|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00024953 ID=TCONS_00024953|Name=TCONS_00024953|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3239bp
GATTAGTTAACTACAACTGATTGTTGATGTAAAATTTCCTGCATTTTAAT
TGGCTAATGAAATCTCCCTGCATTCTGATTGGTTAATACTATGACGGAAG
AAGTGGAATGGTTTTGGGATAAATCGGATTTGGAATCTTATTTAGAAGAA
GATacaaaCATGGCAGAACAATCAAAGCCAACGCGACCCTCAAGGGATTT
AGACCATTACGATGAAAATGTGGAAGAATTATTAAAAGAGCACAAGTACC
TTTACAAGAAAGAAGCAAAATATGACATCATGCAGGTGTTGCATGCTTTC
CAAGACTTGCATCCTAAAATTGAACGATGTGCACACACGAAAGGTGGCCG
CACTGAAGAGCTTTTGACGCTGCGAGGCACAGTCCCTATCGAGTTTAAAT
CTGCAACGTATAACATCCCGATTCAGATTTATACTTTACGCACGCACCCG
AAACAAGCACCAGTTGTCTTTGTAAAGCCGCTCAAGAATATGGTGATCAG
AGAATCGAAAAATGTTGACAAATCGGGATTGGTTTATTTGCGTTATTTAG
TTGACTGGAAATCACCACGATCTAACACATTAGCGTTATGTAAATTGTTG
AGTCGTACGTTTAGTGAAGAGTGCCCCGTATTTACGGAAGATCGTTCAAA
GAAACAAATTAAAGCgacaaaaccaaagaaaaagtcGCGTCGTTTTCGTC
CGCTGCGCCGCTTTTCTTTGTCTCGGAACAGCAAGTCTCCAGAAGTGATG
CATGAACCCGGAGCAGTTGAACAACCATCCAAATCCATCTTAATCGATAA
AGATCGAGAACTAAATTCCGAATCGGATATGAGTAAAGCCGATTTGGATC
GCATGGTACCTGAATCACCGTCTGTTTCTACTGATAGTTCGCTATCTAAA
GGAAGCGCGAAAAATGTCTCTTTCTCCGACGACGCCACGATGGATGACAT
TCCCGACATGACGTACGACGAGTCGCTAGATTCTCTTTATTCGTCATCTT
TCGAATCATTATATAGCGACCGTTCCGTCACTATTTTAGCTGCTTTGAAG
AATCAAAAAATCGATACAAACAGTTTATTTAATTCGTCATTCGAGTCTTT
ATTAAGTGAGAAGAGTATTTCTTATTTGTtggatttagaaaaacattggG
CACGACCCGAGGGTGGACTTACACCCCTGGCAAATAAAAGGGGTGTGTCG
TCACAATCACCTGCATCGGCACGCTCTGATCGTCAGAGTACAATCAGGCC
ACGTCGATCGTTATCGCTAAATAAAAAAGACGCTTTGAGAAGGATGAATC
AATTATCAATCGACTCCGATAATTGGCCGACTCCACCCTTATCGACTGCT
GGTAGCGAAGGAGGCGGTAGCCTTACCAGACAGAGTACCTTTGATTCTGA
CAGCGGCTGGCCGGAGCCGCCACCTTCTGACGGTCGCAATAGCGCCGCTT
CAACCGAATGGCCTGAACCCCCCATCGATATTTTACCACCGCCCGATTAT
CCTATGCTAATTAGCTCAGCGCGAAGTCGTGCTTTTTCTGATATCGAAGA
ATCGCCTTTTGAAAATGTATTATCGCCGTCTAAAGAGAAAGCACTTTTAC
CGCTTttcgagaaaaagaaaaaggaatggGAACTAGAAGCTGAAAACGAT
TTCAAATTTAAGGATACTTCGAAATTTAACGGTGATACACTGGAACGACC
AAAACTAAACGGAAATGTAAGCGATTACGAATTTAACGACACTCTTGACC
GTAAATTTATGGAGAAACTAGAACAAAAGTATAACGAAGACTCGCTCGAT
CGTAAATTCCCAGAGCCGTTTAGTAATGAGACTCCAACTAAGAAAACCAT
CAATATCGGCACAGATTCACCTTCGAAGATTTACGAATCTAAAGAAACAC
AATATGAATCAACGACTCAatttaaatcaactgaaactCAATATAACACT
TGGGACAAACCTGATAAGGCATTTCTAGAGGCGTTAAGAGAAGGGCGGAC
TGAGTATTTGGATGAGAATAATATAACGCCCACGCCCATACGGAAGGTAC
