TCONS_00036336 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00036336
Unique NameTCONS_00036336
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length748

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00036336 ID=TCONS_00036336|Name=TCONS_00036336|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=748bp
aaaatcgatttttaccctttttaagcctcgtttccattcagaatttcgtc
gtcgtgtgcaactgtcttaagtcccaatatggagaattatcgcctgtacc
cgactgtctgttgtTTGGCAACTCcgcaaaaacaaacaaataccATTTAG
GCGTGAGACAGCGAGGCACTAGCTTTTTTGTCGTGATACGTTGATTCAAT
TTGCGGAACGTCTTTGATGAGGCGTAGGTTCAAGTGAATCTGTTTGTTCA
GAGTTGTACGTTTCTCGTTTCTGAAGCGTATCGTCGGCAACCAGCTGTTC
ATTTCGTACACTGGTCACAACCACAACGCAacgaaagcaaagaaaagttA
AAAGCCAAAGCTGATTTGAAAAGATTTCAGAAGAAACAGAATCTCATtcg
tttttcaagtttttcaagtCAACAGATCAATCTTGACGATGGATACCGAA
CTTCATTACCTATTTTCTACctatttattttcattatctACATACACCCG
TCACGAGACAACAGGTCCCAATCGACTATTCTCTACAAGACCAGAAGGAA
AACGAAtgatattttaaaatatatagTATATTCTAACAAATGTACAATAT
TCTTCTTCTTTAAGAAATTTATACTTTAATATGACATATCTCTTTcatct
tttattgaaaaatccaTTAAACACTCGGTTGAAGTCATTTCCAATTATTT
TcccaagaaaaaatatttattctacAGCAAGAATATTCGATAGATTAT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0001443:50340..60267-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00036336 ID=TCONS_00036336|Name=TCONS_00036336|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9928bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001443:50340..60267- (Clytia hemisphaerica)
AAAATCGATTTTTACCCTTTTTAAGCCTCGTTTCCATTCAGAATTTCGTC
GTCGTGTGCAACTGTCTTAAGTCCCAATATGGAGAATTATCGCCTGTACC
CGACTGTCTGTTGTTTGGCAACTCCGCAAAAACAAACAAATACCATTTAG
GCGTGAGACAGCGAGGCACTAGCTTTTTTGTCGTGATACGTTGATTCAAT
TTGCGGAACGTCTTTGATGAGGCGTAGGTTCAAGTGAATCTGTTTGTTCA
GAGTTGTACGTTTCTCGTTTCTGAAGCGTATCGTCGGCAACCAGCTGTTC
ATTTCGTACACTGGTCACAACCACAACGCAACGAAAGCAAAGAAAAGTTA
AAAGCCAAAGCTGATTTGAAAAGATTTCAGAAGAAACAGAATCTCATTCG
TTTTTCAAGTTTTTCAAGTCAACAGGTATTATGTTGATACTTTTGGGTTT
CTCTTTAAATTTTTAAATCATTTTTGTAGTTTTTTGTATCTGTAATATAT
TGGGAACTTCTTACGGTAGAGATTTTTTTTTTAAGTTTTGCGTTTACTTT
CTCCTATGAAGATGCTGTACCCCATACCGATACCGATACCAATATCATTT
ATGCCGCTGTTACCAAAATCATTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTA
AATAAGCAACCTAAAGGTTACACAGACAGATAAGTATTTAGTTTTTTCTC
AAACTGCATGATTATTTTATACACTTGCGATTGTTTTGATACTTTTGGGT
TTCTCTTTTTTTTTAAATCATTTTTGTAGCTTTTTGTATCTGTCATATAT
GGGAACTTCTAAGAGAATTTTTTTCAAAGTTTTGCGTTTACTTTCTCCTA
TGAAGATGCTGTACCCCATACCGATACCGATACCGATATCAAATTGCCGC
TTTTACCGAAATCGTTCAAATTTTAATAGTAAGCACCCAAGTGAATAAGC
AACCAAGTAAGCTTAAAGGTTACACAGACAGATAAGTATTTAGTTTTTTC
TTTTTGTATATTTATAGCTTTTTGTATCTGTAATATATGGGAACTTTTAA
GANCATTTTTGCAGTTTTTTGTATCTGTAATATATTGCTGGGACTTCTAA
GAGAATTTTTTTTAAGTTTTGCGTTTACGTTTTACTATGGATATGCTGTA
CCCCATACCGATACCGATACCGATATCCAATTGCCGCTGTACCGAAATCG
TTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTT
TTAAAGGTTACACAGACACGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCAT
CATTATTTTATACACATGACTTGCGATTGTGTTGATACTTTTGGGTTACG
CTTTTTTTTTTAATCATTTTTGCAGTTTTTTGTATCTGTAATATATGGGA
ACTTCGAAGATAATTTTTTTTTAAGTTTTGCGTTTACGTTTTCCTATGGA
GATGCTGTACCCCATACCGATACCGATATCCAATTGCCGCTGTACCGAAA
TCGTTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAG
CTTTTAAAGGTTACACAGACACGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTG
CATCATTATTTTATACACTTGACTTGCGATTGTGTTGATACTTTTGGGTT
ACGCTTTTTTTTTTAATCATTTTTGCAGTTTTTTGTATCTGTAATATATG
GGAACTTCAAAGAGAATTTTTTTTTAAGTTTTGCGTTTACGTTTTCCTAT
GGAGATGCTGTACCCCATACCGATACCGATACCGATATCCAATTGCCGCT
GTACCGAAATCGTTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAA
CCAAGTAAGCTTAAATGTTACACAGACCTATAAGTATTTAGTTTTTTCTC
AAACTGCATCATTATTTTATACACTTGACTTGCGATTGTTTTGATACTTT
TGGGTTTCTCTTTTTTTTAAATCATTTTTGTAGTTATTTGTATCTGTAAT
ANATCTGTAATATATGGGAACTTTTAAGAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGC
GTTTACTTTTTCCTATGGAGATGCTGTACCCCATACCCATACCCATACCG
ATATCCAGTTGCCGCTTTTACCGAAATCGTTCAAATTTCAATAGTAAGCA
CCCAAGTAAATAAGCAACCTAAAGGTTACACAGCTTTTTGTATCTGTAAT
ATATGGGAACTTTTAAGAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGTGTTTACTTTTT
CCTATGGAGATGCTGTACCCCATACCGATACTGATACCGATATTCAATTG
CCGCTGTTACCGATATTCAATTGCCGCTGTTACCGATATTCAATTGCCGC
TGTTACCGAAATCGTTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGC
AACCAAGTAAGCTTAAAGGTTACACAGACAGATAAGTATTTAGTTTTTTC
TCAAACTGCGTGATCATTTTATGCACTTGACTTGCGATTGTGTTGATACT
TTTTGGTTTCTCTTTTTTTTAAATCATTTTTGTAGCTTTTTGTATCTGTA
ATATGTGGGAACTTCTAAGAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGCGTTTACTTT
CTCCTATGAAGATGCTGTACCCATACCGATACCGATACCAATACCGATAT
CCAATTGCCGCTGTTACCGAAATCGTTCAAATTTTAATAGTAAGCACCCA
AGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTAAATAAAGGTTACACAGACAGATAA
GTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCGTGATTATTTTATACACTTGACTTGC
GATTGTGTTGATACTTTTGGGTTTCTCTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNCCAAACTGTATGGGTGTTCAGCTGAATGGAAGATAC
TTTCAATACTTCCCCAATTCATATTATGCTGACACAGTCATCCATCAAGA
TAGAATAAATCAACTTCCAGACGAGGCCGCTCAGCTGCCAGGACTAAAAG
TTGTTGAAACACAGGAGGACATGACAGAAGATGAAAAAGGACCTGCTCCC
AATCAATTTTTCATTCCATTCAACGAGGGAGATGACAGTGTTACTGGGTC
AGGCATCACCTGTCCTGTCGATCCACAGGATGCTGATAAGGAGCTCAAGA
TGATCATACAAAAAATGACTGGATCTGAAGAAATTCTACATCAAGGCGGT
GTTGCATCCGCTGATTGGGATCGAACTCGAGAAGTTCCCATAAAGGAATT
GAAAACGCCTGGTTTTTTTACCATGGTTGCTCCTGACATCTTTGTCAATG
GAAGTTGTGACATCACCTGCAAGAAGTTGGTAACTGTACATCTCGACGAA
TGGATACAACATATTTATTTTGTTGGGGAAGATCGTGTTCCAAAGCATCC
ATTTCTGAAATTTCTTCTCCATAACCTGAAATTACGGCAACAGGCACTTG
ACCATGGAAGCTTTTTGGTCGCACAGCAGTTGAATGATGCACATCTGACA
ATTGACGAACTCAGAACAAATCTGAATGAAAACAATGATCAGAGTGTCCC
ACTCAAGATCATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCCAATGATACCAAATTTATAAAGATT
AAAGAATTCCTTCAAAAGTTATAGGTAAAAGAAAAAAGAGTGCACACTTA
