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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00034773 ID=TCONS_00034773|Name=TCONS_00034773|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2951bp attttttcttttgataacaGGATATGGAAAAAGAGATTTTTAGTATTAAA TGGGCTGGCTGCATCAATCCTGGATTTAAAGAGTATGATCCTAGCGATAA ATCaactttaaatgaaaattggctttcaaaaagtaaaaaatacatttaTG GCAATCACTTTCAGTCAAAAAGACTCATTTGAAAGACTTCTGAAGGTAAA CTTATTGATTACGAGGTAACTACAAAGGTGCATTGGGTAGTCCTATCTTC AGTTGCTCAACGATTgaatcaaaaattaataaagacggtcagaaagagga aaaggaaCTGAAATTTAGTAGCACAAAAAATCCAACATCGCcagttaaaa atctttttagagAACTGGGtgtcaaagttaaaaaaaattggaacggCAAT AACTTTTTTGGCTTTGATTTGAAGGACACACCGACACCATTGGAACCAGC AGATAAAACATCATTAGAGCAGAAtgatgaaaatgttgataatttTAGAT CTTTTAATATCTCAAGCACCCCGTCAAGAGATGCAGCATGGCTTGGTGTA AGGTCACTTGGTGTACCTGTTATTCAAGCACGCTATATACACACAGTatc aaaggaaaaaaagattttaattcaaCCAGGTTATGAGGCAGTGCGCTCAA TAAAATCTGACTCCGGAAATGTTGAAGTTGTATGCAAAATTGTTGATGGT CCTAAATTTCACTGTATTGCTGATGAGAAAAACATATTAATTGAAAATTG GACTGCTGGTTCTGCAGTTAATGAATTTCTCAAAACAATCGGATACAAAG GCACTCACAACTGGTCTGGGTATGAGTTTTTTGGACTCTTGAAACCAGAG GTTTTGTGTcacattttttattcaatgaatAGTGGAGTATCTGAAGTTAA TACGAACAGTAAACGAATCAAAACAGACTTGCCCAGTGATAAATGGAAGC CACTCAAAGATGTGCAAAATATAATTAACCGAGATGGAGGGCCAACTAAC AGCTTAAAAAGCAAACAAGCAAAAGACAATCGTAATGCTGCTATCCATCG TCTTGTTGAACAGTCTTCATTTGATGATGTCAAAACTTACATTGAATACT TGTGTGAAACCCTGCCAGAATTAATGGAAGAAGCCATAATTGACAGCACT CCAGAGTTTGTAGATCATTTAGCTAAAAAACTTAGGAAAGATTCTTCTCG ACATGCGTTTATTTCCAACAAAGATACTGCAGAACTGTTGTACGGTAAAA NTAGGAAAGATTCTTCTCGACATGCGTTTATTTCCAACAAAGATACTGCA GAACTGTTGTACGGTAAAAGTGATCTCTCTCAGCGAGGATATAAACATTT ACGTTCTATTCTTCTACGTAATAATGTACACATCCCCTCTTATGAAGTAA TACGGAAGTATTGTAAAGATCTTGAAGTTGGCGATATTAAATCTTTTAAT CATGCAAACTCTGATTGTCCTTGTATGGGTGTACATACAGATTTGATTGA TACTTTACAGAGAATCTTTTCTTCTGACCTATAtgataaaatgaattttt taccAGAAGGGAAGAACAAAGCTCTTTgtgaatttttgaaatcaaaagat CCAATAATGTATCAGAAATTCAACCCAAGAAATAAAACGATCCTTTTACG TGAAACTGGCGACAACTTTAGAGGTGCTGCAAGATTTCCAACAGAGCAAA CGTCTTTTTCGCTCCTTAATTTACTTTCCTTTGCTAATAACCCGTATGGT CAATTCATATCAACATTATGGCGTGGCTCAGAAAGTAGATCTATGCTGGA TTCTCATGTTTCAAGTCATTACAAAGAATTAAAAGAAGCTGTGTTAAATG GAGTTGATATTATTATTAACGAAGACATTGAACATTTTAATGTTGTAGTT TTCCTCATTGCAGACTTGTGTTTCCTCAAGGATATAATTGGACACACTTC TCCAACATCAACTTATGGTTGCTTTTTATGTAAATTACCACAAAAGGATT