TCONS_00038448 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00038448
Unique NameTCONS_00038448
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2933

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00038448 ID=TCONS_00038448|Name=TCONS_00038448|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2933bp
AAACATGCGATTGTTGATATCTGGACTGTAAAGACCTTTTCCAGATCACA
ATGTCATGTTTAATAATTAAAAATTCAAGCATCAAAACAATGACAAGAAA
AAATTTATTACACACTTTTACTAAGGTCTATATGTGATAACACAAGCAAT
TTAAAAGATATAAAATTCTTGCCAGCGAAAAGCAATCAGTCGGCTATTTA
TAATTCCAGTAGCCGGCAGATTACCTGCTGATATATAAGGTGGAAAAATT
GCAGGCAAAGCAGTGCAATTGTATTTTTATATTTTTATCGGTAGATTGTC
GGCTAGTTTTTTCTTGTTGCCAGCAATTTGCCGGCAAAAGTGCCCCTTAG
GTCAAAACCTTATCTAAAAATAGATTTTTCACAATTGTTGCCGGCAAACT
GTCTACTGGCTTATTGCCGGCAGCAATTGATGAATTGCCAGACTGAACAA
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GATGTTGAAAATGTGGAAGCAGAGAAATCTTAAAATACTTTATAGATATC
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GCAAAAGCCAAATTGTATATTTTATAATTCGCTGTTCGCATTAATTCAAA
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AAATGACTTAACAGTATGAAGATGAGCTGAATTAAGAGCCTTTTAAAGTT
GCGGAGCCTGGACTTAAACTTATTCAAATGAAGGTGAATGTATTATGCAT
TCTGTATTTAATTGAAAGGGCAGCTGACATTGAAAAATGAGGTTAAGTAT
ATTTTTTGATGAACCTGGTAAATCACGCACTTTAGTGCTTTAGTGCCTTG
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agggaagaaatttttgcgggaattaaatttcgctgcTCACTGCAATCTTT
GATTTGTTATTTgaatacacattgtttttttttttaataagaaacacctt
tataaggaacttgaggctgaaatttgactatgaatcttaaggaaattCAC
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AcattaaaagaatattttttgggtatttttagGGATAGGGTGACTATATT
TTCTATGAAGCTGGACTtgtttgttggtttgccgttgcccgaccctagat
tttggaggagGGTTGGCCAGTTGGAAATTCTTTTTATTATTACAATTTTG
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GCTAGAAGGGAATTCACTTTTCCTAAGCTTAAGATAGAATGAGACAGACA
AAATACAGGTTGTGCTTtgaagcTTCTCACTCACAGTCACCACGACAATC
GCCGAACTGTGCACGAAATAATGgcgctatgaaaaaaaaacatGCAAACT
TCATTGTTCCTGAAACCAATGATCAACGACCTTCGACACAGAAAAAATGC
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AAAACAGAATTCTCGCCATCCTGGAAAACCAAGAAACAAGCCCTTCAGAA
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CGAGGAAGAAAAACTCAAAACACACGATAAGAGAGTGATAAAGCGAAAAA
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CTCGACAGCATGATGTCGAGAAGACTACAAAGCAAGTTTTCAAAGTCGGG
CttgcagaaaaaaagaaaatttaaaggcACTTATCATTATAAATGCTTAG
AGGCTGTGCTGCTTCTAAAGTACGAACAATTCGATATTGATAAAGAAGTT
