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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00035852 ID=TCONS_00035852|Name=TCONS_00035852|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2162bp AAACCGTTCCAACGGTTAATCAGTCCGGTTTGCACATCAGTTTTGTACTC GTAGCTTTTACAGGTTACTTTATCTGTTGGCATTTATTATGGTAATTTAC AAGCTTTATGTGTAGTGTGGTGGTACTACCCTAGTATGGAATCTTCAAAA AGGTCAAGATCACCAGACAAAATGTTGATGTTTTCAATTCTCATTCTGCA ATCAATCTTCTTCATCTCGGCTTCACCGACGCCTGAAAATACCGAGAACG AACGAAAAACGACAAACGACAAGGGTAGAGAAACGAAAAGACGCGACCAA CTGAGACGTATTATTGAAAACACTCTTGGCTTGGATGATTCAGAAACTTC TTCAAATGCGTTGAAGAAATTTAAAGAATCCATTAATCCAGACCTTGTGA AAAATTTCTTGAGTCCATCAAAGACAGAAGAAgatggaaaaaatggaaaa gaacTCATCTTTTTGTGGAAAAATGATCACCTACTCGAACaatgTCAAAA CGGCCATTTCATCAAAGACCTTGAATTAAGGTTCCTTTTCaacttggaaa tttttcaaaagaacacCTTAGCGAGCGCAAGGATACATTTCTTCAAGAAA AACGAGACCCCGGCTGAGCGTATTATCGTCAAAGAGATACCCAATGTGGG TACACATGAACATGTAATTAACAGCGCCCTAATTAACCATGACGGGTGGG CAGAGCTCGATATAACAAAGCAAGTTAATTACTGGACAGCAGATTACGGG TTAAATGAATTTCGGACACTTCGACTAGGCTGTGAGGAAAAATGTTCGGA GCTTTATGTTGAGCATTGCGACCCGAAAGTCATGCCTTTCTTATCCATTA GAATGAAGCCGAACGACGAGAAAGAGTGAAGAGAAGAATGGCTAAGGAAA TAAAGAGAGATGAGAAATTTGACGATTGAAAGAAGTACCGACACCAGATC TCAAGACCCTTAGACCGTCCAAATCCATTTATGAAAACCAACTATCGAAG AATcagactaatatttctaaaatcGAGGGTCCATTTTATTGCCGAACAAT GCTGGATTATTCGGGCGACATATTTTAACTTCAGTAGatttaatttgaaa agaaatacatttataaaatcatttttggtatctgataaaataattatgtt TGAAAATGACAATCGTAagagaaaatatatttgatgCTTAAACCGATACC CGAAAATTCGACTGTTTACAATATTAAGTTAAATAAGAAGTTAAATAGGT TCTATAGAAGATAACAGAACTCGTAACAGAACTCTTTGAGATTTGGTCAG GTTGACTGTTTGAACTGTTCATTTTAGGGTGCTGATGATATTGAAGCCAA TAATAGTCAACTCAATTAGGGTgacaaattttaaggtttttcggATTCAT TTTATCTTCTACCATGGAAACGGTGCATAAGTAACTATGAAATGCAGCTA GGACTACGACTGTCTTTTACCATTATATCTCAGTAATGTTCCTTTGCTTT GGATCGTCCTTTATAATAGGAgacaatattttttgaaatttttcccaATC TAATAGAGATAATCAAAATCAACAATCCCTTTATACAGTGTATGTATCTT TGAGCCATCTTGTGTTTTCTCTAGCTCGCTCGTATTTTTCACCAAACCAT TTTGTTGTAAAATTGCTTGCCTTCTTCTCGTTTTGTTTTCATTCTGATCC CTCCAATGAATGTACAGAGTTTCAAGTGCTAACGCGACCAGTGCAATGAG AAGAGAGATCAACACCAAGATGACCATTCCACCAGCATACTCGTATTCAA ATTGAAAAGCTCTTAGCTCAGCAGCCGAGCACTTATTAATCCATTTCTCC ATTAATTGATCAACCACTTTTTTATCCTTAAGGTCACGGATGGCGTTCGA TAAAATCCGCGTCAGTTGAGAATTCTGACGTGTTCCGAAGGCGTTGGAGA CGACAAATGTTTCTTTTCTGACGATAATGTTTTCACACAAGTCAGCTTTT TTACCTTGGACGGCTGTTAGGTGCCAGTACTCTTCTACGTATGCGtctaa aagcctaaaaagtaGAATGACCGACTTATcatggtaaaatttcaaacaaa gcaAGGTTTCGTTTTAGGTTGCATGCGTTTGTTATTGAGCTACATTTTTA TTTAAACTCTAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0001377:2863..10666- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00035852 ID=TCONS_00035852|Name=TCONS_00035852|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7804bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001377:2863..10666- (Clytia hemisphaerica) AAACCGTTCCAACGGTTAATCAGTCCGGTTTGCACATCAGTTTTGTACTC
GTAGGTATTCTTGTGTTATGGCTCCATTTACATTTCAGTTTGACATGATC
