TCONS_00025465 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00025465
Unique Name	TCONS_00025465
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4061

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000536:129525..149970+

transcript sequence

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transcript from alignment at sc0000536:129525..149970+

Legend: exon

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>TCONS_00025465 ID=TCONS_00025465|Name=TCONS_00025465|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=20446bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000536:129525..149970+ (Clytia hemisphaerica)
CATTGATCTCCTTAATAGGAATATAGATAACGGAAATGTTCTCCATCGTT
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CATATTTTCTTGCAATTATCTATTTTctataaatttttatttgtctttta
tttattttgtacaCCTTGATAATTTTATAATAATAAATACCACTCA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_014296	XLOC_014296	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000536	supercontig	sc0000536:129525..149970 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
16.4548	16.0474	10.1704	9.60981	3.90526	5.65791	0.383527	0.3633	0.294694	0.372583	0.23558	0.00436002	2.77233	3.27206	0.148997	0	2.08355	1.96027	1.85404	5.68808	3.82091	3.23444	6.29663	5.23933	5.71637	7.61393	0.996856	0.171812	1.14054	1.47826

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00025465 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00025465 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00025465 (transcript) - C. hemisphaerica