GGGGATATCATTAAACGAGCCAATGACAAACCAAAGAATGCTGGTACTGA
CGATGGAAACCAATCGGATCACGAAAACAGCCCTATTTCATAAATACatg
ttttattataagcataaatgaaaatgaaatcactATGCTTATTTTACCGA
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TGCAAATATAGCAATCTCTCAATTCACTAAATTTTTCCAaggttcattta
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tagtatgcttataaacgttatgcttgtaaaaaaacatgtatgttatattt
cataaatattacttcgaataaacacccctttCTTTAAACGTCCTCTCAAG
AAAACGCCTTCCctctaggaggggcgtttatttgcaACAGGTGGCTGTAA
GAAAAATATCACGaaagaaaacttaaatatataataATTGTACTCTTTAG
TGCTCGAACTCGTTTGACTCGCTTTTACATCCC
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0001855:24153..35703+

Legend: exon
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>TCONS_00038448 ID=TCONS_00038448|Name=TCONS_00038448|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11551bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001855:24153..35703+ (Clytia hemisphaerica)
AAACATGCGATTGTTGATATCTGGACTGTAAAGACCTTTTCCAGATCACA
ATGTCATGTTTAATAATTAAAAATTCAAGCATCAAAACAATGACAAGAAA
AAATTTATTACACACTTTTACTAAGGTCTATATGTGATAACACAAGCAAT
TTAAAAGATATAAAATTCTTGCCAGCGAAAAGCAATCAGTCGGCTATTTA
TAATTCCAGTAGCCGGCAGATTACCTGCTGATATATAAGGTGGAAAAATT
GCAGGCAAAGCAGTGCAATTGTATTTTTATATTTTTATCGGTAGATTGTC
GGCTAGTTTTTTCTTGTTGCCAGCAATTTGCCGGCAAAAGTGCCCCTTAG
GTCAAAACCTTATCTAAAAATAGATTTTTCACAATTGTTGCCGGCAAACT
GTCTACTGGCTTATTGCCGGCAGCAATTGATGAATTGCCAGACTGAACAA
GAGTGTTGCTGGCAAAATGCCGATGGATTTGCCGGTATCAGCCGGAAAAA
AATAAGTAGTATTTTGAGTTCAGAGTAGTAATTTTTTGGATTAATTGCTA
GATGTTGAAAATGTGGAAGCAGAGAAATCTTAAAATACTTTATAGATATC
TGTGGCAGAGAGGAATTTTTTACATATTTCGATGCAAAAGCCTATTCAAA
GCAAAAGCCAAATTGTATATTTTATAATTCGCTGTTCGCATTAATTCAAA
TTAAATGCCTCCAGGCTGCTCCAGGTTCAATGCTGGCCGAATTGCCATCC
CATGTTTTGTCAGATATTTCCAAGTTAGAACCGTTGATGGTAGATGGCAT
TAGAACAATAAAAGATTTCATAATTCAAAAAGAAAAACTTTCAAAATATC
CAAAGCCTTTTAAGAATTGGTTCTTAAAGACAGCAAATTCTGTTTTGAGG
CTATTAACAATTCCACAAAGGAGGTGAAGTACTCAGGCCAAACTTTTAAA
ACACCCAaattgaaagcagtaattatgacatCATACCTTCTTTCCCTgtg
caagaaaatattaaacCCCCATTTGGATATATGGCGTTTAGCTCACCCTG
TTAGTAAAAACAAGTATTTTGCCgctataaaaatttgaataatcgaAAAA
AAATGACTTAACAGTATGAAGATGAGCTGAATTAAGAGCCTTTTAAAGTT
GCGGAGCCTGGACTTAAACTTATTCAAATGAAGGTGAATGTATTATGCAT
TCTGTATTTAATTGAAAGGGCAGCTGACATTGAAAAATGAGGTTAAGTAT
ATTTTTTGATGAACCTGGTAAATCACGCACTTTAGTGCTTTAGTGCCTTG
CATGAAGAAATTAGTTGCCTCTGGTGCATGATTTAACTTATTTATAtcta
agggaagaaatttttgcgggaattaaatttcgctgcTCACTGCAATCTTT
