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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00038093 ID=TCONS_00038093|Name=TCONS_00038093|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2945bp
TAGATATCTAATATATCCGAAATGGATGATGAAATACGAActcaaatgag
aaaattttacaataagCACATCCTTGTGTCTACAACAGGGCTTGATGTAG
AAGGAACTACAAAATTCATAATCACCAAATGTATTGAAATTTATCAAAGT
AAACAAATTGAGGCTGAGTTAAAAGTTTTGGAGAGAAGTGAAAAGGAGAT
AGAAATCCTTGGCAAGTTCGTAAAGATGTGTGTTGAGGAATTCCCTGAAG
gtgaatgttataaacagttgCTACAAACTGGTCAAAACACAATGGAATTA
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ATATTACCTTCGTTACCGATTTGGTAGACCTTGGAGCTGACTTTAAAGTT
AAGGACAATGGTGGAAAAACACCGTTTTCGTTGGCCGCTTTGAATCGGAA
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AACACTTGCCCCAAGAGCTGTTTAAAAAGAAGCGATCGTTTAtcgttgat
tcatactttcgtTGAAAATCAGAGGCGATCAGAATCTGTCTTAAGGTACC
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ACTCCATTGATAAAATCAATTATGAGATCAGATCTGGAGTTTTGCAAAGT
GCTTTTGGAAAAAGGAGCTGATGATATGACCTGTTTGCATTACGCTGCAT
CTATCCCTGCAAGTAATAAGATCAATGATCATCACAAGATTACTAAAATC
TTATTGAAGCATGGTGCTGTGATTGAGGCCAAGGATTGTTTTGGCGATAC
GCCAATCGTCTATGCTGCTTCTACAGGAGATACAAAGGTCTTCAAGGTGT
TTTGGCGAAAACACCAAAAGTTGGCGCCAATAGATTCCGCCCTTTCAGAT
CGATTGATCACTGTTGCAATGTTGACCGGTTTTGATAGCTTGGTTGATGA
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CTCCAATGCCTAGAAAAGGGATTTCGTTGACAAACGATAGTTGGAAGGTG
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TGTTGAAGGCACAAAAATTGGAGTTCTGGACGAAATCGATTTTCTGTGTC
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GTTTCCAATTTAAAgcaaatcaaaataattagtgGCAGTGATATCGCAAA
tctttcagattttattgacGAAGAATCATTTCTATCCTCGAGAAAAATTG
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CTTCCTAAGGAGGAAGGGGTTATTGAAAATTCCAaaagctttgaaatttt
gcagaagcaTTTTGAATTAGATTCAGAGATAGGAAAGAACCTTCTCGTGT
CAAAGAAGGTAGATTCGGAATTTGTCAATGAGCAAGACAAAAGCATTATA
TGGAGAAAGTCATACTCTTTTGTTGAGGCAGCAATTTTTCAACAGTTGCC
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GAATATGCCCCGCATTCACACATGTCGATACAAAAAGTGTCGACAAATTA
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GATCGAAGCTGAAAAGCAACTGGAAAGCTTCACATCTATTCAATGGGGTA
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TCACGTATCTCCAGATATTGTGATTAAAATGGTGATTGCTTTTtgtgaaa
ttggaaaaaaatggcTCAGTCAGCCATGGGACTTTATTGATGTTTAAATT
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aaatttaatgaaaataatactccataactcgatcaCGCACGGGCAACACA
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gcaTTGTGAACTGAAGGGAGTAGAAATTTgacatttgagttatagaggtt
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TAATAATTTTTATCCATGTTAGTGCCTTCGAATTTGCCAAATTCAATTCC
