TCONS_00034773 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00034773
Unique NameTCONS_00034773
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2951

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00034773 ID=TCONS_00034773|Name=TCONS_00034773|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2951bp
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ACAGTTAATTTTCACAAGCTCCatcatttcaaatgaaaaaagtgTGAAAT
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T
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00034773-protein

>TCONS_00034773-protein ID=TCONS_00034773-protein|Name=TCONS_00034773-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=692bp
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TIVHFLRSKQLIFTSSIISNEKSVKCSKCSQYGHNKKNKICL
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0001217:72252..76245+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00034773 ID=TCONS_00034773|Name=TCONS_00034773|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3994bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001217:72252..76245+ (Clytia hemisphaerica)
attttttcttttgataacaGGATATGGAAAAAGAGATTTTTAGTATTAAA TGGGCTGGCTGCATCAATCCTGGATTTAAAGAGTATGATCCTAGCGATAA ATCaactttaaatgaaaattggctttcaaaaagtaaaaaatacatttaTG GCAATCACTTTCAGTCAAAAAGACTCATTTGAAAGACTTCTGAAGGTAAA CTTATTGATTACGAGGTAACTACAAAGGTGCATTGGGTAGTCCTATCTTC AGTTGCTCAACGATTgaatcaaaaattaataaagacggtcagaaagagga aaaggaaCTGAAATTTAGTAGCACAAAAAATCCAACATCGCcagttaaaa atctttttagagAACTGGGtgtcaaagttaaaaaaaattggaacggCAAT AACTTTTTTGGCTTTGATTTGAAGGACACACCGACACCATTGGAACCAGC AGATAAAACATCATTAGAGCAGAAtgatgaaaatgttgataatttTAGAT CTTTTAATATCTCAAGCACCCCGTCAAGAGATGCAGCATGGCTTGGTGTA AGGTCACTTGGTGTACCTGTTATTCAAGCACGCTATATACACACAGTatc aaaggaaaaaaagattttaattcaaCCAGGTTATGAGGCAGTGCGCTCAA TAAAATCTGACTCCGGAAATGTTGAAGTTGTATGCAAAATTGTTGATGGT CCTAAATTTCACTGTATTGCTGATGAGAAAAACATATTAATTGAAAATTG GACTGCTGGTTCTGCAGTTAATGAATTTCTCAAAACAATCGGATACAAAG GCACTCACAACTGGTCTGGGTATGAGTTTTTTGGACTCTTGAAACCAGAG GTTTTGTGTcacattttttattcaatgaatAGTGGAGTATCTGAAGTTAA TACGAACAGTAAACGAATCAAAACAGACTTGCCCAGTGATAAATGGAAGC CACTCAAAGATGTGCAAAATATAATTAACCGAGATGGAGGGCCAACTAAC AGCTTAAAAAGCAAACAAGCAAAAGACAATCGTAATGCTGCTATCCATCG TCTTGTTGAACAGTCTTCATTTGATGATGTCAAAAGTATGTTTTTTGTTC ATAaatctttttgctgatttcaTTTTCTCTATTTCTTTGTTTGTCTTTTA TTGACAACGacaacaaataaaaacaaaggcatgaaaacattattttgaat AATGGAGAAGTGCAAAGCGGGTAGAATATTGGTGACAAAGTTCTTTTCGT