TCONS_00023353 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00023353
Unique Name	TCONS_00023353
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	562

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000452:98058..117030+

transcript sequence

>TCONS_00023353 ID=TCONS_00023353|Name=TCONS_00023353|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=562bp
TCCGGAAGAAGATTCGTCGTTTTCAGATTTGCAAACTGTCTCATCTCTTC
AAAAGAAACCAGCTTCCATCAATACAAAAAGTACAACATCTCACgaatca
acaaaatcaaacaaagagCTTTCGTTTCCTATCCAAAAAGATCAAACAAT
GTCAGAAGATTATATGTTACCTTTTAAGAAGAAATCGTCTTCAAATGAAA
ATAAAAAGACAAAATTGCTCTTTGATGCAGCCCTTCCGGAAGAAGATTCG
TCGTTTTCAGATTTACAAACTGTCTCACCTCTTCAAAAGAAACCAGCCTC
CATCAATACCAAAAGTACAACATCTCACGAATCAACAAACTCAAACAAAG
AGCTTTCGTCTCCTATCAAAAATGATCAAACAATGTCAGAAGAAGAAGAT
ATGTTACTTTTTAAGAAGAAATCATATCCAAATGAAAAAAAGACAAAATT
GCTTTTTGATGCAGCCCTTTCGGAAGAAGATTCGTCGTTTTCAGATTTGC
AAACTGTCTCACCTCTTCAAAAGAAACCAGCCTCCATCAATACAAAAAGT
ACAACATCTCac

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000452:98058..117030+

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00023353 ID=TCONS_00023353|Name=TCONS_00023353|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18973bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000452:98058..117030+ (Clytia hemisphaerica)
TCCGGAAGAAGATTCGTCGTTTTCAGATTTGCAAACTGTCTCATCTCTTC
AAAAGAAACCAGCTTCCATCAATACAAAAAGTACAACATCTCACgaatca
acaaaatcaaacaaagagCTTTCGTTTCCTATCCAAAAAGATCAAACAAT
GTCAGAAGATTATATGTTACCTTTTAAGAAGAAATCGTCTTCAAATGAAA
ATAGTACGTTTCCTTTTCCACTTGAGCCATCTTTATTAATTACATCTGCT
GCATCTCCTTTAGAAAGCAAAGCAACTCGGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATGGTTCG
TCACTAATTGACGTTTTACAGAATTTATCATGTTTCCTGTTGTActagaa
aaatcattttcaattacAGATCCTGATTCTCCttcagaaaaaatatcaac
ttcgCCAATCAATTCTTTCTCATCGATCCAACAGGAAAAATCATGTCAAA
GTTCTGCACCTAAaggaataaatttttaaaaagcgcTAGGAACATGACAT
CAGTAGTGTTATTTAACCCCTTTTAAGGCCGCTCTACCCACGAGAATAAT
AAGATGAATTCGACTAGAATTTTCTGTTTGAACTGTTATTCTTGTGCAAA
CTACACgcaagaattgaaaaaaatgtaaattagataatacttgaagaatt
ttcTAATATCCCTTTTAATGTTGAATTCTTCGTCAAACTACCCATAAGAA
TAAAAACCACGTGTCCTTTTAAATGTCCGAACTGAAATTAATCATATACT
CCACTACAATGTCTTGTTCTAAGATTGAAGTTTCATtcttgtgaaaatgg
taattatagcaCTATTATACAAGAAGTtcatttcatcttcatttttNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAT
CATGTTTCCTGTTGTActagaaaaatcattttcaattacAGATCCTGATT
CtccttcagaaaaaaaatcaacttcgcCAATCAATTCTTTCTCGTCGATC
CAACAGGAAAAATCATGTCAAAGTTCTTCACCCAAaggaataaattttta
aaaagcgaTAGGAACATGACATCAGTAGTGTTATTTAACTCTTTTTAAGG
CCGCTCTACACACGAGAATAATAAGATGATTTCGACTAGAATTTTCTGTT
TGAACTGTTATTCTTGTGCAAACTACACAcaggaattgaaaaaaatgtaa
attagataatacttgaagaattttcTAATATCCATTTTAATGTTGAATTC
TTCTTCAAACTACCCATAAGAATAAAAACCACGTGTCCTTTTAAATGTCC
