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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00035671 ID=TCONS_00035671|Name=TCONS_00035671|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2263bp
ATAACAACGATTCATTGATGCTTGAAAAATCTGATTATCTTTAAAAGCAC
TTTTTTAATAGCTATGTCATATCGTCACAGCGACTAGGGcaattcaaatt
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TGGGTCGCTACTGcagtgtttttttgttttttttgcatgtAATAAAAAGA
TTGATGGAGATTTTGACAATGGTGGCGTAGAAAGGTGAACAACCGAtcaa
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gttgttgttgcattCGTAACAAGAAGAAAAAGGAGAAGGAAAAAGACACT
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CGAATCTGGTGCTGAATCCAGTTTATCCGATTACGATCGGGCATCTGAAT
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TAAGGCCTGTCGTAGATACGGTTTTCTACTaatcttttaaaataaatgAA
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tttttttaccttttgtaTTATATTTAGAATAATCTAataacttttatttt
aaatAGCTGAAGAATTAATCGGAGCAGAataacttagaaaaaaattacga
attaaaaatcaaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0001348:38490..42994- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00035671 ID=TCONS_00035671|Name=TCONS_00035671|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4505bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001348:38490..42994- (Clytia hemisphaerica)
ATAACAACGATTCATTGATGCTTGAAAAATCTGATTATCTTTAAAAGCAC
TTTTTTAATAGCTATGTCATATCGTCACAGCGACTAGGGCAATTCAAATT
TCCTTTCTAACTACGAGAGGAGAATTGATAAAATTGAGACACAAGCGTAG
TGGGTCGCTACTGCAGTGTTTTTTTGTTTTTTTTGCATGTAATAAAAAGA
TTGATGGAGATTTTGACAATGGTGGCGTAGAAAGGTGAACAACCGATCAA
AAGTGAAGAAAAATTTGGAGATTTTTCTGAAACATGTGTAGGTTTTTTTA
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TTGTTTTTGGAGCGCGAGCTAAAAAAAGTAGGCGGCAAACGCTATTTCAC
ATCTCTCAAACCGGTGAAATTGCATATTTTAGTCACGTGACTTTGGTAGG
AAATCCTTCCAAACCTAGGCTTCACTTTTCGATAAAAGTTGCTTATCTAG
CCCTTCGGGCTTTACAGATCTGTGTTCTGGGTGCAGTTTAGCCTGGATAT
CCAAGCTCAAAATTAAAAAAAAAAAAATTTACCTCTCAACAAACAAAGTT
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CCCAGCATACCAATTAGAAAAATCGGCCTGAATATCTGAAACTTTCATTA
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GTGTATACATATTCTTGACAAAAATCATCCTTAGATATCCATAGCGGTAT
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CGGCCTTTATGCGTTTACCAACTACCAGCAAGTGACGAATATTTTTCCCC
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TGTATACCTTAGCCAAGGTTATAAGCTAATGTACGTTTTTTAATAAGAAC
AAACTATATAAGAAAATAAGGCTTCGGTGGCCAAAAAGTTAAGAGCATCC
CAAGGCTTCAAAAATTTTGGATGTTCTTATAAAAAATGTGTAGTATAATT
TTGACTTTAAAAAGATGTATACTATTATTAGCTTGTTGCAAACAAACTCG
GTAAAAACATGCTCGCCTTTGCTGAAGACTTTTCGTACTAGCAAAAAAAA
CAAAAATACACGTTTTTCTATAAGAACAAACTATATAAGAACATAAGGCT
TCGATGACCGAAATTAAGAACTCTAAAACAGCCGGTTTCTTAGAAAAATG
GGCAAAAATTTTCAAAAAATGGTGAAAATATAAAGAACATGTCAAGAACA
TTTTTAGGCTTAAAACTCAAAAAGTTAAGAACATCCGAAGGCTTCAAAAT
TTTTCGATGTTCTTATAAAAAACGTGTATTTTGTTGTCAAAGGCAAAAAT
ATTAACATCTACGTTATTCCCGAGAGCAATTAAAAATGGCAACAAAATTA
AACAGTCATGGATAGAATTTATTTTCCACTTTTTAATTGGACATTAATTA
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ATTATTTTGTTTTTGTTTGTATGCTGAAATTAATTAGGCGCATCTCAGAA
GTAACAAGGGGAAGGTCTTCCATTTAATTACTTTATACAGTTAAGCTTCA
ATACACGCTTTTTTATAAGAATATACTTTATAAGAATATTCATGATGGAA
TTGGCCACTTAAGAATGTGGTAATTTGGCAGCCGAATCTAAGAATGCCAT
TTCCCACAATTAAATTGCACAATTAAATTGCAAATTATTCCCCAGCAACG
CAAAAAGGTTCCACGAAAATGCTAAGTCTTTGGTTGAGGTATGTTTTACA
TGCTAGATGTTGGCTTAGGTTGGATGCAAACTTATACAGTAAGAATATTT
CAGAATGATTTTTCCCAAAAAGTTTTAAAGAACATTCATGATTCGGAAAA
