TCONS_00026340 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00026340
Unique Name	TCONS_00026340
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3322

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000569:125481..144013-

transcript sequence

>TCONS_00026340 ID=TCONS_00026340|Name=TCONS_00026340|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3322bp
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GACTTTTCAACGACAGAATCAACTGCACACATGAATCGACTTCAAAAGAT
GGAAGGTCAACTTAGCAAGTTTACCAATTTGATGAAAGGTTGGCAATTTC
GTTGGTTTGTACTTGATCCTGAAAGTGGAACACTGACATATTTTTTGgaT
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CTCACCAAGTGATGAAGATTCAATGTCATTCATGATAAGCGCTCATAATG
GAGATCTTTATAAGTTGAGAGCAATTGATGCAAAGGAGAGGCAGCACTGG
ATCAATCTAATCAGAGCAGTTGCAGAGTACCATAGTCAAAACGCCTTAAC
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GCAACACAACATCTGCAGGTGCTacaaacaatattttgaaatcacCTGGT
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TGCTCCGCCACCTCCACCTCAACAACCACCACAGTTGGCAAATCCAATAC
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CAGTCTTCTGCTGTAGAAGCATTAGAGAATGGACCTCCATCTGGTGAAGC
CTTGAATTCATTGGACGAGCAAGTGCTTTTACTGAAAGCCACTTCACAAG
CCACTGTCAACATTCTCCAACAATGCTACTCTATTCTTCAACAGCAGTCT
TTGGAAGTGAGAGGATCAGCTCAAACTACAAGTCTACCGCCAGGTGCAAA
GATTAAGTGGTTTGAACCTCAgaATAAAGGGTTTATCAATAAGAGTGGAT
CGACAACCAGCGAGGAGAGCATCGAGGAAGCGATGGATGTAGCAGCTGCT
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ACATTCTGAGGAAGAAGTAGAAGATAAAGAGAAATACACAGACGAACAGC
TGGAAGATATGGAACCTCACAAAAGTGTCATACTTCACCTCTTATCACAA
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ggaaaaaCGTTCACTTTTGGAGATGTATGCTGACTTTTTGGGCCACTCAG
ATCTCTTCACAAGTATACCTGACCGAAAAACACCTGAAGATCGAATGTTA
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TGTTGCTAAGAAACCATATAACCCAATCCTTGGAGAATATTTCGTCTGCT
CCATGGATACTTCGTCAACTATCAATAACACTTCACAACAAGAAACCTCA
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TGTTTACTTCGTTGCTGAGCAAGTTTCGCATCATCCGCCAATTTCGGCTT
TTTACGCGGAGTGTCCCTCGAAGAAGATTTGCATGAACACGCACATTTGG
ACGAAATCCAAATTTTATGGAATGTCTATTGGAGTTATCAACGTTGGAGA
AGGTGTGATCAGCTTGCCGGAGTTACACGAAGATTACATCATAACCTTTC
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GCCCTGTTGAGAAACAACTGGACTACGAATCTAGAAAGTTATGGCAGAAT
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CTGGAACAGAATGGAAGACAAAGttgtTCAAGAAAGCTGGAGAGACATAT
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GGTATTGGCCACTAATTCTAAATTTAACActagaatagacgatatcgcgt
ttagataaatgcaatgcattctggtttctcggggaccctcaagggaatta
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tttagtttAAGTGTTTTAATTCAATTACTTTGTTGCAATCTTTACTATTT
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ATATAAAATCTAcgctaaaatttattttgttacaTATGAAAATACAATGC
ATTAATTTCAAACATAACCATC

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transcript from alignment at sc0000569:125481..144013-

Legend: exon

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>TCONS_00026340 ID=TCONS_00026340|Name=TCONS_00026340|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18533bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000569:125481..144013- (Clytia hemisphaerica)
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GTAATTAAAAGAAGCTCAGATTTAACTTATTTTATTTGTCTTTTTTATTT
