TCONS_00028649 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00028649
Unique NameTCONS_00028649
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length851

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00028649 ID=TCONS_00028649|Name=TCONS_00028649|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=851bp
aaaaaacaaaagaagaagagATATTTCTTTCCGAAAGAAGAAATCAGCGA
TCAGGATTCGGCCACCGAGAGCATCGATCTCAAACAGAAACGAAAATCGA
AACAAGATTCAGATGGGCCAGCATCGAAGAAAGCCAAAGCTTTTGAAGCA
TACTTGCAAAAGAAGACCTGCTTAGCGTATCGTAATCTACCAAGATGTCT
AGATTGTAACCAAGACTACAGGGAAGATGAAGAAAAACACCAGAAGAAGA
ATGATGAAAATGAGTTGACTTGCCGTTTCTCCATGTTCAGAACTTGGACA
TCAACCAACAGGAtcacttctttatttaattattcaactAGAAGAACAAT
GNttttttcagtccaaatatGAAAAACATCAATACATGACTTATGAATGG
CTCTGAACGGCAACGACATGAAGTTGTGACGCTATGGTCTCCACGTTTGC
ATCGTCTTCACGCAACTGATTTCATCCACACACTTTGTATCATCACCACT
CGCGCGCCCAATGTGAAACAAAGGATACAATGTATCATCTCCACTTGCGT
ACCCCATGTGAAACAAAGGATACGAGCACGCGCCAATACAAAATGAAGAC
GTTCTACTGCTGTTTACATTTGATCTTTCGCGTGGGAGAGTTTATGGTAA
AATAATGattaatgaataatgaaaaatgaaattttgccgtGTCAAATTTT
GCCGtgtcaaattttgaattcattgTAACGGTAAACTAATACCTAACTTC
CCTTCGCCTTTCAGTCGAGTACTGAGTGATCTTTTCAAGTCATCtctata
caaaaaagaaaagcaaaaagaccTATCGAATTAGAGTTCCACCGCAGAGT
A
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000695:125340..139226-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00028649 ID=TCONS_00028649|Name=TCONS_00028649|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13887bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000695:125340..139226- (Clytia hemisphaerica)
AAAAAACAAAAGAAGAAGAGATATTTCTTTCCGAAAGAAGAAATCAGCGA
TCAGGATTCGGCCACCGAGAGCATCGATCTCAAACAGAAACGAAAATCGA
AACAAGATTCAGGTCAGGGCATTTTTTATTCCTACCATACTTTTAGGCTT
CATTCTAAACTTTTCGTTTCAGAAATATTCGGAACCTTTAAAGTGTTTCC
GTTGGTCTTGGTTATCATAATAAATGCATTTTTTTACGATGACATTAATT
AAGTGTAGCAACACTTTCACTGTAATTTATGAGAAATCTTAAAATATCCG
CCGTTGACACTCATATTGTTGACCCTGCATTACAGTTGACGCATTTCTAA
TTCGATTTTGCGAGAGGTTCTTGTTGACGGTGACTTTCAATATCATCGAA
AAATTCAGCGTATCGAATAGTAGAACGTCGAAGAAGAGAGCGTAAACTGT
ATTTATTTTAAAGGGATCCTCCGGTCATTTTTCAAGTTTGGCTTTGAATT
TTCGTTTTATGAATATGAGAAGGAAAATCTATTTCATAAAACGTAAAAAT
CTCTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATAGATTTGGGCAGGTA
