TCONS_00024141 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00024141
Unique NameTCONS_00024141
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length3762

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00024141 ID=TCONS_00024141|Name=TCONS_00024141|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3762bp
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00024141-protein

>TCONS_00024141-protein ID=TCONS_00024141-protein|Name=TCONS_00024141-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1036bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000476:106399..124776-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00024141 ID=TCONS_00024141|Name=TCONS_00024141|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18378bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000476:106399..124776- (Clytia hemisphaerica)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000476:106399..124776-

>TCONS_00024141 ID=TCONS_00024141|Name=TCONS_00024141|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=68442bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000476:106399..124776- (Clytia hemisphaerica)
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AATATGTTCGTGCATGCGCCGCAGCCGTTCCTGGGCACGAGCACGTGTTA
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CAAAAATGCTCTGACTGCGCAAGTTCAATCTGTGTTAAGCGTGCACCACA
AACTTCCACACCGTTGTTCCGCTGGTTTTAAATTCATCAACAACCACATG
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TTGTAAACTATTTAACGCATACGTCGCTTCCCCAGACAGCTGTCAATCAG
CCGTTCACCTCGCTTTCCTTGCTCAACAACAACAATTCGTAATTGCCAAG
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CTACTCACATCACAGTTTGTCAAGCCTCCACATTCAATGGACACTCTCAC
AATGGTGTTAGCCTGGACGTTTTCATCATGCCAGGTATGAGCATGGGACA
TGGACAAGACAGTTCTAAGAAAGAAGTTGTTGCCAGTTGGATGATGCCGC
ACATGTGGAGAGCCAATCTTACTGGATGGCGCCCGCACATGCGCATTGAA
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TGTGTCCAAGAATTTCACGCATGGGCACGATATCATCATGATTATGAGTT
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TGTTAGCTGGTGGTAAAATCAAATGGGTGGCATTATATAATTACACTCAA
GGTCCAATAGAGCAAAGTGGACACATGGAGAAAGGACAGTTGTATAATGT
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TCACCACCCTCGCCAATCCCCGCCCAAATGACCGTTCAAAAGCCTACACC
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TCCGTAACCCTGACTACTGCAACAATTGCGGTAAATGTAACACTATCAGT
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TGATGTCAGACCTGCAGTAGCCTGGGATAACTGGGCGCCAGGAAACCCAA
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GTTGATAAGAACATTGACGTAAAGGAATTCGAACAAAAATGCTCTGACTG
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TGTCAAGCCTCCACATTCAATGGACACTCTCACAATGGTGTTAGCCTGGA
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CTTACTGGATGGCGCCCGCACATGCGCATTGAAAAGAACGCTGACTACAG
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ATTTTGATATCTCACCACCCTCGCCAATCCCCGCCCAAATGACCGTTCAA
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GTGCTGCTTTTTTCGTGGCTGCCCTCGTGATCCTTGACTGCATCGTGGTT
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TGATGTCACAAGTGTATGGACAACATCAAATCACACCGTGTGGAAGTTGG
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TGCAAGAAGCTGAACCATTCCACCCTGATGTCTGCCCACAGATCCGTCTC
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GCTGTCATGGATTGTATTGTGGTACAGTTTCCACAGATGATCATGTATGG
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TTATCGCGATCGACGTGGTCTTGAAAACGCACGAAAAACGGACGTCCGAA
