTAAATGGACTGTTACGACGTT
TCGTTTTTCAAATTCTCAAAACTGCTCCAAACTGATGAGAATGTTTTTGA
GGTGTTTTTCCTAACGGGCTCTTTATTAAAGCGCATTTAGTATGATTTTT
AAGATTTGGCCGTTCAGAAAAATATCTTTTTTCGTGCCCCTTGCTCTTCG
GCGCACCTTTAAAAGAGTTCCGCTTGGTGGTGGAGCCACTTTGTATTGCT
GGAATTTTTTGTGTTTGTAGACTCTACTTCTGCAATATCTTGAAAGAATA
CGCCAATTGCCAAGTAAGGTGACGTCATCTTTGAAGCAGTTTTGAATATC
ATAAAATATTTTAGGTGAACTAGAGGATTTCAACGAAATCAAAGCTCAGC
TGGTGCAACTAAAAATTGATATGGGAATTGAATCAATGAACGAATTCCAG
GAAACCTTTGCTACAATGGTCGCTAATGCTGTGAATATTGCATTCTTCGA
AATTAAGGTGATAACATTTATTTATTCATTGTATTCACCATTGTAATGTC
TTCTGACATTATGTCACTTTCACAACAGCTGAGAGTTAATAATTTCGATA
TCCAATTTTCACGTTGAATACATGGTTTATCGCATCGAGTTTCAAGCCCG
AAGGGCTAGAGACGAGACTCCTGGATGGGAAATGAAACCACTTGTTTCCC
ATCCAGAACGCCCGCGCTTAGTTTTTACACAAACGCCGGTTCGAAACTAA
AATCATCGCTAGATTTCAAAAAATGTAGTCCTCCAAAACAAAGGAACCGC
TAGATACAATCCGTCGTCATGATTATGGTGTTTTCTATACGAGTTTTGAA
TGGTAGCTTCAATTTCTTTTGCCTGAGAAGGGTTGAAGTTTCGCCTCTAG
CCCTTCGGGTTTGAAACTCAATGGTTTATCGTTCACTAATTAGCAGAAAA
GCATTTTACTTTTTCCAATTAATTTTTCATTCAGTATTTCTCTCTTTTTA
TGACATTCTCGAACGTTTTACTATCTTTTTTAAGGATGTCAATTTCATTG
TTTTTTCTGTTTGTAAAATTCCAAATCACGTAATCACGCAAGAAAAAGGT
CCCTGTCACGCCATCACGAAAACCGCTTGGGGGGGCCTCCTCAAGGTGTA
TAATAAAACATATATGTTAAAATATATGTATTCAATAATTGGTTATTGAA
TTTATTAACCCTCGGTGATATGTATTTTGGAAGAATTTTTCACCTCGGAT
TAATAAGTCTCAATAGCCGACTTTTACCCATTGAATATCTGCTTGATATT
CAACAGTGTGTTTGGTTAGAGGTGGAGGCTGATGTGTATTAATGTCATAT
TTTAAGCGACAATCTTGTTCTAAATGGTCCATGGATCGTAAAAAAGGAAT
ATTGATATATTGATACCAAATTTCATCAAAATGAATATAAAGGGGTGTCA
GTCATCCGACACGGAATCATGTTGGAAGAAATATAAAACATTAACAGACG
CAATGTTACATGGAAAAAACCCGTGCCCGTATGGGACAGGCTAGATACAA
AACTTTCCCCACAAAGAAGATCGAGGGTGGCCCATGATGCTTCTGTTTGC
GTCGGACCTGGTGGGTTCTTGGGCCTTATATTTTTGGTTCATCTTTAAAC
AAAATCATAAATCTTCTTTTAGGAGGGCTCATTTAAAGGAAGACTTTGCC
CTGCCGTCAAACAAGTGTGCGACAATTACGGCATTACCTCGAAAGTCAAA
TTTATGGGTAAATGTGTTTTTGGATTGGCTTACGCTATGGGCTTCGTGAA
CTGTGTGCAAACATTGATGAGGTAATTACTTTTTTTCGTTTAAAGGTAGG
TCTACACTTGCACGTGTTGCGGTCACACTTGCTTGGAGAATATTCATACG
TCATAAAAAAGAAATACGCGCTTGAGTTGAATAAGCGACTACTTCAATCA
TCAATAACTTTATTATATTGCTTCTTGGTGAATCACACTCTGATGACTTC
TCGATCGCGGTCGAGACAATAGATTTAATTCTAGATCGCCAACTATCACA
ATGCTCCCTTAGCAGTCTCAAGAATCCGAATTTGAGCCCAGTGTCCCTGC
AGATGGTAGCTATGGATGTCAATCTATTCTGGATTGAAGAATAAACTTTG
