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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00034853 ID=TCONS_00034853|Name=TCONS_00034853|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=984bp
tcagggaaAAAAGAAGTGTGGCTCCTATGGAAAAATCCGATAAGCTAACC
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ATCAAACGTTGGGAATCTAAGATCTGCAAAACTG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0001227:15702..27256+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00034853 ID=TCONS_00034853|Name=TCONS_00034853|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11555bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001227:15702..27256+ (Clytia hemisphaerica)
tcagggaaAAAAGAAGTGTGGCTCCTATGGAAAAATCCGATAAGCTAACC
GTTATAATTGGAATAACATGCTCGCTCCTGTATGCGTTATTCTTCCAAAT
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GTATCTTCTACTGGGAGCTGGAGTTTCATATTTTCTATGTGTTGTTTGTG
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GTCAGTTTAGTTTCCAGCGCTCTAATCTagagcttaaattttcaaaatcc
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tgcaaaaaagtgggggccATGGCCCCACCGGCCCCCCCGGTGGCGCGGGC
CCTGTTAAATCCTCAACATTCAAATTAGGTTCAGTTTAGAACGAAATTAA
GACTAATCTGAATACATAGGCAAGACATTTCATTCTGTGATGGTTTTTAA
TGTATAACTGCACACAAAATGCATGGTttgccctcgcggtgtcactaaac
tttcAGCCCTCCCAataagaaaatgcttcctacagCACTGAAATATAAAA
GATTTAACGGTTTTTCTCCTGTGTTGCTTTGGGAAATGCAaccatctctt
ttcatccaaaaattaTATGATACTAGTTTGGACTATTCagtgttttatca
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TTCATCACGTTTGTATTTCATGATTTTATCGAAATCAcctaaaaatgaat
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CCTCCTGTATGCGTTATTTTTACAAATTGGCGATTGGCTATCCAAGTATA
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GTTTGGTTGGTTATTGTTAAAAGAAAGAATCAGATTATCTGATATGATGT
ACGGTTTATTATCCTACGTTGGAGTTGTCCTGGTAGTCTGGGAACGAATT
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TCTTACCCTTTTCGCCTTGGATATTCAGTGCTAGCTTCGCACTGACCAGA
TCGCCTTTTGTTTTCACGTATCTTCTACTAGGAGCTGGAGTTTCATATTT
TCTATGTGTCATGTGCGAAGTGACCAGTATGAGATGTTTAAATGTTGCAC
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ATGGTAATCACACGTTTATTCCCAAACTGGGTAAGTAAGCTTCACTAATA
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GCCGCTAAAAAACACACATAAATAAACTCGGTAATGTTGAGATTGGACGG
CCGTCCAAGGACTCTCCACTGTCCTGTCAGCTAGCATTGTGGGAGAAAGA
GTTCAAGCCCTACCTTCCTCTTACAATTTAAGTCCAGGATTGTGGTAGGA
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CCGGAATACTGACATAAAATAAGGCTAAATAAAGTTACTAATAAAGTTAA
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ggacgaatagccattgAGATATATGGAAGTGCCTGAAATAcaattaataa
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CTCCACTCAAATTATTTGTTCGTTTACTTTACAGATTGTTATAATCGGCT
TGTTGATTGTGATAGTGGCAACTTCAATGATTGCAGTCAATATGATTTAT
GATATCCCTTATTTGGCTACAATCAAACGTTGGGAATCTAAGATCTGCAA
AACTG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00034853-exon-sc0001227-1491911889:15702..16564 | TCONS_00034853-exon-sc0001227-1491911889:15702..16564 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00034853-exon-sc0001227-1510915933:15702..16564 | TCONS_00034853-exon-sc0001227-1510915933:15702..16564 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00034853-exon-sc0001227-1575043694:15702..16564 | TCONS_00034853-exon-sc0001227-1575043694:15702..16564 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00034853-exon-sc0001227-1491911889:27136..27256 | TCONS_00034853-exon-sc0001227-1491911889:27136..27256 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00034853-exon-sc0001227-1510915933:27136..27256 | TCONS_00034853-exon-sc0001227-1510915933:27136..27256 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00034853-exon-sc0001227-1575043694:27136..27256 | TCONS_00034853-exon-sc0001227-1575043694:27136..27256 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0001227 | supercontig | sc0001227:15702..27256 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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