TCONS_00023796 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00023796
Unique Name	TCONS_00023796
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2958

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000462:85293..99672+

transcript sequence

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transcript from alignment at sc0000462:85293..99672+

Legend: exon

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>TCONS_00023796 ID=TCONS_00023796|Name=TCONS_00023796|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14380bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000462:85293..99672+ (Clytia hemisphaerica)
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GGTTCCGGAAAATGCAAGATTTTCTTAATTATTTCGTCATCCATATTGGA
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aaaattttaattgcttCCATGCAAATGTTCCCTAATTCAAACAAAGACTC
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gatcgaattagagagagaatGCTTTGTTTGAGTTATTCTGGCATTTCTCA
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CTGATGTAAGTTTCACCTCGTTCGAAATTTACTGTGTTTGAATGAATTTC
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GTATGACATTTCACAAGAAAAGTTTTATCAAATACAGTGGATTCTTTCGg
tataattcgaacttctgtTATTCGCATCTTTCCTATAAATCGAGCTAATT
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TTATCTTATGAATGCGCCTTTTAGAAAATTAATATTACTCAGAACCAAGC
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TGAGGTAAGAAAACCACCCTTAATTGCTTTGAATACTTTTCGCTACATAA
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AACTGGCTTTATTAAATTTGGCATATATCACAAATCTACCCAAGTTATTT
AGGTGAAATAACATTTAAAACAACTTTTAACTTGCCCTACGACAAACCCT
AAAAATCATTTAACAATTTGATTGTATCAGTATTTTAAAGTGATCCTACA
CATAAGAAAATATTATCAGTGATGTATTTGGCAAAAGAAAGTTTGATACA
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AATCGCAAAAAGTCACTTAAAATTACTGTACTGGAGGAAAATTTACTTAG
ATATAGTTGAACTGAAAACCTTTTCACTTGTGTAATCGACTTTTTGCGAA
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TCGGCATTATTCAACTGCTTGAATTTTTACTCCctataatttatattttt
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GCATGCTCcttagaatatttttaacaAGATCAATAATATATTCTATGGTT
ACTACCCTTTTTGAATGATACGGAAAAGATTCACTTCAAtatattttcaa
cactgaaacAAAATAGTATAGCTTATTATTTTAACCTAAAATCTCACACA
cttaaaatttttcgatttttcagatattttcgTGTGATTTTACacgaaat
tatttttaattatgGTTAATTAGAGAACTGATACCTGGCTGTTTTGGTAT
ATCTGCTTCTTGGGCAGTCCTGAACTTTTGCGATGCCTGATTTCTTATTC
TGCCATTGTGAATAAGttttaatatttcataaaattaaagttttgtaatt
tttttttgtatttttgcaaggttattatttttcaataacatttttaaatg
aCACTCATTTCGTAATATATTGCTTTATATAATGTATTTGTTCGTTAAAA
TGAGAAAATCTGATATAAACtagatgaaaa

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_013370	XLOC_013370	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000462	supercontig	sc0000462:85293..99672 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	9.04211e-07	1.91925e-06	0	2.07938e-06	0	7.72205e-08	2.74992e-05	2.59134e-05	4.98596e-07	1.64348e-06	1.21212e-07	1.68821e-06	0	1.06535	1.95393e-05	3.35702e-06	3.11763e-06	6.42012	9.35331	6.24112e-06	2.01317e-06	3.50692e-05	9.93074e-06	0	0	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00023796 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00023796 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00023796 (transcript) - C. hemisphaerica