GTTACTTTATTTTCAGATTCATCTGATGTTGATCTGACAAAAAAAATTGA
TAAAACACCCATCCATACCAACTCATTTGTGCTATACCATTACCATTTAA
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TTTAGGACTTTTCAACGACAGAATCAACTGCACACATGAATCGGTAAGCC
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GGACCAAGCTATATCCGCCATCTTTGTTTTTTTGAATTGGTACTCGTAAA
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TCCCTAAGCTAATTAGATCTCACAAGACTCTACCTTTTTAAGATAGTTTT
GCCAACACAGTGTTTAGGGCTACACAAAAGGCTTCTGTTCAAAGTATTTC
AATGTCAAATGGAGCTTTTCAATTTCATTGATTTTGATTTTCCTTTTTAA
GACTTCAAAAGATGGAAGGTCAACTTAGCAAGTTTACCAATTTGATGAAA
GGTTGGCAATTTCGTTGGTTTGTACTTGATCCTGAAAGTGGAACACTGAC
ATATTTTTTGGTAACTTTAATATATATCTGATTAGAGAATCTATAACGAT
TGACAACCAACTTAAATAATATTCAAGAAATCTTTAAAGGCCTTTTCATA
AATTATTTTGAGTGCACCGTCTGTCTTATTTTGAAACCATTATAAAGGCG
ATTTAAATCCTTGAGTCTTCAAATTTTATCTTTATAAGTGAAGTAAACAT
GTTGTAGACTCCTCTGGGAATCAATAATATTATACCATAATCAATTTTCT
TAAACTTGGATACTCTCTAATATCAAGAATGGCTGTTAACCAAAATGGAG
CCTATAAAGTAAGTCCTTTTATTTATATGAAAGACATAGTTTGATAACAG
CAGCTTCTTTGTATGTATAATGTCTTGTGATTCCTGTTTTTCTTTCTTTA
GGATAAACAAAAGCAGAAGAACAGAGGGACACTACCTTTATCAGTGAGTA
CTAAAGTCTGTCTCAAAATAATTTGCAGCCGGAGAAAAAAATGGCTGTAA
CTTTTGATAGAATTTGAATCAAGTTGCGATTTTGTGCTCGTTAAAAAGAT
ATTCGTGAGTGGAATATTATCAAGTAAAAAATTTGAGGAAAAAAAAGGAA
AATGAAAATGAAAAATGAAGAAGAAAAAAATTAACTTTTTGTATAATTAC
CATTTTCACAGGAGTGACTCTTCAATCTTAGATCATCATCACTGTGAAAA
AATTTTTCAAAAATATTCATTCAATCAAAAGATATCAAACTAAGTTTATC
GCTGGTTGATCGACAAAAGGCTGTTTTTTTTGTCGTTTTTTAACGTTTTT
TAATACTTTATAGAGTCAATCAGCAATAAACTTTGTTTCTTTTGATTGAA
TGAATATTTTTGAAAAATTCTTTGACAGTGATGATGATCTAAGATTGAAA
NTGTTTGATATCTTTTGATTGAATGAATATTTTTGAAAACTTTTTTGACA
GTGATGATGATCTAAGATTGAAGAGTCACTTTTGTGAAAATGGTAATTAT
ACCACATTTCTACAAGAAATTGATTTTTTTCTTCTTCATTTTTCATTTTC
ATTTTCCTTTTTTTTTTCAAAATTTTTTACTTGATAATATTCCACTCATA
AATATCTTTTTAACGAGCACAAAATCGCAACTTGATTCGAATTCTATCAA
AAGTTACAGCCATTTTTGTCTCCAGCTGCAAATTATTTTGAGACAGACTT
TATATCATATATTTTTGTGATGTACATTTTGCATTTTCCTCTCATAGCAT
TAAAGTGTTGTTTGTTTATTCGTTATTTTTATTGGGCTCGAAATGATGAA
AAGATTCCCCATCCTTTTGTAAGTTTTTTCAATTTTTTTATGTTTATTAC
TTTATTCTTGTTTTTTTTTCATTTTTATTTCCTGAAGGGAGCAGTTATCT
CACCAAGTGATGAAGATTCAATGTCATTCATGATAAGCGCTCATAATGGA
GATCTTTATAAGTTGAGAGGTAAGAATTAAAAAGAAGCATTTTGAGAAGT
TGTATTGTTGCGTAGTTCTATCTCACTTTTTTCCATACTGTAACAGAACA
ATTTTATAAGAACACAATACTAAAGAAGATATTTGCAGTTAAAAATTATA
AAGAAAACAAGAAAAGATCTTTTGCTTACATTCATATCTTAGCAATTGAT
GCAAAGGAGAGGCAGCACTGGATCAATCTAATCAGAGCAGTTGCAGAGTA
CCATAGTCAAAACGCCTTAACCAAACCAGCGCGGCCAGCACCGCCGACAG
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AATATTTTGAAATCACCTGGTTTGATTAAAAGTCATAGTTTGAAGCTAAG
CCCAAAGATCAGGTCACCGCGTGCTCCGCCACCTCCACCTCAACAACCAC
CACAGTTGGCAAATCCAATACAGGAAGAGTTGAAAAATATTAAAGATGCA
CTGAACAGTGTTGCTGAGTTCCAGTCTTCTGCTGTAGAAGCATTAGAGGT
TTATTTTCTTAGATTACAGACAGTGTCATGTTATATGATTTTTATATCTG
TTTCTTCCATTCTTGATAAGGGATCTGATGTTGTTTCAGGCCTTGATTTT
CCAAGTTAAGTGGTTTAAATTATAGCGTCTAAGAAGGCGGAAAAGTGACC
AATTTCGCCCAGAAATGAGGATTTTAAAAGTGTGAATTGTGGCATTTCGA
AGACAATAAGGTTAACGGCGAGAGTGTCATGTGATGCATCCCTGCAGCTC
TCCACCTGCCCCAATGGTGTGAACACTAGGCTTTTTCTAAATATTATACA
AAATTAGATTCCTACTAAAATGCACCATAATAGCAGACACAAAATTCGGG
TTACTAAAGGTAACTAAAGTTTGTTTCGTTTCAAGATCGTTTCTCATTGA
TTTTATGTTTATTTTATAATATTTAGAATGGACCTCCATCTGGTGAAGCC
TTGAATTCATTGGACGAGGTATGCTTTATTTTGTGTCTCAACCTTTTCAT
