|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00036333 ID=TCONS_00036333|Name=TCONS_00036333|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=453bp TGCTGTACcccataccgataccgatatccaATTGCCGCTGTACCGAAATC GTTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAattGATG AATGCATCTGGAGATCAACTAATCACAAAAATCAATCTTGACGATGGATA CCGAACTTCATTACCTATTTTCTACctatttattttcattatctACATAC ACCCGTCACGAGACAACAGGTCCCAATCGACTATTCTCTACAAGACCAGA AGGAAAACGAAtgatattttaaaatatatagTATATTCTAACAAATGTAC AATATTCTTCTTCTTTAAGAAATTTATACTTTAATATGACATATCTCTTT catcttttattgaaaaatccaTTAAACACTCGGTTGAAGTCATTTCCAAT TATTTTcccaagaaaaaatatttattctacAGCAAGAATATTCGATAGAT TAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0001443:50340..58815- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00036333 ID=TCONS_00036333|Name=TCONS_00036333|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8476bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001443:50340..58815- (Clytia hemisphaerica) TGCTGTACCCCATACCGATACCGATATCCAATTGCCGCTGTACCGAAATC
GTTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCT
TTTAAAGGTTACACAGACACGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCA
TCATTATTTTATACACTTGACTTGCGATTGTGTTGATACTTTTGGGTTAC
GCTTTTTTTTTTAATCATTTTTGCAGTTTTTTGTATCTGTAATATATGGG
AACTTCAAAGAGAATTTTTTTTTAAGTTTTGCGTTTACGTTTTCCTATGG
AGATGCTGTACCCCATACCGATACCGATACCGATATCCAATTGCCGCTGT
ACCGAAATCGTTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACC
AAGTAAGCTTAAATGTTACACAGACCTATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAA
ACTGCATCATTATTTTATACACTTGACTTGCGATTGTTTTGATACTTTTG
GGTTTCTCTTTTTTTTAAATCATTTTTGTAGTTATTTGTATCTGTAATAN
ATCTGTAATATATGGGAACTTTTAAGAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGCGT
TTACTTTTTCCTATGGAGATGCTGTACCCCATACCCATACCCATACCGAT
ATCCAGTTGCCGCTTTTACCGAAATCGTTCAAATTTCAATAGTAAGCACC
CAAGTAAATAAGCAACCTAAAGGTTACACAGCTTTTTGTATCTGTAATAT
ATGGGAACTTTTAAGAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGTGTTTACTTTTTCC
TATGGAGATGCTGTACCCCATACCGATACTGATACCGATATTCAATTGCC
GCTGTTACCGATATTCAATTGCCGCTGTTACCGATATTCAATTGCCGCTG
TTACCGAAATCGTTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAA
CCAAGTAAGCTTAAAGGTTACACAGACAGATAAGTATTTAGTTTTTTCTC
AAACTGCGTGATCATTTTATGCACTTGACTTGCGATTGTGTTGATACTTT
TTGGTTTCTCTTTTTTTTAAATCATTTTTGTAGCTTTTTGTATCTGTAAT
ATGTGGGAACTTCTAAGAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGCGTTTACTTTCT
CCTATGAAGATGCTGTACCCATACCGATACCGATACCAATACCGATATCC
AATTGCCGCTGTTACCGAAATCGTTCAAATTTTAATAGTAAGCACCCAAG
TAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTAAATAAAGGTTACACAGACAGATAAGT
ATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCGTGATTATTTTATACACTTGACTTGCGA
TTGTGTTGATACTTTTGGGTTTCTCTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNCCAAACTGTATGGGTGTTCAGCTGAATGGAAGATACTT
TCAATACTTCCCCAATTCATATTATGCTGACACAGTCATCCATCAAGATA
GAATAAATCAACTTCCAGACGAGGCCGCTCAGCTGCCAGGACTAAAAGTT
GTTGAAACACAGGAGGACATGACAGAAGATGAAAAAGGACCTGCTCCCAA
TCAATTTTTCATTCCATTCAACGAGGGAGATGACAGTGTTACTGGGTCAG
GCATCACCTGTCCTGTCGATCCACAGGATGCTGATAAGGAGCTCAAGATG
ATCATACAAAAAATGACTGGATCTGAAGAAATTCTACATCAAGGCGGTGT
TGCATCCGCTGATTGGGATCGAACTCGAGAAGTTCCCATAAAGGAATTGA
AAACGCCTGGTTTTTTTACCATGGTTGCTCCTGACATCTTTGTCAATGGA
AGTTGTGACATCACCTGCAAGAAGTTGGTAACTGTACATCTCGACGAATG
GATACAACATATTTATTTTGTTGGGGAAGATCGTGTTCCAAAGCATCCAT
