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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00030501 ID=TCONS_00030501|Name=TCONS_00030501|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3046bp
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AAATATGAAGAATTCACATTACGTAGAGCTTTAGTTGGTATACCAGACAT
TAGATGGTGCCCAGCACCTGATTGCGGTTATGCGGTTATAGCCTCTGGTT
GTGCAAGCTGCCCACAGTTGAAATGTATGCGGGCTGGTTGTAACTATGAA
TTTTGTTATCATTGTCGCCAATTATGGCATCCAAATACAACATGTGACTT
AGCTAGAAtgcaaaatcaatttgaaatccGCTCACTTACTTCATCTGAAA
GGAAATCATCAAATATGCAAGAAGACATTAAACCATGTCCAAAATGCATG
GCACTGATTATTAAGATGGACGATGGTTCTTGTAACCATATGACTTGTGC
AGTCTGCGGTGGTGAATTTTGTTGGCTTTGTATGAAAGAAATTTCTGATT
TACATTACCTAAGTCCGTCTGGGTGTACATTTTGGGGTAAAAAACCATGG
AGTCGTAAAAAAAAGATAATGTGGCAAATGGGTACGCTCATTGGTGCACC
TGTTGGTATTGGTCTGGCTGCTGGTGTTGTTTTACCCGCTATGATGATTG
GAATCCCAATTTATGTTGGTAGAAGGaTACGCGAGCGATTCGATTATGCT
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CGATCGCACTTGGATACGTGTATGGTGTAGTGCCAGTCTCTTTATGTCGA
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ttttgaatttaacgaACGAGAAGAAGCATACGGGTCCGGGTCCGTACATA
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GCTGGCAGTGGCAGTGTTTTGGCAGTCAAAGCAACTATTTCAAAAGAACA
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TCACTCATTCCAGCACCACGTAGCACTACTGTTAGCGTCACATCTAGCCT
GGAGAATGTACACATGAAATCTGCGAGTAGCCACAATGTATGTGCTAGTC
TACCGGAAGTGGAGAACCAGCCGACCTTAGAATCAAGTAGTTCGAAAGGA
GAGAGTTTGAGCAGCATTGTTCAACAGCATCCATCTAGCCCGACTATCAC
GAGCTCAAACGAAAGCGAACTAGCTACGCAACAAATAGTCGCTCCGTGTG
CTGTGCCAGAAGAGTCGAGTATTTGTGAATAGTCGATCGGACTAGGTTCC
CGCTGAGTAAAGTCATCGCTGTTGTTCACTTCGATTCGATTGGATTCAGC
GGCGTTCAAGTGAATGGTATTTGGTATTCGAGCAAAAATACAGATTCTAT
GGCGAtctttaaacaatagaattagTCTCGCTATTTTAGGGTGTTTCCTT
GCAAAAGAATTATCGCTTCTGTatcttgatttgattggttGGCCAAATGT
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TAAAAATTGGTCCTGAAGTACAGTAGTATTCACAGGTTAtagtacaaaaa
tattttttaggttcggagttttttcattcttttgagGGAAAATATTCTTC
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CGTCAAAACAATAGTTCTCTTTCGTTGATTATTTTCTTCAAGGcgaattt
tttaagaattttccaCTAGCCTCTGATGGGGTCGGGTGGTAGTAAAGTTA
AACTTAGTctagtgaaattttgtgaataatATGAAACTTGTACATAaatt
ttattaatatttttttcaacttgACGACTtgtgttttttccttttttttt
ggtctttagGCATGTTCTTGATTTCTTACGTTTCCGTCATCCTATAAAAA
TATTCAGGTTTAGATGCTTTTGGGGTGTTTAAAATTCgtattatatttat
tatttctGAAACTTGAAGCGCGTATTGGCTCTTAAGGTTTGTCCTAATTT