TTGATGAGAAACCATTTGATAGCGATTTGTTCAAGCTAGATTTTACAGAT
GTTGAGGGTGAAACATCACGTGAAACCACGCCACGGCAAATGACAATGAC
TAATGGTGGCATGGTCACACGCGCTGAACCAGTCGAAAGTAAAAAACGTA
GACCATGGCCATTTCGTTCGAAGAAAAGTTCTGAGAAAACAAAATCGAAT
AAGAATCCGTCTACGAATCATGATGATTCGTGTCATAATAACTGTGACAG
TATACCAAACAATAACACATGGTCACACTCACTGAACTCCGATAAAgatg
aaattgaaaaccaaTATAATAAAGAGAGTGATACCAATCATGTAAATAAT
CATGTGGAAAACCATGTGGCCAATAATCATCACGGCATCAACAGGTCCAA
AAGTATGGAGGAAAGCGCCTTCAAGAAAAATGATATATACGAACATGTAA
ACAAcaataatcaccatggtaaccATATCAATAATCATGATGGTGGCATG
AGTAATGGTATCTATGAGCGCGTGACTCTGACCAATGGATTTAAGCATCG
TGATTGTTTAAGCGAGGCCAAAATATATGAACCAATTTCGTTTGCTAATA
AAGGTAAAGCTAAAAGTGATAACCATTTAACGTGTAGATATAAATCGGTG
GGTTGTCTAGCTCATAGTGAAAGCGAAAGTGACTGTCTGAACCATAACGA
TGAAGCTGTCAATCACCACATGTATTTATTATTGAACAAAGTTGAATATT
TAACTGGTGAAgtaaaacatttgaaacagAAAGTCAAAACATTGGAAACT
GACTGAGACTaagtattctttaataaatgGTATTGTACTAAAACACTATT
TTATCATCATTTGTTAAACAGACAAAGCTGTTTGGTTATTTTTAACTACC
TAATTAAATTTTTGTaacaaaaaacaattataattttaattCTGGCGTGT
TGGATATGAAAATATATGCAATGAGTTTAAATTTATATTGAAACGCAACC
CCAATGAAATTCCATAttccaatagacgatatcgcgtttagataaatgca
atgcattctggtttctcggggaccctcaagggaattataatctattccaG
ATCATTATGTAATCGACATTAtcattcctttgagagtccccgagaaacca
gaatgcattgcatttatctaaacgcaATATCGTCTATTG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000514:90229..102577+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00024953 ID=TCONS_00024953|Name=TCONS_00024953|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12349bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000514:90229..102577+ (Clytia hemisphaerica)
GATTAGTTAACTACAACTGATTGTTGATGTAAAATTTCCTGCATTTTAAT
TGGCTAATGAAATCTCCCTGCATTCTGATTGGTTAATACTATGACGGAAG
AAGTGGAATGGTTTTGGGATAAATCGGATTTGGAATCTTATTTAGAAGAA
GATGTAAGTATTAACGTATTTTCTTGCAATTTAATTGGTTAATAtgaaat
ttcttgaattttgagGGGATAATGCAATAATTTCTCGCATTTTCATTGGC
TAACCGATTATTtgatactcttgtctcccgaatagatgtcccccccgcta
attgctaagagagaaaaaaatccaacccccccgctcttattaagaccccc
ctgctaattaaattcgaataattcaatattttgttACATAGTGTAGACAT
ACCtcaaacttgttaaaattttcctttttgttagtattggttcttatttt
acgtgtttatttgttaaagtttcttttttgttgttgaaattgatatcagt
taaaaaaaattctgtcttcaaattcccccccccctcttattccccccccc
ccccccgcttattggtatttagaaaattttcctaccccctgcttattcgg
accccccgtctatttgggagacaagagtaaCAGTTCCAGCTGCTTTAGAC
ATCATGGAAACATGattaatatttcaattttacaatttcacGCATTTAAC
ATTAAAGGTCTCttcaactcgaacctctataactcgaacgtctccttaac