AGACTCACTTTGATGTTAATTGACGTTTCCTCCAATGAAGATGTATTTAG GTTAGCGTGTTGCTTAAAGGTGGATATTACTTCTTGATAATAATCCTGTT GGATAataatagactttttttaaagaggacgccctgttgaataattaagt tTATTCTTTTCTTAATTTTAGCTTACATTGAATACTTGTGTGAAACCCTG CCAGAATTAATGGAAGAAGCCATAATTGACAGCACTCCAGAGTTTGTAGA TCATTTAGCTAAAAAACTTAGGAAAGATTCTTCTCGACATGCGTTTATTT CCAACAAAGATACTGCAGAACTGTTGTACGGTAAAANTAGGAAAGATTCT TCTCGACATGCGTTTATTTCCAACAAAGATACTGCAGAACTGTTGTACGG TAAAAGTGATCTCTCTCAGCGAGGATATAAACATTTACGTTCTATTCTTC TACGTAATAATGTACACATCCCCTCTTATGAAGTAATACGGAAGTATTGT AAAGATCTTGAAGTTGGCGATATTAAATCTTTTAATCATGCAAACTCTGA TTGTCCTTGTATGGGTGTACATACAGATTTGATTGATACTTTACAGAGAA TCTTTTCTTCTGACCTATAtgataaaatgaattttttaccAGAAGGGAAG AACAAAGCTCTTTgtgaatttttgaaatcaaaagatCCAATAATGTATCA GAAATTCAACCCAAGAAATAAAACGATCCTTTTACGTGAAACTGGCGACA ACTTTAGAGGTGCTGCAAGATTTCCAACAGAGCAAACGTCTTTTTCGCTC CTTAATTTACTTTCCTTTGCTAATAACCCGTATGGTCAATTCATATCAAC ATTATGGCGTGGCTCAGAAAGTAGATCTATGCTGGATTCTCATGTTTCAA GTCATTACAAAGAATTAAAAGAAGCTGTGTTAAATGGAGTTGATATTATT ATTAACGAAGACATTGAACATTTTAATGTTGTAGTTTTCCTCATTGCAGA CTTGTGTTTCCTCAAGGATATAATTGGACACACTTCTCCAACATCAACTT ATGGTTGCTTTTTATGTAAATTACCACAAAAGGATTGGTTGAGTGATACA CCAAAGGAAGCTCCAGAAAAATCCGTAAAAGAAATGACAGTGAATGGGGT TAAAGGTGTCGAAAAGTTAGGAAAAAATCCTAACAAAGATTCTCAGATGT ACAAAGATTTTCACTTGAAACACTTTGGACAATGGGTAATTTTTATAATT CTCTTTAACTTTAAAAACTTTAACTTTGTAAGAGTCAGAATACTTTAAGG ATTTGCCTTAAATCCGCAAAATTAAGTTCTCGCCAAATTTAATTTTATCC GCCATCCCCCAAATTAAATCCCTCTAAAAAGCTTTTTCGGCCATCCGCCA AATTAAATTGCTGCCAAAATTTCCTCCAATAAGGTAACGTGAACTAGTTT TGATTAAAAGATAAGTTTCGGTGATACATGATTTTTTAACGAAAACCATT TAAATCAAGCAATCTTAGCATGAATTTCTGCTTAAAATGTGCATTTTTCA TTACAGGCACCTCCATTGTTTGATGGTTTTATATTGGATTTAATGCCGCC CTGTGGTTTACATTTAATACTGGCCAATCACAGATATCTCTGGGGTTTCA TGTATGACGTAGTCAATAAGCGAAAAATGGATCAGAATATCCCTGCGGCT CTCAAAAAAATTGGTTGCGGATATCTAGCCTATCAAATGGAACAATATTT TAACAGGTATATAATATAGTATAACTCATATAAATTATATGAATAAGATC TAAGTCTAAATCCTGTTCTTCATCTAAAGTCATTTCTCCTACCTTAAGGG AATAAATTAATGCAAGAATAAACCAATGTGGAATTAATTAATGCGAATAA CACAGTTTTAGGAACAATTCACATTAATTAATCTCGCATTAATTTATTCT TACATTAGTTAATTTTTTTAAGGTAATTTTTTTAAGGTACTATTTTCCTT TTTAGCAAAAAGAAGTTCTACGATGGCTCAAAATCACTGAAAATGATTGG AAACGATTGTCGCTTGTTAGAAGAAAATATAGATGCATTTTTAGATACGT TTGTGAACAGACAATCTGGTGAGACGTGGGAAAGTCCATCAGCAAGGAAA TTGAGACAAGTGTTGACTCTCTACAAGGATTTTGGTGAACTTGCAAggta tttaattttctttaggtTGAATCTCTCTTAAAATAAGTTACATGACTTTT AATATTGAATTGAGGGGAAATGTTTGACAAGTGAATCATGGGACTCTTTC AAAACAATatacttttttaaatctttctaTTCAGGGACATACGCAGCACC