GAACTGAAATCAATCATATACTCCACTACAATGTCTTGTTCTAAGATTGA
AGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTCCGAACT
GAAATCAATCATATACTCCACTACAATGTCTTGTTCTAAGATTGAAGTTT
CATtcttgtgaaaatggtaattatagcaCTATTATACAAGAAGTccattt
catcttcattttttgaagtttttcaaataactttttatttaaaattattc
cactcaacaatatctttccaacggtaccaaAATTATTAAGATTGAAACAT
CTCTCTTTCTCCTAGAAAAGACAAAATTGCTCTTTGATGCAGCCCTTCCG
GAAGAAGATCCGTCGTTTTCAGATTTGCAAACTGTCTCACCTCTTCAAAA
GAAACCAGCCTCCATCAATACACAAAGTACAACATCTCACgaatcaacaa
aatcaaacaaagagCTTTCGTCTCCTATCCAAAAAGATCAAACAATGTCA
GAAGAAGAAGATATGTTACCTTTGAAGNTAACTCTTTTTAAGGCCGCTCT
ACACACGAGAATAATAAGATGAATTCGACTAGAATTTTCTGTTTGAACTG
TTAGTCTTGTGCAAACTACACGCAGGAATTGAAAACAAATGTAAATTAGA
TAATACTTAAAGAATTTTCTAATATCCCCTTTAATGTTGAATTCTTCTTC
AACTACCCATAAGAATAAAAACCACGTGTCCTTGTAAATGTCCGAACTGA
AATCAATCATATACTCCACTACAATGTCTTGTTCTAAGATTGAAGTTTCA
TtcttgtgaaaatggtaattatagcaCTATTAAACAAGAAATCcaattca
tcttcattttttgaagttttccaaataactttttatttaagaTTATTCCA
CTCaacaatatctttccaacggtaccaaATTTATTAAGATTGAAACATCT
CTCTTTCTACTAGAAAAGACAAAATTGCTCTTTGATGCAGCCCTTCCNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNATCTCACgaatcaacaaaatcaaacaaagagC
TTTCGTCTCCTATCCAAAAAGATCAAACAATGTCAGAAGAAGAAGATATG
TTACCTTTTAAGAAGAAATCATCTCCAAATGAAAGTACGTTTCTTTTTCC
ACTTGAGCAATCTTTATTAATTACATCTGCTGCATCTCCTTTAGAAAGCA
AAGCAACTCGGCcaattaattctttttcatcAACCCAACAAGAACAATCC
CATCATAGTGCTGCACCTAAAGGTAGTTAttactaaatttttgaaaagcg
aTAAATAGTATCATGACAATTGTGCAACACTTTTCAGTCATTGTGAAATG
CCTTAAGGGAAAATATGGCGGATTTGGtgcattttgtttcttttctctaA
TGGTTTGTCACTAATTGACGTTTTACAGAATTTATCATGTTTCCTGTTGT
ActagaaaaatcattttcaataaCACATCCTGATTCTCCTTcagaaataa
aatcaacttcGCCAATCAATTCTTTCTCGTCGATCCAACAGGAAAAATCA
TGTCAAAGTTCTTCACCTAAaggaataaatttttaaaaagcgaTAGGAAC
ATGACATCAGCAGTGTTATTTAACCCTTTTTAAGGCCGCTCTACACACAA
GAATAATAAGATGAATTCGACTAGAATTTTCTGTTTGAACTGTTATTCTT
GTGCAAACTGCACGcaggaattgaaaaaaaatgtaaattagataatactt
gaaaaattttctaatatCCCTTTTAATGTTGAATTCTTCTTCAAACTACC
CATAAGAATAAAAACCACGTGTCCTTTTAAATGTCCGAACTGAAATCAAT
CATGTACTCCACTTCAATGTCTTGTTCTAAGATTGAAGTTTCATTCTTGt
gaaaatctatatattaatacgcttaaacgtgtgtgtttacaaggttttgt
aaaaagttttcgaaaatctaacaaagctctacaaagcctcctcttcatgg
cgttgaaccatcatctttttgcactttaagcagatttcctaccactagac
taaatTTGAGACACCAAtatgctattttctattcaccaagtttggagctt
gatcagttaaaatcaaccttctttccaaatttcttttgtcaatttaaaga
attcttattcagatattctttaaaactttctgtttacaatagcggctccc
tatcactttcaaaactttttaaaacatttttatataatCTTTTGTCCCGG
TTTCAACTTTggtttttttgaagaatgtgcaTTCTTCTGAACCAGTAAGC
CAACTGTGGCTTGCATAAAATTAGTTACTTCATTCAAGGATATAGTAAGA
Gtgtctttcaaactttcactttgaaattgtctttctaatctatatattaa
tacgcttaaacgtgtgtgtttacaacgttttgtaaaaagttttcgaaaat
ctaacaaagctctacaaagcctcctcttcatggcgtTGAACCATCATCTT
TTTTCTCCTTAAGCAGATTTCccaccactagactaactttgagaccccaa
