TCONS_00024149 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00024149
Unique Name	TCONS_00024149
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1287

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000476:175743..189255-
coding sequence from alignment at sc0000476:175743..189255-

transcript sequence

>TCONS_00024149 ID=TCONS_00024149|Name=TCONS_00024149|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1287bp
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ATtcagatgaaaaaataaaaaacgagaGATAAAACAAACACACTTTCTTA
ATCACTGAAAGATGATCAACTGGTATCAAAATGTCAATCATTGGACGTTG
TGAAGCATTTCGTCCCGGTGTGTCTCCTAAGTATACCCATAATGAAGATG
TCGTTGCAAAAGTTGGTCTAGCTTCCGCGTCACTTAcaCTGGTCTCCACA
CTCAGTATTGTTTGTTTCATCCTTTGTAAACACATCCAGTCTAATGTTCA
AGTCAAGCCTCTACTCCATCTGTCCATCGCAGACTTTTTGTTAGCCTTTG
CATGGGTGTCAGCCAACACTGCTTATCTGGTGAAAAATGATTTCGAAGAT
GTTCAACAAACTGCGATGTCTTGTTTCACATGGCAGTTGATCACAGAGat
CATTCACATTGTGACATTTTGTTTCACCATCAATTATTCGATTAACGTCT
ACTTCCTCATGAAGGATCGTGTTCGTAGCATGGGTATGGATTACACTGAG
CAAGTTCACgaaatGGCAAGTTTATCGGCGATCCGTTTACAACGCTTCAA
AAGTCTTTTATATTACATTTCTTGGTTGATGCCAATTATTTTGATGTTAC
CAATTATCATCGAATCGAAAATGGAAAACATAAGCTCTTGTCAAAAATGC
GTGATAGCAATAGACGTACCAAGACTAGTTAATAAAGTTCCGCCATTTAT
AAAAGCTTACGGATTTATCTTACTGGCTGCCACCCTTTTGTTGTCAATGG
TTACCATTATGGTTTTATATGGTTTAACCTTGAGGTTATACTGGCGAGCT
ATTCCAGCGTACCATACAGATCGTCAACGACGTCAGCTATCGAACATGAA
AAAGAGAATCAGCGTTTATGTGGTGGTGTTCATGGTGTGCTGGCTACCCG
CCTTGATTCTGTCGATCATGAAAAGCAGAGAGGTGTGGCTAGATGTGGAA
CACAAGAAAGTAGATTTGAATGATTATTTCGCATTGTACATCCTCCAGGC
TGTGTTGACGCCGTTACAGGGATTCTTTAACACGATCGTTTACGGATGGT
CACGGCGTTCTTTCCGTGAAGCTACCCGTCAATCCCTTTCTTCAAGTCAA
ATGTTCGTACCTACACCCGAATTCACGTCGGCGTATTACGATCAATCGCC
CGATTTCCCGAATTACATTGATGATGAACCCGAATCGGAAACAGCTTTTG
ATCCAGCTACGAAAAGTAAGAAACAAGACAGTAATGA

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00024149-protein

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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000476:175743..189255-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

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>TCONS_00024149 ID=TCONS_00024149|Name=TCONS_00024149|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13513bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000476:175743..189255- (Clytia hemisphaerica)
CCTGGTCCTAGAATCGATTCGGAAGATAATTTCAGCCAGCTTCTAAACTC
ATTCAGATGAAAAAATAAAAAACGAGAGATAAAACAAACACACTTTCTTA
ATCACTGAAAGATGATCAACTGGTATCAAAATGTCAATCATTGGACGTTG