ACCGGAGATGTTGAAAGAATAAAATCTTTTACAGCCCGTGCCgagagata tttcaaaaaatttacatcaaATGCTTCTAACTCTATGCTACAAAGGCTAC CTTATCTTCATTTGTTACGAATGCATATTGGAAAAATTATGGTAAAGCAC TATGAACTGTTTGGTTGGGGTTATGGAGTGTATTGTTGTAATGCTGGTGA ACACCTAAACAAGGTCATTAAGACAGTTGAAATCACAGGAACAAATTTTg atgcaaaaagatttttcacaaTTGTTCACTTTTTGCGGTCTAAACAGTTA ATTTTCACAAGCTCCatcatttcaaatgaaaaaagtgTGAAATGCTCGAA ATGCAGTCAATACGGTCAcaataaaaagaacaaaatttgtCTAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0001217:72252..76245+

>TCONS_00034773 ID=TCONS_00034773|Name=TCONS_00034773|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=10380bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001217:72252..76245+ (Clytia hemisphaerica)
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AGACTTGCCCAGTGATAAATGGAAGCCACTCAAAGATGTGCAAAATATAA
TTAACCGAGATGGAGGGCCAACTAACAGCTTAAAAAGCAAACAAGCAAAA
GACAATCGTAATGCTGCTATCCATCGTCTTGTTGAACAGTCTTCATTTGA
TGATGTCAAAACTTACATTGAATACTTGTGTGAAACCCTGCCAGAATTAA
TGGAAGAAGCCATAATTGACAGCACTCCAGAGTTTGTAGATCATTTAGCT
AAAAAACTTAGGAAAGATTCTTCTCGACATGCGTTTATTTCCAACAAAGA
TACTGCAGAACTGTTGTACGGTAAAANTAGGAAAGATTCTTCTCGACATG
CGTTTATTTCCAACAAAGATACTGCAGAACTGTTGTACGGTAAAAGTGAT
CTCTCTCAGCGAGGATATAAACATTTACGTTCTATTCTTCTACGTAATAA
TGTACACATCCCCTCTTATGAAGTAATACGGAAGTATTGTAAAGATCTTG
AAGTTGGCGATATTAAATCTTTTAATCATGCAAACTCTGATTGTCCTTGT
ATGGGTGTACATACAGATTTGATTGATACTTTACAGAGAATCTTTTCTTC
TGACCTATAtgataaaatgaattttttaccAGAAGGGAAGAACAAAGCTC
TTTgtgaatttttgaaatcaaaagatCCAATAATGTATCAGAAATTCAAC
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TGCTGCAAGATTTCCAACAGAGCAAACGTCTTTTTCGCTCCTTAATTTAC
TTTCCTTTGCTAATAACCCGTATGGTCAATTCATATCAACATTATGGCGT
GGCTCAGAAAGTAGATCTATGCTGGATTCTCATGTTTCAAGTCATTACAA
AGAATTAAAAGAAGCTGTGTTAAATGGAGTTGATATTATTATTAACGAAG
ACATTGAACATTTTAATGTTGTAGTTTTCCTCATTGCAGACTTGTGTTTC
CTCAAGGATATAATTGGACACACTTCTCCAACATCAACTTATGGTTGCTT
TTTATGTAAATTACCACAAAAGGATTGGTTGAGTGATACACCAAAGGAAG
CTCCAGAAAAATCCGTAAAAGAAATGACAGTGAATGGGGTTAAAGGTGTC
GAAAAGTTAGGAAAAAATCCTAACAAAGATTCTCAGATGTACAAAGATTT
TCACTTGAAACACTTTGGACAATGGGCACCTCCATTGTTTGATGGTTTTA
TATTGGATTTAATGCCGCCCTGTGGTTTACATTTAATACTGGCCAATCAC
AGATATCTCTGGGGTTTCATGTATGACGTAGTCAATAAGCGAAAAATGGA
TCAGAATATCCCTGCGGCTCTCAAAAAAATTGGTTGCGGATATCTAGCCT
ATCAAATGGAACAATATTTTAACAGCAAAAAGAAGTTCTACGATGGCTCA
AAATCACTGAAAATGATTGGAAACGATTGTCGCTTGTTAGAAGAAAATAT
AGATGCATTTTTAGATACGTTTGTGAACAGACAATCTGGTGAGACGTGGG
AAAGTCCATCAGCAAGGAAATTGAGACAAGTGTTGACTCTCTACAAGGAT
TTTGGTGAACTTGCAAgGGACATACGCAGCACCACCGGAGATGTTGAAAG
