TCONS_00036331 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00036331
Unique NameTCONS_00036331
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length388

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00036331 ID=TCONS_00036331|Name=TCONS_00036331|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=388bp
TGTTACCGAAATCGTTCAAATTTCAATAattGATGAATGCATCTGGAGAT
CAACTAATCACAAAAATCAATCTTGACGATGGATACCGAACTTCATTACC
TATTTTCTACctatttattttcattatctACATACACCCGTCACGAGACA
ACAGGTCCCAATCGACTATTCTCTACAAGACCAGAAGGAAAACGAAtgat
attttaaaatatatagTATATTCTAACAAATGTACAATATTCTTCTTCTT
TAAGAAATTTATACTTTAATATGACATATCTCTTTcatcttttattgaaa
aatccaTTAAACACTCGGTTGAAGTCATTTCCAATTATTTTcccaagaaa
aaatatttattctacAGCAAGAATATTCGATAGATTAT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0001443:50340..57917-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00036331 ID=TCONS_00036331|Name=TCONS_00036331|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7578bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001443:50340..57917- (Clytia hemisphaerica)
TGTTACCGAAATCGTTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGC
AACCAAGTAAGCTTAAAGGTTACACAGACAGATAAGTATTTAGTTTTTTC
TCAAACTGCGTGATCATTTTATGCACTTGACTTGCGATTGTGTTGATACT
TTTTGGTTTCTCTTTTTTTTAAATCATTTTTGTAGCTTTTTGTATCTGTA
ATATGTGGGAACTTCTAAGAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGCGTTTACTTT
CTCCTATGAAGATGCTGTACCCATACCGATACCGATACCAATACCGATAT
CCAATTGCCGCTGTTACCGAAATCGTTCAAATTTTAATAGTAAGCACCCA
AGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTAAATAAAGGTTACACAGACAGATAA
GTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCGTGATTATTTTATACACTTGACTTGC
GATTGTGTTGATACTTTTGGGTTTCTCTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNCCAAACTGTATGGGTGTTCAGCTGAATGGAAGATAC
TTTCAATACTTCCCCAATTCATATTATGCTGACACAGTCATCCATCAAGA
TAGAATAAATCAACTTCCAGACGAGGCCGCTCAGCTGCCAGGACTAAAAG
TTGTTGAAACACAGGAGGACATGACAGAAGATGAAAAAGGACCTGCTCCC
AATCAATTTTTCATTCCATTCAACGAGGGAGATGACAGTGTTACTGGGTC
AGGCATCACCTGTCCTGTCGATCCACAGGATGCTGATAAGGAGCTCAAGA
TGATCATACAAAAAATGACTGGATCTGAAGAAATTCTACATCAAGGCGGT
GTTGCATCCGCTGATTGGGATCGAACTCGAGAAGTTCCCATAAAGGAATT
GAAAACGCCTGGTTTTTTTACCATGGTTGCTCCTGACATCTTTGTCAATG
GAAGTTGTGACATCACCTGCAAGAAGTTGGTAACTGTACATCTCGACGAA
TGGATACAACATATTTATTTTGTTGGGGAAGATCGTGTTCCAAAGCATCC
ATTTCTGAAATTTCTTCTCCATAACCTGAAATTACGGCAACAGGCACTTG
ACCATGGAAGCTTTTTGGTCGCACAGCAGTTGAATGATGCACATCTGACA
ATTGACGAACTCAGAACAAATCTGAATGAAAACAATGATCAGAGTGTCCC
ACTCAAGATCATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCCAATGATACCAAATTTATAAAGATT
AAAGAATTCCTTCAAAAGTTATAGGTAAAAGAAAAAAGAGTGCACACTTA
TCGTGAATAGATTGATGAATGCATCTGGAGATCAACTAATCACAAAAGTT
TGAAATTCAACTTTATTAATTAGTTATATCGTTTTCGAGTGCTTTAATCT
ACTAGCAAGTTGAGTATTTCTAATGACTATTATTGCTTATGTGGGACTTT
CCAAAATGTGATTTGTAAATGGTTAAAACCCAATGCTATCTACTTTATAT
CTTAATTTTACTTCTGCAGATCAATCTTGACGATGGATACCGAACTTCAT
TACCTATTTTCTACCTATTTATTTTCATTATCTACATACACCCGTCACGA
GACAACAGGTATTACTTATAGTAAATCGGATTTATTTTTACTTATCAGCG
TTTGAAAAATCTTTTTTGCGATTCTTCCAAGAATAACTTGTAACAGTTCC
TGTAAATTTTCGTCTAAACTTTAAAGTGTATTTTAAGCNACAGGTATTAC
TTATAGTAAATCGGATTTATTTTTACTTATCAGCGTTTGAAAAATCTTTT
TTGCGATTCTTCCAAGAATAACTTGTAACAGTTCCTGTAAATTTTCGTCA
AAACTTTAAAGTGTATTTTAAGCAAAATCTGATTACTTGCTAAAATTAAT
TATGTGCGATATTTACTTTTTACCTTTCCTGTTTTTACTTGCAGGTCCCA
ATCGACTATTCTCTACAAGACCAGAAGGAAAACGAATGATATTTTAAAAT
ATATAGTATATTCTAACAAATGTACAATATTCTTCTTCTTTAAGAAATTT
ATACTTTAATATGACATATCTCTTTCATCTTTTATTGAAAAATCCATTAA
ACACTCGGTTGAAGTCATTTCCAATTATTTTCCCAAGAAAAAATATTTAT
TCTACAGCAAGAATATTCGATAGATTAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_021387XLOC_021387Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00036331-exon-sc0001443-1575043694:57890..57917TCONS_00036331-exon-sc0001443-1575043694:57890..57917Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036331-exon-sc0001443-1575043694:51171..51207TCONS_00036331-exon-sc0001443-1575043694:51171..51207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036331-exon-sc0001443-1575043694:50910..50998TCONS_00036331-exon-sc0001443-1575043694:50910..50998Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036331-exon-sc0001443-1575043694:50340..50573TCONS_00036331-exon-sc0001443-1575043694:50340..50573Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036331-exon-sc0001443-1510915933:57890..57917TCONS_00036331-exon-sc0001443-1510915933:57890..57917Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036331-exon-sc0001443-1510915933:51171..51207TCONS_00036331-exon-sc0001443-1510915933:51171..51207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036331-exon-sc0001443-1510915933:50910..50998TCONS_00036331-exon-sc0001443-1510915933:50910..50998Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036331-exon-sc0001443-1510915933:50340..50573TCONS_00036331-exon-sc0001443-1510915933:50340..50573Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036331-exon-sc0001443-1491911889:57890..57917TCONS_00036331-exon-sc0001443-1491911889:57890..57917Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036331-exon-sc0001443-1491911889:51171..51207TCONS_00036331-exon-sc0001443-1491911889:51171..51207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036331-exon-sc0001443-1491911889:50910..50998TCONS_00036331-exon-sc0001443-1491911889:50910..50998Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036331-exon-sc0001443-1491911889:50340..50573TCONS_00036331-exon-sc0001443-1491911889:50340..50573Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001443supercontigsc0001443:50340..57917 -
Expression
No biomaterial libraries express this feature.
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00036331 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top