CATCCTCAagctcttattaaaaaaagcttgTCTACTTCCAAAAGCATTGA
TttcaattaaaggttttgttttaaataagaatgCTATCGTTtacttactc
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caagattggtaagaaaaagggaaagaaaaacatttttgcttatataagca
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tgaaacgggaactcttatgtaaaaataaaacgttTAAAAGGTATGATTTG
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GGTCCAAAgcttttaaaaaatacttattttctctaatatttttttatttt
ttgtttttgtttttctaccCCATGTAAATAGAGAGAAACTCGAGCCGCGC
CCACGAGTCGTTTTACAAAGTATACGGATTTTTATGTCATAAAAAACAAT
AACCAGAgtctcgttggaaagatatttctgaGTGGATATACTGTACTCTA
TAAGTGGGCGTGGTCTTGAATAAAACAATAACTTCTACTTTATTgtcgat
ttattttttattttgtataacACATAGCATTTTTAATTGAATTACTCGAA
AATGTGAATAACTATTGAAAAATATGGTATAAAAACTTCTTTGAAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000824:119930..129974- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00030501 ID=TCONS_00030501|Name=TCONS_00030501|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10045bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000824:119930..129974- (Clytia hemisphaerica)
NTCACCCGTCTGATGTTAAAATGATATTCAGTGACGATAACTTTTATGCA
AAATATGAAGAATTCACATTACGTAGAGCTTTAGTTGGTATACCAGACAT
TAGATGGTGCCCAGCACCTGATTGCGGTTATGCGGTTATAGCCTCTGGTT
GTGCAAGCTGCCCACAGTTGAAATGTATGCGGGCTGGTTGTAACTATGAA
TTTTGTTATCATTGTCGCCAATTATGGCATCCAAATACAACATGTGACTT
AGCTAGAATGCAAAATCAATTTGAAATCCGCTCACTTACTTCATCTGAAA
GGAAATCATCAAATATGCAAGAAGACATTAAACCATGTCCAAAATGCATG
GCACTGATTATTAAGATGGACGATGGTTCTTGTAACCATATGACTTGTGC
AGTCTGCGGTGGTGAATTTTGTTGGCTTTGTATGAAAGAAATTTCTGATT
TACATTACCTAAGGTAGACTTTGATTTTTTATCTAACCATTTGAAATGGA
AGTACGACTCCGTGCTCTAAAATTCAGAAGCAGTTCCTGCAAGCAATGTT
TTTACTCCTGATTGAAAAACAAAACAGAAATAAGAAGCCTGCCACACTAA
TGTATAAATCAGACAATTGATTATGTCTTTAACTAGCATTCCTTCTCATT
TCATTTCAGTCCGTCTGGGTGTACATTTTGGGGTAAAAAACCATGGAGTC
GTAAGAAAAAGATAATGTGGCAAATGGGTACGCTCATTGGTGCACCTGTT
GGTATTGGTCTGGCTGCTGGTGTTGTTTTACCCGCCATGATGATTGGAAT
CCCAATTTATGTTGGTAGAAGGGTAAGTGAAATTCCTGTCTATTAACCAT
AGGGGTTTAGAGGTATTTTTTCTACAAAGTGTAATTTTGATTTAAATGAT
TTGAAACCAACAGTCGTTAAGTCGTTCGTTGGATTCATGGTTTGAATATC
ATAGAAGCAGCAATTTTTCTTTGGAGATCATTCTTCTTCATAGAATCATA
CAGGAGTCTAAGTTTAAGGCCATTGAAAGCCATTGCAAATCTTCCTAAAT
TCATGGTATTCTTCCAAACGATATCATCTTTGCAAATATTGAGATATCAG
TGAATCAAAAAAAATTCTTCTTACAGTATTTTTAAAAAAGAGCAGAGATA
TCGACTATCGAAAAGATACTTCATGGTTATGGTCTGTCAGATACAAGTTT