CACCGGATCTTACGAAATTAATTGCAATCACCATATTAAATCCAC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0001772:25430..34999- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00038093 ID=TCONS_00038093|Name=TCONS_00038093|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9570bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001772:25430..34999- (Clytia hemisphaerica)
TAGATATCTAATATATCCGAAATGGATGATGAAATACGAACTCAAATGAG
AAAATTTTACAATAAGCACATCCTTGTGTCTACAACAGGGCTTGATGTAG
AAGGAACTACAAAATTCATAATCACCAAATGTATTGAAATTTATCAAAGT
AAACAAATTGAGGCTGAGTTAAAAGGTAAGTGAAATTTGAAAAACGTCTC
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AACTAATACCGAAAGCTCTATCATAAGTTACAGCCATTTTTGTTTTCACT
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ATTATTTTCCCGTCACCCGGACTCAGTCCATCGAATTTCTGCATCTATCT
GCATCCTCTGTCCCGTCAAAACTTGAAAACCTACAGTATATTCAGTGAAA
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TCTTAGCTTTTTTAGTTTTAAGCTTAAGAATGTTCTTATTTTTACCATTT
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ACACGGACTCCTTTAAATTTTCGATAAAACACGGGCCCCACTGACAAATT
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TCTAGAATGGATCCCAAGGAAATTTGTTCTCGCTAGATTATAGGATAGTA
TAGAAGTAGAACTTGTTAGAGTTTCTAAAGGATTTTTTACGCTGTTTGAG
CTTTCTTAGATAAAAGATTACAAGGAAAACTTTCATACTTTGAGACGAAT
CAATGTTCTGACATAAAAACTCGATGCCATAAAGAGAAACAACATGTCGA
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TGATTTTCCCATGTGCTTATTAAAAAGAGTGTAGATGCTCAGATAATTTG
ACGGTTCGTTGGAAGAATTTGATTAATTCTATTCAAAAACGGCCATTTGA
TATTTGGGAATTTGAGGTTTGAATTATGAGCTGTTTAAATGGTAAATGTT
TATGAAAATAAACTGGAAAATAAATGGATTCGTGTTTTCTCGAAAATTTA
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GTTTTCGCTAAAATTTGAAAGGGTACGTGTTTTTGCTAAAATTTGAGAGG
GTACGTGTTTTCGCTAAAATTTGAGGGGGCACGTGTTTTCGCTAAAATTT
GAGAGGGTACGTGTTTTCGCTAAAATTTGAGAGGGTACGTGTTTTCGCTA
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GTGTTTTCGCTAAAATTTGAGAGGGTACGTGTTTTCGCTAAAATTTGAGA
GGGTACGTGTTTTCGCTAAAATTTGAGAGGGTACGTGTTTTCGCTAAAAT
TTGAGAGGGTACGTGTTTTCGCTAAAATTTGAGGGGGTACGTGTTTTCGC
TAAAAACTTAAGGGGTCCGTGTTTTCGCTAAAATTTGAGGGGGTACGTGT
TTTCGCTAAAATTTGAGAGGGTACGTGTTTTCGCTAAAATTTGAGTTGTC
CACGTTTTCGCAAAAAACTTAAGGGGGTCCGTGTTTTCGCCAAAATTTGA
GGGGGGTCCATGTTTTGTCGAAAATTTACGAGGGGTCCGGGTTTTCAAAG
GGTGCAGGGTCCGGTCCAGGTCCTGGTTGTACAATACGCCGATTTTCTTA
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AATAATCCTCATGTGTATTGTCGAGGCCCTACCTGTCTTACCTTTACCAA
ATCTAATTTTTATCAAAACAGAGAAAATCTGAAAAGGGGTTTTGGATAAA
TTGGCCGAAATGACTTGAAAAACATTGATACAGCTTTTAAGAAGTTCAAA
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CTATATTCAAAACAAAACTTGGTTCAATGGGTGGTGTAATGGGATTTCCG
AGCCCTCCATCTGAACTTACTAAATTTCATGATCAGATAGAGTACATATT
AAAACAAAAAGGGAGACGAGTGCAGAATGAACTTTGAGGCAAAGTGAGTT