TGAAGCATTTCGTCCCGGTGTGTCTCCTAAGTATACCCATAATGTAAGTT
TTCTTTCCATGCTTTTCTTGTTTGTTCCCTAAACCGTCTGAGAACTTATC
CATTAACCGCTATAATATTTTAAGCTTTTTGACTCAGGAAATGATACACC
CTAGATACACACCTGGTGTGTCTCCGTTGGACGGCTCATACCCACTGGAG
AAATATCTTTGTTTTAAGTGGATGGGAATAGAGTAAGGTTGACAAGATTT
TATCATTTTAACCATCATAATATGCTGAGAACTTCGGTTCTTAGAGCACT
CTTTAAAACTATGTTGAGGAGCAAGCTCTGCTTCTCCTTTCACCATAAGC
GATTATGCGAAGCTCAACTGTTAGTGTTTTGAACACTCTGGTGACAACAG
CAGTCTATGCTCGCTTACCTGAGCCGCGCTGACGAGTCCTGGGACGGACG
AAACACGTGTCTGCGGTAATATATAACCATCATACGTATTATACTTTCAT
ACAATACAGGAAGATGTCGTTGCAAAAGTTGGTCTAGCTTCCGCGTCACT
TACGTAAGTTTTTTTATTTTATCTCTACCCTGGATTTCCATTTCCTTACG
TTGGAATTGGATGATTAACATCTGGTGCGCCAAGCTGAGCAGAATCTCTT
ACAGTATCGAGCCATGACTTTTAGAGTGAACACGTGCCCTGCGTGAAGTA
TCAGAATCTGTTCCAGGCTATATTCTCAGCGTTATTGGAATATTTTTGAG
CTTTTTCTAAGAGCCTGAGATCCTGAGGTCTTAATTCTTAAGTCGAATCT
TAAAACTCAGAGTTAAAACTCTACTTTCAAAGCACTTAAGAATCATTTGC
GGTTTTAAAGTTTTGAGGGAATGTCCCTTTTGTGTCAAATATTTCGGCGC
CGATTGTAGAGATCATAGTGCCATGAGAACTAAGTCTGTAAACCAAAATG
GGGTGCCAAACAGGGAACTTTCTAGGTCCGCATTATGTGACTTTCCAATG
AACAGGTAGTCAGTTTTATTTGAAACCTCGGAAACTAAAGAGATCGATAT
CAAGGAGGCTTAACAACACTTCATTTCGACCAGACTTTGCATTGCTAATA
CGTAAGACAGGAAATTGATATTGAGACAGGGAGCTCTTCTTCCATCTCAT
TTTCACAGGTTTCTATCGCATTCCTGCAATGCGGAATATAATGTAATCTG
CATCTCCCAAGCATTTTTGGTGTCCCTTAGTTGAAAAATATGTTTAAAGT
TGAAGAATTAGGTCGCCTCCAATCCTGTTTGTTAACATTTGTAATACATT
ATGTAATGCAGTATTAATTTATACATTAGTAGCGACCGTAGTGCAGTGGT
AGAGTATCCGGCTACGGTGCGCAAGGTTATGGGTTCCACCCTCAGCCGGG
TCACACCAAAGATTCCCAAAATGGTACTTGATGCCGCTCTGCTTGATGCT
CAACAATTAAGAGACGGACCAAGGGTAAGTGGAGCAATCCAGGGAGAAAG
AGTGACGCCCACCCCTACGCTCCGGTACGTTCGGGTAGATAGCTATCGAA
AGAGTAGCCTTCGTGACGCCTCCGGCTGCGCTCGCAGACTTACTATGTCA
TACATTTGTCACATTCAAGAAACGAAAAACTTTAGTATAGTGTCTGCGTT
ATAGACATTCCGGGCCACTAGCCCGAACTAGGATTTCTGAATTGGGAAGA
ATTTCCCGAACTGGCAGGAATTTCCCGAATTGGCAGAACTAAAGAGAAGT
TCTTCTTGATTAGGTTCCCGTCCACGTTGATTTTAGTGCACAGCGTGGCT
TCAGCTTCCCGTTCGGCCAGATTCAGAAGATTTTGGACAAATAGGATCTC
AGGATCTAAAAGCTCAAAAATGTTGTTTGGCAAACATGGTTTAAAAGCAC
TGAAATGGGGAAAACGAAATTCCTTAGACACCCTGAATTTAGGTAATTAA
TGTTAACTTTAGTTATAATCTGAAACGGGTAGTAGTAAAAGAAGTATCAA
TATCGACAGGCTTAACAACACCTCATTCCGAAGACGAATGATGGTAATGA
TGCGAAAGAAATGATACCTAGAAACTCCCTTCAAACAATGCGGAACATAC
ACCTTCACTCACATTATTTTATGTCCTTTTTATGTACAACAAACGTCTTT
TTAACATCCCATTTCTTACATAAATGATTTAAGAATCTTTAGTTATGTAA
GGCTTAGTTTTAGTTTCTGGGAAATACAATAACAATTCTATCGTAAATTT
TTTTCTCCATCCCATCTATTCTACGCTAGTATCAAGAAACTTTCTATCGT
TATCCAATAAGCTTGTCTAATGAGAAGAAGTTTCACAAGAGTTAGCAATG
CTTTCATAACCTTTTCGTCTCGACATAAAGATCACGAGACCTAACCAGTT
ATTGCAACAATAAATCCATGTTGCAACCTACTGAAAATTCAAAGTATGGT