TTTTTTATATAAGAACAAGCTATATAAGAACATAAGGCTTCGATGGCCTT
GTTGTTAAGAACAATTTTTAGCCCTAAATCCCAAAAAGTGAAGAACATCA
GAAGACTTCAAAAATTTTAGATATTCTTTTAAACAAACGTGTATACTCTC
GACTTTTTTGGTTTTTTCCTTAATTGTTCCCTAAATTCCCTAAAATCACA
ATTTTTAATTTTTGATAACCATTTTGTTTACCCCATAGAAAAAAATCAAA
ACAGAAAGTTGTTTTTCATTTTTTGTTTTTGTCTTTTTAGTTGGAAAAAT
GCCAAAACCTTACGCTAATAAAACCCTTCCATTTATCTCAAATGACGTCA
TTAAGTGACATCATTAGCATGGAAAAGACATTGTCGTCTGACAACTGTCC
TTGTAATTTGAGTGTAAATTATTTTCCTGTCGTAAATTAACCAAAATTGT
TGATTTTAACGTCTTTTCAATAACAATAGTTTTCAATTATTGAGCTAATG
ACTATCTGACGGTCATTAAATTAAATTGACTTAATGAAGTTAAAAAATCT
TTAAAAATGTTGAAATGTAGTGACACCCCCATTCGTTTATTACTTATTTT
AATTGAATTTACAACATCTCTTTTTAAATTCATCTGCAATTTCTCTTCCT
TCTCTAGGGGGTGTAATACTCTCTTTCTCAGGGGGTCGAAAATTGTTTAA
TTGATTAGACTTACTTGTCGAGTACTTTTTGATTAAATCTGTGTGTGTAA
CATTTAGTGCCTTAGAAATTTGGTGCTTTAGAGTCAGCGAAGCCTGAAAA
TGTTATTAACTTATTCTTAATATTTTTGCTATCAAAGCCTTATGTTATTA
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TTATTTTAAAGAGAGTTTTCGGATCAGAACAATATAACCAGATATAACAT
ATCTAAATGTGAAAGATAGCTACATCCAGCTAAAAGAGACTTGCGATAAA
TTTGTTTAAGCTGTTTACACATTATCATGTTGAGGAGAATGGTCTTTTAC
AAGAACAATTTTAGAATGGACAATGAGGCTCAAAAATGCCAAAAGTTAAG
AACAATTTAAGAATATTTCTTAGCCTGAAGTAGCTGAATTTTTAGAAAAT
TAACGGGTTTGACTCTCACAATAGGTTTAAAAAACCTGAAATTTACCTTG
AAATTAAGAACAATTTGAATTGTAGAGTGCTGAAAAGATAAGAACAACCG
AGTCTCGAAAAAAGTTTGTTAGTTCTAATAAAAAAACANTGCTCTAAAAT
TCAGAAGCAGTTCCTGCAAGCAATGTTTTTACTCCTGATTGAAAAACAAA
ACAGAAACAAGAAGCCTGCCACACTAATGTATAAATCAGACAACTGATTA
TGTCTTTAACGAGCATTCCTTCTCATTTCATTTCAGTCCGTCTGGGTGTA
CATTTTGGGGTAAAAAACCATGGAGTCGTAAAAAAAAGATAATGTGGCAA
ATGGGTACGCTCATTGGTGCACCTGTTGGTATTGGTCTGGCTGCTGGTGT
TGTTTTACCCGCTATGATGATTGGAATCCCAATTTATGTTGGTAGAAGGG
TAAGTGAAATTCCTGTCTATTAACCATAGGGGTTTAGAGGTATTTTTTCT
ACAAAGTGTAATTTTGATTTAAATGATTTGAAACCAACAGTCGTTAAGTC
GTTCGTTGGATTCATGGTTTGAATATCATAGAAGCAGCAATTTTTCTTTG
GAGATCATTCTTCTTCATAGAATCATACAGGAGTCTAAGTTTAAGGCCAT
TGAAAGCCATTGCAAATCTTCCTAAATTCATGGTATTCTTCCAAACGATA
TCATCTTTGCAAATATTGAGATATCAGTGAATCAAAAAAAATTCTTCTTA
CAGTATTTTTAAAAAAGAGCAGAGATATCGACTATCGAAAAGATACTTCA
TGGTTATGGTCTGTCAGATACAAGTTTTTTTTTATATAAGAACAAGCTAT
ATAAGAACATAAGGCTTCGATGGCCTTGTTGTTAAGAACAATTTTTAGCC
CTAAATCCCTAAAAGTGAAGAACATCAGAAGACTTCAAAAATTTTAGATA
TTCTTTTAAACAAACGTGTATACTCTCTACTTTTTTGGTTTTTCCCTTAA
TTCCCTAAATTCCCTAAAATCACAATTTTTAATTTTTGTTACCATTTTGT
TTACCCCATAGAAAAAAAATCAAAACAGAAAGTTGTTTTTCATTTTTTGT
