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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00037218 ID=TCONS_00037218|Name=TCONS_00037218|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7364bp
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AAGACAGTCGACAAAAAGTAGTAGACGATCTTTCCACATTTCCACCAAAT
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TCCGTCATTGACGTCTTAAGTTATTTAAATACCTTTTAACTTAGGTATTT
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TCAGTAAGAAGTGG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0001590:17989..25352 Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00037218 ID=TCONS_00037218|Name=TCONS_00037218|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7364bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001590:17989..25352 (Clytia hemisphaerica)
CCACTTCTTACTGACTGTCACCCAAAGGAAATGACTTGTTcagtttcaat
taaattttacaaaatcacaaaaatgtaaGCCAATGACAAAATAAAACGTT
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AGAACTACTTAAATTACTGAATGCATAATCTTACACCATTTGTGATCACG
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CGACTTTTTTCGGACTGAAAATAGGAGCGTAAATCGCGTTATAGTTTTGT
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tataaattagGGGAagataacattttattttctaaacGTCTTTTTAATTG
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CTTTCACTTTCAAATTCCAAGACCAATCTTTCGACTCTGGTCTATAACCC
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ACTTCAACTTATTTGCTTTAGCCAACGTAGTTGGTCGGATATCTTCATGA
TGACGgttattattttcaaatatgAAAACTAAAATGTTTTCGGTATGGTC
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GCACACATGAAACTCGTATCACTTGCTTCTGAATGGATTATTATAAAATT
ATCTCTGAATTGACCGGGCTTTAAGAAAGATAAATTGAAACCTCTTATCT
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CGTAACACGATTCTTCTTCCTTAATGAGGCTTACCAAGTCAATGTTGATG
CCAGTAAGAAGCATGTTGTGTTTTTCCTTGAAACAAAACAACGCTTTCGT
AAAGTCCTAACTCCTAACTAAGCGTCTCATAATTTCCTCGGTTACTaaca
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CGACACTGAAGCCATCTTACTTTGAAGTTGTTATTTTTGCATTTACAAAG
CCTGGTTGTAtataagaaaaaactcaaatacTAAAAAAAAGATTCTCAGT
ACATCACTCACTTTCGCAAACTGCGTCCACTTGCAACGTTAGGAACAACA
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TTCCTTGAAACAAAACAACGCTTTCGTAAAGTCCTAACTCCTAACTAAGC
GTCTCATAATTTTTTCGGTTACTaacacaaagaaaatatttctgacTTAA
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GCCTGGTTGTATAtaagaaaaaaactcaaatactAAAAAAAAGATTCTCA
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CCCTTAAGGGCAATAGCGATATTGACGATAAAAAAGTCTTGATCGTATAa
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GATGCGGTTACAGGAGTGACCAGTCCGGTGAAAACAAAGTCTATACTCGC
TTTCGTGTTGTGTTTTTGAAGTGCTGTTTATGTCATTGTTTTTATACAAC
AGAGATGGTTTTGCACAATCATCTTAAGCAGCCAAGTCAGTTTTTACTTG
TGGAGTGTCCTTGGAATTGTTATTGCCACTTTCAACTGCtacgttgttgt
tgttgacgtTGACGTTGTTGTTTGCGATAGTTGTTGTTGTTCGGGTGTTT
GTTTTGGGTTCCCTTGTCCCATTGATTCCTCTCCTTTTAATCGTTTATCT
TTCTTCAGtgtctttcatttcaaaatctaCTTTTTCTCCACTCTGCAAGT
CAGAAGACATCGAAGATTCTATTCCTCAGCTTTCTCACGTTCATAAAACC
TGTTTTACACGCCAAAACGGAAAAAGAGCGCTAGAAGGGGGAGACGGGAG
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CTACTTGAGTAATTAGGAtgatattttgagaaatttacttTGAAAACTTA
GCAAAAAAAGTCTCGAAGCCAAATGGATTAGACATTGTATGAATATGCTT
GTactcttttgattttttttctcaaagtcACAAGCTACGGTCTCAGACAA
AGAATAGCTATCTAACAGATTTTCCGTAGTCTTCGTTTCTGTGTCCACTT
GTGTTTGCATTcgtttattttagattttattttcatatcaatttttttta
acaaatactATAGTgcttaaaaatttatttgacaATATTGATACAATTTA
TTTTGTAACATAAGATAagaattttaatgaattttgtgAGAAGAGAATCG
TTGTACACAGTCAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00037218-exon-sc0001590-1491911889:17989..25352 | TCONS_00037218-exon-sc0001590-1491911889:17989..25352 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00037218-exon-sc0001590-1510915933:17989..25352 | TCONS_00037218-exon-sc0001590-1510915933:17989..25352 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00037218-exon-sc0001590-1575043694:17989..25352 | TCONS_00037218-exon-sc0001590-1575043694:17989..25352 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0001590 | supercontig | sc0001590:17989..25352 . |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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