ACAGTCAAAATTACAACATTGTTCAAGGGGCTAGAGCTATTGAAGCGCGC
GTAAAAATCATCCCATTTAAAATCAATTTTTGACCGTTTTGGCCGTACTA
AAACAACAATTCGACAAAAAATCCGATTAAACGGAGAAGAAAAAATAATA
GTTCATAATCGCACTACGAAGACTAAAATTTATATATCTACATATTATTA
TTTTTCTGTTTTAGACTGGTCTCCACACTCAGTATTGTTTGTTTCATCCT
TTGTAAACACATCCAGTCTAATGTTCAAGTCAAGCCTCTACTCCATCTGT
CCATCGCAGACTTTTTGTTAGCCTTTGCATGGGTGTCAGCCAACACTGCT
TATCTGGTGAAAAATGATTTCGAAGATGTTCAACAAACTGCGATGTCTTG
TTTCACATGGCAGTTGATCACAGAGGTATTTAGTTTTCGAATTCCAGTTC
CCACTTGCAGCTCCTTTAAATTATATGATGTCCTCCGTACGTCTGTCCTG
CTACTCTATAACTCGAACCTCTTCGGGGAACATAAATTTGTTCGAGTTAA
GGAAATTTCGAATAATGGAGTAAGGCTTAAAAGGCATTGTTAACTGACTG
AAGGGACCATAAAACGTGTTCGAGTTAAGAAGACATTTTGAGAAGACACA
TTTGAGTTATAGAAGTTCGAGTTATAGAGGTTCTACTGTATCACTTTTCC
GAAAAAGTTTCCTGAAATATTTTAAAGTTGTATCACCTTAAATACAATAC
CAAAGTTTTGCAATTTTCGCAAATAGATAATAATGCTGCTTCAATATGGC
AAAAGCCCTGCACAATAGATAGTAAAGTTGAAACCAGGTGACAAAACTTT
CAAAAAAATACTTATAAGTCTGTATTAAAAGGAAGTACTTGCACCGGGTG
TGGCCGGAGTCGGTAGAGCATTAAAGCGGTAAAGCCTTACAATCCAAGGG
TTGTTGGTTCGAACCCTGGTCACCGCCAACCTCAGGGAATGAGTAGCTTA
GATTGGGTAGTCTGATCTTAGCGGTAATTAGCGCCCAGGTCTAGCGCAAA
TAGAAAAGAGGATAGATTCCACCAACAACCACCAGATAAATATTATACTT
ACTTATATGTCCTTCTTCTTTTTCTTTCAGATCATTCACATTGTGACATT
TTGTTTCACCATCAATTATTCGATTAACGTCTACTTCCTCATGAAGGATC
GTGTTCGTAGCATGGGTATGGATTACACTGAGCAAGTTCACGTAAGATTA
TCACCAAAAACTACAGCTAGCTCGAAAATTTACACTTCAAAATTTCTATA
ACTACTTTATCCCAGCCCTCTCTCGTATGAACCTCGACACTTAATGTGTT
CGTCTAGCTCCGAAGGGGCTAGAGTTTAATCTCTTGGACGGGAAATAAAG
CCATTTGTCCCCATTCAAATCGTGTAACCTGCGTCATTTCACACAAATGC
CTNATCTCTTGGACGGGAAATGAAGCCATTTTTCCCCATTCAAATCGTGT
AACCTGCGTCATTTCACACAAACGCCGGATTGAAAGTAAAATATATCACC
AGATTTCGAATATTATGCCACGTGAAAACAAAGAGAACGCTAGAATCAAT
CCGTCATTCAAAACCCAGCGCAAAGCTTAAGGCTTAACTTGTTCATTCTT
AAAAAAGGTAGAAGATTTCTTCTCTAGCCCTTTGATTTTTAAACTCGATG
TTGGAGTCCTTGTTTGTTTACAACATGAATATTGTTCACCTTGTGTTTTG
TATTTTTCAGGAAATGGCAAGTTTATCGGCGATCCGTTTACAACGCTTCA
AAAGTCTTTTATATTACATTTCTTGGTAAATATTATTTGCGTTTATTAAA
TAATTCTCGTTTTTTGAGAGAAATGACTAAAATTTCCATAAATAAGACTT
CATTTTTCCCGATAAGGTACATCTCTAATGGACAAAATGATTCGAATTAC
CATATCCATATGGTTACAGGGCTTGGGTCATATTTCGCACATCATTATCT
TAGATTCAAAAAGAACACTATGGCTTTGCTCATCAAAGAATAGTATTGTG
CGTTCAGTAAACAAAAAGAAATTTAGTGAGTGAGATCACTTGAAATATTT
AAAACCTTATTATTGAATGAGAATGCGTAGTGGTATAGTGGTTATCATCC
TTGACTCCCGCTTGAGAGGCCCGAGTTCGATACCCACCGTGTCTCTACGA
TTCACTTGGCAAGTGAATATACCTTCGCCCGGGTCAACCCATTCCATGTG
AGGGAAATTGGGTACCATTACTCTGATACAAGAGTGTGGGTAGATTAGAC
AGACATTGTGATGTGCCGTGGCACTCATAAGCTTCGGCCTCGCGCGAGCA
TCGCTCTCCCAGTGTCGTTCGAGTGCCATTGTATAAGCCATTGGCAGCTC