CCCTACAAAAATAATCTTTAACATAACCAGCTCCTAAAGATACAAAAAAA
AATGTTACACTTACAGTATGTGGCCCCCAAAATGGCGATCAAATTTAATA
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GCAAAACTTTAACATCTCTACTTTATTTCCCGACCGTTCTTTTTCAAAAT
TTTCAATTTCAACAATATTTTTCAATCGCTTAAAGATAGGTAGCTTTTTT
CTAATGGCCCCAAAAACGGAGGTCTACAATTTTAGTGATTTCTCGAGATA
TCTTTAAGATATACAAAATTTTGACCATAGTTTTCAAATGTGATTTAGAG
GGATTTGGGCATAAATTTGTTTGATAAAATTTTTACAGTATACCCCTGGT
TGTCAAAATGCAGGTTTGGGGCCCCCAAAACGGAGGTGTAGTTAAAATCA
AATTATTAAGCCCAGTTGTAATAGGAGGGAAAACTATGAACATATTTGTG
TTTACCCTTAAATTTACGACCCGATAGATAAAATTTATGATTTTATGAAA
TATTTCAAGATTTTCGATATAGCAAAGTCCAAACTGAAAATTTAGAAATT
TTCAAAATAACAATTTAGATTTAACAACGTCTTAATCAAGTTTCTGAAAA
TCAATGTCTTTTGAAAATAGTTCCATTCATGTATGTAAAAAGCTGTGAAA
ATTTGAGAAGAAAAGCTTATCTGAAACTGAAAATATTAAGCTTTAAAGGT
ATTTTTCTCCTATATTTTGCAGAAAAATGACAGAATTTGCCATTTTTGCT
GATTCAGCGAAAAAATTTTATATATAATGTAAATTTTTTGTTATAAGCTA
TTAACTCAACCTGATAGGAATGGAATTCTAAGATTTTTTGCTGTTTCTCA
TATTTAGAATTTTCAGTTTTGTCAATGCTGATTCTAGGGCTCCAAAATAC
TGGTTGACCTTCAAGATGCTATATCTCTAACCCAGCCTCTAAAATCACAA
ATGTAATTGCATTTTCTGAACGGCATTTGGACGCTTTACCTCTCCCAAAT
GGTGTGCACTGATTTTAGAGTTAGTAGTAAGTAAGTCTGTGACCGCACTC
GGAGGCGACCCGAAGGCTCCTCTTGTGATAGCTATCTACTCGAAGGTAGG
GGAGGGTGTACCCCGGGGTCCACTTAAAGCTTTTTGATAGACTGGATGGC
GCAATTAAGTGGCCCGGTAGTATATGGTAATTTTAGTTGTTTTTGGAAGG
TAAAAACAGTATGAAGCAATGTTTTTATTTGAGAATAAGGGATTGCAAAT
CTGTTACTGATGTTTGTTTCTCATTTTTGGTTATATCTTTCAACTCCAAG
TAGTTTTTTTGTTTTTTGGATTTTAAACATTCTTTTTCAAAATGGCGACC
TCTCCAAACGCTCCTAGTCTACTTCACTGGACTCAGCGTTATCAAAAATT
ATCAAAAAGCAAAGTTCAGCCAGAAGTAGACTCTAGTCTAGGGAGGGTGC
GACTCTTTCTCCCTTGATTGCTCCACTTACCATTGATCCTTTTCTTAAGG
GCTCTGACCATAGTCAAAAAATTGATTTTAGTACTTGAACAGGAAAGTTA
TGTTTTAGGTTATTTAACACTTTTAACAAAGAATTGCCTTTATAAATTGC
TTTTTAATTAAATCCCTTAAGAGTAATTAAGAATTTAATTGTAAAAATGA
CGCTATAAACTTTAAAGGGACATTAAAGTAGTAAAATGTAAACATTGCGC
GAACCAAGTGTCATTAAAGAGAACAATTAAAATCATGTGTCCGAAACAAA
CTTGTAAAACAATTGAACAATCAAAATTAGCCATATTTGGTTTGATTTTT
TATTTTGACATGTGACATTTGTTTTGATTTTGTATCCGCTGCACACAGTT
TGTTTACAAATTTTGCAAGTACTGGCTGCGTTTAGACCAACTGGCATTTG
TAATTTGGCATTTGCTCATGAGGGATTCGATTTTAATACCGGGTGCGCCA
CAAAAAGGTTTCTCTCTTTAAAAGTAATTTTCTCGAAATTTAAAAATTTT
AAAAGAACCATTCCTATATTATTGGAAAGAAGAAAAATAAACTTAAATTT
TGATAGGTCATTTATTGAATTCGATTCATTACATCAAAAGTTATGCTCAA
TTGAATAAAAAAGTTACTTTTGGAAAGTGCTCAAAAACGTTAAAAATCGA
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TCCAGTCTAGAACCAAAAATCTGAGGAAAATTTCGGTAAAACTAAATCAA
ATTAATTTTGATGAAGATTTTGAACCCTTTTGACCCTTTCAAAATTTATA
TGTGTTTAGTTAATGAAAAATGCTCTTAATCATGTAAAGGCTATTGCGAT
TGCCAAATTTAAAGTAAAAATTTGATAGGTCGATTTTTAACCTTTCGAGC
ACTTTCTGAAAGTAACATTTTTATTCAATTGAATATAACTTTTGATCTAA
