TCONS_00025541 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00025541
Unique NameTCONS_00025541
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2474

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00025541 ID=TCONS_00025541|Name=TCONS_00025541|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2474bp
TAAAATACCATCACATTACATTACTATACAATAAAGCAAATAAATTGGAg
tgatttaacatttaacaagaAAGGAGCAAAATTAGTAGCTTTGTTATCGA
AAATAATGTTTCAATCAAACGCTAAGCGGAATTTTGGACATTATGATTTT
TACGGTACTAAATCAACCAATAAAGTCAAATCTAACAAACGCCCTCTACC
AAGGGCGCAACCTTATGATGATGAATATTTGGAACGACCTTTACGTCTTC
CAAATTTACCGACAATCAACGAGAGACGTAGAGTGGATATTATAAGAGAA
TACACAAGATACCAACAAATGCCACAATGGGATTTTTCTGTCCCTCCACA
AGTTAAAGATTATATGGTTAACAATTCAAAGAAAAGCCTTATGGGTATAC
TAATCGAAGATGGTCGGAAAGTAAGTACAGCAAGTCATCAAGAAGACGGA
TCAGCGCGTCAACGTAAACATggaaaaacattacgtcatccGTTAGACAT
GGTCAATTTCAATAAACAAAACCAAGAAGGTGGAGAACCATCGAGACGAA
GTAGCTCAACGATGGAGAGATATCGATTACAAGAAAATATGAAAGACCAC
AAGCGAAGTGGAAGTAGTCTTAGTTTGCTACCGTTAAAAAGAACTGGATC
CGTAACAAGTTCAATCGTATCACGAAAATCCAGTGCCAAGAGTGTCGGAA
GTAATCGAAGTAAAGGCACCAGTCGATCTTTTACAACCACTCGTAGTTAC
ACTACCAACCGTAGCAATGGAACTGTTACATCCCAAAGCAGCTACATCAA
GAAAAATTCCGGAAATTTTGACGGTAGTAATGATCGCTCTCGCCGAAAAT
CATCGTTGCAACGAAAATCATCGGCTTCGAGCCGTAGAGAACAACTCATA
GCAGATTTTTATCGAGATTTGGAAGAACTAGACGAGGAACGAAGTTGTTC
CGACTCTTccgatgatgaaaatgatagcCGCGGAAACGGAAGTCGGaatc
gaaataaaaagaaattaaagaaaggACGAATAGAAGTAGAGGAAGTCAAA
AGTCATCAACGTGTCCAAGAATATTTGATGAAACTCGAACATACAGAACC
CCCGGAAATTTTTGAGGAGGACGAGGGAATTCGTTCGGATATGTCAGACG
GTAGATTAGGCTCGTCTTATAATAGTAACTACAGTAACGATATCCCTATG
GAAACTAATAAAAATGATAACAATAATGGCGGACGTAAAAGTGAACCGAG
ATACATAAAACGACCGAACCCTCCCGATAATATGATCGCTGATTTGGAAG
ATTCACCGAGAACGCACCGACTTAAAGTTCGGGACGAATACCGAAAATCG
CGAAACGATAAACAAGACTCTAATAAATATGACGTCAATAAAAATAACGT
CGGAAAGAAAACTCGTTCTGCAAATTACACGCCTCGAGTGTTACCCCAAC
ATCCAAAAGAAATCGAACTGATTGATAAAAATTTACGTGAAAGTTTTAAT
AATAAACGAAAACCGAGTAATAACGACTATAAACGAGTTTCGGTTCACGA
AGACTTATATATGAACGATAGTGGTAGCGAATCATCCTGTTCAACAGATT
CGGCACACGGTTCAACTCACTCCATCTCTACCGTTAGTTCCATCTCAGTA
GCAcagaaacaccaaaacaaacaaattcatCAGTTAAGTTTTAAAACAAC
GGTACCCAAAAATTTTATACCAggacaacaacaaaaacatatACTGGACT
CACAACGTAAAAAGACAAATCGAAAACcgaaaaaagtttcattttgttTC
AGAGGTATTCCTTTCAGAGTTTACAATAATACACCGAGAACTCATAGGGC
GTTAGCTCACGCAGGGTGTATTGCCCTCATTATTCCCGCCCCTGGTAATC
ACAAATGTAGACATTAACTTTTCGctatacacgtctttttttttaaagaa
actagttttaccaagcagcctcaatgtttcttaagaaatcggccttttga
gctttaaatgtttcttacatgtttctaaactttttgacataattagcctt
ggaaggttcttataaaaaaacgaattaaaaaatgttattttctcattctc
agcctcagcatgtttcttagatatttcttagtttttaggcattctgagcc
tcatgtttcttaaaagtgtgtttcttaaaaaaaaaaagacgtgtagaAGA
GTATTGTTTAAATCATATGATGTTGCAATGTTGAACCAAAGAACATGGGC
TTCCTAGCTCGGACATTATATTTGTACTGGACTGGtttaaattattcaaa
atagtattttttttaagttttgtgaATCTTAATTAAAACGCACTTTTAGT
TCtgttcaataaaaaaacttctttttttaagaaaatgaagacaCAAAAAT
GACCTAAAAAGAGTCCTACTATTGCCTTCTTCAAAAAGAGTTTTCTCTAG
AGTTCAGGCCTAGAATACACGCAT
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00025541-protein

>TCONS_00025541-protein ID=TCONS_00025541-protein|Name=TCONS_00025541-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=603bp
MFQSNAKRNFGHYDFYGTKSTNKVKSNKRPLPRAQPYDDEYLERPLRLPN
LPTINERRRVDIIREYTRYQQMPQWDFSVPPQVKDYMVNNSKKSLMGILI
EDGRKVSTASHQEDGSARQRKHGKTLRHPLDMVNFNKQNQEGGEPSRRSS
STMERYRLQENMKDHKRSGSSLSLLPLKRTGSVTSSIVSRKSSAKSVGSN
RSKGTSRSFTTTRSYTTNRSNGTVTSQSSYIKKNSGNFDGSNDRSRRKSS
LQRKSSASSRREQLIADFYRDLEELDEERSCSDSSDDENDSRGNGSRNRN
KKKLKKGRIEVEEVKSHQRVQEYLMKLEHTEPPEIFEEDEGIRSDMSDGR
LGSSYNSNYSNDIPMETNKNDNNNGGRKSEPRYIKRPNPPDNMIADLEDS
PRTHRLKVRDEYRKSRNDKQDSNKYDVNKNNVGKKTRSANYTPRVLPQHP
KEIELIDKNLRESFNNKRKPSNNDYKRVSVHEDLYMNDSGSESSCSTDSA
HGSTHSISTVSSISVAQKHQNKQIHQLSFKTTVPKNFIPGQQQKHILDSQ
RKKTNRKPKKVSFCFRGIPFRVYNNTPRTHRALAHAGCIALIIPAPGNHK
CRH
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000539:67976..88323+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00025541 ID=TCONS_00025541|Name=TCONS_00025541|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=20348bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000539:67976..88323+ (Clytia hemisphaerica)