TTCTGAAATTTCTTCTCCATAACCTGAAATTACGGCAACAGGCACTTGAC
CATGGAAGCTTTTTGGTCGCACAGCAGTTGAATGATGCACATCTGACAAT
TGACGAACTCAGAACAAATCTGAATGAAAACAATGATCAGAGTGTCCCAC
TCAAGATCATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCCAATGATACCAAATTTATAAAGATTAA
AGAATTCCTTCAAAAGTTATAGGTAAAAGAAAAAAGAGTGCACACTTATC
GTGAATAGATTGATGAATGCATCTGGAGATCAACTAATCACAAAAGTTTG
AAATTCAACTTTATTAATTAGTTATATCGTTTTCGAGTGCTTTAATCTAC
TAGCAAGTTGAGTATTTCTAATGACTATTATTGCTTATGTGGGACTTTCC
AAAATGTGATTTGTAAATGGTTAAAACCCAATGCTATCTACTTTATATCT
TAATTTTACTTCTGCAGATCAATCTTGACGATGGATACCGAACTTCATTA
CCTATTTTCTACCTATTTATTTTCATTATCTACATACACCCGTCACGAGA
CAACAGGTATTACTTATAGTAAATCGGATTTATTTTTACTTATCAGCGTT
TGAAAAATCTTTTTTGCGATTCTTCCAAGAATAACTTGTAACAGTTCCTG
TAAATTTTCGTCTAAACTTTAAAGTGTATTTTAAGCNACAGGTATTACTT
ATAGTAAATCGGATTTATTTTTACTTATCAGCGTTTGAAAAATCTTTTTT
GCGATTCTTCCAAGAATAACTTGTAACAGTTCCTGTAAATTTTCGTCAAA
ACTTTAAAGTGTATTTTAAGCAAAATCTGATTACTTGCTAAAATTAATTA
TGTGCGATATTTACTTTTTACCTTTCCTGTTTTTACTTGCAGGTCCCAAT
CGACTATTCTCTACAAGACCAGAAGGAAAACGAATGATATTTTAAAATAT
ATAGTATATTCTAACAAATGTACAATATTCTTCTTCTTTAAGAAATTTAT
ACTTTAATATGACATATCTCTTTCATCTTTTATTGAAAAATCCATTAAAC
ACTCGGTTGAAGTCATTTCCAATTATTTTCCCAAGAAAAAATATTTATTC
TACAGCAAGAATATTCGATAGATTAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| TCONS_00036333-exon-sc0001443-1575043694:58723..58815 | TCONS_00036333-exon-sc0001443-1575043694:58723..58815 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036333-exon-sc0001443-1575043694:51171..51207 | TCONS_00036333-exon-sc0001443-1575043694:51171..51207 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036333-exon-sc0001443-1575043694:50910..50998 | TCONS_00036333-exon-sc0001443-1575043694:50910..50998 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036333-exon-sc0001443-1575043694:50340..50573 | TCONS_00036333-exon-sc0001443-1575043694:50340..50573 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036333-exon-sc0001443-1510915933:58723..58815 | TCONS_00036333-exon-sc0001443-1510915933:58723..58815 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036333-exon-sc0001443-1510915933:51171..51207 | TCONS_00036333-exon-sc0001443-1510915933:51171..51207 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036333-exon-sc0001443-1510915933:50910..50998 | TCONS_00036333-exon-sc0001443-1510915933:50910..50998 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036333-exon-sc0001443-1510915933:50340..50573 | TCONS_00036333-exon-sc0001443-1510915933:50340..50573 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036333-exon-sc0001443-1491911889:58723..58815 | TCONS_00036333-exon-sc0001443-1491911889:58723..58815 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036333-exon-sc0001443-1491911889:51171..51207 | TCONS_00036333-exon-sc0001443-1491911889:51171..51207 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036333-exon-sc0001443-1491911889:50910..50998 | TCONS_00036333-exon-sc0001443-1491911889:50910..50998 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036333-exon-sc0001443-1491911889:50340..50573 | TCONS_00036333-exon-sc0001443-1491911889:50340..50573 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0001443 | supercontig | sc0001443:50340..58815 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|