GATTTGTTATTTgaatacacattgtttttttttttaataagaaacacctt
tataaggaacttgaggctgaaatttgactatgaatcttaaggaaattCAC
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AcattaaaagaatattttttgggtatttttagGGATAGGGTGACTATATT
TTCTATGAAGCTGGACTtgtttgttggtttgccgttgcccgaccctagat
tttggaggagGGTTGGCCAGTTGGAAATTCTTTTTATTATTACAATTTTG
TATGGACATAATCAACAACATTTAAgtaattttgaaaggaaaacgGAAGA
GCTAGAAGGGAATTCACTTTTCCTAAGCTTAAGATAGAATGAGACAGACA
AAATACAGGTTGTGCTTtgaaggtttgaaatttttgaagaaaagaattTC
TCTTCTTTAAAAtagcaataaatttttttggattgGCAGATTTTGAGGTA
AGGTCGGTTGGGTGATGGCAATAAGTCCAGCCTGAAAAGTGCTTAGTAAT
CTAGGGACTATGAAATTTCGCTGTTCACTGattatgaaaaattttgtggt
tcacctattttgaaaaatttcgcagGAAGTTAACTTTGCAGACTGCCGAT
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ttcccttaaggtaacacAACTGTTATGAGTCATTGTTACCAATAAAGGTA
CTTAGATATCTTGATAAAGGAAGCAAGCAAATTGCACAGGAAGAATCTTG
CTCAAAATGCTATTTCCATCACAAGACTTgattttcattatttatttttc
cGTAGGATTGTACAAGTTTTCCTGAGTTATTGTGAAATTTCATCGTTCCT
GATTTGAACCTTCATCCTTTAAGGTACCttctttactttactttttttcg
ttaaaaaatatttttagtaaaGGTCAGAGCAGGTCAGGGATGTTTTATGA
ACTAATCTAATCCACACctatttttaactgaagttttTAAGCTATTTACC
CCATTATTCTCAGGTACCTAGCCTGACCTAGCAGGCAGACCACCCTAACT
TGTTAATTTAAGATTCTTaagaccttataagctagtttGTTTGataataa
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CACCAATAGATTTTGAATTATACCTTATCCAACATTTAGGAGGTGAGTCA
ATGGATCTTCTTCATTGAAATGTCATCACTCAATGACTACAGATTTTTTT
GATTTTTTCTTTAAATTGGTATGTACACTCCTTGATAGAAGGGGCAGTAA
CTTTAGTAATTATGGGTACTGAAGAACTAATTCTTAAAATTTAGGTGGTG
GTACGAAAAAAATGGTCCTTACTTACGTCTGAAACTGGCCCACTTACTGG
AATTTTTCTTAATGATCTTAAGGGTTAAATAATAACATGTTTTTGTCTTC
TATTTTTAGTTTCTCTCTACATCTTTGACACCAATTGAGTTATCCCTTAT
CCATCAAGTTAGAAAGGTAAGACAATTTTGTTGATTTTGGTTCAATCAAT
TTTCTTCTTTAAATGACAGGTGCTGTAACTTGAATATTTTTATTTTGTCT
TACTTCAAAAGTGGCTATTCTCTTCAACACATTTTGTAATATCAATTCAA
GACAGCCTTAAGCTGCCTTAAGTCCATTTCATTTTGAGATAATCGACTTT
AATAAAGAAGGTTTCATTTGCTGATAAAACTTTGAAACAATGCCAGGAGT
CCCTTCTTTTGCTATTATGGGAGTATCGTGAATATCTTTTTGTGGATGAA
AAGACATTTTAAATAGCTTACTCTAGAGGCTCTAAAATGGCATTTATTGG
ACTTGTTAAGGTCGTATTGCATTTAACTGAAAATCTTTATACTAAGCAAG
TTTCGAGATAAAATTGAGCCTTAAACTGCCTTAAGTCCATCGTCCAATGT
GTTGGACTTAAGGCTACACAATTTAGTTGTGATGCTTCATGAAGGCTTTC
TAAGACTTTTTTGCCCTACAATTCAGGATGCCAACTTTTCTGATAGGGGT
TATTgtcttaagtcaattttcgaaaaaatgggcTTAAGTCTATCTTGAAT
TGATACGGCGATTTATTTATATATAATTTAAAGgaatctttgttttggtg
ttattTTACTTGGAATTTTAAATAAACTCGTTATACGTTATACAATCTAA
GATTTTACTAGCTCTTGAACtgctttttagcattcaaagAACCTCAAAAT
