TCONS_00026428 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00026428
Unique Name	TCONS_00026428
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4139

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000571:81567..102840-

transcript sequence

>TCONS_00026428 ID=TCONS_00026428|Name=TCONS_00026428|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4139bp
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ACCTTTCCCACATGCAAGAAACAGCGAACTTTCTAGCAC

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transcript from alignment at sc0000571:81567..102840-

Legend: exon

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>TCONS_00026428 ID=TCONS_00026428|Name=TCONS_00026428|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21274bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000571:81567..102840- (Clytia hemisphaerica)
ANCGGAGATTTCTCACTTTCCTTCTGGTAAGTCCAACTTGTAAGTCTGCG
ACCGCAGGTAATGAAATACAAAAAAAAAATGACATCGAAATTCTTTGTCT
AAGAGAATGTGAACTTCAAACAGTTCCTTCCTCGAAAATTGAAACCCAGT
CTTTAAGGGTTCAATATGTGTATTGGGTTCATAGAAGGTGGTGAGTTGTC
CTTTTGTTTACCGATTTCTTTTGAGATCACTTAAACTAAGCAAATTCGCC
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GTACAACATTGTCGAATCAAGTTACGTCAAACGCAAGACGGTTCCACCAA
ATATTTCTTGGTTGGTCAAAAGAGTTTTGATAACTTGTGGAGTTTAATCA
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AACAGTCTCTCTCTATTTCGAACCTATGTAATTCGAATCTTTCTGTAATA
CGAAGTAAAATATTGGTCCCCTCATCTGGAAAATAGAATAAATTACTCTC
TGTAATTCGAATCTTTCTCTAATTTGAAGAAAATTTCATGGTCCCTTGAA
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TTGCCCATTGATTTTCAACACTTCTCAGGCAAGGGCTAGAGGGCTAGAGG
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TAGCGGTTCCTTTGTTTTGGAGGACTACATTTTATTTGAAATCTAGCGAT
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TGGATGGGAAATAAGTGGTTTCATTTCCCATCCAGGAGTCTCGCCTCTAG
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TAAGTTAGCCTCAAAAGGTTAAATACTCCAGCATACTTTTCTGGTTTTGC
GATCCTAACTGGAACTCGTGGAGGTAGAAAAAAAGGGATGAAATGCTTTG
TACCTACTGCAATAATTGTCCCCGTACCCGTTCATAGACATGTCCATCTC
TTCTGTTACTCTCCCAACAAACAAACACCAGAATGTCTTAATCTATCTTA
ATGTTTTCATTTTATTTTCATTTCTAGCCAAACGCTCATATTGGTAAACC
GTAAGTTCATTCTTTTAAGTTCTGATAAATCTTGCGATTCTGGGTAGGGA
AACTTTGAAAAAATCAATGTTTTCGTTTCGTTTGTTTGGCATTGGCAGAA
ATAAAATAAAAATTGAAAGAATATTACTTAGTCAATCTAAGAAGGATGGA
AGGGAGAGGATGACTACCGAATGGTCTAAGACGCCATCGCCACGAACCAA
GGGCCCCTTTTCGAATTTCCAGATGAGATGCAGTTTTTTATAAGATAATT
GGTCATTTGAAGTAATAAAAATGACGCGTTCTTTAGAAAAAGTAACAAAA
TTGTTTTATTACTGATTAACGACCAACCAAATCAAATAAGAGCTTGTAAA
AACTTCATCTCGTTCCCTGCGATAAAGAAACACTCATTTTCAAATAATGC
ATTTACTTTTAGTTGGTACCATGACAATTTGACGCGCCAACAAGCAGAAG
ATATGTTAAAACGCATGCGCAAAGATGGTTACTTTTTGGTCCGCAAAAGG
ATGGGCTCGAACGAATTAGATCCTGATAGTGATTCTTACGCCATCTCATT
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GGTGACAGTTTTTTTCTTAACCTTTTTTGCCTTAAGAAAAGATTATGTCA
TAAAAAAGTTTCGCGCGAGCAAAAAACAGTTGAAGGAAGCTCTACTTCTT
TTTTTCATCCGTTATGTCAATTTCGACCAATGGAATTGCTTCATTTTTCA
ACCGACCCAATGACCTTACAAAAACGTCAACAAGTTTTCGCTTATGTTGC