ATTTTCATTCCACTCCTTTTTGCCTTCATCACGAGAGTCTGTGATGAAAC
CTGAAATTGGTCAATATGTTATTGAATACTATGTGACCTTCCATTAGAAG
AGGACCACTTTTGTTTTTAAAACCTTACCGATCCAACGTTCTTCTTACTG
GTAGGTTAATGATCTAATTGATGAATTTCTTTCTTACTGATTACAGCTGC
ACTTTTCTATCAGTAAATTTTCACAGGTATATATTATTATCTTATGGTAT
TAGGCAGGAGGATTTGAATTAAAATTCAAGAAATTTGATAAGGCTTGGAA
AGGTTGGAAATAACAATGGATGCAAAAATTGGGGGAGTATTTTTAGCAGT
GAGATTCTTTTAAGTAACAAATAGTGATATTTATCTTTTGTTCAACTTTT
AGCAAGTGCTTTTACTGAAAGCCACTTCACAAGCCACTGTCAACATTCTC
CAACAATGCTACTCTATTCTTCAACAGCAGGTATCGATAGTTTTCAAATT
ACACTTTGTTTACAACAAACATGGATATTTTATACACGTTTTTTTTTTTT
AAGAAACTAGTTTTACCAAGCAGCCTCAATGTTTCTAAAGAAATCGGCCT
TTTGAGCCTTAAATGTTTCTTACATGTTTCTAAAATTTTTGACATAATCA
GCCTATTTTTCAAGCAAAGAAAAAAAAACGTTTGTTTTGATTGGAAAGTT
CTTAAAAAAGCGAAATAAAAAATGTTATTTCTCATTCTCAGCCTCAGTAT
GTTTCTTAGATGTTTCTTAGTTTTTAGGCATTCTGAGCCTCATGTTTCTT
AAAAGTTTGTTTCTTAAAATAAAAAAAAAACGTGTAGATCATTTACAGGG
GGTTTGAGTTTTTTAAAGGTTTTGCTTTTAAATAAGAGTGATATCGACTT
TTTACTCATCAATTTTAATTTACAAGCTTTTTGATATTGAATTGACATGG
ATGTGGAGCAAGATTGTTTAGAAAAAGGAAAAGAAAAACATTCTTTTGCT
TATATCAGCATAATATAACAATAGGCAGACACTGTCCTGGTGTGAAACAT
GTGTCTGATATGAAACGGGAACACTTATGTGTTGAAATAAAACCTTTAAA
ACCATATGAAAATAGTATAATATCCTTAGAAATATTCCTTCGATTGTTGG
CCAAACAATTTACATAGAAATAATATCGACTTTGAAAACAAGTTAGTAGC
CTGTAAGATCTATTTTTTAATAAAAGGCCTAAAAAACGGTCTAGTTGAGT
TTCATTTTTCTAATCCAGTTATCCCAAATCTAAATGTGGATTTAGAGAGG
TTTTGCCTCTATTGATACCTAAGTAACCACTTGAATTAAAAATTGCCAGT
GAAAATTGCCTATAGTTGATAGCCTTTATAGTAAACTGTATGTTGTTTTA
CGGTATACTCGGTAAAGAGAGCCGTAGGAATTTAATCTGAGGAAAAAAGG
TGGAGAAAATGGTCTCATTAAAATTGAGAAAAGTGTTTCATTTTTCAGTG
TTGTTAGTAATTTTCTATTTTAACAAAACCATGTGTGATTTTTTTCTTTA
AATGGAATGGAAAAATGTTTCAATCTGATAAAGTTTTTTATTATCATAAA
ATAGAATAGGAGGAGAAATTTGTCGATGTTTTCCTAGACGACTTTTCGTT
TTTGGCTTGGAATGGGCATTTCCATGCTGAATGTGGGTCGTGGATTGATC
TGATAAACAATACTTTTGGAGAGGTCTTACTTAATATTCAAAGGATCCTT
CGAAAATGAAGATGTTTTGCTAAAAGAACTCAATTTTTCTAGTATTTTGG
CCCTTTGATTGCTCACAGCCTTTTTATTCTTGAAACATTTTGTTTTTGAT
TCTATGAATGCAAGAAAAATATCTTTATATTATAAATAAAAATTCAAAAA
GATAGTAGAAAAAAATGGTTTCAAGAGAGAAGAGAAATATATAATAAATA
ATTCTTTAAAGAAGAAAGAAACATTAAAAGAAAATGAAGAGGTGAACCTG
GTTAAAAATAAGTTTCAAGTTCAATAATTTACAATACTGTATTTGGAATT
TTGCTAGTCCTCCCACTCAAGCTTGAGGGCTTGATGAGAGTATCATAGCC
TGTCTTTTGTTGTTTTTCACTCTATAAATCTTACTAAAAGTTTCTTTCTT
CTTATTTTTTGTATTGTTTTGTTTGTCTTTTTTTAGTCTTTGGAAGTGAG
AGGATCAGCTCAAACTACAAGTCTACCGCCAGGTAAGAAAGCTGACTCCA
TTTTATTAACCCTTGACTGCGTGGTTGGATTCTGAGGGGCCTGGTGATGA
ATTTACAAGGAAATGATGTCAAAATTCGCTGTCTTTAAGAATGTTGCATT
ACATTTTTATGTCATTCCTTCCTAGTAAATTCAAACCCACTGACCTTAAT
AAGCCCTGGACCAAACTATATCCACCATCTTTGATCAGAGTTCTTTTGAA
AGAGGTACCCGCTGCCTAACGACAAACGACGGTACATCACTAGTGTGCAA
GCTAATATAAAGTAGGTCTAGCGCTCGCGATGCGGATTCAACTTTCAACA
GAACTCCGATCAAAATATTTAGCTTGGTCGGGACTGAGAAACTGCCTCCA
GGGTCTATATAAAGCTCAGTGTTGAAACCCGAGCTCTTCACGCTTCAAAG
GTTGATATATTGTACTCGAGAGTGATTGGCTATCATTGGCTATCATTGCC
TCTCTTTTATTCTAAATTAAATCTATAGATTATCGCTCCCTGGCTGTTTA
AAGAAACGAGTTTGAGCGACCAAAGTTTCATGTAATATTTAAAGTCAAGC
ATGGAGTGATAAATATTTCGAAAAATGTTCAACAACATAAAGCCAACTCC
TCTCTAATCTTTATTCTAACCTTTCTGCGATTCTCAGTTTGTGAAACCTT
ACACTAATATGAAGAAGATTCTATGTCCATTTAAAATTATCGAAAAAAAT
ATGACGTCATTTGCAATGACTGGATTTCGAGACATGTTTGAACAAAAAAA
GTAAATCCTGATTGAATGGTGGGCCTATGGTTGTGAAATTAGTAAAACTG