tcggACAGGTTAGCTtttcccttcagttaacaatgcttttttaaacctta
ctccactgaatcaatctggcttagatttctaggctacgtCCGTCCATCCG
CTCGTTACcaaattttctcgagattgggtcattagttttttctgattttt
tgcatgaaggTAGGATATcattttttgctcatgagggcttatgtttgaaa
aatatgtgtgtttagacatgaacttttggttgcttggcgtgtttttatag
aaaaactggccaaattcgatatttttttataagcacattatcaattactt
aggtattagcttttctcgagattgactctttcattctttatgattttttg
cacaaagatggagcattgtttttttctgatattttgcatgaaagtaagta
aaagatggctcaagcagatttttgtaaaaagataatttttcagctcggaa
aacgcatctttatctataagaatcgctattaataagcatacatcaatggt
CTTAGTccaattattcaatttttttatgagatagatgtttttttttgctc
acgaagtcttgaatatgaacgaatatttcaagagcatgaaattttgggtT
TCTAaacgttctttttataagaaacaaacgactaattttaataaatcgtc
actatttgtgttctgaatgattgtttcacggtcatgctcacgtagacatc
aattatatatgtgttaaatgcataaccaggtaggtccataaaagtatcac
ttgtttttataAGAGTAGTGTActtgagggtcaagtattcttaaaaaatt
aCCCAAATtgaggttgaaatattcttaacgtattcaaGTACTCTTTTAGA
ctcaatttgagagtttaagACTTTTGAGTGTACATTGGGAGCTATAGTTA
TATTTCTTCCTcaaagtttcaaacaaaaaacccagttttttttctgttaa
ccaaatacaaaacgactgtatttttatcaaaatctgtgAAAGTCATCCTA
GAGGGTATTCCTATTTTTACGATTTGACCAATATttaccctgatattctt
atagaagatgattcttgtaaaaaactttaCATGATGGCCATTCTTGGATT
AAGTTCATACAGGAAttctttaatcaaaaaacgataaaaattcTGAGGAA
TTCAGGGCTAATTTCCTTTCCAAAAAATACATCGGGGACGAGGTTGTAGA
CGTATAAGAgtttattcgaattacagagagtaatttaaaccacttttcag
ctaaggggaccaatattttagttcgaattagagaaaggttTCAATTTCTG
AGAATAGCTTTAACCACTTTCCAGTCAAGGAGGccaatattttagtttaa
attacaaaaaaattcgaataatagaagtttggATTAGATTTAATTGAGTG
GTACTATTGATATATTCATAATTTGTAGCGTTCAGGTTAAACATAAAATC
ACTTCTTCTCTTAATATTAAAATTATAAACTACTGACGTCCTCTGAATCA
CTTTCATCTTCTCCCTCCTTTACCACAATGAGGTTTGTGGTACATCGTAA
CATGTAATTACAATCGTGGTAAGTTGTGTTGCCCAACATTCGTTCAAATA
CAATAACTGTTGGCCAGTCAAATCCTAAAGATGTATAATcatcaatggcc
aaaatgtttcCTTCCTGAAGAAACTTATACGGATTCTCTCCttctttaaa
atcatttttttgtttgtcaTATGCTTTATAATTCTCGTTCAACCGATCTA
GAACATCAGAATAATTTCTTGCAACGATTGGGCTACTATTTATCACAAGG
ATTCCTTCATTTGTTCGTTTTCTCGCTTCTTTCACTGCTTTTTCGAACGT
GTCGACAAATATTGGCTCGCAACCATCCGGAAAATTACCAAGTGGCATGA
CGATACCTTTTTTGTAGTCATAATATTTCTTCTCGGCTTTTAATTTGGTT
GCTTTGACGATCTGTTGAGAATTTCTAAAATTCTGTTTGAGATCGACGAA
CAAAAAGTCAGTCGAGAATTCTTGGTAACTTCCATCACTCAAGTTTTGTG
TCGATGGGACGATCCATAAGTAGTCAACAAGTGGCATCACCTTCTCTTTt
atccattttttgttttgtgaatGCACTTTATATTCATCGATGAACAATGC
TTTGATGTTCCGTGTTTTGATTATCTCGACAAAACGAGCTCTCTCAACCT