GCAAAAATGGAGACCGGCCACAACTGACTTTTGGAAAAAAGCTTATTAGA
AGGTAACAGTAATAACTTTTAAAAATGCGTAAAAACTTTAAACGATTTTG
TGTAGAGCCCTCATCAATACTTCGAGCATCTTCCTTTTTGGACCTACCCC
GGAGGCTCTTTAATTCAACCTTTGTTCGGCCTAACCCAGAGGTCCTTCAA
TTCAATCTCAGTTCGTTCGTTCGTTTGGCCGAATTTCGGATTTGTGGAAG
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TTTTGTCTTGAAGGATTTTTAGTTCAAGGTTAGTTTAGTTGAAGTTAAAT
TTTGTTCAAGGAATGAAATTGTTTCCTCGTGATTCACAGACTCAGGTGAG
GCAATCTTCTTAAAATCCTGATTAAGAATGTTTTCATTGATCTTATTAAA
AATGCCTTTGGTCTCAGCAACAGCATCCTTCGTGGCCAAGTTTTCAAGTC
TGTTATCCATTATTTCTTCTATAATCTTAGCAAGTTCAGTTGACCTTCTT
GTCTTTTGACTCATATTAACAAAAAGCAACAGAAAATCAAAAAAACAACA
GCAAATCAAAAAAACAATAGTCAAGCAAAAAGATTGAGCAAAAACCGTAC
AATGCCAGATCAGTTAATTCTCGTGTTATACTGAACTTCAACTGCGAAAT
GAGAGTTGTTAGCCCTACCCGAAGGAAGTACCTATGTACTAAGAATGAAG
TTTCTATCTCCGAAAAATCTTTCTTCTTAATTTTTCATCTAAATTTTCCA
AAATTGTTACAATAATTATTTTGCAAAAATTAAAGTGCTCTAAATTATCT
TTTCAACGGTACATAACCATTGGTTGTAAAAATTGCAAGTAAAACAAACA
GTATTGCATTCTTAAAGCAAATGGACTTTAATAACCTTTTTTACGCGTTT
TTCAAGTTTTCAATTTAATTTTGTCTCTAAAGTTTCTTACCTATAGAACT
AGTGGATCAAATGTAAAAAGTAACACCTCAAATTTTCGGATATTTATTTT
TTGGAGAATGAACGATGGAAAACCGGACTGCTAGGGCAGTGGCAGAGCTG
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GGAGCCCGATGATAAAAACAAGAAACAATATTAGCGTTTTAAGTTTTTTT
GGGTTAATTTTTAGAAAATAATTTATATATAAAAAAGTGGTAGAAATTAA
TATTAAAAAGTCCATGATGAGAAAATTATTTACAAATGTATACGTATAAT
TTGGTGATGACGTCACTACCAGAGTGAATCATCGTTGGTGACAATGCTGT
AGACTTTGATGAGAAGAAACCATATTCCGATACAAAAGGTGACAAGTGAA
GTGTCGTATAAGCTCCACGGTCTTCCGTTATCATGTTGGTCGAAAATAAC
GTCTGATGTGCTTACAACGTCTTTTGATGCTCTTGATGGACTTTTTCGTT
GTGGAGAACTATAAAATCAGCAGTAGCGATGTTTAATGAAAAGAAGCTAA
ACTGGCAAGGGCTATTAATGTTAATTGGAAAATTTCTTGAAGCAGACGAG
AGGAAACAAGTGAACTGAAGTAATCCAAGTTCCTATTACTGATTACACGT
TGTTTTTTATAAGAACATACGTAATTATTGAAGCCTTAGGATGACCATTT
TTACCTCATTTTCCTAAGAAATCGGATGTTTTTGAGTCCACAAAGCCTTA
AGATGTTCTTTAAAATGTTCTTATAATATTTTAGCCATCGAAACCTTATG
TTCTTATATAGTTTGTCCTTATGAAAAAACGTATAGTTTTAATTACCTTT
TTTGTACTTTAGCGACTTTCTTGATCTTGCCATTGCTAGCCTGGTTCGGA
TTGTTATCCTTTGCTTCTTGTAGCTTTGGAAGCTCTTTGTTAGGTGCAGG
AACAGTTGGTGCTTCGATATCGTTGGAAACAGCCTGTTTTGATTTTCTCT
TGCGTTTCCTTTGCTTTTGCTTGCCCACTGCCTCTGTCTCTTGCATAGGT
TGCATTTGAGCAATTTTATACTCATATTCTTTCTTCACCGTTTGCAAGTG
TTCTTTGGTGGACTCAAGCTTTTTGTAAGCTTCAATCTTCTTTATACCAT
TCGTGTGAGCCTGAAAAGAAGTATTTAAAATTCTGATAACGATCACACAA
TCGAGAACCTTTTTGAAGTCTTTACGGCTTCCCTTTACTAAATATTTAAA
ATAAATATTACTCGTTGCCTAAAAAATAGCTTTTCTATGGGGTAAAACCC
ATGATTGATGATTTTTTTCTCGTATTGGGAGTTGTAAAGGATTATTCGAA
TTCCAACAAAAAGGGATTGGCTCAGATCAGCGAATATTATCTCAACGACT
CCTGCAACCTAACCTGATAACAACTGTTCATAATTTTTTTACGCGCACGG
TCAACCTCTAAAAGCGCTTGGAAATTACGCATCTGAGAAAAATAGTCCTC
CCGCGTAAAATTCTACAACAAGAATCTTGTGCGCACAATCACGCAACTTA
TTTGTCATTCCTAACCCTTTTAGACGAACACGGTTCTTACGATTTTGAGA
TTGCATATTCGTCACATTGTTATGTTTTCACACATCCCTTTAGAGAGCTC
CCAAAAATTTATTTTAATTGGATACTGATCGATGTCAATTTATTGCAATA
AAATATTGAAATCTCACCTCTTCTCTGTAAGCATTGCGTTCACGGATCAA
AGATTCGATTCTCTTCTTTTCACGTTTCAAATCGTTCTGCATTTTCTCCA
TTGAGACCTTTTGTTTTTCGATAGTAGCTCGGTCCGTATTTTCTTTCTTC