TCGTGAATAGATTGATGAATGCATCTGGAGATCAACTAATCACAAAAGTT
TGAAATTCAACTTTATTAATTAGTTATATCGTTTTCGAGTGCTTTAATCT
ACTAGCAAGTTGAGTATTTCTAATGACTATTATTGCTTATGTGGGACTTT
CCAAAATGTGATTTGTAAATGGTTAAAACCCAATGCTATCTACTTTATAT
CTTAATTTTACTTCTGCAGATCAATCTTGACGATGGATACCGAACTTCAT
TACCTATTTTCTACCTATTTATTTTCATTATCTACATACACCCGTCACGA
GACAACAGGTATTACTTATAGTAAATCGGATTTATTTTTACTTATCAGCG
TTTGAAAAATCTTTTTTGCGATTCTTCCAAGAATAACTTGTAACAGTTCC
TGTAAATTTTCGTCTAAACTTTAAAGTGTATTTTAAGCNACAGGTATTAC
TTATAGTAAATCGGATTTATTTTTACTTATCAGCGTTTGAAAAATCTTTT
TTGCGATTCTTCCAAGAATAACTTGTAACAGTTCCTGTAAATTTTCGTCA
AAACTTTAAAGTGTATTTTAAGCAAAATCTGATTACTTGCTAAAATTAAT
TATGTGCGATATTTACTTTTTACCTTTCCTGTTTTTACTTGCAGGTCCCA
ATCGACTATTCTCTACAAGACCAGAAGGAAAACGAATGATATTTTAAAAT
ATATAGTATATTCTAACAAATGTACAATATTCTTCTTCTTTAAGAAATTT
ATACTTTAATATGACATATCTCTTTCATCTTTTATTGAAAAATCCATTAA
ACACTCGGTTGAAGTCATTTCCAATTATTTTCCCAAGAAAAAATATTTAT
TCTACAGCAAGAATATTCGATAGATTAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_021387XLOC_021387Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00036336-exon-sc0001443-1575043694:59843..60267TCONS_00036336-exon-sc0001443-1575043694:59843..60267Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036336-exon-sc0001443-1575043694:50910..50998TCONS_00036336-exon-sc0001443-1575043694:50910..50998Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036336-exon-sc0001443-1575043694:50340..50573TCONS_00036336-exon-sc0001443-1575043694:50340..50573Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036336-exon-sc0001443-1510915933:59843..60267TCONS_00036336-exon-sc0001443-1510915933:59843..60267Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036336-exon-sc0001443-1510915933:50910..50998TCONS_00036336-exon-sc0001443-1510915933:50910..50998Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036336-exon-sc0001443-1510915933:50340..50573TCONS_00036336-exon-sc0001443-1510915933:50340..50573Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036336-exon-sc0001443-1491911889:59843..60267TCONS_00036336-exon-sc0001443-1491911889:59843..60267Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036336-exon-sc0001443-1491911889:50910..50998TCONS_00036336-exon-sc0001443-1491911889:50910..50998Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036336-exon-sc0001443-1491911889:50340..50573TCONS_00036336-exon-sc0001443-1491911889:50340..50573Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001443supercontigsc0001443:50340..60267 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0.389703	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.26585	0.135355	0	0	0	0.000678004	0	0	0	0	0	0	0.205536	0.572117	0.415683	0.403221
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00036336 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top