gatactattttctattcaccaacTTTGGAGCTTGatggtttttttctgtt
tacaatagcggctcccttatcactttcaaaacttttcaaagtctttcaaa
gtcaccctcgaatgtccaactacgatggctagccacgatggctaagacga
tctaaaatatacttttgctaagtcatttatttaattgtggtttaaaattg
caatgcaatgttaattttttttctcttttatttcctaaaatcaaaatcaa
atcatcgaTCCTTTCCGTTAGAATTTTGTAGTGATTCACTGGATTGGTtc
acgcagcgtgcgacgctgcgcatacggctagtggTAATTATAGCACTATT
AAACAAGAAggtcatttcattttcattttttgaagtttttcaaataactt
tttatttaaaattattccgctcaacaatatctttccaacggtaccaaATT
TGTTAAGATTGAAACATTCCTTAAATGGTTACAGCCGAAACAAAAAAGAT
AAGAATACATTGATTTGATAATTTCTTGTTTTGTTTCTGTTTCTAGGCAT
GTCAATATGGTATCAGCCAAGAGCGTTTAAGAAGAAAACAATAATGAGTG
TCCTTTATCTTGGACACGATATTGTCGTTGGTAGAGAAAGCCTTTCCGAA
TGTGATGACAATAAGATGGTAAAACTTTCTggactgaaaatcaaacaagc
AAAAGAAATACTAAAAACTATGAGGAAAAAATATAATAAGGAAAGTGACC
ACACATTGTTTCAAGCCTTTTATGAAAAGGCAAAATTGCTCTTTGATGCA
GCCCTTCCGGAAGAAGATCCGTCGTTTTCATATTTGCAAACTGTCTCACC
TCTTCAAAAGAAACCAGCCTCCATCAATACACAAAGTACAACATCTCACg
aatcaacaaaatcaaacaaagagCTTTCGTCTCCTATCCAAAAAGATCAA
ACAATGTCAGAAGAAGAAGATATGTTACCTTTGAAGNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTACATCTGCTGCATC
TCCTTTAGAAAGCAAAGCAACTCGGCcaattaattctttttcatcGACCC
AACAAGAACAATCCCATCATAAGTGCTGCACCTAAAGGTAGTTAttacta
aatttttgaaaagtgatagATAGTATCATGACATTTGTGCAACACTTTTC
AGTCATTGTGAAATGCCTTAAGGGAAAATATGGCGGATTTAGtgcatttt
gtttcttttctctaATGGTTTGTCACTAATTGACCTTTTACAGAATTTAT
AATGTTTCCTGTTGTActagaaaaatcattttcaattacAGATCCTGATT
CtccttcagaaaaaaaatcaacttcgcCAATCAATTCTTTCTCGTCGATC
CAACAGTAAAAATCATGTCAAAGTTCTTCACCTAAaggaataaattttta
aaaagtgataggAACATGACATCAGTAGTGTTATTTAACTCTTTTTAAGG
CCGCTCTACACAcgagaataataaaatgaattggactaaaattttctgtt
tgaacTGTTATTCTTGTGCAAACTAcacgcagaaatttaaaaaaaaatgt
aaattagataatacttgaagaattttcTAATATCCCTTTTAATGttgaat
tctttttcaaactacCCATAAGAATAAAAACTACGTGTCTTTTTAAATGT
CCGAACTGAAATCAATCATATACTCCACTACAATGTCTTGTTCTAAGATT
GAAGTTTCATtcttgtgaaaatggtaattatagcaCTATTANTTTTCAGT
CATCGTGATATGCCTTAAGGGAAAATATGGTGGATTTGGtgcattttgtt
tcttttctctaATGGTTTGTCACTAATTGACGTTTTACAGAATTTATCAT
GTTTCCTGTTGTActagaaaaatcattttcaattacACATCCTGATTCtc
cttcagaaaaaaaatcaacttcgcTTATCAAATCTTTCTTGTCGATCCAA
CAGGAAAAATCATGTCAAAATTCTTCACCTAAaggaataaatttttaaaa
agcgaTAGGAACATGACATCAGTAGTGTTATTTAACCCTTTTTAAGGCCG
CTCTACACACGAGAATAATAAGATGAATTCGACTAGAATTTTCTGTTTGA
ACTGTTATTCTTGTGCAAACTGCACGcaggaattgaaaaaaattgtaaat
tagataatacttgaagaattttcTAATATCCCTTTTAATGTTGAATTCTT
CTTCAAACTACCCATAAGAATAAAAACCACGTGTCCTTTTAAATGTCCGA
ACTGAAATCAATCATATACTCCACTACAATGTCTTGTTCTAAGATTGAAG
TTTCATtcttgtgaaaatggtaattatagcaCCATTAAACAAGAAGTtca
tttcatcttcattttttgaagtttttcaaataactttttatttaaaatta
tctcactcaacaatatctttccaacggtaccaaATTTATTAAGATTCAAA
CATCTCTCTTTCTACTAGAAAAGACAAAATTGCTCTTTGATGTAGCCCTT