CCTTATCTTCAGTGCATGGAAAACCTCCAAGTGTGTTGTATAGACGTTTA
AATTGAGCTTGCGAAGACCTTTTTGGAATTCCGCATTAAAGATAATCTTC
TTCAAGGCTTCGTGTGGTTTAGATCCTGCCTTTAGCCAATCATACTGATG
TGATTTGTCATGGGGTGGGGAACTTGTGTAGTGGTTTCTTAGTTCGTGTC
TGTCAACAATGTGAACAATCACGCTGTTAAACCGCTCTGTTAGCTCTTCT
CCGTTTTCGCTGCAATTTTGTGCCGCCCAATAAAAATGATTTACTATCAT
TGGAGCCCAATCTGCCAGCTTCTCGTATCATTATCGAACTATATTCAAAG
GCAAAATATATTGCAACCGTTCTCGTATTTCCCGTGATTTTTATCGCAAA
ACACCCATGAAAATGAAAATGATGAAGTTATAAGAAAGCTTCAGAAACAA
GGTTTTTCATTTTTTGAAGGGAGAAAAAAAAAAGAACATCAAATAAAAAT
GAAAACGTTATTGATAATCTCAGTCCAATTTACTGGAATTCACTGTAAAA
TAAGCTTTTCAACTTCTTATGTGACAACAATCTACGTCACAACCCATTAC
TTTCGGCACCCGGTTAAAAATTACGTTTTAAAACAAGATGGCGACTATTG
ATTTTTCTTTCTCTATTTGTTAAACAAAAAGTGCTCATAATCTCCTTATG
TGGAGCTTTTGAGGGAAAAGAGAAACGTTTTCGTAGATGTTTTTATGCTA
GCAGTGATATGAGAGGAACTTTAAAAAAGGCCGGAGGGTCCCTTTAAAAA
GCCCCTCCTAACTTTAGCAATATGTTAATTTGTTTTATACAGATGGGCCA
GCATCGAAGAAAGCCAAAGCTTTTGAAGCATACTTGCAAAAGAAGACCTG
CTTAGCGTATCGTAATCTACCAAGATGTCTAGATTGTAACCAAGACTACA
GGGAAGATGAAGAAAAACACCAGAAGAAGAATGATGAAAATGAGTTGACT
TGCCGTTTCTCCATGTTCAGAACGTAAGTACAGTGGTAGATGTCCTGTAA
CTTGAGTATACACATACAGGGAATGCAATTCTGTTCGAATTGTAGAGAAT
TTATGGAGACAAACTCGCAAGAGTTTGATTCATGTTAATTGGAAAGAAGA
GCTTTCTCGATTCATGGAAAAATTAGATTTTAGAGACTCGAGTTCATTAT
CTTCTATATACTAAAAGTCTAATTCTCTATGAGCCGTGGGGTGGCCATTT
TGATTTTTTTCCAAGTCTCTTTTTAGATCGAGCTCCGAGCGGGAAAACAG
TACAGTGTTCTTTTTTCGAAGCGGAGTACGTTTTGTTTGAGACACGTCAC
CGGAAAACATGCATACGGTTCCCTGCCGATCGGGAAACGTCGCCCCCGGT
TCCGAAGCGTATTTTTGATCGGACCATACTGCTTTCTAACAGTCAAAATG
AAAGATGGCGGCAAAAATAAACAACTGGTTGCTACTGCTCTTTTGCTATT
TTCTTTGGTTTTTATGCTTTAATGAGTTGAGTTGGATCATGATTTTTGTT
TGATTGTTACAAGAAATGGTTGATGATGAAGTTTTATTATTCTTTGCTGG
ATTTGATGCTTCGTTTGATGTGGCATGAGAGATGCAATGCAATCTCTTGC
ATCTTGAATTCTTGAAAAAGAGGACACTTTATCAACTTTGATCATGCTAG
GTATATTTGAAAAATTAAACTGCCTCACTTTGTAGACCGATCGACCGCCT
CACTTTGTAGACCGACCGTCCGCCTCACTTTGTAGACCGACCGACCGCCT
CACTTTGTTAGACCGACCGACTCACTTTTTAGACCGACCGACTCACTTTT
TAGACTGACCGACTCACTTTTTAGACTGACCGACTCACTTTTTAAACCGA
CCGACTCACTTTTTAGACCGACCGACTCACTTATTAGACCAGCCGACTCA
CTTATTAGACCGACCGACTCACTTTTTAGACCGACCGACTCACTTATTAG
ACCGACCGACTCACTTATTAGACCGGCCGACTCACTTATTAGACCGACCG
ACTCACTTTTTAAACTGACCGACTCACTTTTTAAACTGACCGACTCACTT
TTTAAACCGACCGACTCACTTTATAGACCGACCGACTCACTTTTTAAACC
GACCGACTCACTTTTTAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCG
GCGGGTGCGACGCCGGGTGACGGCTAGTCTATATACTAAAAGTCTAATTC
GTATTGAGCCGTGGGGGAGCCATTATGGATTTTTGAGATGAGGGTTCGAG
AGTTACGTGACCGATTTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGATGGTTGAAAACGA
AAGCGAAAGTGGTCAGGGGAAGAGTGTGAAAATTAGCGTTTTTTTAAAGA
AGTCGTTGCAGTGCAAATCTTTTGCAAATTTAAAAAGCCACTTTCCCGTG
GAAATAATTGACGTTTTTTGGTTTTTTGGGACCCTTCGGGCATAAGCTAC
CCGTTGACCGCAAAAATTCCGAAATTCGCGAATTGACCGTTGACAACATT
AGGGGTAAAGGGACCCAATGACGTCACAGATTTAGGAAAAACNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATGGAGAATAAGATGGAAGGGTTT
ATATGGCTTGAGTGTGACTTTAAAATTTGGCTGAATTTTTAGGCGTTTTC
AGTTGATGACGTCATCAAAACAGGAAGAATGCGATATCTCGAGATTGGAT
AGGAGCTGGGAAGTCGTTGACCCCTCATTTGATCGGAAATTTAATGGATA
ATAAGTTGGGAGGGGTAATAGTTGGTATATAGAAACTTTCAAAAATAAAT
ATATTTAAATTGAGGCTTTTTTGGTCCGATGATGTCATCAAAACCTTAAA
AATACAATATCTCGAGTTTGAGAAGGATTTCAGTAATGATTGACCCCTCA
TTGGATCGGAAATCATCGATACAATCTTTTCAGTCAATGAAGAAATACTT
GCAGTGAAGTGAAAAGTTTATTACCCTTTCGATGACGTCACTTAGGTCCC
AAATGACGTCACCAAACATAAAATATGCGATTTTTCAATCTTCGATTATT
GATAAGTGGTAGTATTTCGTTTTTTCGGCTTAGAATTCAAGCTTATTACC
CTCTCCCACCATCCAAAGGGCTTTTGATGTGTTCAACAACACTCTACTCG
GCGGGTGCGACGCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNATTGACGTTTTTTGGTTTTTTGGGACCCTTGGGGCACAAGC
TACCCGTTGACCGCAAAAATTTCAAAATTCGCGAATCGACCGTTGATAAC
ATTAGGGGTAGACTAGTAAACTAGTCGTTGTAGGTTTTTGAGAATCCATC
CAACTTTTTTGACTAAATGATATTTCATAGTAACATTAAACATGAGAACA
TATAAATAAATGAGCATTTCCAAAAATGCAATAAACGGAAAGAAAAATAA
ATGCAATCCCGCACGGGTCAGACATACAGAAATCTGTATGTCTCTCCTTA
CGGTTTTAGGTGAAGAAAAAAAGGCGTTGGAAGAAGCTTCTAGTCGGTTA
TTTTCCTTTTCTCTCACGCGCGCTGAATATTTAATTAGTGTTTACATTAT
TTGATTGACAGTTTTATTATAAGTAATAACCGACTAGTTTACTAGTCTAC
ATTAGGGGTAAAGAGACCCAATGACGTCACAGATTTCTGAAAATCTTCAA
AATGCGATATCTCGAGTTTGAAAAGGAGTTGGGAGGTCGTTGACCCCTCA
TTGGATCGAGAATTTTATAGAGAATAAGATGGGAGGGGCTATGAGGCTTG
AGTGTGACTTTAAAATTTGGCTGAATTTTTAGGCGTTTTCAGTTCATGAC
GTCATCAAAACAGAAAAAATGCGATATCTCGAGATTGGAAAAGAGTTATG
AGATGGTTGACCCCTCTTTGGATCGGAAATTTAATGGAGAATAATTTGGG
AGGGGTAAGAATGGGTATTTAGAGACTTTCGAAAATAAATATATTCAAAC
TGAGGCATTTTGGGTCTGATGACGTCATTAAAACCTTAAATTCTGATATC
TGGAGTTTAAGAAGGATTTAAGCAATGATTGACCCCTCATTGGATCGAAA
ATCATCAAGAGAATCATTTCAGTCAATGAAAGAATACTTTCAGTGAAGTG
AAAAGTTTATTACCCTTTCGATGACGTCACTTTATGGCCCAAATGACGTC