TTGATAATAAGATTAATATTAAAAGTCATAAAAATTCTTTTAAAAAATTC
AGTGAGCTACTACCGAAAGAGCAGGTGGTTGAAAACACTTCCTGACAAAA
ATAGGGTTAAGGTCGAATTAGAGAAAGTGAACTGTAGCTATTCCACGAAA
AAAAAAACAAGTCTTCTTTTAATAATTTCTACCACATCATTGGGAATAGT
ATCTACCACGTTTGATTTCGATTCCCTCAATGTCTATACATTTCGTCTGT
CGGTTTTACTTTCAATGTTTCCTTATAAAATGTTTAACTCTCTCTTCCTT
AACAATTTTTAGGTGCAAAGATTAAGTGGTTTGAACCTCAGTAAGTCTAT
AATGTTTTGTTTTTTTTGCGCTATTACAGAAAGAATTATTATGATGGTTT
TCAGATCTTTGTAACACTCTTTCCGTGTGATTTTCAGACATTCTAGGGTT
AACTTTAGGTTTTTTTTTCTGATATTCTTCGAATTCGTTTCGAAAGTAAT
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GAGAGCATCGAGGAAGCGATGGATGTAGCAGCTGCTGGTGGTGCATGTGA
TAACCTCACTCAAAGAAGTAAGTAGTGTTGGTTGAAACCTTTGGTCTCAT
TATAATCTCTTACAATTATTATAATCTAAGGTAAGTTATCCTATCAACAG
TTAATCTCCGAGTAGATTCTGATACTCTGCGCATGGTTCCGTAAGAAAAT
CTGCCAAGGTTCACAGACCGGATTGATCTTTTTCATCCAGGTTTGGGATG
AATATTAAAATGAGTTTTTGAAAATGTTGATTGGCTGAAGCAAAACAATC
GCACAAACATCAATCATTAGCATTAACATTAGAATCCAGTCGCTTTCGCT
TTCGTTTTTAAGCGAAAAGGAACGCGATTGTTTTGGCGGAACGCCAAAGA
TTTCAAGGAGCCACATCCCTTTAGAACAGAGCCTGGTGTGTACAGAATGG
ATTTTCCGTATGAGATTAATCAGACCTTGACGGCTTTTAAGGGGAATGAT
GATGAATTCAAATGAAAAATCTTTTCTAAATGCATGACATGATTAAACGA
TAACTTAAAGAAAGAAGCCAAGTAAAAACTCTATTCGATGCAAGACACAA
TTTCCCTGAGAACTATTTTTAACATTCGAAATTTCAAAAAATCATTAAAA
ACAGCAATCTAGCTATAAATAAGACAAAATGACAAAAACACAATTCTATT
GTATCTTTGATTCCTTTTTTTCTTATTTATATTTTGCCTACAGTTTCTCC
ATCTTATTTGCACGTCATGAACATTTCCAACGCGAGCAAACTCAATGTAG
ACCCAAGTTCTTTGAGCAACTAGTCGAGGAATGGTGATGTATTTTTCGAA
AGTGTTCTCACATTATCACACCCATAACATCAAAACCTCTCTTGGAGATT
TCCAAAACTTTTTTCAGCTTTTCCAAAAATATTATCCCACTATTTCTAAA
TTCTGTAATGAGTTTTGACAGTTGTTTTTTTTTTTTGGTATTNTATTATC
CCACTATTTCTAAATTCTGTAACGAGTTTTGATGAACACAGTTGTTGTTG
TTTTTTTTGGTATTTTAATTTGTAAAAAAGGTAAGTGCAAGAGAAAGGTT
TGGTCGCTGTTTTTGATGATTTTTTGAAATTTTGACATTAAAAAAAAGTC
AGTTTATTTAAAATAAGTTTTGAACTACTTTTTCAAACCTAATGTATGAT
AGCTCAAAATTTAAGTTAGAGCATCCTCTATAAGATTAAAAAAGAATGAA
CAAAAAATTTAAATCCTGAAGCGCACAATATCTCGACAAACCTGTATACT
TTTTTTTTGGTGCACCCGGTATTTTTCGCAAGAGTATTAACCCTATCTAC
CCAGCGGGTGTCAGGGCTGTGTTGCTCGGTTAAGGGGAATGTCCCCCTCT
TCAATAATTCCAAAATGGTACCCTGAAAATGATGACGTTATCAAGGTCAT
TTTTAGGTATTCAATCTATGAACTAAAATTCGATCCTTTAATAAGAGTTT
CGAAGTAGAGAGAATCCATCGTATTTACTTTTTCTTCTCTTTTTGCTTTG
CATCAGGTTTGATGTCGATCAGTCAACATTCTGAGGAAGAAGTAGAAGAT
AAAGAGAAATACACAGACGAACAGCTGGAAGATATGGAACCTCACAAAAG
TGTCATACTTCACCTCTTATCACAATTGAAACTTGGTATGGACTTGACGA
GGGTACGTGCGTTTTCCTTTTACTCTTAGACCAACTAAGGTTAATATATA
CCGTGGAGGCCAGGCTCTCGATCCCGCCCAAGGAAAATCTTTTTATCGGA
ATTTTTTGAAAGTGGTACCCTAATTGTAGCACTACTCAATAGTGGTGTAA
ATGCATCGAGAGTGCTAGCTCTACTTTGCATACTTGTGATAATGTAGTGT
TTGGCGTTTATTCTTAACACTGCAATAGCTTTTTTGCGGGTACCAAAACT
CCGATCAAAGATGGTGAACATGACTTTGTCCAGGGTTTATTAAGGTCAGT
TAGGGGTTACATATTAATAAATTACTTCTTACAGTCTTAGCTAAGAATCT
TAATAAATTCCTAAATTTGATTAATATAATGATCGCGGGCTAATATTCCA
TCATATTCAAGAGGGTTTTCCCTACTATTTTTTCAGGTTGTTCTACCGAC
TTTTGTTTTGGAAAAACGTTCACTTTTGGAGATGTATGCTGACTTTTTGG
GCCACTCAGATCTCTTCACAAGGTAATGTATGGGATTTTTTAAGCCACGA
TAACAAACCTTCGAACACAATCTTTTGTATTTCTTAAAATTAATGTCTCT
TCCTGAAATCTGCAAAAAAAGAAATTGAAAATGTCTTTTTTCCAAATAAT
GAAAATTTGTGATATAGTTGACGCTCTTTAATTCGACGTTCTACTATTCG
ATAGGCTCCCTTATTTGATGAAATTTAAAGTCCTCGTCAACATGAAGCTC
TCATAACCGACGCTCCCTTATTCGATAAGCTCCTTTATTCGATGAAAATC
CAATTCCCCTTGAAGATCGAATTAAAGAGCGTCAACTGTATGNGAAACTT