TTTTGTCTTTTTAGTTGGAAAAATGCCAAAACCTAACGCTAATAAAACCC
TTCCATTTATCTCAAATGACGTCATTAAGTGACATCATTAGCATGGAAAA
GACATTGTCGTCTGACAACTGTCCTTGTAATTTGAGTGTAAATTATTTTC
CTGTCGTAAATTAACCAAAATTGTTGATTTTTAACGTCTTTTCAATAACA
ATAGTTTTCAATTATTGAGCTAATGACTATCTGACGGTCATTAAATTAAA
TTGACTTAATGAAGTTAAAAAATCTTTAAAAATGTTGAAATGTAGTGACA
CCCCCATTCGTTTATTACTTATTTTAATTGAATTTACAACATCTCTTTTT
AAATTCATCTGCAATTTCTCTTCCTTCTCTAGGGGGTGTAATACTCTCTT
TCTCAGGGGGTCGAAAATTGTTTAATTGATTAGACGCTCGACTTTCTGTC
TTACTTGTCGAGTACTTTTTGATTAAATCTGTGTGTCTAACATTTAGTGC
CTTAGAAATTGGGTGCTTTAGAGTCAGCGAAGCCTGAAAATGTTATTAAC
TTATTCTTAATATTTTTGCTATCAAAGCCTTATGTTATTATATAGTTTGC
TCTTATTAAGAAACGTATCTTATTTGTGTATTATAAACCAACGGGGTCTG
GGATGCCCTTATTAAATAGCTCTCTTTTACTGATATCCTTTTATTTTAAA
GAGAGTTTTCGGATCAGAACAATATAACCAGATATAACATATCTAAATGT
GAAAGATAGCTACATCCAGCTAAAAGAGACTTGCGATAAATTTGTTTAAG
CTGTTTACACATTATCATGTTGAGGAGAATGGTCTTTTACAAGAACAATT
TTAGAATGGACAATGAGGCTCAAAAATGCCAAAAGTTAAGAACAATTTAA
GAATATTTCTTAGCCTGAAGTAGCTGAATTTTTAGAAAATTAACGGGTTT
GACTCTCACAATAGGTTTAAAAAACCTGAAATTTACCTTGAAATTAAGAA
CAATTTGAATTGTAGAGTGCTGAAAAGATAAGAACAACTGAGTCTCGAAA
AAAGTTTGTTAGTTCTAATAAAAAAACAAGAGTGTAATTAATCCTGTGTT
TACTTGTTTGTTTATCAGATAAAACAACACTGTTAATTGGTTTTCAAATT
GATAATTGCGTGTGTTTTAACATGTGTAGTCACTTTGTTTTCTCCCTTAA
ACTTAAGAAAAACCTGGGCCTCAGAGTTCGAGAAATATTGAAATTGTTGT
AATACTGATCTTAGGGCTACACGCTTTTTTTTATGAGAATGTTTTTTTTT
TTCATTCCATCATGGATATTCTTAACTTTTTGGCGAAAATCATCCAAAAT
ATTCTTACGGTATTCTTAGGTTAAGATCAAAATTGGCAATCTACAGGTTA
AAATGCATTAAAAATGGCATTCTTAGGTTCGGTTGCTAAATTCCATGATG
GTGATATTCTTACCATATTCATAATCTTTTGGCCATTTTCATAATGGACA
TTCTTATAAAGTGTATTCTTATTTAAAAAAAAGCGTGTATTTTAAAAAGA
GTTTTGGTGGTGAATAAACTTTGTATATTTAAGAATATCGTGAGAGCATT
CAAGACTGAAGATCCCGAAAAATTAGAAGGCTGAGTCTGGTTTTACGTAG
TACGTTCTTATATAAAAACATGTAATCAGTCACTCATGTAATTTGATCAT
CACTTTATTGAAAAATGTCACGTACACTTTTCAAGAGGACAAACTCGATC
AATTTTAATTCTCTTATTATCAAAATATAAACCTTGGTTCTTGGATCTTC
GTCTAACATCTATTTTATAATTACTGCAATCTGGTTTTAAAGTTTTGGCT
CAAAATAGATTGGTCTACTTAGATCGGAGGATTAGTCTATACCTATATCT
TATTTAAATAATTTTTAAAATTTTGAAATTCAGTTAAGCCTCTTCTTCAA
TCTTACACTATACTCAAAACTGCTCAATCAAAAGGAATAACAAATAAAAA
GTACAAAATATTTTGCTCATAAATTACTCAAAGCTTCTGTTCTTTAACTT
TATCCTCTCCTAAATGTATTTCCTCATAGTTCCCCTTTAGTTTTTAACAA
CAGATGCTGATTTTCAAAATTTTGAAAAATAGAGAAAAATTTCATGATGC
TAGTTAAGTAATCCTCAATGACTAAACCGACACTATAATAATATATGCGT
