TCONS_00036771 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00036771
Unique NameTCONS_00036771
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length304

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00036771 ID=TCONS_00036771|Name=TCONS_00036771|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=304bp
ATGGGATGTAAGGCCACTTCATTTTTGCATAATCTGTGAAACAAGAATGA
CACAACAATGCTAAACCTCAagATATTCACTCACTGGGTTGTCACTTTCT
GCATGGTGTGTAATTTCTGCAAGTGATGTCAGGATATCAGGAACTAACTT
CTTGATGTAATTCAATTGTTTATCTAATCATTGGAATAAGGAAGATCCAA
AATTTATAttaaaatgaAACAAGTTGGTGGAACCTTGTCCATTGTTGGTG
AGACTCTCCACTTCGATGCCAGCTGGCTTTTTGCGTCCATCAACTTGTTA
TTTG
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0001510:24749..30401-

Legend: exon
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>TCONS_00036771 ID=TCONS_00036771|Name=TCONS_00036771|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5653bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001510:24749..30401- (Clytia hemisphaerica)
ATGGGATGTAAGGCCACTTCATTTTTGCATAATCTGTGAAACAAGAATGA
CACAACAATGCTAAACCTCAAGGTAAATTTTCTTTTGAACTCGGATTTTC
CTTACACTGACCATCTCCCTCGATTACTTAAGCAGACCTCCAGCACAAAA
AGTCGTTAAATCTGAACCACTTACAGCAAATGATTTCAGCTTCTTATTTC
TCAACAACTCAGAATCGGAGGCTTAAAGTTGACTGGAGAGTCACTAAAAA
AAATAAACTTACTTTTCAAATCAGTTATTAACGTCGGGTTAAGTGCAGGT
CGTTGATTACCCGTCTTTATATCTGTGGATCCCATTGCGCATGACCTATT
GTGAGTTTTCATTGTAAATACTTAGAAATCTTATCATTGCATTAGACCGC
GGCAATCACAAATATCTTCATTTCGCTTGTTGGGTCTAAAAAGTGAGTCG
GTCGGTTGAAAATATTTTGGGGTGTTCTACTTCTCGCGTCCAACGAGAGG
GGAATTTGATGTTCTGTTTAGGCGGCCATCGAAAAATTGTTCTATTCGCG
CCACCCGCCCTCATCATATTTTTTGCTGATTTTCCGGTGCGGAGAAGTGG
AAAAAAATCCAGGAGAAGCAATTTGTTCTTTTAAAGTAATTTAGCTTTTT
TCTTAATCGCTCTGACGGCCATCGAAAAATTGTTTTGTTCGCGTCACCAC
CCGCCCCTGAATTACTGCCGTAATTATAAAAAACCCGGGAATTTTTCCGC
CCGCCCATCCGCCCGCATGCATTTTAAACACCCGTTGCGACGCGAACAGA
GCATTTTTTCGATGGCCGCCTTACCGTCGACCGCTCGCATGCTCTTGAAT
TTTTGAACGAAGGAAACGTCATTGACAGAAAAGGTCCGAAAAATTTAAAG
ACCCATTCTACTCAATTTCGATAGTCGGTTGGGCGATGCAAAACAAAGAT
ATTTGTGATTGCCACCTTGTGCTCTCGTTGTTTTGAAATGACTAGAAAAA
TACTTCAAAGGCGTACAGACTTTGGTGAGCAGAAACTTTCACTAGGTCGA
AAAAGTAGAGAATTCAAATTCTTGGGGCATAAAACCAGTGTTTTGATCGC
CATAAAGCAAAATATTTACCTAGCTAGTTCGTCTTTGGTGAATAAGATAT
CCAGAATTTCATTTAGGAAAGGTCGCCAATTAGTCAGGTTTGAAGACTGG
ACTTGTAACCTTTTCATATCATCCGGTGTCAAAATGATATGTGGGGCAAA
TTCATTCAATTGTTTAAACTGTAATAGAAAATAAGTGATTTATAAAAACA
TCAGAAATTTACTCAAGCTGAAAAACTTGATTTCACGAAATGGGGCTTAA
ATTCAGCAAATTTAAAATCAGAAATATTTGTAACAATTTGGTTACTCATC
TGCTACTTTACATTCTTAAAGGTCAAAGAAACACTGGAAAAACGAATGTC
TCGCACCAACTTGTTGTACTAGCAAGAAGAGGGTGCTTGTTGATGAAAAC
ATAATCAACAAGGACGATTAAAGATTCAAAGATTCAAAAGTCCATCCAAA