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GTGCTGATATAAGCAAAAAATGGTTACCATTTCCACTCTCTGACCAATTT
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AGTGAAGAATTAAGTGGATGGAAAGTTTGGCTCAAGATTGTCAAAAGAGG
TTCAGTTTAATTTTTGTTAAGTTTTTAGTGGCTTTAGGTCCTTCGAAAAG
TTCTTATCATTGATTGATTGATTGGTTTATTGATTGATTGATTGATTGAT
TGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTG
ATTGATTGATTGATTGATTGATTGTTTTCATGCTTGCTAATTAAAGACTA
TACTTGTAATTTGTTCATGTTGTCCCCTCTCCTCTCCTTTTGTTGCTGGT
CAGGACCGGTTCCCGACCTCAAGACTTTCTTGGTGAGAGAATATTTTGAC
ATGCGGAATATTTTGTAACAACCTGAAGCAATGTCTTAGAAACAATGATG
TGTTTTTTCGAGGTTTGGTGCGACTTTCGAATGAAATGACAAAAAAGGGA
ATTCCGATTGACCAATAACCTGCTTGATGTTGATGTAGGAGAAACACAAT
AAGTCCTTACAATAGATGGTCGGTCTTGGGTTTCTCCTTATAAGGAAATA
CATGTAGGTGGAACTTGTGATATAAATGCATTCGAGATTATAAATAGGCT
TTAAAAAAAAAGCTTTTTGGAATGTTTGGTTGATGTTTGGGTGTTTCAAA
GTCCAACAGTTGAATCTAGAAAAGTCTTACTGGTTACTTACGCTCTTGAA
ATAATCAAAGTGATGAATAGTCAAGTAAAAGAATTTCTTTCTAAGGTAAC
CTTAATATTCATAGATCACAGATGAATTGTAAGCTTAACATCAGAATAGT
GCTTTCTATCTTCGATATTTTGAAAAGCGACGACATAAAGGCATAAACTG
TGATACTTACTGTGTCTATTAAGTCCATCAGACATGACTTTTTAATTTAC
TTTGCTCAACCATAAAATCCATTTCTCGAGCAAGTAATAAACGAATCCCT
TCTCCCAGATTTTATTACCTCTTTCTTTCTGGTATGGTGGAACAGTCCAA
TACAAAGAAAAAGGGTGTGTCCTAAAGTTGTATAACATTTCCTTCCATTA
AGGAGAAAAAAGGAGGGAAAGAAAAATATTGTAGTGACTTTTAGGGTTCA
GTGCGATTTTGCAATACCTTTTGATGTTTAAACAATCTATTTCGCAATTA
CTATGTTTCCAATAAATATTGCTTTAACCTTTACAGTGAATATCTTTGCA
GTGTGATCCAAATTTGTGCCTCGTATAAAAGTTGGACAAATTCCAAATCT
TGATTGTCTTTTTCAGTATAATTTAACAGACTCCTCTGAGTGCAATCAGT
GAGTACATTGAGAGGTCTTGATGAAGTTTTTTGTACCATTTCATGCATTT
TGTAGTTTTAAGGCTTGAATTTTTCTTGATTTTCTCTTATGTACACTCCT
TCTCACAGATCCTGTTGGAACTTTTCAGCCAACGGGGGGTAAAAATAAAA
TAACGAACTGAAACTCAATGAAGATTGATGTTCGCATGTTTTATTCTATG
GCTGGGGATTTGGATTCCATTGCTTTCAATACACTCTTCTCGAGATGCAT
AAGTTTATTGTTGTCCTCGTTTTCAAACAGATTTCATTGCTATTTTGTAT
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TTACAGCCCTGTTTCCAGTTAGTTAGTACTTCTGTTGTTTAAAACTACTG
TCTAAGCAAATGGTGGGAATATGTTAAATGATAACCTTAAAGCTTATAAA
GCGAGAGGCATCTGATGAGAAGCAAATTCTTCTGTTTTCCTGCTTTAATA
AAGTCCATTTTTGGGCCCCTTTTGAAGGTAGTAATATTTGATCTTTATTA
TGGGTCAATCGTTAAAGATCCGAAATCTGACTGACGTCAGGTCATAAATC
AGTCAGTAGCGATACAGAATAATGGAAAAAAGGGATGTATCATAAATTCT
ACGACATGACAAGCTGTCAACTAAACGGACAGGGGGTTGAATCACCGGAA
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CCCACTCGCATTGTTTGGCGTGTGTCATTTTTGTCATTTTGATGTAAAAT
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GTTTTGTAGGGTTTAAAATTAGTCAAAATCATCAGAAACGCCTGTATGTA
CTGTGATATTTGAATGCTTGGTTCTTCGTTTTTCTAAGCTTCATTTATGA
TGGAATTTGGGGTTTGGGCTTAAGCTTTTACGCTAAAACGAAAACAGAAT
AAATCTCGTACCCAGAGCTACTTGTACCACTTGTACCGTTTACTGATGGA
CGTGATACAACCTTTGGTGAGCGCTATCAGAATTATCAAAAAACGTGCTA
AAGGACTGGATAGGAGTTAGACTAAATCTAAGCCTACACACGTTAGACAG
TAAAATGTTATATTGGGTATTAGTTTTGTAATTTTCTTGAATTTGTTAAT
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TCTTCAAATGCGTTGAAGAAATTTAAAGAATCCATTAATCCAGACCTTGT
GAAAAATTTCTTGAGTCCATCAAAGACAGAAGAAGATGGAAAAAATGGAA