GGTATGGACTTGACGAGGGTACGTGCGTTTTCCTTTTACTCTTAGACCAA
CTAAGGTTAATATATACCGTGGAGGCCAGGCTCTCAATCCCGCCCAAGGA
AAATCTTTTTATCGGAATTTTTTGAAAGTGGTACCCTAATTGTAGCACTA
CTCAATAGTGGTGTAAATGCATCGAGAGTGCAAGCTCTACTTTGCATACT
TGTGATAATGTAGTGTTTGGCGTTTATTCTTAACACTGCAATAGCTTTTT
TTGCGGGTACCAAAACTCAAAGATGTTGAACATGACTGTGTCCAGGGTTT
ATTAAGGTCAGTTAGGGGTTACATATTAATAAATTACTTCTTACAGTCTT
AGCTAAGAATCTTAATAAATTCCTAAATTTGATTAATATAATGATCGCGG
GCTAATATTCCATCATATTCAAGAGGGTTTTCCCTACTATTTTTTCAGGT
TGTTCTACCGACTTTTGTTTTGGAAAAACGTTCACTTTTGGAGATGTATG
CTGACTTTTTGGGCCACTCAGATCTCTTCACAAGGTAATGTATGGGATTT
TTTAAGCCACGATAACAAACCTTCGAACACAATCTTTTGTATTTCTTAAA
ATTAATGTCTCTTCCTGAAATCTGCAAAAAATTGAAATTGAAAATGAAAA
TGTCTTTTTTCCAAATAATGAAAATTTGTGATATAGTTGACGCTCTTTAA
TTCGACGTTCTACTATTCGATAGGCTCCCTTATTTGATGAAATTTAAAGT
CCTCGTCAACATGAAGCTCTCATAACCGACGCTCCCTTATTCGATAAGCT
CCTTTATTCGATGAAAATCCAATTCCCCTTGAAGATCGAATTAAAGAGCG
TCAACTGTATGTTTATTTATCTCTGGTTTTAGTATACCTGACCGAAAAAC
ACCTGAAGATCGAATGTTAGCCGTTTTAGAATTTTATTTGACCTCATTTC
ACGTTGGAAGAAAGGTAATTCATTGTTTATTCATTATGTCATGAATCATT
TTCTTTGATACCCGGGTGGCTCTGTTTCTTTTTGTATGTCCTGACAGGAC
AATACCTCCCGGACAGTTGGCCCGGACAATTCATCCCAGGACAATTGCCT
CGAAACTATTGTTTCCCCACGGAAAATTGACACCCAGATTCGAGGAAGTC
TAAAATTGTACTGAAGATAAAACATCAAAATTCAAACTTGAGAAAAAAAT
AATTAAAAAGTTCATTCGAAGCAAATTTTTTTATTTCTTATAAAAAAGGA
CGAAATTGAGCCTTTTCTNATTCGAACCAAATTTTTTTTATTTCTTATAA
AAAAGGACGAATTTGAGCCTTTTCTGTCTGATTTTCTCTCCATATGATGT
CAAAAAAGACTGGGTTCTAGAAGCGAAATTCTTTTGTTTTTCTGCAACCG
CTAACCAAACACTTTCAGGAGCTTATGAGAAACTTCTTAACTTTCCTTTA
GTTAGAACTAGCGGGAAACACATTTTGTAATTTCTCCAATATATAAAATA
AATAAAAGATTTCGTATGTATTTTGGGTAAGTATGCGGTTTGTCATTTTT
GACCGTAGTCGGAAGTTATGGCTAATTATATTATGTTATGACTGCTAGAA
CTTTTCTGATTAAATATTCGTGAGTAATAATAAAAATAATAATGATGATA
ATGATTTTCTTTCAGTCTGGTGTTGCTAAGAAACCATATAACCCAATCCT
TGGAGAATATTTCGTCTGCTCCATGGATACTTCGTCAACTATCAATAACA
CTTCACAACAAGAAACCTCACAACCGGACCCACTTTTGAATGGCGACAGC
CCAGTGGGTCCTGAAGGTCGTGTTTACTTCGTTGCTGAGCAAGTTTCGCA
TCATCCGCCAAGTAAGGCCTTTTATATTTTCTATGAAACTTTTATAAAGG
GTACCCTTCGTTGGCTTTTCCGTTTTCAAATTCAGTATAATCCTGCAAAA
TTTGAAGAATCTTGTCTAATTTGTTGTTTGAAGTCCATTTCCGTCTGAAA
GAATTAGCTTTGACCACTGAAAAGCCAAATTTCTAAAAACTTCGACCACA
AAAGGCCATATAACTTTGGTCCAGTGCGCCTCTTATGAATTAAATTTTGG
TTTTAAAGAATATCCGGCATGGTTGAACCACCGTTCAAACAGTCTTCAGC
GGTTCTTGCGAACAAAGTAATCTCAATATAGTACACCTCACAATTTCAAT
GAAAAATAAATTCTCTTGTTCCTAGCTGAAAAATCAAGCGGGGATGGTCT
TGGAGTGCAGTTTTCCCTTGAATTTCAAATAGGGATGAAATCAAAGTCAA
TTTTTTAGTATGGCTGAAATTGAAGAGTATCTTCCTACCAGGGACAAAAT
CTCGGCCCAATTTTACAGTGAGGCGAGGGTCAGAGGCGTCTGTGACACAG
TGGTATTGACAATGAGGCACTTTGAAACTTTTGATTACATTTTCACTTCT
ATTAATATTTTAGTTTCGGCTTTTTACGCGGAGTGTCCCTCGAAGAAGAT
TTGCATGAACACGCACATTTGGACGAAATCCAAATTTTATGGAATGTCTA
TTGGAGTTATCAACGTTGGAGAAGGTTGGTTTTGTTTTGTTTATTGGCAG
TTTTATTGTTAGGTTTTAGAGTCAATATTTTAAGGCTAGCCGTCGTTGTT
AGTTGTGGAAGGACCACTAATTAAATAGGGACCCTCAGGCTATGGCGCTG
ATTTTTTACTTTTTGATATTGTGTCCACGGGACTTCCCTTTAAATATTGA
AAATCTTAGAGTCATTGATGATTTAAATATTGAGAACTTGAAAATATTTG
TAATCTGATTTTGAGCGATCTGATTTTCTTACTCGTGTCTCGAAGTTTTT
TATCATCAAACTTGTAAGATAGGAATGAAACATAATTTCGCCAAGGAATA
AGTTACAGTCTGGTACTCGTAAAAGTCTCGAAAAATTTAACTTCGCTAAA
GTCATTACCTGTATAAATAAAGTACAATGACTCTTGCCAATTTGTCTTTC
CTTTTTGGTACAAAGTTCCAAACTGTTTCAATGACTTATTTTTCTCACGC
TCAATTAAATATTTCAGGTGTGATCAGCTTGCCGGAGTTACACGAAGATT
