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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00030155 ID=TCONS_00030155|Name=TCONS_00030155|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1698bp AATAGGTGGAGGTATCACATAACAGGTCTATGAgatgtttcattttttaa ttcaattgatATAAATCACATTGGACTGCAGTTCCTTTGATACTGTTACT TTGTTTTACCGGACACAAACACACATAATGTCATTAATCGGACAGTTAAG AATGGCTGAGACGAAGATCGATTTCGGAACTCAACAGGTGCTTTTAGCAG GCCAACAGAATATTTGCAGATGTATTAGCAAGCCTCCAGCCTACAGTAGC AGTAACGACTGCAATATGAGTGATTCTAcgacaaacatcaataacaataa caacaacaacaacaacaacaacacagGACCAACAGCTCCAACAAATTGCG ACGACCTTATCAACAACAATAATCCAGAATATCCTAACTCACAAACAGCA ACACCAACTTTCCATTTCGATCATAATACCATGGATCTTGGGGCGCCACC ACCTTATGCTCCACCCTACGCCACAGCTCCACCTTACTATCCAACGACTA TCACTATGAGTCCAGAGCAGCGTCGCCTTGTCAACACCCATAACAACAAT GATGAGGAAAAAGAAGATTTGGATTTCTTCAAATATACCATCCCCTGCAA ACGCATCGCAGGATATATCTCAGTGTGTGTGGCCGTGGTAGTAATCGTGG TCATACTGTTACTATTGATCTTTGGAAAGATGTAAGGAGAATAGAGAGAG AAAAAAGGAAGTGAGTCTTGATTTTTTAGCTTCCAATTCCACTGATTTAT TAGAATTGGATTTTTTGATTCTCTCTTTCTTAGATAGTTAAGCCGTCGGA ATCTGAAGGGAAATCGATTTTGAGAATTGTGACGTGAATTATAGAAGATT CTACCAGAAAGATGCCGTTTGGGAATGGTTTTTTAGATGATAGACCTTTC AGACCCAACCGTCTACTTGATTTTGATGATAACCCTAGTTTAATGGGAAT TGGTGGCCACAGAGGCCGTGGAGGGCGGGGAGGGGCACGAGGCCATATGA GAGGACGTCAAGGGCGATTTCAACACGATCGCCATTACATGGCTCATAAT AACAGGCGGGTTGCTACGAACATTTTAGGGCGTAGTTCTGCTCAACAACG TTGTAACGATGACTCGACAATACCTTTGAATGCTGAAACGAATGTCTGTT GCTTGGTTACTAAGATTGATATGAACGGCAACCCCGTACTTGTCTGTAGG AATATACAATGTACCAATATCTTACATACTAAAGACAATATTCAGTATTA TGACCAACCTTTATCAGCAGCTATACCACCACCTGAGTATCAAAGTGGAC CGCCCTCCCCGAACACCCATCCCGCCCTTAATAATAATTCCCGCCCACCT TTAACGCaaatgaataatttgaaaaatttgtctNTAATAATTCCCGCCCA CCTTTAACGCaaatgaataatttgaaaaatgtgtcaacAACGGCACACCA ACTAACCGAAGAACATGTGGACCATTTTGGGAAACTTTACGGGTGTAAAA CAATGACCAATATAATTGTCATGGTATTAGCAGTAGTTTTCTTCGCaata tttttaacattattagttTTACTGGCCTAGCTTTTATTTCCTATCTAAGT TTTCCATATGAGTTCAGAACATGAATAATTACTTTTTCATTTAAACTTTC AGCAATTGAAGTCTGAGCGACCTTCGCTTAATTCGAACTATAAGTatc Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000796:100081..110093- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00030155 ID=TCONS_00030155|Name=TCONS_00030155|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10013bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000796:100081..110093- (Clytia hemisphaerica) AATAGGTGGAGGTATCACATAACAGGTCTATGAGATGTTTCATTTTTTAA
TTCAATTGATATAAATCACATTGGACTGCAGTTCCTTTGATACTGTTACT
TTGTTTTACCGGACACAAACACACATAATGTCATTAATCGGACAGTTAAG
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ACAACCTTTGTCCAAAGTTACTTTTATCTCATAATTACACCCCTGGATTA
GTGACCTGGTGGGAATTTTTAAGCAAGTAAACACAAACAACAAAGCCTTT
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TCTAAATTCTTTAAATAAGCTGAAGATTTTATTTGAAATAAATCTTGAGG
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TATTCTTTCACGGGCGAAGGAAAAGGTTATAAATTTTTAGTTTCCATGAG
TTGCTAGAGAATCATTTTTGTGCTAGTGCCAAATGAAAGAAAGTGTTGGA
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TTGTTTTGTTAATTTTGTATATTTAAGTGAATGAATTTTAAGAACGCCGA