GAGCCTGTCAAGTCGCAGTGTCTTTCAGCGCCGTGATTCCTACTCCTTCG
TGAGTAGAACCCATCCCGAATGCATTCGAAGGACTCATATCTATCTATCT
ATTGAATGAGAAGTATTTCACATGACTTTTGATAGCGAGGAACAGATTTT
TTAAAAGATTTTCATTTTATTGTTATTCAGGTTGATGCCAATTATTTTGA
TGTTACCAATTATCATCGAATCGAAAATGGAAAACATAAGCTCTTGTCAA
AAGTAAGTAAGTTGATTATCTCAAATTTCCTGGAGACATTAATTAGTCCA
AAGGGAAGGCCATTCCATTTTATCTCCATTTTATCTCCATAATACAGGGG
GTAGGATGAACATTTCCAGGGGGTAACCCGAGAAGAATTTCCAGGGGGTC
TATAGGAATGTTTTTCATTTTTACCCGGGGGGTAAAAAGTTATTCTAAAA
TTTCAAGGGGGTAAAGACAGGTTTTAGTTCGGCCGCCGTCTCCGTTAAAG
TATGCAAAGGCTTTCCAAGGGTTTTTTTTTGCAAATTTAGCCCTTTTCCA
ACGGGAAATCCTCACATTTCTAAGAATTTTATTTTGACTTGGAAAGGTTC
GTCCACCCCCTGTATGGATATTTAATGGAACAGTCCAATGCAACGATTGA
TGGTGCTTCAGCCTTAATTTTGTTGAAAGTACAGTTTTATAAATGGGTTT
AGGAAGGCTACTCAATATCTTATCGACCAAATGATTCGTCGTCAAAAGAA
ATTCGTTGGTAAAAAGTGACGAAATTTTTTAACAATTGAGGAAAATAATC
GCAGACGCATTTTTTCACTAGATGTGTATTTTTCCTCGTTTTCAGATGCG
TGATAGCAATAGACGTACCAAGACTAGTTGTAAGTCAACCTTTCTCTTTC
ATTTTTATATTTCTACACAATACTTGTCGTTTTGTCTTCAAAATATAAAA
ACAAATCTTTGCAAAAAATCAACTTCTGAGTTCAGTTAGCCATCCAAACA
TTTTGTTGATACTTTTTCAACTCCTTTTCTGAAATTTGAACCTTTATGAA
TTTTTCAGTAATTTTTAAGGCAATTGTTTGGGGGCAAAAATAATGTGTAT
GAATCTTGATTAAATAGGAGCTATAAGTATTAGAACAGTGTTTGAGTAAA
ATAAATTTACGGAATTCAATGTATTATATACACAGTTATCTTATCAGTTA
TCTAATCAATAATAAAATCAATCAATTATTTAATACCCAATCTCGGTGAC
TCAGCACAAAAATTTTGAAAAATGTGAATAGCAATTCACATTATGGGGAT
TATACAGTGGAGTCTCCATAACTCGAACATGCACGGGGAATATAAATGTG
TTCGAGTTAAGGAGACATTCGAGTCATAGAGGTTCGAGTTAAAGAGAATC
CACTGTAATAATGTATAATAATACGTATAATTTATAAATTCTTAATGTTA
TTATTTAAAAGGATTACTTTCATACCTTTTTGTGCCACTTTATCGTACCA
TTTTTATACACATTAAGAAAAACACAAAAATAATGTCAACAGAGTCTGCA
TTTTTCATGATGCTCTGCGCATGTGCACAAAAACTGTATATTAATTTGTT
AAGCGGAACTGTTTTTCAAGTCTGATTTCAGGAAACTGAAGTATTTTTTT
TTAGTTTTGAACAACCTTGAAGTATATCATAGTCCATACTCTCCCATATT
ATGGGTAATCGTTTTTTATAAGCCATGTTGAAAATGTCTCAGTCAGCCGG
TGAGACTTCTTTATCCAGTGTGGGTGAATTGACTTAGCTTAATGGTACAG
GAGTGATAAAACTTTAAATGGGCCGGGGTTTAGAATTTTGATTTGTCTAC
AGCTCAAAAATCTAATTATTTTAGTGTTTTCCTTACACTGATATTTCATT
TGTAGTTTTGGAACGAATTTCAGTTTTTACATTCTCACCAGAGACGAATT
TTTCGAGTAATACAATTATGTTTCATTAACAAAACGCACATGGTAAGAAG
GCCATGGTGGATAGACTGCAAACTATATGGGATTCTCATAAAAATATTTG
ATGTTTATTTTATACATTCTATACCCACCAGCTTTTCAAACCAGTTGATT
TCGGTGGTATTTTTGCATTAACTCGATAAGTCAAACGATGTTTCACGTTG
ACAATAGCTGCCACAAAGGTGCTCGTGAATAGATAACCGAGAAAAATCAA
TATGATGGGCACCGCAATGTGTTGTGGTTTCTCGGTAAAAGAGTCTGGGA
TCAAGTTTTCGTCAGACATAGTAGTCAACAACATCAACCATTTGAAACTA
TGGCTTTGGAATGTGACACCCGCCCGGGCATATCCTGTAGTCACTCCCGC
GCAGAATAAAATGTAGAGCCCTACAAGGGCGGTAGCCGCCAACAGGACTT