ACATCATAACCTTTCCAAATGCTTATTGTAGGTTAGTATTGCGATCTCGT
ACAAAACTACTGGCAAAATTTTATCTTCTTAAGAAAAATCTCTAAACCTT
TTTACCTAAAATCATGTTTAAAATACAGATAATGGGGATTCTTTAAACCC
GACAATGAATGAAAAGATCTTTACGTTCAAATTTTTGTACGTTGAAAATT
GTTGTCTTGTTGAAGTCGAAAATTTCGTAACTTGATATCTGGACCTTGGA
AGAACATTAGGCAAAAAAAGTAAAGGACTTAAAAATCTCTTAGCAAAAAA
TCAGAATACTTTATCATTATCCTCTTGAGAATGTGCTCAAAAGTGTGAGG
AATACTTTTTTCATCATGAAACAATTATGTCATTCCCCCTTAAATATTTG
AAGCATAATCTCAATATTTGTTGTTGTCTTATCTTTTAGGTCGATCCTAA
CGCAACCTTGGATCGAGCTCGGCGGCCGAACGTTAATAAGATGTCCGCAA
TCTGGATACAGCGCATCCGTTACTTTTCACACTAAGGTAAAGGAAAGCTG
AATCAGCACAAACTTGGGGATGTATGAAAAAAATAAATTTAGCGGGAATT
TAAGTTTGGCGAATTCTAGGTTAATCTAGCGAAAATATATTTTTTTAATT
CTTCTTACGAGGATTTAGGAGTGAAATTAGCCATTAAAGTTCTTTTTACT
GGAACCAGGTTTAATCTTTCCACATTTCTTATAGCCATTTTATGGTGGAA
AGCTGAACAGAGTAACCTTCGAAGTCAAGTAAGTTATTGATGGATTATCT
TATCTTTTCATATCTTAAAGCCGTTATACTACAATTGACTGAGCGGTATC
ATACTTTGAAAATATCTATATGCGCTAGGGACAACATTTCTCGAGACCAG
CCAATCAAAAAATTTGATTGGAGTTTTTTGAAAGTGATATTTTCAAAAAA
ATGGTAGCACTTACTCAAACTTGGGGATACATTTTAAACAGAAAAATTCC
ATTGAATTATAAATTAACCTACATCAAGTAAAGCTACCATTATGATACCA
CAAAAAACTATGGTAGCTTGGTCGATGGTATGTAACAGTCAATGGTAGTG
AGAAATGAGCGNACAAAAAAGTATGGTGGATATAGCTCGGTCAAGAGTAG
TGAGAAATAAGCAAAAAGATTTCAGTTTTGTTAATGTCGGATTTCGTTTC
CTCTCAGGAATTCTTCAAGCGATACTGGACAAGTGATTTGCCACGGTGAA
GGATCATGGGATGGCAAAATTCAATTCAACTATCCCAAACGAACGGTAAT
TTTGTTTTCATTTCAATGTTAAAAAGTCTTTCCGTCTCAAACAGGTTTTC
ATCTCAGTGAAGTATATAAGAGGTTTTTCCGTATCGAAATCCTGCATAAT
TATTCACAAACTTAAAGAATATGTGCTAATTTGCTGCCAAAAAAACATTT
TCTGTCTCAGACGAAAAACTGATTCGACCACTGCCATTTGACCACTGCCA
TTTGTAGTAGTGCTACTATAGTTCAGGGAGACCTCTGTCCCAGCCTCCTA
AAAATCATTCACCTACGTTTCTATTCCCTACCTAACAATAATTTTTATAA
TGATGAATGAGAGTTTTTAAAAACTGGCGATTTTTGAAAAGATAATGTTG
AGTGGAATCATCGATACCGATGACGTTCTCTTTCGTACAGGTCGATCTTT
CTGATACTTTAATTATGAAATAATCACTACGAGAAATTTTCTTTTCGATT
TTGGACCTACCCCGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCTGTGTTCCGTTCGT
CCGTCCGTTCGTTCGTTCGTCCGTTCGTCTGTTACCAACTTTACTCAGGA
TTGAATCATAGGAATCTTTTGATTTTTGGTACAAAGGTGCAAAATGGGGG
TGGCCAAAATGTGACGGAGCCCAATTTTGGGGAAAAAAAATTTTGGGACA
AATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGGTGTTTTGGACTTTTGTGAA
AAATTGTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTGCATGAAAGTAGGGTAC
CATCATAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTGCAAAAAAATTTTGTT
GGCTCAAAAACACATGTTTATCTATAAGAATCGCTATTAATAAGCATACA
TCAATGTTCTTAGTCAAATTACTCAATTTTTTTATGAGATAGATGTGTTT
TTTGCTCATGAGGGCTAACTTTTAGAGAGTATGTGTGTTTAGACATGAAA
TTTTGGTTGCTTAGCGTGTTTTTATAGAAAAACTGGCCAAATTCGATATT
TTTTTATAAGCACATTATCAATTACTTAGGTATTAGCTTTTCTCGAGATT
GGCTCTTTCATTCTTTATGATTTTTTGCACATAGATACATAACTATAAAC
CATCAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCAAAAAAAAATGTTTTTGGGCAAA
TTTGGGCCGAAAAACGGCTAAAAAAGGGTTTTTTGGACTTTGTGAAATAT
TGGATCATTTTTTTCTGATTTTTTGCATGAAAGTACTTCAAGCAGATTTT
TGTAAAAAAAGAATTTTTCAGCTCAAAAAACGCATCTTTATTTATAAGAT
TAGAATCACTATTAATAAGCGTACATCAATGTTCTTAGCCAAATTACTCA
ATTTTTTGATGAGATAGATGTTTTTTTTGCTCACGAAGTCTTGAATATGA
AAGATTATTTCAAGAGCATGAAATTTTGGTTTCTAAACGTTTTTTTTGTA
AGAAACAAACGACTAATTTTAATAGATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATT
ATTGTTTAACGGTCATGCTCACGTACATATCAATTATATTTGTTAAATGC
ATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCATTTGTTTGAAATGACAATAATA
TTTGAATAGGATTTGAAGTAATATCCAGTTTTTACGTATCATACTTTTTT
CCCTTATCTTTAACAGCCGTCCACCAAAACGATAGATGTGAAGGATTTAA
GCATCACACCGAAACGAGTGCGCCCTGTTGAGAAACAACTGGACTACGAA
TCTAGAAAGTATGCATTTCCGCTTGAATTAAATATCTTGTCTACACCATT
TTTGGGAGCTATTTTAAATCTTTATCCATTACCAAAAATCATGCATATTA
TGGTCATCCATTTCATTTCGATCATTCTATACAAGTAAGTAAGTAGGTCT
GCGATCGCAGTCGATAGCCATCCAATCAAAGGTATGGGAGGACGACACTC
TTTTTCTTTTATCCGAAAGGCATTAAGTACCGTTTTGGATTCTTGGGTAT
GACCAGGCCAGGGGTTGCTCACCGTTGCCGACTGCTCTACCTTTACACCA
CGGTCTCTAATAAGTGTATATAAACAAGTGCTCGTAGAACAATGATGTGA
AAACGGAACCCCACAACCAGACTTCAGAATACACAATCCAACGTAGAAAT
AACGGGAGACTCTGAAAATTCTCGATTTTAGTTTTCTGTGTTTAACAGGA
CAGTAGCTCTTAGAATAGTTCTCAAAGAATTGGTTGTTAAACCACCTTCC
TAGAAAATATACAATCAGATTTCCAAGAACAAGGCTGGTCTCAAGTATGT
TCTCACATTTTTAGGTTATGGCAGAATGTTACTGAATCCTTGATCAAACC
TAACCTGGAGAAAGCTACGGAAGAAAAACACAAGGTATAATTCGAATGAT
TCAGTAATTCAAAACTAAATGATGACATCCACCTTAAGCCTAATGAAGCC
TCTTTAATTCGAATTCTTCTGACACATTTATTTTAACGATAAGATTAGGA
ATAGTAGAACACCTCTGTCTCTCAGTCCTGGTGGGAGTTTTTCCCTCAGT
GGTGATGAAAACCTACACTGAAATTTTACTGGGGATGGTTTAGGAGAGCA
ACTTTTTCCATTGAAATTTCCAATGGGGATGAAATCAAACCATTTTCCTT
ATGGGGCAGAAATTGTAGGGTATTTTTTCTATCAAGGACAAAATTTTAGA
CAATTTTCCCACCGGGTCTGTGACACGGGGTTTAGAAATGAACAAAATCC
AATAGTTCTAATCCAAACAGGTATACGTCATTCATATTCAATTATTATCT
TTATTATAGCTGGAAGAACGACAACGCAAAGAAGCCAAAGAAAGAGTAGC
CTCTGGAACAGAATGGAAGACAAAGGTTATTAGCTTTACGATAACGGCAG
CTCCCCGCAGACTCTATATAGAAGCCTTTTTAAAGTCAATCAATCTCTAC
ATATATGAAGCCTAGTGCTGATCATGCAAAAGCATTGCAAAAAGATTTTA
TTCCATCAGAAATGTAGACCATTTGATTCTCTTCTTACTCAACACGCCAT
AATGTTCTAAATAACAAAACAATCAATTGACGAAACGCGCGTTATTTTGT
TTCGTTTGAACAACTGCATTATGTTTTTGAAAGCTTAGCATTTTTCCATA
ATAGCGATCCAGGCCTCAATTTTAATATAGTAAAAAAAAAACAAATTTGA
CAATAACTTGATTTTAGACAACTTGACATTCACCCAATTCATAAGTATGA
AATACTTATTAACGTATGAAATTTCAATTTTTAGTTGTTCAAGAAAGCTG
GAGAGACATATCTATTCAATCAACACATCGCACATGTACAGAGAAATCGG
AAATCAAGGACGGCGTCTACTCCAAATGCATGATGGGAAAAAGAAGAAGT
GTAATTCTTTGAGATATTTGTGACGTGTTGTTTTATACGGAAGCACCCTT
AAAAAACACCGGGTATTGGCCACTAATTCTAAATTTAACACTAGAATAGA
CGATATCGCGTTTAGATAAATGCAATGCATTCTGGTTTCTCGGGGACCCT
CAAGGGAATTATAATCTATTCCAGATCAATATATAATCGACATTATAATT
CCTTTGAGAGTCCCCGAGAAACCAGAATGCATTGCATTTATCTAAACGCG
ATATCGTCTATTAGTGGAAAACGCATTGTGGGTGCTTCCGTATAAAACAT
TACGTCATGAATATATAGATTTCGAACCAAATCAATTATCTGTTGTCGAC
CAGGATTGCAATAACTAGCGATCTCGAAACGGTCAAGTTTTCGCTGTACA
ATTTTCTATCAAAGGGCTGGATAGTCGATCATACGGATAATCTAAAGTCC
ACATATGCCCGTTTGATGTACACTTTTTAAAAAGAATATTGGGAAAACAG
ACTTTCTGTACTATTATTAACAGAGACTTCTGAATCAGGGTACTGGCTAA
TACATGATGTTTGCGTTGGACGGACTTGTAAATTGGTTTTTGTAGGTTAA
AAAACATAATATTTTACTAAATACTACAGTAGGTGTATTTTTATGACAAA
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CTTTACTATTTATTTTACGAGGGTTTTAAGAAGGTTGATAAAATCTGGTT
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GGTGGAAAGTATGAAAACTGTCTGGGCCCAATCTTACTTTCCCCTGTTTT
ACAAAGCTCAAATTAGTATGGTTACTTTGAGGGTTTTGTATTTGACAGTA
TAAAAAAAGACGGTTATATCGACGGATTCGCTCTCTCTTACTTTGTCCTC
GTTTGGTTAAATTTCTATTTTGAAATGATTCGAAATATTCTTTTTGTACC
TTTATAAGGATATATAAAATCTACGCTAAAATTTATTTTGTTACATATGA