TAAAATACCATCACATTACATTACTATACAATAAAGCAAATAAATTGGAg tgatttaacatttaacaagaAAGGAGCAAAATTAGTAGCTTTGTTATCGA AAATAATGTTTCAATCAAACGCTAAGCGGAATTTTGGACATTATGATTTT TACGGTACTAAATCAACCAATAAAGTCAAATCTAACAAACGCCCTCTACC AAGGGCGCAACCTTATGATGATGAATATTTGGAACGACCTTTACGTCTTC CAAATTTACCGACAATCAACGAGAGACGTAGAGTGGATATTATAAGAGAA TACACAAGATACCAACAAATGCCACAATGGGATTTTTCTGTCCCTCCACA AGTTAAAGATTATATGGTTAACAATTCAAAGAAAAGGTATAGCACTAAAA TTATTGATGAAAACACTTTCCAGAATCTCTCAAATActccttttttttaa atctacttTCTATATTAAAATCCTAAAATGTTAAACTTTTGGATTTAAGT Ttcatctacaatcatggtcgtaatatttgagaaaaaagggaaatccaccg ggaagttttgaaaccacaatcgatttgtaagtgctctaaagtaggttcga tgaggatccaaaagttcaaaaatagtccaataaggctcagaatatagcct ggaagtctgccaacccctcccaaattgttaaagagatagcccaaaatata tcgactttctcgctagaactttaaatcttgaaaaacgttaaaataaccgg aattctcattctatttcgaccatgattgtagactggagtcgtttataatc caTGTATAATATAGTAATATTGGTGTAGTTAAGTAATAATAAAATAGTTG TAACATGATAATATCAGTTTGGCCCTTCAATTAGATTTCTCTTGTTTTTc ttatgtctgaattagttgtCTAGCACTCTAGAAAAAGTTTGAACATGGTT TGAGAGTTAAGTAAAGGTATACGATTTAATGCATTCCCaactgacacaca acgttgtttcaacgtttatctaacgttcacaacgtccatataacgttaga ttaacgttgaaacaatgggTTTAGATTACTTTCATAAGCAAGAGACTTCG TCAGCTCCAGACCACAATAAACTTTTCTAATCTgggaaaacgggtttttt taaACCTGGTTTGCATCATTATtggaaaaaaaggttttgttgGTGATTGA TCTTATGGTAACGGATGATCTCTTTATGCGTTAAGTCACGATTGTCTTCT TAATCTTACAATTTGGTGATTTGAAAACGTTTATTTATATTACACCTGGC ATATGAAAGTACAGACATTTGAGTTATTGAAGTTCGAGTTAGGAGACATT ttagttatagaggttcgagttaggagacatttgagttatagaggttcaag ttaggagacattcgagttatagaggttcgagttaggaaacatttgagtta tagaggttcgagttaggagacatttgagttatagaggttcgagttaggag acatttgagttatagaggttcgagttaggaaacatttgagttatagaggt tcgagttaggagacatttgagttatagaggttcgagttaggaaacatttg agttatagaggttcgagttaggagacatttgagttatagaggttcgagtt aggaaacatttgagttatagaggttcgagttaggagacatttgagttata gaggttcgagttaggagacatttgagttatagaggttcgagttaggaaac atttgagttatagaggttcgagttaggagacatttgagttatagaggttc gagttaggaaacatttgagttatagaggttcgagttaggagacatttgag ttatagaggttcgagttaggagacatttgagttatagaggttcgagttag gaGACATCTgtgttatagaggttcgagttaggagacatttgagttataga tgttcgagttaaagagactccactgtaaagCTTCAATTAATGGTACCTGA TAATCTCTGGCTTGATGTCCCTATGAAGAATTATACTTTTACATGTGATA GACAATTCTCGATGCTTAAAACGTAGACATGGTACTTAAAGTCCTTGAGA CACTAACAGTGATGGTTCTATAAGAAGATATTGAGGATCCATGTTTGTTA TAGAAAGATTATAGCGGATACTTATTACACTATTAATCGCAAGATAAAAT CTagattgaaaaattattttcaaaagcaaagtagaaaataaaataaaggg GAGGTTTTCGAAAAGATTATCCCTGGGACGTGTCATCATCAGAAAtctaa ataatcatttttaaaagtttatcaaaatatgttgatctaaaaaaagtaaa atggtaGAAGAACAAGCGTTCGTTTTCCTGacgttttttctataagaaca ttcaaaatttttgaagcctttggatgttcttaactttttgagttttgagc atcaaatgttcttattttcatcgttttgtgagtattttggcccattttct taagaaactgGATGTTTTagggtctgcaaagccttaaaatgttcttaact tgttcttaatatttggcCATCAAAGCTTTATGTTATATAGTTTATAATAA AGAACTTAGTTTACTTTTACAAGAGATAAATGGTAGTAGTATTTGAGCCG TACCAGGTTTGACGCTAGGTGCTCTAAAGGCATTCTAGGGTTTGGTTCAC ATTCTATCAAAAAACGTATTCCCACGTATATATTCTTATAATTCTTATGT AAGCAATAAATGCTGGTACAAATAAAGTCATTATTGATTTCATAAACATT gattaagaaaacaaaaagtcaAACCTATTAATTCTAATTAACTTTTGTTT CGCTATGATACAAattaaagagagaaaaaacctgCTTAAGCTCCATGCAA AAGATAGCTTGCGAATAAAACAACATATTTCAAGCTGAGGAGTGCTGTGT TTTTAAATTAATTGCACCGCTTGTAATCTTTAGATCAATATTTACCTAAT GGTAGGGAAACTGAAAATAAAGTCTTTcaaaagtagaaatttttgttatA TATACTTTAAACTTAAAACAGACGATTGATGGCATTTGCTTTTTTATCGG ATATCTTTGTAAAAGAtatatttgatgtttttttgtgAGATATATAGAGG TATTTTAGTCTAAAGCAGCACTCTACATTCTAAAAAGATATCCATTAAAT GTCTTTCTGAGGACATTATGTATGGTAGTGGTATTCGGAGCAATAGGTAT ATTAAAtgtatttgaattattttaactattgaaacacccctgtctcacag tcctcagtggggataaattGGGGATTTCTATCGAAATGCAAATGGGGATA TAAATTCCAGTGGGATAGTTTTTGAGTGCAGTttttaaaagttgattttc GGATGGGGATGAGATCAATTTcccattgaggctgaaattcccgggtattt tcctaccggggacgaaatttttgccaaattttccagtggggctggggtcc agCAGGTCTGTGACACCCCTGTGTGTATTGAACTTATAACAGACAGGAGG TTTATCCAGACATAcaaattacacccctgtctcagttaCTCGGTGAGGAT TCTTTAGCTAgccaatgatgatgatgatggtgatgaagaatctcatattt tttaataaatagGGATTTTAAGTATACTTGAAGATAGGAACAAAAGGGAA TATCTTTTAAGTTGAGGATAAAGAAATCGACCTAAAGCGAGTTGGTTCAC ACAGATCTATAACTATATGCATATAGAAGACAAATCGATTCTTACCAAAT CTTTTATCTCTATGTTTCTTCCAAAAGATGCAGGTCATATTGTGGGTAAT AAAGAGTTTTTAAGAGAAAACATCATCCTATCATCTTTACCGATGATGCC AGAGGGGGGTCTCTCGAAAGGAAACCAAACGTAAAACCTCCAATATCACT TATATATTATTGGGTATTTAGTATATTTGGTTACATCTACATTATCACAA