TTTTGTACGGAAATATCTTCCAAACGAGCACGAATCTCGACTTCGCGTTG
GTTTAGTCTCTTCTCCAAACGGAGAACACTGTTCGATGCGCTGTCTAGTT
TCTTCTCGCAAATTGCTTTTTCTTTTTGTAAGTTACCAATCGTCAATTGA
GATTCTTTAAGGTTGCCATCTTTTGCAGCCAATGCCTTCTGGTGCATCAA
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TTTTTTGCCATCTCTGCTGCATGGATTAAATCACATTCGACTTGCGCTAA
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CGTTGATTTGTTCTTTGAAGCTATCGCACGTCTTAACCAACTCGCTTTCT
TTTCGTGTCAGTTCTTCAATATGTTTCTTACGCTCTTCCTCGTTATCCTT
TAACAATTTCTCATTCATCGCCTTCAGATCATCCAGCTCATCATCCTGTT
GTTGTTTTTTAAACTCTTCTCGGCCATGGGCCACCTTTTCGTTAGCTTCC
TTTATCTCTTTAGTAGCCTTAAACAGTTTCTTCTTAATGACAGCTTTCTT
GTCATTCAATTCTACGAGCTGAGTGGCCTGGACATTGATTTGTTCAGTTT
GTTGCTGTGCAGAGTGTTGCGTATTAAGCAGTAATTTTTGTTCGGCGTCC
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AGCATCCGCCTCTTCACGATGCGCAAGATTGGATTCTTCCTTGATCAAAG
ATAATCGCCGAATTTCAGTTTCAGCTACCGTGTTTCTATTTTCTAAGTTC
TCGTAGTCAACTTTCATTTTACTGTAGTCACTTTCAATTTTACGAAGTTC
TTCCAAAAGAGCTGTTTTATTTTGTTGAGAAGTTTCTACACTTCCTTTTA
TTTTTGTATTGGCTTCACTCTCTCTTGTTTTTATCGCAATGCCGAATTCC
AGTGGACCGGCGTTCAACTCCTTTATAATCTATAACCGATGTGAAAAATA
TTTAAGTCAGAATTTTCGGATGAACCAGCCTGTAAAAAAGGCTTTTATTT
GACCTGAGGCCTCGCCCTTCTTGTTTTAGTCCAGGATACAACGACAGTTT
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ATGTGTCAGATGTAAGAAAAATTCTTATGAAATTGGTTGGCCTTTCTTCA
GCAGATGAAAAGATTCGAGCTAGAATTATTCTTCACTTCCCGACACCGAA
GAAAAGTGTGATTATAGAAACAAACCTTTCTTCGAAGTAATTCTTTATCA
TCAGTAACAATGCATGACTGTCTGTTTCGGCCACCGTAAAGTTTGTCAGG
AAGGGTAACATCCTTGTAACTGATTAACGTTCTATCGGTCTCACACAACT
CGCCAGTTTCTGAATTTTGGACAGATTGAGAACCCTGGATTGGATTACTA
CCACGATAGAACCCCTTTGGAAGTCTTGCTTCCGAAGGTTTCTTTAAATC
TTCTGTCATCAATGATGTAGCGCGCCACCACATCTTTCCAAAAAAATTTT
CGTCGATAAATATTTTACACGTCTATTCAATTCACAATAAAATTTTTAAA
TGAACCTGTTTTTCGTTCGGTGTTTAAAGATCACTTTTGTAAAATGATAT
TTGACGTCAAAAAATTCAACGCAAACTGACGTCATAATGACGACTTTCTT
AATCTGTTATTTATTCTGATGAAGGATTGGCGGCCGCCCACGCTCACTTC
TCCAGGGGAGTAAGGGGGGTCAAAATGTTGGGGGGGGGTTGCCTTATTTT
TTCTAAAACATCTCATCAATCCTAAACCATCGCAAAATTCTTCCTGTTAT
AGAATATTATTCATTGATCTGTTTTTAGGACTGCTGGAAGTATTAAACAT
TGCGTCATCAAAAAAGAAGGCCGTTTATTTATGATTGGATCAGCACCCTT
TGAAAGTCTGGTTGAACTGATCTCACATTATGAAAAATTTGCACTTTATC
GTCAAACCAAACTGAAATTTCCTTGCAATCAAGAGGTTGGTATGATTTAC
TTTTACAGTGGAGGCTCTTTAACTCGAACCTCTATAACTCGAACCTCTAT
AACTCGAACTCGTTTCCCTGTCCCTTCAGTTATGCCTTATAAACCTTACT
CGCTGCATAACTCGAAATTTCATTAAAACAAATTCGTATTCTCCGTGCAT
GTTTTAATTATGCAGGCTCCAATGTATTTTTTTTAGATTTTTTAAATCAT
GTTCTCTTATCATTGACCAAGCGCTTAACGCTAATGGGTCTTCAATCATC
TTTTGGTTAGTCCGTTCGTTCGTAAATGACGAAATCTAAAATAAAAAACA
TGTTGTTTTTTTTCATTTTCAGGTCGTAAAGGAGCTTGGCATCGTGAGTA
TACTTTCCATTGAGGTTTAGGGTTTAGAGACAGTTTCAAGATTTTCACAA
TCTTTATAATATTTGTTAAATTTTTTATGGATATAAATAAGGGTGGCCAC
ATAATATTTATGAGTTTTTGTTTTGGCATAGCAAATTAATGCATTTTTTC
ACCTTTTCGAGTGGTAAATTTGGTCGTAACTAGGAATCTGATTTGAATAT
GTCAATACTTTCAAACAACATAATTTAGGGGTATTTTTTGTCGAAAATGA
CGATTCCGAACTATGACCTATCGACAGAGGACCGATAAATGGGCGTTTCC
GTGCGTGTTTATTTTAGTATTTGAATTAAAAGTATATTTATTTTTCATTA
TAGAATCCAGACTTAGAAGAAGAAGCACCCGATTCTTTCTATGCTCTACC