GACATGAGTGACAAGAGAAATAGAGAAAGGTGAATACTTTGTTTAAAAGC
AATGAGCATTTGTACGATAATGAAGGTCTTATTCTCCTGGATTGGGTCTA
AGATAAAAGTTTATTGGTTTTCTTTGAAAGTTGGAGAAACCTTTTAGAAA
GCGTGGGCATTGAGGCTTTTTACCGACCAATGTATCAAAATTAGTCTTGT
ATCTATTAAAAAATGTCACTGATAGCGGAATTTTGAGACGATTTTGAATT
TCCAGGAGAACCTGCATTCGAATTATAGTTCATCTTCAAAACAATCTTTT
ATAACAGCTTTTCACTATGGTTGTGATTCATAGTATTATCGCTTTTAGCT
TCTTAGAGACTAAATAGTAACGAAATTGATCATTGCGAACCTAGAAATCT
TGCTATTTTCAATTCTTATCAAACTTTGGAAGTAAGAAATTTGTTTCAAC
AATGTTGATTGACTGTTCTAGTAGATTTTTAGTTAATGCAGAGCTTATAA
TAcgaactttcaaattttaaggttGAAATCTTGGAGAGATAGAAGAAGAG
GTGTTCAGGCTATCTCAAACGCCATTAATGATTATGGAGNgttattttag
tacacatgtactaagattattttgagcaatttaacatagataccacccat
tttttgcccttttatgAGTTTAAATTGGGGTaattgttacaaacctagtc
gaaatttggtattttagtacacatggtactaaaattatttttgagctttt
ttgcagtaccaccacgtcactaaatgtcatgatgtctgaaattttagtac
cgaccccccccccctgggagaGGATGCTTTCAAATTATAGTTAATCTTCA
GAACAATCTTTTATAAGAGCTTTTCACTATGGTTGTGATTCATAGTATTG
TCGCTTTTAGCTTTCTTAGAGACTAAATAGTAACAAAATTGATCATTGCA
AACCTAGAAATCTTGCTATTTTCAATTCTTATCAAACTTTGGAAGTAAGA
AATTTGTTTCagcgctatatttcaacaatgtTGATTGACTGTTCTAGTAG
ATTTTTAGTTAATACAGAGCTTAGAATAcgaactttcaaattttaaggtt
GAAATCTTGGAGAGATAGAAGAAGAGGTGTTCAGGCTATCTCAAACGCCA
TTAATGATTATGGAGGTCATTCTGATTTCGACTCATCTGCTGTCAAGTCA
ACAGGCGTGGCTGTGGATAATGATGTTGACATGAGTGATAATGACTCTCA
GATAGTAGATAGCGTGTCCCCTGATGATGGTGATAACGAGATGTTGGGCT
CCCCTGCAGTTTTTGCTGGAGCTTGTGCACAGTCTACAGAATCTTCATCC
TCTTCGTCGGAAGCTTCCTCTATTTCCCTGGAGTCAGATTTGGAATGTCT
AAATGATGAAATTGATGGTGTTTTGTGTGAGAAATTGAAGACATGGGCAC
TAAAAAACCACTGCACAAGGGTTTGTGTAAATGAAGTTTTGAGCATTGTT
GGCAATCTTGGTTGTAAAGTGCCTAAAGATAAAAGAACACTTCTAAATAC
GCAAAGAACAATTGTTCAAACACCTATGGGTCTTGGACATTACATTTATA
TTGGTGTTGAGAATAGAGTCACTAAACTGTTGGCATATGACAGTAATTTG
GATTCTATAACTCTGTTCGTAAACATGGACGGTCTtcctctttttaaatc
aagcacAATCAACTTATGGCCTATTCTAATTCAGTTCCACACTTTTAAAC
CGATTTCTGTTGCTTTTTTTTGTGGCAAATCCAAACCTCCTTTTAACGAG
TTTATGCatgattttgttgttgagatgAGGCATTTGATTAACAATGGTAT
GACGTTCAACCATGTTCATTATCGCgtatctttgttttgtttaacATCTG
ATGCACCAGCACGGTCTGCCATGAAAGGTATTATTCAACATACCGGTTAT
CTGCCCTGCGAAAGATGTGATATCAAAGGCGTGCATGTCAAAAACAGAAT
AGTCTTTGATAGAGATCAAGCAGAAGCCAATGGNATACCGGTTATCTGTC
CTGCGAAAGATGTGATATCAAAGGCGTGCATGTCAAAAACAGAATAGTCT
TTGATAGAGATCAAGCAGAAGCCAATGGTGAACGGACTGATGAATTATTT
CGCATGAATTTATACGCCATACCTGATGAGGATGGAAAGCGTCATCAAAT
TGCCATCTCTGAACTGACTGACTTACCTATTGATATGATCAAAGATATAG