CCGGAAGAAGATTCGTCGTTTTCAGATTTGCAAACTGTCTCACCTCTTCA
AAAGAAACCAGCCTCCATCAATACAAAAAGTACAACATCTCACgaatcaa
caaaatcaaacaaagtgCTTTCGTCTCCTATCCAAAAAGATCAAACAATG
TCAAAAGAAGAAGATATGTTACCTTTTAAGAAGAATTCATCTCCAAATGA
AAGTACGTTTCCTTTTCCACTTGAGCAATCTTTATTAATTACATCTGCTG
CATCTCCTTTAGAAAGCAAAGCAACTCGGCCAATTAATTCTTTTTCGTCG
ACCCAACAAGAACAATCCCATCATAGTGCTGCACCTAAAGGTAGTTAtta
ctaaatttttgaaaagcgaTAGATAGTATCATGACAATTGTGCAACAGTT
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNTCGATCCAACAGGAAAAATCATGTCAAAGTTCTTCACCTAA
aggaataaatttttaaaaagcgaTAGGAACATGACATCAGTAGTGTTATT
TAACCCTTTTTAAGGCCGCTCTACACACAAGAATAATAAGATGAATTCGA
CTAGAATTTTATGTTTGAACTGTTATTCTTGTGCAAACTGCACGcaggaa
ttgaaaaaaaatgtaaattagataatacttgaagaattttcTAATATCCC
TTTTAATGTTGAATTCTTCTTCAAACCACCCATAAGAATAAAAACCACGT
GTCCTTTTAAATGTTAGAACTGAAATCAATCATATACTCCACTACAATGT
CTTGTTCTAAGATTGAAGTTTCATtcttgtgaaaatggtaattatagcaC
TATTAAACAAGAAGTTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAAGTtcatttcatcttcattttt
tgaagtttttcaaataactttttatttaaaattattccactcaacaatat
ctttccaacggtaccaaATTTATTAAGATTCAAACATCTCTCTTTCTACT
AGAAAAGACAAAATTGCTCTTTGATGCAGCCCATCCGGAAGAAGATTCGT
CGTTTTCAGATTTGCAAACTGTCTCACCTCTTCAAAAGAAACCAGCCTCC
ATCAATACAAAAAGTACAACATCTCACgaatcaacaaaatcaaacaaaga
gCTTTCGTCTCCTATCCAAAAAGATCAAACAATGTCAGAAAAAGAAGATA
TGTTTCCTTTTAAGAAGAAATCATCTCCAAATGAAATTGCGTTTCCTTTT
CCACTTGAGCAATCTTTATTAAGTACATCTGCTGCATCTCCTTTAGAAAG
CAAAGCAACTCGGCAGATTAATTCTTTTTCATCGACCCAACAAGAAGAAT
CCCATCATAGTGCTGCACCTAAAGGTAGCTAttactaaatttttgaaaag
cgaTAGATAGTATCATGACAATTGTGCAACACTTTTCATTCATTGTGAAA
TGCCTTAAGGGAAAATATGGCGGATTTGGtgcattttctttcttttctct
aATGGTTTGTCACTAATTGACGTTTTACAGAATTTATCATGTTTCCTGTT
GTActagaaaaatcattttcaattacACATCCTGATTCtccttcagaaaa
aaaatcaacttcgcCAATCAATTCTTTCCCATCGATCCAACAGGAAAAAT
CATGTCAAAGTTCTTCACCTAAaggaataaatttttaaaaagtgataggA
ACATGACATCGGTAGTGTTATTTAACCCTTTTTAAGGCCGCTCTACACAC
GAGAATAATAAGATGAATCCGACTAGAATTTTCTGTTTGAACTGTTATTT
TTGTGCAAACTACACGcaggaattgaaaaaaaaatgtaaattagaTTATA
CTTGAAGAATTTTCTAATATCCCTTTTAATGTTGAATTCTTCTTCAAACT
ACCCATAAGAATAAAAACCACGTGTCCTTTTAAATGTCCGAACTGAAATC
AATCATATACTCCACTACAATGTCTTGTTCTAAGATTGAAGTTTCATtct
tgtgaaaatggtaattatagcaCTATTATACAAGAAGTtcatttcatctt
cattttttgaagtttttcaaataactttttatttaaaattattcaactca
acaatatctttccaaaagtaccaaatttattaaaattgaaACATCTCTCT
TTCTACTAGAAAAGACAAAATTGCTCTTTGATGCAGCCCTTCCGGAAGAA
GATTCGTCGTTTTCAGATTTACAAACTGTCTCACCTCTTCAAAAGAAACC
AGCCTCCATCAATACCAAAAGTACAACATCTCACGAATCAACAAACTCAA
ACAAAGAGCTTTCGTCTCCTATCAAAAATGATCAAACAATGTCAGAAGAA
GAAGATATGTTACTTTTTAAGAAGAAATCATATCCAAATGAAAGTACGTT
TCTTTTTCCACTTGAGCAATCTTTATTAATTACATCTGCTGCATCTCCTT
TAGAAAGCAAAGCAACTCGGCcaattaattctttttcatcGAGCCAACAA
GAACAATCCCATCATAGTGCTGCACCTAAAGGTAGTTAttactaaatttt