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GCAAACAACATCATCCTTGATGACTACTCAGCAGCTAGTTTTGTCAATTT
CCCTGCCAATGACCTCCAGCCAACCCACGAACGATTGAATGATTATTATT
GCAAGCCATTTTCTACTGCGCCAGTAATGAAATTCACCTTAAGATTGAAA
CATGGATATCATTCAGCTCAAGATGCCATGGTGGTGTTTGCCAAAGGAAT
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GATATCATCATGATTATGAGTTGTGCTGCTGGAATTGCGCCACGTCAATT
CCTTACCGAATTCGAATACCATGGAACTCCACTCAACTATCGACCAGTTG
TTACCTGGGTCGAAGCTGTCGAAGCTCAATATGTTCGTGCATGCGCCGCA
GCCGTTCCTGGGCACGAGCACGTGTTAGCTGGTGGTAAAATCAAATGGGT
GGCATTATATAATTACACTCAAGGTCCAATAGAGCAAAGTGGACACATGG
AGAAAGGACAGTTGTATAATGTCAAATCTTACACCGCCGATAAACACTGT
TTCAGCTTCAGCTTCCCACAAGCTTTTGCCAGGGTGCTGATCATGGTTCC
CATGGAAACCCAGAAGCTGAGCAAGAGCATCACCAACAGCTTCACCACCA
TCATTCACATAATTTTGATATCTCACCACCCTCGCCAATCCCCGCCCAAA
TGACCGTTCAAAAGCCTACACCACCTAAAGAATACGACAGCATGGCGGCT
CACGTGATTGATTCACGTGATCACGGCTGCAGTGAATTCAAACACGATCA
CGATGAAGCTGACGGTTGTATTGATATCTGGCTCAAAAACAAATTCAGAT
GCATATCATTCGTGCTGCTTTTTTCGTGGCTGCCCTCGTGATCCTTGACT
GCATCGTGGTTGAGTTGCAACTTCCGTAACCCTGACTACTGCAACAATTG
CGGTAAATGTAACACTATCAGTCCATTCAGCCATATCTGTGCTTGCATCC
CACCATACGGTGGCCCCCGCTGTGATGTCAGACCTGCAGTAGCCTGGGAT
AACTGGGCGCCAGGAAACCCAACTTCCGGCGTATTGAACGACAATGATTG
CGCTAACCAACGTGGTACAAGCGTTGATAAGAACATTGACGTAAAGGAAT
TCGAACAAAAATGCTCTGACTGCGCAAGTTCAATCTGTGTTAAGCGTGCA
CCACAAACTTCCACACCGTTGTTCCGCTGGTTTTAAATTCATCAACAACC
ACATGTGCGCCAAATTCGACCCAACATGCCGAACACCAGCACAAGCTCAC
GATGCTTGTAAACTATTTAACGCATACGTCGCTTCCCCAGACAGCTGTCA
ATCAGCCGTTCACCTCGCTTTCCTTGCTCAACAACAACAATTCGTAATTG
CCAAGACTGATGCTGTCACAGAAGGAAACTGGGTTCCAGGATACGAATAT
GAACTCTACTCACATCACAGTTTGTCAAGCCTCCACATTCAATGGACACT
CTCACAATGGTGTTAGCCTGGACGTTTTCATCATGCCAGGTATGAGCATG
GGACATGGACAAGACAGTTCTAAGAAAGAAGTTGTTGCCAGTTGGATGAT
GCCGCACATGTGGAGAGCCAATCTTACTGGATGGCGCCCGCACATGCGCA
TTGAAAAGAACGCTGACTACAGCGCTTGGATCGAGCACTGGACTCTTTTC
AACAAATCCATGATTCACGATTTCGGATTCTCCCACAAAGTTCATTTCAA
ACCATCTAAGCAACAAGGATTCGAACATAAAGCACAATGTCAAACTAAAG
CTTACTTGCCAGCTGGAATGTACTTAATCAACTCGGCAACTACTCTCGTC
TCCTTAAAACACAGTATCAAACCATACAGTGCTATGGACTCTATGAAAAA
ATATCATATGCACAGAGCGGAAATGATGAAAGATGGAAATGGACGGTGTC
ACTTTTATGATGACAGTCGAACAAACGAAAACCGTGAAAGCGCAAGACGT
AAGCGACGCCGTTAACGTCTGGTTGGAATACGACGAACAAACTCACGATT
CTTACATCTGTTTGAGAGAATTACAAAACTTTGATGGAAAACACGAGGGT
ATCCATGTTATCATCATGAATGGTTCAAACGTATGTTGATGGGATATGGT
GTCAAAAAATTGAACTTGACAAGTGGCGTTGATCAAGATGGCTGGCGATA
CGATGCTCATCTGATGTCACAAGTGTATGGACAACATCAAATCACACCGT
GTGGAAGTTGGAGACTGGCAATCAGGGACTCATTGTGTACCACTCCATGA
ACGTAAACCAATGCAAGAAGCTGAACCATTCCACCCTGATGTCTGCCCAC
AGATCCGTCTCCAAGATGTCGGAAAGGTAGTGGAAAACCATCAGCTTCAT
GGGTAGAAGAAGTTACACCAAAGAAATTCAAAGCCTGTGTTATGCTTCCT
GGACGTTCTCATGGTACTATGCAACCTACCATTAATTGGTTTGCTTACCA
AGGAGAAATGGCTGAGAATACACCTTTAATCACGGTCGTCAACAATTGAC
TGCTGTACCAAGCTGTCATGGATTGTATTGTGGTACAGTTTCCACAGATG
ATCATGTATGGTACAAAGATGCTAAAGTTAATGTCCAAATCTCTACTGCT
TATAATGGGCTTGCTCCTGACAAATGCAATACTTTAACTTGCCCAGCCAA
CACGGAATGCATCCACCAAGCCGACGGCTCACCCATTTGTGGATGTATCA
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GGACGTCCGAATTCATTACATCATTTATGGAGAATGTAACCTTGCCAACT
GCTTACTGGCCATGCCCATCAATCCTCGTACAAGCTGAAGAACCAAACTT
ACAAATTTGTGAATCACCCGTCACCGCTTGGGTTTCTTTCTGGTATGGCA
TTGCTAATCAAGCAAACAACATCATCCTTGATGACTACTCAGCAGCTAGT
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TGATTATTATTGCAAGCCATTTTCTACTGCGCCAGTAATGAAATTCACCT
TAAGATTGAAACATGGATATCATTCAGCTCAAGATGCCATGGTGGTGTTT
GCCAAAGGAATCACTAATGGTGGTGCTGTTGTCTGTGTCCAAGAATTTCA