CTCTTGACCCTATGCACTTGATATTTCTCGGTGTCACCAGGCGGCTGTTG
TATTACATCAAAGGATCCTTCCGAAAAATCAAAGCTGGAAAGCTGTCTAC
CGGTTACTTGAACGGTATTTCTGCTGCTTTAAATGCCTTTAAATTACCGA
CTGAATTTGCTCGTAAAGCAAGAACGCTGTCCGAGCTAGACAGATGGAAA
GCTACTGAACTGAAGTCATTTTTGCTGTACACTGGATTAGTAGTTTTGCG
ACCCTATCTTTCCTCTCCTACTTTCAAGCACTTTCTTAGCTTTTCCATCG
CTATCCGATTGCTCAGTGAAGAAAATGGTGTTatcagaaatcaaaacatt
ggaGCAGCTCGAGGTCTTTTAAAGTATTTCGTTGACAATTGTCATGTTTT
TTACGGTGAAACATTTTGTGTTTATAACGTACATAACGTGAAACACCTCC
CAGATGACGTGGTTAGATTTCAGTTACccttaatgaaattttcatgtttc
CAGTTCGAAAACCATCTCCAAAAAATCAAACGTCTTGTTAGGGGAAAAAA
TAATCCACTCAGTCAAATTGTTAAAAGATGTGATGAGCTAGATGGAAGTT
ACTATCTTACCAAACCACTTGAATTGAAATATAATCCGAATGGCAAAGAC
TCTTGGTTCATTGCATTTGATCTAATAGTTCAGTTGAAGGAAATAGGAAA
CAATGGAACATTTTGGTGTGATACTTATAAACCTGCTAACCTGTCGTCAT
ACTTCAATGCTTTCAACATCGATTCGAAAGAACTTGGAATATACCTATTG
AAAGAGAACCTGAAACCATCTCGCGCAAACTTTAAAAGGGAACAGTTACA
AAAGAAATGTGTTTGTTTACCATATAAGAACGACTTTGTTATTATTTCAA
TGTTATAGTCCGTGGTAAATGGCCCCAAagcgtttcactttttttgcggt
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ctttttttttaccTTAACAACGCCCATAACTTCTGATCTACAAAAGTTGG
AAAATTGTTGtagtatatttttttgttcagtttgaagagctttaTCCCGT
TATAATacaggtcttttttgattttgaagttcccccaaaaaatgaatttt
aatttcatttctgaGGCTTCAGAAATCCAAGGGCCATGGCCTATTATTAT
AGGTCTTGATCTTtagaggttctataaattacctataataaaaattcatt
tttcttttccattttatCTTGTGTTTATTAAATATAAATATATCTAGtca
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TACTATTCTTAATTGCCCAATTTTAACCTTATGAAGCTcattttaagtaa
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TCCTCCCTTTTTGGCTGAGGGTAGGAAACTAGAGATCTACAGCCaaagtt
ttgcttttctttgaGCCTGAGAAAAAAGGGACCCTTCAAAgacgtcttct
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ATGCTTTGTTcaagtattttgaaaaaaatggtcaGCACCGGGAGTGCGTT
GCGCCAACACAATGGATAAAAGAAAGCAAACTTTACTGGCCAAAATATGC
TGCTCGTCAATTGGCTTTAGAAATGGCACCCTTAGACGAAACTTGGCCCT
CTTATCCCATACACGAGATAAAGAAATATCACGGTATTAATACAATTCCC
TTTTCTCTGTTTTGAAAAAGATCTTTGGAACTCTCGTGTTCGGTGCATTC
TTCCGCCTCTTTTATAACCTCTTAAAATAATGTGATTTTTCTTTCAACAg
ccatttttaaatttaaacgTTTGATTTATTTTCCAGACGACTACAATTAT
CTTAATGACTGCTGCTATACCACCACCGAAGATGAGAGtccagtcaaaaa
aaaaaccgaTGGTCAGTATATATTAAAACATAGTTCAAGTATCAAGTTTC
GTACATTTGCCCTTGTGCATTTGTATTGTTTCTGAAAAATCATGATGGTT
AGTAATAATTAATGTCGATTTGCGTATTTCTTTTGGTTTAGAATCACCGA
AAAGAGCTTCAAGCccaaatttcaatatttcagGCAGCTACGCCAATTCG
TTTAGCAGGCCGACCCTACCTGGCGCTTGTAGAACGCAATCTCAGGTGCA
GTCACCTACAGTTTCAATGAAAAGTAAGTTTAACCAGAATATTTAGAATA