ACAAAACATTAAATCTGGAATATTTTTAGTTTTCAACATTTAAAGTGGTA
ATTTTTCGTTCCTTGGGCTTATAAATCAGATCTTATTACCCACCCTCGCC
ATCCAAAGGGCTTTTGATGTGTTCAACAACACTCTACTCGGCGGGTGCGA
CGCCGGGTGACGGCTAGTCTATATACTAAAAGTCTAATTTTCTATGAGCC
GTGGGGTGGCCATTATGGATTTTTGAGATGGGGGTTCGAGAGTTACGTGA
CCGACTTTTTGGTTGGATGGATGGTTGGTTGGGTGGTTGAAAACGAAAGC
GAAAGTGGTCAAGGGAAGAGTGTGAAAATTAGCGTTTTTTTAAAGAAGTC
ATTGCAGTGCAAATCTTTCGCAAATTTAAAAACCAACTTTCCCGTGGAAA
TAATTGACGTTTTTTGTTTTTTTTGGGACCCTTGGGGCATAAGCTACCCG
TTCGCCGCAAAAATTCCAAAATTCGCGAATTGACCGTTGACAACATTAGG
GGTAAAGGGACCCAATGACGTCACAGATTTGGGAAAAACTTGAAAATGCG
ATATCTCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NCAAAATACGATATCTCGAGTTTGAAAAGGAGTTAGAAGGTCGGTGACCC
CTCATTGGATCGAGAATTTTATGGAGAATAAGATGGCAGGGTTTATATGG
CTTAGGTATGACTTTGAAATTTGGCTGAATTTTTATTTAGGCGTTTTCAG
TTGACGACGTCATCAAAACAGGAAAAATGTGATATCTCGAGATTGGAAAA
GAGTTTTGAGATGGTTGACCCCTCATTTGATCGGAAATTTTACGTGGAAT
TAGTTTGAAGGGGTCATGGTGGGTATATAGAAACTTTTGAAAATAAATAT
ATTCAAATTGAGGCTTTTTTTGTCCGATGACGTCATCAAAACCTTAAAAA
TACAATATCTCGAGTTTGAGAAGGATTTCGGTAATGATTGAACCCTCATT
GGATCGGAAATCATCGAGACAATCTTTTCAGAGTCAATGAAGAAATACTT
TCAGTGAAGTGAAAAGTTTATTACCCTTTCGATGACGTCACTTAGGTCCC
AAATGACGCCACTTTTTCAAGCTTCGATTATTGATAAGTGGTTATATTTA
GTTTTTTCGGCTTAGAATTCAAGCTTATTACCCTCTCCCACTATCCAAAG
GGCTNCTACTGCAGGAGCTTCGAAAATTAAAAGTGATGTCAAAAAATCGA
ATGTTTAGAGCCCGAAAACCCGGGCTCAAAACATTCGAAAAAGTCGCAAA
GTGGAATAGACGTTAATTGCGTAAAAAACGCGNACACTCTACTCGGCGGG
TGCGACGCCGGGTGACGGCTAGTACTATACTAAATGAAATTTTGAAAAAT
GTGTGTAACGCAAGATGGTAGCTGAGCTGTTGTTCTCAAATTTTGCCAGG
GGGTTGATTCGAGTATGAAAGAGGGATTTCGTGCAGTTTTAAGACAAAAA
TCTTATTGTCTTTCGAAAAAGCAGTTGATGATACGTCGTGGTTTCAATTT
TATGTTTAAAATTTCTTTTTCATCTATGATTGAGCGTGAAAATTAGCACT
ACCTTCCCATAGAACCCCCGTCCAAAAAAGGATTTGTTCGAATCGAAGAA
GCCCCTACAGTGACTTTTTAACGAAAATAATTCTGACGTCAATTATTCTA
AACATAATAACTTTAGAAGGCGTGGCACTTTTTACGAAAAAGTTGTAAAA
TATAGTTTTTAAATAGTGAATGTGCAGGTAAAAAACGGAGGTCTTCTGTA
AATTGGTTGTTACTCACCATTCACAATAGTTGGACATCAACCAACAGGAT
CACTTCTTTATTTAATTATTCAACTAGAAGAACAATGNTTTTTTCAGTCC
AAATATGAAAAACATCAATACATGACTTATGAATGGCTCTGAACGGCAAC
GACATGAAGTTGTGACGCTATGGTCTCCACGTTTGCATCGTCTTCACGCA
ACTGATTTCATCCACACACTTTGTATCATCACCACTCGCGCGCCCAATGT
GAAACAAAGGATACAATGTATCATCTCCACTTGCGTACCCCATGTGAAAC