TCTGAAGTATCACTAAATTGGTGAACTCAAACTTATTTAAAACTAGTACA GTGGGTGAAAAGTCATTTCACCCACTGGTGCGACCGCCCTGAAAATTTGA TTAAACTCATTTTGACTTTTATAATTATCTTTCCACCTGtctgtttgatt tttgagattaaaaatttgcaAACTAAGTAAAGTTGCTTAAAATACCAAGA TCAAGAATCTCACATTTTGTTAACTTAAGTCAATTAATTACTCAATAGTT CGGCAACACGTTTTTATTAGAATAGCTTCCTCCAGATTATTAGAAAGGCG AGTTGgcgagattttaataaaaataagccCAATGTAATATGTTTTNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNtcaatcaagagttattgatttgattcttataaag tagatgcttataagaaaaataaatatgctcatctttttcgccatcctttg tttactttgtaagaactaaataCAGAAAGGTAAtctgccttcaatcaaga gttattgatttgattcctataaattagatgcttataagaaaaataaatat gctcatatttttcgccatcctttgtttactttgtaagaactaattaccga aaggtaaattgccttcaatcaagagttattgatttgattcttataaagta gatgcttataagaaaaaaaaatatgctcatctttttcgccatcctttgtt tactttataataactaattaccgaaaggtaaattGCCTTTAATctagagt ttttgatttgattcttataaagtagatgcttataagaaaaataaatatgc ccatctttttcgccatcctttgtttactatATAAGAACTAATTAACGAAA GGTAAattgttttcaatcaaaagtaATTAAATACCCGAGAGTATTACACG TTAAAAACTATTGAGTGACTTGCAAAAGttctttcccgcgttttattaaa tttggtcACGCGGTTAATATATTACGGAGGAAATCGAAATTGTTATTATC TCCTCAGTATTGCACTCATATGCGACAATTGGCCTAACGATTTCGTGGGA CCGCCTTCAGGGCGGTCGATAAAatatacatccctgtctcaaagggaaaa atcaaaatatattagccgcattttttttcaccgttcaacatatCCCTGTC TCAAAGAACTTTCCAGCAGTaggaatgaaaatttctgtCGATATGACATT ATGGTTTCGGACTGCATTTCttttcattgaatttcaaatgggattgaaat aaaaaccacTTTCCCATAGAGGAACTTTGGCCAAATTTCCCACTTAGGCT TGGTTTCCAAGGGGTCTTTGACACTCAAACTTCGTTTCTCTTTTTCAGCC TTATGGGTATACTAATCGAAGATGGTCGGAAAGTAAGTACAGCAAGTCAT CAAGAAGACGGATCAGCGCGTCAACGTAAACATggaaaaacattacgtca tccGTTAGACATGGTCAATTTCAATAAACAAAACCAAGAAGGTGGAGAAC CATCGAGACGAAGTAGCTCAACGATGGAGAGATATCGATTACAAGAAAAT ATGAAAGACCACAAGCGAAGTGGAAGTAGTCTTAGTTTGCTACCGTTAAA AAGAACTGGTAAGTTTGAgctcttgtttattttgaaatctttcaaaGCTC GTTCAATGTTCGATAAGTGATTTTACAGTGAAGTCTCATTAACTGGAACC TCTAAAACTCCAAAGTTTGAACGATGTTTGGATTATATACTGTAAATGAA GAACTATATATTGATGGATCAAAAAGCTCACTAAAGACCACcgctaaaaa aattaagagtTTTAAGTAAGTGAGAAAGTAATTCTGAAACCGCAGtcaga ggcgacccgaaggctcctctttcgatagctaattacccgaaggtaggggg cGCCACTCTTTATCCATAGATTTCTCTACTCTACGAGTTTTAACGAGTTG AGTTTACTGATTCAGAAAAGATCTGAGCTTTGGTACATTCCTAAATTAAG ATGAGTGATAAGAAAAAAGTACGATGTTACAATTCCATGTgaaattttag taaaaagaATTCTTCGATATTCTCTAGACCTTATGTGAGATGAAGTGTCA AGTATTTAGCCATcctgaaaggaaagaaaaagtgGACTTAAAAGTTCCGT ATATGATGCAAACAGCACTGGTTTTTCCCATTAAAGATCGTAGCTTATGC TTCCTCATTTTGTAGttcatcttttttataagaacaaactgtaaaagaac ataaggcttcgatgacaaATATATTAAGAAcagactatataagaacacaa ggcattgatgacaaaaatattaagaacgaGTTAAGAACATTATGAGGTTT CACAGGCTCTAAAACAtctaatttcttagaaaatcgcataaaaatgctca aaaaatgatgaaaatacagacatttaagaacattttaaggcataGAACTC AAAAAGTCACcttaagaatatccaaagacttcaaaaggttttggatgtct tataaaaaaacaggtACTATTCACTGTTtccctttaaaaaaaacttcaaa cgaAGTGTTGGTACTTCATCGACACCTTTATGTTTCACTTCCCAACTAAT GAAACTAAGAGCAAAAAGAAACATAGTTCGAAGGAAATATCGTTTTTGTT GACGGATTTTGGGTTCCTATGAAATCTTATACTTAATCAACACTTTTACA tggttttataagaaaaaattatataaaaacatatGTAGAAGGTTAAGCGA TGCTTATGAGATGCTATAATAACATAAAGTTTCAATGGCAAAAATTTCAA GGACTAATTAACAAATTGAAAATTCCAAAACACAcggtttcttagaaaaa tggataaaaatagtcacggtgaaaataagaacatgttaagaacattttta ggcttaaaatttaagaaatcaAGAACATCGaaatgcttcaaaaaattttt tagatgttcttataaaacaaacgtgtataatttaaaagatacataataag gaaccttaactttgctctgagcctggagttccttattcttacagagaatt tcagcctcaaatttccttatcgagttccttatttacatagctgctaagtt tggattcgcaaaaattggattccttaaaacttgttttcttattctcagcc tgagcagttccttaacaattccttattttcagcctcgagttccttataaa cgtgttccttattaaaaaaaacgtgtaacgaACTTTTGAAACTATGGACA TGTCATCCGCATTCCATTGTAACGCCTATATGACGTCATAGTGATAACGC CTCTCCAGAGAAGGCGTCGCGTGACAAAACGGATTTCTACCTGAGAAAAA AAGCATTCTGGGTGCCAAAAAGATGTTACGCAACAAGTCAGGGGGCACAG AAAATGGTTTCCACACCCTACCTTTGTGATACTTAAATAAACTTAAGAAA ATGAGTTGTAAAATTAACGTTTTGTAGGGCCCCTTTTGAAGTACTGAAAG AGGACGAAATATCGTAAAAAACAGAgctaattttacttttttatttctcG TCGTGATACCTGAACTTTATTTTACAATGAAAAGGTATATCACATTAAAA TTAACTAAATCGCACTCTTCACCTAAAGCTCCTTCTGTAATCAGGACTAT CATAAATAGGTCAAGTCTGTCAGAGAAATGATCATCAgtaatatcttttt ttataagaatatactttataagaatatttataatgaaattggccaaaaac ttaagaatatggtaacaacaccatcatcatggaatttgaCAACCACTGAA CCTATTAATGTCAATTTTCGCAATAGCAATAGCAATGCTATAAGGTTCAa caaaaaatgccaaatttttgcTTGGGGTATTTATTACATGCTAGATTTTG GCTGAGATTGGATCCAATCCtcagaataccgtaagaatatttcacgatga