TGGACCCTTCTCCTGTttagtaattttcaaaaaaaattttagctGTTAAA
AGGAAAGTCCTctctttattttgctttaaattgtcttttaaatcattttt
accATAGGAAAAAGAGACGATACTATCGTTCGCTCCAGTTTTTCTCCGGC
AGCCACATGCACCGAAAGTAATAGCTTTATACCACTGGCGTCAATAATAA
ACGCAGGtattttttattcgaaaattttACTATAGGTACTATCCAATCTT
TTCGCATCTTTTACTCAGATTGCACTATTTCATTACTCCAGACAATTCTT
GTTTTTTGACGGTATTTTCAGCTGATAATAACTTATTTTGGCTTTCAGAT
AACAGTTTCAATCCAGACGACTGTATATCTCCATATGACCTTCTCGGCAA
ATCTGGATCAGGTATGTTAGTCACCTTAGTTAGTCAGTGATTATTCCGAG
TAAAAAATCGATCAAATAATATCACTAAACCGGATTAAACAATTTTCGAa
gaatgtttataaaaaaatatccattTTAATGGCGATGGAGTAATACTTGA
ATTTTTCTCTGCTTATTATTCTttacattcttttatttatttttattcag
catacattttcatatttttcatagcTTCTCACTCACAGTCACCACGACAA
TCGCCGAACTGTGCACGAAATAATGgcgctatgaaaaaaaaacgtaaaaa
aaatatatttttttttattagcaaTTTCAGTACCGAATATTTTCAAAGCA
GCCCTGTTCAGAAAGCTCGAGCTTATcctagtttgttttttttttacttt
tagatGCAAACTTCATTGTTCCTGAAACCAATGATCAACGACCTTgtaag
tcttttttaaattaagcacagatgatttttttgtttttttcgtgTGAGTG
AAGAATTCTTTTGCCTTGATCAATGCttcctgatttttttttactttctg
gGAAGGACTTGACAGATATTTTGTTGAGATAGAGAAACATACTAtactat
ttttttaatttctttttgcaGCGACACAGAAAAAATGCCACTCAAAATAT
GGAGATGGCGGAAAGGACTTCAAAGAAATGTCGAATAAACGTAAGTTTTC
AAGCTCAATATTACATTCTTGTTTTGTACAAAGAAATAAAGTCCATTCGC
TTTGAGTATGCACACGTTTTTTCTACAACGTGGGAAACAATCTCAAAGGA
AGTAAGTCTAATTACGCTGACACGGTTTCTACATGGTAGCTAAAAcgagt
gcacacttaaagcgaatgtaCTCTAGTTTGGTTGGATTTACATAAAAGCA
AGAGTATAGAGTATAGTCATTCATGCGGGCTCCAGACATTCGGTAAGAAA
ATGAGCAAGAGTGTAACCCACCCTTTGTTTCCATATCACATCAGACTaat
tattacacttttttttcagaatatcaATATTCCGTCATGATGGAGTTGCA
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ATGGAAGAATTCGATATCGAGGAAGAAAAACTCAAAACACACGATAAGAG
AGTGATAAAGGTAAAAATAATCAATACTTTTTATATACCTTTTCAATACC
TCGATCTTCTTTTTACCCGACAACTTCACGTTTCACAGTAGGCCCTCGTG
AAATTTTTTTATTTCTTGTGAAAATATATGGTAATTAATGTATTATTTTG
AATTTTATCTTGTAGCGAAAAATGATCAAGCAAATAGGTGGCAAAGACAT
CCGTCAAGCAATCCGCTTAGCACTCGACAGCATGATGTCGAGAAGACTAC
AAAGCAAGTTTTCAAAGTCGGGCttgcagaaaaaaagaaaatttaaaggc
ACTTATCATTATAAATGCTTAGAGGGTAAGAcatattttatcttatttta
tcCAAACTTTTATCCTTAAATAGTTAAGTATAATAATTCCGTCATAGTTA
AATTCACTGTTGATGTAGACTTTGATCGTCAGAACTTCGGCTTTACATTT
TAGTATACTTTAagagaataaattaatgcgaaaTTAGTTAATGAGAATTG
GCCCTAATTTGCATTACATATTCACTTCCGCATATCCTAAAATTGGCCAA
TTCGCATTAATCTATTCCCTTATATTAAATTAGCTGTGACAATTAGTTCT
GCAAGGCATGAATTTTTGAGGTGTCATTTGCATTATTGTATTCCGCATTA
ATCTATTATggggggggttttcacttttacggtacgacggtattgggcct