GGTTGAGTGATACACCAAAGGAAGCTCCAGAAAAATCCGTAAAAGAAATG ACAGTGAATGGGGTTAAAGGTGTCGAAAAGTTAGGAAAAAATCCTAACAA AGATTCTCAGATGTACAAAGATTTTCACTTGAAACACTTTGGACAATGGG CACCTCCATTGTTTGATGGTTTTATATTGGATTTAATGCCGCCCTGTGGT TTACATTTAATACTGGCCAATCACAGATATCTCTGGGGTTTCATGTATGA CGTAGTCAATAAGCGAAAAATGGATCAGAATATCCCTGCGGCTCTCAAAA AAATTGGTTGCGGATATCTAGCCTATCAAATGGAACAATATTTTAACAGC AAAAAGAAGTTCTACGATGGCTCAAAATCACTGAAAATGATTGGAAACGA TTGTCGCTTGTTAGAAGAAAATATAGATGCATTTTTAGATACGTTTGTGA ACAGACAATCTGGTGAGACGTGGGAAAGTCCATCAGCAAGGAAATTGAGA CAAGTGTTGACTCTCTACAAGGATTTTGGTGAACTTGCAAgGGACATACG CAGCACCACCGGAGATGTTGAAAGAATAAAATCTTTTACAGCCCGTGCCg agagatatttcaaaaaatttacatcaaATGCTTCTAACTCTATGCTACAA AGGCTACCTTATCTTCATTTGTTACGAATGCATATTGGAAAAATTATGGT AAAGCACTATGAACTGTTTGGTTGGGGTTATGGAGTGTATTGTTGTAATG CTGGTGAACACCTAAACAAGGTCATTAAGACAGTTGAAATCACAGGAACA AATTTTgatgcaaaaagatttttcacaaTTGTTCACTTTTTGCGGTCTAA ACAGTTAATTTTCACAAGCTCCatcatttcaaatgaaaaaagtgTGAAAT GCTCGAAATGCAGTCAATACGGTCAcaataaaaagaacaaaatttgtCTA T Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00034773-protein >TCONS_00034773-protein ID=TCONS_00034773-protein|Name=TCONS_00034773-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=692bp
MNSGVSEVNTNSKRIKTDLPSDKWKPLKDVQNIINRDGGPTNSLKSKQAK DNRNAAIHRLVEQSSFDDVKTYIEYLCETLPELMEEAIIDSTPEFVDHLA KKLRKDSSRHAFISNKDTAELLYGKXRKDSSRHAFISNKDTAELLYGKSD LSQRGYKHLRSILLRNNVHIPSYEVIRKYCKDLEVGDIKSFNHANSDCPC MGVHTDLIDTLQRIFSSDLYDKMNFLPEGKNKALCEFLKSKDPIMYQKFN PRNKTILLRETGDNFRGAARFPTEQTSFSLLNLLSFANNPYGQFISTLWR GSESRSMLDSHVSSHYKELKEAVLNGVDIIINEDIEHFNVVVFLIADLCF LKDIIGHTSPTSTYGCFLCKLPQKDWLSDTPKEAPEKSVKEMTVNGVKGV EKLGKNPNKDSQMYKDFHLKHFGQWAPPLFDGFILDLMPPCGLHLILANH RYLWGFMYDVVNKRKMDQNIPAALKKIGCGYLAYQMEQYFNSKKKFYDGS KSLKMIGNDCRLLEENIDAFLDTFVNRQSGETWESPSARKLRQVLTLYKD FGELARDIRSTTGDVERIKSFTARAERYFKKFTSNASNSMLQRLPYLHLL RMHIGKIMVKHYELFGWGYGVYCCNAGEHLNKVIKTVEITGTNFDAKRFF TIVHFLRSKQLIFTSSIISNEKSVKCSKCSQYGHNKKNKICL Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0001217:72252..76245+ Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00034773 ID=TCONS_00034773|Name=TCONS_00034773|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3994bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001217:72252..76245+ (Clytia hemisphaerica) attttttcttttgataacaGGATATGGAAAAAGAGATTTTTAGTATTAAA
TGGGCTGGCTGCATCAATCCTGGATTTAAAGAGTATGATCCTAGCGATAA