tttttaccgaaaaattatgaatactgatgataaattgaaaaaacactaat tcttataaaaaaaggcgtGTACTATCTTTTTGAGAAAGATTCCCACTTAC CGGACTAAATTTCCACTGACTTATTTCTGGTATAGCCCGCCTGTAAAGGC ACAGAAAACCTTGTGTTAAATTAGGAGGCTGTAtaactttccgaagctca tATTTCAACTACCCGGAATTCTTAAATTTTCCCGCTAAAGTGGCAACGTG TTAGAAAGAAAGAAGGCTTTCCGTGTTGTTAGCTCATTATTCAAACGTAG TAGAAACCATATGAAAATTTGAGTTATTATTTCCGTAACACAAACAGCCA TAAAGCTAACGGAAAAGATGTTCTTTTGTTGAGCAATCTACACCATCTGG TGTGAGCAATTTTCTCTTAAGTAATGATGCTATCGAAGATTGATGTCAGA TGATGGGTATTTAACAAGATGGTCATGTCAAATGGTGTTTTTAATGTTTG GGTTGTTCTTTGACTGATGTTCTCTAAAATCATTAGTTACTTTTGCAATT GATTCTAGTCAAGCAAGGAGAAAAAAATGTCCTTGCTTTGTTGGGTGTAT ATCAGTTTTGAATTATGATTCTAAACATTATTATTCTGGATAGATTAGCT CTGGTATAGATACAGTGACAGTCAAAATACAATCTTCATTGGGTCTTTGT TAGTTCCAGGTTTATATTATTGTTGTATACCTTGAAACAATCATAACCTA TCAAGAAGATTGGATTGTTGAGTTATAATGAATATTCTTTGACTTGAATG TAGTATTGAGAAGTTAATCTTTGGGATTAGGTAGCACGTTCACAGTGTAC AGGAATCAGAAGCTCaaaagattattttgaaaagaaatattaatcgACTA AATGTAGATGGAATCATGAGAActttgtttgtttacattagaAAATATAG TGGTTTAGATGACGCAACATGGTTTCATAACATCAAATGAACTGTTTTAG AGATATTCTCAGGATCTCGCAGTATCCTAACATCGCTCGAAGCTTAACAT CTCCGGGTCACACTGACTGTCTCATAGAAAGCCAAGATGAAAATAGTTAC AACTTTCCACAAAAATAGAACCTACTCTTTTCGAACAGGTTGGAACGTAA ACAAGGAGAACAATAGGTTATTGTCAGTACACTGATGACCATGGTAATGG TTATTAAGACAAGAAAATAGCTTTTTGGATTAGTTCTACTTAAAATAGAT GATGGCTTGGTTGCCCCAGCGGTGTTGACACTGTttcgacaaaaacaaaa atcaagcaaatcaattcaaaaaaaacttgaaaaagttgaatacatGGTCC AATCTCAAAGGCTAATTCGATTGCTGGCAAAACAAGACAAAGGAGAACGG ATTAAGAGTAAGCGAGTCAAAAACTTCTCAGACAAGGATTTAGATGGTCT TTTACATGAATAAAACCAGTTGCTACATGTTTTCGTTATGACTATTTGAT CCTGTTGCCTTATTCGTTTTCCCACTTCAAAATAATGTGTTATTTCATGT AACAGTCGGTCAGTCTTTGTGTACACAAGAGCTTACTTAAAGTACAAAAA CTgttgaacatttttttgaaaatttgtaggACCATCAGATCTGATCTGAT GAATCATAATTCTCGATATGGTTAGTTAGTCGTTCgtttggttggttggt tgatCTGTTGTATTAGATTTTTAGGTCTATCAGATTAATATATATGACAG TCTGAATTATGGATAGTACTTGTTGATTTGTTGGGTACGAAAGTTCTAAc tatgggtaaaagatatacaGTAGgagaaaactttttagaaaacAAAGGAA GTGAAAAAggcatttttttattgttgaaaGTTGTTgccacgattttgtga cttttactatCAAATCATACAtgtttggttgttgaaatacacgtTATTTG CGCCTCTTCGACGCAAGTagccattcaaatagtatttatttgaaattttt tgagtttggttttgaaatatttcgcggatgaggcccttccaaatttcgcg gttgacacCCCagtccgcgaaatccgcgaaatttaatccccgcgaaagtt tatcccaatAAAGTATACCATCAGGATTGTTTTTCCATTGATATAGAAAG TTATTCAAACAGGGTAGAAAGCAACAAGATGATTATATTCAGAGAAGGAA GGATTTCATAACAACCCAAAATAATGGTGACAAATAGCCTTAATTGATTC TCTAATTAAATATTTCGCATTTCAGTATGTGGTAACACACAGGGCTTCCT GTAGCCTGTTAAATAAATGAGTTTTGATACCTACCTATAATTCTAcaaca aattttctttcttttatgtGTGAATACTTTAGTTgacaaaaatactgaaa atataCTTGAAATCTATATGTGGATGGTTTGTGTATTTAGTTCAAACGaa ttgaaatattgataaatgtccgctgtttattgattagaagTTATTGgcta ttgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgatt gattgattgattgattgattggcttaaaaacgTAATAATGCCATTGGATC GAGTTTTAAGTTTCAGTAAGTATTCATTATGTCAAATTCTTTGAGGTCAA GCCCACAACATTTTTCTCGTTAATTGTCGAGCCGAACATTGACCGGCAGC CTGGGGGCTTTCTTTCTTAAATGAATGACTTCAAAGACAAAGAGTGATCA GTAAGATCAGACATCTAAGCACTTACtttctaagaaaaattttataagaa cacaaagctggttattttctttaagaaaaggTAAGaagaatttaagaaca atttaatgtGTAAATTGAAAAAAGTACGATGACATGAAGAAAAGCAGCAT AATGTACTgtatttttcaagttaaatacTGCAAACTAATTCTTCAATTCA GTTTTCCATGCTCAACTTTGTTCAGACTGGATTTGAGGATTACTAGTTAG GAATAGCATAGTTTAATAGTTCGTTGGGGgtactcatttttttataagaa accagGTTGGTAAGGTTCTGGGGCTCAAATTATCCGGTTTTTTCATTATC CCgcaaagtaaaagctttttagataccATGGCAAGCGATAGCCCTTaacc caataagcataaatatggtataatatcagggatGGTTAAAGCAGGTTTAT CAGAAAATGAACTAGGATGTTAAGCAACCCTAGACCTGACCCGAAAATtt gagttgcttataaaaaaatgtacaggtcatttttagccgtttttttcaCC ATCTATCTNTTAAAGTATACCATCAGGATTGTTTTCCATTGATATAGAAA GTTATTCAAACAGGGTAGAAAGCAACAAGATGATTATATTCAGAGAAGGA AGGATTTCATAACAACCCAAAATAATGGTGACAAATAGCCTTAATTGATT CTCTAATTAAATATTTCGCATTTCAGTATGTGGTAACACACAGGGCTTCC TGTAGCCTGTTAAATAAATGAGTTTTGATACCTACCTATAATTCTAcaac aaattttctttcttttatgtGTGAAAACTTTAGTTgacaaaaatactgaa aatataCTTGAAATCTATATGTGGATGGTTTGTGTATTTAGTTCAAACGa attgaaatattgataaatgtccgctgtttattgattagaagTTATTGgct attgattgattgattgattgattgattgattgattggcttaaaaacgTAA TAATGCCATTGAATCGAGTTTTAAGTTTCAGTAAGTATTCATTATGTCAA AGATGGTCAAAGCAGGTTTATCAGAAAATGAACTAGAATGTTAAGCAACC CTAGACCTGACCCGAAAATttgagttgcttataaaaaaatgtacaggtca tttttagccgtttttttcaCCATCTATCTCGTCAAGTTAAAGCTTTCTAG