ATAAAATGAATGATAAACACCATATAAGACTTGAAAATATCCAGGTGTCA
AATTCATCGATGAACGATGCTTTGATGTCACGTGGTTTGATGACCTCTTT
GAGATGACtatcaaatgaaaatgaaaaagatattcttACTTGTTTTTAAA
ACATGAAAAGGAAGACACCTTAAGAATATAAAGATTTTACAAGATCAATC
CGTaacaatcagaaaaaaattgattacttACAAAAATCGAATTAACATAT
TCAACAAATATTCCATGTTGATTCTCCAAGTCAACCTTCAGACGATGAGA
TTGCATGGTTGCAGGTTTATTGTCGTCATAATCCNGATTCTCCAAGTCAA
CCTTCAGACGATGAAATTGCATGGGTTTAATAATTCCCATGATTTTTAAA
TATGAATCGACAACAATCATAACCTTTCCTTTGTATTCAGGTCGTTTGTT
TAATTGTATGGCCTTCTGTGTAAGTAAGATTGATTTTCCAACACCAAAAG
GCCCCTCAATGATCACTCTCCGGTAGCGTTGGTCATCGTTGTTCATTATT
GCCATCTGTTGGTTGGAGTAGAATAAGATGTTGTGGCTAGTCGAAACATT
TTCGATAGCGTTGCTGGTGTATTCGACCCATGTTGAGCTGGTAATAGGTG
CGACTTGATCTTTTTTCGAAACGTGAATGGCAAAGAGCAGTATTTTGAGT
AGTTTCTTAGCTTCGTCCAATGAATTCGGTATGGACGCTGCTGGAATAGT
CGGGAACCTTTTGAATATACTGGTCAGCCATTATTTTATTTCAGTTTGGA
TTGTGATATAATGCTGACTGTTTACTGAAAGGTTGTCGTTCTCCACGCCG
ACCACCGGGAAATATGTCCAGCCTGATTTGAGTTGATCTGCTAGTCTCTC
CTCGAAGATTTGATGGCTTTTTTCCAATTGCTTGAAGACTTTATCATCTG
CGATTGTTCTTTTCAGCTCGATTGAGATGATAAGTTTCCGTTCCCAAGAT
ATGATTAGAAAGTCTGTCTCTTTAtgcattttgtttttcaaatttgtcag
GAAAATGAGTGAAGAAAGAACGACTGTGTTTTGGAGAATGTCATCTTTCA
ATGGTAGAAGCTGGTCATATAACCAGTGTTCCAGCTTTTCACCAACTTCC
GACAGTTCCAATTTGAATAGCCATTGAAGGTTTGAATCATCGCTTGGTGT
TTCTTCAATCATTTGCTTGATCTGCTTTTTGAggtttttcgaatttttta
ggAGAATTGTTCCCAGAGGTGATGTGGGAGAGAGCACGGCAAGACATTCT
CTAATTAAAACTTCCAAGTTAGATGTTGTCGGCGGTAGGGTCAATTGGTT
AGATTTCAATTCTGTAATTACCAGATACATGATTTGAAGGTTTAAAATCC
ATTCCTCAAACGCCTTCTTGTTGATAAAATCAGCATTGTGTTGCGTTTGC
ATAAAAGTTTCCAATTCTTCGGTCAGCCAATGCGTTGGTGAATGTTGTTT
CAGATTAACCAAAAGTCTGTCAATGTCTTCTTTGAAGTCATAATTAAGAA
TAGCGGTAGAAGACTTTTTGTACTGTTTCGAAACAAACGTGGGTGGTATG
AAAACACTGTGTTCACCTTGAACGTAAAGAGAACTGTCTCCATACTCCCT
TTCAAGAACGAAGTCGGCTGCATGCATAGGATTTGATGTACAGTGCGAGT
TCCCCAAGTTGAACTGTTTTGCTTGTCTTTCTGACGTGGCTTCACTGTTA
TTGAGAATCTGCTGATACAACGATTTATTGGAAGTACATCTGGTTGGATC
gattggtaatggtttcaaagaCAAAACTTTCTGGATGATACCTGCCATAT
TCATTTGATTAGCCATACCTCCAATATTCACTTGATTAcccatttacttt
caaaatcaaatcaaaaaaactcATATACAACACTTAATCATGAAATACGT
TGTTTTCCTTTAATATAGATTGatgcttttttatatatgttgACATTGGC
AGTATTAAATTACAAATGTTAGCGTGTATCCATATCTTGAAATTTCTATA
AATCGAACAAATTtatgttccccgtgcgtgttcgagttatggagattcca
ccattatatttcaaaaagtatttacctTATAGCTTAATGGTGAtagacat
GTTTTTCGAAGACAAAGCTATGTATCAAGAATTGGTAGCCTGCAGTTCTT
AATCGTAAAAATGTATCAATTATTTAAGCATAAGTTGTGTCTGGAatttt