TGAATCGAATTTAATAAATGACCCATCAAAATTTAAGTCTATCTTTCTTC
TTTCCAATGAAATAGGATTGGTTCTTTTAAAATTTTTAGATTTCGAGAAA
ATTAGTTTCAAAGAGAGAAACTTTTTTGTGGCGCACCCGGTAGCTTTTCC
ATTGCATTTTCTGCCATGGCATTTAAGGAATCGTCTTTTTAGAGTCATTA
CTGAAAAGGTAGCCTGGATATTCAGGCTATAAACTATTTCACAGTCTAGT
TTTTGGCCTGGTCTCCCTAGAGCGTTTTGCATTCTCCATATGAGAATGCA
GTCCACTTGCTTGCGCTCACTTCGCTAAAGCCGTAAGGACCAATCTACAC
GGCGCGGAGCAATTCTGAAGCAAGAATAGGATAGTCCCCCACTTGCTAGT
GAAGATTGAACTTTCTGTTACATGAAAACATGAAAAAGAAGAAAACAGAG
GCAAGTTCATTTTCCAAGAAAACATGGTCTGATAGTTGGTCATGATAATG
CATGCAAAAACTTGTCCATGGACTCTGGTGTAATCTTTGGATGTTTTAAA
TGGTTTTAGATCTTGTAAGGCTGCTTTTATTAATTTCTGTTTTGCTGCCC
TGGGTTGGCTAGGAAAGTTTTGGAAACATGGGTTTGCACTTTCATTCTCT
AGGGAGACCAAGCTCTATAATTTTAGAACTTTGTATGTTGAGGTAAATTT
TGTTTTTTTTCTAAAATTTTGAGCTTGGATATCCAGGCTACTGAAAAGGT
GATTCCCCCAAGTTCAACTTTGACAGATCAAACAATGAAAAGCATGGAAT
TTCTCAGAAACTGCAGTCATTAAGACTGAAACTTTTTGCCGTAGGGCTAG
ACTTTGGCAAATCTTGCAAATTTAACAATCTATAGAAAGAACTGAATAAA
AAACATGCAAATACTTTAAAAAATCAAAAAAGTCATTTTTTCTCTTTGTT
CTGGTTCCTTTGTTTGATTTGAAATGCCAGAAAAGGGGATTCCTTTGCTC
AAACAAAATGGCATTTCAAATGCCAACGAAATGCCAACACGCTGGCATCA
TTAGGCATTTGACAAACCGAACAATTGCGCGGAACAATAGAATTCAAAAG
GATACTGCAAGCAATTACAAATGCCAGGCTGGTCTAAACGCAGCCACTGT
TATGTCCCTTTAAAAAGACATTATTGATATGTTGCATTATCTTACAAAAA
GTGCTAAGTTTTAATGGGTAATTAACCTTTTTGTTTTGAATTTTTTTTCA
AACTTTTTTTAACTCTCGCGTTCAAAATGTTTCTCTTTTTGTATTTCTAG
TTTTGGAGAGAAGTGAAAAGGAGATAGAAATCCTTGGCAAGTTCGTAAAG
ATGTGTGTTGAGGAATTCCCTGAAGGTGAATGTTATAAACAGTTGCTACA
AACTGGTCAAAACACAATGGAATTACTACAACATCCTTCAAATCTGATCT
ACGCACAGATGTCGCCGAATAATGAGACAATTCTACACCGTGCTATTAAG
GACGATACGCCGAAACGTGACGTTGATATTACCTTCGTTACCGATTTGGT
AGACCTTGGAGCTGACTTTAAAGTTAAGGACAATGGTGGAAAAACACCGT
TTTCGTTGGCCGCTTTGAATCGGAATTACGCTGTAATGAAAATGATGTTA
GAAACTGGAAGAATCTCCAAAGATCAAATACAAAATGCAATGTTTGAGAT
ATTGTATTTTATACCGTTAGAAACCCCTATAAATCAAGTCGAGTCTCTTT
TTGAATTATTGAAGACTTATGATGGAAATATGAATGTTAGAAACAGATCA
CAGCAATCATTGGTGGAATATTGCGTATCTTCACCACGCTGGCTGCCATC
TTTAGATGTATTCAAGTATCTTGTTAACACTTGCCCCAAGAGCTGTTTAA
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CGATCAGAATCTGTCTTAAGGTACCTGTGTGAACTAAATGATATTGATGT
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GATCAGATCTGGAGTTTTGCAAAGTGCTTTTGGAAAAAGGAGCTGATGAT
ATGACCTGTTTGCATTACGCTGCATCTATCCCTGCAAGTAATAAGATCAA
TGATCATCACAAGATTACTAAAATCTTATTGAAGCATGGTGCTGTGATTG
AGGCCAAGGATTGTTTTGGCGATACGCCAATCGTCTATGCTGCTTCTACA
GGAGATACAAAGGTCTTCAAGGTGTTTTGGCGAAAACACCAAAAGTTGGC
GCCAATAGATTCCGCCCTTTCAGATCGATTGATCACTGTTGCAATGTTGA
CCGGTTTTGATAGCTTGGTTGATGAGATTGAAAAGTTGCGTTCCTCTGAT
AACATCAATGAGTCAACCAAAGACGCTCCAATGCCTAGAAAAGGGATTTC
GTTGACAAACGATAGTTGGAAGGTGTGGTTACAAGAGAAAGAAAACGAAA