ATCTAAGTATTGCAAACAATAgccataaatatggtataatattaggGATG GTCAAAGCAAGTTTTTCagcaaatgagctagaatgcttagcaaccccagc cctgacccaaacatttgcttataaaaaatgtgtgctgGAAAGCTTGCCTG AAACCATGCATGTAAACCTAAAgatgaaaaatcgaaatgaaaATTCGCTC GCTCTTTCGTAACGAACTACAGTATTcctattttaaattattttctttag aaCCCAACCGTGCCTTAGAGAGAAGCGAAATATCaacaaaaaagatgaaa attatcTTCAAcccataaaaaagaaaaaaacaagctGGGATTTCATTGGg cgaaaatatatattttataaattcaaatggggtgttttaaaatttttagc aGTGTGAACcaaattaattcaaaaattatagctGGAAAAACAACTCCGTG GACGACTTGAGGCAGAGCTATTAGAAGTTCTCATAAAGTGACGAGCTTGA GGGCATGGTTAGGTGCTGAAAATACCACTAAAAGACACTGGAGAAGGAAT TATAAGACTATTTGTGCACGGAGATTTCAAAGTCGGAAAACTTTCTTTAA TTATATTCAAACTTTGACCGGCTATCATTAAAAACACGTTAGCTTTTGAA TTATTGCGACTAGGTATTTCCTACCATTATGGATTGGCCGTCGTCAAGGA AAACATTAGAAACGATGGAAAAACGAATGAATATTAAGAGAAGGCATAGC TATACAGGTAAAGTCTGTTTTAGATAAATTTGAAGtagatttattttgaa acatTGCATTTCCCCTTAGCTTACCTTTCCAacgcgcaacattttttgaa aatatgaaaatttccagCTTATTTTTTTACATCCAAAAGTTCAAACTAGC ATAAAATATTGTAACTTGGGAGTTAGAcaatggttttggtaccattaaTT AGAAAGGTATTTTAGGTATTTTAGGTATTTTAATCCCCTTTTAAAAGCAT TCTAAGCGTTTATACCCTTTTAATtaaagtggtcaggagttatagtCTGG GGAGTCTGGGACTCGATATTGGCGAACGTTTCTCAGGTTTGAAGGGTTAA AAGACAAATAgatgaaattaaaaatacaaTACCTCGCTCGAAAGATAATT TGAGTGaatgaatttgaaagatttttgatttttaagaaaaggaaagaaaa aaaaaaaagatagtcATGTTTGAATTATCAAATCGAGACAAAATCAGCGT GGGAAAATTGGCATCTAGCTTAGCTGAATAGTTAAATTCACATCTCATAT TCTATTTGATAATAAGACAATTATGAAAGAGACTCTGTAACCATATGGGT TATAAGTAATCATACTAGACCCATTAGCATGTTTGATAATTAATTAGTAG GCTCtaattgaattttaaaagaGCTTATTTTTCTCGTCACGCCACACTTG CAGTTGTTGATAAACATATTAAGTCTAGGATGCCTATCTACAAATTGTAG ATTTTATTGAACANCGCAGTTGTTGATAAACATACGAAGTCTAGGATGCC TATCTACAAATTGTAGATTTTATTGAACAGTTTTAAGTGTGTGAgtgtca aaatatatttttgtaagTTGACAAATCTTATTTGTTTGTCCTTGGGATAC ATAAAGCCATATTCATCCACTCGAAAAAATTCTAATCATTTCCGAATCAG CTTGAGAAGTTTTGAAACCTCAATTTCTATATTTTCTAATAACCAGTGGG TAATGAATTGATCAAATTTTGCTATTTCCGAAAGGGCTTAAGGGTCAAGA CACCAAAATATAGCTCCTAAAAATCTACTTCCGAATCAACTttaaaaaat ccaaaacctcTTAGTGAATCATTCTTGACCATAGTGACAACTGCTTAACC ATTAATAAAAGGGTAACGTCTCGaaattggatgaaaatttcgtcacttgc CTAAAAATCTTGTctgtcacttttccccgattAGGATTCTTTATTTATCT TTAAGCCTTCACACCTTCACTTTTATAAGCAAACCCAATTTTCTTCGGCT CAGGGCTGGAGTTGCTAAggatttttcagatttcagccaaaaagttGCCT ATgcattttgagccaaaaattcctagtatcttaaaaatttttgggttttt atctcattttatgTCCAAAGTACTTCAAATTTGGTATCTAAATACCATCG GTACCAAATAATGCCAACAATGCCTCTTTTTTAGGAATTTTCGGTTGCTT ACCCGGCTCATGCTCAGGTTCAGGACTAGGTCGTTATGGCCAAACTGCTT AGTTTTTAGGCCATTCTCAAGGCTGGACCCTTAGCAACTCGATTGCTTGt gttaaactaaaaataaattttcgacAATCCTTTACACTTTAGTCTTTACC ACAGTATGTCAAATAAATATCTTGAAACTGTCTTAAATTTTGTTTACTCA AGTTTGAGCTGTCTCAAcaatattgcaaatttacaatTTCCGAGTCACTT AAAAACACTTATAAGGCTCTTGAGCCTAAAATCTTAACCACAGACTTGCA GAAAAATACATTAGATTGCGGGATTTTCCATTTATTTAGACACTCATCGA AAAGAATATTTCCGGAGTAGTTTAAGGAGATACAACAAAACTTGCACGAA AATAAGCTATAATACAtggtattcatgacgtaatgttttctacggaagta ccccggttttagccagtagtggcaaagttaaaatagacaaaagttgtata aaatttgccactgttgccaaaaaccggggtctttccgtagaaaacattac gtcatgaatattatgAATAGGGTTTGGNTTGTTgccaaaaaccggggtct ttccgtagaaaacattacgtcatgaatttATTATGAATAGGGTTTGGGTT ATGCAAACCCTGGGTTATGGGTGAAGCCTGTTAAAAAATCGATTCTCTCA AAAGACAAATAAAATATAAGACCTCAAAAAATTTGTTTGGAACATTTTAG CGACagataaacaaaaattaaatccacgcgttATTTTCgtaaaacacatt ttaaacactaTTTCGACGTTTAAGAGGCGTGATGgctgaaattaaatcca cgtgaGAGATTTCAGAAAATACAGGTTCGCAAAAATATGATCCAGAAAAT TTCtctaaatttaatttgattaaattaatCAACTTTGATTGGTACAAGGT ACTGGACTCAACATTACCAGGAATAAATGATCTCAAATATCTAAAGTTAT TTCATACAAATACATCTTTTCTACCATAGCCGCAAATTCCcgcacgggca tttttttgtccgttttaccaccctaaaaccgtcacAGTCTCATACATATa tctatagacaatagaaaaaggtgtaaaaaaaggattgggtctAGTTTAGG GGGatgattaaataataaagtggcacgcgcctgaccgcgcgactacggtc gaaaaggtataTACAGATAGAGGCTTTTTAACTTTGTGACGTTGATAGGT CACCAATAAGGTTTAACACTGGACTAAGTTACACATGTCCCATCAAAAAG ATCTTTATCATTATAAAACATGTCATcattagaaaaaatttcaaaacttt gaactTATGTCAAAACTGTCGAAGTTTTATTTCCTTCAATGCACGCAGAT AAAATCTTAGTTTCATTAAGGAGTAAGATAGGaggaaaaatcttaaatct aattgttgttgaaattgaatcAAGTTGATTAACCCCCAACGGTTTGCGTG AGTGCGTGAATGGGccttttcacttgcgtgaatacgtgaattggaaagct ttgcgtgaattgcgaaaaaacattgcATTTGCATGAATGCAcgaatttgg aaaaaaactgcacgattgcgtgaattgaaggttcgctggggggcctcatt aaGCTAGATCTTTAAAAAGATCAAATCTAGATGATTGAAATGCATAGTTT