attcaattatttttagcTCCAATTAATCTCTTTTTATNGTTGTGTCTGGA
attttattcaattatttttagcTCCAATTAATctctttttattaaatttt
tcatgATTTGTTATCTTTTTCCAAATAACATCCAAATTAATTTGaatgtg
aaacattttttcCAGGTAGAAATTCTTGGTAAATATTTATTCATCGAATG
CGAATTTTTTACACGTTACTTTTAACTGCAGAAAATTTGAGATTTATTAT
TTGAGAGATGGATCAATTGATCAATTATTGACCGTCAATGGTTTGATTTA
AAAAGTATTGGGAAATGTTTTGTATTGATtaaacaccccttctcacagac
ccggtcaATCCGGTAgaaatttttcagccagtggggataaaaataacgga
ctgaaacggGGAGGAGAggggaggaggaggaggaggaaaATTGGAGGATA
ACTTTCCACCAGGGGCGATATTTTGGAGATTTTTCGAGTTTTCCGTGATC
AGAGTATTTTTGGTACCACTACCTGCTTCCACTTTTCTAAATACTCTGAT
TAAAGATGGTGGACATAGCTTAGGCTATGTCGTTATTATCTAACGTTATA
cgtatggacgttgtgaatgttagaaaaacgttgaaacaacgttgtgtgcc
agctgggtggaCCAATCAAAAATGATGAACTATAGCTAACAGATATCTCT
TAAGTCACCTTTCGATTTTGGTATTTCTAGCTAGACCTGGTCAAACACAG
AATAATACCGCCAGCGAGTTGGGTTTCTTTTGTAagggtttttaatttta
taaatttcaacCAACAATTTTTAAGGAGCCTCAAATCGTACATTGATAAC
TCCTGGACGATAAATCTCATAAACTAGGATAATTTTTAATTGCTTACTTC
CGTGCAGTTTCGTATCGTAAAATCTAGGTCACATGTCACGAGTGAAAGAA
TTTGAAATATCAATAtgaatgaaatcaaaacaaaatggccattgcattct
tttataagaattttaacaAATTCTGAACATTGAGGAATTAAACAACAAGA
ATAAGACTTCTTTCGCCTTTTGGAAGTATAATTTCATTCGACCTCGATAC
GAACTCTAGGCCATTTCCCATAAAGCGATGGGTCAAATCTTGCAAGGTAA
GTCCTGCTATGTCCTATGTcctcaaaaaataaaacaactgAAATTTAAGA
CAGATACTGTTATTAgcttctatttttttttttttatgaaaatattcttg
TTTTACGATCTTATAAGTAGTGACTTTTgaataatattattttaaaatca
aatccaCTATACCcaacaaacaaaaatatataacgTTTTGGAGGTTTAAG
TGACTAAGCAACgagattcttgaaaaaaaatcaatactcAAAATCGTCAA
TAAACGTATTAGTGAAAATGTCGAAATTGATTAATTTATGACAGGTCAAA
TTTAGGGAGttcataaatttttgatttcatcaTCTTTGGAATTGAATAGA
ATATATTTGTAAAAAAGACTAAcaaaagttttcaagtttttgctTTACTG
TGTACGTATGTGTAGCAGTCTGGAGAGACATTTTCTTATaagtaaaatat
ttaaataagtTCTTAAATACAGTACAATATATTGTATTGAGTTTCTTGAA
GAATACCATGAATGGTTGCCCCGGGTTTCCACAACCTCCCTCCTCCCGCC
TAAAATCTTGAATTGAATCGTTCCAATGATTTTTAAATGAATATTTAACA
GTATTTGATNGTCACATGTCACGAGTGAAAGAATTTGAAATATCAATAtg
aatgaaatcaaaacaaaatggccattgcattcttttataagaattttaac
aAATTCTGAACATTGAGGAATTAAACAACAAGAATAAGACTTCTTTCGCC
TTTTGGAAGTATAATTTCATTCGACCTCGATACGAACTCTAGGCCATTTC
CCATAAAGCGATGGGTCAAATCTTGCAAGGTAAGTCCTGCTATGTCCTTA
AAACCATTCTTTCCAAGCATTTggtcttcaaaaaataaaacaactgAAAT
TTAAGACAGATACTGTTATTAGCTTCTATTtgtgttttttcttataaaaa
tattcttgtTTTACGTTCTTATAAGTAGTGACTTTTGAATgatattattt
taaaatcaaatccaCTATACCcaacaaacaaaaatatataacgTTTTGGA
GGTTTAAGTGACTAAGCAACgagattcttgaaaaaaaatcaatactcAAA