CAACGCCACGACGCACAAAGTGAGTTTCCTCCAAGAAATAGACCTTTTCA
TAAATTACGTCACGAACATCACTTGCCTCTGAATAGGAAGTAGTTTTAAT
AAAATCCACTAGGAGTTAGTCACCATGGCAATAATTTCAAAACGAGGCAA
GTGATGTTCGTGACGTAATTTATGAAAAGATCTATTTCGGTTCTAAATGT
TCCCCTGTATTGTGTCAACTAAAAGAAAGGAAATTTGGGATCCTAAAATG
CTGCGGTTATGGTAGTTTTAGGTTGATAATGAAAAATGAAAATATGACCA
TCCATAGCCACTTTACCTGATAACAGATGGTCATAATTTTTTACGCGCAC
GGTAAACCTCTGAAGGCGCTTGAAAATTAACCATCTGAAAAAATAGCCAC
TTTCATGACAAGAATCTTGTTACGTTGCAGCGATGTCAAAAATAAGCCTT
TTTCTGATACGGCGCCCTATTTTTAAAACAATCACGACATTGTTTTCATT
CCCTGTTTTTTGAAACGAGCGCGCTCCAGTCCTTGCGAAATCGACATAAA
CGACGTTCAATTAACAGCCAATTCGATTGACTTCCAAATTTGCCATACTC
ACCAACTTTGCCAAATCTACAATTTCAATGTCAAAAGATCACAACTTCAT
GGCAAATTTGTACATCGCTAGGCCGCCATTATGATTTCCGTTTTGTGATG
CTTAGTCAGCAGTTTTCTGTCGGCGTTTCTAAACAAACGATTTTTTATCC
AATCAAATTGCAGATCAGCATTGTTTTGCTTTAGCATTGGAAGGTCTTCT
ATTTTTCAAAATCTTTGGCAAAAGTGGCAAAATTGGAGCGAAAACACAGG
TCTCGTGGGAACAGTGTTTTGTATGGAGACGTATGGAGGTAAGTTCCAAA
AATGCCAAGAATACCAGATTCACCACATCTTTTTTATTTGGCATTTATGG
CACTCAAATTTTGCCACATTTGCCAAATTTTTGTTAATCGAATGCAAAAT
AATTGGCAAATAGGGCAAAAATGGCATATTTTGAAGTCAATCGAATTGGC
TGTAACAGTCGTCCCATCAGGCAGGTAGGAAAGTTTCTTATTAACTAATA
ACTATTATCTCTCTCTTGTTATACAGCCTGCTTGCTTAGCGAAGTATGAT
TACATTGGTAAAGATGACGAGCTGAAATTCCCGAAAGGTGCCATGATCAC
AAATGTTGTCAAATTCGATGGCGGATGGTATGACCAAGTTTTTTTTTCAT
TAAGGGCTACTACATACACTACACAATATGTTTTAACTCTATACTAACTG
TTTATGAGGGCTATAGAGGTGTTTCATGTTCTGTTAAGATACGTAACTAC
TGCCATTATGGTAGCGAGCACCTCACTAAAAACTGGGATTTTTCATCTCG
TTTCTTAGTGAGTTCAACTTTGACGGTTTTTGAAAAATAGAAGCCTTTCA
AGTGTTTTGACGCAAATTCAATTTCTTCGCTAAAGCTGGGAGCAAACCGT
CAAACATTGTTCTTCAAACATCGTGACGTTTCATGTTTGAAATCGATGTT
TGATTGTTTGCTCCCAGCTTAAGGCGAGGGCTTCAAAAGTTTAAAGTGAC
GTCAAAAAATCGAATGTTTGGAGCCCGAAAACCTGGGCTCAAAACATTCG
AAAAAGTCGCAAAGTGGAATAGACGTTACTGCGTATATGAAAAGCCGTGA
TGTCTAGTATAGGCTACCATTATGGAAGCAAACGTTCGAATCTGTTCGCG
ATCCCTTACGCAAATCGAACGTTTGCTTCCATAATGGCGGAAGTTACACA
ACTTAAAAAAACATGAAAAAACCCTCTATACCGTAAAAATATTCACCGAT
GGTGAAAGGTATTATCCCGAGCTTGTGATATATTGAGTATGACCATCTTC
AAGTTCAATATCAAACAATATTGGTGAGTGTCTACATATGTTTACAATCA
GGGGTCTTAAGTTTAGGCTCGGTGAACGGCGAATTTTGCTGGGCCGAGCC
GCGAAAAAAATTACAATTCGCCGTTCGAAAAGTTCGGTTCGGCCGCCTCA
AGTACATATTTACGCTAATCAATACACTGCGCTTGCTAAGAATTCGCTGG
CCTGGATTCTAGAAACCGAGCTAATTTTTCATTCGCCAGCCTACCAAAAC
AAAGCAAAACCCCTGTACAATAATTCAATTTTTCATCAGGTGGCGAGGTG
ATTACAATGGTCAAGTTCAAAAATGGTTTCCAGTCAATTTCACTGAGGAG
ACGGTGATCAAAGAAAAAGCTCCGGTCTCACAACAAGAAATAGTAGGTTT
TCTGGATTGATTTCAACTGAGCATGCGCATCTTATTTTTACTAAATTATA
CTGGAGTCTCCAGAACTAGAATCTCTATAACTTAAAAGTCTTCTTAGAAA
GGAGGTACGCCTTTATGCGTCAGCAAAGTAAACATAAGAATTTCTCAAAA
TTTGTGCTTTCGCAGCGTTGAAATCAATTGAAAAATCTAACTGAGAGAGA
AAGTCAATTTACAAATAAAAAATCTTAATTCTAAAACTATGAAATGCGGC
GATCATACGAAAATACCACTATGTTGATTAAACGAACATGATGACTTGCA
TTTTATAGTTCAAAAAAATCTTCAAAACTTTAGATCAATAGTAAGCCATC
ATTCATTAGCGCGGTGGTCCTGATTACCCATTACTATTTGCGACTGTGAA
ATGGCCTTTTGTTAAATATTCATTGTTTTTTTCAAGGAATCAAAGCAAGG
AGGTGTAATGTTAGAAGAAATGCAAAAAGGTGTTATTGACCTTACTGGCT
GCCAACAGCGTAAGTCAAGATCGGTGTTTTTTCTTAAAAATTGTTCATAA