CGCATGGGCACGATATCATCATGATTATGAGTTGTGCTGCTGGAATTGCG
CCACGTCAATTCCTTACCGAATTCGAATACCATGGAACTCCACTCAACTA
TCGACCAGTTGTTACCTGGGTCGAAGCTGTCGAAGCTCAATATGTTCGTG
CATGCGCCGCAGCCGTTCCTGGGCACGAGCACGTGTTAGCTGGTGGTAAA
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GCAGTGAATTCAAACACGATCACGATGAAGCTGACGGTTGTATTGATATC
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GCCTCCACATTCAATGGACACTCTCACAATGGTGTTAGCCTGGACGTTTT
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GGACAACATCAAATCACACCGTGTGGAAGTTGGAGACTGGCAATCAGGGA
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ATATCTCACCACCCTCGCCAATCCCCGCCCAAATGACCGTTCAAAAGCCT
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TGATCACGGCTGCAGTGAATTCAAACACGATCACGATGAAGCTGACGGTT
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CAGTTTGTCAAGCCTCCACATTCAATGGACACTCTCACAATGGTGTTAGC
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GAATTACAAAACTTTGATGGAAAACACGAGGGTATCCATGTTATCATCAT
GAATGGTTCAAACGTATGTTGATGGGATATGGTGTCAAAAAATTGAACTT
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CACAAGTGTATGGACAACATCAAATCACACCGTGTGGAAGTTGGAGACTG
GCAATCAGGGACTCATTGTGTACCACTCCATGAACGTAAACCAATGCAAG
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GTCGGAAAGGTAGTGGAAAACCATCAGCTTCATGGGTAGAAGAAGTTACA
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ATACACCTTTAATCACGGTCGTCAACAATTGACTGCTGTACCAAGCTGTC
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GATGCTAAAGTTAATGTCCAAATCTCTACTGCTTATAATGGGCTTGCTCC
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AAGCCGACGGCTCACCCATTTGTGGATGTATCAAATCATGTGCACCAGAA
GATGACGTCGTTTGCGGCTCAGATATGAAGGAATATCCAAACCGGTGTGA
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CGATCGACGTGGTCTTGAAAACGCACGAAAAACGGACGTCCGAATTCATT
ACATCATTTATGGAGAATGTAACCTTGCCAACTGCTTACTGGCCATGCCC
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CCGTCACCGCTTGGGTTTCTTTCTGGTATGGCATTGCTAATCAAGCAAAC
AACATCATCCTTGATGACTACTCAGCAGCTAGTTTTGTCAATTTCCCTGC
CAATGACCTCCAGCCAACCCACGAACGATTGAATGATTATTATTGCAAGC
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TGGTGGTGCTGTTGTCTGTGTCCAAGAATTTCACGCATGGGCACGATATC
ATCATGATTATGAGTTGTGCTGCTGGAATTGCGCCACGTCAATTCCTTAC
CGAATTCGAATACCATGGAACTCCACTCAACTATCGACCAGTTGTTACCT
GGGTCGAAGCTGTCGAAGCTCAATATGTTCGTGCATGCGCCGCAGCCGTT
CCTGGGCACGAGCACGTGTTAGCTGGTGGTAAAATCAAATGGGTGGCATT
ATATAATTACACTCAAGGTCCAATAGAGCAAAGTGGACACATGGAGAAAG
GACAGTTGTATAATGTCAAATCTTACACCGCCGATAAACACTGTTTCAGC
TTCAGCTTCCCACAAGCTTTTGCCAGGGTGCTGATCATGGTTCCCATGGA
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ACATAATTTTGATATCTCACCACCCTCGCCAATCCCCGCCCAAATGACCG
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ATTGATTCACGTGATCACGGCTGCAGTGAATTCAAACACGATCACGATGA
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CATTCGTGCTGCTTTTTTCGTGGCTGCCCTCGTGATCCTTGACTGCATCG
TGGTTGAGTTGCAACTTCCGTAACCCTGACTACTGCAACAATTGCGGTAA
ATGTAACACTATCAGTCCATTCAGCCATATCTGTGCTTGCATCCCACCAT
ACGGTGGCCCCCGCTGTGATGTCAGACCTGCAGTAGCCTGGGATAACTGG
GCGCCAGGAAACCCAACTTCCGGCGTATTGAACGACAATGATTGCGCTAA
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AAAAATGCTCTGACTGCGCAAGTTCAATCTGTGTTAAGCGTGCACCACAA
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GCGCCAAATTCGACCCAACATGCCGAACACCAGCACAAGCTCACGATGCT
TGTAAACTATTTAACGCATACGTCGCTTCCCCAGACAGCTGTCAATCAGC
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CTGATGCTGTCACAGAAGGAAACTGGGTTCCAGGATACGAATATGAACTC