ATCGTCAATAAACGTATTAGTGAAAATGTCGAAATTGATTAATTTATGAC
AGGTCAAATTTAGGGAGttcataaatttttgatttcatcaTCTTTGGAAT
TGAATAGAATATATTTGTAAAAAAGACTAAcaaaagttttcaagtttttg
ctTTACTGTGTACGTATGTGTAGCAGTCTGGAGAGACATTTTCTTATaag
taaaatatttaaataagtTCTTAAATACAGTACAATATATTGTATTGAGT
TTCTTGAAGAATACCATGAATGGTTGCCCCGGGTTTCCACAACCTCCCTC
CTCCCGCCTAAAATCTTGAATTGAATCGTTCCAATGATTTTTAAATGAAT
ATTTAACAGTATTTGATAGTTTATTCCACCATATtaaaaattttatgaat
tttcttgATTCATATTATTAAATTATTGGTCAAGTAAGGAAAAATTTTGT
CCtcgaattttttctaaaaagagaaaaaatttcttgaattttttatgttt
tcgtGAGTTCAGGGTTTTGGGATGGAATTACTACTAAATGTATTTTTTGA
TCGAGATTATTAATTTAAAAGGTTTCTTCTTTTGTGTTTGAtgataaaat
acaattttttttgaagaagttAAACTATATTATTTTTTCGGCAGACGTTT
TTTTTGTTTCGCTGAATACTTAATGTGGGGGGAAAAAGATGACAGTtttt
ttgtagtttaatgtATATTTTGTCGTTagtgaaaattttatatatttttt
ttgctcagtcgGATGGTTTCTAATGTCTAGCTTCTGTTTCTTTCGAAACT
TTATCTTGGTGAAAACTCATCATTTTTAGTCTGAAATGATAAAATTTGGG
CTTCAtaatatttcttcattttcactgTTTCAAAAAAACCTATTTGGCAG
GAGGAATAATTAGAGAACTTTCCAAAGGATTTTCGGATAACAGTTTATTC
TATGCATCTTTTCCCCGAGACTTTTTGCCACATTGAAGGCTGAAATGAGT
TCACGTAAACAGATttcaggctcggatacagagggaggctataaccaatg
gaggagagtgcactttattatggttttaccttatatggaaactaattact
ctccatgaataagatagcctacctcctgtatccgaccctggaTTTGAGCA
TAAAAGATCGTCAAAGTATCCTTGAAGTATATAGAAGATACTCGCCTCAT
GTGTTATAAAAATATGTATAAAATTGGANGGAAGAATTATTAAAAGAGCA
CAAGTACCTTTACAAGAAAGAAGCAAAATATGACATCATGCAGGTGTTGC
ATGCTTTCCAAGACTTGCATCCTAAAATTGAACGATGTGCACACACGAAA
GGTGGCCGCACTGAAGAGCTTTTGACGCTGCGAGGCACAGTCCCTATCGA
GTTTAAATCTGCAACGTATAACATCCCGATTCAGATTTATACTTTACGCA
CGCACCCGAAACAAGCACCAGTTGTCTTTGTAAAGCCGCTCAAGAATATG
GTGATCAGAGAATCGAAAAATGTTGACAAATCGGGATTGGTTTATTTGCG
TTATTTAGTTGACTGGAAATCACCACGATCTAACACATTAGCGTTATGTA
AATTGNgagcagttccttaacaattccttattttttgaaccattttcagc
ctcgagttccttataaacgtgttccttataaaaaaaaaaacgtgtaatga
atAAAATCCACTAACAATGTTGATATTGAACATCTATAACAGCCATTAGT
CTAACGCAGTCTAACTACTAGagacaattttcaatatttcaattctttct
aattttttttcagacaaaCATGGCAGAACAATCAAAGCCAACGCGACCCT
CAAGGGATTTAGACCATTACGATGAAAATGTGGAAGAATTATTAAAAGAG
CACAAGTACCTTTACAAGAAAGAAGCAAAATATGACATCATGCAGGTGTT
GCATGCTTTCCAAGACTTGCATCCTAAAATTGAACGATGTGCACACACGA
AAGGTGGCCGCACTGAAGAGCTTTTGACGCTGCGAGGCACAGTCCCTATC
GAGTTTAAATCTGCAACGTATAACATCCCGATTCAGATTTATACTTTACG
CACGCACCCGAAACAAGCACCAGTTGTCTTTGTAAAGCCGCTCAAGAATA
TGGTGATCAGAGAATCGAAAAATGTTGACAAATCGGGATTGGTTTATTTG