GAAGGTACAATTCCATTGATTACATTTCAATTTTTGCAAGACTTTACTTG
TATAATTGTTAAATACGCATGTGCTTATTATTTTGGTGAACCAGCAAGTT
CCATAATTTTTGCAGAGACTTACTTTTGCAAAAATGGTCAATCATGAAAA
TTGAGGTATACTATTTTCATCTTTGATTGAAAGGTGAATAATTAACAGGG
AGTGACTTACCTTTGCCCCTATTGATTGGGGACTTTTAGAGGAAGGTAGC
TTTGGTGCGGAATATGCAGGCTGCTATAAAATAAGTTTTTAGGTGCTGAA
ATGCTTGGAACTTTTCTCTTACTCTCAGGTGCCCAATACACGTACATGAA
AAAATTTACCAAATTTTCAAAAGTAGAGTTCAAATCAAATGCTAGAATTT
ATAGTAAAACGTTCGAATTTACTTGTGTAGCATTTAAAATCTCCCACGAT
ACATACAAATGTAATTAACGGCCTTTCTACACGTCTTACTTGAACAAAAA
ATAACAATTTTTTCCAGTATAAATTGGACAATGTTAGGTCAAAATAAACG
TACAGGCTGGAAAATTCCTCAAAATAAATAAACGTACAGGGTTTAATAAG
GTGCGTACAGTTCCTGCCTGTGTTCCTTGACACAAAAAAATTAGGCACCC
GAGAGTAGCGCCTGTTTTATCAAAATTTTAAGGATTTTTACTGCTTGTCT
TAATTGGTTCCTTTTTTTAATTATTAAAGTTAACAAAGCTCTACAATGTT
CTCTTACCTCTACTATCAAGGGGGTTGTTTTTCTGATCACTTTTGGCTTG
TTCACACTAGATTTTGGAGTCGACATCTTATTGGAATACTAGGAAAAATC
AAGAAATTCCTATTAACCTTTCTTGTTTGATTCTTATTGACCTTTCACAT
TTGACCTTTAAGGGTGACATCGAAAAATTGTCCTATTCGCGTCACCCGCC
CGCATCAAATTTTCCGCTGATTTTCCGATGCGGAGAAAAATCTGGGAAAA
GCAATTTGTTCTTTTAAAGTATAGCTTTTTTCTCAATTGCTCTGACGACC
ATCGAAAAATTGTTTTGCTCGCTTTACCACCCATTGTACATTAGAGTACA
ATTAAATAAGTGCAAAAACAGGATGGGTTAATACTAATAATTGACATTGT
CATACCAAATTAGAATCAAGCAGCTCTTCATGTCCACGGTCTCATTCCTG
ACTAACTTCAACATACTGAAATTAAATTGATAACATATTCAACAGTGTAC
AATTTTCCACTCCCGTTTTATGGCATAGAGGCTAGAAATTATTTGAAGGA
TTTCAAGTCATTTATTACACAAATTTGACAAATTCAATATTTACTACAAA
GTATTAAATGTATTTTATTAGTACAAAAAATTTTCTTAAATCTAGATATT
CACTCACTGGGTTGTCACTTTCTGCATGGTGTGTAATTTCTGCAAGTGAT
GTCAGGATATCAGGAACTAACTTCTTGATGTAATTCAATTGTTTATCTAA
TCATTGGAATAAGGAAGATCCAAAATTTATATTAAAATGTAAGAAATTTT
TTTTTAATTTGGTAGTTTGAAGCAAGGCTCTCCATTCAACTGTTAAATTA
AATTATTTTCTTTGAATGTCATCTCTACTATATCTCAATGTGTCTTTCAC
TTTCCATCTTGGTAAAAAAGTGTTTTGAGTACCGTCTATTAAAATCAAAG
TTACCTTTCTGTTTAAGTTTCTCTTTCAACTCTCTTAACTCCTTGTTTGT
TGCGAGACATTTGCTACAAGACACTGTTAAGGAAACAAGAGTTAATTTTA
TTTTTGTAAATGAATAAATTGNTGCTACAAGACACTGTTAAAGAAACAAG
AGTTAATTTTGTTTTTGTAAATGAATAAATTGCAAAGGAAATTTAATGGT
GACTGATTTAGTTAAGGCAAATTTTATTGAATAAGGTAAGGGTTTTTGAT
GGTACATACCTTTTTTTTTCCATATGGTGATAAACAGGTGATCTTTCTGA
GAATTGAAACAACTTATATCAATATAACTATTTTGACAACATTTAAAATG
ATCAAGAGTAAAGGGTCTCAAAAAACACTCCCCTGGTGAAAAGCTTCAGT
TTAATAATTATTTACCTCAAGCCTTTTTTTTAGAAAACTACTTAAAAACG
AAATCTAGATTACTTTTTCCATACCTTGAACAAAATCAGAATTAGGTAGT
TTGAGAGGAGCTGGAGCAAGATCCATGTTCCCTAAAATTAAAATATTGAT
GTGATGTCAGGTCATGTTGAAAAATTCAAGGAATGAATAAAAGACCATGT
ACCGNTTAGGTAGTTTGAGAGGAGCTGGAGCAAGATCCATGTTCCCTAAA
ATTAAAATATTGATGTGATGTCAGGTCATGTTGAAAAATTGAAGGAATGG
ATAAAAGACCATGTATGCTAATAAAATAATAAATGCTAATAAATTTTTAA
TCTTCAAATTTTCTTTTTAATACAAGAATTGGTTAGTAATTTTGAAAGAA