AAAGGATACGAGCACGCGCCAATACAAAATGAAGACGTTCTACTGCTGTT
TACATTTGATCTTTCGCGTGGGAGAGTTTATGGTAAAATAATGATTAATG
AATAATGAAAAATGAAATTTTGCCGTGTCAAATTTTGCCGTGTCAAATTT
TGAATTCATTGTAACGGTAAACTAATACCTAACTTCCCTTCGCCTTTCAG
TCGAGTACTGAGTGATCTTTTCAAGTCATCTCTATACAAAAAAGAAAAGC
AAAAAGACCTATCGAATTAGAGTTCCACCGCAGAGTA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_016257XLOC_016257Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00028649-exon-sc0000695-1575043694:139115..139226TCONS_00028649-exon-sc0000695-1575043694:139115..139226Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028649-exon-sc0000695-1575043694:136004..136184TCONS_00028649-exon-sc0000695-1575043694:136004..136184Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028649-exon-sc0000695-1575043694:125340..125897TCONS_00028649-exon-sc0000695-1575043694:125340..125897Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028649-exon-sc0000695-1510915933:139115..139226TCONS_00028649-exon-sc0000695-1510915933:139115..139226Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028649-exon-sc0000695-1510915933:136004..136184TCONS_00028649-exon-sc0000695-1510915933:136004..136184Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028649-exon-sc0000695-1510915933:125340..125897TCONS_00028649-exon-sc0000695-1510915933:125340..125897Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028649-exon-sc0000695-1491911889:139115..139226TCONS_00028649-exon-sc0000695-1491911889:139115..139226Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028649-exon-sc0000695-1491911889:136004..136184TCONS_00028649-exon-sc0000695-1491911889:136004..136184Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028649-exon-sc0000695-1491911889:125340..125897TCONS_00028649-exon-sc0000695-1491911889:125340..125897Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000695supercontigsc0000695:125340..139226 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.541347	0.336306	0	0.527823	0	0	0	0.168092	0.141405	0	0	0	0.434903	0	0.67604	0.927563	0.695959	1.2008	1.23496	0.95872	0.966741	0	0.349117	0.128022	0	0	1.13611e-06	0.150725	0	0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00028649 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top