TGATTTTGAATGCAGAAAATGATCAGAAGCCACGTATTATTGATGCTTTC
CAAGAACGTGACAAAATGCTTCAGATTGAAAACAACGAGATACAACGGCA
GTTTAGTGTACTATTAGAGCGCATTTCGAAGTACGGGTATGATTTCCCAT
TCACGCCAATTCTCTCTGGTAGTAATGTTGAAGGCACAAAAATTGGAGTT
CTGGACGAAATCGATTTTCTGTGTCAACTCAAGTTTATTTTAAAACCAGA
ACAATATGAAATTTTAACGATGAATGTTTCCAATTTAAAGCAAATCAAAA
TAATTAGTGGCAGTGATATCGCAAATCTTTCAGATTTTATTGACGAAGAA
TCATTTCTATCCTCGAGAAAAATTGCTGCTCAGCTTTGGAAAATCTTTGC
CTCATCATTCAAGAAGGAAGATATTTGGAAAGATTTGTATTTTACCAGGC
CGTGGTGGGAGGATGACTCTTTACATACAGGTGGTGTCAGCTTTATATCC
ACAATCAATTTAATTTGGAATAGCGCAAATATCAAAAGACTTCATATTTC
AGTGGACCTTGTTCCCACGCTTATCCTTCCTAAGGAGGAAGGGGTTATTG
AAAATTCCAAAAGCTTTGAAATTTTGCAGAAGCATTTTGAATTAGATTCA
GAGATAGGAAAGAACCTTCTCGTGTCAAAGAAGGTAGATTCGGAATTTGT
CAATGAGCAAGACAAAAGCATTATATGGAGAAAGTCATACTCTTTTGTTG
AGGCAGCAATTTTTCAACAGTTGCCTCAATGTGCTCGGGATGGGTATAAA
TTGACGAAGTTTGTTCGTGATTCAAGAATATGCCCCGCATTCACACATGT
CGATACAAAAAGTGTCGACAAATTAATCACAAGTTATGTGTTGAAAACAT
GTTTGTTTCATGAAGTTGCTATGGAGATCGAAGCTGAAAAGCAACTGGAA
AGCTTCACATCTATTCAATGGGGTACCAAGATTTTGAACAGGCTTGAAAG
TTATATGAATAATACGAAAAGTAAAGTACCAGCCTTCTTTGATGAAAACA
TTTCGTTAAGTATCAAAGGACAATTTCACGTATCTCCAGATATTGTGATT
AAAATGGTGATTGCTTTTTGTGAAATTGGAAAAAAATGGCTCAGTCAGCC
ATGGGACTTTATTGATGTTTAAATTTGTCTTTTCCTACACTGGTTGTCTG
GTCAAGATGACATCTTCCACGTTGTGGGACAAACTACCTTAAATTTGGTG
AATTTAGGCAGATTTGCTCCCTGCCAAATTTAATGAAAATAATACTCCAT
AACTCGATCACGCACGGGCAACACAAAATTTGCCTTAGTTTAGGAAATTT
CTAGTTATGGAGTAAGGTTTATAAAGCATTGTGAACTGAAGGGAGTAGAA
ATTTGACATTTGAGTTATAGAGGTTCCAGTTAAAGAGACTGTTCTTCATT
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CTTCGAATTTGCCAAATTCAATTCCCACCGGATCTTACGAAATTAATTGC
AATCACCATATTAAATCCAC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00038093-exon-sc0001772-1575043694:34825..34999 | TCONS_00038093-exon-sc0001772-1575043694:34825..34999 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00038093-exon-sc0001772-1575043694:25430..28199 | TCONS_00038093-exon-sc0001772-1575043694:25430..28199 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00038093-exon-sc0001772-1510915933:25430..28199 | TCONS_00038093-exon-sc0001772-1510915933:25430..28199 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00038093-exon-sc0001772-1491911889:34825..34999 | TCONS_00038093-exon-sc0001772-1491911889:34825..34999 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00038093-exon-sc0001772-1491911889:25430..28199 | TCONS_00038093-exon-sc0001772-1491911889:25430..28199 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0001772 | supercontig | sc0001772:25430..34999 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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