CGTATTTCAGCGATTCTTTACGGTGACGTCGGAGTCTCGCTCGTAATTTT
CGAAATCCGAAATTGAGTAAATTCACCCCGATAAATCCGATAAGTGTGTA
TAATCGGGTTGCCAAGATAATCCCGAAAACGATAGCTGGACCAAAAACGG
ATTGGCCGCCAGTTGAGCGCAAGTGAAGGAACAGCGTGTCTGAAATATTT
CAAAAAGGAAATTGTTTAAAGCGTTTCACATACTTAGGTACTACGTATCT
TCCTTAGAAATACGTAACGTCGTGACGGGACCTAAACCTAAACGGACTTG
TTTAACTTTAAACTGGACTAAAACTTGACACACTTTCAGGAATTCTATAT
GCAGATAGCCTTTCTATCTTAAAAAACTATTTTGCTATATCTGGAACGTG
TCAGAGCGTTATTTTTATAAGATTTTGTTAATAAAGCTCACCCGCGCCGT
GGAAATGCGCCACTGTGAAATAAATCCATTTCATAACCGTCATCGACTTC
AAACTGCATTTCGTCGTGCCGTCAATGATGTCGTTTGTTGTCGTCGTTTT
CATTTCACTTGGTGGAGTACATTTCGTGATGTCAGCTACACCACCCTTCT
CTCCGTTATTGCTTTCCTTGTTGCCATGGTCGTGGATACCATTCCCAACG
TGTGTTTGAACGGTTGTACAATTTTGACGTTGTGCTGCCGCCGGTGTTTG
AACCTTGTTTTGAGACATACTATTTGATTTTGAATCATGGTTTTTATGAT
CACTCAGACATTGCTCAGTTGAGAAAAATACGACGCTTGCAACTATGGTG
TAGACTAAGAATATGAAGTAGAACTTGATGACTTTGGACCATGGGAATAA
GTTCAGGAATTCTCGTATGTTCATTGTACGTTGAACTAAGTTTTCTTTGT
CGGATGCCGTCATTTTGTCGTTCCACGGTATATTTGTTGATTGTTGTGAA
CGTTTTTTAAATTGACTTTAACCACTTGTTATTGCACGCAAAGGTTATAT
TTCGTCCTTCGATTCCGATTAAGAATGGTGTCGATATAGGTGTTTCGCCA
CACGTCTGCTTTGCCGTTTTATGATAATATGATTTCAATCGCCATACGTC
CTGTTATTTTTGCTCGAATCTTTTTCTGAAATTTTGTTAAACTACCATCG
AAACAGAAGCTTACCAATAAGAAAAAATGTGGAGATTGTGTTCATCGATA
TTTGTTGAACTACGTACTAATGTAAATATCCTTTATCCTCAAAGCTGGTG
ATTTCGTTTTTTTTCTTCTTTTGAAATTCACCAAAATATTTCCCATAAAG
CCTTGCAAGATTGATTTTGTCTTGTGAACTAAAAAAAAAATCAAATTTAG
AAATTGGTTTTCATGAAATATTGAAAAAATCCAAATGAAATTTAGCAAAA
TGCATTGATAAAGTAAAATTTACTTTGCAAAACGAAAACAAAACACCAAT
ACATGGTNATTGTGTTCATCGATATTTGTTGAACTACGTACTGAAATAAA
TATCCCTTTATCCTCAAAGCTGGCGATTTCGTTTTTTTCTTCTTTTGAAA
TTCACCAAAATATTTCCCATAAAGCCTTGCAAGATTGATTTTGTCTTGTG
AACTAAAAAAAATCAAATTTAGAAATTGGTTTTCATGAAATATTGAAAAA
ATCTAAATGAAATTTAGCAAAATGCATTGATAAAGTAAAATTTACTTTAC
AAAACGAAAACAAAACACCAATACATGTCGTATAAAACATTCCCAGCCCA
AAAAAGTTATAAGAACGTTTTTTTTTCTTTTTGCTTTTTTCCATCAAATT
AACCAGCGTTGTTTAAAAAATATAATACAAGCGTTTTTGAGCTAGAAAGA
ATACTGAATGAATTCAAATCCAACTCTGTTAGTTTTTAACTCAATTTGGC
TCCAAGCCGATCCTTCCCCAATTTACTCCGTTTTTATAAAACCTGAATGA
ATAGAGTTTCTCTATGCAGAAAAATAATATTATTCAAAACGACATCAAAA
ATTTAATTTAATATTTTGATATATTCTATCGAATAGTCTGATTTACTAAA
TATTTATGAGATTTTAAGAAAACATTTTTTATTAGCATTGCTAATAAACT
TCCGAAACGATATAAGGGCAAGTGAAAACTTTTTGTTAATACCTTGGTTT
CTTATAACAAGTGACAAAGCTTCCCTTGGTTGAAGCATGGAGAAAAAATA
AAGGAAAATTATTGAATTTTTGGAGAATAAGCTAATCAACAGAGCATTGA
TTTTAAAGCTCCGAAGAAGCTAGATCCGAAACTCCTGGATGGGAAATGAA
GCCACTTATTTTTCCCATCCAGAACCCGTGTGTTTTTCAAACAAAATTTC
TAAATGCGGGGAAAACTTAAGGCTTCACTTTTTCTTGATTGAGAAAGGTT