ATTGATATGCTTTAAACACCCTGACACAATTTTTTTTCTGGGAAAGCCTA
ACATCGATCGATCTTTGTACTTTTAAAGGACTCCTTTAAAGCATAGAATT
CTTTGAGTTATAAATCTACAATCGTTGCCAATATAATATGGCACATTTCC
GGCGGTCAAATTTAGACACAAGGCAATAACCTCCCCCTCCCCTCCGAACA
ATGTTGCTGGGAAAGAAATATTACTTGGCCGGTCTCTAGCCCCCTCCGAC
AACATTGTTTGGGGGGGAGGGGGAGGGGGAGGGAACTCATTTTTGGGCTT
TGTGCCATAGGTTTTGTCAATGATTGTAATTGTAGATTTTTGAGAAATAC
GGCAAGGGTCGACACATCCTTTTGTACGCTTGATTTAGCATGATATCTAC
TTTACTTTTTTTTCAGAACTTCTCCAATCACAGCCATCAAGACCATACAT
CTTTTCCATCAAATCACAGAGTGGTGTTTTCAACTGTTCTGTAGAATCGG
AACACGTAAGTGAAGTCAAAATGAAAATATGTGTGAATTAAGCGGCCGGA
AGAAAGCTTCTTTCTGCTTTGACGTAAATTCCATTTTTTGATACTGCTTG
GGCTCCAAATTTTCAGATAAGACGCAGAAGGAATAGACTTTCCTGTTTAG
AAGAAATGCCGTGACTAGTATATAGGCTACGTATTGACCGGTTTGCAACG
CGAGTACAGTTTAAAGTTAGATCTTGACGGAGAAAGCTCACAAAATGAAC
ATGAGCTGGAATCTCAACGAAAATGCGATAAGAAAATAAAATACTGGTAA
ATTAAACATTATAACTTTTTTCAAAAATAGTATGCTTAAAAAGGAAATCC
CCTGAAATTTTTTTTATTTTAATCTGACACAGGAAATGATTGAATGGGTG
ACAGCTATACAAGACGCATCAACGAAAGCACAAGAATCCAGTTCCCAGTT
GAAACAATTGGTGGAGCAACGGAAAATTGCTAAAGAATTGAGTGACCTCA
TCGTTTATTGTGTCACTGTACCTTTCAATGAAGAAGGTAAGCGTTTATCC
CGAATACCCTACCTCGTCCCCGTGTATTCCAGGCTTTATTTACGTTACTG
GTAGATGCAAAAGAATACCCTGGTGTTGGCTGATGCGAGTTCCAGACAAT
GCCAGGGTATTATCTAGCGCTAACAGTAAGCATCCAAAAGCTGATGATAC
ACAGGGAACGAGGTTGCCGAATACTATAAGGACAGAAAGTTCCGCGAGAC
CGAAAATTCCGGACTTAAGTTTCGCGAATTTTACTTGAAATTTTTTTGGC
TTTTAAAACTGTTTTTTTCTGCTTACTTTCTTACTTAGCATAAACTTTTG
CGAAAAAAGTCTAAAAAATCTAATTGGTGGATGGCTGAGAATTTTTTAGA
GGGAATATAATTTGGCGGATTGCTGGAAAAAAGTTTGAAAGAATTTCATT
AGGTGGTTGCAGAATATTCTTGTTCAAAATTTGATTATTTTGACTGATTC
CAGGGAAAAAAATTTCCCTTTAAAGTATTGAGCTGATTCATTCAATTTGA
TTTTCATCTACTTTTATTGCTTTTAATTATTTTTAGGGTTTGAGAACGGG
AAATATTACCAGATGTCTTCATTCCCAGAACTAAAAGCAGAAAGATTCGT
CAGCCGAAAAACTGTGGATTTACGCTTTTTAAGATATCCTTTTCTAGATG
TTATTATAATGCAGATTCTGTTTTACTGTCTTTCATCGGGACATTCGTCA
AGATGGATTTCTCTCATTCATTCACTAGCAAGTTTATGCATTTGTACCTT
TGAGGACGGTGGAGTGACTGAAGCGATTTGGATTACCCTCATGTTTGCCC
CGCAAAATCGAGGACGGTAAAAGTGCTGAACGGTCGTCCTCAGTCAGTCA
GGATGTAGACAAATTAGAAGCTTACCGTACATAGATTCGCTACTGTCTCT
GTACAATTCAAATTCTCAAGTTCCACGTTTGTGCCGTAGCTTAACATTAT
CACCTTCTTATGAGTATTTTTCTGTAATTTCTTAAGAAATTGAGTGTTTC
GGAGTCCGCAAAGCCTTAAAGCGTTCTTAACTTGTTCTTAATATCTTGGC
CATTGAAGCCTTATATAGTTTGTTCTTATATACAAAACATGTATCATAGT
TAGACTAACAAACATGTACATTAACTATTTTGATGTATTTAACACTTTAT
ATATGACTCCAACTTAACTTTCCTTGACGCCTTCAACACGTTAAACCATC
GACAACTGAGTCGTGTTTACCCGAAAGGTACACGTTTCGATTCATCAAAT
TATGATCCAGTTATATTTTGGAATTTCGGTTGTCAGATGGTGGCATTGAA
CTACCAAACACCTGATCGATCCATGCAAATTGAACGTGGAACCTTCTTAG
ATAACGGAGGGTAAGTGTGACATTATTTCAAAACTTCTTCTGGGTCAGAC
AGAAAAAAAAATTAAAAAAATAACATAACACGATCACTGCCGAGCCTTTT
CAGAAATCGAAAATTTGAACTCTCCGAATTTTATCAAAAGTTTGACTTTT
AGAGGCTCCTGTGGCCTCAAATGTCTTCAAACAGTACACCAATCGACGCA
GAATTTCACGTATATAAAAAAATGCAATAAAAAGCAAGCAAAAGTTTCTT
TATCAAAAGTTAAGGGCTTAGTACAACTGGTATTTTGAACCAGTGATAAG
TCGTTGTATAAACTACATTCAGAAATGACGTCAAAATTCCAGATGGAATT
GGCGTGCTCAACAATAAGGATATTTGATCATATTCTATTGAATTGGAACC
CAACCCCTAAGTAGCATTAACCCTTTAACTGCCGTGGCATTTTTTTACAC