AATAAAATCTTTTACAGCCCGTGCCgagagatatttcaaaaaatttacat
caaATGCTTCTAACTCTATGCTACAAAGGCTACCTTATCTTCATTTGTTA
CGAATGCATATTGGAAAAATTATGGTAAAGCACTATGAACTGTTTGGTTG
GGGTTATGGAGTGTATTGTTGTAATGCTGGTGAACACCTAAACAAGGTCA
TTAAGACAGTTGAAATCACAGGAACAAATTTTgatgcaaaaagatttttc
acaaTTGTTCACTTTTTGCGGTCTAAACAGTTAATTTTCACAAGCTCCat
catttcaaatgaaaaaagtgTGAAATGCTCGAAATGCAGTCAATACGGTC
AcaataaaaagaacaaaatttgtCTAatgaatAGTGGAGTATCTGAAGTT
AATACGAACAGTAAACGAATCAAAACAGACTTGCCCAGTGATAAATGGAA
GCCACTCAAAGATGTGCAAAATATAATTAACCGAGATGGAGGGCCAACTA
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CGTCTTGTTGAACAGTCTTCATTTGATGATGTCAAAACTTACATTGAATA
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CGACATGCGTTTATTTCCAACAAAGATACTGCAGAACTGTTGTACGGTAA
AANTAGGAAAGATTCTTCTCGACATGCGTTTATTTCCAACAAAGATACTG
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TTACGTTCTATTCTTCTACGTAATAATGTACACATCCCCTCTTATGAAGT
AATACGGAAGTATTGTAAAGATCTTGAAGTTGGCGATATTAAATCTTTTA
ATCATGCAAACTCTGATTGTCCTTGTATGGGTGTACATACAGATTTGATT
GATACTTTACAGAGAATCTTTTCTTCTGACCTATAtgataaaatgaattt
tttaccAGAAGGGAAGAACAAAGCTCTTTgtgaatttttgaaatcaaaag
atCCAATAATGTATCAGAAATTCAACCCAAGAAATAAAACGATCCTTTTA
CGTGAAACTGGCGACAACTTTAGAGGTGCTGCAAGATTTCCAACAGAGCA
AACGTCTTTTTCGCTCCTTAATTTACTTTCCTTTGCTAATAACCCGTATG
GTCAATTCATATCAACATTATGGCGTGGCTCAGAAAGTAGATCTATGCTG
GATTCTCATGTTTCAAGTCATTACAAAGAATTAAAAGAAGCTGTGTTAAA
TGGAGTTGATATTATTATTAACGAAGACATTGAACATTTTAATGTTGTAG
TTTTCCTCATTGCAGACTTGTGTTTCCTCAAGGATATAATTGGACACACT
TCTCCAACATCAACTTATGGTTGCTTTTTATGTAAATTACCACAAAAGGA
TTGGTTGAGTGATACACCAAAGGAAGCTCCAGAAAAATCCGTAAAAGAAA
TGACAGTGAATGGGGTTAAAGGTGTCGAAAAGTTAGGAAAAAATCCTAAC
AAAGATTCTCAGATGTACAAAGATTTTCACTTGAAACACTTTGGACAATG
GGCACCTCCATTGTTTGATGGTTTTATATTGGATTTAATGCCGCCCTGTG
GTTTACATTTAATACTGGCCAATCACAGATATCTCTGGGGTTTCATGTAT
GACGTAGTCAATAAGCGAAAAATGGATCAGAATATCCCTGCGGCTCTCAA
AAAAATTGGTTGCGGATATCTAGCCTATCAAATGGAACAATATTTTAACA
GCAAAAAGAAGTTCTACGATGGCTCAAAATCACTGAAAATGATTGGAAAC
GATTGTCGCTTGTTAGAAGAAAATATAGATGCATTTTTAGATACGTTTGT
GAACAGACAATCTGGTGAGACGTGGGAAAGTCCATCAGCAAGGAAATTGA
GACAAGTGTTGACTCTCTACAAGGATTTTGGTGAACTTGCAAgGGACATA
CGCAGCACCACCGGAGATGTTGAAAGAATAAAATCTTTTACAGCCCGTGC
CgagagatatttcaaaaaatttacatcaaATGCTTCTAACTCTATGCTAC
AAAGGCTACCTTATCTTCATTTGTTACGAATGCATATTGGAAAAATTATG
GTAAAGCACTATGAACTGTTTGGTTGGGGTTATGGAGTGTATTGTTGTAA
TGCTGGTGAACACCTAAACAAGGTCATTAAGACAGTTGAAATCACAGGAA
CAAATTTTgatgcaaaaagatttttcacaaTTGTTCACTTTTTGCGGTCT
AAACAGTTAATTTTCACAAGCTCCatcatttcaaatgaaaaaagtgTGAA