AAATACAATGCATTAATTTCAAACATAACCATC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_014793	XLOC_014793	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000569	supercontig	sc0000569:125481..144013 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.27156	4.41239	4.0488	6.93663	19.5214	13.5563	25.6772	25.4325	21.3355	19.967	20.3419	13.0058	11.3773	12.8375	7.80028	9.72673	11.327	9.60899	13.64	9.84659	9.58586	7.90999	1.67449	2.7408	7.12314	6.91682	5.41124	5.92589	3.03995	2.64731

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00026340 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: OSB11 (Oxysterol-binding protein-related protein 11 OS=Homo sapiens GN=OSBPL11 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 578.556 bits (1490), Expect = 0.000e+0
Identity = 323/709 (45.56%), Postives = 452/709 (63.75%), Query Frame = 3

Query:   84 NRLQKMEGQLSKFTNLMKGWQFRWFVLDPESGTLTYFLDKQ--KQKNRGTLPLSGAVISPSDEDSMSFMISAHNGDLYKLRAIDAKERQHWINLIRAVAEYHSQNALTK--PARPAPPTAESSMKRSNTTSAGATNNILKSPGLIKSHSLKLSPKIRSPRAXXXXXXXXXXLANPIQEELKNIKDALNSVAEFQSSAVEALENGPPSGEALNSLDEQVLLLKATSQATVNILQQCYSILQQQSLEVRGSAQTTSLPPGAKIKWFEPQ---NKGFINKXXXXXXXXXXXXAMDVAAAGGACDNLTQRSLMSISQHSEEEVEDKEKYTDEQLEDMEPHKSVILHLLSQLKLGMDLTRVVLPTFVLEKRSLLEMYADFLGHSDLFTSIPDRKTPEDRMLAVLEFYLTSFHVGRKSGVAKKPYNPILGEYFVCS------MDTSSTINNTSQQETSQPDPLLNGDS--PVGPEG-RVYFVAEQVSHHPPISAFYAECPSKKICMNTHIWTKSKFYGMSIGVINVGEGVISLPELHEDYIITFPNAYCRSILTQPWIELGGRTLIRCPQSGYSASVTFHTKPFYGGKLNRVTFEVKNSSSDTGQVICHGEGSWDGKIQFNYPKRTPSTKTIDVKDLSITPKRVRPVEKQLDYESRKLWQNVTESLIKPNLEKATEEKHKLEERQRKEAKERVASGTEWKTKLFKKAGETYLFNQ 2162
            + ++ + G L K+TNL+ GWQ+R+FVL+ E+G L YF+++Q   QK RGTL L+GAVISPSDEDS +F ++A +G+ YKLRA DAKERQHW++ ++   ++H++ A+ K  P   +   + +S   S  +    + N +    +  S    LS +   P                  + L  +++ ++     Q   +  +E  P SG  L+SLD+ +L+LKATS AT+N L  C+ ILQ Q      S Q  SLP G  I+W EP+   +  + N +    + +  +          A   L  R    I+  +++E+ED   + ++ L  +E  +SVILHLLSQLKLGMDLTRVVLPTF+LEKRSLLEMYADF+ H DLF +I +  T EDRM+  +E+YLTSFH GRK  +AKKPYNPI+GE F CS         SS  +++S Q  +   P L+G+S   VG +   V FVAEQVSHHPP+S FYAEC  +K+C+N H+WTKSKF GMSIGV  VGEG++SL E  E+Y  + P AY RSILT PW+ELGG+  + C ++GYSAS+TFHTKPFYGGKL+RVT EVK++ ++T  V+C  +G W+  ++F Y      TK +D+  L++T KRVRP+EKQ  +ESR+LW+NVT+SL +  ++KATE KH LEERQR E + R  +GT WKTK F K G+ +++++
Sbjct:   56 DHMENVYGYLMKYTNLVTGWQYRFFVLNNEAGLLEYFVNEQSRNQKPRGTLQLAGAVISPSDEDSHTFTVNAASGEQYKLRATDAKERQHWVSRLQICTQHHTE-AIGKNNPPLKSRSFSLASSSNSPISQRRPSQNAISFFNVGHSKLQSLSKRTNLP-----------------PDHLVEVREMMSHAEGQQRDLIRRIECLPTSGH-LSSLDQDLLMLKATSMATMNCLNDCFHILQLQ----HASHQKGSLPSGTTIEWLEPKISLSNHYKNGADQPFATDQSKPVAVPEEQPVAESGLLAREPEEIN--ADDEIEDTCDHKEDDLGAVEEQRSVILHLLSQLKLGMDLTRVVLPTFILEKRSLLEMYADFMSHPDLFIAITNGATAEDRMIRFVEYYLTSFHEGRKGAIAKKPYNPIIGETFHCSWKMPKSEVASSVFSSSSTQGVTNHAP-LSGESLTQVGSDCYTVRFVAEQVSHHPPVSGFYAECTERKMCVNAHVWTKSKFLGMSIGVTMVGEGILSLLEHGEEYTFSLPCAYARSILTVPWVELGGKVSVNCAKTGYSASITFHTKPFYGGKLHRVTAEVKHNITNT--VVCRVQGEWNSVLEFTY--SNGETKYVDLTKLAVTKKRVRPLEKQDPFESRRLWKNVTDSLRESEIDKATEHKHTLEERQRTEERHRTETGTPWKTKYFIKEGDGWVYHK 734

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00026340 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00026340 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
OSB11	0.000e+0	45.56	Oxysterol-binding protein-related protein 11 OS=Ho...	[more]

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TCONS_00026340 (transcript) - C. hemisphaerica