GTTATTCGACAACAGAAAAGTTGGAATCAAATCGGAAATTAAAATTCGAA
TCGCAAAGCGGAATAGCCGTTACTACGTAGAAAAAAGCCGTAACATCTAG
TATAGGCTAGAGTTGAGCGCATGTCATTTTTGTTTTCAACTGTTTTAGGT
CAGATATTAGATTGCTTCATTTTCTTGTCTAAGACCACGTGACGGTTTCG
TATTATTCCGAAACAAAATGAAGCCATTCTATTGGTTAGAAATGACAATG
CCTCCAAAATTGTGTCCAATAGATTGGCTTCATTTCTTAATCTCCAAAAG
TTTTAAGGCGCTCTCCACTAGTTAGGGCTAAAATACTCATTATTGATCCA
ATAAACTTCATTTTTGGTCAAATGAGCTAACCAAGCTCCCACTCATTTTT
GTGGTAACCAATTTTCCCGGGACACTTGTTTTCGCGGTGCGAGGGTACTA
CGTTGACGCATTTTTTTGAACTAATTTTTGCGGTTCACACCCACTTTATT
CCGAAATTCTTTCATATTCCTAGGGGTTTTTGAAGAGAATTTTTAGTTAA
TATCGCATTTCGCGGGACTAATTTTCGCGGTAACACCCAAAAACGCGAAA
ATTAGTTCCTGTGAAAACTAGTTCCCTAGCCTTAAGGTATTGATTTTTTT
ACTTAGGTGGGACTCGTTGACTACCGACCAAAAAGCTTTAATCACCGTTG
ATGCTATGCGATATGGTACGGAAATCATGAGAGCAATGTTCAGTATTGCT
GATTATGTGGACGAAAGTTTCGTTAATGGAAAGTGGGATTGGAAAGCAAA
CAGGGAATTTAGATCAGCTTGTGAAAACCTTGGCATTAGTGAAGGAAAAT
ACGCGAAAAGTCTTCATGCTAAGTTGGAATGTAAGTTACACGCTTTTTTT
ATCAGAATAACTTCTAAGAATCTTAATCTTATGCTCTTTAATCTACCTTA
AGGGCTCTGAACTAGCCTGGATATCCAAGCTCAAAATTTTAGAAAAAATA
AGTTTTACCTCAGTCAGACAAAGTTCTAAAATTATATAGCTTGGTTCACC
TAGAAATCAGTTTTCATTAATAATGACATTTAAGGCTGAAAAACTCATAT
AAATTTAAGAGCAGCCCAGCCAGAATCAGATGACTTACTGGTTTTTCCTA
TAAAAAGCGTATATATCTGAAGATACTGCTCTTCATATGTTATTTTACTA
ATGTACACGTTTAGCAACATTACTGTTCGAATACTTTAAGTAGGGTAATA
TTTTTAACCTATGAAGAGCGCTTAATAACTACTTGTGGTATAAAAAGGGA
ATTTCCCAGAAAAGGGAATTTCCTTAGATTCATTTAACTCTACAAAGATA
AGAAAAATACAAACTGACATTTCAAAATGAGTAATCAGATCAAAATAACT
CCGGAAAAGTCTTTTTGATGATGATAAAACAATAGAGAGACCGTAAGATA
AGAATGCTACCGTTAAGCGGAACTAAAATAATACTGAAAACGCGTGCAAA
ATTATGAGATTTTTGCCCAACTTCCTTATGCGTGAAGCTATGAATGCCAT
CCTCATCCTCAGAAGCTTTAGGCTTCCTCCGGTGGCAAAAAGTTAAGAAC
ATCCGAAGGCTTCAAAGATTTTGGATGTTCTTATAAAAAAACGTGTATCA
ATTCTTGTGGTTACCTGCTAAAAACATTTTATCTCGATTTTTTTCACCAG
TTGATGAATCAATTTTTGAAGCTGATATGGCAGAATCACTAGCAGACATT
GAAGAAGCTGGTAAATTGGAAGGAAGATTCAAAAAATTTTTCAATATCGC
TGACGACTTTCTAAAAAGATTCACAATGGTTTTATCTGTTGCAAACACTG
CTTGTCTTGGTTTCAAACTTTACAAAGATTTTAAAGATGATGCTCCAATG
TACCAAAAAGTCATTGATGGGCTTCAGGTTAGTTTTGGACTAATTAAAAG
TTAATTGTGGATTCTTTCCGTCAAGAGTTATTGAATTACAAAAATGACAA
TATCAACTTTAAAATGTTTTATTACCCTCTTTCACACAGGGCTTAGTTTT
AATGGGTAATTTACCTTTTTGTTTCAATTTTCATGAATTGTCCGCAAAAA
ATTGAACTATTTGGAAATTTTCAGAAAATTTTTCTAGATTGCCGTATCAA
