TCONS_00027921 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00027921
Unique NameTCONS_00027921
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length5366

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00027921 ID=TCONS_00027921|Name=TCONS_00027921|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5366bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000657:159146..174472+

Legend: exon
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>TCONS_00027921 ID=TCONS_00027921|Name=TCONS_00027921|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15327bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000657:159146..174472+ (Clytia hemisphaerica)
CAAATCAATTGAATAATTACAATTGGATTGTAGAATACAATTAAATTCTA
AACAAATATTACCCAAGATTTGCTGTTCAATTGTCAGAcataatcaaatc
aatcaaatattAGGGCGAATTCAAGTtcaattgatttgatttttatacaA
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CGTTCGATTGCTATACTTTATGAAAATGCCTTAGGAAAATCCCTAAATTT
GCCACTAAGCTAGCTAAAATAGAATTCAAAGTGCAAAAGTCATGTTTCAA
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ACCAATGTAAACGTTTTCATCATAACTTACagtattacacgaatattact
agtcattttgttaacacgaattgaaatatcgtgttaataaaaaccccctt
aattaaaaccagctgctgtttccttgaaaaagcagaaaaattcatGTAAA
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ataaggtaaatCTTAAGTTTCTTTACATTGCGATCTCTGATGCCTCAAAT
TCATTCTCTCGTGAAATAACTTTAGGGATCATTTGTTCAACTTTAATAAT
GACTTCTATTGAATTTATAACTTTTCTTTCATTAAATTTAAGTTTCCCTT
TAAATTTTGAGGATCTTTTTTACCCATTCACTTTTCCTCCGTTCTTAGGT
TTGTTTAAAAGTACAAAGCATAGTGAATATGGCCATTGGGAAAGACGTAG
CTTATGAGTATGATGCTGAAAGTGACATCATCACTTTTGTATACTCAGGC
GTCGTACAATCAGAGTAAGTTCCACTTACATTGGCCGCTGATGAAAAGGA
GATAAAAGCCTTTTTACACTGACCTATGTTTAAAACTTTTGACCATGTAT
CCTCCATCTTTGATCATGCATAGTTTAAAAAGGAAGAGTTACCTGCACAT
TAGTAGCGCTAAACCTGATTTTCACCAGATATTAATGCGTTTATGTTTGT
AACTGAAAACGATTAGCTTTTGATTTGACTAGATCGTGACTGGCTGACAA
CAACAAAATTTCTGCTAATTCTTCTCTTCCCAGAAATGgtttaaggtttt
attttgaataagcTTTAAAGGAGAATTTCTTTCTTTAGAAAAGTACAAAC
TCGAATTACAATGCATTGCTCCACTACAGCACCTGGCATTGGCACACTGG
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AATCGCTAGATTTTACCTTTCCTTAGCCTCCATGGATCTGTGTTCGACAC
CCGAGATGTCGGGTGTCAACTTCGGTGAGACGTTTTAAAGCCGTTTTTAA
AATCCAAATCCCACGAaatcaaattttgctttcaacaAGATTTTACCAGA
TTTCAATTCAACCTCTATGAGAGtgtaattttattaaaattaatttttga
cttGTGGTTTTATTTACAGTGGCTTGTCCACCGGCAGAGAACCTCCCTTA
AGCTTTTTGAGCATTTGTTTATTCAAAATGTACGCCGAAGGTGCTATTTT
TccgggtcaagctggagtttttacaagatacttacAAATCAGAGATGCTT
TGAGCATAGAACGTTTTCCTATCGTATACAGTAGAATTAATTTATGAAAT
ACAGAACAGATAGGAGGTAAATAAAAGATAAATACCTCAAGCGTCCACAA
CACTCTCCAAACTATCTAcacccccaggtcccgaggtcccgaagtcctgA
GTTGAACTAtaacaacactctccaaagtatctataaccccaggtcccgag
gtcccgaagtcccgagttgaactgtgccaatactctccaaagtatctact
cccccaagtcccgaggtcccgaggtcccgagttgaGTTATGTATGTTCTC
TTCACCTATAAAAACCCACatccccaggtcccgaggtcccgagttgaGTT
ATGTTCTCTTCACCCATAAAAACCCACACCCCCAGGTCCCGAGTTGAGTT
ATGTTCTCTTCACCCATAAAAACCCAAacccccaggtcccgaggtcccga
gttgaGTTATGTTCTCTTcacccaaaaaaaaacatattataGATACCCGA
GTTGAGTTATGTTCTCTTCACCCATAAAAACCCAAacccccaggtcccga
ggtcccgagttgaGTTATGTTCTCTTCACCCAAAAAAACCCACACCCCGC
CCAGGTCCCGAGTATAAATATTATTTCCAAAAGATCTACAACCctaggtc
ccgaggtcccgagttgaGTTATGTTCTCTTCACCCATAGAAACCCAcacc
cccaggtcccgaggtcccccGAGTTGAAGAAATCAGCGAGTGCGCACGAA
GCGGAAAACATAGTGAAGGGACGAAGCGACCTCGTGGTATACAGAAACAA
AACCATGACTTATATAAAACTATTGTTGTCCATTTTGTTAAGGATTAGTC
TAAATAAATTTAATagtaaatgataaaaataaatttaacaccacattttt
aattttcgNCTGacaacaacaaaattttggttCTCTGATCTGCTATTCTT
CTCTTCCCAGAAATGgtttaaggttttattttgaataagcTTTAAAGGAG
AATTTCTTTCTTTAGAAAAGTACAAACTCGAATTACAATGCATTGCTCCA
CTACAGCACCTGGCATTGGCACACTGGCTAACGTCAACAACGATAAAGAT
AGTAAATTATTTGTAAGTTACATCGCAAATCGCTAGATTTTACCTTTCCT
TAGCCTCCATGGATCTGTGTTCGACACCCGAGATGTCGGGTGTCAACTTC
GGTGAGACGTTTTAAAGCCGTTTTTAAAATCCAAATCCCACGAaatcaaa
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ggacctgggagtgtagatactttggagagtgttgacttcaggacctcggg
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cctcgggacctaGAGTTGTAGATCTTTTGGAAATAATATTGATATAGTTt
aactcgggacctcgggacctgggggtgTGGTTTTTTTTTGGGTGAAGAGA
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GAGTATATTATAAAGGGGTAAAGCCTTaacattgggctattccattaaat
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TTACATTATCAGACGACAGCNGTCCACTccatgtatggatataaaatgga
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TGACATCGAAGTACGCTTGTTTCAGCGATGCTGGTGGTGGAAACTCCTCA
AAAGGATTGAGCATCGGCTCTATTCTGTGCATTACGTAAGCTTATGTATA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00027921 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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