TAAACCAAGTGTTGCAAGGTTGCATGACAAATATTTATCGCTTCTAATCA TTAACCGCAAGAGGAGGACCAAAACGAactattttttgcaaaaattgctt aaatttgagaaggtcaaattttcaataaagttTTGTGAATCCTTGCTGGG AATGTGGCAAAGTCCTACGAAATGTAATAAGAGCACAAGGCTTGGTATAA TATCTAGAAGACCACACATGGTCCTCAACAGATAACACCACAATGAAACT CTGaatcaaatgtttttcttttacatGACCAAGTCCTTAATATCACTTCC TGGTCAAAAACAGCAATAAggaaatcgaaaaataaaactttcttaCAAAG GTTGCTTGCAACGACGCTGACTTCAATTTAAAATCGTtatcaggcccggc ggaagcagggagactggggagacttcagcctccacACTTTTgtgcaaatg agatttttttctcttaaattcctagcgaatttaTCTCATTTTCAgtcttc agcctccccactttttaTGATTGTTCTGCTGGGCCTGTCTATGATTATAA AGTTGATTGATTACAGTATCATGAGAGAGCCAAATCAATATAAATCATTG GAAATTATTGTACGTACCACAATCATAAATCTAaagtacacccctgtgtc agacCTGTTGGGACCCCGCTTCACTTGAAAATCTAGTTAAAAATGCGTCC CCAATGGGAAATATGCCTCTGGGTAACAgggtttttaaaatcaaaaggCC TTTCTGGCAAGGTCTAAGAAAAAAGGAAGCTTATTCATCATTATCATTAG TCTCATATTCGACAATATTACCACACCTTCTTAATATTCAGACACCTTAA AAAGGATATATGGTTTTTTACGTTAATTGGTCTATCGCAACAATGAGTAA CTGTTGaatcttttaagaaaaataatgtGTTACTTTCAAGTAAAAcactt caaattcaactttAGAGTAATCAAACAAGCCGTGATAAAAATGTTCATGT AAGACATTAAAAAcacgaaaatgaaattttagaaTGCGTTGCAAAGCGAT CAGAACTGAAAATATTTCGAAGTTGCCGAGTGATTTACGAATTTTTTCAT AATAATggagaaaacaataaaaaaaaagaaaaaaatagactttacacgtt tcttttatttaagaacaaactatttaagaaaataaggcttccattgctaa aatgttaagaacaagctaagaacattttatggctttgcagacaaaaaact ttaaaataagaatatattaagaacatcccaaggcttcaaatattttggat gttcttatataaaaaaatagacTATCATGAACAAATTGACTCAAGTACTT TGCGGTGTAATCAGACGTCAGGATAAatagcttttttcttttcttttcga gATGCCTTGACAATGAAGATAAGACCTTCTACAGTATGATAAGACAGTAA GAGCATTACTGAAATACACTCGAGGAACAAGTATtattaaatcatttttt tggCATCAGTGCAGATGAAAGCtttataattgtttttaaaacatttattA TCATATTGCCATGAAATTTGTTACACTAGGCAAGCTCAGTTATTATAAGT AGTATTCAAGACTAACTGGagacaaaagaatttaaaaatttgagcttgaa atatttcataaacgTTTTTGGTATTGTATTACAAGTTAATATTGGATGAC ACTAAAATAAGGAGACTCACTGTATAATAAATTTTATTTCGTTTGcgatt ttctgaggcactgtaCAGTAACATTGTTTTTGCTGCAATTCCGCAATGTT CTCAAGGAAAACCAAGGACAGAGAAAGCAAGAGTAAgcaagaatattttt ttatcacaAACTCAAACTTACAGTATCTGACATGTTTGGGAGCTCCTTCA GATTGAAGTGTTCTTTTAGAAGAAACACTAAACAAATGTTGAGATTTGAA TCAACTTGATCTAAATTTTAGCTTACTTTAATAATTGTATACCTTGATCT GCCTAGCTGCTAGGGTTCAATGCTTGCTCTATTGAGTACGAAAGATGCAT CCTGTTGCTATTTATGTTGCCTATAATAAAAGTTTGCTTCTACTAAGCCT TTATAACTATCCAAAATGTCTTGCAAAAATTGggggaatttaaaaaaaaa tttatttactttttcaagTATTCCACCAGATGACCCATCCGTATGCGTTG TAGTTAGGGGGTCGAAGAAAGCGTAATGTCTATCTTATACGTTTAtcata taaaaacatccaaaattttttaaacctcttcaattttgagttttaaacct aaaaatgttcttaacatgttcttattttcataatttttagagtatatttt tccattttcctaagaaattgggtgatGTAGATTCTGCAAAGgattaaaaa attatgtttttaacttgttcttataaagtttattcttataaaaaacgtgt atttctcTTTCTCTCTACAGGATCCGTAACAAGTTCAATCGTATCACGAA AATCCAGTGCCAAGAGTGTCGGAAGTAATCGAAGTAAAGGCACCAGTCGA TCTTTTACAACCACTCGTAGTTACACTACCAACCGTAGCAATGGAACTGT TACATCCCAAAGCAGCTACATCAAGAAAAATTCCGGAAATTTTGACGGTA GTAATGATCGCTCTCGCCGAAAATCATCGTTGCAACGAAAATCATCGGCT TCGAGCCGTAGAGAACAACTCATAGCAGATTTTTATCGAGATTTGGAAGA ACTAGACGAGGAACGAAGTTGTTCCGACTCTTccgatgatgaaaatgata gcCGCGGAAACGGAAGTCGGaatcgaaataaaaagaaattaaagaaaggA CGAATAGAAGTAGAGGAAGTCAAAAGTCATCAACGTGTCCAAGAATATTT GATGAAACTCGAACATACAGAACCCCCGGAAATTTTTGAGGAGGACGAGG GAATTCGTTCGGATATGTCAGACGGTAGATTAGGCTCGTCTTATAATAGT AACTACAGTAACGATATCCCTATGGAAACTAATAAAAATGATAACAATAA TGGCGGACGTAAAAGTGAACCGAGATACATAAAACGACCGAACCCTCCCG ATAATATGATCGCTGATTTGGAAGATTCACCGAGAACGCACCGACTTAAA GTTCGGGACGAATACCGAAAATCGCGAAACGATAAACAAGACTCTAATAA ATATGACGTCAATAAAAATAACGTCGGAAAGAAAACTCGTTCTGCAAATT ACACGCCTCGAGTGTTACCCCAACATCCAAAAGAAATCGAACTGATTGAT AAAAATTTACGTGAAAGTTTTAATAATAAACGAAAACCGAGTAATAACGA CTATAAACGAGTTTCGGTTCACGAAGACTTATATATGAACGATAGTGGTA GCGAATCATCCTGTTCAACAGATTCGGCACACGGTTCAACTCACTCCATC TCTACCGTTAGTTCCATCTCAGTAGCAcagaaacaccaaaacaaacaaat tcatCAGTTAAGTTTTAAAACAACGGTACCCAAAAATTTTATACCAggac aacaacaaaaacatatACTGGACTCACAACGTAAAAAGACAAATCGAAAA CcgaaaaaagtttcattttgttTCAGAGGTATTCCTTTCAGAGTTTACAA TAATACACCGAGAACTCATAGGGCGTTAGCTCACGCAGGGTGTATTGCCC TCATTATTCCCGCCCCTGGTAATCACAAATGTAGACATTAACTTTTCGct atacacgtctttttttttaaagaaactagttttaccaagcagcctcaatg tttcttaagaaatcggccttttgagctttaaatgtttcttacatgtttct aaactttttgacataattagccttggaaggttcttataaaaaaacgaatt aaaaaatgttattttctcattctcagcctcagcatgtttcttagatattt cttagtttttaggcattctgagcctcatgtttcttaaaagtgtgtttctt aaaaaaaaaaagacgtgtagaAGAGTATTGTTTAAATCATATGATGTTGC AATGTTGAACCAAAGAACATGGGCTTCCTAGCTCGGACATTATATTTGTA CTGGACTGGtttaaattattcaaaatagtattttttttaagttttgtgaA TCTTAATTAAAACGCACTTTTAGTTCtgttcaataaaaaaacttcttttt ttaagaaaatgaagacaCAAAAATGACCTAAAAAGAGTCCTACTATTGCC TTCTTCAAAAAGAGTTTTCTCTAGAGTTCAGGCCTAGAATACACGCAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000539:67976..88323+