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GGACAAGACAGTTCTAAGAAAGAAGTTGTTGCCAGTTGGATGATGCCGCA
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TGCCAGCTGGAATGTACTTAATCAACTCGGCAACTACTCTCGTCTCCTTA
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CGCCGTTAACGTCTGGTTGGAATACGACGAACAAACTCACGATTCTTACA
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TCATCTGATGTCACAAGTGTATGGACAACATCAAATCACACCGTGTGGAA
GTTGGAGACTGGCAATCAGGGACTCATTGTGTACCACTCCATGAACGTAA
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AAGAAGTTACACCAAAGAAATTCAAAGCCTGTGTTATGCTTCCTGGACGT
TCTCATGGTACTATGCAACCTACCATTAATTGGTTTGCTTACCAAGGAGA
AATGGCTGAGAATACACCTTTAATCACGGTCGTCAACAATTGACTGCTGT
ACCAAGCTGTCATGGATTGTATTGTGGTACAGTTTCCACAGATGATCATG
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ATGCATCCACCAAGCCGACGGCTCACCCATTTGTGGATGTATCAAATCAT
GTGCACCAGAAGATGACGTCGTTTGCGGCTCAGATATGAAGGAATATCCA
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GTATGCACACAAAGGAAAATGTGAAACATCACAATGGACAAATTGCCACC
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GGCACGATATCATCATGATTATGAGTTGTGCTGCTGGAATTGCGCCACGT
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CCGCAGCCGTTCCTGGGCACGAGCACGTGTTAGCTGGTGGTAAAATCAAA
TGGGTGGCATTATATAATTACACTCAAGGTCCAATAGAGCAAAGTGGACA
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GTTCCCATGGAAACCCAGAAGCTGAGCAAGAGCATCACCAACAGCTTCAC
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CCAAATGACCGTTCAAAAGCCTACACCACCTAAAGAATACGACAGCATGG
CGGCTCACGTGATTGATTCACGTGATCACGGCTGCAGTGAATTCAAACAC
GATCACGATGAAGCTGACGGTTGTATTGATATCTGGCTCAAAAACAAATT
CAGATGCATATCATTCGTGCTGCTTTTTTCGTGGCTGCCCTCGTGATCCT
TGACTGCATCGTGGTTGAGTTGCAACTTCCGTAACCCTGACTACTGCAAC
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CATCCCACCATACGGTGGCCCCCGCTGTGATGTCAGACCTGCAGTAGCCT
GGGATAACTGGGCGCCAGGAAACCCAACTTCCGGCGTATTGAACGACAAT
GATTGCGCTAACCAACGTGGTACAAGCGTTGATAAGAACATTGACGTAAA
GGAATTCGAACAAAAATGCTCTGACTGCGCAAGTTCAATCTGTGTTAAGC
GTGCACCACAAACTTCCACACCGTTGTTCCGCTGGTTTTAAATTCATCAA
CAACCACATGTGCGCCAAATTCGACCCAACATGCCGAACACCAGCACAAG
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TGTCAATCAGCCGTTCACCTCGCTTTCCTTGCTCAACAACAACAATTCGT
AATTGCCAAGACTGATGCTGTCACAGAAGGAAACTGGGTTCCAGGATACG
AATATGAACTCTACTCACATCACAGTTTGTCAAGCCTCCACATTCAATGG
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GCATGGGACATGGACAAGACAGTTCTAAGAAAGAAGTTGTTGCCAGTTGG
ATGATGCCGCACATGTGGAGAGCCAATCTTACTGGATGGCGCCCGCACAT
GCGCATTGAAAAGAACGCTGACTACAGCGCTTGGATCGAGCACTGGACTC
TTTTCAACAAATCCATGATTCACGATTTCGGATTCTCCCACAAAGTTCAT
TTCAAACCATCTAAGCAACAAGGATTCGAACATAAAGCACAATGTCAAAC
TAAAGCTTACTTGCCAGCTGGAATGTACTTAATCAACTCGGCAACTACTC
TCGTCTCCTTAAAACACAGTATCAAACCATACAGTGCTATGGACTCTATG
AAAAAATATCATATGCACAGAGCGGAAATGATGAAAGATGGAAATGGACG
GTGTCACTTTTATGATGACAGTCGAACAAACGAAAACCGTGAAAGCGCAA
GACGTAAGCGACGCCGTTAACGTCTGGTTGGAATACGACGAACAAACTCA
CGATTCTTACATCTGTTTGAGAGAATTACAAAACTTTGATGGAAAACACG
AGGGTATCCATGTTATCATCATGAATGGTTCAAACGTATGTTGATGGGAT
ATGGTGTCAAAAAATTGAACTTGACAAGTGGCGTTGATCAAGATGGCTGG
CGATACGATGCTCATCTGATGTCACAAGTGTATGGACAACATCAAATCAC
ACCGTGTGGAAGTTGGAGACTGGCAATCAGGGACTCATTGTGTACCACTC
CATGAACGTAAACCAATGCAAGAAGCTGAACCATTCCACCCTGATGTCTG
CCCACAGATCCGTCTCCAAGATGTCGGAAAGGTAGTGGAAAACCATCAGC
TTCATGGGTAGAAGAAGTTACACCAAAGAAATTCAAAGCCTGTGTTATGC
TTCCTGGACGTTCTCATGGTACTATGCAACCTACCATTAATTGGTTTGCT
TACCAAGGAGAAATGGCTGAGAATACACCTTTAATCACGGTCGTCAACAA
TTGACTGCTGTACCAAGCTGTCATGGATTGTATTGTGGTACAGTTTCCAC