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TCCTCTAATTCAAACTGGAAGGTCGAACTTTTCAGTTGAAAAATCGAGAT
AGGACCGATGTATTTTTTTCAAGATTCAAATCAAAAAGGTTCGAATTGGA
GATTTTTGAATTTAGATAACAATAAGATATTTTTAACTTTCTTTTTTCTT
CATTTTCCAGATACGCGAGCGATTCGATTATGCTGACAATGTTCACAAAC
GCAATCTTGCCATCACTGGTGGGGTCGCCCTTTCCGTTATCGTTTCGCCC
TTTCTTGCCGCCCTAACTGTTGGCGTTGGAGTTCCGATCGCACTTGGATA
CGTGTATGGTGTAGTGCCAGTCTCTTTATGTCGATCAGGAGGATGTACCG
GTGTGACAACCTCACGGAATGGGAAAGGTGTTAATTTTGAATTTAACGAA
CGAGAAGAAGCATACGGGTCCGGGTCCGTACATAATAAGAACAGTCCGTT
ACGTCGAAACAGCGGCAACAGTAGTATGATGGACGCTGGCAGTGGCAGTG
TTTTGGCAGTCAAAGCAACTATTTCAAAAGGTATTATTTTCATATTTATT
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ATGTACAACTTCACATATCAAAATGAAAAGAGAACCCTCATATTTTTTTA
CTCTGACGTCATTTCGTCCAGTTCTTCCCACGATTTTACACCTTCAAAGT
ATCTAGACTGTGGGTCTCTGAAAAATGGACGTTGTCTAAAACAGTGGACT
ATTGTACGTTTTTCATTTTGCGAAGAAACAAAACTCGCTATCAATACGAA
ATAGAGGTTTTTCATGATTGGCTAAGTTACTCCATTTCCGCCATTATGGA
AGCAAACGTTCGATTTGTGTAAGGGATCGCCTTTTCAAAATTGAACGTTT
GNCGTCTAACATCTATTTTATAATTACTGCAATCTGGTTTTAAAGTTTTG
GCTCAAAATAGATTGGTCTACTTAGATCGGAGGATTAGTCTATACCTATA
TCTTATTTAAATAATTTTTAAAATTTTGAAATTCAGTTAAGCCTCTTCTT
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CAACAGATGCTGATTTTCAAAATTTTGAAAAATAGAGAAAAATTTCATGA
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CTTTTAAAACCCCTGCATCTTAACTCCTATGTATTTTTTTCAAGATTCAA
ATCAAAAAGGTTCGAATTGGAGATTTTTGAATTTAGATAACAATAAGATA
TTTTTAACTTTCTTTTTTCTTCATTTTCCAGATACGCGAGCGATTCGATT
ATGCTGACAATGTTCACAAACGCAATCTTGCCATCACTGGTGGGGTCGCC
CTTTCCGTTATCGTTTCGCCCTTTCTTGCCGCCCTAACTGTTGGCGTTGG
AGTTCCGATCGCACTTGGATACGTGTATGGTGTAGTGCCAGTCTCTTTAT
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GCTTTCACTATTTGTAACAACATGTACAACTTCACATATCAAAATGAAAA
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CTCCATTTCCGCCATTATGGAAGCAAACGTTCGATTTGTGTAAGGGATCG
CCTTTTCAAAATTGAACGTTTCCTTCCGTAATGGGAGAAAATTAGAAATC
AAAAACCTCAACTGTCAACGATTTATTGTTTATATTCCATTATAGAACAA
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ATACATTGCTCCCTTTCATGCACATGACCATGACGTCGAGTCTAATGCAT
CACTCATTCCAGCACCACGTAGCACTACTGTTAGCGTCACATCTAGCCTG
GAGAATGTACACATGAAATCTGCGAGTAGCCACAATGTATGTGCTAGTCT
ACCGGAAGTGGAGAACCAGCCGACCTTAGAATCAAGTAGTTCGAAAGGAG
AGAGTTTGAGCAGCATTGTTCAACAGCATCCATCTAGCCCGACTATCACG
AGCTCAAACGAAAGCGAACTAGCTACGCAACAAATAGTCGCTCCGTGTGC
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GCGATCTTTAAACAATAGAATTAGTCTCGCTATTTTAGGGTGTTTCCTTG