CATCTCTATTCCCTTCGAGGATTCTAATTCAATACAGGCTAGTTAGTCCC
TTTACTAGACAAAACTCCCCTTTCATCTATGGTGTTTCTTGCTTTCATTT
TCAGCATTTTAGACACCCCCTTCTCACAGACCCACTGGGAACCCTTCACA
CTGGAAAAATTGGCAAAAATATCATCCCAGTGGAAAATTACCCTCTAATT
TTTGTTCCCGCTGAAAATAATTGGATAAGCACTGCAAAATGTTGTGCTAT
TTTTTCGATCCCCGCTGAATTTTCTGGCTGAATTTTCTGGCTAGAAAACA
ATGGAATTCAAGTCTTCAGCCATAAAAACACGGGAATATCAATACCCATC
GAGTTTTTGTCCGTTGTTTTTGCCCCCACTCGCTGATAAAATCCCACCGG
GTCTGTGAGAAGGGGGTGTTTTTAGTGATTGAGATATTTGCCGGTTAAAA
TAGCCTGTGTTGATCACTTCATAACCAAAACTTTGTCTTCATTAGAGAGA
TATCATTATGCATTTTCTTTGCAAACCCCTTCCAACTATTTCAAGTCTGA
TTTTTTTCTACAGAGAAAGATCTTTGCAAAGTTAGAGTACACGCTTTTTT
ATAAGAACCATTTTTTGACTCAGACTGGGCTGTTCTTAATTTTTTTGAAA
TTTTCAGACTTATTTGTTCTTACGATGTTCTTACGATGTTCTTACTATGC
TTAGTTTCTTTACTTAAAATCTGTTAAAATCAATACTTAGTGATTTTTAA
AATCTGAGGCTCAGATTGTTCTTAATTGATTCTTAGGTTTTGGGCAATTT
TCAGCCTCATGTTCTTATAAAAAATGCGTGTAAGTTGAATCACGTAACTT
AAAACTTATAGTATCTCTTTAGTTAGTTTCGGGCTATGAATTCAAAGAAA
TTCTAAACAATTTGAAAAGTTTATCTTAAAGTTCTTTCAATTGATTTTAC
AAAGAACATGTCTTCGTTTGAAAATAAGGTTTTTCCAAAAATTTTAAGCT
GATAAAATAACTTTAAACATGCTTGTCTGATAGCTGAGTCGCCATCTCGA
CTCAGAAACCCAGTGTTATTAAAATGAATTTAACCACCATTGCTTATTCA
CAATATTTGCATTTTCTTTTCCAACAGAATAAAGTTCCGCCATTTATAAA
AGCTTACGGATTTATCTTACTGGCTGCCACCCTTTTGTTGTCAATGGTTA
CCATTATGGTATGTTCGTTTTACTCACGGAGGTTTTTCCCTCAGCAAAAT
GTAGCTTGACGTGTGCAGTATCTCTTTTGACCTTCTCCTTATTATTTAGG
CTGTCAATTTAGACTTTAATTCAAAAGACAAAATACCCGAACTTTAGTTT
AATCCTCATTTTTTCACATAGTGTTGGTTAAAACTAAGCCAAATGAAATT
TTCTTCGGAACTTAAAAAATCCTTTCAAGATTAATGTTATTTTTGGAGCA
ATCCAGGAAGAAAGAGTGGCGCTCTCTCCTACCATCGGGTGGATGGCTAT
CGAAAAGAGAGCATTTAGATTCACATCTTACTAACCTTGCTGACCTACTT
ATTTCTCTTTTAAGGTTTTATATGGTTTAACCTTGAGGTTATACTGGCGA
GCTATTCCAGGTGATTATATTATTTTCTGTTTTTGTTTATTTATCCTTAA
TTTCTAATTTAAGTTTGAGACCAATTTTCATTATGTACTACAGTAGACTC
TCGCTTATTCGAACTTCTATTATTCGAACTTTTCCATAATTCGAACTTTC
CCCGTCCCCATCAAGGAGAGACCCTCTTGAAATACTTTCTATAATCTCTG
CGCAATTCGAACAAAAAGATTTCCCGTGAGTGTACTGTACTCCTTTACAG
ATTTAAAGAATGGGCTTTTCTTGCCAAAAGTTTCATACACAAGGCTTTTC
TTCAGAGGGTTTCGACGAATCAGGGCTGGCATTTTGTTTGGGAATTTACG
ATTCAATGAATTATTACGGGTTGGGAGGAGGAGGTAATTTATTGTGCTTT
CACGATCATTCCTGGAAAGTGCCTAGATCACTTTCCCAGGGAATTTAGAA
AAACTTAGCCGTATTTTTTTGCGGGTATTCAAACTTTATATTTTGGGTAT
TCTTATCGTGCCGAAGATTGATTACTTAAGAAATTGTTCACTAATACCTT
CAGAAAGTAAATATCTGAAAATTTTGAATGTTTTATAAACATTTTTTCAG
CGTACCATACAGATCGTCAACGACGTCAGCTATCGAACATGAAAAAGAGA
ATCAGCGTTTATGTGGTGGTGTTCATGGTGTGCTGGCTACCCGGTAAGTA
TACCTTGTACCCAGTCCCTACCCAGTGCTCGCTTTTTATGGTTTTGATAT
TGCTCAGGAAATAGCACAACGTCCACCTATTGAACCAAAAATTGGTCCAC