AGATGATCATGTATGGTACAAAGATGCTAAAGTTAATGTCCAAATCTCTA
CTGCTTATAATGGGCTTGCTCCTGACAAATGCAATACTTTAACTTGCCCA
GCCAACACGGAATGCATCCACCAAGCCGACGGCTCACCCATTTGTGGATG
TATCAAATCATGTGCACCAGAAGATGACGTCGTTTGCGGCTCAGATATGA
AGGAATATCCAAACCGGTGTGAATTGATGAAACAGTCATGCGAATCTGGA
TTCAAATTTGTGTATGCACACAAAGGAAAATGTGAAACATCACAATGGAC
AAATTGCCACCTTATGTTATCGCGATCGACGTGGTCTTGAAAACGCACGA
AAAACGGACGTCCGAATTCATTACATCATTTATGGAGAATGTAACCTTGC
CAACTGCTTACTGGCCATGCCCATCAATCCTCGTACAAGCTGAAGAACCA
AACTTACAAATTTGTGAATCACCCGTCACCGCTTGGGTTTCTTTCTGGTA
TGGCATTGCTAATCAAGCAAACAACATCATCCTTGATGACTACTCAGCAG
CTAGTTTTGTCAATTTCCCTGCCAATGACCTCCAGCCAACCCACGAACGA
TTGAATGATTATTATTGCAAGCCATTTTCTACTGCGCCAGTAATGAAATT
CACCTTAAGATTGAAACATGGATATCATTCAGCTCAAGATGCCATGGTGG
TGTTTGCCAAAGGAATCACTAATGGTGGTGCTGTTGTCTGTGTCCAAGAA
TTTCACGCATGGGCACGATATCATCATGATTATGAGTTGTGCTGCTGGAA
TTGCGCCACGTCAATTCCTTACCGAATTCGAATACCATGGAACTCCACTC
AACTATCGACCAGTTGTTACCTGGGTCGAAGCTGTCGAAGCTCAATATGT
TCGTGCATGCGCCGCAGCCGTTCCTGGGCACGAGCACGTGTTAGCTGGTG
GTAAAATCAAATGGGTGGCATTATATAATTACACTCAAGGTCCAATAGAG
CAAAGTGGACACATGGAGAAAGGACAGTTGTATAATGTCAAATCTTACAC
CGCCGATAAACACTGTTTCAGCTTCAGCTTCCCACAAGCTTTTGCCAGGG
TGCTGATCATGGTTCCCATGGAAACCCAGAAGCTGAGCAAGAGCATCACC
AACAGCTTCACCACCATCATTCACATAATTTTGATATCTCACCACCCTCG
CCAATCCCCGCCCAAATGACCGTTCAAAAGCCTACACCACCTAAAGAATA
CGACAGCATGGCGGCTCACGTGATTGATTCACGTGATCACGGCTGCAGTG
AATTCAAACACGATCACGATGAAGCTGACGGTTGTATTGATATCTGGCTC
AAAAACAAATTCAGATGCATATCATTCGTGCTGCTTTTTTCGTGGCTGCC
CTCGTGATCCTTGACTGCATCGTGGTTGAGTTGCAACTTCCGTAACCCTG
ACTACTGCAACAATTGCGGTAAATGTAACACTATCAGTCCATTCAGCCAT
ATCTGTGCTTGCATCCCACCATACGGTGGCCCCCGCTGTGATGTCAGACC
TGCAGTAGCCTGGGATAACTGGGCGCCAGGAAACCCAACTTCCGGCGTAT
TGAACGACAATGATTGCGCTAACCAACGTGGTACAAGCGTTGATAAGAAC
ATTGACGTAAAGGAATTCGAACAAAAATGCTCTGACTGCGCAAGTTCAAT
CTGTGTTAAGCGTGCACCACAAACTTCCACACCGTTGTTCCGCTGGTTTT
AAATTCATCAACAACCACATGTGCGCCAAATTCGACCCAACATGCCGAAC
ACCAGCACAAGCTCACGATGCTTGTAAACTATTTAACGCATACGTCGCTT
CCCCAGACAGCTGTCAATCAGCCGTTCACCTCGCTTTCCTTGCTCAACAA
CAACAATTCGTAATTGCCAAGACTGATGCTGTCACAGAAGGAAACTGGGT
TCCAGGATACGAATATGAACTCTACTCACATCACAGTTTGTCAAGCCTCC
ACATTCAATGGACACTCTCACAATGGTGTTAGCCTGGACGTTTTCATCAT
GCCAGGTATGAGCATGGGACATGGACAAGACAGTTCTAAGAAAGAAGTTG
TTGCCAGTTGGATGATGCCGCACATGTGGAGAGCCAATCTTACTGGATGG
CGCCCGCACATGCGCATTGAAAAGAACGCTGACTACAGCGCTTGGATCGA
GCACTGGACTCTTTTCAACAAATCCATGATTCACGATTTCGGATTCTCCC
ACAAAGTTCATTTCAAACCATCTAAGCAACAAGGATTCGAACATAAAGCA
CAATGTCAAACTAAAGCTTACTTGCCAGCTGGAATGTACTTAATCAACTC
GGCAACTACTCTCGTCTCCTTAAAACACAGTATCAAACCATACAGTGCTA
TGGACTCTATGAAAAAATATCATATGCACAGAGCGGAAATGATGAAAGAT
GGAAATGGACGGTGTCACTTTTATGATGACAGTCGAACAAACGAAAACCG
TGAAAGCGCAAGACGTAAGCGACGCCGTTAACGTCTGGTTGGAATACGAC
GAACAAACTCACGATTCTTACATCTGTTTGAGAGAATTACAAAACTTTGA
TGGAAAACACGAGGGTATCCATGTTATCATCATGAATGGTTCAAACGTAT
GTTGATGGGATATGGTGTCAAAAAATTGAACTTGACAAGTGGCGTTGATC
AAGATGGCTGGCGATACGATGCTCATCTGATGTCACAAGTGTATGGACAA
CATCAAATCACACCGTGTGGAAGTTGGAGACTGGCAATCAGGGACTCATT
GTGTACCACTCCATGAACGTAAACCAATGCAAGAAGCTGAACCATTCCAC
CCTGATGTCTGCCCACAGATCCGTCTCCAAGATGTCGGAAAGGTAGTGGA
AAACCATCAGCTTCATGGGTAGAAGAAGTTACACCAAAGAAATTCAAAGC
CTGTGTTATGCTTCCTGGACGTTCTCATGGTACTATGCAACCTACCATTA
ATTGGTTTGCTTACCAAGGAGAAATGGCTGAGAATACACCTTTAATCACG
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TGAGAATACACCTTTAATCACGGTCGTCAACAATTGACTGCTGTACCAAG
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ACAAAGATGCTAAAGTTAATGTCCAAATCTCTACTGCTTATAATGGGCTT