ACACCATAAAAAAACGTGAGAATAATAACATTATCACAGCCAAGCCGAAA
GAAAAATGGTTTTCATAAAAATGTTTATACAAGCAAACAAATAGAAAATC
TTTATCGATAAATTTGTTGTCAGTTTCAGGGTGGATATGGGCGTCAATCA
GTGGCGGAGCTGGTTTACTAGTCCTCATCACGTGTATATGTTGTTGTTGT
TGCATTCGTAACAAGAAGAAAAAGGAGAAGGAAAAAGACACTACTTATAA
TCGAGTACCTGACGAAGAAATCGGTAGTGAACTCGAAGAATTAACCGATT
CATTCGATTCCCGCCACAGTCAAAAACAGAAAAAACGGCACCCCCGGTCT
CAGAAAAGAGACAGTAGTGGTAAGGGTGATCCATTAACATATTACGTATC
TGCACCTCATCATCGTGCTGTTGACCGTGTTGCACAGTATCACGAATCTG
GTGCTGAATCCAGTTTATCCGATTACGATCGGGCATCTGAATCGGTTTCC
ATTTCAGCTTATGGTGACGCAGTTTCTACACATAGTAGTGATAGTTATGG
GACAAATAGCTTTGCAAAAGCTCCTGGTAACTTAGCTATCCAAGCATCGT
TGATATACTCGAGAGATTCTAAATATGTAGCTGGGAAGATAGTTACTATT
GATGGTCTTCGTTTTGAGAAAAGCACAATGAAACCAATGCTTGAAATTAA
ATGTCACGTGGTTATTTTACCGTTAAAAAAATATGCTTTGAAAACAAACT
GGTATCATATTCAGAAGAACCGAATTAAAATGGACGAATATTTTAAATTC
AAATTTAAGCAGTTACCTCAAGAAACAAAAACGATGTTACGGTTTAGACT
TTACGGCCGACGTGCAACTGTCGGTAGATCACATTGTCTTGGAGAATGTT
ACGTCGGTCTACGTGAAATTATTACATCACGGGGTGGACTCACGTTATGG
CGGTCTATAACTAAGGGTGCCCCTGAGATAGTTGATTTAGAGTAATGGAA
ATCAAAGTGAAATATACTGAAATAAGGTGCCCTATTGGGTTCAATTTACG
ATTAAATACGCATTTAATTAGAGAATTTCCTCATACAATTTAACCATCAT
AAGAATATGGAAGACACTTTTTAGTTGTGTTTTAAATTCCTTTTTATTCC
TTAGGAAATTAGGATGTAATCCAATATTTGCTGATGCTTTATAGAAAATG
AAAGTGCTAACATTTTAAGATGGGCGTAGAATTTATCAAAAAAATGGGAA
TAAACATGCATTTCTTTTTGTTTTATGATTTTTTTTTGATTTTTTGTTTT
GTTTTTGTAATCCTCTCCCTGTCCTGACCATTTCTATAATGATATGTGAA
ATATATTTCATGTCAGCGAAATGCTAGAACGCACAATAACTTTAAGGCCT
GTCGTAGATACGGTTTTCTACTAATCTTTTAAAATAAATGAATATAATGA
ATGGATGGTTTATCAGATGGTTTTTTGTATACCCCTGTCGAGGAAATCTA
TAACTTTTGCTACTTTAACCCTCTGGGATTCCAGGGTTCATTATGTTTAA
TTTTACTGGGGCTAAAAAATGTCACCCACAGAAATCCAGCAAGAAATATT
CAAGTACCTTGAGGGAACTTATTTTGACGGGGACAAATTTTGTTAAATTC
GCCGAATTCACCAAAATTAGTTCCCGCCAAAATTAGTTCCCTGAAGGTAT
CTTGTTCCATTTTCTATTCTATTCTTCCGACTAACTTACTGTAGTTTTCA
CAAATTTGTTAAAAGATGTCTCGATAGGTACCTTGTTACGTAAAAGAAAA
TACAAGTGATTTTTCTTCTTGTTGTCTTAGGACCTTCACCCTTAAAGGGA
GGCCCCATACCCTTTCACAAATGTGTTGTAATGGAGACTAACATGGGAAG
GTTTGGTTTTTTTCTGTTTATCTTAAGATAAACCTGTATTGAGTATTGGC
GAGACTTTTTTCATAATTTTGTCAAGTTACTTTCAATAAATTTTTTTTTA
CCTTTTGTATTATATTTAGAATAATCTAATAACTTTTATTTTAAATAGCT
GAAGAATTAATCGGAGCAGAATAACTTAGAAAAAAATTACGAATTAAAAA
TCAAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00035671-exon-sc0001348-1575043694:42708..42994 | TCONS_00035671-exon-sc0001348-1575043694:42708..42994 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00035671-exon-sc0001348-1575043694:38490..40465 | TCONS_00035671-exon-sc0001348-1575043694:38490..40465 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00035671-exon-sc0001348-1510915933:42708..42994 | TCONS_00035671-exon-sc0001348-1510915933:42708..42994 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00035671-exon-sc0001348-1510915933:38490..40465 | TCONS_00035671-exon-sc0001348-1510915933:38490..40465 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00035671-exon-sc0001348-1491911889:42708..42994 | TCONS_00035671-exon-sc0001348-1491911889:42708..42994 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00035671-exon-sc0001348-1491911889:38490..40465 | TCONS_00035671-exon-sc0001348-1491911889:38490..40465 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0001348 | supercontig | sc0001348:38490..42994 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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