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TAGCTTTGCACAATATTTGAATTGAAAAAGTATGTATGCGTTGTTGCCTT
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AGACCTTCAGGGGTACTTAATTGATGAAAGTGGATCGAGCCATCAGACCG
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TCTGATATAACAATGCAAATGACATTATGAAGACTAGGCGGTAAACCAAA
AACATCAAAAATAAAATCGTTCTACAGCCCTTATATTCAGGCTATTTTAT
TTTAGATAAAAACGCACTTAATAAGTTAGAGTCAGTGAGAGGGCTATGGA
GATCTTAAAGGAATTTAAAAAATGGTGTGAAACAAAGTTTAAATTATTTA
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CTATTCCCAAACAGTTTCCCCTATTCAGAAATATTGAATAATAAATTTTG
TTGTCCATTCAGTTAACTGTGTATTAGTATTGAAGTTTTATTAATAATTA
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TTTGACAAAATATTCAAGATATTGGTCATCTATACTTTATATTGATTGAT
GACATCGCATTTTGTAATTTTCTGGAGTTTTGAAATGAAGCCGGTAAGTA
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TGTCTCAATGAGCTGTTCCGGAAAATTTGCGAAAAAATCCTTGGCAAAAT
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TCTAAGAATAACTTTTTACTCTCTGGAAAAAATAATAAATACTCCTTTAG
ACCCTCCTGGAAATTCTTCTCGTATCACCCCCTAGGAATGTTCGTCCTTA
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GAACTTCTATTATTCGAATCTCTCAATAATTCGAACTTTTTTCCAGTCCC
TATCAGGGAGAAACCTCTTAAAATACTTTCTATAACTCGAGCAAATAAGA
ATCACCATTTGAGTTCGAATTAGCAAGAGTCAACCTGTAACTGGGATCGA
AGTTTTAGGTCCGAAGGACAAAAATGCAACGAATTTCGTTTCAGACCCAC
CCCAGCTGACACATAACGTTGTTTCAACGTTCATGTAACTCTATATGGAA
GTTAGATGAACGTTTTAAGCAAGCTGGGCCGTCTCCTTACCAGCAAAGTT
TTAGAGGTTTTAGAGGTTCTTACATTGATATCGGGCTTGGGAATTCAAAA
AAAAACAAAAAAAACAGTAAAATTTGTAAGAAAGAAGGAGAAATATATTT
GGGGAGAATTCGAAATTTTGGTAAAATTCACAACCACTTTTGCAAATAAT
TTGAGAGGTCTTTTTTTAAGCTTCAATATGGCACATCCTATAATGCTTTT
GCGTATATGATATTATGAGACCTATCTATTATCAAGTTTCTTCAGTCGGT
TCAGTCCTCAAATTCCTTAAGGAAAGGATAGAGAAAACCTTTGTTCGATG
TAACCTATGATGTTATTTATTTGCAACTATGGCACAAGATATTTCGATAA
TTCTAAGAGAAATTTGTAACATGGGCATTTATTAAAACCCCACTGAAACT
ACAAGTGACACAAACACCCCCTTCTCACAGACCCGTTAGGATTTTTCCAG
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AATGTTGTTTTCTGGGTGAGAGATTTGAATTCCATTGTTTTCGAACCAGA
GTTAGTGCGGATAGAAAAAATAGCACAATATTTTGCAGTGAGGATTTACT
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GGGACGATATTCCGGCTAATTTTTCCAGTGGGAACGGGTCCCAGTGGGTC
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GACCGATATTAAAGATTGTCCTAGTTGGAAACAACTGGGTACTAAGGCTA
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CATCTGCTATTTCGAAAAAAAAATTCTTATTTTGTGGTTTCTGACTTATC
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GGAAAAATATTCAAGAAAAAAATACACAAAAGAGAAAACTAAAATCAACA
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ATTGTAAAATATTGTTGTCAAAACCCAGAAGGGAACCGTACAAGATCAAA
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ACGTTTTTGGACCAAAAGATTTATGAAAATTCAAAACATTTGAAGCAATA
AAAAACTTGGTCAAGGAGGCTCTTGTGTGTTGACGTCATTTTTAATGAGA
GACATGCCGATTGTTTTGTTGTGAATCATGATGTTAAGGAAATGAAATTT
CAATTCAACTTCATGTACTGAAACTCCGAACACGTAAGATTAGATGTTTT
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TACAATCTAAAGTAATGAATGTGGTATCACTTTTACACGGTTTCACTGGT
TGAGAAAATTAAAAATCCTCTTTTCAATGGTTGGTGAATAAAGCTCCCTT
TCATGCATTTTTTGAATGAATTTTGGTGGGAGAGCCCTAAAAATCAAATC