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ATATCATCATGATTATGAGTTGTGCTGCTGGAATTGCGCCACGTCAATTC
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TACCTGGGTCGAAGCTGTCGAAGCTCAATATGTTCGTGCATGCGCCGCAG
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GCATTATATAATTACACTCAAGGTCCAATAGAGCAAAGTGGACACATGGA
GAAAGGACAGTTGTATAATGTCAAATCTTACACCGCCGATAAACACTGTT
TCAGCTTCAGCTTCCCACAAGCTTTTGCCAGGGTGCTGATCATGGTTCCC
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CATTCACATAATTTTGATATCTCACCACCCTCGCCAATCCCCGCCCAAAT
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ACGTGATTGATTCACGTGATCACGGCTGCAGTGAATTCAAACACGATCAC
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CATATCATTCGTGCTGCTTTTTTCGTGGCTGCCCTCGTGATCCTTGACTG
CATCGTGGTTGAGTTGCAACTTCCGTAACCCTGACTACTGCAACAATTGC
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ACCATACGGTGGCCCCCGCTGTGATGTCAGACCTGCAGTAGCCTGGGATA
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GCTAACCAACGTGGTACAAGCGTTGATAAGAACATTGACGTAAAGGAATT
CGAACAAAAATGCTCTGACTGCGCAAGTTCAATCTGTGTTAAGCGTGCAC
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CATGTGCGCCAAATTCGACCCAACATGCCGAACACCAGCACAAGCTCACG
ATGCTTGTAAACTATTTAACGCATACGTCGCTTCCCCAGACAGCTGTCAA
TCAGCCGTTCACCTCGCTTTCCTTGCTCAACAACAACAATTCGTAATTGC
CAAGACTGATGCTGTCACAGAAGGAAACTGGGTTCCAGGATACGAATATG
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GACATGGACAAGACAGTTCTAAGAAAGAAGTTGTTGCCAGTTGGATGATG
CCGCACATGTGGAGAGCCAATCTTACTGGATGGCGCCCGCACATGCGCAT
TGAAAAGAACGCTGACTACAGCGCTTGGATCGAGCACTGGACTCTTTTCA
ACAAATCCATGATTCACGATTTCGGATTCTCCCACAAAGTTCATTTCAAA
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CCTTAAAACACAGTATCAAACCATACAGTGCTATGGACTCTATGAAAAAA
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CTTTTATGATGACAGTCGAACAAACGAAAACCGTGAAAGCGCAAGACGTA
AGCGACGCCGTTAACGTCTGGTTGGAATACGACGAACAAACTCACGATTC
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TCCATGTTATCATCATGAATGGTTCAAACGTATGTTGATGGGATATGGTG
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GATGCTCATCTGATGTCACAAGTGTATGGACAACATCAAATCACACCGTG
TGGAAGTTGGAGACTGGCAATCAGGGACTCATTGTGTACCACTCCATGAA
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GATCCGTCTCCAAGATGTCGGAAAGGTAGTGGAAAACCATCAGCTTCATG
GGTAGAAGAAGTTACACCAAAGAAATTCAAAGCCTGTGTTATGCTTCCTG
GACGTTCTCATGGTACTATGCAACCTACCATTAATTGGTTTGCTTACCAA
GGAGAAATGGCTGAGAATACACCTTTAATCACGGTCGTCAACAATTGACT
GCTGTACCAAGCTGTCATGGATTGTATTGTGGTACAGTTTCCACAGATGA
TCATGTATGGTACAAAGATGCTAAAGTTAATGTCCAAATCTCTACTGCTT
ATAATGGGCTTGCTCCTGACAAATGCAATACTTTAACTTGCCCAGCCAAC
ACGGAATGCATCCACCAAGCCGACGGCTCACCCATTTGTGGATGTATCAA
ATCATGTGCACCAGAAGATGACGTCGTTTGCGGCTCAGATATGAAGGAAT
ATCCAAACCGGTGTGAATTGATGAAACAGTCATGCGAATCTGGATTCAAA
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CCACCTTATGTTATCGCGATCGACGTGGTCTTGAAAACGCACGAAAAACG
GACGTCCGAATTCATTACATCATTTATGGAGAATGTAACCTTGCCAACTG
CTTACTGGCCATGCCCATCAATCCTCGTACAAGCTGAAGAACCAAACTTA
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TTGTCAATTTCCCTGCCAATGACCTCCAGCCAACCCACGAACGATTGAAT
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AAGATTGAAACATGGATATCATTCAGCTCAAGATGCCATGGTGGTGTTTG
CCAAAGGAATCACTAATGGTGGTGCTGTTGTCTGTGTCCAAGAATTTCAC
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ATGCGCCGCAGCCGTTCCTGGGCACGAGCACGTGTTAGCTGGTGGTAAAA
TCAAATGGGTGGCATTATATAATTACACTCAAGGTCCAATAGAGCAAAGT
GGACACATGGAGAAAGGACAGTTGTATAATGTCAAATCTTACACCGCCGA
