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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00037651 ID=TCONS_00037651|Name=TCONS_00037651|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1788bp
GCTTTTCAATTTAGGATGATGTTTTTGGAGACGAATACCATGGTCTGTGG
AAAGTTTGTTATGATCGTCCTAATCGTGGGCTGACATCATCTTGTTTTGA
GCGAGTTGGGGATAtttacttGAACAATGTCAGATCTGGTATGTGTCTTT
CATTCTTGTTGTATGCTGTGGTGCTGGGATATTTGATAGCTATGCAGTTC
CGTTCTGATCTACAGTTAACACCTATTGGTTTGTGTTTGATCATTTCGTC
ATTATCAGCACTCTTTTCATTGACATTGTTCATCGCAACACAAGATATTC
CACGTGTCCACTGGCTGTTCACCATCAAATACGGATATTCGTTTGGTTTC
GGATGGTTCGGGATGTTGTTATCCATCATCACTGGTGTTGTGTGTATCTC
ACTTCCCAAGATTGATTGAACaccaatcaaaaaaatttttgaggaAAAGT
CTTTTGACTTTGTTTTATTGCAATTGCTTCCTCTTTTCTATTTTGGAATA
ATCTCTGTGGAAAGTTCTCTGGTTGATGTAAAAGAGACAAATCGATATTT
TTTATGAGAGATAATAATGCTTAACAAAAATGAGTAATATTAGTTGAGAT
GTTGGTGGTGCTAAATGGACCCCTTTAAATAGTAGGATTTTTTAGGCTAT
GTATGATAACAcccaattatttttaatttttttttgttatttactctata
ttttcttatatatTATTGCATATAAATaacttgattttgatattttgata
attttttgtacCTTATGACCCACTCTATCATATTTGCATATCTCTACGTC
TTCGTTTCGGTCTTGGTAGTGTCGAATGTTTTTCCAACAATATGGTGTGa
tttcatataaaaattatGTTTCCATTCATGCTTTTAAGTCACCTACTCTT
AGGTgctaaataaacgcccccccttgcttgttaatttttcgatttttttc
caaccccccgggaccttattaggaccccctcgtttattaatttttgaaaa
aattcccagctacaaaaagtaaaattacTTGTTtcactctaaaaagccta
aatttagtctattttgaccctttttagggtttttaaaggtcaattttcca
acccccccggtaattaggtccccccgtttatttaatttgaaaatttttcc
aaccNCCCCccatttattcgaaccccccccccgtttatttggcacctaag
agtagcaTTCTCATTGCTATTTATCATCAATTTTAGTTTCTGCTGGTTTT
CCATTGTTAATAATAAAACGTACCATATATCGGTGACATTGATAGATTCA
CAGCGTTCAATAGTAATTAATGATCGTTAATAACAGTTAATCATTAagag
atgagatggagtttttataagatacctCACTTATaggtcatttgaagtaa
aagGGTTGGCGTGTTCTTAAGAAAAAGTTACCAAATTGTtgtattacagg
ttaacgaccaactaAATCAAATAAGAACTTATAAAAACTCCAACAGTTCT
CAAGCATTTAGGGGTATATAGAATCCCCTTGTTTTCAATGTCAACTATCT
CTTTCTGTACTCTTGTAAATAGTCACACTTTTTAAAAAGGTGCttgatat
gtttttaaaaataaattgtttttatgtttctaattatttgattaaaaaaa
actaacaaaaacaCTGGAAAACTCAACGAGTCGTTCGTTATCATCAGCAA
CTAAATTCGAACCTCGTCCCTTAGTTCGATTTTTAGCTATTCCAATAGCG
ACCATggccatcagtaaaatcaaaaagaattgGGCTCt Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0001676:30795..33294- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00037651 ID=TCONS_00037651|Name=TCONS_00037651|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2500bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001676:30795..33294- (Clytia hemisphaerica)
GCTTTTCAATTTAGGATGATGTTTTTGGAGACGAATACCATGGTCTGTGG
AAAGTTTGTTATGATCGTCCTAATCGTGGGCTGACATCATCTTGTTTTGA
GCGAGTTGGGGATAGTAAGTTCATCTAATTCCATCCATGATACAGTATGG
TGAAACCATGGGTAAAACCTACACATTTTTTTATAAGAACAAACTATATA
AGAACAGCTTTGATGGTCAACATATTAAGAACAACTTCAGGCTTGCGTTG
CGGCCTCTGAAACACCTAATTTCTTAGACAAATCTGCCAAATTTTCTTCC
CGCCAAAATTTCTTCCCTTAGGTATACTAAAGATACAAATGCGACTGATT
GAGCATCACATCCACTATATAAACCTACTCAATTTTTAACTTTCTATCTT
GATTTTTTTTTTAGTTTACTTGAACAATGTCAGATCTGGTATGTGTCTTT
CATTCTTGTTGTATGCTGTGGTGCTGGGATATTTGATAGCTATGCAGTTC
CGTTCTGATCTACAGTTAACACCTATTGGTTTGTGTTTGATCATTTCGTG
TAAGTCATATTAAAGCAGTTGACCCTTCAACGATTTGTCATAACAAACCC
TGTTTTACTTGAACCTTTTTACCTCAAATCTTTTCCTACCATGTCCATAA
CGATGTTATCATGAGGAGTACACCGTTTTTATATTTGAGCAGCATGTTAA
TATTTTCGAAATTGTGCTTTGAAAAAATTTTTGTCGACTTTAGAATATAA
TATATTTGCAGGTCTTTTAAAATTTATTCTTAAGGCAAATACTTGGTTTT
AGTAGCGATTTTCCATGATTTTCTTAGAAGAATGCAAATTTGTTGAATTT
GACTATCGCTGTTAGATTGTGACTGCTCTATTTATTTCAATGTTGATTAT