GTTACTCTGGGTGATATCCAAGTAATTCGAAGAAATATGTTGTATTGGGC
TCCACTAGAAAAAGTTGTAAACCAAAGTGGTTAAAATATGATTTTTTCAA
AAATGTTCCATTCCTGTGAAAGTCTATCTATTCCCTACAGTAGACATGAA
TTACTCTTTGGTGAATTTACCCCCTTTTCTTCAACCTGGTCATGACAGAT
TCAACTCTGGACAAAGCTATCAGCCCTATTGAAAAATGTACTCTTTTTTA
TTCGAACCCCTTTTTCTACTGTTTTACATTTCTTGCTTAATTTTTGAAAC
TTCCTTTCCTATTAGCCTTGATTCTGTCGATCATGAAAAGCAGAGAGGTG
TGGCTAGATGTGGAACACAAGAAAGTAGATTTGAATGATTATTTCGCATT
GTACATCCTCCAGGTGAGTTTCAGCCCTGCTCTGCTGCATTTTTAGGCAG
ACTCATCCTAAATTCTCGAAATTGACAAGTGCTATGACCTTTGAAATTTT
GATATGCTACTCGGATTACTTTAGGCGGACAAACTTTCGCGAGCAGAAAC
TTTTGCAAGGTCGAAAAATCGCGAAATTCACGACATTTACTTTCGTGAAT
TTGACAAAAAAAAATTTCGCGAGCATAAGCTTTCGCAAATTAGGTATATT
TTAAGTAGAAAATTCAAGTTTTCGGTACATAAAACCATTGTTTTGATCGT
TCAAATGTACTCTTTTGCATAATTTCTACACTAAATTTTGATTGGTTGGT
TTGTTATTGCGCTGTTTTAGGGTAAAAGGACAATTTGAATTTCACCTAGT
CTATAAAATACTCGATACTTTGTACTCTTTTTGAAAATAATATTTTCGAG
GGTGAACAAAAGTTGCTTTATCATTTCAAAGCTATTATCATTTGTAAGAT
AACACTCATTTTTCTGGGGTGGAATTTTCCGAAGCTCATTTTCAACTAGC
TGTGAGTTTTGGCCTTTTTTCCACTGGAGAATGGTAGAGGAAATTTAGTG
CGAGGCTAAGTGCAATCATACACGACGGTACAAAAAGGGTTAAAATTTTC
TGTTTCCTTTTTTTCTGTTAATAGGCTGTGTTGACGCCGTTACAGGGATT
CTTTAACACGATCGTTTACGGATGGTCACGGCGTTCTTTCCGTGAAGCTA
CCCGTCAATCCCTTTCTTCAAGTCAAATGTTCGTACCTACACCCGAATTC
ACGTCGGCGTATTACGATCAATCGCCCGATTTCCCGAATTACATTGATGA
TGAACCCGAATCGGAAACAGCTTTTGATCCAGCTACGAAAAGTAAGAAAC
AAGACAGTAATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000476:175743..189255-

>TCONS_00024149 ID=TCONS_00024149|Name=TCONS_00024149|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=13860bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000476:175743..189255- (Clytia hemisphaerica)
GCTGTGTTGACGCCGTTACAGGGATTCTTTAACACGATCGTTTACGGATG
GTCACGGCGTTCTTTCCGTGAAGCTACCCGTCAATCCCTTTCTTCAAGTC
AAATGTTCGTACCTACACCCGAATTCACGTCGGCGTATTACGATCAATCG
CCCGATTTCCCGAATTACATTGATGATGAACCCGAATCGGAAACAGCTTT
TGATCCAGCTACGAAAAGTAAGAAACAAGACAGTAATCCTTGATTCTGTC
GATCATGAAAAGCAGAGAGGTGTGGCTAGATGTGGAACACAAGAAAGTAG
ATTTGAATGATTATTTCGCATTGTACATCCTCCAGCGTACCATACAGATC
GTCAACGACGTCAGCTATCGAACATGAAAAAGAGAATCAGCGTTTATGTG
GTGGTGTTCATGGTGTGCTGGCTACCCGGTTTTATATGGTTTAACCTTGA
GGTTATACTGGCGAGCTATTCCAGAATAAAGTTCCGCCATTTATAAAAGC
TTACGGATTTATCTTACTGGCTGCCACCCTTTTGTTGTCAATGGTTACCA
TTATGATGCGTGATAGCAATAGACGTACCAAGACTAGTTGTTGATGCCAA
TTATTTTGATGTTACCAATTATCATCGAATCGAAAATGGAAAACATAAGC
TCTTGTCAAAAGAAATGGCAAGTTTATCGGCGATCCGTTTACAACGCTTC
AAAAGTCTTTTATATTACATTTCTTGATCATTCACATTGTGACATTTTGT
TTCACCATCAATTATTCGATTAACGTCTACTTCCTCATGAAGGATCGTGT