GCAATATGTATATGAATAAATTATAATAACGTCTTACTCTGGGCTTTGGT
GATTTCGGAAAGGTGGAGTTGCTTGGTCCAGGACAGTTTTTTGTTTAGCT
ACTTGTGGCTGTTGGAATTGTTGTGGTGGTGGTGGTGGTTTAATTTGTGT
TGATTCTTGGCTTGGTTGAAATTTGAATTGGGAATTATGTTGATATGATG
GCTGGTACTGTTTGGGTGGTTTGAATTCTGTATTTTGCTGTTGGTCCACA
TTGGTTTGGATGATTTCAAAGTCTGAGAAAATATTTATTTAATTCAAGTC
AAGTCAATCTTCAATTTTCCATTAAAATCATTACATCATTAAGTTGTTTT
CGTTCTTGAAATTACAAATTCTCATTTATTGAACAAATTTATTGTACTGG
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ATAATGTATATTTCAACAACAAACATGGATTACTTGGTAGTAAAATGCAC
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TAAGTCCCTGTCAAATCTTATAACTTCGCAGATGAGTTTTGATTACAAAA
ATCACGGCCAGTATAATGAAATTTATTGTAGGCTTAACAGAATTAACTTC
ATTTTTATTTAAAGGAAACAAGTTGGTGGAACCTTGTCCATTGTTGGTGA
GACTCTCCACTTCGATGCCAGCTGGCTTTTTGCGTCCATCAACTTGTTAT
TTG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_021715XLOC_021715Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00036771-exon-sc0001510-1575043694:30330..30401TCONS_00036771-exon-sc0001510-1575043694:30330..30401Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036771-exon-sc0001510-1575043694:27314..27456TCONS_00036771-exon-sc0001510-1575043694:27314..27456Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036771-exon-sc0001510-1575043694:24749..24837TCONS_00036771-exon-sc0001510-1575043694:24749..24837Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036771-exon-sc0001510-1510915933:30330..30401TCONS_00036771-exon-sc0001510-1510915933:30330..30401Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036771-exon-sc0001510-1510915933:27314..27456TCONS_00036771-exon-sc0001510-1510915933:27314..27456Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036771-exon-sc0001510-1510915933:24749..24837TCONS_00036771-exon-sc0001510-1510915933:24749..24837Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036771-exon-sc0001510-1491911889:30330..30401TCONS_00036771-exon-sc0001510-1491911889:30330..30401Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036771-exon-sc0001510-1491911889:27314..27456TCONS_00036771-exon-sc0001510-1491911889:27314..27456Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036771-exon-sc0001510-1491911889:24749..24837TCONS_00036771-exon-sc0001510-1491911889:24749..24837Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001510supercontigsc0001510:24749..30401 -
Expression

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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00036771 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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