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TTTTGTTTTAACCCAACCAAGCACAATCACGTTTAGATAAACTACTCTGA
AACATACACCACCACCAACTCTGTTAGGTGACAAAGTGTTAAAATAAAGA
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TCATCAAAGACCTTGAATTAAGGTTCCTTTTCAACTTGGAAATTTTTCAA
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CCCGGCTGAGCGTATTATCGTCAAAGAGATACCCAATGTGGGTACACATG
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GATATAACAAAGCAAGTTAATTACTGGACAGCAGATTACGGGTTAAATGA
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TTGAGCATTGCGACCCGAAAGTCATGCCTTTCTTATCCATTAGAATGAAG
CCGAACGACGAGAAAGAGTGAAGAGAAGAATGGCTAAGGAAATAAAGAGA
GATGAGAAATTTGACGATTGAAAGAAGTACCGACACCAGATCTCAAGACC
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AACTCAATTAGGGTGACAAATTTTAAGGTTTTTCGGATTCATTTTATCTT
CTACCATGGAAACGGTGCATAAGTAACTATGAAATGCAGCTAGGACTACG
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CTTTATAATAGGAGACAATATTTTTTGAAATTTTTCCCAATCTAATAGAG
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CTTGTGTTTTCTCTAGCTCGCTCGTATTTTTCACCAAACCATTTTGTTGT
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AATGTACAGAGTTTCAAGTGCTAACGCGACCAGTGCAATGAGAAGAGAGA
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GCTCTTAGCTCAGCAGCCGAGCACTTATTAATCCATTTCTCCATTAATTG
ATCAACCACTTTTTTATCCTTAAGGTCACGGATGGCGTTCGATAAAATCC
GCGTCAGTTGAGAATTCTGACGTGTTCCGAAGGCGTTGGAGACGACAAAT
GTTTCTTTTCTGACGATAATGTTTTCACACAAGTCAGCTTTTTTACCTTG
GACGGCTGTTAGGTGCCAGTACTCTTCTACGTATGCGTCTAAAAGCCTAA
AAAGTAGAATGACCGACTTATCATGGTAAAATTTCAAACAAAGCAAGGTT
TCGTTTTAGGTTGCATGCGTTTGTTATTGAGCTACATTTTTATTTAAACT
CTAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| TCONS_00035852-exon-sc0001377-1575043694:10613..10666 | TCONS_00035852-exon-sc0001377-1575043694:10613..10666 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00035852-exon-sc0001377-1575043694:10138..10202 | TCONS_00035852-exon-sc0001377-1575043694:10138..10202 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00035852-exon-sc0001377-1575043694:9561..9599 | TCONS_00035852-exon-sc0001377-1575043694:9561..9599 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00035852-exon-sc0001377-1575043694:4825..5156 | TCONS_00035852-exon-sc0001377-1575043694:4825..5156 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00035852-exon-sc0001377-1575043694:2863..4534 | TCONS_00035852-exon-sc0001377-1575043694:2863..4534 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00035852-exon-sc0001377-1510915933:10613..10666 | TCONS_00035852-exon-sc0001377-1510915933:10613..10666 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00035852-exon-sc0001377-1510915933:10138..10202 | TCONS_00035852-exon-sc0001377-1510915933:10138..10202 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0001377 | supercontig | sc0001377:2863..10666 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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