TCONS_00023797 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00023797
Unique Name	TCONS_00023797
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2933

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000462:85318..99672+

transcript sequence

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transcript from alignment at sc0000462:85318..99672+

Legend: exon

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>TCONS_00023797 ID=TCONS_00023797|Name=TCONS_00023797|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14355bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000462:85318..99672+ (Clytia hemisphaerica)
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AGCATCTTGGATATGGTGCAATCAGCTGATGTAAGTTTCACCTCGTTCGA
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GAttcaagttcgaattagagagtgagTTAACTgcattttattatatttgt
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aAGATCAATAATATATTCTATGGTTACTACCCTTTTTGAATGATACGGAA
AAGATTCACTTCAAtatattttcaacactgaaacAAAATAGTATAGCTTA
TTATTTTAACCTAAAATCTCACACActtaaaatttttcgatttttcagat
attttcgTGTGATTTTACacgaaattatttttaattatgGTTAATTAGAG
AACTGATACCTGGCTGTTTTGGTATATCTGCTTCTTGGGCAGTCCTGAAC
TTTTGCGATGCCTGATTTCTTATTCTGCCATTGTGAATAAGttttaatat
ttcataaaattaaagttttgtaatttttttttgtatttttgcaaggttat
tatttttcaataacatttttaaatgaCACTCATTTCGTAATATATTGCTT
TATATAATGTATTTGTTCGTTAAAATGAGAAAATCTGATATAAACtagat
gaaaa

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_013370	XLOC_013370	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000462	supercontig	sc0000462:85318..99672 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0.0787004	0.109731	0	0.104612	0	0.0630248	1.28596	1.26844	0.0502272	0.473406	0.260552	0.78201	0	5.06366	7.13731	0.259467	0.652267	3.61486e-08	0.725398	1.23611	1.22658	5.32916	1.49537	0	0	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00023797 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00023797 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00023797 (transcript) - C. hemisphaerica