CGTTATTTAGTTGACTGGAAATCACCACGATCTAACACATTAGCGTTATG
TAAATTGTTGAGTCGTACGTTTAGTGAAGAGTGCCCCGTATTTACGGAAG
ATCGTTCAAAGAAACAAATTAAAGCgacaaaaccaaagaaaaagtcGCGT
CGTTTTCGTCCGCTGCGCCGCTTTTCTTTGTCTCGGAACAGCAAGTCTCC
AGAAGTGATGCATGAACCCGGAGCAGTTGAACAACCATCCAAATCCATCT
TAATCGATAAAGATCGAGAACTAAATTCCGAATCGGATATGAGTAAAGCC
GATTTGGATCGCATGGTACCTGAATCACCGTCTGTTTCTACTGATAGTTC
GCTATCTAAAGGAAGCGCGAAAAATGTCTCTTTCTCCGACGACGCCACGA
TGGATGACATTCCCGACATGACGTACGACGAGTCGCTAGATTCTCTTTAT
TCGTCATCTTTCGAATCATTATATAGCGACCGTTCCGTCACTATTTTAGC
TGCTTTGAAGAATCAAAAAATCGATACAAACAGTTTATTTAATTCGTCAT
TCGAGTCTTTATTAAGTGAGAAGAGTATTTCTTATTTGTtggatttagaa
aaacattggGCACGACCCGAGGGTGGACTTACACCCCTGGCAAATAAAAG
GGGTGTGTCGTCACAATCACCTGCATCGGCACGCTCTGATCGTCAGAGTA
CAATCAGGCCACGTCGATCGTTATCGCTAAATAAAAAAGACGCTTTGAGA
AGGATGAATCAATTATCAATCGACTCCGATAATTGGCCGACTCCACCCTT
ATCGACTGCTGGTAGCGAAGGAGGCGGTAGCCTTACCAGACAGAGTACCT
TTGATTCTGACAGCGGCTGGCCGGAGCCGCCACCTTCTGACGGTCGCAAT
AGCGCCGCTTCAACCGAATGGCCTGAACCCCCCATCGATATTTTACCACC
GCCCGATTATCCTATGCTAATTAGCTCAGCGCGAAGTCGTGCTTTTTCTG
ATATCGAAGAATCGCCTTTTGAAAATGTATTATCGCCGTCTAAAGAGAAA
GCACTTTTACCGCTTttcgagaaaaagaaaaaggaatggGAACTAGAAGC
TGAAAACGATTTCAAATTTAAGGATACTTCGAAATTTAACGGTGATACAC
TGGAACGACCAAAACTAAACGGAAATGTAAGCGATTACGAATTTAACGAC
ACTCTTGACCGTAAATTTATGGAGAAACTAGAACAAAAGTATAACGAAGA
CTCGCTCGATCGTAAATTCCCAGAGCCGTTTAGTAATGAGACTCCAACTA
AGAAAACCATCAATATCGGCACAGATTCACCTTCGAAGATTTACGAATCT
AAAGAAACACAATATGAATCAACGACTCAatttaaatcaactgaaactCA
ATATAACACTTGGGACAAACCTGATAAGGCATTTCTAGAGGCGTTAAGAG
AAGGGCGGACTGAGTATTTGGATGAGAATAATATAACGCCCACGCCCATA
CGGAAGGTACTTGATGAGAAACCATTTGATAGCGATTTGTTCAAGCTAGA
TTTTACAGATGTTGAGGGTGAAACATCACGTGAAACCACGCCACGGCAAA
TGACAATGACTAATGGTGGCATGGTCACACGCGCTGAACCAGTCGAAAGT
AAAAAACGTAGACCATGGCCATTTCGTTCGAAGAAAAGTTCTGAGAAAAC
AAAATCGAATAAGAATCCGTCTACGAATCATGATGATTCGTGTCATAATA
ACTGTGACAGTATACCAAACAATAACACATGGTCACACTCACTGAACTCC
GATAAAgatgaaattgaaaaccaaTATAATAAAGAGAGTGATACCAATCA
TGTAAATAATCATGTGGAAAACCATGTGGCCAATAATCATCACGGCATCA
ACAGGTCCAAAAGTATGGAGGAAAGCGCCTTCAAGAAAAATGATATATAC
GAACATGTAAACAAcaataatcaccatggtaaccATATCAATAATCATGA
TGGTGGCATGAGTAATGGTATCTATGAGCGCGTGACTCTGACCAATGGAT
TTAAGCATCGTGATTGTTTAAGCGAGGCCAAAATATATGAACCAATTTCG
TTTGCTAATAAAGGTAAAGCTAAAAGTGATAACCATTTAACGTGTAGATA
TAAATCGGTGGGTTGTCTAGCTCATAGTGAAAGCGAAAGTGACTGTCTGA
ACCATAACGATGAAGCTGTCAATCACCACATGTATTTATTATTGAACAAA