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ATCCGGCTACTAAAGTCTGCCATATTGATTAAGAGGATTTTTAATTTTTA
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ACATAAAAAAGTACTTTCATAGTAATTAAAACACTATCAGAATTTCATAA
TCTAATTCCAATAGGATTGCTAAAGCAAAGAAAGCAAGCAATCTTAAAAA
CATTTTCAGCAAAAAAAATCCAAAATAGATTGGCTTAAATGTTAATATGG
ATCAGATTTAAACAAAAAGAAACAATTCTAGCCAATGAAAGCGTANCCTC
TTTAGTAATTAAAACACTATCAGAATTTCATAATCTAATTCCAATAGGAT
TGCTAAAGCAAAGTAAAAGCAAGCAATCTTAAAAACATTTTCAGCAAAGA
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ATCGGATTGAATATTTTAAATACGTCAAAAAGAATAATCTTAAAAAGGCA
AAAAAATGAACGAGGAATAATGGGCCTGGGGATAGTTAATGCTATCCTTT
ATGTTACCAGTTCAGCTTATATCATTATTGTTTTTCTTTGATCTCTCTAT
GAACCTTGCAGTAGCAGTAACGACTGCAATATGAGTGATTCTACGACAAA
CATCAATAACAATAACAACAACAACAACAACAACAACACAGGACCAACAG
CTCCAACAAATTGCGACGACCTTATCAACAACAATAATCCAGAATATCCT
AACTCACAAACAGCAACACCAACTTTCCATTTCGATCATAATACCATGGA
TCTTGGGGCGCCACCACCTTATGCTCCACCCTACGCCACAGCTCCACCTT
ACTATCCAACGACTATCACTATGAGTCCAGAGCAGCGTCGCCTTGTCAAC
ACCCATAACAACAATGATGAGGAAAAAGAAGATTTGGATTTCTTCAAATA
TACCATCCCCTGCAAACGCATCGCAGGATATATCTCAGTGTGTGTGGCCG
TGGTAGTAATCGTGGTCATACTGTTACTATTGATCTTTGGAAAGATGTAA
GGAGAATAGAGAGAGAAAAAAGGAAGTGAGTCTTGATTTTTTAGCTTCCA
ATTCCACTGATTTATTAGAATTGGATTTTTTGATTCTCTCTTTCTTAGAT
AGTTAAGCCGTCGGAATCTGAAGGGAAATCGATTTTGAGAATTGTGACGT
GAATTATAGAAGATTCTACCAGAAAGATGCCGTTTGGGAATGGTTTTTTA
GATGATAGACCTTTCAGACCCAACCGTCTACTTGATTTTGATGATAACCC
TAGTTTAATGGGAATTGGTGGCCACAGAGGCCGTGGAGGGCGGGGAGGGG
CACGAGGCCATATGAGAGGACGTCAAGGGCGATTTCAACACGATCGCCAT
TACATGGCTCATAATAACAGGCGGGTTGCTACGAACATTTTAGGGCGTAG
TTCTGCTCAACAACGTTGTAACGATGACTCGACAATACCTTTGAATGCTG
AAACGAATGTCTGTTGCTTGGTTACTAAGATTGATATGAACGGCAACCCC
GTACTTGTCTGTAGGAATATACAATGTACCAATATCTTACATACTAAAGA
CAATATTCAGTATTATGACCAACCTTTATCAGCAGCTATACCACCACCTG
AGTATCAAAGTGGACCGCCCTCCCCGAACACCCATCCCGCCCTTAATAAT
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AATAATTCCCGCCCACCTTTAACGCAAATGAATAATTTGAAAAATGTGTC
AACAACGGCACACCAACTAACCGAAGAACATGTGGACCATTTTGGGAAAC
TTTACGGGTGTAAAACAATGACCAATATAATTGTCATGGTATTAGCAGTA
GTTTTCTTCGCAATATTTTTAACATTATTAGTTTTACTGGCCTAGCTTTT
ATTTCCTATCTAAGTTTTCCATATGAGTTCAGAACATGAATAATTACTTT
TTCATTTAAACTTTCAGCAATTGAAGTCTGAGCGACCTTCGCTTAATTCG
AACTATAAGTATC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| TCONS_00030155-exon-sc0000796-1575043694:109848..110093 | TCONS_00030155-exon-sc0000796-1575043694:109848..110093 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00030155-exon-sc0000796-1510915933:100081..101532 | TCONS_00030155-exon-sc0000796-1510915933:100081..101532 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00030155-exon-sc0000796-1491911889:109848..110093 | TCONS_00030155-exon-sc0000796-1491911889:109848..110093 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00030155-exon-sc0000796-1491911889:100081..101532 | TCONS_00030155-exon-sc0000796-1491911889:100081..101532 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000796 | supercontig | sc0000796:100081..110093 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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