ATGCTCGAAATGCAGTCAATACGGTCAcaataaaaagaacaaaatttgtC
TAatgaatAGTGGAGTATCTGAAGTTAATACGAACAGTAAACGAATCAAA
ACAGACTTGCCCAGTGATAAATGGAAGCCACTCAAAGATGTGCAAAATAT
AATTAACCGAGATGGAGGGCCAACTAACAGCTTAAAAAGCAAACAAGCAA
AAGACAATCGTAATGCTGCTATCCATCGTCTTGTTGAACAGTCTTCATTT
GATGATGTCAAAACTTACATTGAATACTTGTGTGAAACCCTGCCAGAATT
AATGGAAGAAGCCATAATTGACAGCACTCCAGAGTTTGTAGATCATTTAG
CTAAAAAACTTAGGAAAGATTCTTCTCGACATGCGTTTATTTCCAACAAA
GATACTGCAGAACTGTTGTACGGTAAAANTAGGAAAGATTCTTCTCGACA
TGCGTTTATTTCCAACAAAGATACTGCAGAACTGTTGTACGGTAAAAGTG
ATCTCTCTCAGCGAGGATATAAACATTTACGTTCTATTCTTCTACGTAAT
AATGTACACATCCCCTCTTATGAAGTAATACGGAAGTATTGTAAAGATCT
TGAAGTTGGCGATATTAAATCTTTTAATCATGCAAACTCTGATTGTCCTT
GTATGGGTGTACATACAGATTTGATTGATACTTTACAGAGAATCTTTTCT
TCTGACCTATAtgataaaatgaattttttaccAGAAGGGAAGAACAAAGC
TCTTTgtgaatttttgaaatcaaaagatCCAATAATGTATCAGAAATTCA
ACCCAAGAAATAAAACGATCCTTTTACGTGAAACTGGCGACAACTTTAGA
GGTGCTGCAAGATTTCCAACAGAGCAAACGTCTTTTTCGCTCCTTAATTT
ACTTTCCTTTGCTAATAACCCGTATGGTCAATTCATATCAACATTATGGC
GTGGCTCAGAAAGTAGATCTATGCTGGATTCTCATGTTTCAAGTCATTAC
AAAGAATTAAAAGAAGCTGTGTTAAATGGAGTTGATATTATTATTAACGA
AGACATTGAACATTTTAATGTTGTAGTTTTCCTCATTGCAGACTTGTGTT
TCCTCAAGGATATAATTGGACACACTTCTCCAACATCAACTTATGGTTGC
TTTTTATGTAAATTACCACAAAAGGATTGGTTGAGTGATACACCAAAGGA
AGCTCCAGAAAAATCCGTAAAAGAAATGACAGTGAATGGGGTTAAAGGTG
TCGAAAAGTTAGGAAAAAATCCTAACAAAGATTCTCAGATGTACAAAGAT
TTTCACTTGAAACACTTTGGACAATGGGCACCTCCATTGTTTGATGGTTT
TATATTGGATTTAATGCCGCCCTGTGGTTTACATTTAATACTGGCCAATC
ACAGATATCTCTGGGGTTTCATGTATGACGTAGTCAATAAGCGAAAAATG
GATCAGAATATCCCTGCGGCTCTCAAAAAAATTGGTTGCGGATATCTAGC
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CAAAATCACTGAAAATGATTGGAAACGATTGTCGCTTGTTAGAAGAAAAT
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GGAAAGTCCATCAGCAAGGAAATTGAGACAAGTGTTGACTCTCTACAAGG
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AGAATAAAATCTTTTACAGCCCGTGCCgagagatatttcaaaaaatttac
atcaaATGCTTCTAACTCTATGCTACAAAGGCTACCTTATCTTCATTTGT
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TGGGGTTATGGAGTGTATTGTTGTAATGCTGGTGAACACCTAAACAAGGT
CATTAAGACAGTTGAAATCACAGGAACAAATTTTgatgcaaaaagatttt
tcacaaTTGTTCACTTTTTGCGGTCTAAACAGTTAATTTTCACAAGCTCC
atcatttcaaatgaaaaaagtgTGAAATGCTCGAAATGCAGTCAATACGG
TCAcaataaaaagaacaaaatttgtCTAatgaatAGTGGAGTATCTGAAG
TTAATACGAACAGTAAACGAATCAAAACAGACTTGCCCAGTGATAAATGG
AAGCCACTCAAAGATGTGCAAAATATAATTAACCGAGATGGAGGGCCAAC
TAACAGCTTAAAAAGCAAACAAGCAAAAGACAATCGTAATGCTGCTATCC