ttttttccccggtaaatcggtattaccagaaaaaaacgacgggattacgg
tNTTTTATCCTTAAATAGTTAAGTATAATAATTCCGTCATAGTTAAATTC
ACTGTTGATGTAGACTTTGATCGTCAAAACTTCGGCTTTACACTTTAGTA
TACTTTAagagaataaattaatgcgaaaTTAGTTAATATTCACTTCCGCA
TATCCTAAAATTGGCTTATATTAAATTAGCTGTGACAATTAGTTCTGCAA
GGCATGAATTTTTGAGGTGTCATTCGCATTATTGTATTCCGCATTAATCT
ATTATTGCATTAATCTATTCCCTTATTAAggtattttgttttatttcaac
AGCTGTGCTGCTTCTAAANATTATTGCATTAATGTATTCCCTTATTAAgg
tattttgttttatttcaacAGCTGTGCTGCTTCTAAAGTACGAACAATTC
GATATTGATAAAGAAGTTGGGGATATCATTAAACGAGCCAATGACAAACC
AAAGAATGCTGGTACTGACGATGGAAACCAATCGGATCACGAAAACAGCC
CTATTTCATAAATACatgttttattataagcataaatgaaaatgaaatca
ctATGCTTATTTTACCGAAGAAAAGCGAGATTGATTTTGTCTATAGATTT
TTCTATCACTAAATTGAGTGCAAATATAGCAATCTCTCAATTCACTAAAT
TTTTCCAaggttcatttaaaatgacaaaagctCACTGATATGCTCAATTT
TTCACCAAATCCAAGTCttagtatgcttataaacgttatgcttgtaaaaa
aacatgtatgttatatttcataaatattacttcgaataaacacccctttC
TTTAAACGTCCTCTCAAGAAAACGCCTTCCctctaggaggggcgtttatt
tgcaACAGGTGGCTGTAAGAAAAATATCACGaaagaaaacttaaatatat
aataATTGTACTCTTTAGTGCTCGAACTCGTTTGACTCGCTTTTACATCC
C
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_023040XLOC_023040Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00038448-exon-sc0001855-1491911889:24153..25974TCONS_00038448-exon-sc0001855-1491911889:24153..25974Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038448-exon-sc0001855-1510915933:24153..25974TCONS_00038448-exon-sc0001855-1510915933:24153..25974Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038448-exon-sc0001855-1575043694:24153..25974TCONS_00038448-exon-sc0001855-1575043694:24153..25974Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038448-exon-sc0001855-1491911889:33027..33095TCONS_00038448-exon-sc0001855-1491911889:33027..33095Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038448-exon-sc0001855-1510915933:33027..33095TCONS_00038448-exon-sc0001855-1510915933:33027..33095Clytia hemisphaericaexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001855supercontigsc0001855:24153..35703 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0.30055	0.212441	0.358292	0.457257	1.12973	0.750648	0.645019	1.20564	1.07352	1.0772	0	0.0649808	0.0829189	0	0.0276899	0	0.0269028	0.0439018	0	0	0.724924	1.92085	0	0	0	0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00038448 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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