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ATGCAGTCAATACGGTCAcaataaaaagaacaaaatttgtCTAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0001217:72252..76245+ >TCONS_00034773 ID=TCONS_00034773|Name=TCONS_00034773|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=10380bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001217:72252..76245+ (Clytia hemisphaerica) atgaatAGTGGAGTATCTGAAGTTAATACGAACAGTAAACGAATCAAAAC AGACTTGCCCAGTGATAAATGGAAGCCACTCAAAGATGTGCAAAATATAA TTAACCGAGATGGAGGGCCAACTAACAGCTTAAAAAGCAAACAAGCAAAA GACAATCGTAATGCTGCTATCCATCGTCTTGTTGAACAGTCTTCATTTGA TGATGTCAAAACTTACATTGAATACTTGTGTGAAACCCTGCCAGAATTAA TGGAAGAAGCCATAATTGACAGCACTCCAGAGTTTGTAGATCATTTAGCT AAAAAACTTAGGAAAGATTCTTCTCGACATGCGTTTATTTCCAACAAAGA TACTGCAGAACTGTTGTACGGTAAAANTAGGAAAGATTCTTCTCGACATG CGTTTATTTCCAACAAAGATACTGCAGAACTGTTGTACGGTAAAAGTGAT CTCTCTCAGCGAGGATATAAACATTTACGTTCTATTCTTCTACGTAATAA TGTACACATCCCCTCTTATGAAGTAATACGGAAGTATTGTAAAGATCTTG AAGTTGGCGATATTAAATCTTTTAATCATGCAAACTCTGATTGTCCTTGT ATGGGTGTACATACAGATTTGATTGATACTTTACAGAGAATCTTTTCTTC TGACCTATAtgataaaatgaattttttaccAGAAGGGAAGAACAAAGCTC TTTgtgaatttttgaaatcaaaagatCCAATAATGTATCAGAAATTCAAC CCAAGAAATAAAACGATCCTTTTACGTGAAACTGGCGACAACTTTAGAGG TGCTGCAAGATTTCCAACAGAGCAAACGTCTTTTTCGCTCCTTAATTTAC TTTCCTTTGCTAATAACCCGTATGGTCAATTCATATCAACATTATGGCGT GGCTCAGAAAGTAGATCTATGCTGGATTCTCATGTTTCAAGTCATTACAA AGAATTAAAAGAAGCTGTGTTAAATGGAGTTGATATTATTATTAACGAAG ACATTGAACATTTTAATGTTGTAGTTTTCCTCATTGCAGACTTGTGTTTC CTCAAGGATATAATTGGACACACTTCTCCAACATCAACTTATGGTTGCTT TTTATGTAAATTACCACAAAAGGATTGGTTGAGTGATACACCAAAGGAAG CTCCAGAAAAATCCGTAAAAGAAATGACAGTGAATGGGGTTAAAGGTGTC GAAAAGTTAGGAAAAAATCCTAACAAAGATTCTCAGATGTACAAAGATTT TCACTTGAAACACTTTGGACAATGGGCACCTCCATTGTTTGATGGTTTTA TATTGGATTTAATGCCGCCCTGTGGTTTACATTTAATACTGGCCAATCAC AGATATCTCTGGGGTTTCATGTATGACGTAGTCAATAAGCGAAAAATGGA TCAGAATATCCCTGCGGCTCTCAAAAAAATTGGTTGCGGATATCTAGCCT ATCAAATGGAACAATATTTTAACAGCAAAAAGAAGTTCTACGATGGCTCA AAATCACTGAAAATGATTGGAAACGATTGTCGCTTGTTAGAAGAAAATAT AGATGCATTTTTAGATACGTTTGTGAACAGACAATCTGGTGAGACGTGGG 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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0001217 | supercontig | sc0001217:72252..76245 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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