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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00025011 ID=TCONS_00025011|Name=TCONS_00025011|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=696bp
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cagaaaatgttcggtGCGAAGTAGACACTGTTCTCTGCTCTTTGAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000515:193452..202286+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00025011 ID=TCONS_00025011|Name=TCONS_00025011|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8835bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000515:193452..202286+ (Clytia hemisphaerica)
AGTGATTTATCGGTTGTACAGCCTTCAGCGTTACATCGCTTACACAGATA
GAGTGGATTGGGAACAAGCTTATATGAACTGCAGAGCGATCGGTGCAGAT
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taacatgttcttattttcaccatgtttgagcatttttgtccattttccta
agaaattgggtattttagaatcttcaaagccttaaaatgttcttagcttg
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CCTAAGTAAACACTTGTCCTTTCTATGCTGTCATTTCCTAATTTCGAGAT
TACGACAACAGGGCTGTAAATAGCAGAACTTATGTAAACTCTGAAACACT
CAAGCTAAAGCTGAATTTTACATCAAATATCCAAATTGGCCGGCAAATCG
TTTACAAACCTTTCTAAGGGTTTtgaccatagtcgaaaaattgTCTTTGA
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TTTCCTAACTTCGAGATTACGACAACAGGGCTGTAAATAGCAGAACTTAT
GTAAACTCTGAAACACTCAAGCTGAGCTTAATTTTACATCAAATATCCAA
ATTAGCCGGCAAATCGTTTACAAACCTATCTAAGGgttctgaccatagtc
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GATTGATGGAGTTTTCTGGAATAATTGAGGCATTGCGGTTCAGTTGAGCG
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gcgtgataccgttccagcccgaatGGCGTGCCAGTCTACCGATAAGgtag
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AAATGGATAGCTCTCAAATCGATTATAAATCTCTTAATCACCATTTTAAC
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GAAGTTGTGATTCATATGGAGAGAGTTTGAGTGTGGAGAATTCTGGtaag
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AGGACTCATTTTTACagatttcaaagtcaaatatctcagctttggaaaaa
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GAGTTTGGGGTTAAATTTCTAAATGGTCCTTCTATAATGAATTTTAGAGC
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TACTTttgcaaaaggtctattactgGACTATACTTTAAATATCGACTTTA
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CTTGGCATCAAGCTCAAACGAACTGCAGAGCAATCGGTGGTGAATTGTtg
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TAGGATGCTCGGGGATTTTTGACGTGAATAAACAATgaattactcttgtc
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cggtGCGAAGTAGACACTGTTCTCTGCTCTTTGAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00025011-exon-sc0000515-1491911889:193452..193485 | TCONS_00025011-exon-sc0000515-1491911889:193452..193485 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025011-exon-sc0000515-1510915933:193452..193485 | TCONS_00025011-exon-sc0000515-1510915933:193452..193485 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025011-exon-sc0000515-1575043694:193452..193485 | TCONS_00025011-exon-sc0000515-1575043694:193452..193485 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025011-exon-sc0000515-1491911889:200580..200701 | TCONS_00025011-exon-sc0000515-1491911889:200580..200701 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025011-exon-sc0000515-1510915933:200580..200701 | TCONS_00025011-exon-sc0000515-1510915933:200580..200701 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025011-exon-sc0000515-1575043694:200580..200701 | TCONS_00025011-exon-sc0000515-1575043694:200580..200701 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025011-exon-sc0000515-1491911889:201747..202286 | TCONS_00025011-exon-sc0000515-1491911889:201747..202286 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025011-exon-sc0000515-1510915933:201747..202286 | TCONS_00025011-exon-sc0000515-1510915933:201747..202286 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00025011-exon-sc0000515-1575043694:201747..202286 | TCONS_00025011-exon-sc0000515-1575043694:201747..202286 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000515 | supercontig | sc0000515:193452..202286 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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