ATCGTCTTGTTGAACAGTCTTCATTTGATGATGTCAAAACTTACATTGAA
TACTTGTGTGAAACCCTGCCAGAATTAATGGAAGAAGCCATAATTGACAG
CACTCCAGAGTTTGTAGATCATTTAGCTAAAAAACTTAGGAAAGATTCTT
CTCGACATGCGTTTATTTCCAACAAAGATACTGCAGAACTGTTGTACGGT
AAAANTAGGAAAGATTCTTCTCGACATGCGTTTATTTCCAACAAAGATAC
TGCAGAACTGTTGTACGGTAAAAGTGATCTCTCTCAGCGAGGATATAAAC
ATTTACGTTCTATTCTTCTACGTAATAATGTACACATCCCCTCTTATGAA
GTAATACGGAAGTATTGTAAAGATCTTGAAGTTGGCGATATTAAATCTTT
TAATCATGCAAACTCTGATTGTCCTTGTATGGGTGTACATACAGATTTGA
TTGATACTTTACAGAGAATCTTTTCTTCTGACCTATAtgataaaatgaat
tttttaccAGAAGGGAAGAACAAAGCTCTTTgtgaatttttgaaatcaaa
agatCCAATAATGTATCAGAAATTCAACCCAAGAAATAAAACGATCCTTT
TACGTGAAACTGGCGACAACTTTAGAGGTGCTGCAAGATTTCCAACAGAG
CAAACGTCTTTTTCGCTCCTTAATTTACTTTCCTTTGCTAATAACCCGTA
TGGTCAATTCATATCAACATTATGGCGTGGCTCAGAAAGTAGATCTATGC
TGGATTCTCATGTTTCAAGTCATTACAAAGAATTAAAAGAAGCTGTGTTA
AATGGAGTTGATATTATTATTAACGAAGACATTGAACATTTTAATGTTGT
AGTTTTCCTCATTGCAGACTTGTGTTTCCTCAAGGATATAATTGGACACA
CTTCTCCAACATCAACTTATGGTTGCTTTTTATGTAAATTACCACAAAAG
GATTGGTTGAGTGATACACCAAAGGAAGCTCCAGAAAAATCCGTAAAAGA
AATGACAGTGAATGGGGTTAAAGGTGTCGAAAAGTTAGGAAAAAATCCTA
ACAAAGATTCTCAGATGTACAAAGATTTTCACTTGAAACACTTTGGACAA
TGGGCACCTCCATTGTTTGATGGTTTTATATTGGATTTAATGCCGCCCTG
TGGTTTACATTTAATACTGGCCAATCACAGATATCTCTGGGGTTTCATGT
ATGACGTAGTCAATAAGCGAAAAATGGATCAGAATATCCCTGCGGCTCTC
AAAAAAATTGGTTGCGGATATCTAGCCTATCAAATGGAACAATATTTTAA
CAGCAAAAAGAAGTTCTACGATGGCTCAAAATCACTGAAAATGATTGGAA
ACGATTGTCGCTTGTTAGAAGAAAATATAGATGCATTTTTAGATACGTTT
GTGAACAGACAATCTGGTGAGACGTGGGAAAGTCCATCAGCAAGGAAATT
GAGACAAGTGTTGACTCTCTACAAGGATTTTGGTGAACTTGCAAgGGACA
TACGCAGCACCACCGGAGATGTTGAAAGAATAAAATCTTTTACAGCCCGT
GCCgagagatatttcaaaaaatttacatcaaATGCTTCTAACTCTATGCT
ACAAAGGCTACCTTATCTTCATTTGTTACGAATGCATATTGGAAAAATTA
TGGTAAAGCACTATGAACTGTTTGGTTGGGGTTATGGAGTGTATTGTTGT
AATGCTGGTGAACACCTAAACAAGGTCATTAAGACAGTTGAAATCACAGG
AACAAATTTTgatgcaaaaagatttttcacaaTTGTTCACTTTTTGCGGT
CTAAACAGTTAATTTTCACAAGCTCCatcatttcaaatgaaaaaagtgTG
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tCTAatgaatAGTGGAGTATCTGAAGTTAATACGAACAGTAAACGAATCA
AAACAGACTTGCCCAGTGATAAATGGAAGCCACTCAAAGATGTGCAAAAT
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CAACCCAAGAAATAAAACGATCCTTTTACGTGAAACTGGCGACAACTTTA
GAGGTGCTGCAAGATTTCCAACAGAGCAAACGTCTTTTTCGCTCCTTAAT
TTACTTTCCTTTGCTAATAACCCGTATGGTCAATTCATATCAACATTATG
GCGTGGCTCAGAAAGTAGATCTATGCTGGATTCTCATGTTTCAAGTCATT
ACAAAGAATTAAAAGAAGCTGTGTTAAATGGAGTTGATATTATTATTAAC
GAAGACATTGAACATTTTAATGTTGTAGTTTTCCTCATTGCAGACTTGTG