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CATGGCGGCTCACGTGATTGATTCACGTGATCACGGCTGCAGTGAATTCA
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GCTTGCATCCCACCATACGGTGGCCCCCGCTGTGATGTCAGACCTGCAGT
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ATCAACAACCACATGTGCGCCAAATTCGACCCAACATGCCGAACACCAGC
ACAAGCTCACGATGCTTGTAAACTATTTAACGCATACGTCGCTTCCCCAG
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GACTCTTTTCAACAAATCCATGATTCACGATTTCGGATTCTCCCACAAAG
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GCTGGCGATACGATGCTCATCTGATGTCACAAGTGTATGGACAACATCAA
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TCAGCTTCATGGGTAGAAGAAGTTACACCAAAGAAATTCAAAGCCTGTGT
TATGCTTCCTGGACGTTCTCATGGTACTATGCAACCTACCATTAATTGGT
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AACAATTGACTGCTGTACCAAGCTGTCATGGATTGTATTGTGGTACAGTT
TCCACAGATGATCATGTATGGTACAAAGATGCTAAAGTTAATGTCCAAAT
CTCTACTGCTTATAATGGGCTTGCTCCTGACAAATGCAATACTTTAACTT
GCCCAGCCAACACGGAATGCATCCACCAAGCCGACGGCTCACCCATTTGT
GGATGTATCAAATCATGTGCACCAGAAGATGACGTCGTTTGCGGCTCAGA
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TGGACAAATTGCCACCTTATGTTATCGCGATCGACGTGGTCTTGAAAACG
CACGAAAAACGGACGTCCGAATTCATTACATCATTTATGGAGAATGTAAC
CTTGCCAACTGCTTACTGGCCATGCCCATCAATCCTCGTACAAGCTGAAG
AACCAAACTTACAAATTTGTGAATCACCCGTCACCGCTTGGGTTTCTTTC
TGGTATGGCATTGCTAATCAAGCAAACAACATCATCCTTGATGACTACTC
AGCAGCTAGTTTTGTCAATTTCCCTGCCAATGACCTCCAGCCAACCCACG
AACGATTGAATGATTATTATTGCAAGCCATTTTCTACTGCGCCAGTAATG
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TGGAATTGCGCCACGTCAATTCCTTACCGAATTCGAATACCATGGAACTC
CACTCAACTATCGACCAGTTGTTACCTGGGTCGAAGCTGTCGAAGCTCAA
TATGTTCGTGCATGCGCCGCAGCCGTTCCTGGGCACGAGCACGTGTTAGC
TGGTGGTAAAATCAAATGGGTGGCATTATATAATTACACTCAAGGTCCAA
TAGAGCAAAGTGGACACATGGAGAAAGGACAGTTGTATAATGTCAAATCT
TACACCGCCGATAAACACTGTTTCAGCTTCAGCTTCCCACAAGCTTTTGC
CAGGGTGCTGATCATGGTTCCCATGGAAACCCAGAAGCTGAGCAAGAGCA
TCACCAACAGCTTCACCACCATCATTCACATAATTTTGATATCTCACCAC
CCTCGCCAATCCCCGCCCAAATGACCGTTCAAAAGCCTACACCACCTAAA
GAATACGACAGCATGGCGGCTCACGTGATTGATTCACGTGATCACGGCTG
CAGTGAATTCAAACACGATCACGATGAAGCTGACGGTTGTATTGATATCT
GGCTCAAAAACAAATTCAGATGCATATCATTCGTGCTGCTTTTTTCGTGG
CTGCCCTCGTGATCCTTGACTGCATCGTGGTTGAGTTGCAACTTCCGTAA
CCCTGACTACTGCAACAATTGCGGTAAATGTAACACTATCAGTCCATTCA
GCCATATCTGTGCTTGCATCCCACCATACGGTGGCCCCCGCTGTGATGTC
AGACCTGCAGTAGCCTGGGATAACTGGGCGCCAGGAAACCCAACTTCCGG
CGTATTGAACGACAATGATTGCGCTAACCAACGTGGTACAAGCGTTGATA
AGAACATTGACGTAAAGGAATTCGAACAAAAATGCTCTGACTGCGCAAGT
TCAATCTGTGTTAAGCGTGCACCACAAACTTCCACACCGTTGTTCCGCTG
GTTTTAAATTCATCAACAACCACATGTGCGCCAAATTCGACCCAACATGC
CGAACACCAGCACAAGCTCACGATGCTTGTAAACTATTTAACGCATACGT
CGCTTCCCCAGACAGCTGTCAATCAGCCGTTCACCTCGCTTTCCTTGCTC
AACAACAACAATTCGTAATTGCCAAGACTGATGCTGTCACAGAAGGAAAC
TGGGTTCCAGGATACGAATATGAACTCTACTCACATCACAGTTTGTCAAG
CCTCCACATTCAATGGACACTCTCACAATGGTGTTAGCCTGGACGTTTTC
ATCATGCCAGGTATGAGCATGGGACATGGACAAGACAGTTCTAAGAAAGA
AGTTGTTGCCAGTTGGATGATGCCGCACATGTGGAGAGCCAATCTTACTG
GATGGCGCCCGCACATGCGCATTGAAAAGAACGCTGACTACAGCGCTTGG
ATCGAGCACTGGACTCTTTTCAACAAATCCATGATTCACGATTTCGGATT
CTCCCACAAAGTTCATTTCAAACCATCTAAGCAACAAGGATTCGAACATA
AAGCACAATGTCAAACTAAAGCTTACTTGCCAGCTGGAATGTACTTAATC
AACTCGGCAACTACTCTCGTCTCCTTAAAACACAGTATCAAACCATACAG
TGCTATGGACTCTATGAAAAAATATCATATGCACAGAGCGGAAATGATGA
AAGATGGAAATGGACGGTGTCACTTTTATGATGACAGTCGAACAAACGAA
AACCGTGAAAGCGCAAGACGTAAGCGACGCCGTTAACGTCTGGTTGGAAT
ACGACGAACAAACTCACGATTCTTACATCTGTTTGAGAGAATTACAAAAC