CTATCTATCAAAGAAACATTTTTCCAGATTATTGAAAAATTTTCATTATT
TCATGTTTTAGCATTATCAGCACTCTTTTCATTGACATTGTTCATCGCAA
CACAAGATATTCCACGTGTCCACTGGCTGTTCACCATCAAATACGGATAT
TCGTTTGGTTTCGGATGGTTCGGGATGTTGTTATCCATCATCACTGGTGT
TGTGTGTATCTCACTTCCCAAGATTGATTGAACACCAATCAAAAAAATTT
TTGAGGAAAAGTCTTTTGACTTTGTTTTATTGCAATTGCTTCCTCTTTTC
TATTTTGGAATAATCTCTGTGGAAAGTTCTCTGGTTGATGTAAAAGAGAC
AAATCGATATTTTTTATGAGAGATAATAATGCTTAACAAAAATGAGTAAT
ATTAGTTGAGATGTTGGTGGTGCTAAATGGACCCCTTTAAATAGTAGGAT
TTTTTAGGCTATGTATGATAACACCCAATTATTTTTAATTTTTTTTTGTT
ATTTACTCTATATTTTCTTATATATTATTGCATATAAATAACTTGATTTT
GATATTTTGATAATTTTTTGTACCTTATGACCCACTCTATCATATTTGCA
TATCTCTACGTCTTCGTTTCGGTCTTGGTAGTGTCGAATGTTTTTCCAAC
AATATGGTGTGATTTCATATAAAAATTATGTTTCCATTCATGCTTTTAAG
TCACCTACTCTTAGGTGCTAAATAAACGCCCCCCCTTGCTTGTTAATTTT
TCGATTTTTTTCCAACCCCCCGGGACCTTATTAGGACCCCCTCGTTTATT
AATTTTTGAAAAAATTCCCAGCTACAAAAAGTAAAATTACTTGTTTCACT
CTAAAAAGCCTAAATTTAGTCTATTTTGACCCTTTTTAGGGTTTTTAAAG
GTCAATTTTCCAACCCCCCCGGTAATTAGGTCCCCCCGTTTATTTAATTT
GAAAATTTTTCCAACCNCCCCCCATTTATTCGAACCCCCCCCCCGTTTAT
TTGGCACCTAAGAGTAGCATTCTCATTGCTATTTATCATCAATTTTAGTT
TCTGCTGGTTTTCCATTGTTAATAATAAAACGTACCATATATCGGTGACA
TTGATAGATTCACAGCGTTCAATAGTAATTAATGATCGTTAATAACAGTT
AATCATTAAGAGATGAGATGGAGTTTTTATAAGATACCTCACTTATAGGT
CATTTGAAGTAAAAGGGTTGGCGTGTTCTTAAGAAAAAGTTACCAAATTG
TTGTATTACAGGTTAACGACCAACTAAATCAAATAAGAACTTATAAAAAC
TCCAACAGTTCTCAAGCATTTAGGGGTATATAGAATCCCCTTGTTTTCAA
TGTCAACTATCTCTTTCTGTACTCTTGTAAATAGTCACACTTTTTAAAAA
GGTGCTTGATATGTTTTTAAAAATAAATTGTTTTTATGTTTCTAATTATT
TGATTAAAAAAAACTAACAAAAACACTGGAAAACTCAACGAGTCGTTCGT
TATCATCAGCAACTAAATTCGAACCTCGTCCCTTAGTTCGATTTTTAGCT
ATTCCAATAGCGACCATGGCCATCAGTAAAATCAAAAAGAATTGGGCTCT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00037651-exon-sc0001676-1575043694:33181..33294 | TCONS_00037651-exon-sc0001676-1575043694:33181..33294 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00037651-exon-sc0001676-1575043694:32746..32880 | TCONS_00037651-exon-sc0001676-1575043694:32746..32880 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00037651-exon-sc0001676-1575043694:30795..32333 | TCONS_00037651-exon-sc0001676-1575043694:30795..32333 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00037651-exon-sc0001676-1510915933:33181..33294 | TCONS_00037651-exon-sc0001676-1510915933:33181..33294 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00037651-exon-sc0001676-1510915933:32746..32880 | TCONS_00037651-exon-sc0001676-1510915933:32746..32880 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00037651-exon-sc0001676-1510915933:30795..32333 | TCONS_00037651-exon-sc0001676-1510915933:30795..32333 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00037651-exon-sc0001676-1491911889:33181..33294 | TCONS_00037651-exon-sc0001676-1491911889:33181..33294 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00037651-exon-sc0001676-1491911889:32746..32880 | TCONS_00037651-exon-sc0001676-1491911889:32746..32880 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00037651-exon-sc0001676-1491911889:30795..32333 | TCONS_00037651-exon-sc0001676-1491911889:30795..32333 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0001676 | supercontig | sc0001676:30795..33294 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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