CCTCGACCTATTTGCCGGTCTATTTTTTTACACCTATTTTCCAATGTCGG
CATATGCCGACATGGGCAAAAGGTAGCGATTTTCAATTCATTTTCTGAAT
AATATATGAAGTATCAGCCAAAGACTATAATTTTCAGTTGAACATTGTAC
AATAGTTATTTTTCAACATGGAAAAGTTTTTAACTATTCATTTTTTTCAT
TTCAAACCATCAGATGGAAAAATCTCGTAAAAAATGATAAATTTTCGGCA
AATAGGTCGAAATTTCGCATGTCGGCAAATCCCGACAATGGCAAGGAAAT
CAAAAATGCTCGGCACGGAAAGGGTTAAGATTGAAAGATGTTTTAAACTG
TGAAGTGAAACCGTATGATTGCGTCGAGCCAGGTCATTCATATTGTATCA
CGCCAAAAGTCTTCATATTACTTGTTCTGAATTTATAGGTGTGGGTATGT
ACTTCAACCAGATATTTTACGCGATCCAAATTTCAATCCATACGACCCAA
CGACTTTCAATAAATTAGTTGAACCGTTAAATCTTCGCTTAACGGTAAGT
CCTTTGAAAGTTATCACAACATAAGTCCGAAACTTTAAATTTAGCTGACT
GACTTTATAGGATAACAAAATTTTGTTAAAATACTAGCAAGATCACGAAG
AAGCAGTCTTAACCATTGAGTTTCAAGCCCGAAGGGCTAGAGGTCAATCT
CTAACCTTTCTCAGGCAAGAAAAATTGAAGCCTTAATGCGCCGTATTTTT
GATGACGGATTGAATCTAGCAATTCCTTTGTTTTCGAGTGATATATTTTT
CAAAATTAGGCGGTAAATTTTAGTTTCAATCTGTCATTTGTGTAAAAACC
AGGCGGGTCGCTCAAGGCCGCGCAACTTTGGTAGGATTTGTTGGCTTCAA
ATCCTACCAAAGAGATTGACCTCTAGCCCTTCGGGCTTGAAACTCAATGG
TCTTAACAGTAGACTCTCGCAAATTCAAACTTCTAGTATTCGAATCCTTC
TATAATTCGAACTAATTCTCGGTCTCCGTCAAAAGGAAGCCCTCGTAAAA
TACCTTTTATAATTCGAATCACTCTGTAATTCGAACAAATAGAGTTGAAT
ATACATTTTAAGCCTGTACCAGACGGGCTCGGCTTTTTTTCTCAACATCT
ATTTGTAATATTCTCAAATCCGTCATAGATCAACAGAGAGAGTTTTCCCT
TAGGAGCCGTTACGACATCACATTTGTAATTCTGAATCACTTATATAGGT
TGCCAGCACAGTAAGTGCTCTTCTTTCTTTGAAAATGATCGGTAGAGATG
ATATTGGCAAATGCTCAAATAATGGACTCATTGTGCCAAATGGCGTATCA
AAGGCCACAGTAATGATTCAGCGCAAATAATAATTTTTGTTGTCATTGTT
CCACTTTAGATTATTGGAGCAAGACACTTACCGAAAACTGGTCGTGGTTT
AACGTCGCCGTTCGTCGAAGTTGAAATTGTCGGCCTTTCGTATGACTGTC
GCTCTTTTCAAACCAAAACCAAACGTAAGATTCTTTCCATGTATTGAGCC
ATTACATTTAGTGGACGAACATTTTCAAGGGCAGAAAAGAAAGAAAGAAT
TTCAGTGGGTTTAAGGAAAATAGGACCCCTGTCTAAATTTTCTTCACTTT
AATTTCTTTGTTCAAATTTTGTGAGGCAACTCCACTTGACATGTATTTTT
GGGGCACAGGATCAATTTTTTACCATCTACTGGTATCGTGTATTTTACGG
AACGGCTGAAAATTATCCTAGGTATCTGTAACTGATCCTGACTCAAACCA
ATAAAAACGAATTTCACCCGTACGGATTGAAAAACAAAAAATCTACTTTC
ACCCGTACAAAGAAGTCGGCAGCAGATGCTTACCCTAGTAAAAAATAGGG
AGTTGCTGGGAGGGTTAACCAGCCAATTAGACTAGAGTCTTCTTTTGACT
GAACTTATGCTTTCTGAAAGTTTTGATGACGGTGAGTCCAGTAAGGTAGA
CGAGGTCGCCATTTTGAAATTAAAATCTAATAAACAAACAAGGCTACTGA
GAGTTGCAAAATATGATTGATAATTGGGAAACCAACGTGAATAACAGCGA
TTCCTTATTTTCGAATAAAAACATTGCTGTATCCCAATTCTACCTTCCAA
AAACAAGTATAATCTGGCAGAATGTTTTATAGTCCGCCTAAGCAAATGTC
AAAAACTGAGAAAATACCATATAACTACCATATATTATCGCGCCACTAAA
TCGCGCCATGAATTCTGTAATAAAGCTTTAAGTGGACCCCGCGCTACCAG
CAAAGTAGATTTTATTTCTTTTATTAATCGTTTGACTTACGTTATTTTTT
TGTACTTGTTTTTCACTTTTGATTTTATTTTTTTCTACACTAAAACAGCT
TTTTTTTTTTAAAGAACTAGTTTACAACGTGAATAAGTAACAAGAATTTT
TTTCTCCATTGCTTTCCAGAGGATAATGGTTTATGTCCAACTTGGTTCGA
ACGGTTAGAATTTGACGTCATCTGTCCGCCACTGGCGAAAATTCGTTTTG
TCGTTCATGACGAGGATATGTTTGGCGATCCAAATTTCGTCGCCCAAGCA
TGTTTCCCTGTCACTACACTTAGGCCAGGTAAAATTTATGAAGTTTTCGA
CCGCCAGAGGCGGTTTCTTTCATAGTGGTACGCTAATCTCGTTTTGCCTT
GACTCATTACTTTGTCTACCATTTACTTTCGTTTTTTTAACTAGATTACC
CAGGTGTTTCTCTTATTTTTCGCTAGATGTCTTTTATTAGGAATTGAATA
ATCGAGACATGAAAAATGACTATATTGTAATCTGTTTTCAATGAATAATC