tgaaaagcgaTAGATAGTATCATGACAATTGTGCAACAGTTTTCAGTCAT
TGTGAAATGCCTTAAGGGAAAATATGGCGGATTTGGtgcattttctttct
tttctctaATGGTTTGTTACTTATTGACGTTTTACAGATTTTATCATGTT
TCCTGTTGTActagaaaaatcattttcaattacACATCCTGATTCtcctt
cagaaaaaaaatcaacttcgcCAATCAATTCTTTCTCGTCGANNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtttttttgaa
gtttttcaaataactttttatttaaaattattccactcaacaatatcttt
ccaacggtaccaaATTTATTAAGATTGAAACATCTCTCTTTCTACTAGAA
AAGACAAAATTGCTTTTTGATGCAGCCCTTTCGGAAGAAGATTCGTCGTT
TTCAGATTTGCAAACTGTCTCACCTCTTCAAAAGAAACCAGCCTCCATCA
ATACAAAAAGTACAACATCTCac

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_013129	XLOC_013129	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00023353-exon-sc0000452-1491911889:98058..98260	TCONS_00023353-exon-sc0000452-1491911889:98058..98260	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00023353-exon-sc0000452-1510915933:98058..98260	TCONS_00023353-exon-sc0000452-1510915933:98058..98260	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00023353-exon-sc0000452-1575043694:98058..98260	TCONS_00023353-exon-sc0000452-1575043694:98058..98260	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00023353-exon-sc0000452-1491911889:115117..115350	TCONS_00023353-exon-sc0000452-1491911889:115117..115350	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00023353-exon-sc0000452-1510915933:115117..115350	TCONS_00023353-exon-sc0000452-1510915933:115117..115350	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00023353-exon-sc0000452-1575043694:115117..115350	TCONS_00023353-exon-sc0000452-1575043694:115117..115350	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00023353-exon-sc0000452-1491911889:116906..117030	TCONS_00023353-exon-sc0000452-1491911889:116906..117030	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00023353-exon-sc0000452-1510915933:116906..117030	TCONS_00023353-exon-sc0000452-1510915933:116906..117030	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00023353-exon-sc0000452-1575043694:116906..117030	TCONS_00023353-exon-sc0000452-1575043694:116906..117030	Clytia hemisphaerica	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000452	supercontig	sc0000452:98058..117030 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.51149	1.91798	0.771775	0.484897	2.9956	2.87765	1.32045	0.832377	1.03807	0.432678	0.257288	1.05909	1.1825	1.55159	0.44734	2.00148	1.1735	1.47802	1.86549	3.48138	1.74247	1.13744	0.887727	0.432268	0.59954	0.777525	2.06554	2.44154	1.04196	0.580804

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00023353 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00023353 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00023353 (transcript) - C. hemisphaerica