AAACTATGAATGCGTTTGTATGAAAAATTGAGCAAGAAACACTATTTTTA
GAATTAGAAATTTAGAAAAAAGCCTTCACAAAAATTTTCGGAAGATCTAT
TTTTATTTCAACCAGAGATACACCATATACCACAAAAAAAGTTTTCTAAA
TATTTTCTTTTTACCGAAAATAAGATCTTCATCATTTTTGTTTTCATCTC
TTGACGAACTCAAATTTTCGGTTTTATTCTGTCTTCACAGAATATGCATT
ACACGTTAAAGTTTTGTTCGCTGCTTCAGGCAGATATTATATTTCGTACA
TATGGCAAATATAAGAAATTCACTTTGGCCAGAGTTAATTCGAGTTTAAA
AATTTATACGACCTAACAACCTCTTCTAAATTGGATCAATTTAGATCGTT
TACCCTGTCATGTAGTGAAGCTATTGTAGGTCATTGTAATACTGTCTAAG
GAATAATTTGACATCACCATGCCGATGTAAGTACCCAAAGTTTACTAGTT
TTTAAATTACNATTATATATGCTAAGGAATAATTTGACATCACCATGCCG
ATGTAAGTACCCAAAGTTTACTAGTTTTTTAATTACGATGTTTCCTATTT
TTTATGTTTTGCAGTTGATGGTTGGTATTGGCGAGATGGTTTTTGTAGTT
TTGGAGTTTACAACAGATCTTGCTTTTGTTCCAATCGTCGGTCAAGTGTT
GGCAGTTGTTGGTGTCATCCTCGATATCATTTTACTTATCCTTGGAAGAA
CTATGGATCAAAAATCACCAGCTCAAATCTTTATCGAAGGTGAAGGTCAT
GATTTCCTGCAAACCGTGGAAATTGATCAAGAAGTGCTTGAGGATGATGA
CGACAGTGACAATGGTTCAGTGAGGAGCAGAATCAAAAGAATCAAAAATC
GAATTGCAAGAAGAAAACGAGAATTGGCTGATAAGAAAAAACGATTGGAG
AATGATCAATAAGAAGAAATGAATGAAGAAAAATGGACAATAGAACAATT
GGAATACTGGAAAAATGGAACATTAGAACAATAGAACAAAAGAACAATAG
AACAATGGAAAAATGAAACAATAGAACACTGGAGCAATGTTACAATTAAA
CGATAGAACAATATAGCAATGAAACGATTGCTGACACGAGAATTAAATTT
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TTCGATAAAAGATACACCATTTACCGCAAAACATTTTTCAAAATGTTTTT
TCTTTGCCGAAACTAAGCTCTTCAAAGTTGAAATACTCTTCTTCGCAAAA
GTCTTCATTTTCTTCTTCATATCAATTTTTTTCATTGCGATTTTTAAATT
TTCAGACTCACGCGTAATTGGCCTAACAGAACTTCTTTGAGAATTTCTTC
AAGAGTTTCTTTACCAGGGGGGGN

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_023320	XLOC_023320	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0001945	supercontig	sc0001945:18268..34191 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.41707	6.50748	3.93987	3.41903	0.203784	0.161464	0.0670356	0.14196	0.0718808	0.182769	0.0511788	0.087026	8.08734	4.29359	131.091	292.837	47.6115	51.4653	151.693	114.099	0.344501	0.393235	2.85192	3.50574	0.0928222	0.07746	2.62351	0.645755	2.06397	2.72363

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00038839 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00038839 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00038839 (transcript) - C. hemisphaerica