>TCONS_00025541 ID=TCONS_00025541|Name=TCONS_00025541|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=5436bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000539:67976..88323+ (Clytia hemisphaerica)
ATGTTTCAATCAAACGCTAAGCGGAATTTTGGACATTATGATTTTTACGG
TACTAAATCAACCAATAAAGTCAAATCTAACAAACGCCCTCTACCAAGGG
CGCAACCTTATGATGATGAATATTTGGAACGACCTTTACGTCTTCCAAAT
TTACCGACAATCAACGAGAGACGTAGAGTGGATATTATAAGAGAATACAC
AAGATACCAACAAATGCCACAATGGGATTTTTCTGTCCCTCCACAAGTTA
AAGATTATATGGTTAACAATTCAAAGAAAAGCCTTATGGGTATACTAATC
GAAGATGGTCGGAAAGTAAGTACAGCAAGTCATCAAGAAGACGGATCAGC
GCGTCAACGTAAACATggaaaaacattacgtcatccGTTAGACATGGTCA
ATTTCAATAAACAAAACCAAGAAGGTGGAGAACCATCGAGACGAAGTAGC
TCAACGATGGAGAGATATCGATTACAAGAAAATATGAAAGACCACAAGCG
AAGTGGAAGTAGTCTTAGTTTGCTACCGTTAAAAAGAACTGGATCCGTAA
CAAGTTCAATCGTATCACGAAAATCCAGTGCCAAGAGTGTCGGAAGTAAT
CGAAGTAAAGGCACCAGTCGATCTTTTACAACCACTCGTAGTTACACTAC
CAACCGTAGCAATGGAACTGTTACATCCCAAAGCAGCTACATCAAGAAAA
ATTCCGGAAATTTTGACGGTAGTAATGATCGCTCTCGCCGAAAATCATCG
TTGCAACGAAAATCATCGGCTTCGAGCCGTAGAGAACAACTCATAGCAGA
TTTTTATCGAGATTTGGAAGAACTAGACGAGGAACGAAGTTGTTCCGACT
CTTccgatgatgaaaatgatagcCGCGGAAACGGAAGTCGGaatcgaaat
aaaaagaaattaaagaaaggACGAATAGAAGTAGAGGAAGTCAAAAGTCA
TCAACGTGTCCAAGAATATTTGATGAAACTCGAACATACAGAACCCCCGG
AAATTTTTGAGGAGGACGAGGGAATTCGTTCGGATATGTCAGACGGTAGA
TTAGGCTCGTCTTATAATAGTAACTACAGTAACGATATCCCTATGGAAAC
TAATAAAAATGATAACAATAATGGCGGACGTAAAAGTGAACCGAGATACA
TAAAACGACCGAACCCTCCCGATAATATGATCGCTGATTTGGAAGATTCA
CCGAGAACGCACCGACTTAAAGTTCGGGACGAATACCGAAAATCGCGAAA
CGATAAACAAGACTCTAATAAATATGACGTCAATAAAAATAACGTCGGAA
AGAAAACTCGTTCTGCAAATTACACGCCTCGAGTGTTACCCCAACATCCA
AAAGAAATCGAACTGATTGATAAAAATTTACGTGAAAGTTTTAATAATAA
ACGAAAACCGAGTAATAACGACTATAAACGAGTTTCGGTTCACGAAGACT
TATATATGAACGATAGTGGTAGCGAATCATCCTGTTCAACAGATTCGGCA
CACGGTTCAACTCACTCCATCTCTACCGTTAGTTCCATCTCAGTAGCAca
gaaacaccaaaacaaacaaattcatCAGTTAAGTTTTAAAACAACGGTAC
CCAAAAATTTTATACCAggacaacaacaaaaacatatACTGGACTCACAA
CGTAAAAAGACAAATCGAAAACcgaaaaaagtttcattttgttTCAGAGG
TATTCCTTTCAGAGTTTACAATAATACACCGAGAACTCATAGGGCGTTAG
CTCACGCAGGGTGTATTGCCCTCATTATTCCCGCCCCTGGTAATCACAAA
TGTAGACATTAAATGTTTCAATCAAACGCTAAGCGGAATTTTGGACATTA
TGATTTTTACGGTACTAAATCAACCAATAAAGTCAAATCTAACAAACGCC
CTCTACCAAGGGCGCAACCTTATGATGATGAATATTTGGAACGACCTTTA
CGTCTTCCAAATTTACCGACAATCAACGAGAGACGTAGAGTGGATATTAT
AAGAGAATACACAAGATACCAACAAATGCCACAATGGGATTTTTCTGTCC
CTCCACAAGTTAAAGATTATATGGTTAACAATTCAAAGAAAAGCCTTATG
GGTATACTAATCGAAGATGGTCGGAAAGTAAGTACAGCAAGTCATCAAGA
AGACGGATCAGCGCGTCAACGTAAACATggaaaaacattacgtcatccGT
TAGACATGGTCAATTTCAATAAACAAAACCAAGAAGGTGGAGAACCATCG
AGACGAAGTAGCTCAACGATGGAGAGATATCGATTACAAGAAAATATGAA
AGACCACAAGCGAAGTGGAAGTAGTCTTAGTTTGCTACCGTTAAAAAGAA
CTGGATCCGTAACAAGTTCAATCGTATCACGAAAATCCAGTGCCAAGAGT
GTCGGAAGTAATCGAAGTAAAGGCACCAGTCGATCTTTTACAACCACTCG
TAGTTACACTACCAACCGTAGCAATGGAACTGTTACATCCCAAAGCAGCT
ACATCAAGAAAAATTCCGGAAATTTTGACGGTAGTAATGATCGCTCTCGC
CGAAAATCATCGTTGCAACGAAAATCATCGGCTTCGAGCCGTAGAGAACA
ACTCATAGCAGATTTTTATCGAGATTTGGAAGAACTAGACGAGGAACGAA
GTTGTTCCGACTCTTccgatgatgaaaatgatagcCGCGGAAACGGAAGT
CGGaatcgaaataaaaagaaattaaagaaaggACGAATAGAAGTAGAGGA
AGTCAAAAGTCATCAACGTGTCCAAGAATATTTGATGAAACTCGAACATA
CAGAACCCCCGGAAATTTTTGAGGAGGACGAGGGAATTCGTTCGGATATG
TCAGACGGTAGATTAGGCTCGTCTTATAATAGTAACTACAGTAACGATAT
CCCTATGGAAACTAATAAAAATGATAACAATAATGGCGGACGTAAAAGTG
AACCGAGATACATAAAACGACCGAACCCTCCCGATAATATGATCGCTGAT
TTGGAAGATTCACCGAGAACGCACCGACTTAAAGTTCGGGACGAATACCG
AAAATCGCGAAACGATAAACAAGACTCTAATAAATATGACGTCAATAAAA
ATAACGTCGGAAAGAAAACTCGTTCTGCAAATTACACGCCTCGAGTGTTA
CCCCAACATCCAAAAGAAATCGAACTGATTGATAAAAATTTACGTGAAAG
TTTTAATAATAAACGAAAACCGAGTAATAACGACTATAAACGAGTTTCGG
TTCACGAAGACTTATATATGAACGATAGTGGTAGCGAATCATCCTGTTCA
ACAGATTCGGCACACGGTTCAACTCACTCCATCTCTACCGTTAGTTCCAT
CTCAGTAGCAcagaaacaccaaaacaaacaaattcatCAGTTAAGTTTTA