TCGTAGCATGGGTATGGATTACACTGAGCAAGTTCACACTGGTCTCCACA
CTCAGTATTGTTTGTTTCATCCTTTGTAAACACATCCAGTCTAATGTTCA
AGTCAAGCCTCTACTCCATCTGTCCATCGCAGACTTTTTGTTAGCCTTTG
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GTTCAACAAACTGCGATGTCTTGTTTCACATGGCAGTTGATCACAGAGGA
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GGTCTCCACACTCAGTATTGTTTGTTTCATCCTTTGTAAACACATCCAGT
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TTAGCCTTTGCATGGGTGTCAGCCAACACTGCTTATCTGGTGAAAAATGA
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AAGTATACCCATAATGCTGTGTTGACGCCGTTACAGGGATTCTTTAACAC
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TATTACGATCAATCGCCCGATTTCCCGAATTACATTGATGATGAACCCGA
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TGTCAATGGTTACCATTATGATGCGTGATAGCAATAGACGTACCAAGACT
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ATGGAAAACATAAGCTCTTGTCAAAAGAAATGGCAAGTTTATCGGCGATC
CGTTTACAACGCTTCAAAAGTCTTTTATATTACATTTCTTGATCATTCAC
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CACTTACATGTCAATCATTGGACGTTGTGAAGCATTTCGTCCCGGTGTGT
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AACACGATCGTTTACGGATGGTCACGGCGTTCTTTCCGTGAAGCTACCCG
TCAATCCCTTTCTTCAAGTCAAATGTTCGTACCTACACCCGAATTCACGT
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TTTATATGGTTTAACCTTGAGGTTATACTGGCGAGCTATTCCAGAATAAA
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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Position

The following features are aligned


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Expression

Values :

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Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR000276	GPCR_Rhodpsn
IPR017452	GPCR_Rhodpsn_7TM
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Vocabulary: **Biological Process**
Term	Definition
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Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
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Term	Definition
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GO Annotation

GO Assignments

This transcript is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0007166	cell surface receptor signaling pathway
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Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00024149 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00024149 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00024149 (transcript) - C. hemisphaerica