TAAAATGTACTAAGATGACATGTAGGTGTTAATAATGTGCGCGNTATTGT
AATCTGTTTTCAATGAATGTAGGATGACATGTAGGCGTTAATAATGTGCG
TGCGCTCTTTCGCGATCGTGATGTGTGATGGAAGGCGGTCGTTTCAGTGT
GGTTTACATCCACACTGTGACCTAGTTTTAATTGACTAATGGAGGGTGAA
GTGTCAAGCCCCCCAATTTTTATATTATGAATTTCGTCACTCAAGCATGT
TTCCTTGTGACTACACTTAGGCCAGGTAAATATGCCAAATTATATTTTTT
TGTGGTCTAATGTATTTTGAAGTATCAAGTCTCGCCAAAGGACATAATTT
AGCGTATCTTCTACAGCATTTTTAAATAAAAGAAAAAGCACCCCCCCCTT
CCGCGCGCGGCCAAAAGTTGATTAGTTCTTTTAATTAATATTTTAATCTT
TTTATTCAGGAGGTCTCCCCCCTTCCTGCGCGATCACAAATGTTAAGAAA
TTATATTGTTAATTCTGCTTTATCAGAGGTGCATCCTTTCTATATCATAA
TAAAGAATCTCTTTGACAATTCATTTCCTTCTTTTATCATTATTCAGGAC
ATCGTTCAATTCCACTGAAGAACGCGTATAGTGAAGAAATACCACTTGCA
GCTCTTCTCATTGAACTCGAGATAAAAAATGCACAGGTAAGTCTAACTTC
GTCCCCATGCCAAAAACCTTTCGAGATTTCATAATCTTTTTCAAGAGCCA
AGACCAGGGCTATAACTCATTAAATAACAAATATAAAAACGTTGATTATG
TTTCCCTGTGATCGATAGTGAGGTAGGTCTAACTAGTTTCTGACCAAAAA
CTGAATAAAAAGGAAATATAATGTTGTTTCTTGGTGAATTTTCGATAATT
TTCGAAAAAAAGAAAGCCTTTCAAGGGCTGCGAGCTTTGAAAGTTTAAAA
TATACCTGGGCTCTTAACACCCGAAAAAGTCGGAAAGATGGATAGGCGTC
ACTGCGTAATTTTCTATGTATATGATGTAGAAAGAATATCACTGTGCCTA
ATCTGGGAAACAAAGCTGAGCTAGAAGTTACAGTACAAAAGTTATAATTG
TAGTTGAAGTTTTGTATAGTTAAATTTTCTCCCAACTTTAGAGCACCCTC
CAATACTTTCCAAGGAATTTTTATTAAAAAAGGGTTTCTTTGGTTTTTCC
AGAGATCAGCCGGCGAAAAATGACAAATTTAAAACAAATTATCTCTTAAT
TAACAAATAGTCTAACTAGATTTATTTTATTTTTGCCTTATATGGTCACA
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CATTTTTGTTACCGCAGGAAGACGAGGAGTACGCTTCTATCGCCGAGCTT
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GGAAGAGAATGAGGCGCAATCACAACTCATGCAATTCCAAGATCAACTAT
CACGTCTCACGCTCGACAGAGAAGCAAGGTACGCGTTTTTTTTCATAAGA
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AAATGTTCTTAGCATGTTCTCATTTTCATCATTTTGCGAGTGTTTTTGTC
CACTTTCCTAAGAAATTGGCTGCTTTCCAGTCCACGATACCTTAAAATGT
TCTTATCTTGCTCTTAATATTTTGCCATTTTGCTATTTTTGCCATGTTCT
TTGACCACTGAAATAAGAACATGAGTCTCAAGTTTAATCAAACCTGACAA
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AGGCTTTTTGGCAACCTTAAGTTAAGAAAGCATTGAAAATAAGTTTGTTA
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GATGTTATGCATCGTCGGCAAATTTTTTTTTCAACGAATGAAATCACTAT
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TTATTGAATTTTTTTTTGACAATTTTTTTTGCCTCTATTTTTTATATTTT
TTCAAATTATACAGTAGAAGGGGGAAAATATTTAGATATTACTACAACCA
GCTGGGACAGACCCGTTGGGGCACCGCACTCACCGGAAAAATCACCAAAA
ACTCGTTCTCGGTGAGAAAAAATCTTGAAAATTAATACTTTTGAAAAACT
ACGAAAAACTTTGTCAGTCCAACAGTGAAAGCATTGAATTTCTAAGTCCT
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GAATAAAGATTAGGGCCTTTTAAATGACATATTAACCAGAAAAGCTCTAT
TTGTGAACTTTGGCTCGATGGATTTTTATTTCAAAAGGAAAATTAAAAAA
AATTATTTTACATATTTTAGAGGTTAAGATGTAAAAAAATTGACTGCTTT
TTATGATCGCGGAAGCTTTAAAAAGCTATAGTTAAAAATTATTAGGTATA
GTATAATATTTGGGTAATAATTTTTTTGCGGATGTAATTTACTATATTTT
TTTATTATTTTTTTCCCAGTTTTTGTTTCGTTTTCTATTTGTTTGTTATA
ATGCCAGCTGGCACACGACGTTGTTTCAACGTTTATCTAATGTTCATAAC
GTCCATATAACGTTAGATGAACGTTGAAACAACGCTGTATGCCAGGTGGA
ATGCCAACTAATTTTTGTAATTTATATTATTCGATACCAGTCTATTATGA