AAACAACGGTACCCAAAAATTTTATACCAggacaacaacaaaaacatatA
CTGGACTCACAACGTAAAAAGACAAATCGAAAACcgaaaaaagtttcatt
ttgttTCAGAGGTATTCCTTTCAGAGTTTACAATAATACACCGAGAACTC
ATAGGGCGTTAGCTCACGCAGGGTGTATTGCCCTCATTATTCCCGCCCCT
GGTAATCACAAATGTAGACATTAAATGTTTCAATCAAACGCTAAGCGGAA
TTTTGGACATTATGATTTTTACGGTACTAAATCAACCAATAAAGTCAAAT
CTAACAAACGCCCTCTACCAAGGGCGCAACCTTATGATGATGAATATTTG
GAACGACCTTTACGTCTTCCAAATTTACCGACAATCAACGAGAGACGTAG
AGTGGATATTATAAGAGAATACACAAGATACCAACAAATGCCACAATGGG
ATTTTTCTGTCCCTCCACAAGTTAAAGATTATATGGTTAACAATTCAAAG
AAAAGCCTTATGGGTATACTAATCGAAGATGGTCGGAAAGTAAGTACAGC
AAGTCATCAAGAAGACGGATCAGCGCGTCAACGTAAACATggaaaaacat
tacgtcatccGTTAGACATGGTCAATTTCAATAAACAAAACCAAGAAGGT
GGAGAACCATCGAGACGAAGTAGCTCAACGATGGAGAGATATCGATTACA
AGAAAATATGAAAGACCACAAGCGAAGTGGAAGTAGTCTTAGTTTGCTAC
CGTTAAAAAGAACTGGATCCGTAACAAGTTCAATCGTATCACGAAAATCC
AGTGCCAAGAGTGTCGGAAGTAATCGAAGTAAAGGCACCAGTCGATCTTT
TACAACCACTCGTAGTTACACTACCAACCGTAGCAATGGAACTGTTACAT
CCCAAAGCAGCTACATCAAGAAAAATTCCGGAAATTTTGACGGTAGTAAT
GATCGCTCTCGCCGAAAATCATCGTTGCAACGAAAATCATCGGCTTCGAG
CCGTAGAGAACAACTCATAGCAGATTTTTATCGAGATTTGGAAGAACTAG
ACGAGGAACGAAGTTGTTCCGACTCTTccgatgatgaaaatgatagcCGC
GGAAACGGAAGTCGGaatcgaaataaaaagaaattaaagaaaggACGAAT
AGAAGTAGAGGAAGTCAAAAGTCATCAACGTGTCCAAGAATATTTGATGA
AACTCGAACATACAGAACCCCCGGAAATTTTTGAGGAGGACGAGGGAATT
CGTTCGGATATGTCAGACGGTAGATTAGGCTCGTCTTATAATAGTAACTA
CAGTAACGATATCCCTATGGAAACTAATAAAAATGATAACAATAATGGCG
GACGTAAAAGTGAACCGAGATACATAAAACGACCGAACCCTCCCGATAAT
ATGATCGCTGATTTGGAAGATTCACCGAGAACGCACCGACTTAAAGTTCG
GGACGAATACCGAAAATCGCGAAACGATAAACAAGACTCTAATAAATATG
ACGTCAATAAAAATAACGTCGGAAAGAAAACTCGTTCTGCAAATTACACG
CCTCGAGTGTTACCCCAACATCCAAAAGAAATCGAACTGATTGATAAAAA
TTTACGTGAAAGTTTTAATAATAAACGAAAACCGAGTAATAACGACTATA
AACGAGTTTCGGTTCACGAAGACTTATATATGAACGATAGTGGTAGCGAA
TCATCCTGTTCAACAGATTCGGCACACGGTTCAACTCACTCCATCTCTAC
CGTTAGTTCCATCTCAGTAGCAcagaaacaccaaaacaaacaaattcatC
AGTTAAGTTTTAAAACAACGGTACCCAAAAATTTTATACCAggacaacaa
caaaaacatatACTGGACTCACAACGTAAAAAGACAAATCGAAAACcgaa
aaaagtttcattttgttTCAGAGGTATTCCTTTCAGAGTTTACAATAATA
CACCGAGAACTCATAGGGCGTTAGCTCACGCAGGGTGTATTGCCCTCATT
ATTCCCGCCCCTGGTAATCACAAATGTAGACATTAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_014342XLOC_014342Clytia hemisphaericagene
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00025541-proteinTCONS_00025541-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00025541-exon-sc0000539-1491911889:67976..68361TCONS_00025541-exon-sc0000539-1491911889:67976..68361Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025541-exon-sc0000539-1510915933:67976..68361TCONS_00025541-exon-sc0000539-1510915933:67976..68361Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025541-exon-sc0000539-1575043694:67976..68361TCONS_00025541-exon-sc0000539-1575043694:67976..68361Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025541-exon-sc0000539-1491911889:73524..73783TCONS_00025541-exon-sc0000539-1491911889:73524..73783Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025541-exon-sc0000539-1510915933:73524..73783TCONS_00025541-exon-sc0000539-1510915933:73524..73783Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025541-exon-sc0000539-1575043694:73524..73783TCONS_00025541-exon-sc0000539-1575043694:73524..73783Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025541-exon-sc0000539-1491911889:86496..88323TCONS_00025541-exon-sc0000539-1491911889:86496..88323Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025541-exon-sc0000539-1510915933:86496..88323TCONS_00025541-exon-sc0000539-1510915933:86496..88323Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025541-exon-sc0000539-1575043694:86496..88323TCONS_00025541-exon-sc0000539-1575043694:86496..88323Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000539supercontigsc0000539:67976..88323 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0.0937923 0 0 0 0 0 0 0.167957 0 0 0.265483 1.92445 1.54163 1.1556 1.17413 0.217197 0.290175 2.40171 3.81102 0.243293 0.269349 0.153072 0 0 0 0 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00025541 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top