TTTGATGGAAAACACGAGGGTATCCATGTTATCATCATGAATGGTTCAAA
CGTATGTTGATGGGATATGGTGTCAAAAAATTGAACTTGACAAGTGGCGT
TGATCAAGATGGCTGGCGATACGATGCTCATCTGATGTCACAAGTGTATG
GACAACATCAAATCACACCGTGTGGAAGTTGGAGACTGGCAATCAGGGAC
TCATTGTGTACCACTCCATGAACGTAAACCAATGCAAGAAGCTGAACCAT
TCCACCCTGATGTCTGCCCACAGATCCGTCTCCAAGATGTCGGAAAGGTA
GTGGAAAACCATCAGCTTCATGGGTAGAAGAAGTTACACCAAAGAAATTC
AAAGCCTGTGTTATGCTTCCTGGACGTTCTCATGGTACTATGCAACCTAC
CATTAATTGGTTTGCTTACCAAGGAGAAATGGCTGAGAATACACCTTTAA
TCACGGTCGTCAACAATTGACTGCTGTACCAAGCTGTCATGGATTGTATT
GTGGTACAGTTTCCACAGATGATCATGTATGGTACAAAGATGCTAAAGTT
AATGTCCAAATCTCTACTGCTTATAATGGGCTTGCTCCTGACAAATGCAA
TACTTTAACTTGCCCAGCCAACACGGAATGCATCCACCAAGCCGACGGCT
CACCCATTTGTGGATGTATCAAATCATGTGCACCAGAAGATGACGTCGTT
TGCGGCTCAGATATGAAGGAATATCCAAACCGGTGTGAATTGATGAAACA
GTCATGCGAATCTGGATTCAAATTTGTGTATGCACACAAAGGAAAATGTG
AAACATCACAATGGACAAATTGCCACCTTATGTTATCGCGATCGACGTGG
TCTTGAAAACGCACGAAAAACGGACGTCCGAATTCATTACATCATTTATG
GAGAATGTAACCTTGCCAACTGCTTACTGGCCATGCCCATCAATCCTCGT
ACAAGCTGAAGAACCAAACTTACAAATTTGTGAATCACCCGTCACCGCTT
GGGTTTCTTTCTGGTATGGCATTGCTAATCAAGCAAACAACATCATCCTT
GATGACTACTCAGCAGCTAGTTTTGTCAATTTCCCTGCCAATGACCTCCA
GCCAACCCACGAACGATTGAATGATTATTATTGCAAGCCATTTTCTACTG
CGCCAGTAATGAAATTCACCTTAAGATTGAAACATGGATATCATTCAGCT
CAAGATGCCATGGTGGTGTTTGCCAAAGGAATCACTAATGGTGGTGCTGT
TGTCTGTGTCCAAGAATTTCACGCATGGGCACGATATCATCATGATTATG
AGTTGTGCTGCTGGAATTGCGCCACGTCAATTCCTTACCGAATTCGAATA
CCATGGAACTCCACTCAACTATCGACCAGTTGTTACCTGGGTCGAAGCTG
TCGAAGCTCAATATGTTCGTGCATGCGCCGCAGCCGTTCCTGGGCACGAG
CACGTGTTAGCTGGTGGTAAAATCAAATGGGTGGCATTATATAATTACAC
TCAAGGTCCAATAGAGCAAAGTGGACACATGGAGAAAGGACAGTTGTATA
ATGTCAAATCTTACACCGCCGATAAACACTGTTTCAGCTTCAGCTTCCCA
CAAGCTTTTGCCAGGGTGCTGATCATGGTTCCCATGGAAACCCAGAAGCT
GAGCAAGAGCATCACCAACAGCTTCACCACCATCATTCACATAATTTTGA
TATCTCACCACCCTCGCCAATCCCCGCCCAAATGACCGTTCAAAAGCCTA
CACCACCTAAAGAATACGACAGCATGGCGGCTCACGTGATTGATTCACGT
GATCACGGCTGCAGTGAATTCAAACACGATCACGATGAAGCTGACGGTTG
TATTGATATCTGGCTCAAAAACAAATTCAGATGCATATCATTCGTGCTGC
TTTTTTCGTGGCTGCCCTCGTGATCCTTGACTGCATCGTGGTTGAGTTGC
AACTTCCGTAACCCTGACTACTGCAACAATTGCGGTAAATGTAACACTAT
CAGTCCATTCAGCCATATCTGTGCTTGCATCCCACCATACGGTGGCCCCC
GCTGTGATGTCAGACCTGCAGTAGCCTGGGATAACTGGGCGCCAGGAAAC
CCAACTTCCGGCGTATTGAACGACAATGATTGCGCTAACCAACGTGGTAC
AAGCGTTGATAAGAACATTGACGTAAAGGAATTCGAACAAAAATGCTCTG
ACTGCGCAAGTTCAATCTGTGTTAAGCGTGCACCACAAACTTCCACACCG
TTGTTCCGCTGGTTTTAAATTCATCAACAACCACATGTGCGCCAAATTCG
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AACGCATACGTCGCTTCCCCAGACAGCTGTCAATCAGCCGTTCACCTCGC
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000476supercontigsc0000476:106399..124776 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.06286 0.817696 0.516991 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.108968 0.350887 0.71508 0.926562 1.30945e-05 0.00316059 0.564231 0.194574 0.000155093 0.248209 0 0 4.10721e-10 0.000251788 0.165853 0
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR001304C-type_lectin-like
IPR002350Kazal_dom
IPR016186C-type_lectin-like/link
IPR013032EGF-like_CS
IPR016187CTDL_fold
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0005515protein binding
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0005515 protein binding
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00024141 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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