TAAATGCATACATTTTAAGACATGCTGAAAAGTCAATTTAATATGAGATC
ACATTATTGAATGTCAGGTCGAAGGCTAGAGGTGAACCTTTCCCACATGC
AAGAAACAGCGAACTTTCTAGCAC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_014839	XLOC_014839	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000571	supercontig	sc0000571:81567..102840 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00026428 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: PLCG1 (1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase gamma-1 OS=Homo sapiens GN=PLCG1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 540.806 bits (1392), Expect = 7.837e-168
Identity = 292/619 (47.17%), Postives = 397/619 (64.14%), Query Frame = 1

Query:    4 GDFSLSFWRQNKVQHCRIKLRQTQDGSTKYFLVGQKSFDNLWSLINHYQLNPLRSDQFEMTLNEPIPQPNAHIGKPWYHDNLTRQQAEDMLKRMRKDGYFLVRKRMGSNELDPDSDSYAISFRTAGSIKHCVIKKEGRLFMIGSAPFESLVELISHYEKFALYRQTKLKFPCNQEVVKELGI-NPD---LEEEAPDSFYALPNAT-THKPACLAKYDYIG-KDDELKFPKGAMITNVVKFDGGWWRGDYNGQVQKWFPVNFTEETVIKEKAPVS-QQEIESKQGGVMLEEMQKGVIDLTGCXXXXX-XXXXXXXYIFSIKSQSGV---FNCSVESEHEMIEWVTAIQDASTKAQESSSQLKQLVEQRKIAKELSDLIVYCVTVPFNEE--GFENGKYYQMSSFPELKAERFVSRKTVDLRFLRLNHRQLSRVYPKGTRFDSSNYDPVIFWNFGCQMVALNYQTPDRSMQIERGTFLDNGGCGYVLQPDILRDPNFNPYDPTTFNKLVEPLNLRLTIIGARHLPKTGRGLTSPFVEVEIVGLSYDCRSFQTKTKQDNGLCPTWFER-LEFDVICPPLAKIRFVVHDEDMFGDPNFVAQACFPVTTLRPGHRSIPLKNAYS 1818
            GD++LSFWR  KVQHCRI  RQ   G+ K+FL     FD+L+ LI HYQ  PLR ++FEM L+EP+PQ NAH  K WYH +LTR QAE ML R+ +DG FLVRKR   N       SYAISFR  G IKHC +++EG+  M+G++ F+SLV+LIS+YEK  LYR+ KL++P N+E ++++G   PD   L E     FY   N   T K A  A +DY   ++DEL F K A+I NV K +GGWWRGDY G+ Q WFP N+ EE V     PV+ + E E       L ++ +GV+D+  CQ  +  + + +R ++FSI   S      + + +S+ E+ +WV  I++ +  A    ++ K +  ++KIA ELS+L+VYC  VPF+EE  G E   Y  MSSFPE KAE++V+ K    +FL+ N  QLSR+YPKG R DSSNYDP+  W  G Q+VALN+QTPD+ MQ+ +  F+    CGYVLQP  +RD  F+P+D ++   L EP  + + ++GARHLPK GRG+  PFVE+E+ G  YD    +T+   DNGL P W  +   F +  P  A +RFVV++EDMF D NF+AQA FPV  L+ G+R++PLKN YS
Sbjct:  593 GDYTLSFWRNGKVQHCRIHSRQDA-GTPKFFLTDNLVFDSLYDLITHYQQVPLRCNEFEMRLSEPVPQTNAHESKEWYHASLTRAQAEHMLMRVPRDGAFLVRKRNEPN-------SYAISFRAEGKIKHCRVQQEGQTVMLGNSEFDSLVDLISYYEKHPLYRKMKLRYPINEEALEKIGTAEPDYGALYEGRNPGFYVEANPMPTFKCAVKALFDYKAQREDELTFIKSAIIQNVEKQEGGWWRGDYGGKKQLWFPSNYVEEMV----NPVALEPEREHLDENSPLGDLLRGVLDVPACQIAIRPEGKNNRLFVFSISMASVAHWSLDVAADSQEELQDWVKKIREVAQTADARLTEGKIMERRKKIALELSELVVYCRPVPFDEEKIGTERACYRDMSSFPETKAEKYVN-KAKGKKFLQYNRLQLSRIYPKGQRLDSSNYDPLPMWICGSQLVALNFQTPDKPMQMNQALFMTGRHCGYVLQPSTMRDEAFDPFDKSSLRGL-EPCAISIEVLGARHLPKNGRGIVCPFVEIEVAGAEYDSTKQKTEFVVDNGLNPVWPAKPFHFQISNPEFAFLRFVVYEEDMFSDQNFLAQATFPVKGLKTGYRAVPLKNNYS 1197

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00026428 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00026428 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
PLCG1	7.837e-168	47.17	1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodie...	[more]

You are here

TCONS_00026428 (transcript) - C. hemisphaerica