GTTGAATATTTAACTGGTGAAgtaaaacatttgaaacagAAAGTCAAAAC
ATTGGAAACTGACTGAGACTaagtattctttaataaatgGTATTGTACTA
AAACACTATTTTATCATCATTTGTTAAACAGACAAAGCTGTTTGGTTATT
TTTAACTACCTAATTAAATTTTTGTaacaaaaaacaattataattttaat
tCTGGCGTGTTGGATATGAAAATATATGCAATGAGTTTAAATTTATATTG
AAACGCAACCCCAATGAAATTCCATAttccaatagacgatatcgcgttta
gataaatgcaatgcattctggtttctcggggaccctcaagggaattataa
tctattccaGATCATTATGTAATCGACATTAtcattcctttgagagtccc
cgagaaaccagaatgcattgcatttatctaaacgcaATATCGTCTATTG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00024953-exon-sc0000514-1491911889:90229..90381 | TCONS_00024953-exon-sc0000514-1491911889:90229..90381 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00024953-exon-sc0000514-1510915933:90229..90381 | TCONS_00024953-exon-sc0000514-1510915933:90229..90381 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00024953-exon-sc0000514-1575043694:90229..90381 | TCONS_00024953-exon-sc0000514-1575043694:90229..90381 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00024953-exon-sc0000514-1491911889:99492..102577 | TCONS_00024953-exon-sc0000514-1491911889:99492..102577 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00024953-exon-sc0000514-1510915933:99492..102577 | TCONS_00024953-exon-sc0000514-1510915933:99492..102577 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00024953-exon-sc0000514-1575043694:99492..102577 | TCONS_00024953-exon-sc0000514-1575043694:99492..102577 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000514 | supercontig | sc0000514:90229..102577 + |
Blast
BLAST of TCONS_00024953 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: TS101 (Tumor susceptibility gene 101 protein OS=Homo sapiens GN=TSG101 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 104.375 bits (259), Expect = 1.646e-23 Identity = 46/121 (38.02%), Postives = 76/121 (62.81%), Query Frame = 1
Query: 274 DIMQVLHAFQDLHPKIERCAHTKGGRTEELLTLRGTVPIEFKSATYNIPIQIYTLRTHPKQAPVVFVKPLKNMVIRESKNVDKSGLVYLRYLVDWKSPRSNTLALCKLLSRTFSEECPVFT 636
+ + V+ ++DL P ++ G + EL+ L GT+P+ ++ TYNIPI ++ L T+P P+ FVKP +M I+ K+VD +G +YL YL +WK P+S+ L L +++ F +E PVF+
Sbjct: 24 ETVNVITLYKDLKPVLDSYVFNDGS-SRELMNLTGTIPVPYRGNTYNIPICLWLLDTYPYNPPICFVKPTSSMTIKTGKHVDANGKIYLPYLHEWKHPQSDLLGLIQVMIVVFGDEPPVFS 143
The following BLAST results are available for this feature:
|