CAAAAGAATTATCGCTTCTGTATCTTGATTTGATTGGTTGGCCAAATGTT
GAACTGTTCGGCTCTCTGTAACAGCGAATTCTTTTCCAAATAAGATCTAT
AAAAATTGGTCCTGAAGTACAGTAGTATTCACAGGTTATAGTACAAAAAT
ATTTTTTAGGTTCGGAGTTTTTTCATTCTTTTGAGGGAAAATATTCTTCT
AATATCTTGAGTATTAAAGCCAACAGTAAATGTTCTAGAATATTATAAAA
ACGATGACTTTCAACCTGATTCGCCCTCAGTTGTCTCATAATACCATCAA
AGCCAAAGGAATCACAATTTCTTATTTTTGAGTTAAGAAACGTCAAACGC
GTCAAAACAATAGTTCTCTTTCGTTGATTATTTTCTTCAAGGCGAATTTT
TTAAGAATTTTCCACTAGCCTCTGATGGGGTCGGGTGGTAGTAAAGTTAA
ACTTAGTCTAGTGAAATTTTGTGAATAATATGAAACTTGTACATAAATTT
TATTAATATTTTTTTCAACTTGACGACTTGTGTTTTTTCCTTTTTTTTTG
GTCTTTAGGCATGTTCTTGATTTCTTACGTTTCCGTCATCCTATAAAAAT
ATTCAGGTTTAGATGCTTTTGGGGTGTTTAAAATTCGTATTATATTTATT
ATTTCTGAAACTTGAAGCGCGTATTGGCTCTTAAGGTTTGTCCTAATTTC
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TTCAATTAAAGGTTTTGTTTTAAATAAGAATGCTATCGTTTACTTACTCG
TCAATTTTAATTTCCAAGCTTTTCACATTGAATTGACACAGATCTGGAGC
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GAAACGGGAACTCTTATGTAAAAATAAAACGTTTAAAAGGTATGATTTGA
TTAATATTTGTTTCTGTATTATCTATGGTTTTGTGCTTCAGAAATTCACC
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CGAATAATTTCCACGGGTGGGCATGTTTTGTTCAAACTTTTCAGCGAAGG
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TGTTTTTGTTTTTCTACCCCATGTAAATAGAGAGAAACTCGAGCCGCGCC
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ACCAGAGTCTCGTTGGAAAGATATTTCTGAGTGGATATACTGTACTCTAT
AAGTGGGCGTGGTCTTGAATAAAACAATAACTTCTACTTTATTGTCGATT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00030501-exon-sc0000824-1575043694:129512..129974 | TCONS_00030501-exon-sc0000824-1575043694:129512..129974 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00030501-exon-sc0000824-1575043694:123695..124064 | TCONS_00030501-exon-sc0000824-1575043694:123695..124064 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00030501-exon-sc0000824-1575043694:119930..121979 | TCONS_00030501-exon-sc0000824-1575043694:119930..121979 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00030501-exon-sc0000824-1510915933:129512..129974 | TCONS_00030501-exon-sc0000824-1510915933:129512..129974 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00030501-exon-sc0000824-1510915933:127126..127288 | TCONS_00030501-exon-sc0000824-1510915933:127126..127288 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00030501-exon-sc0000824-1510915933:123695..124064 | TCONS_00030501-exon-sc0000824-1510915933:123695..124064 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00030501-exon-sc0000824-1510915933:119930..121979 | TCONS_00030501-exon-sc0000824-1510915933:119930..121979 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00030501-exon-sc0000824-1491911889:129512..129974 | TCONS_00030501-exon-sc0000824-1491911889:129512..129974 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00030501-exon-sc0000824-1491911889:127126..127288 | TCONS_00030501-exon-sc0000824-1491911889:127126..127288 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00030501-exon-sc0000824-1491911889:123695..124064 | TCONS_00030501-exon-sc0000824-1491911889:123695..124064 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00030501-exon-sc0000824-1491911889:119930..121979 | TCONS_00030501-exon-sc0000824-1491911889:119930..121979 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000824 | supercontig | sc0000824:119930..129974 - |
Blast
BLAST of TCONS_00030501 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: RN19A (E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A OS=Homo sapiens GN=RNF19A PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 437.958 bits (1125), Expect = 1.543e-137 Identity = 202/298 (67.79%), Postives = 235/298 (78.86%), Query Frame = 3
Query: 3 HPSDVKMIFSDDNFYAKYEEFTLRRALVGIPDIRWCPAPDCGYAVIASGCASCPQLKCMRAGCNYEFCYHCRQLWHPNTTCDLARMQNQFEIRSLT------SSERKSSNMQEDIKPCPKCMALIIKMDDGSCNHMTCAVCGGEFCWLCMKEISDLHYLSPSGCTFWGKKPWSRKKKIMWQMGTLIGAPVGIGLAAGVVLPAMMIGIPIYVGRRIRERFDYAD-NVHKRNLAITGGVALSVIVSPFLAALTVGVGVPIALGYVYGVVPVSLCRSGGCTGVTTSRNGKGVNFEFNEREE 875
+P D+++I SDD KYEEF LRR LV PD RWCPAPDCGYAVIA GCASCP+L C R GC EFCYHC+Q+WHPN TCD AR + +R T S ++S +DIKPCP+C A IIKM+DGSCNHMTCAVCG EFCWLCMKEISDLHYLSPSGCTFWGKKPWSRKKKI+WQ+GTL+GAPVGI L AG+ +PAM+IGIP+YVGR+I R++ D + HKRNLAI GGV LSVIVSP +AA+TVG+GVPI L YVYGVVP+SLCRSGGC GV+ NGKGV EF++ +
Sbjct: 184 NPHDIRLILSDDVLMEKYEEFMLRRWLVADPDCRWCPAPDCGYAVIAFGCASCPKLTCGREGCGTEFCYHCKQIWHPNQTCDAARQERAQSLRLRTIRSSSISYSQESGAAADDIKPCPRCAAYIIKMNDGSCNHMTCAVCGCEFCWLCMKEISDLHYLSPSGCTFWGKKPWSRKKKILWQLGTLVGAPVGIALIAGIAIPAMIIGIPVYVGRKIHNRYEGKDVSKHKRNLAIAGGVTLSVIVSPVVAAVTVGIGVPIMLAYVYGVVPISLCRSGGC-GVSAG-NGKGVRIEFDDEND 479
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