TTTCCTCAAGGATATAATTGGACACACTTCTCCAACATCAACTTATGGTT
GCTTTTTATGTAAATTACCACAAAAGGATTGGTTGAGTGATACACCAAAG
GAAGCTCCAGAAAAATCCGTAAAAGAAATGACAGTGAATGGGGTTAAAGG
TGTCGAAAAGTTAGGAAAAAATCCTAACAAAGATTCTCAGATGTACAAAG
ATTTTCACTTGAAACACTTTGGACAATGGGCACCTCCATTGTTTGATGGT
TTTATATTGGATTTAATGCCGCCCTGTGGTTTACATTTAATACTGGCCAA
TCACAGATATCTCTGGGGTTTCATGTATGACGTAGTCAATAAGCGAAAAA
TGGATCAGAATATCCCTGCGGCTCTCAAAAAAATTGGTTGCGGATATCTA
GCCTATCAAATGGAACAATATTTTAACAGCAAAAAGAAGTTCTACGATGG
CTCAAAATCACTGAAAATGATTGGAAACGATTGTCGCTTGTTAGAAGAAA
ATATAGATGCATTTTTAGATACGTTTGTGAACAGACAATCTGGTGAGACG
TGGGAAAGTCCATCAGCAAGGAAATTGAGACAAGTGTTGACTCTCTACAA
GGATTTTGGTGAACTTGCAAgGGACATACGCAGCACCACCGGAGATGTTG
AAAGAATAAAATCTTTTACAGCCCGTGCCgagagatatttcaaaaaattt
acatcaaATGCTTCTAACTCTATGCTACAAAGGCTACCTTATCTTCATTT
GTTACGAATGCATATTGGAAAAATTATGGTAAAGCACTATGAACTGTTTG
GTTGGGGTTATGGAGTGTATTGTTGTAATGCTGGTGAACACCTAAACAAG
GTCATTAAGACAGTTGAAATCACAGGAACAAATTTTgatgcaaaaagatt
tttcacaaTTGTTCACTTTTTGCGGTCTAAACAGTTAATTTTCACAAGCT
CCatcatttcaaatgaaaaaagtgTGAAATGCTCGAAATGCAGTCAATAC
GGTCAcaataaaaagaacaaaatttgtCTA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_020218XLOC_020218Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00034773-exon-sc0001217-1575043694:72252..73336TCONS_00034773-exon-sc0001217-1575043694:72252..73336Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00034773-exon-sc0001217-1491911889:73673..74736TCONS_00034773-exon-sc0001217-1491911889:73673..74736Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00034773-exon-sc0001217-1510915933:73673..74736TCONS_00034773-exon-sc0001217-1510915933:73673..74736Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00034773-exon-sc0001217-1575043694:73673..74736TCONS_00034773-exon-sc0001217-1575043694:73673..74736Clytia hemisphaericaexon
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00034773-proteinTCONS_00034773-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001217supercontigsc0001217:72252..76245 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
5.73995 5.8149 0.366245 2.28807 0.697939 0.661825 4.40614 4.78096 1.50267 0.957833 0.511234 0.578586 0.737121 0.8579 1.41797 0.857555 0.398232 0.675035 0.976538 0.187104 0.809978 0.604083 0.804179 0.472057 0.402858 0.322347 0.561382 0.302946 0.761127 1.91625
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00034773 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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